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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017602 | Chr1 | 47582277 | 47586001 | - | Heat stress transcription factor A-2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017602.m1 | 107 | 196 | PF00447.20 | HSF_DNA-bind | Domain | 107.6 | 3.80E-31 |
LITCHI017602.m2 | 107 | 196 | PF00447.20 | HSF_DNA-bind | Domain | 107.6 | 3.80E-31 |
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>LITCHI014316.m1 MRMKNWSGGLLIMALAVILVISYSFMGTSTTQEPRKGKQSAYSFWRNHPADDDKGKGGND AAVRSPPPIGVKRLFRLSDKPHLVDVDGLGDLYGVKNMSKVESSALLAWSHMRLVLSRSD ALPGTAQGVKEAAMAWKDLLLMIEEEKAAKVNVSEKEVRNCPFAVSRLGKTLSGSGVVLE LPCGLVEDSSVTLVGIPDGHNRSFQIEFIGSQLSGEANPPIVLHYNVSMPGDNMTEEPFI TQNTWTNELGWGKAERCPAHGSANNLKETTAVDGLVICNEQVMRRSVEEHQNVSFPSGDM LTNVSHGGAHATANFPFIEGNPFTATMWVGLDGFHMTVNGRHETSFAYREKLEPWSVIGV KVAGGVELFSAFAKDLPVSEDHDIIVDVEDLKAPLVSRKRLVMLIGIFSAGNNFERRMAL RRSWMQYNAVRSGEVAVRFFIGLHKNSQVNFELWREARAYGDIQIMPFVDYYSIISLKTI AICILGTKVLPAKYIMKTDDDAFVRIDEVLSSLKEKPSNGLLHGLVSFKSSPHREKDNKW YISDEEWPHSSYPPWAHGPGYIISRDIAKFIVQGHQDRTLQLFKLEDVAMGIWIEQFKKS GKEVHYMSDDRFHNAGCESDYILAHYQGPRLVLCLWEKLQKENRAFCCENTKFGCFIAYW LSLVPDKFLKEEEEEIGLVREEDMAIAALGQLNIEELPPAWGSRSVDCFDRLEQIGEGTY GQVFMAREIETGEIVALKKIRMDNEKEGFPITAIREIKILKKLHHENVLKLKEIVTSPDG NKYRGSTYMVFEYMDHDLTGLADRPGLRFTVPQIKCYMKQLLTGLHYCHVNQVLHRDIKG SNLLIDNEGNLKLADFGLARSFSHDHNNTLTNRVITLWYRPPELLLGATKYGPAVDMWSV GCIFAELLNGKPILPGKSEPEQLHKIFELCGSPDEIIWPGVSKLPSYNNFKPARPMKRRV REVFRHFDRHALELLEKMLMLDPSQRISAKDALDAEYFWTDPLPCDPKSLPKYESSHEYQ TKKRRQQQQRQHEEATKRQKLQHTRLPPIQHGGQSHHPPAHWSNQNHPMNNAPPPPVPAG PSGHHHYGKPRGPPGGPGPNRYAGGNQNSGYNPNRGGGSSSSQVGGYSNGPYPPQGRAPP PYGGSSMQANAPRGPSSGYGVVPPNYSQSGQYGTSAPGGRGLNPMGGGNRNQQYGWQQ.
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>LITCHI014316.m1 CACTTTTAGTGCCTACGCGTCGACATTCATTAATGCTATGCAGTCTACAACTTTCAACTC CAAAGTTCCGACAGTGCCACCCACCGCTTTCAAACGATCGTACCTGTAACTGGTCGAGTC ATCAACTTCTCAACTTGACTCGACAAAACCACCATCCTCCATCAACCACCCCTGATTGTC AACCTAGCTTCCAACCAACCTCTCCAAGTCTTTGCATCACTAGTATTTGAATTGTTATAA TTAAATGAGAAAGAGAAATAAAGAATCATAAAGTTTTTTATAGTGGGGGTGTGATTATTT TGATGAAATCTAACTTGTTCAATGAGGATGAAAAACTGGTCTGGTGGGTTGTTGATAATG GCTCTTGCTGTGATTTTGGTTATAAGTTATAGTTTTATGGGGACTAGTACTACTCAAGAA CCGAGAAAGGGAAAACAGTCAGCTTATAGTTTTTGGAGGAACCATCCAGCTGATGATGAT AAGGGGAAGGGGGGTAATGATGCTGCTGTTAGGTCTCCTCCTCCAATTGGAGTGAAGAGA TTGTTTAGGTTGTCAGACAAGCCTCATCTTGTAGATGTCGATGGACTTGGTGATCTTTAT GGAGTGAAAAATATGTCCAAAGTGGAGTCTAGTGCTTTACTTGCTTGGAGTCATATGCGT TTAGTTTTGTCACGGTCTGATGCTTTGCCTGGAACTGCTCAAGGTGTTAAGGAGGCTGCG ATGGCATGGAAGGATTTGTTGTTGATGATTGAGGAGGAGAAAGCAGCGAAGGTTAATGTT AGTGAAAAAGAAGTGAGGAATTGTCCTTTTGCTGTTAGTCGACTTGGGAAGACATTGTCT GGTAGTGGTGTTGTTCTTGAGCTGCCTTGCGGTCTGGTTGAGGATTCTTCTGTTACATTG GTAGGCATACCTGATGGGCACAATCGAAGCTTCCAGATTGAATTCATAGGGTCACAACTT TCTGGGGAGGCAAATCCTCCAATCGTGTTGCATTACAATGTTAGCATGCCGGGAGATAAT ATGACAGAAGAGCCATTTATTACTCAAAATACGTGGACTAATGAGCTTGGGTGGGGCAAA GCGGAGAGATGCCCCGCTCATGGATCTGCTAACAACCTCAAAGAAACCACTGCAGTTGAT GGACTTGTTATTTGCAATGAACAAGTAATGAGAAGGAGTGTGGAAGAACATCAAAACGTA AGTTTTCCAAGTGGTGACATGTTGACCAATGTTTCCCATGGAGGTGCCCATGCGACCGCT AATTTCCCATTTATTGAAGGTAATCCATTCACTGCCACAATGTGGGTTGGTTTGGATGGG TTTCATATGACTGTAAATGGAAGGCATGAAACATCGTTTGCATATAGGGAGAAACTAGAA CCATGGTCAGTTATTGGAGTTAAAGTGGCTGGTGGTGTGGAACTGTTCTCTGCCTTTGCA AAGGACTTGCCTGTCTCTGAAGACCATGATATAATTGTTGATGTTGAGGACCTCAAAGCT CCCTTAGTTTCCCGGAAAAGACTTGTTATGTTGATAGGGATTTTCTCTGCTGGAAATAAT TTTGAGCGTCGTATGGCACTGAGAAGGTCCTGGATGCAATACAATGCTGTACGATCTGGG GAAGTAGCTGTTCGATTTTTCATTGGCCTTCACAAGAACAGTCAAGTCAACTTCGAGTTA TGGAGAGAAGCTCGAGCATATGGGGATATCCAAATAATGCCTTTCGTCGATTATTACAGC ATAATCAGCCTGAAAACAATAGCAATTTGCATTCTGGGGACCAAGGTCCTCCCTGCTAAA TACATCATGAAAACAGATGATGATGCTTTTGTAAGGATTGATGAAGTTCTTTCTAGCCTG AAGGAGAAGCCATCTAATGGCCTTTTGCATGGTCTTGTATCTTTCAAGTCGTCCCCTCAT AGAGAAAAAGACAACAAATGGTATATCAGCGATGAGGAATGGCCTCATTCCTCATACCCC CCATGGGCCCATGGTCCAGGTTACATCATCTCACGGGACATAGCAAAATTCATCGTTCAA GGCCACCAGGATAGAACTCTCCAGCTTTTCAAACTAGAGGACGTTGCAATGGGCATATGG ATTGAACAATTCAAGAAGAGCGGTAAGGAAGTGCATTACATGAGCGATGATAGGTTCCAC AATGCTGGATGCGAATCAGATTATATTCTCGCCCACTACCAAGGCCCAAGGTTAGTGTTA TGCCTATGGGAGAAGCTGCAGAAAGAGAACCGAGCCTTCTGCTGCGAAAATACAAAATTC GGTTGTTTTATCGCTTATTGGTTATCTTTAGTTCCAGATAAGTTTTTAAAAGAAGAGGAA GAGGAAATTGGACTAGTGAGAGAAGAAGATATGGCTATAGCAGCACTAGGGCAGCTGAAC ATAGAGGAGTTGCCACCCGCATGGGGTTCTCGAAGTGTGGATTGCTTTGACCGATTGGAG CAGATTGGCGAAGGAACTTATGGTCAAGTGTTCATGGCCAGAGAAATTGAGACCGGGGAA ATTGTTGCTTTGAAAAAGATACGTATGGATAATGAAAAGGAAGGGTTTCCAATCACAGCT ATTCGGGAGATTAAAATTCTGAAGAAGCTTCATCATGAAAATGTTCTTAAGCTGAAGGAG ATTGTGACTTCTCCAGATGGTAACAAGTATAGAGGCAGCACTTACATGGTTTTTGAGTAC ATGGACCATGACTTGACAGGCCTTGCTGATCGTCCTGGACTAAGATTCACAGTTCCCCAA ATAAAGTGTTATATGAAGCAGCTACTGACTGGGCTCCATTACTGTCATGTTAATCAAGTA CTTCATAGGGACATCAAAGGTTCAAATCTCTTGATAGACAATGAAGGAAATTTGAAGCTA GCGGATTTTGGGCTTGCAAGGTCTTTTTCTCATGACCATAACAACACTCTTACAAATCGT GTTATCACTCTCTGGTATAGGCCTCCAGAGTTGCTGCTTGGAGCCACAAAGTATGGGCCA GCAGTTGATATGTGGTCTGTTGGCTGTATCTTTGCTGAGCTATTGAATGGAAAACCAATT TTGCCCGGAAAAAGTGAGCCTGAGCAATTGCACAAGATATTTGAGCTCTGTGGATCTCCT GATGAAATCATCTGGCCTGGTGTTTCCAAGCTGCCTTCTTATAACAATTTCAAGCCTGCA AGGCCTATGAAGAGACGCGTCAGGGAGGTTTTCAGACATTTTGACCGCCATGCTCTGGAG TTATTGGAGAAAATGCTAATGCTTGATCCTTCCCAGAGAATATCTGCAAAGGATGCACTT GATGCTGAGTATTTCTGGACCGACCCCCTACCTTGTGATCCCAAGAGCTTGCCCAAATAT GAATCATCACATGAGTACCAGACCAAGAAAAGAAGGCAACAGCAGCAGAGGCAGCATGAA GAAGCAACAAAGAGGCAAAAATTGCAGCACACTCGGCTGCCACCTATTCAACACGGTGGT CAATCTCATCACCCACCTGCTCATTGGTCCAACCAGAATCACCCCATGAACAATGCACCA CCGCCTCCAGTGCCCGCAGGCCCTAGTGGTCACCACCACTACGGAAAGCCTCGTGGTCCT CCTGGAGGTCCAGGTCCCAACAGATATGCTGGTGGCAACCAAAATAGTGGATACAACCCA AATCGCGGTGGAGGCAGCAGCAGCAGCCAAGTAGGGGGTTACAGCAATGGGCCATATCCA CCTCAAGGGCGTGCACCACCACCATACGGTGGCAGTAGTATGCAGGCTAATGCTCCCAGG GGTCCCAGCAGTGGTTATGGAGTTGTCCCTCCAAATTATTCCCAAAGTGGTCAATATGGT ACCTCCGCCCCGGGAGGCAGGGGTTTAAACCCCATGGGTGGTGGCAATCGAAATCAGCAG TATGGTTGGCAGCAATAAACCGCTATTAGAAACATATATATTTTATTGAGGAACAGTTGT GTTTTTGTGATAATGTCCTTTGAACACATGTTATTCATCAAATGCCGATGTTACCAATCA TCTTCCTACAAGTGATTGCGACAACAACAGACAAGCTATGTTCAAATGTATAGAGCTTTG ATACAGACTAATCTTATTCAACAGATAGTTTCAATCAATAAAAAAACTGTTTGATTCGTA TACTATAATGAAATTTCATGTAATTCGGATTTGATCCAACTATTAGTTTGATTTCACTAG TTAAGACTTAAGCTAGTTAATGTCCAAAATCTTGGACTCTCAGGACCAAATTTTACATTG TATCTTTCACATATGTTGTGTACTACACTTACCATGTATGATAATTAAGGATGATACAAA AATCCGAGCGTCCCATGATCCGGACTAAAATCTGCCTTGTAGGATCTGACAAACAAAGAA AGCTCGAGACAGTTCAATGTACATATAAAAAGAAGTTTCTGTAATGGACCTTTTTCGACT CATAAGAACCATTGGTACAGCAATGAGCAACTGATCTTGTACTTATCTTCTCAATATCCA ATCATGG
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>LITCHI024452.m1 + Up_Stream_Len 2000 CACACACTGGTGAATCCTTTCAAGTGAAAATATATACAAGCTTGATTTTTATGTATGTGT TTTTGTTTGTTGAAGAGAGGTGATGAGAATGGTCTAAAGAGGGGGTCTTGCATGGCGAAC CACAGAATTGGAGAGACTGGTTTATCAGACTCGGCTCCTGCAAATCACCATCACCATGTT CCATATGCAGCTCTTCATGGGATCAACACACATGCAAGTTTCATGTATACTAGCTATAGC CACCTCATAGTCATAGATTTTTGGTCTTGATCAAGTCAATTAATATTTAATTTTTCACGA TGGATTGTGACTTGACTTCAGTTTCCTTTTGTGATTTTTGTTTTGTTTTGTATTAAATGT TATGTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAGAAACTGACATGGTAATCATGAAAAA CTTGTGTCACAGCAATCAAGGAGGATCTGCTTTTGATTTTGGAGAGCTGGAAGAAGCAAT TGCGCTGCAAGGAGTTAAGCTTAGGAATGATGAAGCAAAAGCATGTATGTTTCTTTCTCT ACAACCATTCCAGCTAGCTTTTGTGACGTTTGATAAGAATAACAATTAACCACTCCCTCT CTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTACAGTGAGGAGAGTTACCATTTCCAATAGAG TAATGATTCTGAGGCAAGAGACTTGAATGGTGTGAGGATACAAATATAGAAAACCTGTGC TGTCACATGATACGATTTACTGACTCCATAACTGCATAGAGAGAAAAGGAAGATTAGGTT CCTTCTCCTTTTGAGATTTGTTTTGTAAGAAAGTCTGTTTCTTTTATATCTATATTTTTT GGTTGATCCTTTCTCTGAGTCTGAGATTTTACTTTTGTGATTCTTTGCAGATTTATTTAC AGCAGCAGTAGCAGGCAGACCAGCAGCAACCCTGGACATATTCCCTTCTTGGCCAATGAG ATTCCATCACACCCCAAGAGTAGTATTCTTGTTTTTAAACCTTTCTTTCTCTTTGTTTGA CCACTTCTTTTTAGTACTAGATAGACAAACCAAAAAAAAAAAAAATTGCTTAACAAGTAC AAACTCTAAATCTCTAAAGTGATATATATATATATTTTTCTTTTTTCTTCACTTTTGAAA ATGTGTTTATTAAGTTGATTTTGATTATTCTGGGATGATTCTATAGATACCCATTTGAAA ATCTTTGATAGGGTTTTTATTTTTATTCAGGGAAGTTCAAAGTCAGGAGGAGAAAGTACA GACTCAGGATCAGCTTTGAACACACTTTCAAGCAAAGTTGAAGGGCAACTAGAGCCAGAA TCTCCTATAAGTAAAAAGGCATCTTCATCAGATCGTCAGGCTGCTTTTGACCAGAAGCAC TTCCAGCTCCAGCAGAATCAACAACACATAGAGATGGCTAATAATGATAACTCAACAATA GGTCCATCACAGAATCAAGCCAAACCACCCCAAGAAATAAAGGTCCTTAAACTACTCTTT TGCTCAATAATTAGCCTCCCCGTAATCCAATAACTCAGGAAAAGTTGGTATCTTTATTGT TATTATCACTCTTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCGCTC TCTATGTGTCCCACTTTGCATATCTTCAAAAATACAAAAGCACGGATCCCAACAATCCAC AAAATCAGATCTCCGTCAGTTTTTCTGATATTAAAGGATTTTCTGATCAGAATCTGACAT GAAGAGAGAAAGACAAAGAGGTACACATTAGAAAGCAAAGAGAGACAGACCCTTTAGTAC TTTTGTATGTGCTTGTGGGTGATTCTCATTATAATAAAAGACCCTCCTTTTATTTCAAAA ACAAAGACCCTTCTTTACTCAATCCCTATAACAAACAGATAAACTTCTCGTTTTTAAGCC TTGAAAATCAGTTTTGGAAGTACAGATAAACTTCTCGTTTTTAAGCCTTGAAAATCAGTT TTGGAAGTACACAAAGCACT
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>LITCHI024452.m1 GenomeSequence + ATGCCACGAAATGATGATGCCTTTGCCTCTCCATATCATCTCCATGATTGCTTGTTCCAA CGACATCACACACATCTGCCTCAGAAATGTTTAATGGTTTGAGATATTTCTAATCATTCT AATTTGTGTTTTTTAAATTACACATATGAAAACAAAACAACCCCTTTAAAATGCTCGCAA TGATTATCATATTTCTTTCTCTTTACCACATTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTGGAAACTTCTCTACCACATTTTCTAACACCTACTTTTCTTGATCATTTTCTTCA CACATAAACTATTTAACTATATGTAGATATATATATATTTTTCTTATTGTTGCAGAGAAA AGGAGCTGGTTCAACTTCAGAGAAACAACTTGATGCTAAGGTCTAAAAATTTCCCATTTA TTGTACTATAAATTTCGGCATTGTTTGGACTCAAATATTTTGAGGTGATTATATATTTTT TCAGACATTGAGACGTTTAGCTCAAAACAGAGAAGCTGCAAGAAAGAGCCGTCTAAGAAA AAAGGTAAAATTTTGAAGAAATATATGTATGTATATGTGTATGTGTATGTGTGTTTTTAA CTTTTGTTATATTGGGTGTGGTCAACAACTTTATCAATGATTGTTTGTCTGTTCATAAAC AGGCTTATGTGCAGCAGTTGGAATCTAGTAGAATAAAGCTCTCTCAGTTAGAACAAGAGC TACAAAGAGCACGCTCTCAGGTTTTAACTCTTTCTTCATCTTTTTAAATCAAGTGATATA TGTTACTTAAAAAAAAACAACAAGTGATATATATATATATATATATAATCTATGAAAGTT ACAATTTGTTCTTTAATTAATTAATTATTACATGCGTTTCTGATTCTGGGGTTGTTTTGT 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