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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017601 | Chr1 | 47575569 | 47579765 | + | BTB/POZ domain and ankyrin repeat-containing protein NPR1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017601.m1 | 60 | 177 | PF00651.34 | BTB | Domain | 45.1 | 1.10E-11 |
| LITCHI017601.m1 | 223 | 265 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 27 | 4.00E-06 |
| LITCHI017601.m1 | 270 | 347 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 29.7 | 7.90E-07 |
| LITCHI017601.m1 | 292 | 336 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 24.5 | 3.30E-05 |
| LITCHI017601.m1 | 323 | 348 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 15.3 | 0.022 |
| LITCHI017601.m1 | 364 | 568 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 291 | 4.60E-87 |
| LITCHI017601.m2 | 60 | 177 | PF00651.34 | BTB | Domain | 45.8 | 6.70E-12 |
| LITCHI017601.m2 | 223 | 265 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 27.5 | 2.80E-06 |
| LITCHI017601.m2 | 270 | 347 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 30.3 | 5.20E-07 |
| LITCHI017601.m2 | 292 | 336 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 25 | 2.30E-05 |
| LITCHI017601.m2 | 323 | 348 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 15.8 | 0.016 |
| LITCHI017601.m2 | 364 | 428 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 84.7 | 6.80E-24 |
| LITCHI017601.m3 | 60 | 177 | PF00651.34 | BTB | Domain | 45.7 | 6.80E-12 |
| LITCHI017601.m3 | 223 | 265 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 27.5 | 2.90E-06 |
| LITCHI017601.m3 | 270 | 347 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 30.2 | 5.30E-07 |
| LITCHI017601.m3 | 292 | 336 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 24.9 | 2.30E-05 |
| LITCHI017601.m3 | 323 | 348 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 15.8 | 0.016 |
| LITCHI017601.m3 | 364 | 426 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 80.5 | 1.30E-22 |
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>LITCHI017601.m1 ATGGATAACAGAAGTGGGTTCTCGGATTCGAATGATGTTAGTAACAATAGCAGCACATGT TGTATGGCAGCAGCGAACACAGAAACACTTTCTTCGTCCGAGCCTTTGAACTCGGACATG GCAGCTCTGCGTGCTCTCTCAAGCCACCTCGAGTTGGTCTTTGAGTCTCCGGATTTCGAG CTCTACAGTGATGCCAAGATCGTGCTTTCGAGCGGCAGAGAAGTGCCGGTTCACCGGTGC ATTTTGTCGGCGAGGAGTCCGTTTTTCAAGGATGCGTTTGGTGGGAAAGAGGGAGGACGC AAGTTTGAAGTGAAGGAGTCGGTGAGAGATTATGATATTGGATTTGATTCGCTTGTTTCG GTTTTGGGGTACTTATATACAGGGAAAGCGAGACCGTTGCCTAAAGACGTTTGTGCGTGT ATGGATGAGTGTTGCTCGCATGTTGGTTGCAGGCCCGCCGTGGATTTCATGGTGGAGGTG CTCTATGCCTCTTTTACTTTTCAGGTTCCTGAATTGGTTGCTCTTTATCAGCGGCACCTA CTGGACATTCTTGACAGGCTTGCAATAGATGATATTTTGGTGGTTTTATTTGTTGCAAAC ATGTGTGGTAATGGTTGTGAGAGATTGTTGGCAAGGTGTATTGAAATTGTTGTCAAATCC GATGCTGATATTGTAACTCTTGATAAAGCCTTGCCAGAAAACATTGTCAAACAAATTGTG GATTTACAGATCGAACTCAACTTAGCAAAGCCTGAAAGCTTGAATTTTCCAGATAAACAT ATAAAGAGAATATATCGAGCACTGGATTCAGACGATGTTGAATTAGTCAGAATGTTGCTG AAAGAGGCACATACTAATCTAGATGACGCATGTGCACTCCACTATGCAGTGGCATATTGT GATACTAAGACTACAACTGAGCTTCTTGATCTTGGACTTGCTGATGTAAACCACAGAAAT CCAAGGGGCTACACTGTGCTGCATGTTGCTGCAATGCGGAAGGAACCTAAGATTATAGTA TCTCTTTTGACAAAGGGGGCTCTGCCATCAGTTCTTACTTTGGATGGTAGAAAAGCACTT CAGATCTCAAAGCAGCTTACAAGGGTTGCCGATTACTTTACCCCTATTGAGGAGGGAGAA GCTTCTCCTAAGGATCGGTTGTGCATAGAGATTTTGGAGCAAGCAGAAAGAAGAGATCCG TTGCTTGGGGAAGCTTCTCTTTCTCTTGCTGTGGCTGGTGACGACCTGCGGATGAAACTT CTGTACCTTGAAAATAGAGTTGCACTGGCCCAACTCCTATTTCCAATGGAAGCAAAAGTT GTGATGGCTATTGCCAATGTCGATGGCACTTCTGAGTGTTCATTAGCTGGCATCAAGTTT AAGAATATGACCAGTGCACAGAGGCCAACTGTGGCCTTGAATGAGGCACCTGTCAAAATC AAAGAGGAGCATCTAAACAGGCTGAAAGCTCTCTTTAGAACTGTGGAACTTGGGAAACGT TTTTTCCCTCGTTGTTCAGAAGTACTCAACAAGATCATGGACGCCGATGACTTAACTCAG CTAGCGAGATTTGGGAATGATTCTCCAGAAGAACGAAACCTGAAGCAAACGAGGTATTTG GAACTTCAAGAAGTTCTAAGTAAGGCATTCAGTGAGGACAAAGAGGAGTTTGATAGGTCT GTGATATCATCTTCGTCTTCATCGATATCAGTAGGGTTGGTGAGGCCTTATGGTGGCAAA CCTCATTGA >LITCHI017601.m2 ATGGATAACAGAAGTGGGTTCTCGGATTCGAATGATGTTAGTAACAATAGCAGCACATGT TGTATGGCAGCAGCGAACACAGAAACACTTTCTTCGTCCGAGCCTTTGAACTCGGACATG GCAGCTCTGCGTGCTCTCTCAAGCCACCTCGAGTTGGTCTTTGAGTCTCCGGATTTCGAG CTCTACAGTGATGCCAAGATCGTGCTTTCGAGCGGCAGAGAAGTGCCGGTTCACCGGTGC ATTTTGTCGGCGAGGAGTCCGTTTTTCAAGGATGCGTTTGGTGGGAAAGAGGGAGGACGC AAGTTTGAAGTGAAGGAGTCGGTGAGAGATTATGATATTGGATTTGATTCGCTTGTTTCG GTTTTGGGGTACTTATATACAGGGAAAGCGAGACCGTTGCCTAAAGACGTTTGTGCGTGT ATGGATGAGTGTTGCTCGCATGTTGGTTGCAGGCCCGCCGTGGATTTCATGGTGGAGGTG CTCTATGCCTCTTTTACTTTTCAGGTTCCTGAATTGGTTGCTCTTTATCAGCGGCACCTA CTGGACATTCTTGACAGGCTTGCAATAGATGATATTTTGGTGGTTTTATTTGTTGCAAAC ATGTGTGGTAATGGTTGTGAGAGATTGTTGGCAAGGTGTATTGAAATTGTTGTCAAATCC GATGCTGATATTGTAACTCTTGATAAAGCCTTGCCAGAAAACATTGTCAAACAAATTGTG GATTTACAGATCGAACTCAACTTAGCAAAGCCTGAAAGCTTGAATTTTCCAGATAAACAT ATAAAGAGAATATATCGAGCACTGGATTCAGACGATGTTGAATTAGTCAGAATGTTGCTG AAAGAGGCACATACTAATCTAGATGACGCATGTGCACTCCACTATGCAGTGGCATATTGT GATACTAAGACTACAACTGAGCTTCTTGATCTTGGACTTGCTGATGTAAACCACAGAAAT CCAAGGGGCTACACTGTGCTGCATGTTGCTGCAATGCGGAAGGAACCTAAGATTATAGTA TCTCTTTTGACAAAGGGGGCTCTGCCATCAGTTCTTACTTTGGATGGTAGAAAAGCACTT CAGATCTCAAAGCAGCTTACAAGGGTTGCCGATTACTTTACCCCTATTGAGGAGGGAGAA GCTTCTCCTAAGGATCGGTTGTGCATAGAGATTTTGGAGCAAGCAGAAAGAAGAGATCCG TTGCTTGGGGAAGCTTCTCTTTCTCTTGCTGTGGCTGGTGACGACCTGCGGATGAAACTT CTGTACCTTGAAAATAGAGTGACTTGTTATTTGCAGTTGCACTGGCCCAACTCCTATTTC CAATGGAAGCAAAAGTTGTGA >LITCHI017601.m3 ATGGATAACAGAAGTGGGTTCTCGGATTCGAATGATGTTAGTAACAATAGCAGCACATGT TGTATGGCAGCAGCGAACACAGAAACACTTTCTTCGTCCGAGCCTTTGAACTCGGACATG GCAGCTCTGCGTGCTCTCTCAAGCCACCTCGAGTTGGTCTTTGAGTCTCCGGATTTCGAG CTCTACAGTGATGCCAAGATCGTGCTTTCGAGCGGCAGAGAAGTGCCGGTTCACCGGTGC ATTTTGTCGGCGAGGAGTCCGTTTTTCAAGGATGCGTTTGGTGGGAAAGAGGGAGGACGC AAGTTTGAAGTGAAGGAGTCGGTGAGAGATTATGATATTGGATTTGATTCGCTTGTTTCG GTTTTGGGGTACTTATATACAGGGAAAGCGAGACCGTTGCCTAAAGACGTTTGTGCGTGT ATGGATGAGTGTTGCTCGCATGTTGGTTGCAGGCCCGCCGTGGATTTCATGGTGGAGGTG CTCTATGCCTCTTTTACTTTTCAGGTTCCTGAATTGGTTGCTCTTTATCAGCGGCACCTA CTGGACATTCTTGACAGGCTTGCAATAGATGATATTTTGGTGGTTTTATTTGTTGCAAAC ATGTGTGGTAATGGTTGTGAGAGATTGTTGGCAAGGTGTATTGAAATTGTTGTCAAATCC GATGCTGATATTGTAACTCTTGATAAAGCCTTGCCAGAAAACATTGTCAAACAAATTGTG GATTTACAGATCGAACTCAACTTAGCAAAGCCTGAAAGCTTGAATTTTCCAGATAAACAT ATAAAGAGAATATATCGAGCACTGGATTCAGACGATGTTGAATTAGTCAGAATGTTGCTG AAAGAGGCACATACTAATCTAGATGACGCATGTGCACTCCACTATGCAGTGGCATATTGT GATACTAAGACTACAACTGAGCTTCTTGATCTTGGACTTGCTGATGTAAACCACAGAAAT CCAAGGGGCTACACTGTGCTGCATGTTGCTGCAATGCGGAAGGAACCTAAGATTATAGTA TCTCTTTTGACAAAGGGGGCTCTGCCATCAGTTCTTACTTTGGATGGTAGAAAAGCACTT CAGATCTCAAAGCAGCTTACAAGGGTTGCCGATTACTTTACCCCTATTGAGGAGGGAGAA GCTTCTCCTAAGGATCGGTTGTGCATAGAGATTTTGGAGCAAGCAGAAAGAAGAGATCCG TTGCTTGGGGAAGCTTCTCTTTCTCTTGCTGTGGCTGGTGACGACCTGCGGATGAAACTT CTGTACCTTGAAAATAGAGGTATAGAGTCTCAAACTCATTTTCTGATTAGTGTGTTCCTT GTATACAAAATGTTTATACTCTGCCTCTAA
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>LITCHI017601.m1 TTTCATTCAAAAGTTTAGGAGTTATTGTAGATGGGATGGAAAGTCTGGTCGCAAAACAAA CTCGTCCAGGCCGTCTATTCCTCGCTATCACGACAAGACAAAAGCATAGTCACTCAAAAA GCCAAAACTGGAAAAAAAGGAAAAAACAACGAAGGTGGAGTCAAGACAGTAGCCGTGAGA GCAGACCACGAATTGGGGTTGGAGTTTGAGATCCTGCTGTACGGACGAAAATGGGGAGAT ATATTAAATCACGCAATAATGTCAAACCCCAAAAGGAGGAAAAAGCTAAATATTTATATC ATCCTCTACTCTCCCACAATCCCACTCTCGCTTTGATGGCATCAATGGCAGTTTTCGTTT CCACTCTTCGTCACCTATGTTGTCGATGATGATGATGATGTGGCGGCTTCTACAAGTCTC TGACTTCACCTACTTCCTCTGGCAATTCATGTCCAAGGCAGTTCTTCTCTCCCTCATGGT TTTTTTCTACACATATGCGTCTCGTTTCCGCTTTCTTGGTGATGTATAAGTATATAATTA GCTTTTTTCTATAAACAAGTGTTTTACTGGTTGGTGGATGGATAACAGAAGTGGGTTCTC GGATTCGAATGATGTTAGTAACAATAGCAGCACATGTTGTATGGCAGCAGCGAACACAGA AACACTTTCTTCGTCCGAGCCTTTGAACTCGGACATGGCAGCTCTGCGTGCTCTCTCAAG CCACCTCGAGTTGGTCTTTGAGTCTCCGGATTTCGAGCTCTACAGTGATGCCAAGATCGT GCTTTCGAGCGGCAGAGAAGTGCCGGTTCACCGGTGCATTTTGTCGGCGAGGAGTCCGTT TTTCAAGGATGCGTTTGGTGGGAAAGAGGGAGGACGCAAGTTTGAAGTGAAGGAGTCGGT GAGAGATTATGATATTGGATTTGATTCGCTTGTTTCGGTTTTGGGGTACTTATATACAGG 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AGATTTGGGAATGATTCTCCAGAAGAACGAAACCTGAAGCAAACGAGGTATTTGGAACTT CAAGAAGTTCTAAGTAAGGCATTCAGTGAGGACAAAGAGGAGTTTGATAGGTCTGTGATA TCATCTTCGTCTTCATCGATATCAGTAGGGTTGGTGAGGCCTTATGGTGGCAAACCTCAT TGAGGCTTGAGGCTTGTTTCATTTCTTATATCCGAGGAATTAGCCCAAGAAATACCTGAT GAGGTACCTATAGGATTAAGTGATGGACAATTCATATAGTCTTTTCATTTTCGTGGATTA TAATTCTCAGTATATAATTGGTTGTACGATCAAGGGAAATAATTTCAGATGCTTGATTGT ACATATAGCATATGATTAAGACATATCTTCTTTAAATTTCTGGTAATTGACGTAGAGAGG TAGAGAAATTGTATGATTGCTGGAGTTTGGCAGTTTAATTAATGAATATAGCCATATACA ATGTTAAAAGAGCA >LITCHI017601.m3 TTTCATTCAAAAGTTTAGGAGTTATTGTAGATGGGATGGAAAGTCTGGTCGCAAAACAAA CTCGTCCAGGCCGTCTATTCCTCGCTATCACGACAAGACAAAAGCATAGTCACTCAAAAA GCCAAAACTGGAAAAAAAGGAAAAAACAACGAAGGTGGAGTCAAGACAGTAGCCGTGAGA GCAGACCACGAATTGGGGTTGGAGTTTGAGATCCTGCTGTACGGACGAAAATGGGGAGAT ATATTAAATCACGCAATAATGTCAAACCCCAAAAGGAGGAAAAAGCTAAATATTTATATC ATCCTCTACTCTCCCACAATCCCACTCTCGCTTTGATGGCATCAATGGCAGTTTTCGTTT CCACTCTTCGTCACCTATGTTGTCGATGATGATGATGATGTGGCGGCTTCTACAAGTCTC 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