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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017592 | Chr1 | 47493663;47493975 | 47499221 | + | Telomere repeat-binding factor 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017592.m1 | 5 | 55 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.7 | 1.90E-09 |
LITCHI017592.m1 | 8 | 58 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 31.5 | 1.70E-07 |
LITCHI017592.m1 | 116 | 175 | PF00538.22 | Linker_histone | Domain | 41.8 | 1.10E-10 |
LITCHI017592.m2 | 5 | 55 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.2 | 2.70E-09 |
LITCHI017592.m2 | 8 | 58 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 31 | 2.40E-07 |
LITCHI017592.m2 | 116 | 174 | PF00538.22 | Linker_histone | Domain | 39.1 | 7.30E-10 |
LITCHI017592.m3 | 61 | 120 | PF00538.22 | Linker_histone | Domain | 42.4 | 7.20E-11 |
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>LITCHI017592.m1 ATGGGAAATCCGAAGCAGAAATGGACGTCGGAGGAAGAAGAGGCACTGAGAGCAGGAGTT GCCAAACACGGCACCGGCAAGTGGAAGAACATTCAGAGAGATCCTGAGTTCAATCCCTAC CTCTTCTCTCGCTCTAATATTGATCTCAAGGACAAATGGCGAAATATGAGTGTAAGTGCC ACCGGACAAGGCCCCCGAGAAAAATCAAGGATGCCAAAAGCAAAAGCCAGCTCAGATTCT CCAGCCGCACAATTGTCCACTCCACAAACTTTTGCTCTCCCTGCTACAGTTGCACATGAT GCGTCAACAGATCCAATCGTAGATGACTCTGCTAGAAGCTCTGCTCCAAAGTATAATGCA TTGATATTTGAAGCTCTTTCTGTCTTAAAGGAGCCCAATGGATCTGACATAACTGCAATT CTCAGATATATTGAGCAAAGAAATGAGGTGCCACAAAATTTTAGGAGGCTGCTGGGTTCA AGGCTCAGAAGACTTGTTGCACAAGAAAAACTTGAGAAGGTCCAGAATTGCTTTAAGATT AAGGAAGACAACTCGTTTGAGACAAAAACACCCATCCCAAAACAGAAGGATGTTCGGCCT AGACCATCACAGAGCTCTGACTGTATAAACTCAGTTGATACTGTTGAAGCAGCAGCAGCT ACCGCTGCTAGCCAGATTGCTGAGGCTGAAAACAAGTCTTATGTGGCAGCTGAAGCAGTT AAAGAGGCAGAGAGGATTTCAAGCATGGCTGAAGACACATATTCACAGCTACAGTTGCTC AAAGAGATTTTTGAGAGATGTTCCCGAGGTGAAATTGTGATCATGGCATAG >LITCHI017592.m2 ATGGGAAATCCGAAGCAGAAATGGACGTCGGAGGAAGAAGAGGCACTGAGAGCAGGAGTT GCCAAACACGGCACCGGCAAGTGGAAGAACATTCAGAGAGATCCTGAGTTCAATCCCTAC CTCTTCTCTCGCTCTAATATTGATCTCAAGGACAAATGGCGAAATATGAGTGTAAGTGCC ACCGGACAAGGCCCCCGAGAAAAATCAAGGATGCCAAAAGCAAAAGCCAGCTCAGATTCT CCAGCCGCACAATTGTCCACTCCACAAACTTTTGCTCTCCCTGCTACAGTTGCACATGAT GCGTCAACAGATCCAATCGTAGATGACTCTGCTAGAAGCTCTGCTCCAAAGTATAATGCA TTGATATTTGAAGCTCTTTCTGTCTTAAAGGAGCCCAATGGATCTGACATAACTGCAATT CTCAGATATATTGAGCAAAGAAATGAGGTGCCACAAAATTTTAGGAGGCTGCTGGGTTCA AGGCTCAGAAGACTTGTTGCACAAGAAAAACTTGAGAAGCTAAGCAGAATGGATGTCTTA AACAAGAGAGAACAAAGAAGATTTTGTCTTGAAGTTGTAGAAATGAAAAGCGTCAGCAGC GCTTTCTATTTTAATAGGGAAATTCAGTGCCATTTTTTATATTTTGTTTGTTTTGGACTT TTAGGCTGGGATGGAACACTAAGCCTTTTTACTCGTTATGTGATCATACTGCAGGTCCAG AATTGCTTTAAGATTAAGGAAGACAACTCGTTTGAGACAAAAACACCCATCCCAAAACAG AAGGATGTTCGGCCTAGACCATCACAGAGCTCTGACTGTATAAACTCAGTTGATACTGTT GAAGCAGCAGCAGCTACCGCTGCTAGCCAGATTGCTGAGGCTGAAAACAAGTCTTATGTG GCAGCTGAAGCAGTTAAAGAGGCAGAGAGGATTTCAAGCATGGCTGAAGACACATATTCA CAGCTACAGTTGCTCAAAGAGATTTTTGAGAGATGTTCCCGAGGTGAAATTGTGATCATG GCATAG >LITCHI017592.m3 ATGAGTGTAAGTGCCACCGGACAAGGCCCCCGAGAAAAATCAAGGATGCCAAAAGCAAAA GCCAGCTCAGATTCTCCAGCCGCACAATTGTCCACTCCACAAACTTTTGCTCTCCCTGCT ACAGTTGCACATGATGCGTCAACAGATCCAATCGTAGATGACTCTGCTAGAAGCTCTGCT CCAAAGTATAATGCATTGATATTTGAAGCTCTTTCTGTCTTAAAGGAGCCCAATGGATCT GACATAACTGCAATTCTCAGATATATTGAGCAAAGAAATGAGGTGCCACAAAATTTTAGG AGGCTGCTGGGTTCAAGGCTCAGAAGACTTGTTGCACAAGAAAAACTTGAGAAGGTCCAG AATTGCTTTAAGATTAAGGAAGACAACTCGTTTGAGACAAAAACACCCATCCCAAAACAG AAGGATGTTCGGCCTAGACCATCACAGAGCTCTGACTGTATAAACTCAGTTGATACTGTT GAAGCAGCAGCAGCTACCGCTGCTAGCCAGATTGCTGAGGCTGAAAACAAGTCTTATGTG GCAGCTGAAGCAGTTAAAGAGGCAGAGAGGATTTCAAGCATGGCTGAAGACACATATTCA CAGCTACAGTTGCTCAAAGAGATTTTTGAGAGATGTTCCCGAGGTGAAATTGTGATCATG GCATAG
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>LITCHI017592.m2 AAAAAAAAAAAGAGCCTATTTTCGTGGCAGAGGCAGAGAGCGAGACAGAGAGATGGGAAA TCCGAAGCAGAAATGGACGTCGGAGGAAGAAGAGGCACTGAGAGCAGGAGTTGCCAAACA CGGCACCGGCAAGTGGAAGAACATTCAGAGAGATCCTGAGTTCAATCCCTACCTCTTCTC TCGCTCTAATATTGATCTCAAGGACAAATGGCGAAATATGAGTGTAAGTGCCACCGGACA AGGCCCCCGAGAAAAATCAAGGATGCCAAAAGCAAAAGCCAGCTCAGATTCTCCAGCCGC ACAATTGTCCACTCCACAAACTTTTGCTCTCCCTGCTACAGTTGCACATGATGCGTCAAC AGATCCAATCGTAGATGACTCTGCTAGAAGCTCTGCTCCAAAGTATAATGCATTGATATT TGAAGCTCTTTCTGTCTTAAAGGAGCCCAATGGATCTGACATAACTGCAATTCTCAGATA TATTGAGCAAAGAAATGAGGTGCCACAAAATTTTAGGAGGCTGCTGGGTTCAAGGCTCAG AAGACTTGTTGCACAAGAAAAACTTGAGAAGCTAAGCAGAATGGATGTCTTAAACAAGAG AGAACAAAGAAGATTTTGTCTTGAAGTTGTAGAAATGAAAAGCGTCAGCAGCGCTTTCTA TTTTAATAGGGAAATTCAGTGCCATTTTTTATATTTTGTTTGTTTTGGACTTTTAGGCTG GGATGGAACACTAAGCCTTTTTACTCGTTATGTGATCATACTGCAGGTCCAGAATTGCTT TAAGATTAAGGAAGACAACTCGTTTGAGACAAAAACACCCATCCCAAAACAGAAGGATGT TCGGCCTAGACCATCACAGAGCTCTGACTGTATAAACTCAGTTGATACTGTTGAAGCAGC AGCAGCTACCGCTGCTAGCCAGATTGCTGAGGCTGAAAACAAGTCTTATGTGGCAGCTGA AGCAGTTAAAGAGGCAGAGAGGATTTCAAGCATGGCTGAAGACACATATTCACAGCTACA GTTGCTCAAAGAGATTTTTGAGAGATGTTCCCGAGGTGAAATTGTGATCATGGCATAGGA TACAGATATGGTTCGCATCAAGTAGAGAGATGGCACCTTTACTTAGCCTTGTATAAATGT AGCACAGTGCTCTTTCGTTAATTTTGTCAGGAACAATCAAACTGATTAGAGGGCAGGTTT TGTGGTAATGATTTGTTCCATACAACTTCTCACAGTAACGGACTACAGTAATGAATTTTT TTCAGAATAAAATTATCATTTGTAACTTCCCTCAAACAAAGTTGAATGCCATAATATTAG CTGTTCTGTATATTCTGGAGTAGAATGATACTTTAATCACTTTGGATTAAAGTTACAGCT CTGAGCCACCAAATTCTTGAAAGTGTAGTCATAACAAAACAGCTTTGCTCTTTCATTTGT ACCGTTTTTATTGTTGTTGCAATTTGCCATGAATGC >LITCHI017592.m3 TATGGATTGGCGATCGTAAAATTTAGCTGTTTCATTGGTGTCTTAAGGATTCTAGATGGT CAAAAAGCACTGTCTATACTGTTTGGTGCTCATTTTAGGCTGTTCATGTTATCAAATCGT AGGAAGTTGTGTTTTTAATTTGATGTTGATTGTTTCTCGTTAGTTTAGTCGATTATTTGA GAAAATGTGAAACAAGGCGTGATTTTGGCTGTGTGAGCTCTGATTTTGGTATATTTGAAG TAAGAACTGAGTTCGTTTTTTTTGTAGTAGTAATGACAGCTAACCCTAAATTTAAGAATG GATTATTGGATATTGAAATGTGAGAGGTTTTTGGGAGAAACATTCATGCGTCTATAAAGT TGAGGCGGTTGACCAGAATATCCTAGGTTGTGAAAGCTAAAGCTTAGTGATTTTGAAGAT GTCTTGTGATGTAGGTTACATATCTGATCATGTCTTATGCTTAAGCTTATTTACATGAAT TTGGGGTGGGACCTGTCTTTTAACAAAGATGTGTTAGAGTAGAAAAAGTAGACAGTGTGC CTTAGGTAGAATACTAGAAGGTGTGCCCACTTAGCAGCACCTGAACCAGTGACACTGGTT AGATAGAGCTCGACCCAGTCTTGAAAAGGTTCAATTTTGATACCATGTTAGAAAGGGTCT TGGGCCTAACTCTACCACAAAAGTTAACTCATAAGTAAAGGTTTACCCTCACCTTATAAA TCATACAAATTCATCTTTTCAACCGATGTGGGACTATCTAACACTCAGTCTATCTCTATA AGTTAAAATTAAGTACAGGATTGAGATCACAACTTGATGCATTTAGTGTAGTTGAAAGAG TCTATTCCTTGGTTTATGTTACCACTCTACCGCTTCCTATGGTTAAAATAACAACAACAA AAAATAAATGGAATATATTCGTTAAAGAATTTCATGTGTGGTTCATGATTTCATTATTGT CTGCTTGTGTAGGACAAATGGCGAAATATGAGTGTAAGTGCCACCGGACAAGGCCCCCGA GAAAAATCAAGGATGCCAAAAGCAAAAGCCAGCTCAGATTCTCCAGCCGCACAATTGTCC ACTCCACAAACTTTTGCTCTCCCTGCTACAGTTGCACATGATGCGTCAACAGATCCAATC GTAGATGACTCTGCTAGAAGCTCTGCTCCAAAGTATAATGCATTGATATTTGAAGCTCTT TCTGTCTTAAAGGAGCCCAATGGATCTGACATAACTGCAATTCTCAGATATATTGAGCAA AGAAATGAGGTGCCACAAAATTTTAGGAGGCTGCTGGGTTCAAGGCTCAGAAGACTTGTT GCACAAGAAAAACTTGAGAAGGTCCAGAATTGCTTTAAGATTAAGGAAGACAACTCGTTT GAGACAAAAACACCCATCCCAAAACAGAAGGATGTTCGGCCTAGACCATCACAGAGCTCT GACTGTATAAACTCAGTTGATACTGTTGAAGCAGCAGCAGCTACCGCTGCTAGCCAGATT GCTGAGGCTGAAAACAAGTCTTATGTGGCAGCTGAAGCAGTTAAAGAGGCAGAGAGGATT TCAAGCATGGCTGAAGACACATATTCACAGCTACAGTTGCTCAAAGAGATTTTTGAGAGA TGTTCCCGAGGTGAAATTGTGATCATGGCATAGGATACAGATATGGTTCGCATCAAGTAG AGAGATGGCACCTTTACTTAGCCTTGTATAAATGTAGCACAGTGCTCTTTCGTTAATTTT GTCAGGAACAATCAAACTGATTAGAGGGCAGGTTTTGTGGTAATGATTTGTTCCATACAA CTTCTCACAGTAACGGACTACAGTAATGAATTTTTTTCAGAATAAAATTATCATTTGTAA CTTCCCTCAAACAAAGTTGAATGCCATAATATTAGCTGTTCTGTATATTCTGGAGTAGAA TGATACTTTAATCACTTTGGATTAAAGTTACAGCTCTGAGCCACCAAATTCTTGAAAGTG TAGTCATAACAAAACAGCTTTGCTCTTTCATTTGTACCGTTTTTATTGTTGTTGCAATTT GCCATGAATGC >LITCHI017592.m1 AAAAAAAAAAAGAGCCTATTTTCGTGGCAGAGGCAGAGAGCGAGACAGAGAGATGGGAAA TCCGAAGCAGAAATGGACGTCGGAGGAAGAAGAGGCACTGAGAGCAGGAGTTGCCAAACA CGGCACCGGCAAGTGGAAGAACATTCAGAGAGATCCTGAGTTCAATCCCTACCTCTTCTC TCGCTCTAATATTGATCTCAAGGACAAATGGCGAAATATGAGTGTAAGTGCCACCGGACA AGGCCCCCGAGAAAAATCAAGGATGCCAAAAGCAAAAGCCAGCTCAGATTCTCCAGCCGC ACAATTGTCCACTCCACAAACTTTTGCTCTCCCTGCTACAGTTGCACATGATGCGTCAAC AGATCCAATCGTAGATGACTCTGCTAGAAGCTCTGCTCCAAAGTATAATGCATTGATATT TGAAGCTCTTTCTGTCTTAAAGGAGCCCAATGGATCTGACATAACTGCAATTCTCAGATA TATTGAGCAAAGAAATGAGGTGCCACAAAATTTTAGGAGGCTGCTGGGTTCAAGGCTCAG AAGACTTGTTGCACAAGAAAAACTTGAGAAGGTCCAGAATTGCTTTAAGATTAAGGAAGA CAACTCGTTTGAGACAAAAACACCCATCCCAAAACAGAAGGATGTTCGGCCTAGACCATC ACAGAGCTCTGACTGTATAAACTCAGTTGATACTGTTGAAGCAGCAGCAGCTACCGCTGC TAGCCAGATTGCTGAGGCTGAAAACAAGTCTTATGTGGCAGCTGAAGCAGTTAAAGAGGC AGAGAGGATTTCAAGCATGGCTGAAGACACATATTCACAGCTACAGTTGCTCAAAGAGAT TTTTGAGAGATGTTCCCGAGGTGAAATTGTGATCATGGCATAGGATACAGATATGGTTCG CATCAAGTAGAGAGATGGCACCTTTACTTAGCCTTGTATAAATGTAGCACAGTGCTCTTT CGTTAATTTTGTCAGGAACAATCAAACTGATTAGAGGGCAGGTTTTGTGGTAATGATTTG TTCCATACAACTTCTCACAGTAACGGACTACAGTAATGAATTTTTTTCAGAATAAAATTA TCATTTGTAACTTCCCTCAAACAAAGTTGAATGCCATAATATTAGCTGTTCTGTATATTC TGGAGTAGAATGATACTTTAATCACTTTGGATTAAAGTTACAGCTCTGAGCCACCAAATT CTTGAAAGTGTAGTCATAACAAAACAGCTTTGCTCTTTCATTTGTACCGTTTTTATTGTT GTTGCAATTTGCCATGAATGC
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>LITCHI014561.m2 - Up_Stream_Len 2000 ATTAATATTTTTGGACGGTTTTAAGTAAATTGTATAATGATATATAAATTTCAATAGCCA TTTTAACCTTGAAAGAGCCATGTGAGAATCGGCATAAATCACTCAAAATCTGACATTGCA AGTGAGAATGTCTGGAGATATCTACTGTTAATTTCTTACTATTGTCTTATCAACAGAACA GATCCAATAGAGAGCCAAAAAAAAAACTAGTATTTAAAAGATGACAAAGTGGGTAGCTAA CAAGTAGCAACAAGGAGAATTAAATGAGAGGGGAAACCAACCAACCATGATATTGGCATT GTGGTGGCACAATAGGTTCATTAAATGGAAGGAACAAAAATGTCAATACCAAGAATAATA AGAAACAATGAAGTTAAGAAAACAATGAATCTTTGAAAATCAGAGCAACTAAGAGACATC ATCACAAGTTGCATGCTCTTGCTTGCTGCCACAGTCTGAGACATCAGATCCAAACAACAT TCTGTTTGAGAAATCTACCTTTCCTCCAACCAAAAAAATTTTCCTTTTTCTTTGTCTTAA ATATGGCCTGTTATGATATCTCAGCTGACAGACTATAGGCCTGCACAAGAGGACAACCTC CTTTCTACCAATTGACTAATGCTTTTCAGGCCAACCCAAAACACAACAAATTCGGGAAAA CAAACAAAATGAATTAATGAAAGAGAGAGAGAGAGAGACTTACATGGTTAAATTACAGCT CAGTATAATAATCACCGCTACTCTTTGGTCACAGCATAACAATGTAACATAAGAAATATA AGCACAAATATAAACAAAAAGAAGGGCAAAAGAGAGAGAGGGAAATCTCAGTACTCAAAT TGACAAAACAGCAAATATATTAACATCGTTTAAGTTAATAAAACCAAGAACGTGAAGCCA TGAAAACTGAGCACCTGATAAGCTTGATGTGATAATGTCATTGTTTTGTTTGCTTAGCTA AGCTGTCATGAGACCCCATCTGAGGAAGAGGCCCATCTTTGTATACAAAAATAGGTATGC ACTCTTTTCTTTCCAGATCAGATGACAAAAAGGAGGCAAAAAGGAAGATAGACTGACAGA GTGAATTCAGGGAAGAGACCTTGAAATTGATACACTGATAACTACCTTTTCTTTTGTATC ACCCCTTCAATAATTATGTCTTCCAGTGCCTCACCAACTGAAGTCACTTTCATGTATGTC CACATCTGCACAGTAAAAAGGATAAATTAAAAATATTTTACAGTTGGTAACAACAATCCA CATGGGTAGCCTTTGATTTTTTGGTCGAAGAGATTCTATACACAGTCCACTGATGTTGAT ATGAGAGTATGTATATATTGTCATCTCTTTTACCTTACACAGCTTCATGTCATACACCAA AAAAATTTAATGCTCTTTCCTTGTGCATTAAGCCACTTGATATCTTGAAGAGGGTGTTTT TTTTTTTTCGCAAGGACAGGTTGTTCTTCTATATATAATGAGAGCTTTCTCTCCTGTCAG TTTGATGTGATGCTGCTGCTGATCCATTGAACAGTGGAAGCGGGGGCTTGCTGCGTCCAA ATGCAAATGAGTTGTCTTCTGATCTGTTGTTGTTCAGATTTCAACCGTATTGAACCTTAC CAAATCTCAAGTTCCAAAGTGGATACTTAAAGATCAACAAGTTTGTATTTCTCTGGTGCT TGTGGGGGCTCTTAAAAAGTACTTCAAATGACTGCAATTTTTGAAATGCTAATGTGGACT AGATGAAATCCTATTCAATATAGGACCACTTCATCTGTAGTGGAATCTCTTGAGTTCCCA CATCTGAAAATCTAGTCCTAATTCTCATACACACACACATATTTCTACTTCTGAATTGCT TATTGTACTGTTGTAAGAAGGATGAACACTGATTCTTTACTTTGTTTTTGAATAGTTCAA TTGACACCGGTTGTTGTCTTGCTTTTCAACATCAGGTTCAATGTTCGAGTTTGTTGAAGG ACACTTCAAGGTTTTACTCC >LITCHI014561.m3 - 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