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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017569 | Chr1 | 47286532 | 47293006 | + | PHD finger protein ALFIN-LIKE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017569.m1 | 11 | 139 | PF12165.11 | Alfin | Family | 232.2 | 1.10E-69 |
LITCHI017569.m1 | 199 | 248 | PF00628.32 | PHD | Domain | 41.3 | 1.10E-10 |
LITCHI017569.m2 | 11 | 139 | PF12165.11 | Alfin | Family | 232.3 | 1.00E-69 |
LITCHI017569.m2 | 189 | 238 | PF00628.32 | PHD | Domain | 41.4 | 1.10E-10 |
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>LITCHI017569.m1 ATGGACGGAGGAGCGCAATACAATCCGCGAACTGTGGAGGAGGTTTTCAGAGATTTCAAG GGCCGCAGAGCCGGCATGATCAAGGCTCTAACAACTGATGTTGAAGATTTCTACCAGCAG TGCGATCCTGAGAAGGAGAATCTTTGCCTGTATGGATACCCTAATGAACAGTGGGAAGTC AATTTACCTGCTGAAGAAGTTCCTCCAGAGCTCCCAGAACCTGCATTAGGCATTAACTTT GCCAGAGATGGTATGCAGGACAAGGACTGGTTGTCTCTGGTTGCTGTTCACAGTGATGCA TGGTTGCTTGCAGTGGCATTCTACTTTGGTGCCAGATTTGGTTTTGATAAAGCTGACAGG AAACGTCTCTTCACTATGATGAATGATCTCCCCACAATATTTGAAGTTGTGACAGGAAGT GCAAAGAAACAGATAAAGGAGAAGTCATCGGTTTCAAACCACAGTAGCAACAGATCCAAG TCAAGCTCAAAAGGGCGATCTTCTGAATCTGGCAAATATTCAAAGAGTGTGCAGCCTAAG GAAGAAGACGAGGGATTGGACGAGGAGGAAGAAGAAGAGCATGGAGATACCTTATGTGGG GCATGTGGAGAGAATTATGCTGCAGATGAGTTCTGGATTTGCTGTGACATTTGCGAGAAG TGGTTCCATGGAAAGTGCGTGAAGATCACTCCAGCCAGAGCAGAGCACATAAAGCAGTAT AAGTGTCCCTCGTGCAGCAACAAGAGAGCAAGACCGTGA >LITCHI017569.m2 ATGGACGGAGGAGCGCAATACAATCCGCGAACTGTGGAGGAGGTTTTCAGAGATTTCAAG GGCCGCAGAGCCGGCATGATCAAGGCTCTAACAACTGATGTTGAAGATTTCTACCAGCAG TGCGATCCTGAGAAGGAGAATCTTTGCCTGTATGGATACCCTAATGAACAGTGGGAAGTC AATTTACCTGCTGAAGAAGTTCCTCCAGAGCTCCCAGAACCTGCATTAGGCATTAACTTT GCCAGAGATGGTATGCAGGACAAGGACTGGTTGTCTCTGGTTGCTGTTCACAGTGATGCA TGGTTGCTTGCAGTGGCATTCTACTTTGGTGCCAGATTTGGTTTTGATAAAGCTGACAGG AAACGTCTCTTCACTATGATGAATGATCTCCCCACAATATTTGAAGTTGTGACAGGAAGT GCAAAGAAACAGATAAAGGAGAAGTCATCGGTTTCAAACCACAGTAGCAACAGATCCAAG TCAAGCTCAAAAGGGAGTGTGCAGCCTAAGGAAGAAGACGAGGGATTGGACGAGGAGGAA GAAGAAGAGCATGGAGATACCTTATGTGGGGCATGTGGAGAGAATTATGCTGCAGATGAG TTCTGGATTTGCTGTGACATTTGCGAGAAGTGGTTCCATGGAAAGTGCGTGAAGATCACT CCAGCCAGAGCAGAGCACATAAAGCAGTATAAGTGTCCCTCGTGCAGCAACAAGAGAGCA AGACCGTGA
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>LITCHI017569.m1 GTCTACGCTAAGCTCCTTTTTCCCTTAACATTATCCAAAGTCCCGAAAGCTCAATTCTAA AACGAGCATCCAGTGCGCAGGTTAACGCGCTGCGCACCCCCTCTGCAGCCATAAAAAACC CTTACAACTTCCGGGAGGCGAATCCCGTCCCAGTTCAAAGACCTATCATTCACTTTGATT ACATTATAGGACACGTGTACGGCTGGTAATCCATCTGGAAGCAACTACAGATCTGATCAA TTTGCGTACTTTCCTTTTTCTGCAATCGCGGACCCTTTATCTCAACTAAAACCCAGTTTA GAGATCCGTTAAAATCCGTCGGTTCAATGACCCATCAGCAACCGCTTGTCCAGATCGGAA CCAACGAATGGCTGCCACGTGGACACAAGTGTCTTTATCATCCACGTCGGCCCAAAAAAA CAATTAAAAAAACGAAATTACTGGCTGTGGAGGGCAATAATTATTTACACTCTAATCCAC ATATATTTTCCCTCCTGATATAAAAATAAAAAATAATCTGCATCTCCTCCCTGCTGCTCC TATCTTTCTTGAAAACCTATAGATTACCGCTAACATCCAGTTTCTCGGTCACATACTCTC CAATCAATCTGTGCATGCGTTTTCTTTTTTCTCACTGAAATTCAAATTTGGAGAGAGTTC GAGTTTAAGTGTAAGTGAAGAGAAATGGACGGAGGAGCGCAATACAATCCGCGAACTGTG GAGGAGGTTTTCAGAGATTTCAAGGGCCGCAGAGCCGGCATGATCAAGGCTCTAACAACT GATGTTGAAGATTTCTACCAGCAGTGCGATCCTGAGAAGGAGAATCTTTGCCTGTATGGA TACCCTAATGAACAGTGGGAAGTCAATTTACCTGCTGAAGAAGTTCCTCCAGAGCTCCCA GAACCTGCATTAGGCATTAACTTTGCCAGAGATGGTATGCAGGACAAGGACTGGTTGTCT CTGGTTGCTGTTCACAGTGATGCATGGTTGCTTGCAGTGGCATTCTACTTTGGTGCCAGA TTTGGTTTTGATAAAGCTGACAGGAAACGTCTCTTCACTATGATGAATGATCTCCCCACA ATATTTGAAGTTGTGACAGGAAGTGCAAAGAAACAGATAAAGGAGAAGTCATCGGTTTCA AACCACAGTAGCAACAGATCCAAGTCAAGCTCAAAAGGGCGATCTTCTGAATCTGGCAAA TATTCAAAGAGTGTGCAGCCTAAGGAAGAAGACGAGGGATTGGACGAGGAGGAAGAAGAA GAGCATGGAGATACCTTATGTGGGGCATGTGGAGAGAATTATGCTGCAGATGAGTTCTGG ATTTGCTGTGACATTTGCGAGAAGTGGTTCCATGGAAAGTGCGTGAAGATCACTCCAGCC AGAGCAGAGCACATAAAGCAGTATAAGTGTCCCTCGTGCAGCAACAAGAGAGCAAGACCG TGATGCTAAAGAAGTGGGTTTCACCTCTTGTAAATCTCTCGTGTTCAAGTCAATCTAACT GTTTAGTTGGTCAGATTTTCTGTTCCATGCCATGTTGGCCAGCACATGTATTGAATGCCC CAGGTTGTCGAGACTCGGTTACTGGAATGTGTTAGTGTTAGACACTTTGCAGGTTAATGA ACATGTCTTCTATGTGGTGGTTAATTTAAGTGGGATATGTATTTCCATCGTGTAGGAGTG TAGATTTTCTTAATTGCAGAATGGCTGCTCTGATCCCACCTCTATTATTTCCGTCGCTCG TACCTCTTCATGTATGCTAGCGCTGTAGATCGTGCTGATCAGATTGATACGCAGGTTACA GCTTCGAATGTGCTTTAATTCTATTTTCTGTATTTTCATTTTTTACAGTTTTGGGGTTTT CAGTGGTTTTGGTTAGTCCTGGTGCAATTGGAATACTTCCAAACAGATTTAAATGTAGGA GTACTTTTAAAATCGGTGCGTAAATCCATATTATAAATAGCAATATTATTGTCCTAAAGA TTTTCTCTCAATCAAATAGGATATTTATATTTATTAGGGAGATAAAGAGTCTCATCAGTT CAACAAGTTGTTTGTCAAAGGCC >LITCHI017569.m2 GTCTACGCTAAGCTCCTTTTTCCCTTAACATTATCCAAAGTCCCGAAAGCTCAATTCTAA AACGAGCATCCAGTGCGCAGGTTAACGCGCTGCGCACCCCCTCTGCAGCCATAAAAAACC CTTACAACTTCCGGGAGGCGAATCCCGTCCCAGTTCAAAGACCTATCATTCACTTTGATT ACATTATAGGACACGTGTACGGCTGGTAATCCATCTGGAAGCAACTACAGATCTGATCAA TTTGCGTACTTTCCTTTTTCTGCAATCGCGGACCCTTTATCTCAACTAAAACCCAGTTTA GAGATCCGTTAAAATCCGTCGGTTCAATGACCCATCAGCAACCGCTTGTCCAGATCGGAA CCAACGAATGGCTGCCACGTGGACACAAGTGTCTTTATCATCCACGTCGGCCCAAAAAAA CAATTAAAAAAACGAAATTACTGGCTGTGGAGGGCAATAATTATTTACACTCTAATCCAC ATATATTTTCCCTCCTGATATAAAAATAAAAAATAATCTGCATCTCCTCCCTGCTGCTCC TATCTTTCTTGAAAACCTATAGATTACCGCTAACATCCAGTTTCTCGGTCACATACTCTC CAATCAATCTGTGCATGCGTTTTCTTTTTTCTCACTGAAATTCAAATTTGGAGAGAGTTC GAGTTTAAGTGTAAGTGAAGAGAAATGGACGGAGGAGCGCAATACAATCCGCGAACTGTG GAGGAGGTTTTCAGAGATTTCAAGGGCCGCAGAGCCGGCATGATCAAGGCTCTAACAACT GATGTTGAAGATTTCTACCAGCAGTGCGATCCTGAGAAGGAGAATCTTTGCCTGTATGGA TACCCTAATGAACAGTGGGAAGTCAATTTACCTGCTGAAGAAGTTCCTCCAGAGCTCCCA GAACCTGCATTAGGCATTAACTTTGCCAGAGATGGTATGCAGGACAAGGACTGGTTGTCT CTGGTTGCTGTTCACAGTGATGCATGGTTGCTTGCAGTGGCATTCTACTTTGGTGCCAGA TTTGGTTTTGATAAAGCTGACAGGAAACGTCTCTTCACTATGATGAATGATCTCCCCACA ATATTTGAAGTTGTGACAGGAAGTGCAAAGAAACAGATAAAGGAGAAGTCATCGGTTTCA AACCACAGTAGCAACAGATCCAAGTCAAGCTCAAAAGGGAGTGTGCAGCCTAAGGAAGAA GACGAGGGATTGGACGAGGAGGAAGAAGAAGAGCATGGAGATACCTTATGTGGGGCATGT GGAGAGAATTATGCTGCAGATGAGTTCTGGATTTGCTGTGACATTTGCGAGAAGTGGTTC CATGGAAAGTGCGTGAAGATCACTCCAGCCAGAGCAGAGCACATAAAGCAGTATAAGTGT CCCTCGTGCAGCAACAAGAGAGCAAGACCGTGATGCTAAAGAAGTGGGTTTCACCTCTTG TAAATCTCTCGTGTTCAAGTCAATCTAACTGTTTAGTTGGTCAGATTTTCTGTTCCATGC CATGTTGGCCAGCACATGTATTGAATGCCCCAGGTTGTCGAGACTCGGTTACTGGAATGT GTTAGTGTTAGACACTTTGCAGGTTAATGAACATGTCTTCTATGTGGTGGTTAATTTAAG TGGGATATGTATTTCCATCGTGTAGGAGTGTAGATTTTCTTAATTGCAGAATGGCTGCTC TGATCCCACCTCTATTATTTCCGTCGCTCGTACCTCTTCATGTATGCTAGCGCTGTAGAT CGTGCTGATCAGATTGATACGCAGGTTACAGCTTCGAATGTGCTTTAATTCTATTTTCTG TATTTTCATTTTTTACAGTTTTGGGGTTTTCAGTGGTTTTGGTTAGTCCTGGTGCAATTG GAATACTTCCAAACAGATTTAAATGTAGGAGTACTTTTAAAATCGGTGCGTAAATCCATA TTATAAATAGCAATATTATTGTCCTAAAGATTTTCTCTCAATCAAATAGGATATTTATAT TTATTAGGGAGATAAAGAGTCTCATCAGTTCAACAAGTTGTTTGTCAAAGGCC
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>LITCHI017569.m2 GenomeSequence + GTCTACGCTAAGCTCCTTTTTCCCTTAACATTATCCAAAGTCCCGAAAGCTCAATTCTAA AACGAGCATCCAGTGCGCAGGTTAACGCGCTGCGCACCCCCTCTGCAGCCATAAAAAACC CTTACAACTTCCGGGAGGCGAATCCCGTCCCAGTTCAAAGACCTATCATTCACTTTGATT ACATTATAGGACACGTGTACGGCTGGTAATCCATCTGGAAGCAACTACAGATCTGATCAA TTTGCGTACTTTCCTTTTTCTGCAATCGCGGACCCTTTATCTCAACTAAAACCCAGTTTA GAGATCCGTTAAAATCCGTCGGTTCAATGACCCATCAGCAACCGCTTGTCCAGATCGGAA CCAACGAATGGCTGCCACGTGGACACAAGTGTCTTTATCATCCACGTCGGCCCAAAAAAA CAATTAAAAAAACGAAATTACTGGCTGTGGAGGGCAATAATTATTTACACTCTAATCCAC ATATATTTTCCCTCCTGATATAAAAATAAAAAATAATCTGCATCTCCTCCCTGCTGCTCC TATCTTTCTTGAAAACCTATAGATTACCGCTAACATCCAGTTTCTCGGTCACATACTCTC CAATCAATCTGTGCATGCGTTTTCTTTTTTCTCACTGAAATTCAAATTTGGAGAGAGTTC GAGTTTAAGTGTAAGTGAAGAGAAATGGACGGAGGAGCGCAATACAATCCGCGAACTGTG GAGGAGGTTTTCAGAGATTTCAAGGGCCGCAGAGCCGGCATGATCAAGGCTCTAACAACT GGTCCGTTGTTATCTTCCTCTTTTCTTGATTTCTTTTTTTAATATCTGTCTCTTGGGTTT AGGGTTTTTGTATCTTTTTAATTCTAATTTTTCTCTTTTATTCAATTGGTTCTTCTTTCC 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