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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017553 | Chr1 | 47143588 | 47145699 | - | Transcription factor TT2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017553.m1 | 41 | 88 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 50.2 | 2.40E-13 |
LITCHI017553.m1 | 44 | 104 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 43.5 | 3.10E-11 |
LITCHI017553.m1 | 94 | 139 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 53.2 | 2.70E-14 |
LITCHI017553.m1 | 98 | 146 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 29.7 | 6.10E-07 |
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>LITCHI017553.m1 ATGTTAATATCTATGTATGCAGGTTTTTGCCAACAGAGGCAAAATTCAGCAACCAGAGAG TACAACTGTGTCTGTGATAGGATGGGCAGAAAACCATGTTGTGCCGAACAAGGACTCAAT AAAGGTGCTTGGTCTGCTGGAGAAGATAAAATCCTCGTCAACTACATTCAAATTCATGGG GAAGGCAAATGGAGAGACCTCCCTCAAAAAGCTGGGTTAAAGAGATGTGGGAAGAGTTGT AGACTGCGATGGTTGAATTATCTGAGACCGGATATCAGAAGAGGTAACATTTCTGAGGAA GAAGAACAACTCATCATCAAACTACATGACCTCCTTGGTAATAGATGGTCCCTGATTGCT GGTAGATTACCTGGGCGAACAGATAATGAAATCAAGAACTATTGGAACACTAATTTGAGC AAGAGACTGAAACGTGATGGCAAGAGTACGATGCCCCAATGTCAATCCAAAAAGAATGGC TGTTCTAGAAATTCCTCACTGAAGTTAAACTCGGAAGAGATCAAACCACAGCCACCTCGT GTGTTTCGAACCAAGGCAGTCAGGTGCACTAAAGTTGTCATTCCAGGACTGCTTGATTAT GATCAGACGGTGGACAATATTGGTGAGCATAGCCAATCTTCTTCTGCCCTGCAAGAAGAT ACTAATTCAGCTGGTGATCTGTTAATGGATTATGACATTAGCAAACTCTTAATATCTGAT GCTTTAAGTTCAGATGGTTCTCTATTCCAAGCTAATGAGATCAATGGAAGTGGTGATCAT GATGATGATCATAACATGGCTGATGGAGATCTTTATCATCTTAGCCCGTTCAAGAACATG TCATGTTTTCCTGAGTGTTCTGATTCTGCATATAAAGCCATATTTGAAGATCTGATGGAT GAATGTACAATCCCTGATAATTGGATGGATAGATAG
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>LITCHI017553.m1 - Up_Stream_Len 2000 CCACAAAATTCTATTTCATTATTTTTATCTTTCTGTCTGTTCGTTTTCAATAACAATACA ATTAATTTCTTTTGTTCCATTTATTTTCCTTTGCCAATAGTCCACCTCAAAAATAAAAAC CGTTTTCTTTCAAAAAGTTCATCGTTACTTCCAAAAATGTTGTTGGATAATCGCAAGTTA ACCATTTCTCTCTCTCTCTTTTTTTCTCATAAGTAAGATTTCTTATAATCCTTATTTTTT TAAAAAAAATAATTAAGTATACTAAAATATGAATTATGTTTTTAAATTGTGATTTCAATG TATATAAAATCGTTTTTAAAATAGAAACAATTGAGTTTATATTGTGATTTTTTCTTATGA TTTGTGAGGATGAATTTAGACATATAGTCATGATTGTAAGCTTTGTAAATGTCACAATGG CTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTAAAAAAAATATTAATAGTTTTAAATTCAATTATAA AGATATGTAATTTTATTTAATGATCGTATATAATACTGTTTAAGAAAACAAAGGGGTACA ATTAAATTATTTGATTGTTTTGTGTTTGGATTATATATGTTATGGGTATTTTTTGGACTG TAAAAATGGGCTGGTAAAAGTTCAATAAACGGACCCAGAAGGTTAATCCAATAGATAAAG TCTGGGATCCAAGGAGCAGACCTTAGCTCTTAGCTCTCAGCTAGCTAAGCATCCAGCTCA CAGTTAGCTAGCTCAGCTCGCTCAGCTTTCAGCTCTCAGTTAGCAGAATGGAGCTCTCAG CTTTCAGCTAGCTCAGCTAGCTCCAGCTTCCAGCTCTCAGCTCTCAGCTCTCAGCTCTCA GCTCTCAGGTCGAGCTCGTAAATCGCAGCTAGCAAGATGGAGCTCTCAGCTTGCAGGTCG AGCTCGCAGCTCTCAGCTAGTAAGATGGAGCTCTCAGCTCTCAACTAGTTCAGCCTCCAG CTCGCAACTCTCAGGTCTCATACCAGCGAGCTTCATGCTATCTTAGATCCCGAGGAGCAA TTAATGCAGTATGACTATGACAGAATTGTTAATCAATGCAATAAATGATATGTCAGAGTA GTTGATTTCTTTACATGTACATCGCTTAAGTGTAATCTCCCTTCTTCTATAAATAGGAGG GGGAAATTCATTGTAAAAGAGGTGAAAATATTTAGTATTACAGTCACTCTGAAAAAATAT ATTGAGAGTGATCCGTGGATGTAGGCACCATTGCCGAACCACGTAAAAATCTCTGTGCAT CTATCTCTTATTCTTCTTCTCTTCTCTCTTTGGTGTGCTCTTTGATTGCAGGTACTGAGC GTTGAATCATCCGGTCAACCATTTTCACGCGTCGACAATGTACAATTGTCTCTTCTACAG TAGAGATCGGTATTTTTTTTAACTACGAATTTGTAAAGCATCAACTACAAAATCGAACAG TAGATCAATAGTTGAATAATAGTTTAATCATATAAATAGCGAGATGCATATTTGATAGTG TAGATAATGAATTTATCATACAACAGTTATAAAAAATGAAACCAAGAAGAGGAGAGTAGT GAAGATATCGAAATGAAATATAATAAACAAAAAATTTGAGGTTGTAGTATTTATTATTTT TATTAATTATTTTATTAACGCCCCTACTGAACAACTCATTGATGTAGAGAGGTATGTACA CATGTAATAATATAAGTGTTGTCCGGAGGACTTTTACAATTATTGGGAAAAATCTCCGAA CAACCATACAAGTACTAAAAGATTATCTTATACGGAAAGCATATCACATGGGGCGAGATC AATAATGTCCGAAGTTTTTTGGCTTCTAATCTACTACCATGAATGCCAGCACAGTAAAAT CATTTATTGTACCATAGCTTACTTTGTCCTATTATTATCACTGGAAGGGGTAAAGAATTC AAGCTGGTTAAAAGTGAGTGGACAGTAATTGACGTCTGCAATTAAACTCCAAGCAAAAGC TCTTGAATGCCCTTACATAA
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>LITCHI017553.m1 GenomeSequence - CTCTTGAATGCCCTTACATAAATGTTAATATCTATGTATGCAGGTTTTTGCCAACAGAGG CAAAATTCAGCAACCAGAGAGTACAACTGTGTCTGTGATAGGATGGGCAGAAAACCATGT TGTGCCGAACAAGGACTCAATAAAGGTGCTTGGTCTGCTGGAGAAGATAAAATCCTCGTC AACTACATTCAAATTCATGGGGAAGGCAAATGGAGAGACCTCCCTCAAAAAGCTGGTACT ATATATTATCGACTTTTCTTCTCACTGATAATTAATGTCCGCCATGCATTTTGTGAGGAC TTGTTTATACATACAGGGTTAAAGAGATGTGGGAAGAGTTGTAGACTGCGATGGTTGAAT TATCTGAGACCGGATATCAGAAGAGGTAACATTTCTGAGGAAGAAGAACAACTCATCATC AAACTACATGACCTCCTTGGTAATAGGTAATATCTTAATTAATTATTTATGTTTTTCTTC GTATTCTTCTTGTTTAATTTTAATTCTTCTAATGTTTTGATTTTTACCACTTTGACCAGG AAGAATAAATTGAGCCATTAATACTCAAACACTCTCTCTCCATACACATTTAAAAAAAAT AATAATAATAGTAATAATTTCAAGACATTAAAAGAAAGTGAAAAAAAGTTGAAATGATTT TATAATAAGAGCATATCCAATACAAATGTGTATTGTCTTTTGAAAAAAATATACATATCA TCAATGTTAAGAAAATGTTTATTCTATGTGACATAAACATGAATTGATAGACACTCAAAT TTAAAACGGTTCTCCAATGCTATTCTATTCATTTCAATGATAAATAGTCGAACAATAATA TATCATTAAAGTAAATTACCATAAAATATTATTTGATGGAAGTCTCCATCATTTATTACT GACATGGCTATCCAAGAGACTCTGTGAAAATAGATATTAAGGTTGATAGTCTTTATTTTC CTTTTTGTCATGTCAGTTTGATAGTGGTTATGGAAGTTTGCATTTGAGAGATTAATTTTA ACCCTCTATCAATTAATCTTATGTGACACTCCATTTTTTTATAATTCATATTTATATTGA AGATGCTCTAAGTTTCTTAAATATATACATTAAGGTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTCGA AATATTATTTGTAGTTAGAACAAATTAAATTTGCGGTTATTGTTAAACTGAATGAATCAT TTTTACCATCATACCATATTGGATAAATTATTTATATGAAGTTCAAGCAATTATGGCTCG AGATATTGTACTTAATAAGTTAATCAGGAAAATTATTAAAAACTGAAATTTAATAACATG CAGATGGTCCCTGATTGCTGGTAGATTACCTGGGCGAACAGATAATGAAATCAAGAACTA TTGGAACACTAATTTGAGCAAGAGACTGAAACGTGATGGCAAGAGTACGATGCCCCAATG TCAATCCAAAAAGAATGGCTGTTCTAGAAATTCCTCACTGAAGTTAAACTCGGAAGAGAT CAAACCACAGCCACCTCGTGTGTTTCGAACCAAGGCAGTCAGGTGCACTAAAGTTGTCAT TCCAGGACTGCTTGATTATGATCAGACGGTGGACAATATTGGTGAGCATAGCCAATCTTC TTCTGCCCTGCAAGAAGATACTAATTCAGCTGGTGATCTGTTAATGGATTATGACATTAG CAAACTCTTAATATCTGATGCTTTAAGTTCAGATGGTTCTCTATTCCAAGCTAATGAGAT CAATGGAAGTGGTGATCATGATGATGATCATAACATGGCTGATGGAGATCTTTATCATCT TAGCCCGTTCAAGAACATGTCATGTTTTCCTGAGTGTTCTGATTCTGCATATAAAGCCAT ATTTGAAGATCTGATGGATGAATGTACAATCCCTGATAATTGGATGGATAGATAGTGATG CTTTTCAAAACGACATGATAGTTATTAAGAGTAAAGTTCTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGG CTTTTTTTTTTTTTCAATTCAGAAGATAACTAGACTAATTAATAATAATTAAGGTAGTTG AATAATGTAGTTCGAACGATGTAGTTCACTAGCCATCATCGATCTATGCATTATTGGAAA TTAGTGCTCTCC