Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017552 | Chr1 | 47117742 | 47128264 | - | Transcription factor TT2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017552.m1 | 14 | 61 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 52.3 | 5.10E-14 |
| LITCHI017552.m1 | 17 | 77 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 46.2 | 4.40E-12 |
| LITCHI017552.m1 | 67 | 112 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 50.7 | 1.60E-13 |
| LITCHI017552.m1 | 72 | 123 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 25.1 | 1.60E-05 |
| LITCHI017552.m1 | 222 | 269 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 44.9 | 1.10E-11 |
| LITCHI017552.m1 | 225 | 284 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 39.9 | 4.00E-10 |
| LITCHI017552.m1 | 275 | 320 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 51.9 | 6.90E-14 |
| LITCHI017552.m1 | 279 | 326 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 25.2 | 1.60E-05 |
Download Copy
>LITCHI017552.m1 ATGGGTAGAAAACCATGTTGCGCAAAACAAGGACTCAACAAAGGCGCTTGGTCTGTTGAA GAAGATAAAATCCTCATCAACTACATTCAAGTCCACGGAGATGGCAAATGGAGAGATCTT CCTCAAAAAGCTGGATTAAAGAGATGTGGGAAAAGTTGTAGACTGCGATGGTTAAATTAT CTAAGACCAGATATCACCAGAGGTAACATTTCTTTGGAAGAAGAACAACTCATCATCAGA CTACATAATCTCCTGGGCAATAGGTGGTCACTGATTGCTGGAAGATTACCAGGGCGAACC GACAATGAAATCAAGAATTACTGGAATACGAATTTGAGCAAGAGACTAAAAGGTGATCAT GACGAGAAGAGTATGCCGCAACATGAAACCAAAAAGAATGAGTGTTCAAAAAATATCTCA GCCAAGTTAAACTCAGAAGAGAGAAAACCAGAGCCACGCAGGGTGTTTCGAACCAAGGCA TTCAGGTGCACCAAAGTTGTTATTCCAGGACTGGTCGATTGTAATCAGTCGGTGGACAAT GTTGGCGAGAATAGCCGATCGTCTTCTGCCCTACAGGAGGATACTAATTCAGTTGGTGAT CTGGTAATGGATTTTAACTTCCAAATGGGAAGAAGTCCTTGCTGTTCTAAAGAGGGTTTG AACAGAGGAGCTTGGACTGCTCGTGAAGACAAAATTCTCAAAGACTACATTACAAGTCAT GGCGAAGGCGGATGGAGAAACCTCCCCAAAAAAGCTGGTTTAAAGAGATGTGGCAAGAGT TGTAGGCTTCGTTGGTTGAACTATCTCAGACCAGACATTAAAAGAGGAAATATATCTCCA GACGAGGAAGAGCTCATCATCAGGCTTCACAAGCTTCTCGGAAACAGATGGACTTTGATT GCTGGGAGGCTTCCGGGCCGAACAGACAATGAAATAAAGAACTACTGGAACACCAACCTG GTCAAAAAAGTTCAAGATCAATACAGTATCTCTGCTTCCACTCCCAAGCAACGAAAGCAA CATAACAAGTCCTCAAAGTCTCCGTTCAAGATAGGGTCTCATGTGATCAAAACCAAGGCA GTTAAGTGCTCCAAGGTTTTCATCAACCCGGATTCACACAAGATTCAACGTTCTGGCACC AACCCAGATGCGGCAACATCAGTGGATAACAACACACCAATATTTCAATCTGATGCTTAC AATGATACTCCATCGGATTTCATGATGGACTTAAACCCGGAAGATTTTAGCTTCTCGAAT CTTCTAGATTCTGAATTTCCGGATTTAAGTGGCTTCAGTTCTCATAGTGGCAACGAGTTA TCGCCTTCCTCTGATCTCCAACAACCTCTAGTCTTCTCTGATGAGGAAATAATGTTGCTG GATAACTTTTGGACTACTGATAATGATCCTGCTACACAAAATGTAGCTTCATATCTCAGT TCATTTGCCTCGTTATTGGATTCAAGAGAAAAGTGGCTGGGATGA
Download Copy
>LITCHI017552.m1 MGRKPCCAKQGLNKGAWSVEEDKILINYIQVHGDGKWRDLPQKAGLKRCGKSCRLRWLNY LRPDITRGNISLEEEQLIIRLHNLLGNRWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTNLSKRLKGDH DEKSMPQHETKKNECSKNISAKLNSEERKPEPRRVFRTKAFRCTKVVIPGLVDCNQSVDN VGENSRSSSALQEDTNSVGDLVMDFNFQMGRSPCCSKEGLNRGAWTAREDKILKDYITSH GEGGWRNLPKKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPDIKRGNISPDEEELIIRLHKLLGNRWTLI AGRLPGRTDNEIKNYWNTNLVKKVQDQYSISASTPKQRKQHNKSSKSPFKIGSHVIKTKA VKCSKVFINPDSHKIQRSGTNPDAATSVDNNTPIFQSDAYNDTPSDFMMDLNPEDFSFSN LLDSEFPDLSGFSSHSGNELSPSSDLQQPLVFSDEEIMLLDNFWTTDNDPATQNVASYLS SFASLLDSREKWLG.
Download Copy
>LITCHI017552.m1 CTGAAACACCTTTGTCCAAAACCTGCGGTATAAAATAATAATTTCCAGGTAAAAAAATTG TAGCACGGTCCTGGATCGATGTCAAAAATTAAACTCCAAACAAAGGCTCTGGAAAGCCTT GCGTGCATGTATATATACATGTGCAAATGGTCTTTGGCGACAGACGAAAGTGGAATATAC CAACCACCGAGTCTGAGTGTCTTTAGTTAAAAATGGGTAGAAAACCATGTTGCGCAAAAC AAGGACTCAACAAAGGCGCTTGGTCTGTTGAAGAAGATAAAATCCTCATCAACTACATTC AAGTCCACGGAGATGGCAAATGGAGAGATCTTCCTCAAAAAGCTGGATTAAAGAGATGTG GGAAAAGTTGTAGACTGCGATGGTTAAATTATCTAAGACCAGATATCACCAGAGGTAACA TTTCTTTGGAAGAAGAACAACTCATCATCAGACTACATAATCTCCTGGGCAATAGGTGGT CACTGATTGCTGGAAGATTACCAGGGCGAACCGACAATGAAATCAAGAATTACTGGAATA CGAATTTGAGCAAGAGACTAAAAGGTGATCATGACGAGAAGAGTATGCCGCAACATGAAA CCAAAAAGAATGAGTGTTCAAAAAATATCTCAGCCAAGTTAAACTCAGAAGAGAGAAAAC CAGAGCCACGCAGGGTGTTTCGAACCAAGGCATTCAGGTGCACCAAAGTTGTTATTCCAG GACTGGTCGATTGTAATCAGTCGGTGGACAATGTTGGCGAGAATAGCCGATCGTCTTCTG CCCTACAGGAGGATACTAATTCAGTTGGTGATCTGGTAATGGATTTTAACTTCCAAATGG GAAGAAGTCCTTGCTGTTCTAAAGAGGGTTTGAACAGAGGAGCTTGGACTGCTCGTGAAG ACAAAATTCTCAAAGACTACATTACAAGTCATGGCGAAGGCGGATGGAGAAACCTCCCCA AAAAAGCTGGTTTAAAGAGATGTGGCAAGAGTTGTAGGCTTCGTTGGTTGAACTATCTCA GACCAGACATTAAAAGAGGAAATATATCTCCAGACGAGGAAGAGCTCATCATCAGGCTTC ACAAGCTTCTCGGAAACAGATGGACTTTGATTGCTGGGAGGCTTCCGGGCCGAACAGACA ATGAAATAAAGAACTACTGGAACACCAACCTGGTCAAAAAAGTTCAAGATCAATACAGTA TCTCTGCTTCCACTCCCAAGCAACGAAAGCAACATAACAAGTCCTCAAAGTCTCCGTTCA AGATAGGGTCTCATGTGATCAAAACCAAGGCAGTTAAGTGCTCCAAGGTTTTCATCAACC CGGATTCACACAAGATTCAACGTTCTGGCACCAACCCAGATGCGGCAACATCAGTGGATA ACAACACACCAATATTTCAATCTGATGCTTACAATGATACTCCATCGGATTTCATGATGG ACTTAAACCCGGAAGATTTTAGCTTCTCGAATCTTCTAGATTCTGAATTTCCGGATTTAA GTGGCTTCAGTTCTCATAGTGGCAACGAGTTATCGCCTTCCTCTGATCTCCAACAACCTC TAGTCTTCTCTGATGAGGAAATAATGTTGCTGGATAACTTTTGGACTACTGATAATGATC CTGCTACACAAAATGTAGCTTCATATCTCAGTTCATTTGCCTCGTTATTGGATTCAAGAG AAAAGTGGCTGGGATGATGCATTTTAACTGTAGCATACATGTTCATAGATTGATATAATA ATCTTATAATCTTATGCTAATTAATTTTTAGTCAATGCTTTATTTATGACCTTGTAAACT TTTATGTTTTAACATTTTCGTGTGATGTTAGCTACTTGCTAAAGTTAAATTATGAATTAA ATCCTCAATTTTATTTTGAATAATATACATATTATGTGATGATGTAGGAGGGACACAGTC ACACAGTACTACAGAGA
Download Copy
>LITCHI017552.m1 - Up_Stream_Len 2000 CAATGGGTCATTTGGCCTCTGAACGGCTGTGTGACAGTGTCAGTAGCATAGATGAATAAC GAATCCATAGGCATTCGTAATTCATAAATGCATGCCCAGCTACCACAAACAACAGTCCAT AGACAACATTTTTGTTTGAAATCATCTTGCTGTATGTCTCTCATTACGATGAATTGATTG GTGAAATTGATACTGCCAAGAAATCAATACTGAAATTTGTGTTGTAAGACTCTAATGTGC CAAAACTGTCGATGGCCCGGGAGGGAGATTAAAAACACAAAATAAGAAAGAGATTTCGTG GGCCTCAAAACAATTATGTAAGCTACTAGCCTAGTTAAAAGGATTAATTAATTAAATAAA CTATATAACCATGTGCAAATTCCTAATAAAATGTAAACTAATCCAACTTGATTTAATAAA GAATACTTCATTTCGAGAACTTAAAAGTAATATTATGAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGAA ACAGAAAAGGAAAAAGAGTTTATTTAACCCAAAAAAAAAAAAAACAATTTGAAGATTTTC CATACTCTAAATATTAATAAGGGCACATTTCATTTCCATCCTATATTTTAACCTTATTTG ACTTATTATACTATGAATCCATTTATGGTTCATGTAGTCCCTCTCATTATAAAATTAAAT CACTTTAGTTCTTGCGGTTGGTCTAACGTTGGTCAACCACAAAGGAAAGAGAGTAAATTT TATCATTCTAATAAAATTATATTAATTAAAAAAAAAGAAGATAAGATGGATAGTGAAAAT CAAAAGTAATTAAAATAATTAAAAATTAAAATAGATAAAAAGAAAAATGATATACACTGT CTATTTCTAAAATGAATGTTGAAGATTAAAATTTATTACAATTTTTCACATAATTAAACA AAATTGAAAAAGAAAAAAAATTTGATTGACTAAATCGACCACTAATATGAAAATTAGATC GATGTCCATATGTTAACTAAGTCAATCATTGATTTGGTTGAACTAGATCGTTTGAATGAT CTAGTCCTGGATTGTTTAATTAATCTGACTTCACTAGATCATCCTTCAATTTAGTTTAAA AACCAGATTGATAGTTGATTTGTATGAACCAGATCGACTATTTTTTTACCATGCGGTGGA GGCTTTGTTGCATGATGGAGCGGGTCCTTCATTGTTGACGATGGAGGTTCCTTATAGGAC GTTCATTATCAGTGAAAGTTTTAGTAAAAATGACTAAAATTATGTATTTTTAAAATGTCA GGGACCACACTACCATTAGTTGTTAAAAGAAGTAACATTAAAACAGGGACCACGCTATTA TTAGTGGATTAGTAGTTAAAAAAGTTAAATAACGTTAAAATATTTTATATATGGACAGAG ATATATAATCTTTTATATTTTAATATCATTTTATAAATCATTTTATTATTTTTTTAAAAA ATAATTAATCTATTTACTGAAAAAGGCACGCTAGTAGTTGGGCCATGGCTTCAAAGGTTA GAATACCTGCTCCCATACAAGTGATGCACTGTTTTATACCCAAATAATATAATCCTTATC ATTAATTACGTGGGTCTCCCTTCACTTTATATGGATCCTCCATTTATGTGTGGGGTATTC CCTCCTGTATGAGAGCTACTTTATAGGTTACATCTTAAAATTAAAATTCTGTTTGATCTC GATTGATTCTTAACTTGTATCGATCATTAAATATATATATATATATATATAGAGGCAAGA CTTTTTGCTTCTCTACGGAATCAACGGATAGAACGAAAATGGAGATAACTGAAACACCTT TGTCCAAAACCTGCGGTATAAAATAATAATTTCCAGGTAAAAAAATTGTAGCACGGTCCT GGATCGATGTCAAAAATTAAACTCCAAACAAAGGCTCTGGAAAGCCTTGCGTGCATGTAT ATATACATGTGCAAATGGTCTTTGGCGACAGACGAAAGTGGAATATACCAACCACCGAGT CTGAGTGTCTTTAGTTAAAA
Download Copy
>LITCHI021537.m1 GenomeSequence + ATGGTGAAGTCTGTAGATACACCAAATCAGCACCACTTGATGACTAGTGCTTCTGATAAA AACAAACACAAGGAGAAAATCCTTGAAATTCCTGATACAACTTACCAGGGTTTTCAGGAT AGTCATCATCGGCAGGATCAGGCCCTTGTTTCAGACCCTTCAATATTTGGGTCCCAACAA ACGGTTCAGGCACCTTCTGCATCAACTACCAAGTTTCCCATCACACAAAATCACCATTTT GCATGTTGTGATGGTGAATCTGGAAAGAGGGTGATTTATGCCTCCAATCCTACATCTATT AGGGAGAGGACTAAAGTTCCACTTAGTCACTTCACTACGAGAACGGGGCCTCGGGTTTCA TGGACAAAGGAACTACATGACCGTTTTGTTGAGGTTATGAGCGAGCTTGGTGGGCCTAAT AGTGAGTAACCTATATACGTAACCTGTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGTGTTTCATTT TTCTTTTGTTGTTGATGATGATGATGATGATATACATAACGTTTCATTGGAAAAAAGCTA CTTGGTTTTCTTTTTCTCTTGAAAAGTTTGATAAGCTTTTTGTCCTTTTTAATTATTTTT CTATCTTTCAAGATTATCATCACCAGAAGCAAAAGCTTGTTGGTTCTTCTTTGTCACCTT TGCATGCCTGTGACTGCTTTGATTTGATTTTATGCTGATTTTGATGAATTTTATACAGAT GTGGGTAGTGGTCATTTTTACTGATGAACTGGGTTTTGATGATCATCTGCTTACATGTGA TAACACTTTTTTTTTGAATGGTCAAGAGATCGTTACAAACTTGATGAGGTCTGGTTATTC TTCAATTTCAAATCCAACCATATCTTTTTAAAGGGTGATTTAATGATTTTTTCCTGCTAG AAACTTGAATTCTCTTTTTGTGGGTTGAATCCTTCACTTTTTATTTCATCTTTTGTTATG TTTATTGGAATTTGTTTAGGGTTGGGTAGTGGTGTTAGATTTCATTTTGGCTACATTTGC CACGCTAGATTAGAATGAAATGAATTGGAATGGAATGAAATAGATTGAATTATATTGAAA AAGTACTGTTTCATGTGTGGTAGAATTTAAAATTAGATTAAAATTATATAATATTATGTT TGGTGTAGATTAGGATTGAATTAGAATAAAATAATTTATTTATAAAAAATGAAAAAAAGG AAAAAAAAAAAAATAGAGATAATCTGGGTTCCCACCATCTTCATTTGGGCATCATCTACC CCAATTCATTAACATCATCTCCCATTGTTTTCAACATCATCAACAATATCATAACATCAT CTTTCACAACAACAACAACATTAGCAAAACAGTTTGTCAAAAAAAAAAAAAATCAAATGA GTTAATAAAAAAACACATCAAAACAGTGGGACAACTTCATCTTCATTTGGATTTGACTGA AACCTAGACGATGTTCATCTGGGTTTCAATCGAACCCAGATGATTGCAACCTCACAAAAA GTTTAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAGAGAAGAAGGTAGAGTTGTCCTTGGTTGTTGCTGCT GGTTAGTCACCATGAATGGAGGAGGAGATGATAGAGACGAGAAGTGGTCTGTGATGGTAA AGTGGGCGTGGTGGATATGAGAGAGAGAGATGAAGAGTACTATGTGAAGAGAGAGATTGT GTTTGATGAGAGAGGAAGAATTAAAATAATAATAATAATAAGGATTCTTGTGTTGACTAG AAATGGAAACCCAAGCTCCATTTCCCACGTTGAGTGGGAATGGTGGCGGATCCGAGAATG AAAAATTTATTTTCCGTTCGGGCTCCAAATGTAGGATGTGGAAGAATGATAAAAAATGAA TTCTAATCCCACCTTTATTGCACGTATCAAACATTGCTTTTGGGATAGTGCAGTTAACAA AGATTATTTTGCTTTAAATTTTATATTTATTTTCGATAAATTACATAAAACTAAGGTAGC AAAGTTCTTATATTCTATCTTTTTGTCTAAACACTAGTGTTCCCCCTCATGTCCAAATTG TTTATGCTTTACATCCTTCTTTCCAATATGTGATTTGTTAATACTCACGATTTTATGGTA ATCTTCAAAGTATGTCTTTCTTAAAAGTTGTTGATGAAATCCTTGTCGGATTGAATAAAA AGTGCATAGGATTTTAATTGTTGTTAACAGAATTTTTTGTCGGACTGATAAAATTAAATT CCGTTATGATGAACTTTCAATATACTAGGAAATTTCTTACACGTGATTGCGGCAAGTATT TAGTTTGTCATTTCGCTCTTTCAATGATTAAGTACAACATTAAGGCTATTTCGTGATGTT CGATAATTTAATTTTAAAATCATTTCATATGTTTTTGATGATGTTTGTCGTATTACAAAA AACATTTTAAAAAAATTGAATATCATTACGACATATTTGTTACTTCTTCAACACACATTT GTGTGATGTCAGTCAAGTAATATCACTACCTTGCATATGTATATAGCATATATTACACTT TGTTTGTTAATGACATTAAATATGTTATCTCAATATTAGCTAGGTGATTATTATTGAAAA CATGACATATTATTCACTGATTGTATATGTATATATACCAAAACTGTATTACATCATTCA TGTTCAAACACTTACTTCTTCTCTCAAAATGAATCTTTACCAATTATCAAAAGTATCCAA CAACTAAAGTTACGAAACTTTTTAGTAATTCATTGACGTATGATATATCATGAATTACTT CATTTCATGTGATATATTTGCAGAGGTAACGCCTGAAACTTTAAGACAAGCCATGGCCGT TGAAGGCCTAACTAGAGTTCACTTGAAGAGCCGCCTTCAGGTACTACTTGTTATTAAAAC ATGTTGAAATTTCAAACCTAATTGTTATTATCATTTTCACTAACCACTGATTTTTCATCC ACTATTACAGAAGTTTAGAAATGGAAAAATTACAGTGACAAATTGGCGCGAACGTAAGTT TCATAATATATATACCTTGATAGTAGGAAGAGATTAGTTATACATAAAATATTAAATCAT TAATGAACCACTAATATAAGAAACGTAATGAGTCATATATTTTTTAAGAAATCTAATATA AAACCAAGCTGACCGACACAATTATCTTTTATAATTGTAGCAAATAGTGTGCGTTCATAT ATGTTAAAAGATGATTAAACTTTTATTTTTAATACTGTTGAATTGGTTCAGATCAAAGCT CAAATAAGTCTAGACGGAAGAACATTCCACTTCAAAGAGCGCTACACCAGCAACTTCAAG TAAGTACTTTAACTAATTATTAGAGAATAAACTCTAAACTTGAATTTTAAGTTGTTAAAT GTATATGATGAATGAGATTTATTTGGTAGTTTTAACACATAACAACTAATATATATAAAT CTAATCGATCATAAATATTTAACTACTAAGAATTCAAGAACTGACTTTTATGTTTGAATT TCTATAGGAATGATTGATTACATCTTTTTATTCAAAATCACAATTTTCGAATCAAGTAAA TTCTTTTATTAATTATACGAACTCTAGACTTGAGTTCTAGGTTATTAAATACATCTAATA AAAGGGATTTGTTTGTCAAAAAATCTCAATAATACTAAGAACACAAGTTCTATATTTTAA AATCAGGACATCTTGAACCAAAAGGATCAAGATCCGCTGAACTTAAAAGAAGGTTTGGTT TGAAAAATCTAAATTTTCCATTATGTGAGCTGAAACTAATTAGGTGTGCTTGTGATTTGT TTCCACTTCATATTGAAATTATCACTGTTGCAGACTGCAGAGGTCAATTTGGATGATCAA AATGTGGACACAGAAATATTGCGTCCTACCCAGCGGGAGTCGTACTTCGAAATATACAAT TCATTGGAGAAATGTCTACGTACCGAAAACGATGTTTCCAGTGCCGCTTCTAATGGTAAC CTACCAAATCATCAGGTGGTCAATCCACCTGATCATTCTGCTGTAAATGGAGTTTTCGGG GACATTGCCTCCCTCCAGGTGCCTGAGACTGCAACAACAGATACTGTTCAGACTCCAAAT GCCATTGCTTCGTCCCCATCTTGTGTGGCCAAGTTTTGCTTACCGATTTCAAACGCTAAT GCTACCTCTTCTTGCGCAGCCTATGGTCCAACATCGAATGAAAATTCGAAGGCTTCAACC GCTTTATCATGCACTGCCACTAAGTTGCCAACCTCGAAAGGAGGCTTCTCTCCTACTGCG TATTTGGATGAATACATGGCAGCGCTGGATGCTTTTAAGAAGAATATGCGGGGGATTGCC TCGGAGGTCGCTTTGATGAACCGCCTCATTTCTGATATGGATGTTTCAGATTCTCCTGAC TTCAACAAGACATTCAAATATCCTGGAGTACCTAGTGATGAGAGGAGATAG