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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017538 | Chr1 | 47002930 | 47006861 | + | N-alpha-acetyltransferase |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017538.m1 | 144 | 267 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 43.1 | 4.50E-11 |
LITCHI017538.m1 | 209 | 270 | PF08445.13 | FR47 | Family | 29.9 | 4.40E-07 |
LITCHI017538.m1 | 210 | 271 | PF13673.10 | Acetyltransf_10 | Domain | 40.2 | 3.20E-10 |
LITCHI017538.m1 | 210 | 268 | PF13508.10 | Acetyltransf_7 | Domain | 33.8 | 3.50E-08 |
LITCHI017538.m2 | 145 | 250 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 21.7 | 0.00019 |
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>LITCHI017538.m1 ATGTCAACCACTTTGGTTCATAGACCTGAATTCTTCAAATTTCCTCACCATGGATTTCGA AATCATCACAAATTCCCCTCTGTTTCCGCCTCCTGGACCATGAACATGGATTCTAAATCT TCCCGTACGGTGAAAAAGGAAGAGCTTTCGATACAGGTGCCAGGGCCGGCCATTCCTCAG GTGGAATCTTTAAGATCTTCTGATCTGAGATTCGATCGGCTACAACCATCGGATCTGGAA TTGCTTCAACCAAACAGATTGGAATTCGGCAGATTCGTTGCACGAGAAGCTGTTCTTGAT GAGGAATATTGGACAGCAGCATGGCTCCGAGCTGAAAGCCACTGGGAGGAGCGTACTAAT GAACGATATGTTGAAAACCACAAAAGGAAATTTGCGGAACAGGAGTTCAATGCCATTAAA AGGCGATGTAGAGAGCAACATGGGCGGAATTTTATGTGCATTGTCACGGTAAAGAAGGAG GAGAAGAATGTGAAACGCACTATACTGAAAAGTGTAGTTGGAACCCTTGATTTGAGTGTC CGGCATTTGTTGCATGGAGAGACCTTTCCAGGGGAACGAATAAAGGCTCCTTTCTTCAGC TGCATCAACAAAACAGATCCGAATAGATATGGTTATGTTGCTAACCTATGTGTTACCAAA TCAGCACGTCGCGAGGGCATTGCAAGCAGCATGCTTCATTTTGCTCTCGAATCAGCCAAA TCTAATGATGTTCAGCAGGTATACGTGCATGTGCACAAAAACAATAGACCAGCACAGGAC CTGTATCAAAAGATGGGTTTCGAGATGGTTGAAATGGCGAGCTCTCAATTGCCAGAGCAG ACTGACTTGCTCTGTATCAAGCTATAG >LITCHI017538.m2 ATGTCAACCACTTTGGTTCATAGACCTGAATTCTTCAAATTTCCTCACCATGGATTTCGA AATCATCACAAATTCCCCTCTGTTTCCGCCTCCTGGACCATGAACATGGATTCTAAATCT TCCCGTACGGTGAAAAAGGAAGAGCTTTCGATACAGGTGCCAGGGCCGGCCATTCCTCAG GTGGAATCTTTAAGATCTTCTGATCTGAGATTCGATCGGCTACAACCATCGGATCTGGAA TTGCTTCAACCAAACAGATTGGAATTCGGCAGATTCGTTGCACGAGAAGCTGTTCTTGAT GAGGAATATTGGACAGCAGCATGGCTCCGAGCTGAAAGCCACTGGGAGGAGCGTACTAAT GAACGATATGTTGAAAACCACAAAAGGAAATTTGCGGAACAGGAGTTCAATGCCATTAAA AGGCGATGTAGAGAGCAACATGGGCGGAATTTTATGTGCATTGTCACGGTAAAGAAGGAG GAGAAGAATGTGAAACGCACTATACTGAAAAGTGTAGTTGGAACCCTTGATTTGAGTGTC CGGCATTTGTTGCATGGAGAGACCTTTCCAGGGGAACGAATAAAGGCTCCTTTCTTCAGC TGCATCAACAAAACAGATCCGAATAGATATGGTTATGTTGCTAACCTATGTGTTACCAAA TCAGCACGTCGCGAGGGCATTGCAAGCAGCATGCTTCATTTTGCTCTCGAATCAGCCAAA TCTAATGGTAAGATTAAATATGCATCTGTTGTTAAAAAAACGGTTGAGTTTCTGCAGATG ATGGAAGGTAGTAAGAAATTTCTTTCTGATCTGAATTTTGGGGCTCAGATGTTCAGCAGG TATACGTGCATGTGCACAAAAACAATAGACCAGCACAGGACCTGTATCAAAAGATGGGTT TCGAGATGGTTGAAATGGCGAGCTCTCAATTGCCAGAGCAGACTGACTTGCTCTGTATCA AGCTATAGAAATTCATTCAACACAAATTGTTGA
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>LITCHI012844.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACCAACTTCTATGAAGAAAAGAAGATTGGAAACTAAATTAGTAAAAATAAGGAAATTGCA GCGGCAGTGAGGTGAAGATCAAGAATATCATTTTCAGTTTTCAGATTCTATATCAGATTA TTTGAGGGTACAACCATGATTCAATGACTGTTGTTTACATGATATATTTTCAGGTACCTC AAGAAAATGATGGCATTGCAAATTAATTAAAGATTGTAACATGGCCGCATCCTTTCTCTG AAAAGCAATAGAGAACTGTAAACAATTGATGGTAATGGAACAATTTGCAATAGAGGAGAA CTGGAAACAATTGAGGGTAAGGGAACAATTTTTAGAAGACAAATAATGAGGATGTATGTC ATGTGCAAAGAGAAATTCAGTTCTTGTTTCTCAATTAATAGCTTCCATTTGCATCATTTT TGGCTTGTGCTACTCTATAGTTTTTTCTTCACTACATAGCCTTAATTCCTATTTTTTTCT CTCTTCTTTTGTTTATTTTTTTCATTCTTAAGTTTTCTGTTATCTGATGATATATAGATG TTAGATGATTCTGCTAACAGAATTGAATAAATCTTTAATAGCTTCTGAAGAGGCATGTAA ATCATAAAATAAAGTGTAAAATTGTCCTACTAACTTAGAAATTGAGATAATTTATTTGTT ATTGCTCTACATATTTCAAAGAAAGATGAGGATATTGAATTATGAATTGGTTGATATGTG AACATAAATGTTATTGGTGAGAAAAGGAGAAAGAATAATATTCATTTTAGACTAAGAAAA TTTTGGACTAGTACTCCAAATATTTAATTACTTAAAAATTATTGAATATAAACAATTTTT TATATGAAAAAGTAACGTAGAAAAAAAAAGCCAGTTTGATTATACATGAAAATCCTTTAA AGGGTTTATATGCTTGAATCATATAATATAAAACAACCTAAATTTTTTACTTAAAAAGTG ATTTCAACATAAGTTAAAAAGTGATTTAAACGTCCATCTATTTTTTTTCACTCAATCTAA GAGTAATGCAAAATTGATAATTACGTCCTTTAAATTGAGTGAAAATAGATGGAAGGATGT TGAAGTCACCTTTTTATATAAAAATTTAAGTTATTCTAGCTTAATCCATTAAAAATATAC AAGTTTTTTTTTTTTTTTAATGGATTAAATTATTAACACATATAGTTAATCGCTTTGGTG AATATTTGATTAAAAGAATTACTAAGTTTGATATACACAAATAAATAAGATTGTTTAAAT TTCTAGCAGTTTAAGATTGGTACTTTGTGGAACTATCATCAACTTAATAATGTAAGGTTT TATAGTACATTAAAAAAAAAAAGTCTTAAAAATTATGTTTTGGATAAAAGAAAAGTCCCT ATCAATGGAGATCCACTTGATCTCCATCGCGTTTTATCTCCCTAGTCGATGGAAATCAAG GTGGTTGCCATTGTTGGAGACCAATCTCCAACGGTGGAGATAGTGGTCTTCAATCGCCTA GTCTCTTTCGTATGGAGATAAAAAATTTGTTCTATAATGGTTCCTCCGATGGAGTTCTAA TAATTTTTTAAAATAATGGTTTTATTTTATTTTTATAGAAAATTGAATGGACAATTTTAT CCCTAATTATATAGATAATCCTTTAACAGCTGGTTAACAATGGCGGTATAGGTATTTGTG TCTTACACTTTTACTCTTGAAAGTTCAAGAGAAGTTGTAATTAAGACAAAACTTATCATA TTGGTAGAGTTTCATCCAACTTTAAGGGACTTTTGAATAATTTTCAAAAACAAAAAGATA AAGGGTAAAAAGGGAAAAGTCAAAAAGAGAACATTAGATTAGGGTAAGGATAGAAATGCC ACGTCGAAGCGGACCTGGGATGCCCTATAAAATGCCAACATCGGATTCACATTGCTTCAT AAATTGTGTTTGCAAAGCATCGACGAGTCCAAATCAATCGATCAAATCCCACCCCGATAT TTTCTAGTTGATCTACAAAA
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>LITCHI012844.m1 GenomeSequence + CCAACATCGGATTCACATTGCTTCATAAATTGTGTTTGCAAAGCATCGACGAGTCCAAAT CAATCGATCAAATCCCACCCCGATATTTTCTAGTTGATCTACAAAAATGGCCGGAATCGG ACCGATCTCGCAAGACTGGGAGCCCGTCGTCATCCGGAAGAAAGCCCCCTCCGCCGCCGC CAAGAAGGACGAGAAGGTCGTCAACGCCGCCCGTCGCGCCGGCGCCGATATCGAAACCGT CAAAAAATGTATATTTATATACCCCTTCTCTTTATTTTCTTTTATCTTTTCACTATCAAT TTTTGTTTTGATATTCTTGGCTTTGGAGAAACCCCATAAATTTAGAGTTTCTTTGTTTAG ATTCTTTTTGAGCAATAAATATCTTGAGCTATAGTTCTTTGATGGATATGATGTTCTTTG GATTTAATTTGAAATTTATTTGAATTAAAGTTGAAGTCCTTCCTTTTGTGTTTGTTTATG TGATTTTGAATTGTATTTGTTGTATCATGAAACGAAACAAAAATGAAATTAATAAGATGG GTGTCTAGTTGTTTGAATCATTGCGATATTGATGGTATCTACATGAATCCGGGTTAGTAG ATAGGTTGCTTCTCAATTTGAAGTAATAGATTGGAATTTATTTGTATTTCGGTTAAAGAT TTATAAATTGTAGTATGGAAACTATATGAAGTGTAATTGCTTATGTCTCTGATTTTTCTG CTGCAGCAAGTGCCGGCACAAACAAGGCTGCATCGAGCAGCACTTCCCTGAATACAAGGA AGCTTGA