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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017373 | Chr1 | 45460949 | 45464222 | - | Protein NLP1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017373.m1 | 319 | 366 | PF02042.18 | RWP-RK | Family | 69.3 | 2.20E-19 |
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>LITCHI017373.m1 ATGGCAGATCCTAGGGCCTTTGTCCCCTACAATGACCCATATGAGAACTCCTATACAGAC GACATTCGCAATATGTTAAACGCCCCAGATGTTGCTTTTGCTAATTTGTCGTTGATTGAG GAATCATATATGCATCCGGCATCTTCAAGTGTTCCTCAATCCAGTGTTGATATTGGGGGT GCTGAGGATCCATTTAATGACCCCATTGTATGGGATGCTCTTAGCAGGTTGGCTGCAGCG AATTCTCAAGCGGGTCCTTCACAACATTCCGCCGAAACGAGTACTCAACTGAGGCCAGAG AATGCAACTTATGGTAACATGTGGTATCAGCAGAGGCCAGGGAATGAAAATCATGGTAAC ATGAGGCCAATTCCAGTCTGGCCAGTGCCACCAGTGCCATATCTCTGTAGTTGTTGCCTT GTGCTTAGAGAAATAATTCATACTAGTGCCACAAGTCGTGATACTACAAAATTGGAGATT CATGGAAGACTTGGTCTAATCTGCCATGCTATTCTTGAGATTCGACAAAGAACAAGTGCA AATCAGTACCAAATGTTCGATTTTTGCAAGAAGAGCATTGAGGATGTGAAGAATTTTCTT GTTCAGTATTGTGATGAGCGAAAACAAGCAGGATTTTTCATGCTGCCAGATCCCCTCTCT TTCTTCTATGAAACCTTATGTGTTGGGTTGGATAGACATGATGATCTAACAGTAGATGAT TATAATACTCAACCACCGATGGCAAATTTAGATGATTATGATATTCAACCACCAATGGAA AATTCAGATGATTATAATACTCAACCACCAATGGCAAATTTAGAGAATTGTAATACTAAT CCACCTAAGGCAAATCCAGGAGCAAATGAAATAAATCATCAAGTAGCGGTGGTGAATGAG CCAGAGAGAATTCCAAGGACCTCTCTTGCAAGACAGAGGATGAGAACGGGAAAGTTGTCA TTGAAAGATTTTGTACAAGTTTTTCATCTTCCCATTGAGGTGGCAGCCAGGGAGTTAAGG TTATGTCCAACTGTAGTGAAAAAGATATGCCGCAAATATAATTTGGATAGATGGCCTTAT AGAAAGATAAAAAGCATTCGGAGAAAAGTAAAAAATTTGGCACCAAGATTAGCTTCAAAT GATGCAGAAGAGAGGGCTGCTGCTCAAGCTCAATTGGACAGACTTCGCAATGAATTGCAT AAAGCATGTGCTGGGGTCATCCCTAAACGACTATCGACAATATAA
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>LITCHI017008.m1 MAFLLLCGGSYETMLYLFLLSSLLSQVSLTSITDPYTISIDPFGPDSCTNGTLICMGSVT AGNGYLSLTPELENGNSTLPLNTFGRVLFNRPVAAWPATITTTFTVRISKFPNTTKAGDG LAFIMAQDNSPPPPHSFGSYLGIMDASTKDGVVRQLAVELDTYMNEFDPDANHIGIDTTS LTNPVAAVSLNSTGIDLKSGKDITVKIDYDGWVKILRVSIAYAGNPLIGVLNQSILMSET VPSSVYVGFTASTGSVPESHRVLNWVFTSIPLPFDSLKYGQSKKDKTRTVLVIVVPVLIG LLLVGSCSFPFARRKVKNKKEKMKKKVDIESRARTAANVPKMFSYNQLQKATHNFSRENL LGKGGFGSVFKGTLSNPTTIVAVKKISATSHQECDNPVVHRDVKPNNVMLDTEHNAHLGD FGLARLIQNDSCATTMLAGTPGYLAPEVGFSGKATPESDVYSFGMVVLEVVCGRRSRGIL EENSLVDHVWNLYARNALLECVDKQLGDKFDEKQVKRTLIVGLACLHPDRTFRPKIRKVV QVFLNPNEPLMNLPESRPNAVYVSVCLPNHDAYTWHMDYTVQRGDTWKNISSKFGSFVVE KPEKTLIPSQIVTLDLLCGCSESSTIDVVTYKIESGDTLYTVCSRFMADVNETAKLNHLA NPNLIFAGDILLFNKFNFFMYKLTSFITDTIVRKKSKPQIGVVVGSTLAALSTILVAVAL VFWKYCKRKGTRRSIICPRRADCMHCYLDSCPFHRKSEESMVSSCSSEKATVFPYHEVCD ATSNFSTSLKIGQGSYGCVYHGKLKGNDVAIKQMKNSNSKEFLSELNVLCKVRHSNLIEL IGYAAGGNSLFLVYEYAENGALSDHLHKPEIKGYKPLAWTARVQIALDAAKGLEHIHEYM KPYYVHRDVKTSNILLDANFHAKIADFGLVKLLEHSPDDAATASRIVGTFGYLAPEYVRD GCVTTKSDVYSFGVVLMELITGQPALSRDAIPGNDSYSERRSLVDHMLAALNGTENIMTE LTNFLDPKLTHYHKDSILQMALLAKDCVDDNWRRRPDMSNVAIRLSLILISSKEWEKEEC IYKSQHYT.
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>LITCHI017008.m1 CCCATGTATGTTTAATTGAATATGGCCTTCTTATTATTATGTGGTGGCTCCTATGAAACA ATGCTTTATCTTTTTCTCCTCTCCAGCCTCCTATCTCAAGTTTCCTTGACCTCTATAACG GATCCTTACACCATCTCCATCGACCCCTTCGGTCCGGATAGTTGCACCAATGGAACCCTA ATTTGCATGGGCTCGGTGACTGCAGGTAATGGGTACTTGAGCCTCACTCCGGAGCTCGAA AATGGCAATTCTACGTTGCCACTTAACACATTTGGTCGGGTTCTGTTCAACCGACCTGTG GCCGCCTGGCCGGCCACGATTACCACCACCTTCACTGTTAGGATTTCAAAGTTCCCAAAC ACAACCAAGGCTGGAGATGGATTGGCGTTTATCATGGCTCAAGATAATAGCCCCCCACCA CCACATAGCTTTGGATCGTACCTTGGAATTATGGATGCGAGCACTAAAGATGGAGTGGTG CGTCAGCTAGCAGTTGAGCTAGACACTTACATGAACGAATTCGACCCAGATGCAAACCAC ATCGGCATCGACACAACAAGCCTGACCAACCCAGTTGCAGCTGTGAGTCTAAACAGCACC GGAATCGACCTCAAGAGTGGTAAAGACATTACCGTCAAAATCGACTACGACGGATGGGTC AAGATCCTCCGAGTCTCCATAGCATACGCAGGGAATCCACTTATCGGCGTCCTCAACCAA TCCATCCTCATGTCGGAGACAGTTCCAAGCTCCGTTTACGTTGGTTTTACAGCCTCTACA GGGTCTGTACCGGAGAGCCACCGTGTCCTCAACTGGGTGTTCACGTCAATACCATTGCCA TTTGACTCTCTCAAGTATGGACAGTCTAAAAAGGACAAGACGAGAACCGTTCTGGTCATT GTGGTTCCTGTTCTGATAGGACTGTTGCTTGTTGGGAGCTGCTCTTTTCCATTTGCTAGA AGGAAAGTGAAGAATAAAAAAGAGAAAATGAAGAAGAAAGTGGACATTGAGAGCCGAGCT AGGACAGCTGCCAATGTGCCCAAAATGTTCTCCTACAATCAGCTGCAGAAGGCCACTCAC AACTTCAGCAGAGAAAACCTGTTGGGAAAGGGTGGATTTGGAAGTGTTTTCAAGGGCACC TTGTCAAATCCTACTACAATTGTAGCTGTCAAGAAGATCTCCGCAACATCACATCAAGAA TGTGACAACCCTGTGGTTCACCGTGACGTGAAGCCTAACAATGTTATGTTAGACACCGAA CACAATGCTCATCTAGGGGATTTCGGGCTTGCCAGGTTGATCCAGAACGATTCATGTGCC ACCACCATGCTAGCCGGAACACCAGGATACTTAGCCCCTGAGGTGGGGTTCTCAGGAAAA GCCACCCCGGAATCTGATGTGTATAGTTTTGGAATGGTGGTACTCGAAGTAGTATGTGGG AGAAGATCAAGAGGGATTTTGGAAGAGAATAGTTTGGTGGATCATGTGTGGAATTTATAT GCAAGAAATGCATTGCTTGAGTGTGTGGACAAACAGCTAGGAGACAAATTTGATGAAAAA CAAGTGAAGAGAACATTAATTGTCGGGCTGGCTTGTTTGCACCCAGATCGTACATTTCGT CCCAAAATAAGAAAAGTTGTACAAGTCTTCTTGAACCCCAATGAACCTCTCATGAACTTG CCCGAATCCAGGCCTAACGCTGTTTACGTATCGGTCTGCCTGCCTAACCATGATGCGTAC ACTTGGCATATGGACTACACGGTCCAACGTGGGGACACATGGAAGAACATCTCATCAAAA TTTGGATCGTTTGTGGTGGAAAAACCAGAGAAGACATTGATTCCATCACAAATTGTGACT TTGGACCTCCTATGTGGTTGTTCTGAGAGTAGTACTATTGATGTTGTGACATACAAGATT GAATCCGGGGATACTCTATATACAGTTTGTTCGCGGTTTATGGCTGATGTGAATGAGACT GCCAAGTTGAATCATTTAGCCAACCCAAATCTTATATTTGCAGGAGATATCCTTTTGTTC AACAAGTTCAATTTCTTCATGTATAAACTTACCTCCTTCATTACAGATACAATTGTCAGG AAAAAATCAAAGCCTCAAATTGGTGTTGTGGTTGGAAGCACCTTAGCTGCCCTTTCCACC ATACTAGTAGCAGTTGCACTTGTTTTTTGGAAATATTGTAAAAGAAAGGGAACTCGACGA TCAATAATTTGTCCAAGGAGAGCAGATTGCATGCACTGTTATCTCGATTCATGCCCTTTC CACAGAAAATCTGAGGAAAGCATGGTTTCATCTTGTAGTTCAGAAAAAGCTACTGTTTTT CCTTACCATGAAGTTTGTGATGCAACTTCCAATTTTAGTACATCGTTAAAGATTGGCCAA GGATCTTATGGATGTGTTTACCATGGAAAATTAAAAGGAAATGATGTGGCCATCAAGCAG ATGAAAAACTCAAACTCTAAAGAGTTCTTGTCGGAGCTGAATGTACTTTGCAAAGTTCGT CACTCAAACTTGATTGAGCTTATTGGGTATGCAGCTGGTGGGAACTCTCTATTTCTTGTA TATGAATATGCTGAAAATGGTGCATTGAGTGATCATCTGCACAAGCCTGAGATAAAAGGT TACAAGCCTCTTGCTTGGACTGCACGTGTTCAGATTGCTCTTGATGCAGCTAAAGGTCTC GAGCATATACACGAGTATATGAAACCTTACTATGTCCATCGAGATGTGAAAACAAGCAAC ATTCTCTTAGATGCGAATTTCCATGCCAAGATTGCAGATTTCGGACTAGTAAAGTTATTA GAGCATTCTCCTGATGATGCAGCTACAGCATCTAGAATTGTTGGCACATTCGGTTACCTT GCCCCTGAGTACGTACGAGATGGGTGTGTGACCACAAAAAGCGATGTCTATTCCTTCGGA GTTGTTCTCATGGAACTTATAACTGGCCAACCAGCACTTAGTAGAGATGCAATTCCTGGA AATGACAGTTACAGTGAACGTCGCTCTTTGGTGGATCATATGTTAGCAGCATTAAACGGA ACCGAGAATATCATGACAGAGTTGACAAATTTCTTAGATCCAAAGCTCACCCATTACCAC AAAGATTCAATTCTGCAGATGGCACTTTTAGCCAAGGATTGCGTAGACGATAACTGGAGA CGACGTCCGGACATGTCAAACGTTGCGATACGCCTTTCACTCATATTGATCAGCTCCAAG GAATGGGAAAAAGAAGAGTGCATTTACAAGTCACAGCATTATACTTGACATTCTCAAAGC CTCATTGAACCCATTTTTGTTCTTCCATACTCACATGTCCAAGTCAAGCGATTAAAGGTA TTAATTACAATAAATATACAGTTGACTTCATTGTCAGGTGGACCATCCATGTGAAATGGT ATGTAGAAATTAACCCCATCGGACTACTGCTTGTGCTTCATTGAAAAACAAGCTCCTCTC AAAATCCTACAGGTGTTGATTTCAAAATCATGAAAAGATATTCTATCTTTTGTTTATACT AGAATCGATTGAATTGAAAAATGAACGATTTGTGGTCGTGATGTCACAAACAGAAGTTTA AATGTAATTTACTATATGATGTCTCTTGCTGAAAAGAACTTATTGAATGTTATTATGCAT CAAGCTTAAGATATTTTAGGGCCTTCTAATTTGCAATCTGGATATAATTATCTGTTTTCA AAAGGGAAG
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>LITCHI017008.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACTACGCCCCCAATATCAATAGTACTAAGCATAGGGTCTATATGTAAATTGGTATCCCAA TTTTCTATGTAATAATTTAATTAATGATATATAACAAAAGAGATAAATCATCATTAATCT TTATTTATTTACTTATCGAATAACATATCAATATATTGAAATATAAGTTGGGATTTTAAT TGAGAGAATTAGCATTGTTATATTTACATACACCATATTATAGACAACTCTTCATCATAA TTGTATATGATTTTGCATTTTTACTAAATTTTATGGAAAATATCACATCACATTGTAATT TCAAAACTTCATTTTGTGAAAATGTCACATCATATTTCTATAAAAATTTTATGCACAAAA TTACCTGATGTAGAATCAAACACTTAATAGATCGGATGGCCCCATCTCTGGTCCTCAAAT TTCCAATGGAAAAAGTCAGCATTTTATAGTATGAATATGTGTGTTACTTCTTATGTTATA TGACCCTCGCACACCCATGTCCTTGCTTTCTCCTGATTTACAGAATTAATTTTCGCAATC TCTAATAAATTTACCCTTAGAATTAAACTTTTGTGTATGTATGTTTCTCAATTTCTTAAT ATTTAAAAATTTATACCAATAGAAGTTTAGAAAAAAACAGAATTTTATATTTTGAACAAA TTATTATTATTAATATTATTTGTTTATTTCTAATAACAGGTTAGAGGACCCCCAGTACAT ACAAGAACTAAGCCTAGACAGGAATTTGCAGCGGACTTTCAGATTTTTAATTGTCCAAAA AAGAGAAAATTCCACCTAAACCCCTTCAAAAAATAGCGCCTTTCTTTTTAACAAAATGAG AGCAAAACCTAGGACAAAACATAAGACTTCCAATCAAGACAAACCTTGAAAACATAAACC TGAGCTTTTGTTTGCAAGTTTTTGTGACATCCTTAAACATGATTTTGCTTCTTCAATCTC TGCCAGTGGATTAACGTATCATATTATTGGTACCAAGGTTCGGCAGTTTGCTGTGGAGTT GGACAGTGTCACAAATGAGTTCAATATAGATAGAAACCATCATGTTCGGTTTTGACACCA CAAGCGCAATAAATCTGTTATACTGAATTAAAGGTCATTTATTATTCTTTATGTGTTAGA AAAAAAATGTAAGAAGAGAATACTATAACTCCTCAAACAGAGGGAACTTGAGTTGACCTC AGAAGTACTAGAAGAAAATGGAGGTTAAAATGAAGTAGCTAGCCAAGTAAAATTACATAA ATACTCTATACACCATTAGTCCTTGCAAAGCCGCTATTTCTTATCTATTTACCAGTACCT ATTCAGCAGTGATCTAAACTGTATTAAGTATCCATGTTTGTACCGTCTGAAAGCGCCAAA ATACCAATTTTCATTTGTTTGCCACAAATTACTTTCATGACCTGTCTCAAGAAATTTTTC GCATTACTTTGAATGTGAAATGACAAATTTCTCAAAAATTAATTTCATGCATAGTCAACA TAATACTACGAATCCAGAAAAATGAAATCAATTACATACGCTACTTAAATTCAGGGTATG AATTTACTGGTGGACTATTTAAAGCATACAAAATTAGTGCAAAAATAAGGTCAAATGTAC TGGAAGTTTTTACTTTTCATAAAACAAAAATGTTTAATTTCTTGTGTCTTTTCTTCAGTA AAACAAAGGGTCAGCTTTGGTTACTGTTGAAAGGGCTTAATTTTGTCTACATATATATCA CATATCATTTCTTGTAAGAGCCAAACTAAGACAAGAACTTGCACAAATTAATATCTTGAG TTGCAAGTCAACTGTTCCTGGATATAGCTTCATATGCATACAAGAACTAGAATCTAGGTA GCCGAATTGTCCAAAATTCCTTGGAAACAATGTTTTCACTAGATATTGAACCAAAACAAA CAATAGCAACAAAATAAATTTCCATTAGTTGATAATAATAACACTTTCTATATATATATC CCATGTATGTTTAATTGAAT
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>LITCHI017008.m1 GenomeSequence + CCCATGTATGTTTAATTGAATATGGCCTTCTTATTATTATGTGGTGGCTCCTATGAAACA ATGCTTTATCTTTTTCTCCTCTCCAGCCTCCTATCTCAAGTTTCCTTGACCTCTATAACG GATCCTTACACCATCTCCATCGACCCCTTCGGTCCGGATAGTTGCACCAATGGAACCCTA ATTTGCATGGGCTCGGTGACTGCAGGTAATGGGTACTTGAGCCTCACTCCGGAGCTCGAA AATGGCAATTCTACGTTGCCACTTAACACATTTGGTCGGGTTCTGTTCAACCGACCTGTG GCCGCCTGGCCGGCCACGATTACCACCACCTTCACTGTTAGGATTTCAAAGTTCCCAAAC ACAACCAAGGCTGGAGATGGATTGGCGTTTATCATGGCTCAAGATAATAGCCCCCCACCA CCACATAGCTTTGGATCGTACCTTGGAATTATGGATGCGAGCACTAAAGGTTAATATCTT CAAAGAAATCTATACTTCCATAGTTCCATCATTATTTGTGTCATTGAATAGGTTAATTAA TCTTCAAATAAGTTAATTATGAAGTTCATCTTGATCAATACTTGAAGGGTTATATTGTCT ATAAATATTTAATACAACATAATTGTTTTAGGTAACTATAGAGATTTATGCTCTCATTGA GTTTTTAAAGATCTTCTAATATATGAACATTTTAAAAATTATGACTAAAAAATACAGTCT TTTTATTATCTATCTTTCCAATAGTTAATTGATCAAAAACATCAAATATTTTTAAATACA ATTTCACATTATATGTATCCGAATTGATCCATCTCATTTAGTTAACTTTTTAAATTTATA ATTGATTTCTGAGTGAAAATTTCAAAAAATAACATCAAAATTAGTATGAGTTTTAACATT 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