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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017369 | Chr1 | 45450487 | 45453172 | - | Protein NLP1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017369.m1 | 348 | 395 | PF02042.18 | RWP-RK | Family | 69.1 | 2.50E-19 |
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>LITCHI017369.m1 ATGGCAGATCCTAGGGCGTTTGTCCCCTACAATGACCCATATGAGAACTCCTATACAGAC TACATTCGCAATATGTTAAACGCCCCAGATGTTGCTTTTGCTAATTTGTCATTGATTGAG GAATCATATATGCATCCGGCATCTTCAAGTGTTCCTCAATCCAATGTTGATATCGGGGGT GCTGAGGATCCATTTAATGACCCCATTGTTTGGGATGCTCTTAGCAGGTTGGCTGGAGCG AATTCTCAAGCCGGTCCTTCACAAAATTCCGCCGAAACGAGTACTCAACTGAGGCCAGAG AATGCAACTTATGCTAACATGTGGTATCAGCAGAGGCCAGGGAATGAAAATCATGGTAAC ATGAGGCCAATTCCAGTCTGGCCAGTGCCACCAGTGCCATATCTCTGTAGTTGTTGCCTT GTGCTTAGAGAAATAATTCATACTAGTGAACTTGTTTTATGTGCTTTTGTATTGAAATTT GCTCTTTATGGTATAGCCACAAGTTGTGATACTACAAAATTGGAGATTCATGGAAGACTT GGTCTAATCTGCCATGCTATTCTTGAGATTCGACAGAGTACAAGTGCAAATCAGTACCAA ATGTTCGATTTTTGCAAGAAGAGCATTGAGGATGTGAAGAATTTTCTTGTTCAGTATTGT GATGAGCGAAAACAAGCAGGATTTTTCATGCTGCCAGATCCCCTCTCTTTCTTCTATGAA ACCTTATGTATTGGGTTGGATAGACATGATGATCTAACAGTAGATGATTATAATACTCAA CCACCAATGGCAAATTTAGATGATTATGATATTCAACCACCAATGGAAAATTCAGATGAT TATAATACTCAACCACCAATGGCAAATTTAGAGAATTGTAATACTAATCCACCTAAGGCA AATCCAGATAATTATAGTACTCAACAACCAGTGACAAATTCTTCAGGAGCAAATGAAATA AATCATCAAGTAGCGGTGGTGAATGAGCCAGAGAGAATTCCAAGGACCTCTCTTGCAAGA CAGAGGATGAGAACGGGAAAGTTGTCATTGAAAGATTTTGTACAAGTTTTTCATCTTCCT ATTGAGGTGGCAGCCAGGGAGTTAAGGTTATGTCCAACTGTAGTGAAAAAGATATGCCGC AAATATAATTTGGATAGATGGCCTTATAGAAAGATAAAAAGCATTCGGAGAAAAGTAAAA AATTTGGCCCTAAGATTAGCTTCAAATGATGTAGAAGAGAGGGCTGCTGCTCAAGCTCAA TTGGACAGACTTCGCAATGAATTGCATAAAGCATGTGCTGGGGTCATCCCTAAACGACTA TCGACAATATAA
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>LITCHI017369.m1 MADPRAFVPYNDPYENSYTDYIRNMLNAPDVAFANLSLIEESYMHPASSSVPQSNVDIGG AEDPFNDPIVWDALSRLAGANSQAGPSQNSAETSTQLRPENATYANMWYQQRPGNENHGN MRPIPVWPVPPVPYLCSCCLVLREIIHTSELVLCAFVLKFALYGIATSCDTTKLEIHGRL GLICHAILEIRQSTSANQYQMFDFCKKSIEDVKNFLVQYCDERKQAGFFMLPDPLSFFYE TLCIGLDRHDDLTVDDYNTQPPMANLDDYDIQPPMENSDDYNTQPPMANLENCNTNPPKA NPDNYSTQQPVTNSSGANEINHQVAVVNEPERIPRTSLARQRMRTGKLSLKDFVQVFHLP IEVAARELRLCPTVVKKICRKYNLDRWPYRKIKSIRRKVKNLALRLASNDVEERAAAQAQ LDRLRNELHKACAGVIPKRLSTI.
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>LITCHI017369.m1 ATGGCAGATCCTAGGGCGTTTGTCCCCTACAATGACCCATATGAGAACTCCTATACAGAC TACATTCGCAATATGTTAAACGCCCCAGATGTTGCTTTTGCTAATTTGTCATTGATTGAG GAATCATATATGCATCCGGCATCTTCAAGTGTTCCTCAATCCAATGTTGATATCGGGGGT GCTGAGGATCCATTTAATGACCCCATTGTTTGGGATGCTCTTAGCAGGTTGGCTGGAGCG AATTCTCAAGCCGGTCCTTCACAAAATTCCGCCGAAACGAGTACTCAACTGAGGCCAGAG AATGCAACTTATGCTAACATGTGGTATCAGCAGAGGCCAGGGAATGAAAATCATGGTAAC ATGAGGCCAATTCCAGTCTGGCCAGTGCCACCAGTGCCATATCTCTGTAGTTGTTGCCTT GTGCTTAGAGAAATAATTCATACTAGTGAACTTGTTTTATGTGCTTTTGTATTGAAATTT GCTCTTTATGGTATAGCCACAAGTTGTGATACTACAAAATTGGAGATTCATGGAAGACTT GGTCTAATCTGCCATGCTATTCTTGAGATTCGACAGAGTACAAGTGCAAATCAGTACCAA ATGTTCGATTTTTGCAAGAAGAGCATTGAGGATGTGAAGAATTTTCTTGTTCAGTATTGT GATGAGCGAAAACAAGCAGGATTTTTCATGCTGCCAGATCCCCTCTCTTTCTTCTATGAA ACCTTATGTATTGGGTTGGATAGACATGATGATCTAACAGTAGATGATTATAATACTCAA CCACCAATGGCAAATTTAGATGATTATGATATTCAACCACCAATGGAAAATTCAGATGAT TATAATACTCAACCACCAATGGCAAATTTAGAGAATTGTAATACTAATCCACCTAAGGCA AATCCAGATAATTATAGTACTCAACAACCAGTGACAAATTCTTCAGGAGCAAATGAAATA AATCATCAAGTAGCGGTGGTGAATGAGCCAGAGAGAATTCCAAGGACCTCTCTTGCAAGA CAGAGGATGAGAACGGGAAAGTTGTCATTGAAAGATTTTGTACAAGTTTTTCATCTTCCT ATTGAGGTGGCAGCCAGGGAGTTAAGGTTATGTCCAACTGTAGTGAAAAAGATATGCCGC AAATATAATTTGGATAGATGGCCTTATAGAAAGATAAAAAGCATTCGGAGAAAAGTAAAA AATTTGGCCCTAAGATTAGCTTCAAATGATGTAGAAGAGAGGGCTGCTGCTCAAGCTCAA TTGGACAGACTTCGCAATGAATTGCATAAAGCATGTGCTGGGGTCATCCCTAAACGACTA TCGACAATATAA
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>LITCHI017369.m1 - Up_Stream_Len 2000 CGAGGAAATGGCAATGCGAATTGCCTGTGAAGTGATCAATAAGAAATATGTTGTTAATCT AGAGAGCTTTTCAGTTCTTGTCAAGGAGTTGTGTGCAAAGGAGAAGGTCACTGAAGCTGA AAAAGTCTTTCAATTGTGTAGTAGATGTGCTGAAGTTGATATAGGGAGTTACAGAAGGGT ACTTGACGAACATACAAGTGTTTGTTCAAAGAACCTGTACTAAATACGGAGAGAATCTTG AGTATCTAACAAAGCTACGAATTTTGTATCACTGGCAATCTTGTTAACCATGTCAGCATT TTTATCAACATCTTTAGTTTTTAATAATGCCTGCAAAGAAAAAAAACAAATATAACATAT TCTCACTACATCCAATTATATTTTGTTAAGTAGAGATGACAATATACTGATCTCTATCTT AATAAATATAAAATTAACTTTCAAAAAATTAAAATTTTAAATTTTATAAATTATATGACG TAATACAAAAAATATATATTTTTTAAGAACGTGATACAACATAATTAAATACATTTTATT TTATTTCTTGTTAAGTTGATACCAACTAAACTAGAGGTTAATTAGATTTAATCAAATTAA AGATATCTTAAAATTTATTAAAATCAAATATTAATTATATGGTTCGAATATTTATTCTAC CGGCAATTATTGATGGTGACAATTGACCATTTACATTTTATTAACAATGTCTCATGGAAG ATTTGCCGACAACAAAAGCCTAAAACAAAGAAAGTCCAGACATGTTGCTTTTATTGTAAT TTGCAAGGGGTAACGAGGGTACAAATTAAAAACCAGTTAGTGGTTCATTTTCAAATCAGA ACATCCACTCTGGCAAGCTATTAGCCACCTCAGCGACCATTAACCACAGAATTCAGTGAG TCTGTAATAAGATGACGTGGCGAGATCTGGATGGCAAATTTGCGAAAGTTGCATCATACT GGGTCGCCGATGCAACCCACGCGTCAACTTCCAAGTGGACCATGGAGCCTTATTTTGTTT ATTTATTTTGGTTTCCACCAAAAATAGTCTCGAAATGGGCCGAAACAGAAACGACATCCG GTTCACGGACTCGTACCGCATTTATCAAATCCAGTTAATGAATCCACTTTGATTTCCGAT TCAAATACAGACACCCACCCACCCAACAGACCCAGACCCAGTTTTGCGTTGCGTCTCTCT CTTTCTCTCGGGGGAGGTCAAAATATTTTCACATCATTATTCTTTCCCTTCTTTACTCTC AGTCTCAGTCTCTCTGCTATTCGATCTCTCCTTCATTTCCTGGACTCGAACAGTGAAAAA AAATAAATAGAAGAGTTGTGAAGTCGAAATCGATTGGGTGATGGACGGAGGTGCAGGCTA CAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAGGGCCGCCGAGCTGGCATGAT TAAAGCCCTCACCACTGGTCCTCTTTTTCTTCTCCTACTGTCTCTCTCTCTCTCGCTCTC TCTCTCTCTTTTTAATTATTATTTATTATTATTGTTGTTGAATTGATGTATTTAATTTTT ATTGTTTGGTGGTTTTTTTTTTCTAATGGGGACTCGATTTACTTGGTCGGTTTCATTCTA GAGGCCGTGCACCCACAATTGCATCCATCCGATTTAGAGACATCGATATAGTTGATCTTT GATTTCGTGGTCCAGGCTTCTTATCAAGGAATCCACACCACCAAATCATCACTCAAAAAT TTCATTTTTCGGGAAGAAAAAAAAAAAGTCAACCGACTGTCACAACGGTCATTAACTGTC TCCGGCGCCTACTCCATTTTCACTCACACCTCTTCAAACATATAAAAATTCCTGAATCCA AACATCCACCTACTTGATTCACTTCACACACCGTGGTGGCGCTTCCATTCAGCGCCACCA CCATAAACCAGCAAATAACACCAACACCCCCAAGAAAAAAAAGATCTTCACTTCATAAAA AATCATATAGTTTCCTAGGC
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>LITCHI017369.m1 GenomeSequence - ATGGCAGATCCTAGGGCGTTTGTCCCCTACAATGACCCATATGAGAACTCCTATACAGAC TACATTCGCAATATGTTAAACGCCCCAGATGTTGCTTTTGCTAATTTGTCATTGATTGAG GAATCATATATGCATCCGGCATCTTCAAGTGTTCCTCAATCCAATGTTGATATCGGGGGT GCTGAGGATCCATTTAATGACCCCATTGTTTGGGATGCTCTTAGCAGGTTGGCTGGAGCG AATTCTCAAGCCGGTCCTTCACAAAATTCCGCCGAAACGAGTACTCAACTGAGGCCAGAG AATGCAACTTATGCTAACATGTGGTATCAGCAGAGGCCAGGGAATGAAAATCATGGTAAC ATGAGGCCAATTCCAGTCTGGCCAGTGCCACCAGTGCCATATCTCTGTAGTTGTTGCCTT GTGCTTAGAGAAATAATTCATACTAGTGGTATGTTACTTGTTACATTATATTTTTTTTTT GCTGTAGAACTTGTTTTATGTGCTTTTGTATTGAAATTTGCTCTTTATGGTATAGCCACA AGTTGTGATACTACAAAATTGGAGATTCATGGAAGACTTGGTCTAATCTGCCATGCTATT CTTGAGATTCGACAGAGTACAAGTGCAAATCAGTACCAAATGTTCGAGTAAGTTTGATTC CTGTTTTTACTTATTTTTATATTCAGTTTACTTTGGTTATAGAAGAATCTCTATTTTGCT TCGATGTTGTTGATGTTTTGTTGTTATTTTTTATCGATTGTGGAATAAAATCCGGTTATA TCTTCTCTAAATCATGCTAGGCTTGCTTCTTGTTTTATTTCTTCTGTTGTTTAAACGATC TTCGTTTTGAATTGATTGAGCAATGTATTTCATGATCCTTGAATTTTTGAATTTAAGCGT CGGTATTCTGTTATTGTTCTTTTCTTTTATCAGTTTTTGCAAGAAGAGCATTGAGGATGT GAAGAATTTTCTTGTTCAGTATTGTGATGAGCGAAAACAAGCAGGATTTTTCATGCTGCC AGATCCCCTCTCTTTCTTCTATGAAACCTTATGTATTGGGTTGGATAGACATGATGATCT AACAGTAGATGATTATAATACTCAACCACCAATGGCAAATTTAGGTTTGGTTTGCTTATT TTTGTTACAAAATGTTCTTTTGCATGTTCATTTTTTCTTTAGAATTTTTTCAGGAATAAA ATACTTATGACTTATCATTTTGCTTACTTGAATGTTTACAGATGATTATGATATTCAACC ACCAATGGAAAATTCAGGTTGGTTAACCTAGTTAGTGAATTTTCGTGAAGTTCTTTTGCT TCTAAAGTACCATTCATGTTATAGAATATTTTATTGTATGCTCATTTTTTCTTATAATTT TTTCAAGGAAAGAATACTTATGAGTTAATACATTATTCATTTGAATTTTTACAGATGATT ATAATACTCAACCACCAATGGCAAATTTAGGTTGGTTTGCCTGCCTAGTGAATTTTTGTG AAGTGCTCTTTGCTTCTAAAATGTCATTCATGTTACAGAATATTATGTTGTATGTTCATT TTTTTCTTGGAATTTTACCAGGAAAATAATGCTCACGATTAACACATTATTTACTTGAAC ATTTACAGAGAATTGTAATACTAATCCACCTAAGGCAAATCCAGGTTGGTTCGCCTGTCA AGTGAATTTTTATGAAGTTCTTAGCTTTTAAAGTGTCATTCATATTATTATAATATTTTA TTATATATTCATTTTTTTAGAATTCCATAAAAAAAATATCTATAATTAAAATATTATTTA CTTGAATATTTACAGATAATTATAGTACTCAACAACCAGTGACAAATTCTTCAGGTTGGT TTGCCTGCCTAGTGAATTTTCGTGAAGTTCTTTTTAGTGTTATTTATGTTACATAATATT TTCTTGTATGTTCATTTTTTTTAAAAAATTTTTCCAGTAAGGAAATCAAACAATACTTTT GAGTAAGCACATTCCCCACTTGAATATTATTCAGTTCACTAAGTGTTAGATGCTATTTAT CAGTACCAACATTAGCATCTTTGAACTTATGTTTAATTTTCAGCAGGAGCAAATGAAATA AATCATCAAGTAGCGGTGGTGAATGAGCCAGAGAGAATTCCAAGGACCTCTCTTGCAAGA CAGGTTATCATCAAGGCTGTTATTCTTTGACGTCTATAGATATTATTGTCATTTTCTTAA ATTTCTTGGTCTCCAACTTGTAAACTTTTGTTGTGCTTGTGAGTAGCACAGAGGATGAGA ACGGGAAAGTTGTCATTGAAAGATTTTGTACAAGTTTTTCATCTTCCTATTGAGGTGGCA GCCAGGGAGTTAAGGTTATGTCCAACTGTAGTGAAAAAGATATGCCGCAAATATAATTTG GATAGATGGCCTTATAGAAAGGTCTGTTACTTTCTTACGTTTCTTTCTCAGATTCTGTTC CTTCTAATATAAATACAAGTTGTTGTTGTTGTGTCTAATGTATATTTTGTTTATTTTCCA CATGTAGATAAAAAGCATTCGGAGAAAAGTAAAAAATTTGGCCCTAAGATTAGCTTCAAA TGATGTAGAAGAGAGGGCTGCTGCTCAAGCTCAATTGGACAGACTTCGCAATGAATTGCA TAAAGCATGTGCTGGGGTCATCCCTAAACGACTATCGACAATATAA