Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI017366Chr14543740845442468-PHD finger protein ALFIN-LIKE 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI017366.m111139PF12165.11AlfinFamily231.71.50E-69
LITCHI017366.m1200249PF00628.32PHDDomain41.69.00E-11
Download   Copy
>LITCHI017366.m1
ATGGACGGAGGTGCAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAG
GGCCGCCGAGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCAC
TGTGACCCTGAGAAGGAGAATCTTTGTCTTTATGGGTTTCCTAGTGAGCAGTGGGAGGTA
AATTTACCTGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCGGAGCCTGCATTGGGTATCAACTTT
GCCAGAGATGGGATGCAAGAAAAGGACTGGTTATCTTTGGTTGCTGTCCACAGTGATGCT
TGGTTACTTTCTGTGGCCTTTTATTTTGGTGCTAGGTTCGGGTTTGATAAAGCTGATAGG
AAACGTCTTTTTAATATGATAAATGAACTTCCGACAATATTTGAGGTTGTTACAGGGACA
GCCAAGAAACAAACAAAGGAAAAATCTTCAGTCTCAAATCACAGCAGCAACAAATCTAAG
TCGAACTCAAAGCGTGGTGCTGAATCTCAGACCAAGTATTCAAAGACAGTGCAATCAAAG
GATGAGGAAGAGGAAGCCTTAGAAGAGGAAGATGATGAGGAGCATGGTGAGACATTATGT
GGGGCTTGTGGAGAGAACTATGCAGCTGATGAATTCTGGATTTGCTGTGATGTCTGTGAG
AAATGGTTCCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAG
TACAAATGCCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCACGCCCTTGA
Download   Copy
>LITCHI017366.m1
MDGGAGYNPRTVEEVFRDFKGRRAGMIKALTTDVEEFYQHCDPEKENLCLYGFPSEQWEV
NLPAEEVPPELPEPALGINFARDGMQEKDWLSLVAVHSDAWLLSVAFYFGARFGFDKADR
KRLFNMINELPTIFEVVTGTAKKQTKEKSSVSNHSSNKSKSNSKRGAESQTKYSKTVQSK
DEEEEALEEEDDEEHGETLCGACGENYAADEFWICCDVCEKWFHGKCVKITPARAEHIKQ
YKCPSCSNKRARP.
Download   Copy
>LITCHI017366.m1
CATTTATTTTTTACGAATTCGTGTCGGAACCCATATTGCCACCCCTAGTTGGTGGTTCAT
TTTCAAATCAGAATATCCACTCTGGCAAGCTATTAGCCACCTCAGCGACCATTGATCACA
GAATTCAGTGAGTCTGTAAGAAGATGACGTGGCGAGATCTGGATGGCAAATTTGCGAAAG
TTGCATCATACTGGGTCGCCGATGCAACCCACGCGTCAACTTCCAAGTGGACCATGGAGC
CTTATTTTGTTTATTTATTTTGGTTTCCACCAATAATAGTATCGAAATGGGCCGAAACAG
AAACGACATCCGGTTCACGGACTCGTACCGCATTTATCAAATCCAGTTAATGAATCCACT
TTGATTTCCGATTCAAATCCAGACACCCACCCACCCAACAGACCCAGACCCAGTTTTGCG
TTGCGTCTCTCTCTTTCTCTCGGGGGAGGTCAAAATATTTTCACATCATTATTCTTTCCC
TCCTTTACTCTCAGTCTCAGTCTCTCTGCTATTCGATCTCTCCTTCATTTCCTGGACTCG
AACAGTGAAAAAAAATAAATAGAAGAGTTGTGAAGTCGAAATCGATTGGGTGATGGACGG
AGGTGCAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAGGGCCGCCG
AGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCACTGTGACCC
TGAGAAGGAGAATCTTTGTCTTTATGGGTTTCCTAGTGAGCAGTGGGAGGTAAATTTACC
TGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCGGAGCCTGCATTGGGTATCAACTTTGCCAGAGA
TGGGATGCAAGAAAAGGACTGGTTATCTTTGGTTGCTGTCCACAGTGATGCTTGGTTACT
TTCTGTGGCCTTTTATTTTGGTGCTAGGTTCGGGTTTGATAAAGCTGATAGGAAACGTCT
TTTTAATATGATAAATGAACTTCCGACAATATTTGAGGTTGTTACAGGGACAGCCAAGAA
ACAAACAAAGGAAAAATCTTCAGTCTCAAATCACAGCAGCAACAAATCTAAGTCGAACTC
AAAGCGTGGTGCTGAATCTCAGACCAAGTATTCAAAGACAGTGCAATCAAAGGATGAGGA
AGAGGAAGCCTTAGAAGAGGAAGATGATGAGGAGCATGGTGAGACATTATGTGGGGCTTG
TGGAGAGAACTATGCAGCTGATGAATTCTGGATTTGCTGTGATGTCTGTGAGAAATGGTT
CCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAGTACAAATG
CCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCACGCCCTTGAATGGTTGCTCTGTGTGTATTCTGGCA
TTATTGAGCTTCTAACTGTTTAGTAGGTTTGTTATTAGTCAGGCCTTCTTCTAGGATATG
TATCTTGGATGTTATGTGTAGGATGCAACTTTGCTCTTTTAAGTTTAGAGTATTTATGCA
TGGGTGGGGGAATTATTTTCCCTGTTGGGATGAAGACTTGTTTTATATGTTATTGAATTT
TCTTGTGTTTATAAGCAATCTATGCCCATTCTTAATTTTTTTTTTCTTCTCACTGACCAT
CAGCTTTTAGCCGTATATTAAATATACTTTCAAGTGGGGTAGATGGCTGTTGGCCTAAGT
TGGTTAAAACGTCAATAGTCTCATGTCAAGAGATACAGTTTTGCACTCTGTAAATACCAT
CCTCCCGCCAATTGTGTGGGCAGGCCTTCCACCTTTCCGTAGGTTGATTTTTTTCATATG
AAAACAGTTTTTCGAGTCGAGTTACTAATATTCTCATATTGATTGGTCCCAATAATTTTT
TAAGTCAGTTTCAGTCTTAAAAAGAAAAATATACTTTCAAGTATTTGACTATATCTTAAA
AAGAAAAAGCAAATAAAAAGCGGAGGCAAGCTCGTAAGTATCGCTAAACCACAAGATAGT
GCATAGAGACCACGTACAGTGACAGGTTAGGAAGACAAAGCTCGAATGATTAAAATATGC
ACGTATATAATTAGTTGTTAGGTGGTATAACTCGTTCTTCTGTTTGATGTGACTAATGGC
ATGTAACAGTTAAAATGAAATGTGCGAGGTGCCCTGGACAACAAATTACACATCTTGTTT
GGCTTATTGAGATTTTCTACTGAGAAGTGGACCTTGTTGGCTTATTCGGCTCTGGAGTCT
GGACCAGTGGAGAGGCAGAGTCAAGTTGGCCTTTCAGGTGCGCAGCCGAATTTTGCCCTA
TCAGAGTCGGCGCATTTTACAAAATGACTTCAGTACATTAGGCCTATAAACATAATTATA
TCGCCAAGAGTCAAAAAAATGAAGACGACGAGTATCCC
Download   Copy
>LITCHI017366.m1 -  Up_Stream_Len 2000
GGGTGGCAAAAAGGGTTGACGTGTCGGGTTGAACCGAATTCGATTCGATTCGTTTACGAA
TTCGACCAATTCGACACGAATTCGTTTAAGAAACGGGTTGATATTTTTGGATTCGACACG
AATTCGTTTATAAACGAATGACACGACCCGACACGATTAATTCGTTTAATACTTGAATCA
TAAAATATTCTAACCCATTAACCCGTTAATTCGTATAATCCATTAATTCGTTTAATTCAT
TTAACCCATTTAACTCGTTCAACCCATTTAACCCGTTTAACTCGTTCAATTCGTTTATTC
GTTCGATTCATTTAACTCGTTTAATCTTAATAATATTTTAATCATATACATAATAAATCA
TTCGCATTTAAATATTCTAACAACAAATTCAACGGATAAAAAACAAAATCCAAAATCAAC
AGAATCAACACAAAAACTAAACACCAAATTCATCAGAATCAAATATTCAAACAACAAATT
CAACGGATAAAAACCAAAATCCAAAATCAACAGAATCAACACAAAAACTAAACACCAAAT
TCATCAGAATCCACACATAAAAACCAAATACCAAATTCAACATAATCAACACATAAAAAC
CAACACAATCATTTTCAAAAAAATAAAAAATAGTAAATTTTTTCAACAACAAAATCAAAT
CAAATCATGCTCAAACTCAATACAAAATTACAAATACATGAAAATTAAATTTGCATAACA
TTATGGTGGTGGAGCCGTGGATCTGGTGGCGGAGTCGTGGATCTGGTGGGGAGCCGTGGA
TCTAGTGGCGGAGTCGTGGATCTGGTGGCGGAGCCGTGGATCTGGTGGCGGACCGTGGAG
AAGAGGCAAGATCTTTAGGAGAAATGGAGAAGGGGAGTCGACCGTGAGAGAGGAGGGGAG
CACAGACGGCGACTGTGAGGGAGGAGGAGTGAATAGGCGACGAGCGTGAGGGAGGAGGGA
AGAACGACCAGCGACCGTGAGGGAGCAAAGAAGATAGGACGGCGAGCGTGAGGGAAGAGG
GAAGAACGACCAGCGACCGTGAGGGAGGAGAGAAGATAGGACGGCGAGCATGAAGGACGA
AGGGAGAACGGGTGGCGACCGTGGAGAGAAGGTGGCGACTGGACGGCGACGGTGAGGGAG
AAGGGGTGACTCGGCGGAAAGGGTAGTGGGGTGTGAGTGTGGTTGCCGAAAAATGAGTGA
AAAGGTTTAGGTTTTGGATGAATATGTGTGTATATATAAATGCATAATTACACACTAATC
CTTCTAATATGTTAAATTATAATTTACCCCTATTTTAATCGGGTCAACCTGCGATTCGTT
TAAGCAAACCCAATTCGTTTCGTTTAATAAACGGGTTAAGCGGGTTGACACGATTACGAC
ACGAATTCGTTTAACTCCAACCCATACCCATTTATTTTTTACGAATTCGTGTCGGAACCC
ATATTGCCACCCCTAGTTGGTGGTTCATTTTCAAATCAGAATATCCACTCTGGCAAGCTA
TTAGCCACCTCAGCGACCATTGATCACAGAATTCAGTGAGTCTGTAAGAAGATGACGTGG
CGAGATCTGGATGGCAAATTTGCGAAAGTTGCATCATACTGGGTCGCCGATGCAACCCAC
GCGTCAACTTCCAAGTGGACCATGGAGCCTTATTTTGTTTATTTATTTTGGTTTCCACCA
ATAATAGTATCGAAATGGGCCGAAACAGAAACGACATCCGGTTCACGGACTCGTACCGCA
TTTATCAAATCCAGTTAATGAATCCACTTTGATTTCCGATTCAAATCCAGACACCCACCC
ACCCAACAGACCCAGACCCAGTTTTGCGTTGCGTCTCTCTCTTTCTCTCGGGGGAGGTCA
AAATATTTTCACATCATTATTCTTTCCCTCCTTTACTCTCAGTCTCAGTCTCTCTGCTAT
TCGATCTCTCCTTCATTTCCTGGACTCGAACAGTGAAAAAAAATAAATAGAAGAGTTGTG
AAGTCGAAATCGATTGGGTG
Download   Copy
>LITCHI017366.m1 GenomeSequence - 
CATTTATTTTTTACGAATTCGTGTCGGAACCCATATTGCCACCCCTAGTTGGTGGTTCAT
TTTCAAATCAGAATATCCACTCTGGCAAGCTATTAGCCACCTCAGCGACCATTGATCACA
GAATTCAGTGAGTCTGTAAGAAGATGACGTGGCGAGATCTGGATGGCAAATTTGCGAAAG
TTGCATCATACTGGGTCGCCGATGCAACCCACGCGTCAACTTCCAAGTGGACCATGGAGC
CTTATTTTGTTTATTTATTTTGGTTTCCACCAATAATAGTATCGAAATGGGCCGAAACAG
AAACGACATCCGGTTCACGGACTCGTACCGCATTTATCAAATCCAGTTAATGAATCCACT
TTGATTTCCGATTCAAATCCAGACACCCACCCACCCAACAGACCCAGACCCAGTTTTGCG
TTGCGTCTCTCTCTTTCTCTCGGGGGAGGTCAAAATATTTTCACATCATTATTCTTTCCC
TCCTTTACTCTCAGTCTCAGTCTCTCTGCTATTCGATCTCTCCTTCATTTCCTGGACTCG
AACAGTGAAAAAAAATAAATAGAAGAGTTGTGAAGTCGAAATCGATTGGGTGATGGACGG
AGGTGCAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAGGGCCGCCG
AGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGGTCCTCTTTTTCTTCTCCTACTGTCTCTCTC
TCTCGCTCTCTCTCTCTTTCTAATTATTATTTATTATTATTGTTGTTGAATTGATGTATT
TAATTTTTATTGTTTGGTGGTTTTGTAGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCACTGTGACCCT
GGTAATTATTTATTTTTGATTAATTTTTATATTTACCGTTAATTGTTTTATTTTAAAGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATGATGATGATGATGATGGTGTGGTTTTGGTGTAATAT
TGTTCTCTGGTTTGAATTTTATTGTTACTGGCTTTTATTTTAAACATGTTTTACATGTGT
GTGTGTTGATAATTTGAGTTTGTTTAATGGAGGTGCATTGATTAGAAGGGAAGAAGATGT
TATTGCATGGTAGACATTGCCTTGCAATTTGAAACTGATATTGTTAGGTGGTATGGGATT
GTTGGTGGTGTGATTAATAGAGTTTTTATGTGGTTGTTTATATTGAAATTGAATGGAAGT
GAGAATGCAGCATTTTGGGATGTTGAAAATATAGGATGAAGATGAACATGAGGTACTTGG
AACAGGAGATGAGTATTGATGTAATGTTTTCGTGGGAATATGTTACTGTTGGGTTTTGGA
TTTTCGTTGTGAGCTTTTCTTCTCACATTGAATGAGATTGCTATGTGGTGTTCTGTTATT
GGGGGCCGGCGTATGCAACGTGTGCCTCTGAAGTTCTTCTCATTTATTAGAGGTTGTGTG
ATCAGATGGTGGAAAAGAAATGTTTATAAGAGAGAAGTTCGGTTTTTAGCATATGAAATG
TTAAGTTGTATATTAATGAAGAGTGGCTGTCACTGAATAGGAAAAACTTCACGAAGCTTG
AGGCACGTATTACTCACCTCACCCCATATGTTAAAGAATCTCTCCGTTAAATGAATTTTG
TCAAATCTGCAATTGGTCCATGTCAGCTTGACCTTTTCATGTTCTGTAAGTGTTGGATAT
GACACCGACAAAGGAATATGGGCCAGACACAGTTTTGTGACAGTTTTCTCATATAAATGG
GAAACATGTTACTTGTTACATGCACGTGTGTTTAACAAAACTATATGTATACAGTGTACC
TATGATTGTGTTAACAACTTAACGTATACTTTGAGGGCATATGTTCTGAGATAAAAAAGT
GAATGAAAGTTTATATTTATACTTTCAACATGGGTGGGAAGTTGTGTATTGGATGATTAA
GTATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATTTAAAATTTT
AATTCTTTGGGCAGATGATTTGAGCATCCTGTATTTATTTTTAATATCTTCTTTCTAGTC
AACCTAACAAATAGAACGGTAGAAAGAAACTTTGTGGTCTTCATTTATCAGAGACTTGAG
ACACCCATATGATATTTTGAACTGCTTCTCTAGTTTTATGTAGCATCGTACAGTGTCATT
TACGTAAATGCAAAACTTTTGATTGCAGAGAAGGAGAATCTTTGTCTTTATGGGTTTCCT
AGTGAGCAGTGGGAGGTAAATTTACCTGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCGGAGCCT
GCATTGGGTATCAACTTTGCCAGAGATGGGATGCAAGAAAAGGACTGGTTATCTTTGGTT
GCTGTCCACAGTGATGCTTGGTTACTTTCTGTGGCCTTTTATTTTGGTGCTAGGTTCGGG
TTTGATAAAGCTGATAGGTATTTTTTTCTCTTTGGCAAATTGTGGACGTGGTTTGGCTTT
GTAAACAATGCAAATGAGTTCAAATTTTGATGATGGTCTGGTTTTGCTTACACACTCATT
TCCAAGAGCTTGTTCATCCTTGTCACAGTCCATCCCGTCCTGTTCCACGGAAATTGTGCC
ATTGATACATGTTTTGGGTGTGGTGACTCGATGACTTGTTTTTAAATGATTATGTTATAG
ATTTGACTCTTTTAAACTCCCAATTTGCAGTTATGTTATAGATTTTAAATTTTCAATGTT
TTAAGTCCCAATTGGCAAATGATTTAATGTCTATTTAATAAACAACTTTTAGCCGTGGAT
TTTTTTTTTTTCACACCCATGGTATTTGTACATGATGAATTAAGTCCTAGATTTGTTATT
TTTCAAATCTCTATCCATTTTTCCTTTTGTCATTAGGATGGATTGAGTTTTACTTTACCA
CATGTATATTGTCTAAGAATTTTGTTTTTGTTCACAACTTCCGTTTTTGAATAGTATCAT
TGAATTAATGTTTACATTCCATGCTCTGCTTCTCATGGTCACATTTAATTCTGCGTTGTG
CCATTGAATTTTACATTCCTGAAAGTTGAAGGCCAATAAATGGTTAGTCTTATTCACAAC
TCTAGGCTCCAGGAGCGGTTTAGGATTTTAAATTGATCAAATTGCTGTTTTCTATAAGAG
ACATAAAAGCACCATAACTCATTTGCTTGTAAAAATTTTTGTGTACCTCTGTTTACGGGT
TCTATGTTGACCTTCATTGTTTTCTCAATTATATTTTCTTGGTATATGTGGTGCAGGAAA
CGTCTTTTTAATATGATAAATGAACTTCCGACAATATTTGAGGTTGTTACAGGGACAGCC
AAGAAACAAACAAAGGAAAAATCTTCAGTCTCAAATCACAGCAGCAACAAATCTAAGTCG
AACTCAAAGGTGCGATAGGATGTCTACTGACATAATATTTATATGATTATATTTCCATAA
TATCATATAAATTACTTAGTTCACGATTTTCAGTGCTGGAATTGATTGAGGGAACTTTTT
AATTGATTTATATTGCATATTTCAAAAAGGATATTTTGGATTCTTTTTGGCCTAGTCAAG
CTTTAAAGAGGGAAGTAATTTATTATCAATTTGACATTCATTGAGAAAATTAAATGTTGG
TAAGAATAGTTATACTTTCTTGTTGAATTAGTGTTTTTAAAAGTATCATCTATATATTCC
AATATTAGACTTAGAAGGAAATATTTTTTCATAATTGTGTAGTATTATGCTTCAGAAAAG
ATACCTGACAAAGTTGTTTGTCTGTTCTTTTTTGTTGGCATGTGCAGCGTGGTGCTGAAT
CTCAGACCAAGTATTCAAAGACAGTGCAATCAAAGGATGAGGAAGAGGAAGCCTTAGAAG
AGGAAGATGATGAGGAGCATGGTGAGACATTATGTGGGGCTTGTGGAGAGAACTATGCAG
CTGATGAATTCTGGATTTGCTGTGATGTCTGTGAGAAATGGTTCCATGGAAAGTGTGTTA
AGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAGTACAAATGCCCATCTTGCAGCAACA
AGAGAGCACGCCCTTGAATGGTTGCTCTGTGTGTATTCTGGCATTATTGAGCTTCTAACT
GTTTAGTAGGTTTGTTATTAGTCAGGCCTTCTTCTAGGATATGTATCTTGGATGTTATGT
GTAGGATGCAACTTTGCTCTTTTAAGTTTAGAGTATTTATGCATGGGTGGGGGAATTATT
TTCCCTGTTGGGATGAAGACTTGTTTTATATGTTATTGAATTTTCTTGTGTTTATAAGCA
ATCTATGCCCATTCTTAATTTTTTTTTTCTTCTCACTGACCATCAGCTTTTAGCCGTATA
TTAAATATACTTTCAAGTGGGGTAGATGGCTGTTGGCCTAAGTTGGTTAAAACGTCAATA
GTCTCATGTCAAGAGATACAGTTTTGCACTCTGTAAATACCATCCTCCCGCCAATTGTGT
GGGCAGGCCTTCCACCTTTCCGTAGGTTGATTTTTTTCATATGAAAACAGTTTTTCGAGT
CGAGTTACTAATATTCTCATATTGATTGGTCCCAATAATTTTTTAAGTCAGTTTCAGTCT
TAAAAAGAAAAATATACTTTCAAGTATTTGACTATATCTTAAAAAGAAAAAGCAAATAAA
AAGCGGAGGCAAGCTCGTAAGTATCGCTAAACCACAAGATAGTGCATAGAGACCACGTAC
AGTGACAGGTTAGGAAGACAAAGCTCGAATGATTAAAATATGCACGTATATAATTAGTTG
TTAGGTGGTATAACTCGTTCTTCTGTTTGATGTGACTAATGGCATGTAACAGTTAAAATG
AAATGTGCGAGGTGCCCTGGACAACAAATTACACATCTTGTTTGGCTTATTGAGATTTTC
TACTGAGAAGTGGACCTTGTTGGCTTATTCGGCTCTGGAGTCTGGACCAGTGGAGAGGCA
GAGTCAAGTTGGCCTTTCAGGTGCGCAGCCGAATTTTGCCCTATCAGAGTCGGCGCATTT
TACAAAATGACTTCAGTACATTAGGCCTATAAACATAATTATATCGCCAAGAGTCAAAAA
AATGAAGACGACGAGTATCCC