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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI017366Chr14543740845442468-PHD finger protein ALFIN-LIKE 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI017366.m111139PF12165.11AlfinFamily231.71.50E-69
LITCHI017366.m1200249PF00628.32PHDDomain41.69.00E-11
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>LITCHI017366.m1
ATGGACGGAGGTGCAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAG
GGCCGCCGAGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCAC
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AATTTACCTGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCGGAGCCTGCATTGGGTATCAACTTT
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AAATGGTTCCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAG
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>LITCHI017366.m1
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>LITCHI017366.m1
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GAATTCAGTGAGTCTGTAAGAAGATGACGTGGCGAGATCTGGATGGCAAATTTGCGAAAG
TTGCATCATACTGGGTCGCCGATGCAACCCACGCGTCAACTTCCAAGTGGACCATGGAGC
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TTGCGTCTCTCTCTTTCTCTCGGGGGAGGTCAAAATATTTTCACATCATTATTCTTTCCC
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AAAGCGTGGTGCTGAATCTCAGACCAAGTATTCAAAGACAGTGCAATCAAAGGATGAGGA
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TGGAGAGAACTATGCAGCTGATGAATTCTGGATTTGCTGTGATGTCTGTGAGAAATGGTT
CCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAGTACAAATG
CCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCACGCCCTTGAATGGTTGCTCTGTGTGTATTCTGGCA
TTATTGAGCTTCTAACTGTTTAGTAGGTTTGTTATTAGTCAGGCCTTCTTCTAGGATATG
TATCTTGGATGTTATGTGTAGGATGCAACTTTGCTCTTTTAAGTTTAGAGTATTTATGCA
TGGGTGGGGGAATTATTTTCCCTGTTGGGATGAAGACTTGTTTTATATGTTATTGAATTT
TCTTGTGTTTATAAGCAATCTATGCCCATTCTTAATTTTTTTTTTCTTCTCACTGACCAT
CAGCTTTTAGCCGTATATTAAATATACTTTCAAGTGGGGTAGATGGCTGTTGGCCTAAGT
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CCTCCCGCCAATTGTGTGGGCAGGCCTTCCACCTTTCCGTAGGTTGATTTTTTTCATATG
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TCAGAGTCGGCGCATTTTACAAAATGACTTCAGTACATTAGGCCTATAAACATAATTATA
TCGCCAAGAGTCAAAAAAATGAAGACGACGAGTATCCC
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>LITCHI009809.m1 +  Up_Stream_Len 2000
GTAATTAGAATTGCTGTGGTTGTTGCTGAGATTATGTGCTCTTCTCTATGGTCGGTGATA
CATCCATTACAAGTTTGCAAGGGGGACGTATTTCAACTTTGCAAATTAAGAATTCTAGAA
CTTATATGTGGTAACAAAGAGAATTTCAGGTTAGGGCAGTAGAATTTTGTTCGTTAGCAT
ATTATTATGGTCAACATCCTCATTAATCTGAAAGTCTTTGTTGAAAATTGATCCAAGAAC
TCTGAATTGACTGTTTAGGTGTATCTCAACCATCAGTTTTTGCCATATCAGCCCCTCTAG
AGCCAATGTTACTTAAATGCATTCATGTAGTGTTAAATCTTAATTTTCATTATCAGTTGT
TTGGTCATCAACTATTGTAATCTTACCTAACATTGTACAATGTTTTGTAGTTTGCGAACA
AAATTCAAATAGGTAATAATTTCATTTGCCTTAATTTCATAGATTAGGCATACATAATGA
CTTCAAGACAACTAGGAGAGCAGTGCCAAGTTATCAATTTTTGGGATTTGTCCTGTCAGC
AGGAACTACTGAAGATGCTTGATTTTTGAATGTTTAGAATCTAGATAAATTGTTGCTTGC
TTGTCCATTGCTTTTGTAGTCATTGGAACCCATACTGCAACGTGTTCTAGAGTTGATTTG
TATAACTTTTGAATCCATAAAGCTAGGAGAAGTCATGAAAAGCAGAACTACTTTTGCTTT
CTCTTACTAATAAGATTTTAGACTTTCCAAAGATTATTGTTGAGAATTGTCTGGCTGATG
ATGTGCATTGTGAAGTGAGCATTGGTCCAGAGGGTCTAGCTCTAGCCGGTAATCTAAGGC
TTCATAGGAAATGTCAGTTGCATTCTGCACTTGTCCTGACTTGGGATGCAAATTTTCTGT
TGAAAGAAAGGCTAACATGCCAATTAATTACTGGAAAAGAGATGTTTCTATATCCTCCTT
AATTTCTTATGTCTTTATACTCTTATGAAGATGGTTAAATATAGGTTTTTTGGCATTTGA
AACTGAAGCTAATTGCTGATGTCATGATCGTTTAATTATTGTTGCAGGTCTGGCTGGATG
GTCTCAATATTGCCAATAAAGGAGTAAATGATCTTACTCTCTCATTCATTTAGCAATTAC
GATGAGTAATCATCTGTTACACATTTTACCAACTTAATTAACACCTGTTTGTGTAGTACC
AACACTTGTAATCCTGTATTGAACGGTTCAGTTGTGGTATTTTCGTTGTATGTTTAGTGA
GGAATGAATAAAGCTACTAAAAGATGGGTTGTTTCATGGCCCAAAATTATGGTTTTACTG
ACTGATCACATGTAGTGCACTGATGTTAATCTTGCTGCCCTCTGTTACGAACTCCGAAAA
ACATATTACTGGTGAACTTGAATAAACAGAGTGGACTACATACACAAAGTAAATCAAGTT
AACCAACAAAGATCGGCTCTTACCTCTCAGGCTATGGACTGCTTATGGAGGTGCAACCAA
AGCAACAAAATCCTAATAATATATAACATTTATCAAACATAATCAACAACAAATTTCTAA
TTCAGGGATTAATATATATAAGATTTATGTCCCATTAAAATTATATATGCAACCCTTTTG
CTTCGGTGAGCACAACCCATCACATATTTAAAAGCATTCTAGTTGGAATAAATTTAAGAA
AACAAGCAGAATGCACATACGTATCATAATTGTATTTTAATGAGACGTATTCGGGAAAGG
GGTATAGATAGTGGGCGGGGTGCAGACAATATCAAATTAAGAGGCCCAGGAGGGTGAGGA
GTGAATAAGAAAAAGCCCACGTCCAAAATATGCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTTGT
TGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATGAATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATCAA
ATGGTTGCTGTTAGTTAATAAGATTCATGTGATTTAGGGTTTGGATTGAATAGAGTGGAG
TAAAAGAGAGAGAGTGATTG
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>LITCHI014690.m1 GenomeSequence - 
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AAGACACTCAAATTTATTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTGC
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AGTTTTTACAGATTGGTTTTTAGTGAAACCGGAAAAAAACAGTCTTTTGTTTGGTTGTTG
TTGAAAAGTTTGTTACTTTGGCTGCAAATCAACTTGTTTTTAGTTATTTTTGTGTTGAAG
TTCTGTTTCGCTATTAGGGCTTTTTAATTTTTTTGGTTGATTGCTTGAATGAGCTTTAAG
TGTTGATCTTGGCATTTTAGTGGTTTTTGGTTGGTTTTGGTTTCTGGGTGTTTGTGTTTT
TGTTGAATTTGGAGTTTGGTTATCTGCGTTGTTGTGATCTTGTGGTTGGAGTTGAAGTTG
CTGATTTATTGGCTTTTGGAGGATTTTGATGCTTTGTTGTTAAGATGCAGCCTGATCAAA
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TTGTTTAAGTTGATATTACTGTGCAAGATCTGTATCCATTGAGGACTAAATAGATGTTTG
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GTCTGGGAATTTTATTCCTTTTGGTCCTTAAAATTTTTTTGTGGTCCATTTGTACTGGAA
ATTTTTTTGTTGTATAGTGGGTATAATTCGTGAATGTAGATAACAAGGAACTGCATGTCA
TGTTCATGTCCAAGCTTCTCTGCCACAAGGCTATGTCCCCATTCGGAATTTTGTTGGAGG
TCCCACTGCAACCAGTTTGTCACATAAGATTTGCATGTTTGGTTGCTGCACTGTATGTAA
TGAGGTTTAGAGTTGGTTTAGGAACTGTAAATGCTACCTTTGGTTGATACATGAGATGAG
ATATCACAATGTTTGGGCAATTTGGCGTGGAAGGTGGAAGTTGACAGCCAAAAGTTGATG
TTCTAATTCTTCGCTATTAGCTTCTTCATGTGTTGAGCAAGATGCCGGGGCCTTAAGAAA
AAAAATTATTTAAATGATGATGTAGGTATCTTTTGTGAGAGGCTTTAGTCGATGTTCTCT
TATGGACTTGATCGTTAGTTGTTTTACGTTTATGTTCAGTCTGCACTATGTGTATGCCAT
TTTACTTCATCAAGGTGATAAAATTCCACAATGCCTTTCTCTAGTTTTCTTTTGCTGTAA
CTATTTACCTTTGTGTTTGAACTTTTGTAATCATTCTGGTAAAGTAGAAATAATTAGATC
AGATACTTTTACTGCACCTGTATTTAGGAACAAGGTTGGCGGTTAAGGTAAACCTTGATA
TCATACTGTCCAATTTTAAATGGCACTAATTAAAACCAGTCTTACTTTGACAATGTGTGC
TATTTTTGGTGTTATTATGCTAGACTGTTTAGTGATGTCGGTAGTACGTACTTGTTTAAT
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TTGGAGTGTTGTGCTGATATTATTATAGTGATGCAGTCATCTGCAGATGTAGATTTTTTC
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GGTGTTGTTTGTTCTGCATATGACACACATACTGGAGAAAAGGTTGCAATTAAGAAAATC
AACGATATCTTTGAACACGTTTCTGATGCCACCCGCATCCTTCGTGAGATTAAACTTCTT
AGACTGTTGCGTCATCCGGACATTGTTGAGATCAAGCATATCTTGTTACCTCCTTCGAGA
AGGGAATTCAAAGACATATATGTGGTATTTGAACTTATGGAATCTGATTTACACCAGGTT
ATTAAAGCGAATGATGATTTGACTCCAGAACACTACCAGTTTTTTCTTTATCAGCTTCTA
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ACCTACTTGTTTGCATTGTATCTAATTATTGAATGTAGTTGCACTTGCACAAGAAGGCTA
CTTTTGACAGTTTCTGATGAGTACTCCAGTCTGAATTTTGTTTTTGTCCTTTCTTTTATT
GTTTTTCAGCAAATGTGTTTCACCGGGATCTAAAGCCAAAGAACATCTTGGCTAATGCTG
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GTAGCTTAATCTTTGGATCTGGTATCGTGAAGATTGTTCTGTTTGAAAATATAATTTTTA
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GCATCTTTAAAATTGGATCTATAATTGCTTATAATGTATTTCTTAGAACTCACCTGATTT
TGTATAGCATTGGAACATTACTAAAATCAAGAAGTATTAACCTCCTTGGGAGAAAGCTCT
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GAGAGCCTTCTGCTCAACCTGTTACCAAGATGGAATTTGAGTTTGAGAGGCGAAGGATAA
CAAAGGAAGACGTAAGAGAGCTCATATATCGAGAAATTCTTGAATACCATCCTAAAATGT
TGAAAGAATATCTAGAAGGGTCTGAGCCAACAGGCTTCATGTATCCAAGGTACTGTTCTT
TAAATTTTAGATTAATACTGTCAGTTGACCTTTATTTTTTACGTCTAGAGTTTGCAGTTA
GGCTAATGTCTTCGCTTGAAGAATGAGCTAAATCTTTTATTTTTCTGTTGGTTGAACTTA
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GATCTTTCCAAATGTTCTATCAAAGAAATTGAAAAACCACAGATGGATAGGACATCTGGG
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GGTTGTCAGTTCAGTGTTGCGGTACAATAATTGTAGTGCAGCAGCAGCAGCGGCAGAGGC
TCTTGACCAGCGGAGGATGGGGGTTAGAAATCCTGCTGTTTCAACTCAATATAACGCTAG
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AGGTTCCAATGGGTTGCAGCCAAAGCCCCAGTACATGGCAAGGAAAGTTGCTGCTGCTCA
AGGTGGTTCTGGTAGTAACTGGTATTGA