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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017240 | Chr1 | 44377738 | 44380036 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 49 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017240.m1 | 133 | 153 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 24.9 | 1.50E-05 |
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>LITCHI017240.m1 ATGATGATCGGCGAAGTCCCCACTCGATCAAATCCCACCATCCAAGTTCCTCCGTGGGAC CCATACGACGATCCGACGGCTATCCTCTCCCCTTCATTTCCTGTGCTCAGCCCTTCTGTC AACTTTAACGGCAATGCCAATGGCATCGACTCACTAATGGCTCTCCAGCGTTACCTGCCG TCAAATGAGTTCATTTTAAAAACCGAGTCAGATTCATTGAGCGATGACTCGGACTTGCCG GTGGATGCTTTCTCGTGCGACTACTTCCGCATGTACGAGTTCAAAGTGCGGAGGTGCGCA CGTGGTAGATCACATGACTGGACGGAGTGTCCGTACGCCCACCCGGGAGAGAAGGCCCGG AGGCGTGACCCGAGAAAGTACCACTACTCGGGCACTGCCTGCCCCGACTACCGCAAAGGC GGCTGCAAAAAAGGCGATTCCTGCGAGTTCGCTCATGGCGTCTTCGAGTGCTGGCTCCAC CCGGCACGGTACCGTACCCAGCCATGCAAGGACGGCACCAATTGCTGCCGCCGGGTCTGC TTCTTTGCTCACACTCCGGAGCAGCTACGTGTCCTGCCTCAGCATAGTCCCAGAGGAAAC GGAAACGGAAACGGGTCCGGATCGGGTGACCCGGACTATGGGTCTCCTGTGAGGCGTCGG TTTGATTTTGACTCCTATGGTGGTGGTGGGGGGTCCTTTGTTTCATCTCCTACTTCCATT TTGACTTCACCTCCGATCTCCCCGCCTTCTGACTCGCCGCCGTCGTCGCCCAGTTGTGGT GGATCGTATAACTCAGTGGGTGAACTCGTGGCTTCGATGCGAGGTATGCATGTCGGGAAG GTGAAACTGAGTGGTGGTGGTGGTGGAGGATCCGGTTGGGGTTTGCAAATGGGTTCTGGT TACGGTTCTCCTCGCGGTTCGATTCTCAAACCCGGTTTTTGCAGCCTACCTTCAACTCCC ACAAGGACTCCGGTCCGGTCGGGGTTCGATCTCTGGGAGTGTCCCTGCGAAGAGGAGCCA ACAATGGAGCGAGTGGAGTCTGGGAGGGACTTAAGGGCGAGGATGTACGCGAAACTGAGC AAGGAGAACTCACTCGGCCGTGGCGAATCTGCCACGTCAGCTCCAGATGTTGGGTGGGTG TCTGAGCTGGTGAAGTGA
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>LITCHI017240.m1 MMIGEVPTRSNPTIQVPPWDPYDDPTAILSPSFPVLSPSVNFNGNANGIDSLMALQRYLP SNEFILKTESDSLSDDSDLPVDAFSCDYFRMYEFKVRRCARGRSHDWTECPYAHPGEKAR RRDPRKYHYSGTACPDYRKGGCKKGDSCEFAHGVFECWLHPARYRTQPCKDGTNCCRRVC FFAHTPEQLRVLPQHSPRGNGNGNGSGSGDPDYGSPVRRRFDFDSYGGGGGSFVSSPTSI LTSPPISPPSDSPPSSPSCGGSYNSVGELVASMRGMHVGKVKLSGGGGGGSGWGLQMGSG YGSPRGSILKPGFCSLPSTPTRTPVRSGFDLWECPCEEEPTMERVESGRDLRARMYAKLS KENSLGRGESATSAPDVGWVSELVK.
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>LITCHI017240.m1 GTTATCTCTTACTCGGAGCACTAACCATAGTCAGCTTGTCGTACTTTTGAGATCAAGATT TCGACGAGAATCATATCATTTGTCTCGCGATATGCGAGACTACTTGCCCCAAAATACCCC TGGCGGATGGGTCCCTTGCAGGTTAGCTTCAATATACCAACAAAGAGAGATAATAGGGTC CCTAGTAAAAGATTATACTTTCTTCTCAGAGTCATTTTAAAGGCGATAAAGACCACCTGC CCAACTCATAATAACATGGGTCCCGCGTGTAGTCATTCCAGCCGTCTGATTAAGATCAAC GGCAAGGGTAGGTCTGTGACCACAGATTTTAAAACCCATTAAAACGACGTTAGTTTCTTT CCACGTTTTAACCGTAGGGGCAGTGGAGAGGTACATTTGTCAACTCAACCATGGTTAACT CGAACCTAACCTTGGTTAAATATGCAGTTTATATTCTAGAGAGCATCCGCAGTCTTGTGT AAATGTCCAAAGATGATGATCGGCGAAGTCCCCACTCGATCAAATCCCACCATCCAAGTT CCTCCGTGGGACCCATACGACGATCCGACGGCTATCCTCTCCCCTTCATTTCCTGTGCTC AGCCCTTCTGTCAACTTTAACGGCAATGCCAATGGCATCGACTCACTAATGGCTCTCCAG CGTTACCTGCCGTCAAATGAGTTCATTTTAAAAACCGAGTCAGATTCATTGAGCGATGAC TCGGACTTGCCGGTGGATGCTTTCTCGTGCGACTACTTCCGCATGTACGAGTTCAAAGTG CGGAGGTGCGCACGTGGTAGATCACATGACTGGACGGAGTGTCCGTACGCCCACCCGGGA GAGAAGGCCCGGAGGCGTGACCCGAGAAAGTACCACTACTCGGGCACTGCCTGCCCCGAC TACCGCAAAGGCGGCTGCAAAAAAGGCGATTCCTGCGAGTTCGCTCATGGCGTCTTCGAG TGCTGGCTCCACCCGGCACGGTACCGTACCCAGCCATGCAAGGACGGCACCAATTGCTGC CGCCGGGTCTGCTTCTTTGCTCACACTCCGGAGCAGCTACGTGTCCTGCCTCAGCATAGT CCCAGAGGAAACGGAAACGGAAACGGGTCCGGATCGGGTGACCCGGACTATGGGTCTCCT GTGAGGCGTCGGTTTGATTTTGACTCCTATGGTGGTGGTGGGGGGTCCTTTGTTTCATCT CCTACTTCCATTTTGACTTCACCTCCGATCTCCCCGCCTTCTGACTCGCCGCCGTCGTCG CCCAGTTGTGGTGGATCGTATAACTCAGTGGGTGAACTCGTGGCTTCGATGCGAGGTATG CATGTCGGGAAGGTGAAACTGAGTGGTGGTGGTGGTGGAGGATCCGGTTGGGGTTTGCAA ATGGGTTCTGGTTACGGTTCTCCTCGCGGTTCGATTCTCAAACCCGGTTTTTGCAGCCTA CCTTCAACTCCCACAAGGACTCCGGTCCGGTCGGGGTTCGATCTCTGGGAGTGTCCCTGC GAAGAGGAGCCAACAATGGAGCGAGTGGAGTCTGGGAGGGACTTAAGGGCGAGGATGTAC GCGAAACTGAGCAAGGAGAACTCACTCGGCCGTGGCGAATCTGCCACGTCAGCTCCAGAT GTTGGGTGGGTGTCTGAGCTGGTGAAGTGAACCCCCAAGTGTCCACGTACAAGCGGGGGT TCCATTTTGGTTATTTTCAATTATTTTTGTTGGCTAATTGTGGAAACTAAGGTAAGCAAT GATCGATCGGTGGCCTTTTGATTCTTCTGACTTTGTGAATATATGCAGTTGATTATGATG GAGATACCGCTGTGTAAATATTATGTTGACGGCAAGAGAGATGTGGAAAGTCTCTGTTTT GTGGTGCTTCTTTTTGGACAGAAAACATAAGAAAAGATTGCAACTTTTGTATAGAGAAGG ATTTGTTAGGGCTGCCGAAGAATGGGTAGCGGTTTGTTTTTTGATTTCATTTGCGAATTG TAATCTCTCTCTAATCTTAATTTTCACGGAATATTATCATCCTTTGTAATTCTCTTGTTT ATTCCTAATCGTTGTAATATAATGTTTATATTTTTGTTCATTTCTTTGTTCATGCACACT TGCTCATATTCAGAGTTTGATCTTTGAATGCTTCTGAATGCTTCTATTCCTCAAGATTTA GATTATGGTTAATGTGTAGCTTGAAAGGGTCTCTGGATTGTTCTTGTTGACTATTTGTAA CGTGAGATTTTTTTATGTTCGTGGAGATCTCTACATCATTGATATTATAATGATAAACAC TGAATGAATCAAATCCGGG
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>LITCHI017240.m1 - Up_Stream_Len 2000 CCCTACAGATAAATTTCAGAGTTTTGAGTGGTGCCAAAGATTGGTATAATTACTCCTTCA CAAGCAAACACAAACGACAACGTTTAATCCAATAAAAGAGACTAAGTATTATAGAACCGT ATTACTTAATCTTAAAGACATATTGTTGATGGAGACTTTAAAATATCTAATATAAATATA ATAATACTTGAAACTAATCAGACTTCAAAGTTGGAATTCGCTCGTCACGTTGTTAATTAA TATTATAGGATAAGATATACAGTAAAAGAAAAAAAATTCTATGCGTTGGGTACCCTACAA GGGTAGGGCTATTGACTATTTCGATATTGTCGTGTTTAGGGTTAAAAGTGGAACTAGATT GATAGGACCAAAAGAACGTCGTTTTGAAGTTATCTTTTGATAAAGGCGCCGTTTGGCATT AACCAAAGCTATCCAACGACCAACTCATTTAAGTAATGATACTTTGGTTATGTACGCGCA TGTTAGAGCAGTGAAAGGGACACTTGCTAAAATGTACAGGGAGTGATCTCTGATGACCGA TGACCAGCAGTAACCAACACCGCCGTTGAATTTGGCGGCTTGATATCTGCCAAGTGTTTC TATACCGTAGCTGCTTTGAAGACTGTGTGCGCCACTTGGCATTTACGAACCCAAATCACG TGCCCCCTTGTGCATGCCTGCCACTCGCGACTCCGTTTTCGTCTTCCACGTGGCCCACCC AACCTTTCCATTTTCACACGATAATAACTGCTTCCATCTCTCACCCATTCTCCAATATAT CGTTTCAATTGTCCTATCCTCTCATCTGAAAGATATTATAATTAAATAAAATTACGAAAA TAACCCAATTTTAAAATTAAAATTGAAAAATAATTTTTTCTTAAAATTTTATATTTTTAC TAAACATATTTTTATTAGAAAACAACTATCTTTTAAGATTTTTAAAATGATATTAGTATT CAACTTAAACCTAAAAAATACCATTTATTAAATAAATCCATTAATTAATTCGAAATTCAA TATTTATGAATGTCTTAATTTAAAGAAAATTTGTTCACCATGGAATAATTATCTTTATTA TAATAATATTATGATGCTTATTAAACTATTTTATAAAAATAATAATAGTTTTTAATAATA ATTAATATTATCTATTATAATATTAATAAATATAAAATAGTTAAAATGAAGATTCTAAAA GAGTTTGAGGGAATGATAATCTCATTTCACAATCACAAATTTATGAGAAATTCATAATTT TATTTCAAATATGAATCAATTTGATTTAAATGAATAACAACAATCATATATATTTTTTAT TTACAGTCTCTAATTTTTCAAGTAAAAACATCATAATTGACTTTCGATTTTAAAAGTATA CATTTAAGTAGTTAATATCAACATAAAAAAATAATTATTTTATCAATTCAATAATATTTA ATATCTCATATTTAATATTTTAATTTATTATATATTAATTCATTAATAAATTTATGTATC AATTAATTGTTATCTCTTACTCGGAGCACTAACCATAGTCAGCTTGTCGTACTTTTGAGA TCAAGATTTCGACGAGAATCATATCATTTGTCTCGCGATATGCGAGACTACTTGCCCCAA AATACCCCTGGCGGATGGGTCCCTTGCAGGTTAGCTTCAATATACCAACAAAGAGAGATA ATAGGGTCCCTAGTAAAAGATTATACTTTCTTCTCAGAGTCATTTTAAAGGCGATAAAGA CCACCTGCCCAACTCATAATAACATGGGTCCCGCGTGTAGTCATTCCAGCCGTCTGATTA AGATCAACGGCAAGGGTAGGTCTGTGACCACAGATTTTAAAACCCATTAAAACGACGTTA GTTTCTTTCCACGTTTTAACCGTAGGGGCAGTGGAGAGGTACATTTGTCAACTCAACCAT GGTTAACTCGAACCTAACCTTGGTTAAATATGCAGTTTATATTCTAGAGAGCATCCGCAG TCTTGTGTAAATGTCCAAAG
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>LITCHI017240.m1 GenomeSequence - GTTATCTCTTACTCGGAGCACTAACCATAGTCAGCTTGTCGTACTTTTGAGATCAAGATT TCGACGAGAATCATATCATTTGTCTCGCGATATGCGAGACTACTTGCCCCAAAATACCCC TGGCGGATGGGTCCCTTGCAGGTTAGCTTCAATATACCAACAAAGAGAGATAATAGGGTC CCTAGTAAAAGATTATACTTTCTTCTCAGAGTCATTTTAAAGGCGATAAAGACCACCTGC CCAACTCATAATAACATGGGTCCCGCGTGTAGTCATTCCAGCCGTCTGATTAAGATCAAC GGCAAGGGTAGGTCTGTGACCACAGATTTTAAAACCCATTAAAACGACGTTAGTTTCTTT CCACGTTTTAACCGTAGGGGCAGTGGAGAGGTACATTTGTCAACTCAACCATGGTTAACT CGAACCTAACCTTGGTTAAATATGCAGTTTATATTCTAGAGAGCATCCGCAGTCTTGTGT AAATGTCCAAAGATGATGATCGGCGAAGTCCCCACTCGATCAAATCCCACCATCCAAGTT CCTCCGTGGGACCCATACGACGATCCGACGGCTATCCTCTCCCCTTCATTTCCTGTGCTC AGCCCTTCTGTCAACTTTAACGGCAATGCCAATGGCATCGACTCACTAATGGCTCTCCAG CGTTACCTGCCGTCAAATGAGTTCATTTTAAAAACCGAGTCAGATTCATTGAGCGATGAC TCGGACTTGCCGGTGGATGCTTTCTCGTGCGACTACTTCCGCATGTACGAGTTCAAAGTG CGGAGGTGCGCACGTGGTAGATCACATGACTGGACGGAGTGTCCGTACGCCCACCCGGGA GAGAAGGCCCGGAGGCGTGACCCGAGAAAGTACCACTACTCGGGCACTGCCTGCCCCGAC TACCGCAAAGGCGGCTGCAAAAAAGGCGATTCCTGCGAGTTCGCTCATGGCGTCTTCGAG TGCTGGCTCCACCCGGCACGGTACCGTACCCAGCCATGCAAGGACGGCACCAATTGCTGC CGCCGGGTCTGCTTCTTTGCTCACACTCCGGAGCAGCTACGTGTCCTGCCTCAGCATAGT CCCAGAGGAAACGGAAACGGAAACGGGTCCGGATCGGGTGACCCGGACTATGGGTCTCCT GTGAGGCGTCGGTTTGATTTTGACTCCTATGGTGGTGGTGGGGGGTCCTTTGTTTCATCT CCTACTTCCATTTTGACTTCACCTCCGATCTCCCCGCCTTCTGACTCGCCGCCGTCGTCG CCCAGTTGTGGTGGATCGTATAACTCAGTGGGTGAACTCGTGGCTTCGATGCGAGGTATG CATGTCGGGAAGGTGAAACTGAGTGGTGGTGGTGGTGGAGGATCCGGTTGGGGTTTGCAA ATGGGTTCTGGTTACGGTTCTCCTCGCGGTTCGATTCTCAAACCCGGTTTTTGCAGCCTA CCTTCAACTCCCACAAGGACTCCGGTCCGGTCGGGGTTCGATCTCTGGGAGTGTCCCTGC GAAGAGGAGCCAACAATGGAGCGAGTGGAGTCTGGGAGGGACTTAAGGGCGAGGATGTAC GCGAAACTGAGCAAGGAGAACTCACTCGGCCGTGGCGAATCTGCCACGTCAGCTCCAGAT GTTGGGTGGGTGTCTGAGCTGGTGAAGTGAACCCCCAAGTGTCCACGTACAAGCGGGGGT TCCATTTTGGTTATTTTCAATTATTTTTGTTGGCTAATTGTGGAAACTAAGGTAAGCAAT GATCGATCGGTGGCCTTTTGATTCTTCTGACTTTGTGAATATATGCAGTTGATTATGATG GAGATACCGCTGTGTAAATATTATGTTGACGGCAAGAGAGATGTGGAAAGTCTCTGTTTT GTGGTGCTTCTTTTTGGACAGAAAACATAAGAAAAGATTGCAACTTTTGTATAGAGAAGG ATTTGTTAGGGCTGCCGAAGAATGGGTAGCGGTTTGTTTTTTGATTTCATTTGCGAATTG TAATCTCTCTCTAATCTTAATTTTCACGGAATATTATCATCCTTTGTAATTCTCTTGTTT ATTCCTAATCGTTGTAATATAATGTTTATATTTTTGTTCATTTCTTTGTTCATGCACACT TGCTCATATTCAGAGTTTGATCTTTGAATGCTTCTGAATGCTTCTATTCCTCAAGATTTA GATTATGGTTAATGTGTAGCTTGAAAGGGTCTCTGGATTGTTCTTGTTGACTATTTGTAA CGTGAGATTTTTTTATGTTCGTGGAGATCTCTACATCATTGATATTATAATGATAAACAC TGAATGAATCAAATCCGGG