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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017207 | Chr1 | 44128107 | 44132891 | + | Casein kinase 1-like protein HD16 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017207.m1 | 152 | 385 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 58.4 | 7.80E-16 |
LITCHI017207.m1 | 154 | 317 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 25 | 1.10E-05 |
LITCHI017207.m1 | 263 | 362 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 32.9 | 3.20E-08 |
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>LITCHI017207.m1 ATGAACCACATCCATACGATGCCTGAACTGCGTAGCCGAGCTCGCAGAAATCGGGCCTTT CTCAACCCAAACCCGAATCCGACCCGACAACTTCGCCCCGATAATAACAATAATAATAAT AATAATAATAATAATAATAACTGTAACGAGAGGAGGAAGGTGACGGTACGGAGTCGGCAA CAGAGGAGAACCGGAGAGAACAAGAGGCGCCGTGACGCGATCGTTCTTGTTGATGAAAAG AACGAGAGGAATATCGACATTGTGAACGGTGACGGACCTGCGACGCCGTTTTACGACGAC GACGACGACGAAGAAGAAGAAGAGTTTGTGGTGAAGAAGAGGATGGGCGAGTACGATAGC GGTGGCCGCAGCGGCGATAAAGGTCCTGGAGCTGAAGATGAAGGAAGCACAGCTCCTCTT CCTGAGAAGGTACAAGTTGGTGGTTCCCCGATGTATAGAATAGATAGGAAACTGGGGAAA GGAGGGTTCGGCCAAGTTTATGTTGGTCGGCGAATAGGTTCAAATTTAAATGAAAGAACT GGTGCAGGAGCTGTAGAGGTAGCGTTGAAATTTGAGCATAGAAGTAGCAAAGGATGTAAT TATGGTCCGCCTTATGAGTGGCAAGTTTACAACGTGCTTGGTGGCAGTCATGGTGTGCCA CGAGTCCATTACAAGGGCCGACAAGGTGACTACTATGTCATGGTTATGGATATGCTTGGA CCTAGTTTGTGGGATGTTTGGAACAATAATTCACACACGATGTCCATTGAAATGGTTGCA TGCATAGCCATCGAAGCAATCTCCATATTAGAAAAGATGCACTCTAGAGGATATGTCCAC GGGGATGTAAAACCTGAAAACTTCTTGCTTGGTCCTCCAGGAACTCCTGATGAGAAAAAG CTTTTTCTTGTTGACCTTGGATTAGCAACTAGGTGGCGAGATAGTTCAACCGGCCAACAC GTTGAATATGATCAACGTCCAGATGTTTTCAGGGGAACAGTGCGGTATGCTAGTGTTCAT GCTCATCTTGGTAGAACTGGTAGCAGAAGAGATGACCTAGAGTCACTTGCTTATACACTC ATTTTCCTTCTTCGTGGTCGATTGCCTTGGCAAGGATATCAGGGAGAAAACAAAGGATTC CTTGTTTGCAAGAAGAAGATGGCCACATCTCCAGAAACTCTCTGTTGCTTTTGCCCTCAG CCTTTTCGACAATTTGTTGAGTATGTGGTGAATTTGAAGTTTGATGAAGAGCCCAACTAT GCTAAGTATATTTCGCTGTTCGACGGTATTGTTGGTCCAAATCCAGATATTAGGCCTATA AATACCGATGGTGCACAGAAGGTACTTTCAATGTTTGCGGCCTTATCTTCTGACTTGCTG GCTATTGCGGCTAATACTGATTGGACTTTTAGGAATTCATTTGACTCATATCTTGTGTTT CTGAAGCTTATATATCAGGTAGGACATAAGAGAGGAAGATTAACAATGGAGGAGGATGAT GAAGAACAACCAAAGAAGAAGGTTCGTATGGGGATGCCTGCAACTCAATGGATTAGTGTT TATAACGCTCGTCGGCCTATGAAACAAAGATATCATTATAATGTGGCTGATGGGAGGCTT TCTCAACATATTGAGAAAGGAAATGAAGATGGTTTATTTATCAGTAGTGTGGCTTCTTGT TCAAACCTGTGGGCTCTAATTATGGATGCAGGCACTGGTTTCACTGCTCAAGTTTATGAA CTGTCACCATACTTTCTTCACAAGGAATGGATAATGGAACAGTGGGAGAAAAATTACTAC ATTAGTGCAATCGCAGGAGCGAATAATGGTAGCTCATTAGTCGTAATGTCTAAAGGGACC CAGTATTTACAACAATCCTATAAAGTGAGCGATTCATTCCCCTTTAAGTGGATCAATAAG AAATGGAGGGAGGGTTTTTATGTCACTGCTATGACCACTGCTGGAAGTAGATGGGCAATT GTTATGTCCCGTGGTGCAGGATTTTCTGACCAGGTGGTGGAACTTGATTTTCTGTATCCT AGTGAAGGTATTCATCGGAGGTGGGATAATGGTTACCGTATCACTTCAACGGCAGCAACT TGGGACCAGGCTGCATTTGTTCTGAGTGTTCCAAGAAGAAAACCAGCTGACGAAACTCAA GAGACTCTCCGAACTTCTGCTTTCCCTAGTACTCATGTCAAGGTGCATTATTTTGAATTT ATTCTGAGAAATGGGCGAAGAATCTGTATATTGCATCTGTTTGCTATGGTCGAACTGTTT CATGAATTGCCAAAGTTTTGTTTGAATGCCACTATATTCATTTGA
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>LITCHI017207.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTAGCATACTGTCCCCTCATGATGCATCATTGCATGCACTTATTAAGTAAAATGGTTGGC AACTTTCCTTTCCCCACAGAATGTGCCGCTGTATCACAAGATCTATCATCGTATTGGCAT CCTTGTAAATTTTATTTATCCATCTCACAAATATATTTTCCAAGAAAAGATCTTTCTTTA GAACTCAATGATACGGAGGTACCAATCCAGAGAATAGATCTATTTAAATATGGTCGTAAG GAAATATCTCTCTAGAATCCATTAATTTACACTATTTATGAATTTTTATTTTTTCAATTA TGGATATTATAAATTGAAAACATTATCCATTTTACTGTTTACCTGTAGATCTCTTATGTC TCAGCTAATTTCATATCCTAATTTATGAAGTAACATCTAAATTTAATTTACACTGTGCAT TCATTTTCCTTTTAAAAATTGATGTGTAATTACCAATTTAACTCTCAACTTTTAAATAAA TTCAAATTACATGTTGCTAGATTGAGATGTCATCTTGAATATACATTCATTTTTTTAGTA TCACGCGAGTGTTCATTATCACCAAGACATATTGAACATTGGTTATTGAGCATTAATTCA TAATTCAACTGTCTGTACAGTTCTTTTTATTTGGGATTGAGTTTTGTACTTACCCACTTC ATAAGCCAGGACTTGGGCACTTCATTTTCATATTAATTATAGCAATTTAACGTTGGTGTC CATGTTTATCAATACACATAAAAAGTGTTTTTCTTGTATTAACATGTACTTATTTTCTGA TATAATAAAAATAAATTTCCAATTCTTGTATGCAGTCCTTAATATCGATAAATCTAAACA GATTTAAACGTTGACATGAAATTTTTTAAAAATTATTTTTTGTGAAAACTGAAACGAGTT TAAATGATTATTAGAACCGACTGAAATAAAAATACTGATGGTACAGTCCAAAATATTATT TTCATATGATAGGGATCTATCCCATAAAGCGGAGTGAGGCTCACACGAGATTAAGAGATA ACCCACACATAATGGTGAAATAACTTTTATTATTAGTATTATTATTTGAATTGAGGGGTG GATGTCGAACTCATGCCACTAAAAGCATTGGAGTTGTGGGCGCCTAACCAACGATACCGA CAGTGAAAGACTTCAAAATTAAAATTGAGATGTTATGAATGATCTTTTATTATTTTATGT AAAAAAACATGATAAAAATAAAATCCTCTATTTATTATATCTTTTCTCTTATTATCGTAA CTTATAATGACAATGACAGTTATATTTTATTCAAACCTTTTAATATTTTGAAATAATATA ATCTATTCAAACTTGATGTCCAAGGGGAATAACATAAAGATTTTTTCTTCTAAAATAAGC AGAATAATTTATGGATATTATTCTCAAATCAACTATTAATTTAAAAATTCCAGTGTAGTT TTTTTTTTTTTTGGAAGGAAATTCCAGTGTAGTTTCCCATTATTAATTAATAAATATTAC TCACATAAAAAATAATAAAAAATAATTCTAAATTTCACGAAAATCAGAAAATTAAGCGGG GACTTTCACTTTTCGCATCTTCTAGCGCCCATTTTTTAGACCAATAAATACATAAAACAA TTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAATTTAAATTCAAACATTAAAATTAAATTA AAAAAATCACCAATAGAAGAGAAATTGTTTTGTTTTCTCTTTGCATCACTATTCACATCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTTTTAATTTTCTTTTCATTTCCCTCCACAGATCTC CAAACCCTAAGGCTATTCTCTCTCTCTCTCTCCACTATCTTCGTCTTCTAGAATAATCAC ATCGTAATCATAATCCCAATCATCGTCTATCAATCAAGCACTCTCTCATTCGTGATCGAA TCTCGACCCTTCGATTTTGATGATAATGCTGATGATGATGATTCTAGAAGCTTCATGAAT CTTCTTCTTTCCCTTCATGG
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>LITCHI017207.m1 GenomeSequence + AAAAAAGGTAATTTAAATTCAAACATTAAAATTAAATTAAAAAAATCACCAATAGAAGAG AAATTGTTTTGTTTTCTCTTTGCATCACTATTCACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TGTGTTTTAATTTTCTTTTCATTTCCCTCCACAGATCTCCAAACCCTAAGGCTATTCTCT CTCTCTCTCTCCACTATCTTCGTCTTCTAGAATAATCACATCGTAATCATAATCCCAATC ATCGTCTATCAATCAAGCACTCTCTCATTCGTGATCGAATCTCGACCCTTCGATTTTGAT GATAATGCTGATGATGATGATTCTAGAAGCTTCATGAATCTTCTTCTTTCCCTTCATGGA TGAACCACATCCATACGATGCCTGAACTGCGTAGCCGAGCTCGCAGAAATCGGGCCTTTC TCAACCCAAACCCGAATCCGACCCGACAACTTCGCCCCGATAATAACAATAATAATAATA ATAATAATAATAATAATAACTGTAACGAGAGGAGGAAGGTGACGGTACGGAGTCGGCAAC AGAGGAGAACCGGAGAGAACAAGAGGCGCCGTGACGCGATCGTTCTTGTTGATGAAAAGA ACGAGAGGAATATCGACATTGTGAACGGTGACGGACCTGCGACGCCGTTTTACGACGACG ACGACGACGAAGAAGAAGAAGAGTTTGTGGTGAAGAAGAGGATGGGCGAGTACGATAGCG GTGGCCGCAGCGGCGATAAAGGTCCTGGAGCTGAAGATGAAGGAAGCACAGCTCCTCTTC CTGAGAAGGTTTAATTTTTCTTTTTTTTAATCTATTTATTTTTTGTCCTGTCTGGATGGT GAGAAAGTGGAGGAAAAAAAATTGTTTATTTTATTTTTAAATTTTTTGTGAATAGGGAGC TGGAATGGTTTGTGAAGATGAGGGTGGCCTACTTGTTTATCTTTATTTTGTTTTTATTTT TATGAATAATAATACGAGTTTTGTTGTTTGATTGATGAGAAAACTGAGGAATGTTTTGTT TTTGGGTTGGTTTTGAGAAGTTGCATGTTTGGTACTTGATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTGCGTTTTCATATGCATTGATGTTGCAGGGAAAGATGTGTGTAAT TTGAAATTGGATTCAAAGTGACTAGGTATTTTTAATTTGGCTTTGGGTGCTTTCGTTTTC TTCCTTGTATTTTTAATTTTTGACAAGAACATGGTCTTTAGTTAGTTAGTTATTGATGAC ACTTAAAAAAGATGTGGGTATTGTTATCTAGTTTTGGATTCTGGAAATGCATCTTATTTT GTTGATTTAATGATAAAATCAGGTACAAGTTGGTGGTTCCCCGATGTATAGAATAGATAG GAAACTGGGGAAAGGAGGGTTCGGCCAAGTTTATGTTGGTCGGCGAATAGGTTCAAATTT AAATGAAAGAACTGGTGCAGGAGCTGTAGAGGTATGTCTTTATTAATATATATATATATA TATATGTATTTCTTCTCTATTATGGTAGTGATATACTTATGTTCTCTGTGTATATTTCAG GTAGCGTTGAAATTTGAGCATAGAAGTAGCAAAGGATGTAATTATGGTCCGCCTTATGAG TGGCAAGTTTACAAGTGAGACTTCTGTTGGATCTTCTCTTATGCTTGTTTCCTATGTGTT GCATTCTCTATAGAGGGGTCATGTTATGCATAAAGTTTTAACATTCACTTTTTCTGCTTT TGCACAGCGTGCTTGGTGGCAGTCATGGTGTGCCACGAGTCCATTACAAGGGCCGACAAG GTGACTACTATGTCATGGTATGTGTATAATTTAAACTCCCTTACTGTCTTTAACATCAAA GTTTTACTTTCTTATTTTTCATGTTTTGATTGCATCTGTAAAATCTCCAATGTTGTATAC AGGTTATGGATATGCTTGGACCTAGTTTGTGGGATGTTTGGAACAATAATTCACACACGT AAGTCCTTTACAAACTTATAGCTGATATTTTGCTATGATATAATATTAAACTGACTATAT TATTCCAATGTAATGGGTTATATTTCTATTTTTTGGTCACAGGATGTCCATTGAAATGGT TGCATGCATAGCCATCGAAGCAATCTCCATATTAGAAAAGATGCACTCTAGAGGGTAACA TTTCTTATTATCATTTATTTGTATGATGTTTTCATTTTTTTAATTGTTAAATTTAAAATT AACTCTTCCCCTTCTCCCTGGTGCACCTTCCACCTTGTAAGACAGATGTTTTGATTATAT TATCCAGGCTGCGGGTAGTAAGGTGGAAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTCCTTTA CTTCATCTATGCCAGCTGCCTTTTTATTCAACTGGGAGAAAAGGTGTTAACTGAAACAGC TGTTTATCAATGGTATGCATGTTGCAGATATGTCCACGGGGATGTAAAACCTGAAAACTT CTTGCTTGGTCCTCCAGGAACTCCTGATGAGAAAAAGCTTTTTCTTGTTGACCTTGGATT AGGTACGTTGTAATATACACTGTCTTCTTTGTGCAGCAGAGTAGATTTTATAATCTTGAC TGTCCTATGTGTTATGTAACAGCAACTAGGTGGCGAGATAGTTCAACCGGCCAACACGTT GAATATGATCAACGTCCAGATGTTTTCAGGTAAAGTTGAAATGATTTGTTTTTATTTTTT GTTTTACCCATAATTATTGCTGGGAGTTTTGACCGTCCTTATATATCACTCTGTGATTCA TTGGTGCATGATAACTTCCGTGCTGCAGGGGAACAGTGCGGTATGCTAGTGTTCATGCTC ATCTTGGTAGAACTGGTAGCAGAAGAGATGACCTAGAGTCACTTGCTTATACACTCATTT TCCTTCTTCGTGGTCGATTGCCTTGGCAAGGATATCAGGTATACGGTTTCCAACTTTCTA ACATTATGATTACTTATAATTTGTATGTTTATGTTTTCTGATTCAGGTTTTTTCTTATTT TTAAAGGGAGAAAACAAAGGATTCCTTGTTTGCAAGAAGAAGATGGCCACATCTCCAGAA ACTCTCTGTTGCTTTTGCCCTCAGCCTTTTCGACAATTTGTTGAGTATGTGGTGAATTTG AAGTTTGATGAAGAGCCCAACTATGCTAAGTATATTTCGCTGTTCGACGGTATTGTTGGT CCAAATCCAGATATTAGGCCTATAAATACCGATGGTGCACAGAAGGTACTTTCAATGTTT GCGGCCTTATCTTCTGACTTGCTGGCTATTGCGGCTAATACTGATTGGACTTTTAGGAAT TCATTTGACTCATATCTTGTGTTTCTGAAGCTTATATATCAGGTAGGACATAAGAGAGGA AGATTAACAATGGAGGAGGATGATGAAGAACAACCAAAGAAGAAGGTTCGTATGGGGATG CCTGCAACTCAATGGATTAGTGTTTATAACGCTCGTCGGCCTATGAAACAAAGGTATGGC CTTGAAGTTACTCCCTTAGCTCTTCAAGCTAATGATGCATGGACTGAAGTTGATGATTTT CTCTCCTGTGTAGATATCATTATAATGTGGCTTAGTTGATGATTTTCTCTCCTGTGTAGA TATCATTATAATGTGGCTGATGGGAGGCTTTCTCAACATATTGAGAAAGGAAATGAAGAT GGTTTATTTATCAGTAGTGTGGCTTCTTGTTCAAACCTGTGGGCTCTAATTATGGATGCA GGCACTGGTTTCACTGCTCAAGTTTATGAACTGTCACCATACTTTCTTCACAAGGTTGTC TGTGTTCCATTTGAATGTTTGTTATAAGAAATCTGCCGTGTGGCATAGTGTATACTGCAT TCCAAGCGATTTGGTTGTTTCACTTGCATTATAGCATTTGTTTCATGTTTATTTCAACTA ATTAATCATGTGATTGTTTATGTTCATTCAAAGGAATGGATAATGGAACAGTGGGAGAAA AATTACTACATTAGTGCAATCGCAGGAGCGAATAATGGTAGCTCATTAGTCGTAATGTCT AAAGGTCTGTTTTGCTATCTGTGGGGCAGATATGATGTTGCGTTTTTTCGTCTTTAATTT TTCACAAATATAAGTTAAATGCTCTTGGTTTATATCATGTAGGGACCCAGTATTTACAAC AATCCTATAAAGTGAGCGATTCATTCCCCTTTAAGTGGATCAATAAGAAATGGAGGGAGG GTTTTTATGTCACTGCTATGACCACTGCTGGAAGTAGATGGGCAATTGTTATGTCCCGTG GTGCAGGATTTTCTGACCAGGTCTTGTTGGAAGTCTTAAGTATCTGCTGAAGAGAATGCA ATGTGAAAAAAATATCTAATATAACATCTTTTCCCACTGGTTTGCAGGTGGTGGAACTTG ATTTTCTGTATCCTAGTGAAGGTATTCATCGGAGGTGGGATAATGGTTACCGTATCACTT CAACGGCAGCAACTTGGGACCAGGCTGCATTTGTTCTGAGTGTTCCAAGAAGAAAACCAG CTGACGAAACTCAAGAGACTCTCCGAACTTCTGCTTTCCCTAGTACTCATGTCAAGGTGC ATTATTTTGAATTTATTCTGTACTTTATTGTTTTGATAGGACTGTTTACTTTCTATATAT ATATATATATTTTGGTGCCTTATTTTTCTTGAAGCGTAAGTGCTAACACATGGCTTTCTT TGCAGGAGAAATGGGCGAAGAATCTGTATATTGCATCTGTTTGCTATGGTCGAACTGTTT CATGAATTGCCAAAGTTTTGTTTGAATGCCACTATATTCATTTGA