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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017207 | Chr1 | 44128107 | 44132891 | + | Casein kinase 1-like protein HD16 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017207.m1 | 152 | 385 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 58.4 | 7.80E-16 |
LITCHI017207.m1 | 154 | 317 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 25 | 1.10E-05 |
LITCHI017207.m1 | 263 | 362 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 32.9 | 3.20E-08 |
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>LITCHI017207.m1 ATGAACCACATCCATACGATGCCTGAACTGCGTAGCCGAGCTCGCAGAAATCGGGCCTTT CTCAACCCAAACCCGAATCCGACCCGACAACTTCGCCCCGATAATAACAATAATAATAAT AATAATAATAATAATAATAACTGTAACGAGAGGAGGAAGGTGACGGTACGGAGTCGGCAA CAGAGGAGAACCGGAGAGAACAAGAGGCGCCGTGACGCGATCGTTCTTGTTGATGAAAAG AACGAGAGGAATATCGACATTGTGAACGGTGACGGACCTGCGACGCCGTTTTACGACGAC GACGACGACGAAGAAGAAGAAGAGTTTGTGGTGAAGAAGAGGATGGGCGAGTACGATAGC GGTGGCCGCAGCGGCGATAAAGGTCCTGGAGCTGAAGATGAAGGAAGCACAGCTCCTCTT CCTGAGAAGGTACAAGTTGGTGGTTCCCCGATGTATAGAATAGATAGGAAACTGGGGAAA GGAGGGTTCGGCCAAGTTTATGTTGGTCGGCGAATAGGTTCAAATTTAAATGAAAGAACT GGTGCAGGAGCTGTAGAGGTAGCGTTGAAATTTGAGCATAGAAGTAGCAAAGGATGTAAT TATGGTCCGCCTTATGAGTGGCAAGTTTACAACGTGCTTGGTGGCAGTCATGGTGTGCCA CGAGTCCATTACAAGGGCCGACAAGGTGACTACTATGTCATGGTTATGGATATGCTTGGA CCTAGTTTGTGGGATGTTTGGAACAATAATTCACACACGATGTCCATTGAAATGGTTGCA TGCATAGCCATCGAAGCAATCTCCATATTAGAAAAGATGCACTCTAGAGGATATGTCCAC GGGGATGTAAAACCTGAAAACTTCTTGCTTGGTCCTCCAGGAACTCCTGATGAGAAAAAG CTTTTTCTTGTTGACCTTGGATTAGCAACTAGGTGGCGAGATAGTTCAACCGGCCAACAC GTTGAATATGATCAACGTCCAGATGTTTTCAGGGGAACAGTGCGGTATGCTAGTGTTCAT GCTCATCTTGGTAGAACTGGTAGCAGAAGAGATGACCTAGAGTCACTTGCTTATACACTC ATTTTCCTTCTTCGTGGTCGATTGCCTTGGCAAGGATATCAGGGAGAAAACAAAGGATTC CTTGTTTGCAAGAAGAAGATGGCCACATCTCCAGAAACTCTCTGTTGCTTTTGCCCTCAG CCTTTTCGACAATTTGTTGAGTATGTGGTGAATTTGAAGTTTGATGAAGAGCCCAACTAT GCTAAGTATATTTCGCTGTTCGACGGTATTGTTGGTCCAAATCCAGATATTAGGCCTATA AATACCGATGGTGCACAGAAGGTACTTTCAATGTTTGCGGCCTTATCTTCTGACTTGCTG GCTATTGCGGCTAATACTGATTGGACTTTTAGGAATTCATTTGACTCATATCTTGTGTTT CTGAAGCTTATATATCAGGTAGGACATAAGAGAGGAAGATTAACAATGGAGGAGGATGAT GAAGAACAACCAAAGAAGAAGGTTCGTATGGGGATGCCTGCAACTCAATGGATTAGTGTT TATAACGCTCGTCGGCCTATGAAACAAAGATATCATTATAATGTGGCTGATGGGAGGCTT TCTCAACATATTGAGAAAGGAAATGAAGATGGTTTATTTATCAGTAGTGTGGCTTCTTGT TCAAACCTGTGGGCTCTAATTATGGATGCAGGCACTGGTTTCACTGCTCAAGTTTATGAA CTGTCACCATACTTTCTTCACAAGGAATGGATAATGGAACAGTGGGAGAAAAATTACTAC ATTAGTGCAATCGCAGGAGCGAATAATGGTAGCTCATTAGTCGTAATGTCTAAAGGGACC CAGTATTTACAACAATCCTATAAAGTGAGCGATTCATTCCCCTTTAAGTGGATCAATAAG AAATGGAGGGAGGGTTTTTATGTCACTGCTATGACCACTGCTGGAAGTAGATGGGCAATT GTTATGTCCCGTGGTGCAGGATTTTCTGACCAGGTGGTGGAACTTGATTTTCTGTATCCT AGTGAAGGTATTCATCGGAGGTGGGATAATGGTTACCGTATCACTTCAACGGCAGCAACT TGGGACCAGGCTGCATTTGTTCTGAGTGTTCCAAGAAGAAAACCAGCTGACGAAACTCAA GAGACTCTCCGAACTTCTGCTTTCCCTAGTACTCATGTCAAGGTGCATTATTTTGAATTT ATTCTGAGAAATGGGCGAAGAATCTGTATATTGCATCTGTTTGCTATGGTCGAACTGTTT CATGAATTGCCAAAGTTTTGTTTGAATGCCACTATATTCATTTGA
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>LITCHI017207.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTAGCATACTGTCCCCTCATGATGCATCATTGCATGCACTTATTAAGTAAAATGGTTGGC AACTTTCCTTTCCCCACAGAATGTGCCGCTGTATCACAAGATCTATCATCGTATTGGCAT CCTTGTAAATTTTATTTATCCATCTCACAAATATATTTTCCAAGAAAAGATCTTTCTTTA GAACTCAATGATACGGAGGTACCAATCCAGAGAATAGATCTATTTAAATATGGTCGTAAG GAAATATCTCTCTAGAATCCATTAATTTACACTATTTATGAATTTTTATTTTTTCAATTA TGGATATTATAAATTGAAAACATTATCCATTTTACTGTTTACCTGTAGATCTCTTATGTC TCAGCTAATTTCATATCCTAATTTATGAAGTAACATCTAAATTTAATTTACACTGTGCAT TCATTTTCCTTTTAAAAATTGATGTGTAATTACCAATTTAACTCTCAACTTTTAAATAAA TTCAAATTACATGTTGCTAGATTGAGATGTCATCTTGAATATACATTCATTTTTTTAGTA TCACGCGAGTGTTCATTATCACCAAGACATATTGAACATTGGTTATTGAGCATTAATTCA TAATTCAACTGTCTGTACAGTTCTTTTTATTTGGGATTGAGTTTTGTACTTACCCACTTC ATAAGCCAGGACTTGGGCACTTCATTTTCATATTAATTATAGCAATTTAACGTTGGTGTC CATGTTTATCAATACACATAAAAAGTGTTTTTCTTGTATTAACATGTACTTATTTTCTGA TATAATAAAAATAAATTTCCAATTCTTGTATGCAGTCCTTAATATCGATAAATCTAAACA GATTTAAACGTTGACATGAAATTTTTTAAAAATTATTTTTTGTGAAAACTGAAACGAGTT TAAATGATTATTAGAACCGACTGAAATAAAAATACTGATGGTACAGTCCAAAATATTATT TTCATATGATAGGGATCTATCCCATAAAGCGGAGTGAGGCTCACACGAGATTAAGAGATA ACCCACACATAATGGTGAAATAACTTTTATTATTAGTATTATTATTTGAATTGAGGGGTG GATGTCGAACTCATGCCACTAAAAGCATTGGAGTTGTGGGCGCCTAACCAACGATACCGA CAGTGAAAGACTTCAAAATTAAAATTGAGATGTTATGAATGATCTTTTATTATTTTATGT AAAAAAACATGATAAAAATAAAATCCTCTATTTATTATATCTTTTCTCTTATTATCGTAA CTTATAATGACAATGACAGTTATATTTTATTCAAACCTTTTAATATTTTGAAATAATATA ATCTATTCAAACTTGATGTCCAAGGGGAATAACATAAAGATTTTTTCTTCTAAAATAAGC AGAATAATTTATGGATATTATTCTCAAATCAACTATTAATTTAAAAATTCCAGTGTAGTT TTTTTTTTTTTTGGAAGGAAATTCCAGTGTAGTTTCCCATTATTAATTAATAAATATTAC TCACATAAAAAATAATAAAAAATAATTCTAAATTTCACGAAAATCAGAAAATTAAGCGGG GACTTTCACTTTTCGCATCTTCTAGCGCCCATTTTTTAGACCAATAAATACATAAAACAA TTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAATTTAAATTCAAACATTAAAATTAAATTA AAAAAATCACCAATAGAAGAGAAATTGTTTTGTTTTCTCTTTGCATCACTATTCACATCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTTTTAATTTTCTTTTCATTTCCCTCCACAGATCTC CAAACCCTAAGGCTATTCTCTCTCTCTCTCTCCACTATCTTCGTCTTCTAGAATAATCAC ATCGTAATCATAATCCCAATCATCGTCTATCAATCAAGCACTCTCTCATTCGTGATCGAA TCTCGACCCTTCGATTTTGATGATAATGCTGATGATGATGATTCTAGAAGCTTCATGAAT CTTCTTCTTTCCCTTCATGG
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>LITCHI006923.m1 GenomeSequence - TTTTTGTAGCTTATTATGTCTTAAGAGACTGACAATAGAGACAAACCTCCACGTCAATAA CCGTGGAAATCAATGCACTGTACAGTGTACTACATACATGTAGAATCATGTTAATAGCCG ATAAAAATTCTGTATATATATATATTTTTAAATTTCTATCTCTGATCGATTAACTAATTC TTAAAAATTGACATGGAAATAAAATTATTGAAAAATGCAAGTCACGGGCCCTTCAGGCAA GCGAAATTAGGCCATTAATTAAATCCAATAAAAAAACCCAACTCAAGAGGCCAACAAATT CTGCATTCCCCACTTCCACGTGACTCCCTCTTCAGTCTTCAGTCTTCAGTCTTCACACTC CCACTGAATATCCAGCTGCTCCGCAACACACACCCACACACACACGCCTTTTCCCTCTCA AAAGGCCCCCCCGACACCACACCAACGATCACAAAATGCGACACCAATGACTCCCAAAAC GACACCGTCTCTCCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTTTCCTCCACTACCAC CGCCCAATACCCTGCCGTCGTAAACTCACTCCTGCCATCGGACGCCGTCTCTCTCCTCTC CTTCAAATCCAAAGCCGACTTAAACAACAAGCTCCTCTACGCCCTCAACGAGCGCTTCGA CTACTGCGAGTGGCAGGGCGTCAAATGCTCCCAAGGCCGAGTCGTCCGCCTCCTCCTCCA CAGCTTCGGCCTACGTGGCACTTTCCCTCCCGACACCCTCACTCGTCTCGACCAGCTCCG TGTCCTCAGTCTAGCCAACAACTCCCTCGTCGGTCCCCTCCCCGATTTGTCCCCACTCGT CAACCTCAAATCTCTCTTCTTGAACCACAATTCTTTCTCTGGAACGTTCCCTCTCTCCAT 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