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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017198 | Chr1 | 44043465 | 44047947 | - | Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g25790 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017198.m1 | 32 | 68 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 43.6 | 2.80E-11 |
LITCHI017198.m1 | 119 | 134 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.7 | 1.1 |
LITCHI017198.m1 | 121 | 138 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.6 | 0.8 |
LITCHI017198.m1 | 142 | 202 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.3 | 6.00E-07 |
LITCHI017198.m1 | 143 | 164 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.1 | 1.2 |
LITCHI017198.m1 | 239 | 298 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.5 | 1.30E-08 |
LITCHI017198.m1 | 359 | 379 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.4 | 0.95 |
LITCHI017198.m1 | 478 | 537 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 40 | 2.60E-10 |
LITCHI017198.m1 | 526 | 547 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 13.7 | 0.08 |
LITCHI017198.m1 | 700 | 953 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 79.1 | 3.70E-22 |
LITCHI017198.m1 | 709 | 957 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 70.9 | 1.10E-19 |
LITCHI017198.m2 | 32 | 68 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 43.8 | 2.40E-11 |
LITCHI017198.m2 | 119 | 134 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.9 | 0.95 |
LITCHI017198.m2 | 121 | 138 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.8 | 0.69 |
LITCHI017198.m2 | 142 | 202 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.5 | 5.20E-07 |
LITCHI017198.m2 | 143 | 164 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.3 | 0.99 |
LITCHI017198.m2 | 239 | 298 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.8 | 1.10E-08 |
LITCHI017198.m2 | 359 | 379 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.6 | 0.81 |
LITCHI017198.m2 | 478 | 537 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 40.3 | 2.20E-10 |
LITCHI017198.m2 | 526 | 547 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 13.9 | 0.069 |
LITCHI017198.m2 | 700 | 830 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 48 | 1.20E-12 |
LITCHI017198.m2 | 709 | 805 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 35.1 | 9.40E-09 |
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>LITCHI017198.m1 ATGGAAGTTGAGCTAGACATGGCCAAGAGAGGACCAAAAACATGTCCAATTCTGTTCATG TTTTTGTTCTTGACCTTTTTCACTTCTCATGGTGCTGAAATTGAGCTTCTCTTATCTTTC AAATCTTCAATCAGCGACCCTTTTCACTTCCTTTCCAACTGGGATTCCACTACCACTTTT TGCAAGTGGAATGGCATCACTTGCAAGAACTCGAGTCATGTTAGTGCAATCGAGCTTTCA GCTAAAAACATGTCCGGGAAATTTCCCTCTTCATTCTTTCATTTGCCATTTGTGGAAACC ATCAATCTCTCAAGCAACCAGTTTTATGGTGAAATTCCTCGCGACTTATTCTCTTCCTCG TCTCTTCGATATCTCAACCTAAGTAACAATAATTTCACCGGTCCAATCCCAAGTGGTTCC ATTTCCCGTCTTGAAATATTGGATCTTTCCAATAACATGCTTTCTGGGAAAATTCCAGAA GAAATAGGATCATTTTCCGGCTTAAAAATTCTTGATCTTGGTGGAAATGTGTTGGTGGGA AGAATTCCACTTTCTATATGGAATATCACTAGTTTGCAATTCTTGACTTTATCTTCAAAC CAACTAGTTGGTCCAATTCCTCCCCAATTAGGCCAACTCAAGAACCTTAAGTGGATATAC CTGGGATACAACAATCTCTCAGGTGAAATTCCAAAAGAAATCGGTGAATTAACCTCTTTG AATCATCTTGATCTTGTATACAACAATCTCACTGGCCCCATTCCATCTTCTTTAGGGAAC CTCATCAATCTCCAGTACATGTTCCTCTATCAAAATAAGCTATCAGGTTCGATTCCTAAA TCCATTTTTGGCCTCAAAAAGCTGGTCTCTCTTGATCTAAGTGACAACTACTTGTCTGGG GAGATCCCGGAACTCATCATTCAACTACAAAACCTGGAGATCATCCATCTTTTCTCCAAC 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>LITCHI017198.m1 MEVELDMAKRGPKTCPILFMFLFLTFFTSHGAEIELLLSFKSSISDPFHFLSNWDSTTTF CKWNGITCKNSSHVSAIELSAKNMSGKFPSSFFHLPFVETINLSSNQFYGEIPRDLFSSS SLRYLNLSNNNFTGPIPSGSISRLEILDLSNNMLSGKIPEEIGSFSGLKILDLGGNVLVG RIPLSIWNITSLQFLTLSSNQLVGPIPPQLGQLKNLKWIYLGYNNLSGEIPKEIGELTSL NHLDLVYNNLTGPIPSSLGNLINLQYMFLYQNKLSGSIPKSIFGLKKLVSLDLSDNYLSG EIPELIIQLQNLEIIHLFSNNFTGKIPNALSSLPRLRVLQLWSNQLSGQIPSNLGKQNNL TVLDLSTNFLTGKIPETLCDSGRLYKLILFSNSLEGEIPQSLSTCKSLRRVRLQNNRFSG ELSSEFTKLPLVYFLDISGNDLSGKIGEQEWHMPSLEMLNMAGNRFSGYLPNSFGSDKLE NLDLSENMFSGTIPTAFGSLSELMELKLSKNKLSGEIPEKLSSCKNLVSLDLSNNQLIGQ IPSSFSEMPVLGLLDLSENLLSGQIPQNLGQVESLVQVNISHNHLHGSLPSTGAFLAINA SAVTGNDLCGGDETRGLPPCKEQKSPVWWFVVGCLFVVLVVLVVAAFAVSFVRGRKNLEL KRVENGDGCWEIRFFNSKFAKSLTVDEITSSTVEENLISRGNKGIMSTYQGRSLANDMLF VVKKITDVNTIISTTFWSDVSELGKLRHPNIVQLAGICRSEKSALLFYEYIDGKNLSQVL PSLSWERRRKIAVGIAKALSFLHCQCSPCVVVGDMSPEKVIVDGKDEPRLRLSISGLECT DAKSFFSSAYVAPETKETKDTTEKSDIYGFGLLLIELLSGKSPADAEFGVHESMVEWARY CYSDCHLDSWVDPMIRGHASMMLINQNEIVEMMNLALHCTAGDPTARPCATDLTKTLESG FRIWTCVTGLKFSSPF. >LITCHI017198.m2 MEVELDMAKRGPKTCPILFMFLFLTFFTSHGAEIELLLSFKSSISDPFHFLSNWDSTTTF CKWNGITCKNSSHVSAIELSAKNMSGKFPSSFFHLPFVETINLSSNQFYGEIPRDLFSSS SLRYLNLSNNNFTGPIPSGSISRLEILDLSNNMLSGKIPEEIGSFSGLKILDLGGNVLVG RIPLSIWNITSLQFLTLSSNQLVGPIPPQLGQLKNLKWIYLGYNNLSGEIPKEIGELTSL NHLDLVYNNLTGPIPSSLGNLINLQYMFLYQNKLSGSIPKSIFGLKKLVSLDLSDNYLSG EIPELIIQLQNLEIIHLFSNNFTGKIPNALSSLPRLRVLQLWSNQLSGQIPSNLGKQNNL TVLDLSTNFLTGKIPETLCDSGRLYKLILFSNSLEGEIPQSLSTCKSLRRVRLQNNRFSG ELSSEFTKLPLVYFLDISGNDLSGKIGEQEWHMPSLEMLNMAGNRFSGYLPNSFGSDKLE NLDLSENMFSGTIPTAFGSLSELMELKLSKNKLSGEIPEKLSSCKNLVSLDLSNNQLIGQ IPSSFSEMPVLGLLDLSENLLSGQIPQNLGQVESLVQVNISHNHLHGSLPSTGAFLAINA SAVTGNDLCGGDETRGLPPCKEQKSPVWWFVVGCLFVVLVVLVVAAFAVSFVRGRKNLEL KRVENGDGCWEIRFFNSKFAKSLTVDEITSSTVEENLISRGNKGIMSTYQGRSLANDMLF VVKKITDVNTIISTTFWSDVSELGKLRHPNIVQLAGICRSEKSALLFYEYIDGKNLSQVL PSLSWERRRKIAVGIAKALSFLHCQCSPCVVVGDMSPEKVIVDGKDEPRLRLSISGLECT DAKSFFSSAYVAPGT.
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