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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017197 | Chr1 | 44030205 | 44037069 | + | Homeobox-leucine zipper protein ATHB-8 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017197.m1 | 21 | 79 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 60.4 | 1.20E-16 |
LITCHI017197.m1 | 166 | 374 | PF01852.22 | START | Domain | 191.8 | 9.80E-57 |
LITCHI017197.m1 | 700 | 840 | PF08670.14 | MEKHLA | Domain | 177.1 | 2.00E-52 |
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>LITCHI017197.m1 ATGATGGCGGTGAGTTCGGGCTGCAAAGACAGCAACAGCAAGATGGCGTTGGACAACGGC AAGTACGTTAGATACACACCAGAACAAGTGGAGGCACTGGAGAGGCTCTACCATGATTGT CCAAAACCAAGCTCTATGCGCCGCCAACAGCTCATCAGGGAATGCCCTATTCTCTCCAAC ATTGAACCCAAGCAGATCAAAGTCTGGTTCCAAAACAGAAGGTGTAGAGAAAAACAAAGA AAAGAAGCTTCACGCCTTCAAGCTGTGAACAGGAAGTTGACAGCTATGAATAAGCTGTTA ATGGAGGAGAATGATAGGTTGCAGAAACAGGTGTCTCAGCTGGTTTATGAGAACACTTAT TTTCGCCAACACACCCAAAATGCGACCCTGGCTACCACAGATACAAGTTGTGAATCGGTG GTGACAAGTGGTCAACACCATTTGACTACTCCTCAGCATCCACCAAGGGATGCCAGTCCT GCAGGACTTTTGTCCATTGCAGAGGAGACTTTAACAGAATTTCTTTCAAAGGCCACTGGA ACTGCTGTGGAGTGGGTCCAAATGCCTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCCATTGGAATC GTTGCTATTTCTCATGGTTGCACTGGTGTGGCAGCACGTGCATGCGGCCTTGTTGGTCTA GATCCTACAAGAGTCGCGGAAATTCTTAAAGATCGACCATCATGGTATCGTGATTGTCGT TCTGCAGAAGTTCTAAATGTGCTGCCCACTGGAAATAGTGGAACCATTGAGCTGCTTTAT ATGCAGCTCTATGCGCCAACTACTTTGGCACCAGCTCGTGACTTCTGGTTGCTGCGCTAC ACCTCTGTTTTGGAGGATGGTAGTCTTGTGGTCTGTGAAAGATCACTTAACAACACTCAG AATGGTCCAAGTATGCCACAGGCGCCACATTTTGTGAGAGCAGAAATGCTACCTAGCGGG TATTTGATTCGACCATGTGAAGGGGGTGGATCAATCATTCATATAGTTGATCATGTGGAT TTAGAGCCTTGGAGTGTCCCTGAAGTGTTGCGCCCACTTTATGAGTCATCAACTCTGCTT GCTCAGAAGACAACAATGGCAGCTTTGCGCCATTTGAGACAAATTTCTCAAGAAGTTTCG CAGCCAAATGTCACTGGTTGGGGGAGAAGACCTGCAGCTCTACGTGCGCTTAGTCAGAGA TTGAGCAGAGGCTTTAATGAAGCTCTAAATGGGTTCACAGATGAAGGGTGGTCTATGTTG GAAAGCGATGGCATTGATGATGTTACTGTTCATGTCAACTCATCTCCTAGCAAGATGATG GGTGTACAGCTTTCTTATGCCAATGGGTTCCCATCTATGAGCAACGCGGTGCTGTGTGCC AAAGCTTCCATGTTGTTGCAGGATGTGCCTCCAGCAATTCTTCTTAGATTCTTGCGAGAA CACCGATCAGAGTGGGCAGACAGCAGTATTGATGCTTACTCAGCTGCTGCAGTCAAAGCT GGTCCTTGTAGCTTACCAGTTCCCCGAGCTGGGAATTTTGGAGGTCAAGTTATTCTTCCA CTGGCTCACACAATTGAGCATGAAGAGTTTTTGGAGGTCATTAAGCTTGAAAATATGGGA CACTATCGCGAAGACATGATGATGCCAACTGACATCTTCCTTTTGCAACTTTGTAGTGGA GTGGATGAAAATTCTATTGGCACCTGTGCTGAACTGGTCTTTGCTCCAATTGATGCCTCT TTCTCTGATGATGCACCCATAATTCCTTCAGGGTTCCGTATCATTCCTCTTGACTCTGGA AAGGATGCATCCAGTCCAAACCGTACTCTTGACCTTGCCTCAGCTCTTGAAGTAGGACCA ACTGGAAACAAAGCATCTGGTGATCTTTCTGCTCAGTCTGGGAGCACAAAGTCTGTGATT ACAATAGCATTTCAATTTGCATTTGAGCTCCACCTTCAAGAAAATGTAGCATCCATGGCT AGGCAGTATGTGCGTAGCATTATAGCTTCTGTCCAGAGGGTTGCATTGGCGCTCTCCCCT TCTAGATTTGGTTCTCATGCTGGACTTAGGCCACCTCCTGGTACTCCTGAAGCACACACG CTTGCTCGTTGGATTTGTCAAAGCTACCGGTGCTATCTAGGTGCAGACCTACTCAAAAGT GAAGCAAGTGAATCCATTCTCAAAGCACTTTGGCATCACTCTGATGCAGTAATGTGCTGC TCACTTAAGGCTTTGCCAGTTTTCACATTTGCAAACCAGGCAGGACTAGATATGCTTGAG ACGACCTTGGTTGCGCTTCAAGACATTACTCTAGAAAAGATTTTTGATGACAATGGAAGG AAGACCTTATGCTCAGAGTTTCCACAGATAATGCAGCAGGGTTTCATGTGCCTACAAGGT GGTATCTGCTTGTCAAGCATGGGGAGGGCAGTCTCCTACGAGAGAGCAGTGGCATGGAAG GTGTTGAATGAAGAAGAAAATGCTCACTGCATCTGCTTTATGTTCATCAACTGGTCTTTT GTCTGA
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>LITCHI010966.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAGATTGGATTTGATTTTGGAAACTCCTGAGATACCACTTAAACAGATTTAAAATCCGAT AGAATATTAAAAAGAATCAACAAATTGTAAAAGAGAGGAATTATAAGAGTGGGGATAACT GGGACAGTTTAACTTTGTTTTTCCAATAATGAGAATCATAGACATGATCAAAATAATCAG TTGAGTATCTAAGGGAAATAATTACTCATCATTTTCCTATTGTTTCCACTTTGGACCCTA CTCCCTTACTGTCACTTACTGATCACAAAAATGATGCATTTCTCACTTTTATAGGATCCC TTAATAAACCACTCATTGCAGTGTTTTTCATGCAATCTTGTTGATGTTGGACACTTGTAG TTTATTTTCTTCTTTTTATGACATTTTAATTAATTATAAAACCCTAATTAAATTAATATA ATATATGTATACATCACCGGTTTACGGGGTTGCTTGTCATAGTTCAATCTTACAGGACAT GAAAACATTCATGCCTTGCCTGGGAAAAAGAGAGATTAATTGAAATAAATATTTTCTTGG GCCATTACAAGAAAGAAAGGAAAAGCTCTGATATATTTTCAGTTATTCATGGAAACTTTT GAGGCCAATAATTCAATCACCTGAGACACGTCAGCAATGGAAAGAAAGCCGAGCCGAGAA GAAGCCAAAGTTTGAGGCTCAAAGCAGCAGAGAGACTAACGGGCTAAAATAGAGTCTATA CAATTGTAAGTTAGTCAGTAAAGGGTAGTAGTGGCCAGAGAGAGAGCATGTATCTATTAT GATATTGAAGTTTGGAATATTAATTATGTGAGAGCAACAAAGAAAAGAAATAAAATAAAA AAGACAAGTTACTTATGAGAAGAAGATTTGAGAAAGGTGTTGTGTTGTGTTGTTGTTGTT GTTGTTATTATTGTGTGGAGGGAGAGAGAACGTTAGAAGAAGAAGCAATAGAAGAGAAGC AGAAGAAGAAGAAGCAAAAATGTCGTCACCAAACAACAGCTTTAAAAATCCCATCACGTA GTTCGATGTATCCTTTACCTTATATATCTGCTAGAGTAGTAGAAAATGATGGGGATTCGA AATTGGAGAATGTGTTGTTGGTTTGATGATCTATACATTAAACAACAAAGGGAAACCTAC AAAATGAAAAGAGGACACTCGTTTGACGTGAAGTTAAAAGCCACCTCCCTCCTCTCTCAC ATTACTTTTCTTTACTATTTTACTCCACCACTTATCTTATGACCATAATACCCATCTCAT TACCAACCAAAATCTGCAACCATTAATTGTATTTGTGTTTTCAAGTGAAAAGGTTAACTC ATCTATTTTAACTATTTAAGGGTTTCTCGTTTTGGTCTTCCCCAGTCACACAATTAATGA TATAATACAATAAATGGTAATATACTAAAATTAGAAAATCAGAATTACCAAAAGAAGCAC CTGTGAGATAAGATTTCATAAAGTAAAATTCAGTGACATAAATGGCATAGGGCAGTGATT ATACATATTTGGTGGTAATGGAGTGTTTGACTCATAAGTAGAGGATTGAGAGAGATAGAG AGAGGGGGTGGCATTGTCAATTTAGAAAGACAGCCTGCACCATCCTTCTGTGCCTGATTT TTAAGTGGGTGTGCGCGGGGATCAATTGTCAGAGAGAAAGAGAGAGAAGTCACGGGTTTG TCTTGAAAGGCCCTTATTTCACAGTCCTAGACAGACAGACACATATTCTCTCTCACTACA TAACCGAGGAGGGAAACAATATATTATATCATTATCATACGACATATATCAAAAAGAAAA AAAAAAATTATATATTAAAAATAACCGCAGTATATACAGTAGTACCACAACGCAACACCC TCCAACCCTCTCCATTTTTATCCACCAAGAATCACCCTCTCTTTACACCTATTATTCCAT TCTCTAAAACCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTAGAGCAA ATAGTGTCTTTGATCTTTCA
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>LITCHI012625.m2 GenomeSequence - CTTTATTTTATGTCATATCAAATCATCAAATGATTCAACACCGGCCACCTGCATTCCTCT GTGTTCCATGAGACCATCATTTGCATTTCATTTCAACAAGCTTTTATACATGTTCTTCCC TCCTAACATCTCCTTTTTACATATATATCTCACCACTGATTTTAGTTACTCGTTTGTTTA GCAAGTTTAGAAAGGGAGTGATTCTTTGAAAAGGTAAGTATGTGCTGTTCATTACTTATT ATGATGTTATTTTTAAACAAAATGAAGAGTTATAATTACTTAGATATAGTTTAATGCTCC TTGGAAGTTTACTTTGTCAATCAAAATGGAGGTAACAAATTGATTTATTAATGTAACTTT GAAAATGGTCTTATCAAATTATGGAAATTTAGAATTAGTTTTAGGTACATCTTGGAACTG AAGACTCCCATTTGCCTGTAGTTACTGATATCATCATCAATGAATTCTCTGACATTACAT CTCTCACTATATATGCAGGACTAAATGGGAAACTCTCTGGTCATAGCACTCTATATCACA ATATGTTGCATTGCTTTTGTTGCATCAAAGATTGTTGTTTCAATCCTCCTTTACAAGAGA TGGAAAAGGAAACACATGATTTATGCAGATGGTTTCTCAGGTATGATGGTAATTTTCTTA AATTTGGCTTCTAGTTCTTGGAAATTAAAAGGTAATCAAGAGTTACTAATTGGTTTTAAC TGGTTAAATACAGAAGGAAAGATGGTGATGTTCAGGTCTCCATTGATACAACCTCTCACT TCCGATGTGTTATTGAAGAAGACTCTGAAGTTTAGCAACAACGACATCATAGGTTCTGGA GGCTTTGGAACAGTTTATCGATTGATGGTAGATGACTCTACAGCTTTCGCTGTGAAACGA CTTAACCGAGGAACTGCAGAGAGAGATAGAGGCTTTGAGAGAGAGTTGGACACAATGGGA GACATCAAGCATAGGAATATCGTTACTCTTCATGGATACTACACTGCCCCTCACTATAAC CTTCTAATCTATGAGCTCATGCCTAACGGAAGTTTGGATACATACTTGCACGGTATGCAT ACACATAACAAAAGATATGTTCTTTAAATTTCAGCACAGATATTGTCCCAAAAAAGTTCT TTCTTGTGTTATATTTGATAATGATACCAATTGTAATGACTCATTCCAACATATAATATG ATAAATGTATTAAATAGTCTCACATTGGTTAAAGAAATAAATTTGTATTGGTTAATAAGG TAAAGGTAAATCTTCACTCATAAACTAACTTTTGTGGTAGAATTAGACCTAAGACATTTT TCTGACATAGTATTAGAGTTGGGCAAGCTCTATCTAAGTTATATGACCCAAACTTAGTTG CACAGGTACAGGAGCAATTGAGTGGACACGTTGCACGTGAAGAAGAGTGTTAGATAATTC CACATTAGTTGAAGAAATGAGTTTGTATTAGTTTATAAGGTGAAGGTAAATCTACACTTA TAAACTAGCTTTTGTAGTGAAATTAGGTCTAAGATCTTTTTCTAACAATTTGGCCACTTG GGGACAATCCCAGCAGTTTATTCTTGGTTCTATATAAAAGACCTCAAATGACCGTAGACA AGTTTGAGAATCAGGCCTGCATATAGTTTGCAGTGATCCTCTCTAACCAATGTGAGATTA TGGTTATGCAAAAACCAAAATTTGCATATTCATGCTAATCAAATCTGAGATAAAAGTATT AGTACTAATCTAATTAGAGATCAAACCATACAATTTAAGTCAACATATCTGCTTTTACAT TACTTGCATGTTTGATTGTAAAGAAGAAAATAATGCAGGGAGATCATTAAACCAGAAGCA TTTGGATTGGCCATCCAGATACAAAATAGCTGTCGGTGCTGCAAGGGGAATTGCATACCT TCATCACGACTGCATACCCCACATAATCCATAGAGATATCAAGCCAAGCAACATCTTGCT GGATCAAAACATGGAGGCTCAAGTGTCCGATTTTGGACTTGCCACATTGATGGAACCTGA AAAGACTCATGTTTCAACATTTGTAGCTGGAACTTTTGGATACTTAGCTCCTGGTAAAGT GCATTAAATAGATAGTCTTGACTTTCCTGTACTTTTGCTTGGTTATCTGATAGATTATAT ATGTTTTACTTCAGAATATTGCGACACAGGCAGAGCTACGGTGAAAGGTGATGTTTACAG TTTTGGAGTTGTTCTACTAGAGCTTTTAACAGGAAAGAAACCGATGGATGAAGAATTTCT AGAGGAAGGAACTAAGCTTGTGACATGGGTAAATCATGAATATTATCTAAACCTTTAAAG AGCTGCACCTGTTGTTATCATAAATCAGTGCAGCATTCATTGCAGATATCTCATTAATCT TTCAAAAATTAAAAAACCTTTGGGCCAAAGAAGTAGTCAGGATGGAGTAAAATACTCTCA CCAAGAGAAATTGATTTATTTATATAATTAAAAAAAAAAAATAGAGAGGAAAAAAAGGAT AGAAATTCATTTAATTCTACCTAAATTTGACTGCATCTAATGCCTTAAATTAAATGAAAA AGATTTTTATATCAAATCCCTATCAATAAGAATCTTTAAATTGCATCAGTTTTTTACATC AGTTTCCAAATATTAACTTCTTTTTAATTACAATTATTTTGAGTCATATTGTTATGAAGC TAAGGTATGAAAATTCACCATAGTTCTATGCAAAATTTTTACGATAGTAGAGCATCATTA ATCACTGTCTTATACTTCATCTTACTAATTTGTTGTCAATGTTGCAACAGGTCAAAGCAG TTGTTCAAGACAAGAGAGAAGAGTACGTACTTGATGCTCGCTTAGAGGATTGTCCGATCA ATGAGATTAACAATGTATTTAGTGTTGCATTGATGTGCCTTGAATCAGAACCCTCCAAGA GACCTACTATGGCTGAGGTTGTCAAGATGCTAGAGCAAATCAAATCAGAAAAAGTTGTAA ATGATTATTAATCTAGCTTTAACCCCTATTGCTTTCTCCCAACATTGGAGTACACATAGA TTCTTAATCATATTTCATTTTTCTAAGTCGTTTTGCTCTCTTTTTTACTCCATCGGGATA ATTACGAAGTTTTATCTGATAATCATGAGCTAGTTAGGACATAAGCAGCTTTAATGCAAC CCTAGAGCCCTACCCAAAAATCGTACACAGAGAGTAAAAAGAGCATGTTAGCATAAGATC TATATCAAATTCACTAATGCTCAAGCAGAAATATTTACGACGACAAGATGCAGCATAAGA ATTGAGAACAAAACATGTGGAGATGATCAAATAGCAGAAGATATGAGCTAGAACAGAACA AAATAAGATGAGCATATTAATGCATTCATGCAGCCATATTGTTTCTCAAGAATACAAATA AATGAAGACAGCAAGCAATTGGCCTCACAGACCATAAGGGACATAAAATGTGTCAACATT TCCTTCCAATCAACTAAACAACTCTAACTTATCCAACTCCATAGGAAGGAATGAACAAAC ATTTAAGCTTGCACTATCTTCAGGCTCTGACTCTGAGGAATTCTAAAACCTCAACCAACC CAGAATAAACTAGAAGACAGACCATATATTGAGAAAGTAAAAACTAATGCTATTTTCATA GATCGGATTCAGAAACTGCAAACATTCAGAGCTAGTTCTTGTTATAAACATTTCATGGTA GTTAGTGCAAGAAAGAACCAAGGTAATAAAGGTGATTCAAGAATTATTAGAACTTGCCTC AACAGATTATATTACTCAAAATGGTAAAGCATGAAAAATCTGCAAAGAAGATGAAATAAT ATACTAAGCTCAACTTTACTAGGCATTATTCTCTGTGAAGAAACATTCCTGTATTTCAGT TTCCTGACTGCTTTTAAGGTCAAAGGAAATACATTGATACAACAAAATTGATAGCTGCTC CATTTGTTATGAAATTACATACAACAACAGAACCAACATCACATATTGGATTGAATAAAT AAAGAAAAAAAAATTAAAGAGACTAACTTCACTTGAGGTTTGTGGCCAGTCCAGTAGCAA CTGAGGCTTTTAAGGAAGGAGAAACTGGAGCATTCCCAAAAAAGACATCATAAAGGGCAA AGGTGACATTTTCTGACTCGATTGTAGCATCTGCCCCAGTTGGCAGCCCATCCGACAAGA TGCCAACCTGGAAATCAAAATACAACCATCATATTGGCATGTTAAGGGGGAAAGGGAAAA CAGAACCAAGAATAAAAATACATTATATGATAATGCATTTCACGCCCAATTAAACTTACT TGTATCTTTGATGAATCCAGCCAAGTTAAAAAGATGAAAGTTCCTTTCTTCAGAGGCCGG TCCTGAAAGATGCTACGAAATGTTGACAAGGCAGATTCATCAATAGGTGTTGGTGTCTTC ATTCTTGGGGAAATGGCATCATCCAAAGCATCCCAGAAAGTTTTTCCATCAACATCTCTG ACAAGAACAATCTGCAATGATTTTTCCAAT >LITCHI012625.m3 GenomeSequence - 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