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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017166 | Chr1 | 43739969 | 43746322 | + | Casein kinase 1-like protein 3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017166.m1 | 9 | 227 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 100.9 | 8.00E-29 |
LITCHI017166.m1 | 10 | 267 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 58.8 | 5.20E-16 |
LITCHI017166.m1 | 108 | 206 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 36.3 | 2.90E-09 |
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>LITCHI017166.m1 ATGGAGAGAATTATAGGAGACAAGTACAAGCTAGGCCGCAAAATCGGAAGCGGATCCTTT GGTGAAATATATCTTGCTACTCATTTGGAGACCAACGAAATCGTCGCTGTCAAGATTGAG AACAGCAAGACGAAGCACCCGCAGTTGCTTTATGAGGCCAAGATATATAAAATTCTTCAA GGAGGAGGTGGTGTTGCAAGCATTAGGTGGTGTGGAGTGGATGGGGACGATAATGTTCTC ATTTTAGACTTGTTGGGACCGAGTCTTGAAGATTTGTTTGTTTACTGCGGGAGGAAGTTT TCACTGAAGACGGTCTTGATGTTGGCTGATCAGATGATTACGAGAATAGAGTATGTACAT TCTAAAGGGTTCCTGCATAGAGACATCAAGCCTGATAACTTTCTCATGGGTCTTGGCAGA AAGGCGAATCAGGTCTATATTATTGATTTTGGACTTGCAAAGAGATATCGAGACCCCACA ACAAACCGCCATATTCCTTACAGGGAGAATAAAAACTTAACGGGGACTGCTCGTTATGCT AGCTGCAATACTCATCTAGGAATTGAGCAAAGTCGCCGCGATGATTTGGAGTCCCTCGGC TATGTACTTTTGTATTTCTTAAGAGGAAGCCTCCCTTGGCAAGGCCTGAAAGCTGCCACA AAGAAACAGAAGTATGACAAAATATGTGAGAAGAAGGTTTCAACCCCCATTGAGGTCCTG TGCAAGTCTCATCCTGTGGAGTTTGCATCCTACTTCCATTATTGCCATTCTTTAACATTT GACCAGCGGCCTGATTATGGTTTCTTGAAGCGCCTTTTCCGTGACTTATTCACTCGAGAA GGATTTGAGTCTGATTACGTGTTTGACTGGACGGTTCTTAAGTACCAGCAGGCACAAAAG ACAAAGACTCAGGCCCAGTCATCTGTTAGTATTTCTACCGATTTGCCACAAGCTTCTCGA GTGACTAGCAGTCGAGCAATGCCTATGCATACAGAGAAACTTAAAGGCAAGCTCCACTAC CTTGTGTATAGAGTCCATGATGCTTCTTACTCAGCTGAAGCTATGGAGCGCAGAGTACAT AATCACTCTCGTCCAGATGTGGATATGCAGCATAGATCATCAAGAGCTCATAATGTGAAT TCTAAAAATCTGACCGAGAAACATATCATGAGCAATGCAGCAGTGCCATCATCTTCATTT GCTCTTCCCAGTGCCTTTAAAAGAAATTTTCCAAAAGCAGAGGGGACAGATGAAACCACA AATGTAGATCGAGGAAATGGGAAAAGAACTGGTGCTTCGAGTAGCTGGATGCCATCATTT CAACGAACTTCTTCTGCTAAGTAA
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>LITCHI017166.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTCATGGAAGCCATTGAAGGAATGAGGGTTGCCTTGGGAGCTGCTGTTGTACTAAACTAC TGTCTGCAGGGGCTTTTCCATCCTGCCCGGAAGGTTAGGGAAGTGTACTGGAAGATTTAC AACTCCCTATATATTGGCTCGCAAGATGCTCTTGTGGCAGCTTATCCAACACTGGATGAT GAGCAGAATAACATATACAGTAGGCCTGAGTTAGTGATGTTCATCTGAGTGCAGCAACTG AGTTTCAGCTAGAGAGGGGAAGAAGAACGATGCAATCATGTTAGGGCTTGTGATGGACAT TTATTTTATATTTTTTCTGCTGTAGTCTTATTTAATTCCATGAGTTACTATATTGGTTGA TGTATGCATATATGGTACTCTTGACTTTGTTGATGCTGGTACTTTTAGAAATGGAAACCA CATGGTGGTGGTGTTTCCTGCAATTTGCTGTCTTATCTCGTGAGTTTCATTGCAGATTCA ATACGCAGACTGCTTAAGGTGTTGATAATGAATAATCTGCAGCATTTGCGAATCAGGTGA TTGAGTAGCTGGAGCTTTGCTGAAAGCTCCACCAACTGAATGTTTGGCTGAGGATGTCTG GTGAATTTACAACTTCGGTTGTAATGTGTTTTTTAAGTACTTGACAAACTTGTCTTGATT TACTGCCTATTGTAATAATATGATTGTTTTGTTTTGCATAAAATGCTGTCTGCGTGTCAC AGATTTACCCAACAAAAGAGTATATAATCCGAGTTGCTTCCTTCAGACGGGATGTGCTTC TATTTAAGTGGTGATTCCTTCTTGCTTAGTTCATTTTCTAGTTGGATATTCTACTAAGGC TGTTTTCATACCTCCATAATTTGATGTCCATGATATGCAGGGTGTATCATCCATTGAAAA GCAAATGTGGAGGAAATGATGTTTGGATTCAGAATATTTGTCGTGTTTATGAATTAGATT GGATTGGAATTAATTATTAATTCAGATTGGATTTGAGTTGGGTGATGCGATCCGTGTGGT TCTGTGTTGTATCTAACGTTGAATTGGGTTTTTAATTCATGTGATCTGGTTAAATTCTGG ACCTTAAAACACTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTCTGTGTCAAGCTACATTTTCTTCATTAA GCAAATTACATATCAATTACTTGTAGTCAAAGTATTCTTTCAGTCATTCTATATGACATA ACTTGTCCTAGTGAAAGATAAATAAAAACAGTCTCAACATTAGAAATGTTGGTCGCCATC AATTTGGTGTAGTTATATATCTTTCCAACGAAACATTATTGAAATTAACAAGTCCAATAT TGATCTCAACAATCTCCTGTTAGAATATTTTCAGGGATTTAATTCTTCATATGTAAATGA TTATAAATTGAAAAATATTTTACAAAGTGCAAGTGCTATTCATTTATGAGATGGGGACAT GTATATGGTTTTATTTTTCAATGTATGGACCAAGATTAAAACAAGTGTATAAACGACCAA GACAACTTTGTGGACTATTAGATTCAATGGAATCAAACAAGACAAGCCCAACAAAAAAAG AATACTACAGAATGATACTTTTATTCTTTTTTTGACAAGATACTTTTATTCTTATTAGTG GTGAATTTAATATAATTAACACAACTAAAATAATTGAATTTTCTTTAGCGTATCAAACAT GGCAATGCATGTTCCTGAAAAAGAATAAACTTGTCACGAAAATTCCTTGTAAACAAATTT AATTTTCTGTTACAAGGCACCTCTTGTATTATATAACCCAACTATCATCCATGAATTTGC TTTCTTTCAGCTTTATATAACAGACCTCTCATTTCTCTAAAATCTCATTTGTCTCCCCAT CCCCTCGCTCTCTCACATCTTCATAATTACAAAACTTGCCCCCGCTTTTTCTCTCTCTCT CTCTTTCTCTCCTCCCCCGATCGTTCTCTGACGACTTTCTCTTCACCAAAACCCTAATTG AAGCGACAGTCTATCCACAC
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>LITCHI008269.m1 GenomeSequence + TCCATATTCCCTTCGTTCACTGTCACTTTGTTTACTTATAAATCGTTCAAAACAATCGAA AACTTCTGTCAAAACCTCTCCATATTCCTTTAAAACTTTTCAACAAAGTCCTTTCTTTTA ACTCCCACCATGAGTTTTGTAGAAAATTTTAACGTCCGAACCATTGGTACGGGAGAAAAA TTTATTGTATTTGGTCATAGCTTTGATGGTGATCAATGTGTATGGAAGAATTTTCTTCCC TATATTGATCCTGATAGATACACTTCCATTATTTTTTATTTTGCTACGACCAAACCCGAA ATATATGATTTTAGCAAATATTCAACGCTCAATGGCCATGTGGATGATTTGTTTGATATA TTAGACACTATATATATCAAACAATGCACATTCATTGGCCATGCTGCCGGTGGGATGATT GGACTTCTGGCATCCATTCGCCAACCCGAAAGATTTACTAAGCTTGTGTTAATGGCTACT TCAGCTAGGTAATTTTTCCTAATCTAATTCTTGACAAAAGAATTTACATCTGATTGCTGT GTTATTGTGTTCTTGTCTTGATTTTTATTTATGTTATTGCTCTTTCTACATCTTGCACTG AATAAATTTTTATTTATGTTATCGATTATATTTAATCATGTATTGATGAACGTCACTATA CTACAAGATTTTTAAACACTCAAAAAATATTATTTTAAATGAGGATTTGACAAAATTCTT AAATTGATATATTTGGCATATATACATACTCGACTACTACAATAATGTCATGTGAAATAA AAAACATACTTGATTGATTGTTTTTATTATGATATAACAGTTAGATAGAGTATGCATTGC ATTATGGCGAAACTAGAAAATAATTTCATCTCATGCTATACTATAAAAATGAAGCCTTTC 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