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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017104 | Chr1 | 43210835 | 43220991 | - | Serine/threonine-protein kinase AFC3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017104.m1 | 126 | 334 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 51.4 | 9.40E-14 |
LITCHI017104.m1 | 127 | 473 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 150.6 | 5.60E-44 |
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>LITCHI017104.m1 ATGATGACGGAAGCGCAAATGAGACAATCATCAATTTCGCGCAAAACCGTCTTCCGGCAC TTTATAAGGAACCCTAATCTCAGACACTCGGTGGTTTTTAATAATAACATAAGTTGGGAT TTTGTGTCGAAGAATTTTGTGTTGCAGATCAGTGGGTGGGAAAACTGTATCAAAAAGAAA CAAACGAGGATGATGGAGAAAGAGAGAACCAGAAAACGGCCTCGGGTGGCGTGGGACGTT GCTCCATCAGAACCAGAAGAGGCGCAACGGGCTTTTCTGCTCGCGGCGGCGGCTAGGCAT GTGTCGCCGCCCAAAAGGGACGATGATCACGAAGGCCATTACGTGTTTAATCTCGGCGAG AATCTCACCCCGAGATGCACATTTGGGCGAGTTTTGGAATGTTGGGACCGTCAAACACAA GAGTATGTAGCAATCAAGGTCGTCAGAAGCATACGCAAGTACCGTGAAGCTGCAATGATT GAAGTTGATGTTCTTCAACTTCTTGCGAAGAATGATAAAGGCTGCTCAGGGTGTGTGCAG ATACGGAATTGGTTTGATTATCGCAATCATATTTGTATAGTGTTTGAGAAGCTTGGACCA AGTTTATTTGATTTTCTAAAGAGAAATAAATACTGCCCATTTCCTGTGGATCTTGTTCGA GAATTTGGACGTCAGCTTTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGATTTACGCTTAATCCAC ACTGACCTGAAGCCAGAAAATATTCTTCTTGTTTCTTCTGAATCTATAAAGCTTCCTGGC TACAAGAGGAGTTCTTCAGATGAAATGTCCTTCAGGTGCTTGCCAAAGTCAAGTGCCATT AAGCTGATTGATTTTGGTAGTACTGCCTTTGATAATCAGAATCATAGCTCCATTGTTTCC ACAAGACATTACAGAGCCCCTGAGGTTATCCTAGGACTAGGTTGGTCTTATCCATGTGAT ATGTGGAGTATTGGTTGCATACTAGTCGAGCTATGCACGGTTAGCCTGCCTTTTTTCATT GCAATTTATATAAAGCTTAGTGGGGCTTTGAACATTTATCAGGGATGGTTAAGCCACGGA AATTCCATGCAGGGTGAAGCATTATTTCAGACACATGAGAATTTGGAGCATTTGGCAATG ATGGAGAGGGTATTGGGACCTCTGCCGGAGCATATGATTCGAAGGGCCAGTCAAGGAGCT GAAAAATATTTCAGGAGAAAATCAGGACTGAATTGGCCTGAAGGAGCAGTTTCTAGGGAG AGTATCAGAGCTGTGAAGAAACTTGATTATCTAAAGAATATGGTATCAGTACATGTACAG AGCTCAAGGTCCTCCCTGACAGACTTGTTGCTTGGTTTGTTGAAATATGATCCATCTGAA CGTCTAACTGCTCGGCAAGCTCTCAACCATCCCTTCTTTCGGAATCTAAGTCACTAA
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>LITCHI017104.m1 MMTEAQMRQSSISRKTVFRHFIRNPNLRHSVVFNNNISWDFVSKNFVLQISGWENCIKKK QTRMMEKERTRKRPRVAWDVAPSEPEEAQRAFLLAAAARHVSPPKRDDDHEGHYVFNLGE NLTPRCTFGRVLECWDRQTQEYVAIKVVRSIRKYREAAMIEVDVLQLLAKNDKGCSGCVQ IRNWFDYRNHICIVFEKLGPSLFDFLKRNKYCPFPVDLVREFGRQLLESVAYMHDLRLIH TDLKPENILLVSSESIKLPGYKRSSSDEMSFRCLPKSSAIKLIDFGSTAFDNQNHSSIVS TRHYRAPEVILGLGWSYPCDMWSIGCILVELCTVSLPFFIAIYIKLSGALNIYQGWLSHG NSMQGEALFQTHENLEHLAMMERVLGPLPEHMIRRASQGAEKYFRRKSGLNWPEGAVSRE SIRAVKKLDYLKNMVSVHVQSSRSSLTDLLLGLLKYDPSERLTARQALNHPFFRNLSH.
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>LITCHI017104.m1 GAGATTTTGTAAAGGCTCAACTTGGAGGAGGTCCAAGCCCATTCAACAAGGACACCATCT AAATCACATAGATGATGACGGAAGCGCAAATGAGACAATCATCAATTTCGCGCAAAACCG TCTTCCGGCACTTTATAAGGAACCCTAATCTCAGACACTCGGTGGTTTTTAATAATAACA TAAGTTGGGATTTTGTGTCGAAGAATTTTGTGTTGCAGATCAGTGGGTGGGAAAACTGTA TCAAAAAGAAACAAACGAGGATGATGGAGAAAGAGAGAACCAGAAAACGGCCTCGGGTGG CGTGGGACGTTGCTCCATCAGAACCAGAAGAGGCGCAACGGGCTTTTCTGCTCGCGGCGG CGGCTAGGCATGTGTCGCCGCCCAAAAGGGACGATGATCACGAAGGCCATTACGTGTTTA ATCTCGGCGAGAATCTCACCCCGAGATGCACATTTGGGCGAGTTTTGGAATGTTGGGACC GTCAAACACAAGAGTATGTAGCAATCAAGGTCGTCAGAAGCATACGCAAGTACCGTGAAG CTGCAATGATTGAAGTTGATGTTCTTCAACTTCTTGCGAAGAATGATAAAGGCTGCTCAG GGTGTGTGCAGATACGGAATTGGTTTGATTATCGCAATCATATTTGTATAGTGTTTGAGA AGCTTGGACCAAGTTTATTTGATTTTCTAAAGAGAAATAAATACTGCCCATTTCCTGTGG ATCTTGTTCGAGAATTTGGACGTCAGCTTTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGATTTAC GCTTAATCCACACTGACCTGAAGCCAGAAAATATTCTTCTTGTTTCTTCTGAATCTATAA AGCTTCCTGGCTACAAGAGGAGTTCTTCAGATGAAATGTCCTTCAGGTGCTTGCCAAAGT CAAGTGCCATTAAGCTGATTGATTTTGGTAGTACTGCCTTTGATAATCAGAATCATAGCT 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>LITCHI017104.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGCTACGCTTTTTACAAAACTGTGGACTGGGGTTGGCCCCGACCCCAACCCCAGGCTTG GTGGTTTTCAGTTTATGTGGTCATAGTGTGTTAACTATGTTGTCAGTTTAGATTGTCCAC TTGGATTACACATCATTGGATCGGACTTGCACCGAGATTCTGCCTTGAATTTCTCTACCA AGGGAAAATCACTAGTCATTTTTTATTTTTTTTTTTCGAAGGTAGCCATTCGTAATATAT CAAGATGTATAAATAACATATGAAATTAAATGATGCAAGTTGAGTACTCAAAAAAAAAAA AAAATGATGCAAGTTGTGCTTTCAAGTTTTTGTTACTCTAGTCTATGATGTCTTTTTCAA ACAAAATAATTATGAAATATTTTCATACTAATGATAAGATTTTATTAGGACATATTGATA TTAAATTTTATATGTATACTAAGTATTTAACCTATGAATAAATGTTGATAATTTATTAGA TTTTTCAATAGTATTTTAATGATAAATTAAGTCTCATGTAATAAAATAATAGAAAAATTA AGGACATAAATTTATATTTTTGAGCAGTTGCTTTTACTAGTTATATCAACCATCATTATA TGTAGAGAGAGACGACATACTAAAACATGATATATTCATCTTATTTACGCTTTCTCATAC TAGCGGCGCATCCGATTCCATAGAAGGTTTATACCACTAGTATCATTATCAGAAATTTGT CAATTATTAGCTATATACATATTCTGTCAGAGAAAATTATGTTCATTTTGGATATTTCGC TCTTTAATCAAGTGTCTTACAAGCTCATAGTTAGAGGTGGCAATTTTTAACCCGATACAA CGGGTCGACATAAATCCAATACAAATATTATGAGTTAGGGTTGAGCATAAATAGACTATA TTAATAAACAAGTCAACCTGTCTAACTAGTTTTTAATAATCATATTGTGTTTGTGTTTTT CTAATCATGTTATGGGTTGACTTATTTAACTAAAGTAATTTTACAATAGAAGGATATGTA TGTAATTTGAACTTTAAGTATACATATTGTGAAAATTGAAACCCTAAATCATTTTTCACC TTGCGGCAACCATACCCACTTAGCCATTCTCTCAACCAGTTCAGCAGCTCTCTAGTCTCT CTATTCAACATGCCCATTTGGCCGTTCAAGCCGTTCAACAACAGTTCATCTTCTTCGATA TTTTAGTGTTGCACCGGATCTATTTTGCTAATTCCTCTTCGACATTTCATCCTCTTGATT TTTTCAATTTCTCTCAATTTCATGTTTGGTTGTTTTGATATAATCTAATCTTGTATATAT GTGTTTAATTATGTCAATTAATATTTGATTTGTCTTGCGTGAGAACAATTTTGGTGGAAA TGAAATGAATCTCGTAATCTTTCTTCCATTTTCTATTATTTAGTTTTATTTTATTTTATT TTTCTTATTGAGTAATCAATTGAATCATTTGTGTTGTAAATATATCACTTGATGGGTTTC TTGTTTTGGGTTATAAGGACTAAACCGGATGATGATCTAATGATATCGATTTAAGTTTTC TTCAATTAGCTTTGGATGTTTGGTTTAATCATATTTTAATTTTGTTATTTTATTAATATT TATATTAAAATTTAAATATATTAAATATTATTAAATGGGTCATGAAAGGATCATTAAACG TGTCAATAAACTATTTATAAATAAACGGTTTAATCATGTTTTCCGCATTGACCTATATAT AATCGTGGAATGTTCGTTTTGAGGATGTCTAACCTATTTATTAATCATGTCATGTTAAAA ATAATCGTGTTGTATTTGTATCGACTCCAACTCGACCCGTCAACCTGGATTGTCACCCTT ATGGTCATAGTTAAACAATAAGAAAATATATATATATATGTACAAAATTTACGAGGGTGT GCACAGAAAGAGATTTTGTAAAGGCTCAACTTGGAGGAGGTCCAAGCCCATTCAACAAGG ACACCATCTAAATCACATAG
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>LITCHI017104.m1 GenomeSequence - GAGATTTTGTAAAGGCTCAACTTGGAGGAGGTCCAAGCCCATTCAACAAGGACACCATCT AAATCACATAGATGATGACGGAAGCGCAAATGAGACAATCATCAATTTCGCGCAAAACCG TCTTCCGGCACTTTATAAGGAACCCTAATCTCAGACACTCGGTGGTTTTTAATAATAACA TAAGTTGGGATTTTGTGTCGAAGAATTTTGTGTTGCAGATCAGTGGGTGGGAAAACTGTA TCAAAAAGAAACAAACGAGGATGATGGAGAAAGAGAGAACCAGAAAACGGCCTCGGGTGG CGTGGGACGTTGCTCCATCAGAACCAGAAGAGGTTCATCGAAGATCTAGGGTTTTCATTA AAGAAAAAAAATAATAAAAATTAAGTCTTGATGTTCTGACGTGGATTGGGATTATATGCT TTTTATAGGCGCAACGGGCTTTTCTGCTCGCGGCGGCGGCTAGGCATGTGTCGCCGCCCA AAAGGGACGATGATCACGAAGGCCATTACGTGTTTAATCTCGGCGAGAATCTCACCCCGA GATGTGAGTTTTTCTCTTTTCTTGTTTTGAATTGATTTCGATTTTCAGTGGCTGAATAGG AAATGTTCCATTTTCTAATATCTGTTTGATTAATATTGGGATTGGCTACCTTACAGGTTG CATAGCATACCCATCAATTACATCCATTGGATTGGTTGTAAGGGTGGTCATCAAAGCCAA TCCAATAGTTGTAATTGTTAGGTAAGGGTATCCAACTAGTAAGTAGCCAAATCGTTGAAT ATCACATATGCATTAGCTTATTATGGTTTGATGTTTAACCACTTGCAATTTTCTTCATTT TGGTAGATAAAATACTTGGCAAGATGGGTGAAGGTTAGCAGTCAAGTGCTCCGCTGATCT 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