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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017054 | Chr1 | 42716734 | 42720677 | - | Probable N-acetyltransferase san |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017054.m1 | 37 | 137 | PF13673.10 | Acetyltransf_10 | Domain | 46.3 | 4.00E-12 |
LITCHI017054.m1 | 51 | 132 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 58 | 1.10E-15 |
LITCHI017054.m1 | 56 | 133 | PF13508.10 | Acetyltransf_7 | Domain | 47.3 | 2.10E-12 |
LITCHI017054.m1 | 77 | 135 | PF08445.13 | FR47 | Family | 27.7 | 2.20E-06 |
LITCHI017054.m1 | 90 | 142 | PF13420.10 | Acetyltransf_4 | Domain | 26.1 | 7.80E-06 |
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>LITCHI017054.m1 ATGGGTGCAGGGCGTGACGTGTCGATATCTCTTGATGGGGTGAGAGACAAGAACCTGATG CAGCTCAAGAAGCTCAACACTGCTCTCTTCCCTGTTCGCTACAACGACAAATACTACGCT GATGCTCTCGCCTCCGGTGAATTCACCAAACTCGCATATTACCGTGACATCTGTGTCGGT TCCATTGCTTGCCGTCTGGAGAAAAAGGAAGGTGGTGCTATATGTGTTTACATCATGACA TTGGGTGTTTTAGCACCATATCGTGGGCTGGGTATTGGTACAAGGCTGTTGAACCATGTT CTTGATCTCTGCTCCAAGCAAAACATTTCTGAGGTTTACTTGCATGTGCAGACGAACAAT GAGGATGCTATCAATTTCTATAAGAAATTTGGGTTTGAAATTACAGACACCATCCAAGAC TATTACACAAACATTACCCCGCGGGACTGCTATGTTCTTACGAAGTTCATTACTCAACAA CAGCCAAAGAAATGA
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>LITCHI017054.m1 AAGCGAATCGACCAGAAAATGATTGTTTAGTTTTGACACACGACATAAAACGAAAACCTC AAAAATCCCCAATATGAGAAACTCCTGCGCCTTCATCTCATAATACTCTGCTCGTCTGTA CAAACCAACCAAAAACCCTCTCTCTCACTCTCATTCTCTCTGTGTTGATCAGAAGAAGAC TGGAGATTGATTGGAAAAGAAGAAGAAAAAATGGGTGCAGGGCGTGACGTGTCGATATCT CTTGATGGGGTGAGAGACAAGAACCTGATGCAGCTCAAGAAGCTCAACACTGCTCTCTTC CCTGTTCGCTACAACGACAAATACTACGCTGATGCTCTCGCCTCCGGTGAATTCACCAAA CTCGCATATTACCGTGACATCTGTGTCGGTTCCATTGCTTGCCGTCTGGAGAAAAAGGAA GGTGGTGCTATATGTGTTTACATCATGACATTGGGTGTTTTAGCACCATATCGTGGGCTG GGTATTGGTACAAGGCTGTTGAACCATGTTCTTGATCTCTGCTCCAAGCAAAACATTTCT GAGGTTTACTTGCATGTGCAGACGAACAATGAGGATGCTATCAATTTCTATAAGAAATTT GGGTTTGAAATTACAGACACCATCCAAGACTATTACACAAACATTACCCCGCGGGACTGC TATGTTCTTACGAAGTTCATTACTCAACAACAGCCAAAGAAATGACATTCCGAAGCAGCA GTCAATCCAGAATTTCCCAATTATTGTCATCTTGTTTATTGAATTTTCCATGCACCAATT GTAATTGGAGTCTTATTATTGCATTATTGAGGTTATACGGATGCTAGAATGCATAAATGA GTTGAATTGTTTTAACGGTATGTCTGCCAAGTCTCATGAAACTAGTGTTTGTTGCTTAGT CTACGAACTATTGAAATTATTCAGTCAGAGACTGGATAAGAGTTTTGTTCAATTCAATAG AGCAAGCCTTTTGCAACATGATGTCTAGGATTTTATCTAACTATTTGACCATCATCAACA CTTGTTTTATATGGATGAACATGAGACGTGCATAAAACACGAGCCAGATGATGAAATGAA ATTATATGTGTAGCTCTATATGTACAGATTCTGATTTACAAAGTTTGATCGAGCTTATTA TGATAGCATTGCTTCAACTTATTACAATATGTACACATTTCTACGGCTGCTTCATGGCAG GCCAACCAAGTAGAGACCACCATATTGTCTGTCATTGCAACCATCGTCTGTTCAGTAAGC TAACCCCCCGGAAAAGGCATCACCATCATGAAGTAAGCTCTCTGTCAACCAATAACCATC CCATGAACCACCAACCCTCTTGCCAATAACAATCCACACCAAAAAAATCAGCATTGTTGC CAAGTGATTAATTGTAAACATTTTCAATAGAAACAATACATAACCCAATGGCATATAGCA CAAAATGTTATAACGTCACACCTGAAGCATAGTAAATTGGAATATCTCTTCTTCCTCTGG GCGACTTCCTCGAATCCAAACGCGCTGCTTGAATCGGTTCTGCTTTCCATTGTACAAGCA AAAACATTAAAAGCGAATTGTCAAAAAAACTACAAAAGTTGCACGTCCAATTGTAAGCAT AATCACACATACATACCTCCTTGACAAACAAACTACTCAAAATCTTCCTCTCCTTGTGAC CAAGCAAGACTCTATAAGTTGAATGATGAAATATCCGCCTAAACCGCTCGAACTACTTCC CCAAGCACCCCCATCACATCAGAATATTGGCATCAAAAAGCATTAAACAAAACAAAAAAA AGACATGCATTCACTGACCTGCCCCAAATCAAAAAAGGGACCAAAATATGTAGACCTTTC AAAGGGATCAAACCCAGCAAACTATCACAACAAACCAAAGCCAAAAATGAAAATATAAGC ACATAAAAAGCTATAATTTTAATTTATACAGGGACTGTAACTGAAACAGACCCGGTACAT GACTTCGATGCCATAGTCTTGACGGGGTTGGTCATTGTACTTCAATGCATCAAGTTGATG ATTAACGGCTTCTTCTGCACTAAACTATAAAACACAACTTTTACTTCTATTTAACAACAT ATAAAAGTACAAAACCAGATCAAATGCTTTTGATTTGTTTACACTGAGTCTTGGGCCAAA TGGTTTTTTCCTCCTAGATTCAAGCCTGCAATATCATCATGTAATCAGTTTCACTTCCCG CC
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>LITCHI017054.m1 - Up_Stream_Len 2000 TCAACTGAACCCAGATGAACCCTCATCTGGGTTCAAACCCACATGAGGGTTCGTCTGGAA CCCTCATCTGGGTTCGAAGCCAGATGCGGGTTCGTCTCATCTGGGTTCGAACCCAGAGGA GAAGAACCCAGTCGTCTGGGTTCGAACCCAGATGAGACGAACCGCGTCTCATCTGGGTTC GAACCCAGACGACTGGGTTCGGCTGGGTTCAAACCTAGACGAACCCTCATCTGGGTTCGA ACCCAGATGAGGGTTCGTCTGGGTTTGAACCTAGTCGAACCCAGTCATCTGGGTTCGATC CTGATCTGAAGAGAAAGAGGAAAGAGGCGGCGGCGCCGCCGGAGAGAGAGAGATGAAGAG GAGTCCGCGTGGGAGAGGTTGGTGGTGGAGGCGGCAGTGAGCAACAAAGCGAACCGTGAG GTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCGATGAGGTTGGAGAGAGAGAGGGAGATCGGTGAGAA AGTGGTGATGACTGAAAAAAATTTGATTTTTCTTTAATATTTTTTATTTTTTTTTAATTT TAAATAAAAATATCTTTATCTTTTATATTTTTATTATTTATTTATTTTAATTTTTCATAT TTTAATTAATTAATATATATTTTTAACTTTCTTCACATTACCGTTTTTACCCTTAGACTC AAATGGTCAACTTTATCTATTTAACAGAATTCGTTACCGTCAAGGGTATTATCGTCCTTT CATATACCTCCAGGGGTATTTTGAGTATTTAATTAAACGTTAAGTGGTATTTTAGATAAA AACAAAATCATATGGGAGAAAATGGATAATCTAGTAAACGTGAGGCTGTTTTTTAGGATT ATCCCTTATTATTATTATTATTATTATTATTTATATCATGTGGACCTCCTATTTTATAAT ACAAAAATCACTTTTTTTAAAAAAAATATATTTGGAAAAACAGAAAAATCACTTGTGACG AGTGATATGACAAAAATAATATATATTTATCTATTTATCTGATCATTTGAATTGATTTTT GAGGTAATGTTTTGGATCCTGTAGTATTATTAACTTATTTTGAACATTGCACAGATAGAA GAATTTTAACGCGTTTAAAAGGGTTTGTATATTAAGTTAGCTAAATCCCTTTGAAAATCA AATTTGTCGAAAAAAAATTTGATGCTTTCTTTGACAATAGAATTCTTATTGTCAAAAATA TTTTTCTGCTTTTACTTCAAAATTATAAGATGTCTAATAAATATTTGATCTTTTCACTAA ATATATTAAAAAATATTAGAGTAAATTGTATTCATTATAATTTGTGATGGAATAATTTAA TTCATTAAATAGGTGATATGTAACATAGAAATTGAGATTTTGGTAGCACTAGTAATAAAT AGTGATCTCTCAAACTTTAAACTTATGATATCAACCCAATTCATGAACCCATACTGTTGG GGGATAGTTAAGAGATGTAATTAATTTCTTTAGTTTTTTAATTTTTTAAATCTTTAACTT CAGTGATTGAATTTTTCAATAATTTTAACACATCATATATCACAAGTTGAAATACAAGTT AAAGATTTAGATTAATATTAATATCCATTTTAAATAGCATTTTAATAAGTCAATCGAATA TTTTTAATTCGTTCTATATTAATGATAAAAACAGAAAAATTTAACAGTATAGGTTGTGCC CAATTACTGTGGACCCTTAAAATTTGCTGGCCCATTTATGATTTCAAATCTAGTAAGATT GGGTTATTAGTCGACTTGACCCAACCCAACATCGATTTTCACGGCCACGAAAGCGAATCG ACCAGAAAATGATTGTTTAGTTTTGACACACGACATAAAACGAAAACCTCAAAAATCCCC AATATGAGAAACTCCTGCGCCTTCATCTCATAATACTCTGCTCGTCTGTACAAACCAACC AAAAACCCTCTCTCTCACTCTCATTCTCTCTGTGTTGATCAGAAGAAGACTGGAGATTGA TTGGAAAAGAAGAAGAAAAA
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>LITCHI007076.m1 GenomeSequence - TCCAATTCAAACTTATCCTATTCAATTCAATCCAATCTCAAATAAATAATCAAACCCTAT TTGATGCACCAAAAGAGGGTTAAAAGTGGATGTCAATCCTATCAACACAATAGATTCTTA CATTAGTGGACATGGCATGCGCCTTTTCCACCAACAATGAATACAAACTCACACGGAACT ATTTAAGATGTCAATGGTGGACCGCTTCTCTTCATAGCATCAATGAATGATCAAAACACC TTTTGACCGTTACCATGTAACGTGATCCAACAACCTATGAGAGTCAAAAAGTATTACATC CAACATTATAGCCCTTGTGACTTTTCTTTCGCGTAGTGCAATTAGGTCATTAATAAGGGA AGTCAAAGTAATTTTCCCAAACCACATATTATACCCGAATAAACAATACAACTAAAAATA ATTACGACAACCAAGATACATCGCTAACGTGTAATCTGTTAGGGCAAAACACAAATACAA GTACAACCAAACCGGAAACTAACAAACAGAAAGAAACAGTGACAACGTTTTAGAGACTCC GGTGTTTGCGGCGGAGGAGTCACATCGTACCTGTGGACCTCAATTTTTACATTCCAGTTT TGCCCTTCTATGGCCACCACCTATCATCCTTTTCTTTCAGTGTCTCCCACCAAAACGAAG CTCTATTTTTTTCATCACAGGTCCAGTTTCCAAAAACCCAGGCAGATTCTTGGGTTTCAA GAGCAATCAGTGAAGGGTTTGTCTCTGGTAGGCAAGGGTAGACGTGGGAAATTGAGGAAA TGCAATGTGTTCAACGAAGCAGAGAATGGGAATGTGGAGGAGACTTATAATAATGTGGAG GACAAACAGTTTGTGAAGTGGTTCCGTGAGGCGTGGCCTTACTTGTGGGCTCATAGAGAG 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