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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI016980Chr14217313842174754+Auxin-responsive protein IAA29

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI016980.m131178PF02309.19AUX_IAAFamily88.18.90E-25
LITCHI016980.m1181219PF02309.19AUX_IAAFamily35.11.40E-08
LITCHI016980.m231176PF02309.19AUX_IAAFamily87.61.20E-24
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>LITCHI016980.m1
ATGGAGCTTCAACTAGGACTTGCCCTCGCAACCCACCACAACCCCACCAAAGGTTTCGAC
CTCAACCACCGTCTAGACACTTTTGATGACCAAAAAAGCTTTAAAAACAAACGTAGCTTT
GAAGAGGCCTCTGGCAAGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTA
TGGAGTGGGCAGCCTAATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCT
TCCACCATTAAAAAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAA
TCATGGAGGAAGAAGTTGCTGTATCATCATGATCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTAT
CATAATCGGTTGGTTCATGATCATCATCAGAAGGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTC
GTTAAGGTTAAGATGGAAGGAGTTGCAATAACAAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGT
TCATTCAATACCCTCAAAAACTCAGTGATTGCCATGTTCGCAAAATACGAAAAATGTGAG
AAGGGAAGCGTACGTTATACACTAAACTACCAAGACAGAGGAGGAGTTTGGCTTCTGGCA
GAAGATGTTCCCTGGCGGACATTTGTCGAATCTGTTCAACGACTGGAAATATCGAGGAAT
GGCGGTTGA
>LITCHI016980.m2
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CTCAACCACCGTCTAGACACTTTTGATGACCAAAAAAGCTTTAAAAACAAACGTAGCTTT
GAAGAGGCCTCTGGCAAGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTA
TGGAGTGGGCAGCCTAATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCT
TCCACCATTAAAAAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAA
TCATGGAGGAAGAAGTTGCTGTATCATCATGATCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTAT
CATAATCGGTTGGTTCATGATCATCATCAGAAGGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTC
GTTAAGGTTAAGATGGAAGGAGTTGCAATAACAAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGT
TCATTCAATACCCTCAAAAACTCAGTGATTGCCATGTTCGCAAAATGTAAGTACATATAT
GTTATAGATTCGTTTCCTGACGAGAAGGTTTATGTAGTCTTGGATTAA
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>LITCHI016980.m1
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>LITCHI016980.m2
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>LITCHI016980.m1
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TTTTATTTTTAATATTTTATATTATTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACA
TTTTTGCTATATAGCTCTATAGCTTCTAATAATTCTACTTGGTAATGGAGCTTCAACTAG
GACTTGCCCTCGCAACCCACCACAACCCCACCAAAGGTTTCGACCTCAACCACCGTCTAG
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AGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTATGGAGTGGGCAGCCTA
ATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCTTCCACCATTAAAAAGG
AAGAAGAAGAAGAGAAGCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAATCATGGAGGAAGAAGT
TGCTGTATCATCATGATCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTATCATAATCGGTTGGTTC
ATGATCATCATCAGAAGGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTCGTTAAGGTTAAGATGG
AAGGAGTTGCAATAACAAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGTTCATTCAATACCCTCA
AAAACTCAGTGATTGCCATGTTCGCAAAATACGAAAAATGTGAGAAGGGAAGCGTACGTT
ATACACTAAACTACCAAGACAGAGGAGGAGTTTGGCTTCTGGCAGAAGATGTTCCCTGGC
GGACATTTGTCGAATCTGTTCAACGACTGGAAATATCGAGGAATGGCGGTTGATCATGAA
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GTTTAGACAAATCGACATGAGACTTACTATTTGAATAAGTTAGATTTATAACAAATTACT
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AAGCTTTGTTTGATCCATCTTTGTATTGTATTTAATTTATTATAAAAGACTATATATATG
CATTTTAAGTATGTAACCATGCTGATATATTAATTATATGAATAACACTACATTCTTCAA
AA
>LITCHI016980.m2
TGGCACGTTGGTGCACCCTTTTCTCATCTGTCCATGTCACTGCTAGGCCTTTTCCCGACC
CAACTTCCATGCTGTCCCTAACTTCCTCTCTTCCACAAGACAATCATCAATTTGATCAAT
CTCTCTCTTCAACTCACATATAAATACTTTACGATTCCAAGCCCACAACTCCCCCTCAAA
GCAGTACAACTACTCTTGCATTGCTTTTCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTTTCGTCCCCTTT
TTTTATTTTTAATATTTTATATTATTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACA
TTTTTGCTATATAGCTCTATAGCTTCTAATAATTCTACTTGGTAATGGAGCTTCAACTAG
GACTTGCCCTCGCAACCCACCACAACCCCACCAAAGGTTTCGACCTCAACCACCGTCTAG
ACACTTTTGATGACCAAAAAAGCTTTAAAAACAAACGTAGCTTTGAAGAGGCCTCTGGCA
AGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTATGGAGTGGGCAGCCTA
ATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCTTCCACCATTAAAAAGG
AAGAAGAAGAAGAGAAGCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAATCATGGAGGAAGAAGT
TGCTGTATCATCATGATCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTATCATAATCGGTTGGTTC
ATGATCATCATCAGAAGGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTCGTTAAGGTTAAGATGG
AAGGAGTTGCAATAACAAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGTTCATTCAATACCCTCA
AAAACTCAGTGATTGCCATGTTCGCAAAATGTAAGTACATATATGTTATAGATTCGTTTC
CTGACGAGAAGGTTTATGTAGTCTTGGATTAATTTTCACCGTTTCTAAATCGTACAGACG
AAAAATGTGAGAAGGGAAGCGTACGTTATACACTAAACTACCAAGACAGAGGAGGAGTTT
GGCTTCTGGCAGAAGATGTTCCCTGGCGGTACGAATATTCGGATTAGTTTCTTTTTTTCC
AATAAATATATATAGAGGGATTTGATTAATATTTATTTATTGTGGTTAATTATTTGGATG
TGTAATTTGCAGGACATTTGTCGAATCTGTTCAACGACTGGAAATATCGAGGAATGGCGG
TTGATCATGAATCGGCTAGTTTTGCTTGCACTGAGAGTAGCTTTTATTAATTTGATGTGG
TTTATGTGCTTGTTTAGACAAATCGACATGAGACTTACTATTTGAATAAGTTAGATTTAT
AACAAATTACTAGTATTGGAGTGACTATAGCTCTAGCAGCCAAGCAATTAGAACAAGGAC
TGGAACTTGAGAAGCTTTGTTTGATCCATCTTTGTATTGTATTTAATTTATTATAAAAGA
CTATATATATGCATTTTAAGTATGTAACCATGCTGATATATTAATTATATGAATAACACT
ACATTCTTCAAAA
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CCATTATTGTCAACAAAAGATTCAAAATCCATTTCACATAGGGTTACAAATTGTACAACC
GCATTTGATTTTCCTGTCACGCCAACCAAAACGACAGTGAATTTAATTTAATTTATAGCA
ATGTACGTACATATGTTTATTCACGTACACAATCTTACTTTTCATCACCTTCACCATGAC
CCACCACACGAGCACCATGCGGTCCAGGCTAGACTACACCCCTGATGGGACTCATCATGA
AGGAGTTCCGGATAGACTCGGTTTGAATTTGTGTCCGAACCAGGCCATAGCCGTGCGGGT
CGGGGGGTTAACCATGTCGAGCCCCACGCTGGCCGTCACGTGAACTTCACGAGGGCTTTT
TTAACACTACAAACAAACCCTACCACTACCACCACATATACCAATCCCACCGAGAACACT
TACCAAACACTAATATATCTATATATATATATATGTATATATAAACTGAGTTCTCTCTCT
CTCTTCTATTATTGGCTCCAACTCTAGAACTAAACTCCGACCAAAAGAATCTTCATTATT
TTAATTTATTTAAAAAAAATGGAGTGTTGTTTAGTTTTGCGGTTATAGTTTGGTATATGA
TGTGTCGTGTACTATTTTGATATCACTATAAACCAAAGAAGAAGATCAAGAGAATGTTTT
AGTGCCAATTAATGTGGAGGTTCATGGGGGTGATTGAGTTCATGCATCATGAGATATTTG
AAGGCAGGAGTCTGCCGACATTATCGATGGACATGTTTGGAGATAGAACTCATCATCTGT
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AAATATTGCTGTTTGGGAGACTGGAGGGTTGGATTTTGATCGAATAATGTGTTTACACGG
TGACAGAAAAGTAAACATTGATCATATCTTGATTTCTTTTTTGTTCAAAAGGAATATGAT
TACCTATAATGTTGCAATTAACTTTATCTAATTCTCTTCCTAACCCTATAAATTATCAAT
TGTTAGTTAGAACTAACAGTCAAGTTCAATATTTACTGCCTTTCTTTTCAAGTAGGTTAT
AATATAATACAGATGGGAATGTCAATGTGAATGTGTATCGTTTGAAAAATAAAATTATAC
AAATTGTAGTGTACTGATAAAACTATAAGTTTTTTTTTTAAGAATTTCAAATGTTGGTAA
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GTTTATAATTGAGATTTTTAGGAAAGAATTTATAAGAGTTTAGATTAGCAACGATAATTC
TGATTTGTGAAAACTAGAGCTTGAGAGAGAGAAGATTTTGGTTACTAATTAGTATGGGAA
CATGTTGCTTGTGTTTATAATTAAGATTTTTATGAAGAAATTTAATAAGAGTTTAAATCG
GTAAAAGATTTTAGTAATTTATTTTATACGCGATACGTGGGACACGTTGACAGTGTGGGG
GTTAAGAGTGGAAGATAGCTCCGGGCAAAGTGGTCCTGGCACGTTGGTGCACCCTTTTCT
CATCTGTCCATGTCACTGCTAGGCCTTTTCCCGACCCAACTTCCATGCTGTCCCTAACTT
CCTCTCTTCCACAAGACAATCATCAATTTGATCAATCTCTCTCTTCAACTCACATATAAA
TACTTTACGATTCCAAGCCCACAACTCCCCCTCAAAGCAGTACAACTACTCTTGCATTGC
TTTTCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTTTCGTCCCCTTTTTTTATTTTTAATATTTTATATTA
TTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACATTTTTGCTATATAGCTCTATAGCT
TCTAATAATTCTACTTGGTA
>LITCHI016980.m2 +  Up_Stream_Len 2000
CCATTATTGTCAACAAAAGATTCAAAATCCATTTCACATAGGGTTACAAATTGTACAACC
GCATTTGATTTTCCTGTCACGCCAACCAAAACGACAGTGAATTTAATTTAATTTATAGCA
ATGTACGTACATATGTTTATTCACGTACACAATCTTACTTTTCATCACCTTCACCATGAC
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AGGAGTTCCGGATAGACTCGGTTTGAATTTGTGTCCGAACCAGGCCATAGCCGTGCGGGT
CGGGGGGTTAACCATGTCGAGCCCCACGCTGGCCGTCACGTGAACTTCACGAGGGCTTTT
TTAACACTACAAACAAACCCTACCACTACCACCACATATACCAATCCCACCGAGAACACT
TACCAAACACTAATATATCTATATATATATATATGTATATATAAACTGAGTTCTCTCTCT
CTCTTCTATTATTGGCTCCAACTCTAGAACTAAACTCCGACCAAAAGAATCTTCATTATT
TTAATTTATTTAAAAAAAATGGAGTGTTGTTTAGTTTTGCGGTTATAGTTTGGTATATGA
TGTGTCGTGTACTATTTTGATATCACTATAAACCAAAGAAGAAGATCAAGAGAATGTTTT
AGTGCCAATTAATGTGGAGGTTCATGGGGGTGATTGAGTTCATGCATCATGAGATATTTG
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CTAGTGTGTTCACGCACTAACAAAGTAGATATATTTTTTATATATATATTTATCACAAGA
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AAATATTGCTGTTTGGGAGACTGGAGGGTTGGATTTTGATCGAATAATGTGTTTACACGG
TGACAGAAAAGTAAACATTGATCATATCTTGATTTCTTTTTTGTTCAAAAGGAATATGAT
TACCTATAATGTTGCAATTAACTTTATCTAATTCTCTTCCTAACCCTATAAATTATCAAT
TGTTAGTTAGAACTAACAGTCAAGTTCAATATTTACTGCCTTTCTTTTCAAGTAGGTTAT
AATATAATACAGATGGGAATGTCAATGTGAATGTGTATCGTTTGAAAAATAAAATTATAC
AAATTGTAGTGTACTGATAAAACTATAAGTTTTTTTTTTAAGAATTTCAAATGTTGGTAA
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GTTTATAATTGAGATTTTTAGGAAAGAATTTATAAGAGTTTAGATTAGCAACGATAATTC
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CATGTTGCTTGTGTTTATAATTAAGATTTTTATGAAGAAATTTAATAAGAGTTTAAATCG
GTAAAAGATTTTAGTAATTTATTTTATACGCGATACGTGGGACACGTTGACAGTGTGGGG
GTTAAGAGTGGAAGATAGCTCCGGGCAAAGTGGTCCTGGCACGTTGGTGCACCCTTTTCT
CATCTGTCCATGTCACTGCTAGGCCTTTTCCCGACCCAACTTCCATGCTGTCCCTAACTT
CCTCTCTTCCACAAGACAATCATCAATTTGATCAATCTCTCTCTTCAACTCACATATAAA
TACTTTACGATTCCAAGCCCACAACTCCCCCTCAAAGCAGTACAACTACTCTTGCATTGC
TTTTCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTTTCGTCCCCTTTTTTTATTTTTAATATTTTATATTA
TTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACATTTTTGCTATATAGCTCTATAGCT
TCTAATAATTCTACTTGGTA
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>LITCHI016980.m1 GenomeSequence + 
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TTTTATTTTTAATATTTTATATTATTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACA
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GAGTTCATTTTTTGTATATTATATGCGGCATCTATATGTGGATCATCATGATATACATAT
GTATATATGATTATGTGCGTGATTAAATAATTTAATTAATAGGGAAGAAGAAGAAGAGAA
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TCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTATCATAATCGGTTGGTTCATGATCATCATCAGAA
GGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTCGTTAAGGTTAAGATGGAAGGAGTTGCAATAAC
AAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGTTCATTCAATACCCTCAAAAACTCAGTGATTGC
CATGTTCGCAAAATGTAAGTACATATATGTTATAGATTCGTTTCCTGACGAGAAGGTTTA
TGTAGTCTTGGATTAATTTTCACCGTTTCTAAATCGTACAGACGAAAAATGTGAGAAGGG
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>LITCHI016980.m2 GenomeSequence + 
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GCAGTACAACTACTCTTGCATTGCTTTTCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTTTCGTCCCCTTT
TTTTATTTTTAATATTTTATATTATTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACA
TTTTTGCTATATAGCTCTATAGCTTCTAATAATTCTACTTGGTAATGGAGCTTCAACTAG
GACTTGCCCTCGCAACCCACCACAACCCCACCAAAGGTTTCGACCTCAACCACCGTCTAG
ACACTTTTGATGACCAAAAAAGCTTTAAAAACAAACGTAGCTTTGAAGAGGCCTCTGGCA
AGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTATGGAGTGGGCAGCCTA
ATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCTTCCACCATTAAAAAGT
GAGTTCATTTTTTGTATATTATATGCGGCATCTATATGTGGATCATCATGATATACATAT
GTATATATGATTATGTGCGTGATTAAATAATTTAATTAATAGGGAAGAAGAAGAAGAGAA
GCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAATCATGGAGGAAGAAGTTGCTGTATCATCATGA
TCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTATCATAATCGGTTGGTTCATGATCATCATCAGAA
GGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTCGTTAAGGTTAAGATGGAAGGAGTTGCAATAAC
AAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGTTCATTCAATACCCTCAAAAACTCAGTGATTGC
CATGTTCGCAAAATGTAAGTACATATATGTTATAGATTCGTTTCCTGACGAGAAGGTTTA
TGTAGTCTTGGATTAATTTTCACCGTTTCTAAATCGTACAGACGAAAAATGTGAGAAGGG
AAGCGTACGTTATACACTAAACTACCAAGACAGAGGAGGAGTTTGGCTTCTGGCAGAAGA
TGTTCCCTGGCGGTACGAATATTCGGATTAGTTTCTTTTTTTCCAATAAATATATATAGA
GGGATTTGATTAATATTTATTTATTGTGGTTAATTATTTGGATGTGTAATTTGCAGGACA
TTTGTCGAATCTGTTCAACGACTGGAAATATCGAGGAATGGCGGTTGATCATGAATCGGC
TAGTTTTGCTTGCACTGAGAGTAGCTTTTATTAATTTGATGTGGTTTATGTGCTTGTTTA
GACAAATCGACATGAGACTTACTATTTGAATAAGTTAGATTTATAACAAATTACTAGTAT
TGGAGTGACTATAGCTCTAGCAGCCAAGCAATTAGAACAAGGACTGGAACTTGAGAAGCT
TTGTTTGATCCATCTTTGTATTGTATTTAATTTATTATAAAAGACTATATATATGCATTT
TAAGTATGTAACCATGCTGATATATTAATTATATGAATAACACTACATTCTTCAAAA