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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI016980 | Chr1 | 42173138 | 42174754 | + | Auxin-responsive protein IAA29 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI016980.m1 | 31 | 178 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 88.1 | 8.90E-25 |
| LITCHI016980.m1 | 181 | 219 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 35.1 | 1.40E-08 |
| LITCHI016980.m2 | 31 | 176 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 87.6 | 1.20E-24 |
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>LITCHI016980.m1 ATGGAGCTTCAACTAGGACTTGCCCTCGCAACCCACCACAACCCCACCAAAGGTTTCGAC CTCAACCACCGTCTAGACACTTTTGATGACCAAAAAAGCTTTAAAAACAAACGTAGCTTT GAAGAGGCCTCTGGCAAGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTA TGGAGTGGGCAGCCTAATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCT TCCACCATTAAAAAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAA TCATGGAGGAAGAAGTTGCTGTATCATCATGATCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTAT CATAATCGGTTGGTTCATGATCATCATCAGAAGGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTC GTTAAGGTTAAGATGGAAGGAGTTGCAATAACAAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGT TCATTCAATACCCTCAAAAACTCAGTGATTGCCATGTTCGCAAAATACGAAAAATGTGAG AAGGGAAGCGTACGTTATACACTAAACTACCAAGACAGAGGAGGAGTTTGGCTTCTGGCA GAAGATGTTCCCTGGCGGACATTTGTCGAATCTGTTCAACGACTGGAAATATCGAGGAAT GGCGGTTGA >LITCHI016980.m2 ATGGAGCTTCAACTAGGACTTGCCCTCGCAACCCACCACAACCCCACCAAAGGTTTCGAC CTCAACCACCGTCTAGACACTTTTGATGACCAAAAAAGCTTTAAAAACAAACGTAGCTTT GAAGAGGCCTCTGGCAAGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTA TGGAGTGGGCAGCCTAATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCT TCCACCATTAAAAAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAA TCATGGAGGAAGAAGTTGCTGTATCATCATGATCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTAT CATAATCGGTTGGTTCATGATCATCATCAGAAGGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTC GTTAAGGTTAAGATGGAAGGAGTTGCAATAACAAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGT TCATTCAATACCCTCAAAAACTCAGTGATTGCCATGTTCGCAAAATGTAAGTACATATAT GTTATAGATTCGTTTCCTGACGAGAAGGTTTATGTAGTCTTGGATTAA
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>LITCHI016980.m1 MELQLGLALATHHNPTKGFDLNHRLDTFDDQKSFKNKRSFEEASGKIIRDELQKMPNLLL WSGQPNEEDDDREGRKKRDSSTIKKEEEEEKRVVGWPPIQSWRKKLLYHHDQVGRIENNY HNRLVHDHHQKENGGSNSKFVKVKMEGVAITRKVDLRFYRSFNTLKNSVIAMFAKYEKCE KGSVRYTLNYQDRGGVWLLAEDVPWRTFVESVQRLEISRNGG. >LITCHI016980.m2 MELQLGLALATHHNPTKGFDLNHRLDTFDDQKSFKNKRSFEEASGKIIRDELQKMPNLLL WSGQPNEEDDDREGRKKRDSSTIKKEEEEEKRVVGWPPIQSWRKKLLYHHDQVGRIENNY HNRLVHDHHQKENGGSNSKFVKVKMEGVAITRKVDLRFYRSFNTLKNSVIAMFAKCKYIY VIDSFPDEKVYVVLD.
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>LITCHI016980.m1 TGGCACGTTGGTGCACCCTTTTCTCATCTGTCCATGTCACTGCTAGGCCTTTTCCCGACC CAACTTCCATGCTGTCCCTAACTTCCTCTCTTCCACAAGACAATCATCAATTTGATCAAT CTCTCTCTTCAACTCACATATAAATACTTTACGATTCCAAGCCCACAACTCCCCCTCAAA GCAGTACAACTACTCTTGCATTGCTTTTCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTTTCGTCCCCTTT TTTTATTTTTAATATTTTATATTATTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACA TTTTTGCTATATAGCTCTATAGCTTCTAATAATTCTACTTGGTAATGGAGCTTCAACTAG GACTTGCCCTCGCAACCCACCACAACCCCACCAAAGGTTTCGACCTCAACCACCGTCTAG ACACTTTTGATGACCAAAAAAGCTTTAAAAACAAACGTAGCTTTGAAGAGGCCTCTGGCA AGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTATGGAGTGGGCAGCCTA ATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCTTCCACCATTAAAAAGG AAGAAGAAGAAGAGAAGCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAATCATGGAGGAAGAAGT TGCTGTATCATCATGATCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTATCATAATCGGTTGGTTC ATGATCATCATCAGAAGGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTCGTTAAGGTTAAGATGG AAGGAGTTGCAATAACAAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGTTCATTCAATACCCTCA AAAACTCAGTGATTGCCATGTTCGCAAAATACGAAAAATGTGAGAAGGGAAGCGTACGTT ATACACTAAACTACCAAGACAGAGGAGGAGTTTGGCTTCTGGCAGAAGATGTTCCCTGGC GGACATTTGTCGAATCTGTTCAACGACTGGAAATATCGAGGAATGGCGGTTGATCATGAA TCGGCTAGTTTTGCTTGCACTGAGAGTAGCTTTTATTAATTTGATGTGGTTTATGTGCTT GTTTAGACAAATCGACATGAGACTTACTATTTGAATAAGTTAGATTTATAACAAATTACT AGTATTGGAGTGACTATAGCTCTAGCAGCCAAGCAATTAGAACAAGGACTGGAACTTGAG AAGCTTTGTTTGATCCATCTTTGTATTGTATTTAATTTATTATAAAAGACTATATATATG CATTTTAAGTATGTAACCATGCTGATATATTAATTATATGAATAACACTACATTCTTCAA AA >LITCHI016980.m2 TGGCACGTTGGTGCACCCTTTTCTCATCTGTCCATGTCACTGCTAGGCCTTTTCCCGACC CAACTTCCATGCTGTCCCTAACTTCCTCTCTTCCACAAGACAATCATCAATTTGATCAAT CTCTCTCTTCAACTCACATATAAATACTTTACGATTCCAAGCCCACAACTCCCCCTCAAA GCAGTACAACTACTCTTGCATTGCTTTTCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTTTCGTCCCCTTT TTTTATTTTTAATATTTTATATTATTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACA TTTTTGCTATATAGCTCTATAGCTTCTAATAATTCTACTTGGTAATGGAGCTTCAACTAG GACTTGCCCTCGCAACCCACCACAACCCCACCAAAGGTTTCGACCTCAACCACCGTCTAG ACACTTTTGATGACCAAAAAAGCTTTAAAAACAAACGTAGCTTTGAAGAGGCCTCTGGCA AGATCATTAGAGATGAGTTGCAAAAGATGCCTAATTTGCTTCTATGGAGTGGGCAGCCTA ATGAGGAAGATGACGATCGAGAGGGACGAAAGAAGAGAGATTCTTCCACCATTAAAAAGG AAGAAGAAGAAGAGAAGCGTGTTGTGGGGTGGCCACCAATTCAATCATGGAGGAAGAAGT TGCTGTATCATCATGATCAAGTGGGTCGGATCGAAAATAATTATCATAATCGGTTGGTTC ATGATCATCATCAGAAGGAAAATGGAGGATCAAATTCTAAGTTCGTTAAGGTTAAGATGG AAGGAGTTGCAATAACAAGAAAAGTTGATCTTAGATTCTATCGTTCATTCAATACCCTCA AAAACTCAGTGATTGCCATGTTCGCAAAATGTAAGTACATATATGTTATAGATTCGTTTC CTGACGAGAAGGTTTATGTAGTCTTGGATTAATTTTCACCGTTTCTAAATCGTACAGACG AAAAATGTGAGAAGGGAAGCGTACGTTATACACTAAACTACCAAGACAGAGGAGGAGTTT GGCTTCTGGCAGAAGATGTTCCCTGGCGGTACGAATATTCGGATTAGTTTCTTTTTTTCC AATAAATATATATAGAGGGATTTGATTAATATTTATTTATTGTGGTTAATTATTTGGATG TGTAATTTGCAGGACATTTGTCGAATCTGTTCAACGACTGGAAATATCGAGGAATGGCGG TTGATCATGAATCGGCTAGTTTTGCTTGCACTGAGAGTAGCTTTTATTAATTTGATGTGG TTTATGTGCTTGTTTAGACAAATCGACATGAGACTTACTATTTGAATAAGTTAGATTTAT AACAAATTACTAGTATTGGAGTGACTATAGCTCTAGCAGCCAAGCAATTAGAACAAGGAC TGGAACTTGAGAAGCTTTGTTTGATCCATCTTTGTATTGTATTTAATTTATTATAAAAGA CTATATATATGCATTTTAAGTATGTAACCATGCTGATATATTAATTATATGAATAACACT ACATTCTTCAAAA
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>LITCHI016980.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCATTATTGTCAACAAAAGATTCAAAATCCATTTCACATAGGGTTACAAATTGTACAACC GCATTTGATTTTCCTGTCACGCCAACCAAAACGACAGTGAATTTAATTTAATTTATAGCA ATGTACGTACATATGTTTATTCACGTACACAATCTTACTTTTCATCACCTTCACCATGAC CCACCACACGAGCACCATGCGGTCCAGGCTAGACTACACCCCTGATGGGACTCATCATGA AGGAGTTCCGGATAGACTCGGTTTGAATTTGTGTCCGAACCAGGCCATAGCCGTGCGGGT CGGGGGGTTAACCATGTCGAGCCCCACGCTGGCCGTCACGTGAACTTCACGAGGGCTTTT TTAACACTACAAACAAACCCTACCACTACCACCACATATACCAATCCCACCGAGAACACT TACCAAACACTAATATATCTATATATATATATATGTATATATAAACTGAGTTCTCTCTCT CTCTTCTATTATTGGCTCCAACTCTAGAACTAAACTCCGACCAAAAGAATCTTCATTATT TTAATTTATTTAAAAAAAATGGAGTGTTGTTTAGTTTTGCGGTTATAGTTTGGTATATGA TGTGTCGTGTACTATTTTGATATCACTATAAACCAAAGAAGAAGATCAAGAGAATGTTTT AGTGCCAATTAATGTGGAGGTTCATGGGGGTGATTGAGTTCATGCATCATGAGATATTTG AAGGCAGGAGTCTGCCGACATTATCGATGGACATGTTTGGAGATAGAACTCATCATCTGT CTAGTGTGTTCACGCACTAACAAAGTAGATATATTTTTTATATATATATTTATCACAAGA ACTGATCATAAGTACTGCTGGCTGATTAGTTTGCTAGCAAAAATTATCATTATATTGAAA AAATATTGCTGTTTGGGAGACTGGAGGGTTGGATTTTGATCGAATAATGTGTTTACACGG TGACAGAAAAGTAAACATTGATCATATCTTGATTTCTTTTTTGTTCAAAAGGAATATGAT TACCTATAATGTTGCAATTAACTTTATCTAATTCTCTTCCTAACCCTATAAATTATCAAT TGTTAGTTAGAACTAACAGTCAAGTTCAATATTTACTGCCTTTCTTTTCAAGTAGGTTAT AATATAATACAGATGGGAATGTCAATGTGAATGTGTATCGTTTGAAAAATAAAATTATAC AAATTGTAGTGTACTGATAAAACTATAAGTTTTTTTTTTAAGAATTTCAAATGTTGGTAA TTGGACATACGTAGTCAGTTTTTAGTAGCTAGAGAGGAGCACATGCAATGCATACTCTGT ATGAGTACGAAATTCAAAGAGGAATATATAAAATCTTTAAAAATGAGACATATTACTAAC GTTTATAATTGAGATTTTTAGGAAAGAATTTATAAGAGTTTAGATTAGCAACGATAATTC TGATTTGTGAAAACTAGAGCTTGAGAGAGAGAAGATTTTGGTTACTAATTAGTATGGGAA CATGTTGCTTGTGTTTATAATTAAGATTTTTATGAAGAAATTTAATAAGAGTTTAAATCG GTAAAAGATTTTAGTAATTTATTTTATACGCGATACGTGGGACACGTTGACAGTGTGGGG GTTAAGAGTGGAAGATAGCTCCGGGCAAAGTGGTCCTGGCACGTTGGTGCACCCTTTTCT CATCTGTCCATGTCACTGCTAGGCCTTTTCCCGACCCAACTTCCATGCTGTCCCTAACTT CCTCTCTTCCACAAGACAATCATCAATTTGATCAATCTCTCTCTTCAACTCACATATAAA TACTTTACGATTCCAAGCCCACAACTCCCCCTCAAAGCAGTACAACTACTCTTGCATTGC TTTTCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTTTCGTCCCCTTTTTTTATTTTTAATATTTTATATTA TTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACATTTTTGCTATATAGCTCTATAGCT TCTAATAATTCTACTTGGTA >LITCHI016980.m2 + Up_Stream_Len 2000 CCATTATTGTCAACAAAAGATTCAAAATCCATTTCACATAGGGTTACAAATTGTACAACC GCATTTGATTTTCCTGTCACGCCAACCAAAACGACAGTGAATTTAATTTAATTTATAGCA ATGTACGTACATATGTTTATTCACGTACACAATCTTACTTTTCATCACCTTCACCATGAC CCACCACACGAGCACCATGCGGTCCAGGCTAGACTACACCCCTGATGGGACTCATCATGA AGGAGTTCCGGATAGACTCGGTTTGAATTTGTGTCCGAACCAGGCCATAGCCGTGCGGGT CGGGGGGTTAACCATGTCGAGCCCCACGCTGGCCGTCACGTGAACTTCACGAGGGCTTTT TTAACACTACAAACAAACCCTACCACTACCACCACATATACCAATCCCACCGAGAACACT TACCAAACACTAATATATCTATATATATATATATGTATATATAAACTGAGTTCTCTCTCT CTCTTCTATTATTGGCTCCAACTCTAGAACTAAACTCCGACCAAAAGAATCTTCATTATT TTAATTTATTTAAAAAAAATGGAGTGTTGTTTAGTTTTGCGGTTATAGTTTGGTATATGA TGTGTCGTGTACTATTTTGATATCACTATAAACCAAAGAAGAAGATCAAGAGAATGTTTT AGTGCCAATTAATGTGGAGGTTCATGGGGGTGATTGAGTTCATGCATCATGAGATATTTG AAGGCAGGAGTCTGCCGACATTATCGATGGACATGTTTGGAGATAGAACTCATCATCTGT CTAGTGTGTTCACGCACTAACAAAGTAGATATATTTTTTATATATATATTTATCACAAGA ACTGATCATAAGTACTGCTGGCTGATTAGTTTGCTAGCAAAAATTATCATTATATTGAAA AAATATTGCTGTTTGGGAGACTGGAGGGTTGGATTTTGATCGAATAATGTGTTTACACGG TGACAGAAAAGTAAACATTGATCATATCTTGATTTCTTTTTTGTTCAAAAGGAATATGAT TACCTATAATGTTGCAATTAACTTTATCTAATTCTCTTCCTAACCCTATAAATTATCAAT TGTTAGTTAGAACTAACAGTCAAGTTCAATATTTACTGCCTTTCTTTTCAAGTAGGTTAT AATATAATACAGATGGGAATGTCAATGTGAATGTGTATCGTTTGAAAAATAAAATTATAC AAATTGTAGTGTACTGATAAAACTATAAGTTTTTTTTTTAAGAATTTCAAATGTTGGTAA TTGGACATACGTAGTCAGTTTTTAGTAGCTAGAGAGGAGCACATGCAATGCATACTCTGT ATGAGTACGAAATTCAAAGAGGAATATATAAAATCTTTAAAAATGAGACATATTACTAAC GTTTATAATTGAGATTTTTAGGAAAGAATTTATAAGAGTTTAGATTAGCAACGATAATTC TGATTTGTGAAAACTAGAGCTTGAGAGAGAGAAGATTTTGGTTACTAATTAGTATGGGAA CATGTTGCTTGTGTTTATAATTAAGATTTTTATGAAGAAATTTAATAAGAGTTTAAATCG GTAAAAGATTTTAGTAATTTATTTTATACGCGATACGTGGGACACGTTGACAGTGTGGGG GTTAAGAGTGGAAGATAGCTCCGGGCAAAGTGGTCCTGGCACGTTGGTGCACCCTTTTCT CATCTGTCCATGTCACTGCTAGGCCTTTTCCCGACCCAACTTCCATGCTGTCCCTAACTT CCTCTCTTCCACAAGACAATCATCAATTTGATCAATCTCTCTCTTCAACTCACATATAAA TACTTTACGATTCCAAGCCCACAACTCCCCCTCAAAGCAGTACAACTACTCTTGCATTGC TTTTCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTTTCGTCCCCTTTTTTTATTTTTAATATTTTATATTA TTATCATCAGCATCATCAATCCTTAAATCAGCAACATTTTTGCTATATAGCTCTATAGCT TCTAATAATTCTACTTGGTA
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>LITCHI010930.m5 GenomeSequence + AAATTTCAAATCAATCAGCCATCTCTATCTCCAATTTAAACACTTAAGTTTAACATCTAA CGGATTGATGACAATTAATGAAAAGAAGGTTGTTCATTGAAAACAGGTTACAAAAGTAAA ACCACACACAATTGCCATTCAAATTCAACACGGGATTGCACAAGATTTCTAGAATCACCC AAGCTGACCTTCATCGACAATCCAAAAACGTGTTAACAAATTTCAAACATCAATCTCTCT CCCAACTAGCTGTTTCCATTTGTTCTAGAGTTTCCCCAAATATTCCAATCAACTTCAATA ATTTTTCTTGCTTGCTACACCAATTTGTTGATCTTCTTCAGGTTCATTGTCATTCCCTCG CTGCAAACAGGTACTACTTGAAAACTTTACGACTTTTGTTCAAATTTGAATCATAGATTT ACTTTGTTATTGGTTTTTGTCTTTGGTTATGAAGAAAGTCTAACGATATATTAGACTTTG ATCACTATAGTGGGTTCGGGTTTAGTGTGTAAAAGATTGTGGTTTTGACTACAAAGATGA AAATGTTGATCTAGTCAAGACATTGAAAATGATCAAAAGAATGAAAACAACATTAATGAT TACAGTGAGCATCTTTGTTGCCGTTTTATGTTTTTAGTGCTTTATTATATCATGTTAAAG AATTTAGATTTGCGAGGTTTCACGTCATCTTTTGCATTTTTCACTTTTGCTTTCTCACCG GACCATATGCACTTGATCTACCCACATGCATTTCTCTATGTTTTTGTCCGGATCGAGATT GAAACATGGAATGCGACGAAGATAGACAATACGATTTTGTTTTTTAGTAACCAAACTTTC TTTCAATTTTGAAAAATAATCCTGAAATGAATTTAAGGGACATATTCAATTTAAAATTTT 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