Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI016976 | Chr1 | 42145026 | 42149269 | - | E3 ubiquitin-protein ligase KEG |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI016976.m1 | 44 | 305 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 89.7 | 2.00E-25 |
| LITCHI016976.m1 | 46 | 305 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 66.1 | 3.40E-18 |
Download Copy
>LITCHI016976.m1 ATGGCTGGAAAGTTTGCTGTTCAACCTGACCCTTTCGAGTATGAGCTTTATGTTGGTGAT CCTGATCACCTGGTAACTGTGGTCGCAACATCAAATCAGAAGACTCCGTGGATTGACCCC GGAATGGTGAAACTTAGACACAGAATAGGGAGGGGAGCATTTGGTGAAACATGGTTGGCT ACCTATCATCGATCAACTGAAGCTTATGAGGAGTATTACGAGGTGGCTGTCAAGATGTTG CATCCCGTTAAAGAGGATTGCATGAAGGTTTTGTTGGATAAGTTGGATGATTTGTTTACC AAGTGTGAAGGGATTGAAGGTGTGTGTTTGCTGCAGGGAATTTCAGTTATCAGTGGAAAA ATTTGCATCATTATGAAATTCTATGAAGGATCGATTGGCGATAAAATGGCCCACCTCAAA GGAGGGAAGCTAACACTTTTTAATGTTTTCAGGTATGTCGTCGATTTGGCTCAGGGAATT TCAGAACTTCACGCAAAAGGGAACCTGGTCCTTAACCTTAAACCGTTCAACTTCCTTCTC AATGAAAATGACCAAGCAGTTCTGGGAGATGTTGGTATTCCTTATCTATTGCTTGGAATT CCTCTACCGAGCCCGAATTTAATTCGCAGGCTTGGAGCACCAAATTACATGGCTCCAGAA CAGTGGCAACCGGAAGTCAGAGGTCCAATATCATTTGAGACTGATTCATGGGGATTTGCA TGCAGCATTCTAGAGATGTTGACTGGTGTTCAGCCTTGGTGTGGGAGGTCAGTTGAGCAA ATTTATGATGCAGTTGTCAAAAAGCAAGAGAAACCGCAAATTCCCAGTGGCCTTCCTCCT CCAGTTGAGAGTGTTCTATGTGGTTGCTTCGAGTATGACTTCAGGAGTCGCCCTTTAATG ACAGACATATTGCGTGTGTTTAAGAGCTGGCAGAATGCAATTAATATTGATGGAGGCTGG ACAGATCCTGGGAGCAGATTACTAGTAGAGAGATCTAGTGGTGGTTATACTGGGAGGTTT CTATCAAAAGATGATTTGCAAGTTGGTGACATGGTGCGTTCTAGAAAGCTGCCTAACTCT CACAAACCTGAAATCATGGATATTCCGGAAGGAACAGTGGTTGGTTTAGAACGTAACACG AACACAGAAAGGGATGGTTTTGTTATGGTGAGGTTACATGGTATCCATGACCCCTTGAGA GTTCATGTTTCTTCACTGGAACGAGTTGCCTTTGGCTTGGCAGCTGGGGATTGGGTACGC TTGAAGGCGGAAGATAAGAGGCACTCTCCAGTTGGTGTTCTTCATTCCATTCATCGCAAT GGAAGCGTGGCCGTTGGGTTTATAGGGTTGGAGACCCTATGGAAGGGAAAAACTTCAGAA CTGCAGATGGCGGAATCTTACCATGTTGGTCAGTTTGTAAGGTTGAAAGGTAACGTTCTT AGTCCTCGATTTGAATGGCCTCGTAAAAGGGGAGGGGCTTGGGCTACTGGGAGAATTTGC TGGGTCCTACCAAATGGGTGCCTCATTGTCAAGTTTCCTGGGAGGTTGTCTTTTGGAGAG CAAAGCGTTTTTTTGGCAGACCCAGCTGAAGTAGAAGTGGTTAGTTTCAGGACTTGTCCA GATATGGTAAAAAAATATGAGCATCTTGAGGATTTCCACTGGGCTGTGAGACCACTTCTT ATTGCATTAGGTATCTTTACAGCCATGAAGGTGGGATTTTCTGTTGGAAGAAATATTAGG GTTTCGGATGTGAAGGAGGAAAAGAGAAAGAGTGGTCAACATGTGGATAGCCAACGTATC GATAACCATAATGCCGCCAGCAATTCTGCATCTGGCAAACGTTCTTTTTGGTGA
Download Copy
>LITCHI016976.m1 MAGKFAVQPDPFEYELYVGDPDHLVTVVATSNQKTPWIDPGMVKLRHRIGRGAFGETWLA TYHRSTEAYEEYYEVAVKMLHPVKEDCMKVLLDKLDDLFTKCEGIEGVCLLQGISVISGK ICIIMKFYEGSIGDKMAHLKGGKLTLFNVFRYVVDLAQGISELHAKGNLVLNLKPFNFLL NENDQAVLGDVGIPYLLLGIPLPSPNLIRRLGAPNYMAPEQWQPEVRGPISFETDSWGFA CSILEMLTGVQPWCGRSVEQIYDAVVKKQEKPQIPSGLPPPVESVLCGCFEYDFRSRPLM TDILRVFKSWQNAINIDGGWTDPGSRLLVERSSGGYTGRFLSKDDLQVGDMVRSRKLPNS HKPEIMDIPEGTVVGLERNTNTERDGFVMVRLHGIHDPLRVHVSSLERVAFGLAAGDWVR LKAEDKRHSPVGVLHSIHRNGSVAVGFIGLETLWKGKTSELQMAESYHVGQFVRLKGNVL SPRFEWPRKRGGAWATGRICWVLPNGCLIVKFPGRLSFGEQSVFLADPAEVEVVSFRTCP DMVKKYEHLEDFHWAVRPLLIALGIFTAMKVGFSVGRNIRVSDVKEEKRKSGQHVDSQRI DNHNAASNSASGKRSFW.
Download Copy
>LITCHI016976.m1 TATCATTAATTCTCTCGCTCTCTCTTCTCTGAAAAATAAAAATAAAAAATAACCCTCCAT AAAATGGTCTCTCGCTCATTTTTGTGAATTCTAATTGCTTGTTCAGCTGCTACTGTCTCT GGTATCATTAATGAGCTTCAAGTTGATTGATTTTGGCTCTTTGTTTGTCTATTGATTCTC TCTCTGCGTTTCCAGTAAGTACTTGTTCTAATATCAAAAGGGTCTGTTTGGTCTACTTAA TATTCAGATTTTATATTTATTTGTTATGTGTTTTTGGTTGTCATGAGTTGATGATGTTTT GATTTGTTTAATATAGGATGGATAGAGGTTTGTTCATGCATGTTTATTGTATATATGGTG ATTGTTTTAGTAGAGTTAAGCAACTTGCGCTCGTACCTTTTTTTTTTTAATATGTGGAAG TTTTTGACAATTGCTTTTGGTTACTGTTAAGATTACTATTATAGTTTTCCAATGAAGATG ATGATTTATAGTGTTTTTTTTATAACTTATTTTGACAATGATTGATGATGTTGGTTTGTT CGAAGTCACCTCATGATATTCATGTGTGCTTGTTTTAAGTGGAGTTAAAGCAACTATGCA AGGAATCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTAATATATATATTATTATGTTTGTGAGACCCTGAA AATTATAGTACTTTTGAGATTACTATTATAATTTTCTGATGAAGATGATGATCTAGAGTG TTTCGTGCTTATATAACTTGTGCAAACAGTGATTTATGATGTTGGTTTGTTTGAAATGAC CTAATGACATTGATATTTTTATTTTTTTGATTTGGTATACGGAATGGCTGGAAAGTTTGC TGTTCAACCTGACCCTTTCGAGTATGAGCTTTATGTTGGTGATCCTGATCACCTGGTAAC TGTGGTCGCAACATCAAATCAGAAGACTCCGTGGATTGACCCCGGAATGGTGAAACTTAG ACACAGAATAGGGAGGGGAGCATTTGGTGAAACATGGTTGGCTACCTATCATCGATCAAC TGAAGCTTATGAGGAGTATTACGAGGTGGCTGTCAAGATGTTGCATCCCGTTAAAGAGGA TTGCATGAAGGTTTTGTTGGATAAGTTGGATGATTTGTTTACCAAGTGTGAAGGGATTGA AGGTGTGTGTTTGCTGCAGGGAATTTCAGTTATCAGTGGAAAAATTTGCATCATTATGAA ATTCTATGAAGGATCGATTGGCGATAAAATGGCCCACCTCAAAGGAGGGAAGCTAACACT TTTTAATGTTTTCAGGTATGTCGTCGATTTGGCTCAGGGAATTTCAGAACTTCACGCAAA AGGGAACCTGGTCCTTAACCTTAAACCGTTCAACTTCCTTCTCAATGAAAATGACCAAGC AGTTCTGGGAGATGTTGGTATTCCTTATCTATTGCTTGGAATTCCTCTACCGAGCCCGAA TTTAATTCGCAGGCTTGGAGCACCAAATTACATGGCTCCAGAACAGTGGCAACCGGAAGT CAGAGGTCCAATATCATTTGAGACTGATTCATGGGGATTTGCATGCAGCATTCTAGAGAT GTTGACTGGTGTTCAGCCTTGGTGTGGGAGGTCAGTTGAGCAAATTTATGATGCAGTTGT CAAAAAGCAAGAGAAACCGCAAATTCCCAGTGGCCTTCCTCCTCCAGTTGAGAGTGTTCT ATGTGGTTGCTTCGAGTATGACTTCAGGAGTCGCCCTTTAATGACAGACATATTGCGTGT GTTTAAGAGCTGGCAGAATGCAATTAATATTGATGGAGGCTGGACAGATCCTGGGAGCAG ATTACTAGTAGAGAGATCTAGTGGTGGTTATACTGGGAGGTTTCTATCAAAAGATGATTT GCAAGTTGGTGACATGGTGCGTTCTAGAAAGCTGCCTAACTCTCACAAACCTGAAATCAT GGATATTCCGGAAGGAACAGTGGTTGGTTTAGAACGTAACACGAACACAGAAAGGGATGG TTTTGTTATGGTGAGGTTACATGGTATCCATGACCCCTTGAGAGTTCATGTTTCTTCACT GGAACGAGTTGCCTTTGGCTTGGCAGCTGGGGATTGGGTACGCTTGAAGGCGGAAGATAA GAGGCACTCTCCAGTTGGTGTTCTTCATTCCATTCATCGCAATGGAAGCGTGGCCGTTGG GTTTATAGGGTTGGAGACCCTATGGAAGGGAAAAACTTCAGAACTGCAGATGGCGGAATC TTACCATGTTGGTCAGTTTGTAAGGTTGAAAGGTAACGTTCTTAGTCCTCGATTTGAATG GCCTCGTAAAAGGGGAGGGGCTTGGGCTACTGGGAGAATTTGCTGGGTCCTACCAAATGG GTGCCTCATTGTCAAGTTTCCTGGGAGGTTGTCTTTTGGAGAGCAAAGCGTTTTTTTGGC AGACCCAGCTGAAGTAGAAGTGGTTAGTTTCAGGACTTGTCCAGATATGGTAAAAAAATA TGAGCATCTTGAGGATTTCCACTGGGCTGTGAGACCACTTCTTATTGCATTAGGTATCTT TACAGCCATGAAGGTGGGATTTTCTGTTGGAAGAAATATTAGGGTTTCGGATGTGAAGGA GGAAAAGAGAAAGAGTGGTCAACATGTGGATAGCCAACGTATCGATAACCATAATGCCGC CAGCAATTCTGCATCTGGCAAACGTTCTTTTTGGTGAAAGCGTTAGTACCAGTGCTGCAC AATTGATATTAGGACATGTTTGTCTGCCGAAAGCTAGTCAAATTTGCTGAATTATGTACA TATTGACTTTGCTAATTTATGCTGCACAATTGATATTAGGACATGTTTGTCTGCCGAAAG CTAGTCAAATTTGCTGAATTATGTACATATTGACTCTGCTAATTTATGCTGCGTATAGGA CATGCGACTAATTATTTCTACGAAAACATGCAACAGCAACTAATACTGCTACTGGGAAAT TGTCGTTTCATTTCGG
Download Copy
>LITCHI025584.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAATACTGCTCGCCGAGTCATGAATGTCTCCCCTATCTAAGCGACACCTGTTATTGGAAT TGATCTGAATTTTCTATTTGTATTTTTAAATTTTTTAAAATAATGTGATAAAATAATTTA TAATATCCATCTTAATTATAAAATGATATAGAATGATATGTAAATGGAACATCCACATTA TTTTGGATAATAAATTTTGATAGAATATTAGATGGTTAAAATTACTCGTCTCCTGTTAGA ATCTCTCAATTTTAAGTGTGGCTTGTGCAGTGTGGGGTTGATAATTGAATCCTTTCGTGT GCAACCATTAAAGTTTCTGTACGCATTCAGTTTTTTAGTTCTTTCGAAAGAATGAAGGCA TGCAGTATTGAATACATACAAATTATGTACTCTTCACAAGTTACCAATATGTAACTGTGA AAGGTACGAAAGATTTCAGGCAACTAATTGCTAAAAGGTACGAAATTTCGGGCGCTCAAT TTCTAAAGTGCACCCCGTGAACATGAATCCAGTACAAGTACAAACAATATGTTATTTCCA AGGTCGATGTTACTCTACTAGACAACAAGACCTGTCCGTCCGTCCATCCATCTATCCATC GACGGAACTACCCCAGCAAATATCTCATCAATTGAATTGAATCTAACCCATTCAAAAAAC ATTTAATAAAGGGTTGACTGATGTGTGACACGTGGTGGATAACGAAGAGAGCAAATCTCT AATAAAAGGAATAATAACGTTATTCTTAATTACAACACAATATATGTTATAGGTTTTTAA ATAAATATTACTATTAATATCAAATATGATTGTTTAATTAATATTATTTTTATTTATAAA GTGATGCTAATATTATGTTGTTAGTAGAATATCACATCAATAACAGTATAGGAAGCTAAT TCAACGTTCAAAGAAAGATTTTCACCATCTTAAAGTGATTGTTTATTATAGGAATGAGTT AGATTAATAAAAGGTGAGAGGAGAATAATTAAATGGCGTAAGCACATTCTTTTAACGTCA TCATCACACACCAGTCTGGGAAATATCACTCACGGGTCAGCCAAGCTCCTCACAGCCCCC GACAAGCGTGGGCTGGAACACAGTGATGCAGTCAATAAGCACACTAATTAGAGAGCTAGA GATGCAGATAGAAAGAGAGAAACCAAAGGTGGGACTCACATGATCTCACTCTCACCCTCT GTCTGTCTCCCCTTTCTTGTTTTATCGTCTAACTTTTTCTCTCACAGTTGGGGGATTCCT TTTACGAAGCCGACAATGAAGTCAATAACTCGCATCCAAATTACTCAAACACCCTTACAT ATAAATGCTGTTTCTTGTAACCATGCATGGTGTTTTTGGTCTTTTCATTGCAGGTACATT GAAAAAGGTTATGAGGAAAAGGCCCTGCTAGGCACAGGAACCAGTACGCAATATAGGTCA AACCCCATCAAGACATTCAAGACACAACCGGGTTTCAGCTAACCTATACCGCGGTGCCCT ATTAATCACGACAAAAACGACGAAATCACAAAATGCCCACCACCCCGCACGCGATCCAGG TAGCGCGTTTGGATTTATCCATATATTCTGGTCATCCTGGGCCCACCAAACATGGTTCAT GGCCTTAATTTATATGATAACTCCACGTATACCACGCGCACCACAATGTGCGTGACGTGA CTCACAGTACTTGCCCCACTAAGTGACAAACGAATCCAGTCACATGACAGTTACAGTAAA AGCGTGACCTCCCAACCGGATACCACCACCTACGCATAATAAGTCAAACTAGTAGCGACT GCATCATCCATATCTCCAAAGTTGCATGTCACAGTCAAACTAAAAACCAAAACCACTTCA ACACAGCTCTCTCATTCCTAACAGCTTACATCTCTCTCAACCACCTCTCGCACGCACACA AAAACACACACAACACTCAGGACTTACTAATGTCGTGAGTTCTCTAACATCAACCTCAGT TTTTGTCTTTATTTACAACA
Download Copy
>LITCHI025584.m1 GenomeSequence + ATGCCATCACGCTGCTTATTCTCACTACCTCCTCCGCCGCTATCACTGGTGGCGCCGCCA CTCTCTCTCTACCACCACCACCACCACCACAAAAACAACCATTTCCACCTCCTCCCCGCC ATTCTCGCCGGAACGCTTGTCCTCACCTTTCTCATTCTCGTCATTATAACCATTCTCTCC TACCGTAAGCTCTCCCGCAACCGTACGGCTCCGTCGGATTTGAAGTCGCCGAATCACCAC CACTGCAGGCGGTTCTCCTACAACGTCATCCGGCGGGCGACGGCGTCGTTTGCTCCGTCG AACCGGCTGGGCCACGGCGGGTTCGGGTCGGTGTACAAAGCTGTGGTCCCGTCTTTACCG CAGCCGCTTGCGGTGAAGATACTTGATTCTTCAGGGTCGCTTCAGGGAGAGCGAGAGTTC CACAACGAGCTCTCACTGGCTTCGCCGCTCGACTCACCTCACATTGTGTCTCTTCTGGGC TTCTCGTCGGATCGGCGGGGACGCAGACTCATTCTGGTCTACGAGTTGATGGAGAACAGG AGCTTGCAGGACGCGTTGATTGATCGCAAATGTGAGGAGCTCATGGACTGGAAGAAGAGA TTCGCGGTCGCATTCGACGTCGCAAGAGGACTCGAGTACCTGCACCACTGTTGTGATCCG CCCGTGATTCACGGAGACATCAAACCCAGTAACATCTTGCTGGACGGCGATTTCAACGCC AAAATCGGAGATTTCGGCCTCGCGAGGTTAAAAACGGAGGATCTCGTCGACGGCGGCGGC GGAAGAAGGGAGGCTGTGGAGGACAATGGGTCGATCTTGGAGGAGACTGAAAGTGTGTTG ACTGCCTACGAAGAGAGCGGCACCGGCGTCGTCGACTGTGGTGTTGATCGTTCTCCGGAG AGTTGTGTTGTTAGAGTTTTCGATGCTGACGTGTCACCCGAGACTGTTTCCGCTTTGTCT CCCGAGGTTGGTGTCGATAAAGGGAGTGTATCGGAGACGTGTTTTGATAAAATCAGCGTC GAGAGCGGGACAGGAAAAAAAGGCGGTTCGAGGAGGGATTGGTGGTGGAAACAAGACAAT GGAGGAGGGTCAGAGTCAGGCAGAGTTAAAGACTATGTAATGGAATGGATCGGAAGCGAA ATCAGAAAAGAGAGACCCAAAAATGAATGGATTGCATCTCCAAGCTCCATCGACAACAAT GGTTCAAGCTCCAAGATTGAGATGAAGAAAGAAAGAGTTCGAAAAAAGGAGAAGAATCGC AAGCCAAGAGAATGGTGGAAGGAGGAATTCTGCGAAGAGCTAACGAAAAAGAAGAAGAAA AGAGGATTGAATTCTAGCAATGGAGGAGAGCTATGGTGGCAAAAAGATGAGGAGCTGGGG CAAGAAAGAAAGAAGAGAAAAAACAGGACTAGTAGAGCAAGTATTGATTGGTGGATAGAT GGGTTCAGTGGTGAATTTAGAAATGGAAGACGAAATAGCCAAGATTGGGCTAGTGGAGAC ATACCCAAGAGTGGTGGCATTAGTAGCACACCAAGCATGAGAGGAACGGTCTGTTATATC GCCCCGGAATATGGTGGTGGCGGGCTGCTGTCGGAGAAATGTGATGTTTATAGCTTCGGT GTTTTGATTTTGGTTCTCATTTCAGGGCGGAGGCCTTTGCAAGTAACGGCCTCGCCAATG TCTGAATTCGAAAGGGCTAATTTGATATCTTGGGCTAGGACATTGGCTTACAATGGGAAG CTTTTGGATCTGGTGGACACGTCTATACATTCGTTGGATAAAGATCAGGCATTGCTTTGC ATTACTATTGCGTTACTATGTTTGCAAAGATCTCCCAGCAAGCGGCCAACAATGAAAGAA ATTGTGGGGATGCTTTCCGGGGAGGCAGAGCCACCGCATTTACCTTTTGAGTTTTCACCA TCGCCGCCTAGTAATTTTCCGTTTAAGTCTCGGAAGAAGGCACGGTGAGTTTTGTTGTAA TTGTTTGTCGGGTGCCACTTAGTTTTCCATGGACTGTAGAGTATGTGTACTGTTGTAGGT CGTCTCTAATTATTATGTTATTGTAGAAATAGATGAAAGTCATGAAAATGAAATGAACAA AAAAAAAAAAAAGAAGAAAAATCGTATTCGTTTCATGAACTCAGGATTTTTTCCGGGGTT AGTTGTTTGGATGTATACTTGCTTGGGCCTACAAGTTTTGTTTCGTTGCAAACTTTCTGA AAACTTATGATTGTCAAGGTACAACCCGCTTGACTTTTGCTCATACAAGTTGTTGAAATT TAGGAATCCCAGGATTAACGGTAAATGTAAAGCAATTAGGGCATTTTGCTTTTGCTTTTT AGATGATCATGGTGGTGCCACTTCATGA