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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016932 | Chr1 | 41756365 | 41762735 | + | Homeobox protein knotted-1-like 3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016932.m1 | 35 | 76 | PF03790.16 | KNOX1 | Family | 65.9 | 2.10E-18 |
LITCHI016932.m1 | 92 | 142 | PF03791.16 | KNOX2 | Family | 74.2 | 4.70E-21 |
LITCHI016932.m1 | 200 | 221 | PF03789.16 | ELK | Family | 29.8 | 4.80E-07 |
LITCHI016932.m1 | 240 | 279 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 63.5 | 1.40E-17 |
LITCHI016932.m1 | 246 | 279 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 25.1 | 1.20E-05 |
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>LITCHI016932.m1 ATGAACAACAACAGCAACAAGAGCGAGGGAGGAGGCGGAGGAGGAGCGGTGGTCGAGAGT GCCATCGGCGGCGACGGAGTCGTGAATTGGCAGAATGCGAGGTACAAGGCGGAGATACTT TCGCATCCGTTGTACGAGCAGCTGCTGTCTGCACACGTGGCGTGCTTGAGGATCGCCACG CCGGTGGATCAGCTGCCGAGGATCGACGCGCAGCTGGCTCAGTCGCAGCACGTCGTCGCC AAGTACTCCGCCTTGGGCGCCGCTCAAGGCCTCGTTAGTGATGACAAAGAGCTCGATCAG TTCATGACACATTATGTTCTGCTGCTTTGTTCCTTTAAAGACCAACTGCAACAACATGTT CGGGTCCATGCAATGGAAGCAGTAATGGCTTGCTGGGAGATTGAGCAATCCCTGCAAAGT TTAACAGGAGTTTCTCCGGGAGAAGGCACAGGAGCAACAATGTCCGATGATGATGAAGAT CAAGTCGATAGTGATGCCAACTTGTTTGATGGAAGCCTGGATGGTACAGACAGCATGGGA TTTGGTCCTCTCATCCCAACAGAGAGCGAGAGGTCCCTGATGGAACGCGTGAGGCAAGAG TTGAAACATGAACTGAAGCAGGGCTACAAGGAGAAAATTGTAGACATAAGGGAAGAAATT TTGCGCAAGAGAAGGGCAGGAAAACTTCCTGGTGACACCACTTCCGTGCTAAAATCTTGG TGGCAATCACATGCTAAGTGGCCTTACCCGACAGAGGAAGATAAGGCGAGGTTGGTTCAA GAAACAGGTTTGCAATTAAAACAGATAAACAATTGGTTCATCAATCAAAGGAAGAGGAAC TGGCACAGTAATCCTTCAACTTCTACTGTCTTGAAGAGCAAACGCAAAAGAAGTAATGCA GGTGATAACAGCGGTGATCGTTTCATGTGA
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>LITCHI016932.m1 MNNNSNKSEGGGGGGAVVESAIGGDGVVNWQNARYKAEILSHPLYEQLLSAHVACLRIAT PVDQLPRIDAQLAQSQHVVAKYSALGAAQGLVSDDKELDQFMTHYVLLLCSFKDQLQQHV RVHAMEAVMACWEIEQSLQSLTGVSPGEGTGATMSDDDEDQVDSDANLFDGSLDGTDSMG FGPLIPTESERSLMERVRQELKHELKQGYKEKIVDIREEILRKRRAGKLPGDTTSVLKSW WQSHAKWPYPTEEDKARLVQETGLQLKQINNWFINQRKRNWHSNPSTSTVLKSKRKRSNA GDNSGDRFM.
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>LITCHI016932.m1 TCTCCGTTTTATTGAAAGGATAAATATCAGCTAATTATGAAAAAATATATCTAATGTTGA CTATAGAGACAAGCAATTATTTACCAGTGAATTTCCACTAGAGTTTAAAGTAAAATCTCA CGCGCAGAACGAGTGACAGTTGTAAAACGCAGCTTGAGATAACTGCAGCTTCAGTTGTAC GGCAACCTGGACATTGTCACCTACTTTCACTTCACATATACGCCTAGTGCGACTACAACC CACGCGCCAACTAAATTACCTTACCTTAAAACCAACAGTATTCGCCACGACGGCAGATTT CAAACCGTCCGATCACACCCAACCCAAATCGACCCTAAAAGGTCCACCCAAAATAAAGAA AGTTTTACCATCTTGTCTTATTATTATTTTTTTTTCAAAAAGGAAAATATGAATCACACC AAAACCTAATAAAAAAATATAATTAATTAATTATTGTTTGATTAATAATGCTTTGATCGT CAAGCTACTACAACCTTGTATGGTAGGTAGTTTTCTTCTACTTGAAACCACATTTCCACC AGTTTCTCTCTCAACAAATCTCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTCTCGCTCTTATGTTGTAAT CGCGCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCGTGCAGAAGACAATAGATAGATATAGACATA GATATAGATAGAGATATAGATACATAGATAGATATATAGATACGTACAACATGGCGTTTC ACCACAACCATCTCTCGCAAGACCTACCTTTGCACCACTTCACAGACCAGCAACCGGCGT CGCAGCGAATATCTCGGAAGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCGAATTGGCTGAACTCGGCCCT TCTACGGACGCAGCAGCAGCAGCAGCCGACGCAGACGCAACAGGCGACGCACTTCACCGA CACAAACTTCCTCAACCTCCGTACGAACAACGCAGGCGGCGCCGCTTCCGACTCCGATGC TTCTCAGACGCCGAACCAATGGTTGTCCCGCACGTCGTCGTCGTTGCTTAATAGGAACCA CAGCGACGTCATCGACGACGTGAATCCAGCCAACGACTCCTTAATCGCTGCCGTGGAGTC GGCTGATTTGAAGCACAGCAACAGCGAGAACATGAACAACAACAGCAACAAGAGCGAGGG AGGAGGCGGAGGAGGAGCGGTGGTCGAGAGTGCCATCGGCGGCGACGGAGTCGTGAATTG GCAGAATGCGAGGTACAAGGCGGAGATACTTTCGCATCCGTTGTACGAGCAGCTGCTGTC TGCACACGTGGCGTGCTTGAGGATCGCCACGCCGGTGGATCAGCTGCCGAGGATCGACGC GCAGCTGGCTCAGTCGCAGCACGTCGTCGCCAAGTACTCCGCCTTGGGCGCCGCTCAAGG CCTCGTTAGTGATGACAAAGAGCTCGATCAGTTCATGACACATTATGTTCTGCTGCTTTG TTCCTTTAAAGACCAACTGCAACAACATGTTCGGGTCCATGCAATGGAAGCAGTAATGGC TTGCTGGGAGATTGAGCAATCCCTGCAAAGTTTAACAGGAGTTTCTCCGGGAGAAGGCAC AGGAGCAACAATGTCCGATGATGATGAAGATCAAGTCGATAGTGATGCCAACTTGTTTGA TGGAAGCCTGGATGGTACAGACAGCATGGGATTTGGTCCTCTCATCCCAACAGAGAGCGA GAGGTCCCTGATGGAACGCGTGAGGCAAGAGTTGAAACATGAACTGAAGCAGGGCTACAA GGAGAAAATTGTAGACATAAGGGAAGAAATTTTGCGCAAGAGAAGGGCAGGAAAACTTCC TGGTGACACCACTTCCGTGCTAAAATCTTGGTGGCAATCACATGCTAAGTGGCCTTACCC GACAGAGGAAGATAAGGCGAGGTTGGTTCAAGAAACAGGTTTGCAATTAAAACAGATAAA CAATTGGTTCATCAATCAAAGGAAGAGGAACTGGCACAGTAATCCTTCAACTTCTACTGT CTTGAAGAGCAAACGCAAAAGAAGTAATGCAGGTGATAACAGCGGTGATCGTTTCATGTG AAATGGTAGAAGACTATCCCAGAACCAACCGGGATAATTTATTTCATGCTTCTAAGACCA GTGATAAAACTCATCAAACTCCCTACTACATAGAAATTGTGACACAGAGGGCTTTTGGGT ATAAGGGAAAGAGCCATATTTCGCACCTTTTGAAAGAAAGAACGAAAAAATGGCTAATGA GGCTGTGATCAACTGATTAGTAGTGCCATTTTGCCGGTATGCTCTGAAGCCATGCAAATG GTGCTATGTATGTGATGGCATATCATTAGAAAGCTCAATATCTAGGATTTATAATACTGT TAACTTGAACTATTATCCAATCCACACATGTTGGTGGATTTATGATTTTTGTTTTAGTCC CATCATCATATTATATCTGTGAATAAGAATTATTAGTGAGGGGTTCTGGGGGTGTACAGA GTAATAATCTTTGTTTAATTCCTTACAATTATAGTAGTGAGTATAGCTTTTTTGGTACTG TGATATAGATTAAATTTGCATCAAATATGAATGCTATATAAGTTGTTTAAATTCTCTATG ATACCACCTACAAAGGGATAATTTGAATCTAAAATATTATCGGGTTGAATCAAAGCTCTT TACACCCTTAGGCCACATTCGATGGTGGCTCTTTAAATGTTGGTATTGCAATTTTCTTAC TTTCTTTCTAATTGTTTTGAGATCAATTAGTGTTGATGATGACTGATATAGCAGGAGATG GTTTTGTTTATATTTAAGCTGCATTACGATGATGTCAATTAAATTTCATAACAAATGTAC AAAAAAGGACCAACAGAAGAGCTTTGTGTACGATCCATCTTTGTGGGCCGAAATTCTTCG AATTTGTTCTTTTTCTTGGAATCTTATTGCTTCAACAAGTTATATATAATATAACTTTAA TTCATTATTTCACTTGTTATGTGGATACATTCAACAAAAAGTTCTTTTGGGAGAGACAAA ACAGAAGTTGAAAGGGTTGGTCACGGTTTGAAACTTTTCAATAGTACAACTGAAAAAAGT TGACTAAATAAATGGAAACGAAATTGACGGCGACGAATATGCTTGAAAGAAAGATTTGTT TGCACAACCAAAGCGAAAATTTTCCATCAACTCTAAAGTAAAAGCAACTTACTTGAATTG ATTTGTATGATTGAAATAGGATGTCGTTGCGTAAGTTGTAGCAGAAGAAGCAACTGTATA AAACTCATTCGGGGACATTGAACCAGTTACTTCCCTCTGTCAGAATGATCATCATTCAAC ATGTTTCACCATCATACATGTATTGAAGTTGGTCGGGACATTCCAAGAAAAGATATGAGA AACCATCATATTGTGGGAATGCAATAGTTTATTTTTGGATGGGAATGCAATAGCTTTGAT ATAGGTAAGCCCCATCAAATGTCACCTTGCAGTAAAACTGAATTAGATCAAAGTACTCTA CAAAAGTGAAGTCCTCAAAGAATTCAATTTCATCAGTAATTTTGTTGAACTCAATATCAA AACCAAGAAAGGAAATATGGATATTATACGATGTGTATCTCTGATCATTTTCATCTTTTT AATAATTAATATAAAAAATATCC
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>LITCHI019055.m2 + Up_Stream_Len 2000 GTAGACAACTTGTTGCCAGAGAGACTATCAGTCCATTAACAATGCAAAATTCAAAATCAA CAACTCTAAAAAAACAGCCCTATTTGATGCAGTAACTTCCAATTAAGTACCAAAACATGA TTCCACAAATTTCTCATTGTTAAACCCTAACCTTAAGAAGAGAAGTAGCTGAAGGTAAAA TTAAAAAAAAAAAAATGTAAGAAAGGAAAATTCACCTTCAGTTAACAGATATTGGAGACA AAGTTTTGGAGAAGTAGCAAAAACCAAGTAACCAACTTTCTTGAAGAGGGAGAAAAAGAA AATGGAAGATAGGAAAGAGACGAAAGTAAGCATCAGATGGGAGGGAGGGGAAATTTTTAG TGAAGATATAAATGATCCCATTTGTCTGGAGGGTTTATTTTATCCTAACAGAGGGTAAAA TTGCTAGTGGCGTAAAATAGTCCAAAGAAGCGGGACTCACCAAAGAACATGCTAGGACTA GAACTAATACTTGCTTATCCTGTCCTGTGTAACGGACTGGGCCAGACGTTTTTTTATAGA ATTTTTATGATAAAATAACACATTACCGTAGAAAATAATAGATGATTATGATTACTATTT TCCTTTTCAAACTCAAACCCCACTTATGAAAAATGACAAAACACATGGTTAGGGCCTGGG GGAAGATTGCAACTTAATAAATATGATAGTGTTTTTTCTTAAAACCACACTGCACGGATA AAAAAAACATGAAAATTTGATGAGATTAAACACTAATTGTGCAATTTGGATATTATCCTC GTAAATGCAAAACAACTATTTTCACAATAAGAAGAAAAAACCACTTATGTAAACTTTAAA ATGTGTTCGTTCGAAATTAAAACCCAACATCCCTAGTGAATAGGAAATGCCCAACTAGGT TATAGGTGATGAAGCATAATATAGGGTTTTAATACATTATTCGGAAGACTAGGTGGAATT GGAATAACAATCCTACCAACCCTTTGTTTGGCAGTCGCTCAAAATTGACTTATACCGATG TTGACTCGATGCAAGTCCATGTATAGTCCTAGACCATGCAAACCCACAAAGTTGGTGGGT TTTGTATAATCTTGGCTCATCAATACTATATATATATGAGGTGGAATCAAATCTATTGGA TTTACCTTTCTATAGAGGGTGCTCGTCAAATGGAGACCTAGATTAGGGTCTTTATTATCG AAATGAAGGCCTAGATCTAGGTCTCCAGCATCGCTATCAATGTAAACCTAATCTAGGTCT CCATCACCATTGATAATGAAAACTGATCTAGATTTTAATCATTGATGGTAATAGAGACCT AAAACTAGGTCTCCATTGTCATTAAATGAGGATCCATATTAGATCTCAATTGCCTTTGAA TGGAGACAATAGAGACCCAAATCTATGTCTCCATCTCGATGGTCACTATCGAATGGAGAC CCAAATTCATTCTCGATTGGAATCACTAATGATGATCTTATTGTCGAGATCTGCATCACC ATTTTCATGTTTACTGTGAAGCAGGAGATTGGTGGAGATCTAATCTAGATATTTACCCTT TTATTTTTATAAATTTTCTTAAAAAATGGATGGATGATAGAAATCAAACTTGTCTTTAAT TTTTTCAAAAATTCTATTCTTTTTATTTTTTATTTTATTAAAATATTTTTCAAGCATTTT AAATTAAAAGTATAGAATTGCCCCTCAAGTATAGATACAGGTTAACATACATCCAATTTG ATATTTTTGATATTAAGGGATATTTTTGGCATATATAAAAAGGTTGCGGGGCATCTTTGT CCATTTGAAAATAACGAAAAATAATTTGGTATTTTATGAAAATAGTTTTTTTTTTAAATC TCCCTTTTTTCCAGTTATTTTTATTGGTGTCCTTTTTCAGTTTCTTCAAGTTTCTATCAT TTTCTCAAAAACCCATCAAGTCCCTAACTGGTTTATTTTGTTGGAAGTAAATTAGCGCTT GATAGAAGAGAGTGAGAGTG >LITCHI019055.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTAGACAACTTGTTGCCAGAGAGACTATCAGTCCATTAACAATGCAAAATTCAAAATCAA CAACTCTAAAAAAACAGCCCTATTTGATGCAGTAACTTCCAATTAAGTACCAAAACATGA TTCCACAAATTTCTCATTGTTAAACCCTAACCTTAAGAAGAGAAGTAGCTGAAGGTAAAA TTAAAAAAAAAAAAATGTAAGAAAGGAAAATTCACCTTCAGTTAACAGATATTGGAGACA AAGTTTTGGAGAAGTAGCAAAAACCAAGTAACCAACTTTCTTGAAGAGGGAGAAAAAGAA AATGGAAGATAGGAAAGAGACGAAAGTAAGCATCAGATGGGAGGGAGGGGAAATTTTTAG TGAAGATATAAATGATCCCATTTGTCTGGAGGGTTTATTTTATCCTAACAGAGGGTAAAA TTGCTAGTGGCGTAAAATAGTCCAAAGAAGCGGGACTCACCAAAGAACATGCTAGGACTA GAACTAATACTTGCTTATCCTGTCCTGTGTAACGGACTGGGCCAGACGTTTTTTTATAGA ATTTTTATGATAAAATAACACATTACCGTAGAAAATAATAGATGATTATGATTACTATTT TCCTTTTCAAACTCAAACCCCACTTATGAAAAATGACAAAACACATGGTTAGGGCCTGGG GGAAGATTGCAACTTAATAAATATGATAGTGTTTTTTCTTAAAACCACACTGCACGGATA AAAAAAACATGAAAATTTGATGAGATTAAACACTAATTGTGCAATTTGGATATTATCCTC GTAAATGCAAAACAACTATTTTCACAATAAGAAGAAAAAACCACTTATGTAAACTTTAAA ATGTGTTCGTTCGAAATTAAAACCCAACATCCCTAGTGAATAGGAAATGCCCAACTAGGT TATAGGTGATGAAGCATAATATAGGGTTTTAATACATTATTCGGAAGACTAGGTGGAATT GGAATAACAATCCTACCAACCCTTTGTTTGGCAGTCGCTCAAAATTGACTTATACCGATG TTGACTCGATGCAAGTCCATGTATAGTCCTAGACCATGCAAACCCACAAAGTTGGTGGGT TTTGTATAATCTTGGCTCATCAATACTATATATATATGAGGTGGAATCAAATCTATTGGA TTTACCTTTCTATAGAGGGTGCTCGTCAAATGGAGACCTAGATTAGGGTCTTTATTATCG AAATGAAGGCCTAGATCTAGGTCTCCAGCATCGCTATCAATGTAAACCTAATCTAGGTCT CCATCACCATTGATAATGAAAACTGATCTAGATTTTAATCATTGATGGTAATAGAGACCT AAAACTAGGTCTCCATTGTCATTAAATGAGGATCCATATTAGATCTCAATTGCCTTTGAA TGGAGACAATAGAGACCCAAATCTATGTCTCCATCTCGATGGTCACTATCGAATGGAGAC CCAAATTCATTCTCGATTGGAATCACTAATGATGATCTTATTGTCGAGATCTGCATCACC ATTTTCATGTTTACTGTGAAGCAGGAGATTGGTGGAGATCTAATCTAGATATTTACCCTT TTATTTTTATAAATTTTCTTAAAAAATGGATGGATGATAGAAATCAAACTTGTCTTTAAT TTTTTCAAAAATTCTATTCTTTTTATTTTTTATTTTATTAAAATATTTTTCAAGCATTTT AAATTAAAAGTATAGAATTGCCCCTCAAGTATAGATACAGGTTAACATACATCCAATTTG ATATTTTTGATATTAAGGGATATTTTTGGCATATATAAAAAGGTTGCGGGGCATCTTTGT CCATTTGAAAATAACGAAAAATAATTTGGTATTTTATGAAAATAGTTTTTTTTTTAAATC TCCCTTTTTTCCAGTTATTTTTATTGGTGTCCTTTTTCAGTTTCTTCAAGTTTCTATCAT TTTCTCAAAAACCCATCAAGTCCCTAACTGGTTTATTTTGTTGGAAGTAAATTAGCGCTT GATAGAAGAGAGTGAGAGTG
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>LITCHI019055.m2 GenomeSequence + GGCATCTTTGTCCATTTGAAAATAACGAAAAATAATTTGGTATTTTATGAAAATAGTTTT TTTTTTAAATCTCCCTTTTTTCCAGTTATTTTTATTGGTGTCCTTTTTCAGTTTCTTCAA GTTTCTATCATTTTCTCAAAAACCCATCAAGTCCCTAACTGGTTTATTTTGTTGGAAGTA AATTAGCGCTTGATAGAAGAGAGTGAGAGTGATGGCAACGGCGACATATCCGCCACCTCC ACCCTTCTACAGACTGTACAAAGATTACATAGAAAATCCAAATTCGTGTCCGCAGCCACC GCCTCCTATCGAAGGCACCTACGTTTGTTTTGGTGGCAATTACACCGTAAGACTTCGTTT TTGTTATGTATTTATCAATCTAACCATAATTCTTTGTGCCCTTGATTTGACTTCCTACGA TTGCTTGTTTAGACTGATGATGTGCTTCCGAGTTTGGAAGAGCAAGGAGTGCGTCAGCTC TACCCGAAAGGACCAAATATTGGTATAGTTTCTCTGCTTGGAGAAGTGTATCTTCTTTTG TCCACTTATTTATATTGAAAATGATGGTTGTAGGGCTGTCTGCTTGAAATATTATTTAAC TAGGTTGATGAAATTGGTTATGACATCTAAACATCGGTCTATGTAGATTTCAAGAAAGAA CTGAGGTCTCTGAACAGAGAATTGCAGTTGCACATATTGGAGCTTGCGGATGTACTTGTT GACAGACCGTCTCAATATGCCAGGAGAGTGGAAGACATATCCCTAATATTTAAGAACTTG CATCATCTCCTCAATTCGTTACGCCCCCATCAGGTTGAATATTTTTGTCTCAACATTAGT TTTCTTGACCATTTTTGAGAATTAATTGACAATGTAATAATTTCTTCTGCCTTGTAGGCT 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