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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016915 | Chr1 | 41521074 | 41526677 | - | Two-component response regulator ARR12 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016915.m1 | 18 | 126 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 79.5 | 2.10E-22 |
LITCHI016915.m1 | 202 | 252 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 28.4 | 1.50E-06 |
LITCHI016915.m2 | 18 | 126 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 79.6 | 2.00E-22 |
LITCHI016915.m2 | 202 | 252 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 28.5 | 1.40E-06 |
LITCHI016915.m3 | 18 | 126 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 79.5 | 2.10E-22 |
LITCHI016915.m3 | 202 | 252 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 28.5 | 1.50E-06 |
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>LITCHI016915.m1 ATGACTGTGGAGCGAGCAAATGGTGGTGATCAGTTCCCGATTGGAATGAGAGTTTTGGCC GTTGACGACGATGCGACTTGTCTCATGTACTTGGAGACTCTGCTTCGTCGATGCCAATAC CATGTTACCACTACAAATCAGGCCATCACAGCTTTGAAGATGTTGAGAGAAAACAAGGAC AAGTTTGACTTGGTTATAAGCGATGTGCATATGCCGGACATGGATGGTTTTAAGTTGCTT GAGCTTGTCGGGCTTGAGATGGACCTACCTGTCATAATGTTGTCGGGCAATGGAGATCCT AAGAATGTCATGAAGGGAATCACTCATGGGGCTTGTGATTATTTGCTGAAGCCTGTTCGA ATTGAAGAGCTGAAAAACATATGGCAGCACGTAGTCAGAAGGAAGAGATTTGAGACGAAG GAACGGAATAATGCTGATTATCAGGACAAAACTCATCATGGAGGTGGTGAAGCTGGTGGA ATGGGAAATTCTGATCAGAATGGAAAGCTTAATAAGAAAAGGAAAGATCAGAATGAAGAC GAGGATGAGGAGCACGATGAGAATGAACATGATAATGAAGACCTGTCAACCCAAAAGAAG CCTCGGGTTGTTTGGTCTGTAGAGCTGCATCGCAAATTTGTTGCAGCTGTTAATCAGTTG GGAATTGACAAGGCTGTACCTAAAAAGATTCTAGATTTAATGAATGTTGAAAAGCTGACA AGAGAAAACGTGGCAAGCCATCTCCAGAAATATAGGCTTTACCTGAAAAGGATCAGCTGT GTGGCTAACCAGCAAGCTAATATGGTAGCAGCCTTAGGAAGTACAGATCCTGCATATTTG CGAATGAATTCTGTTACCAGCCTTGCAAACTTCCATAACTTAGCTGGAGGTGGGCAGTTG CAGAGCAAAACATTCAGACCATTTGTACCAAATGGGATGTTTGGTAGATTGAACTCTCCA GCTGGACTGGGTATGCGTGGCCTTCCTTCTTCAGGAATGGTTCCATTGCGTCAAGCTCAA TGCTTGGACAATGCTGTTAATGATCAGGGCAAATTCCATCCAGTCATACTCTCTGGAAGT CGTAATGGGAATATACTTCAAGGGATGCCACCATCGTTAGAACTTGATCAGTTACAACCA GACAAGAGCCTTACTAGCATTAATGAGCTCCCCTCTGCCAATGAAAATGTAACCATGTTC GGTACTTCTACTGGCTTTCCTCCTCTTCTTGGTGCTGCAAACAGCCCCTTCATGTTAGGA GACCCTCAAGAGGCCCACAGTAACAAAATATTTGGTAATCAGTCATCTGTTTCATCAATA CCCTTAGATCCAGGGCCGTCTTCCCATCTGCTGGATCATGGTAGATGTAATGACAATTGG TCAAGTGCTGTTCAGTCATCTGTGGTACATCCAAGTTCTTTTTCGTTTGGTGGCGGTTAT AAGCAGCCTACTCTGCATCCCGGTAACTTGAGAGAGAATTTTTCTTCAATGGCCTCGCAA ATTGGAAATAATACATGTGATGTTTCACCTCCATTGACCAACCAATTGCAGGATTCAAAA TCAGATTTACAATACCATTCAGTCTCAATTATCAAAAGGGCTGAGCAAACAATTAGCAGT GCTCCACAAGATTGGGAAAATCACAACCAGGACGCTTCTTATCGTGGAAATATTATATGC AGCTCATTAAACTCTGCAGTCCCTATCAATGGTGATGTGGAGCCTTTGGTCCAAAGCTCA GACCTGAATAACACATATTTCCACAGAAGCACAGAATTTGATTCACTTGGGCAGTCAAAC TATATTGGTACCTTCCCCATGAAGATTAATGAGGTTCAAAGGTCAGCTATGTCGACATCA CTGAACCTTAAGGAAGAGTATTTTATGAGCCAACTGATGCCACAGGGCGGTTATGTTTCT AATAAAGGTGATTCCTTGGAAGATCTGGTGACTTCAGTGGTGAAACAGGTAAGACAAAAC ATATTTTTTTGTGATTTATTGTGTACGAGTTCTCACTTTGATATCTTTGCATAA >LITCHI016915.m2 ATGACTGTGGAGCGAGCAAATGGTGGTGATCAGTTCCCGATTGGAATGAGAGTTTTGGCC GTTGACGACGATGCGACTTGTCTCATGTACTTGGAGACTCTGCTTCGTCGATGCCAATAC CATGTTACCACTACAAATCAGGCCATCACAGCTTTGAAGATGTTGAGAGAAAACAAGGAC AAGTTTGACTTGGTTATAAGCGATGTGCATATGCCGGACATGGATGGTTTTAAGTTGCTT GAGCTTGTCGGGCTTGAGATGGACCTACCTGTCATAATGTTGTCGGGCAATGGAGATCCT AAGAATGTCATGAAGGGAATCACTCATGGGGCTTGTGATTATTTGCTGAAGCCTGTTCGA ATTGAAGAGCTGAAAAACATATGGCAGCACGTAGTCAGAAGGAAGAGATTTGAGACGAAG GAACGGAATAATGCTGATTATCAGGACAAAACTCATCATGGAGGTGGTGAAGCTGGTGGA ATGGGAAATTCTGATCAGAATGGAAAGCTTAATAAGAAAAGGAAAGATCAGAATGAAGAC GAGGATGAGGAGCACGATGAGAATGAACATGATAATGAAGACCTGTCAACCCAAAAGAAG CCTCGGGTTGTTTGGTCTGTAGAGCTGCATCGCAAATTTGTTGCAGCTGTTAATCAGTTG GGAATTGACAAGGCTGTACCTAAAAAGATTCTAGATTTAATGAATGTTGAAAAGCTGACA AGAGAAAACGTGGCAAGCCATCTCCAGAAATATAGGCTTTACCTGAAAAGGATCAGCTGT GTGGCTAACCAGCAAGCTAATATGGTAGCAGCCTTAGGAAGTACAGATCCTGCATATTTG 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>LITCHI016915.m1 MTVERANGGDQFPIGMRVLAVDDDATCLMYLETLLRRCQYHVTTTNQAITALKMLRENKD KFDLVISDVHMPDMDGFKLLELVGLEMDLPVIMLSGNGDPKNVMKGITHGACDYLLKPVR IEELKNIWQHVVRRKRFETKERNNADYQDKTHHGGGEAGGMGNSDQNGKLNKKRKDQNED EDEEHDENEHDNEDLSTQKKPRVVWSVELHRKFVAAVNQLGIDKAVPKKILDLMNVEKLT RENVASHLQKYRLYLKRISCVANQQANMVAALGSTDPAYLRMNSVTSLANFHNLAGGGQL QSKTFRPFVPNGMFGRLNSPAGLGMRGLPSSGMVPLRQAQCLDNAVNDQGKFHPVILSGS RNGNILQGMPPSLELDQLQPDKSLTSINELPSANENVTMFGTSTGFPPLLGAANSPFMLG DPQEAHSNKIFGNQSSVSSIPLDPGPSSHLLDHGRCNDNWSSAVQSSVVHPSSFSFGGGY KQPTLHPGNLRENFSSMASQIGNNTCDVSPPLTNQLQDSKSDLQYHSVSIIKRAEQTISS APQDWENHNQDASYRGNIICSSLNSAVPINGDVEPLVQSSDLNNTYFHRSTEFDSLGQSN YIGTFPMKINEVQRSAMSTSLNLKEEYFMSQLMPQGGYVSNKGDSLEDLVTSVVKQVRQN IFFCDLLCTSSHFDIFA. >LITCHI016915.m2 MTVERANGGDQFPIGMRVLAVDDDATCLMYLETLLRRCQYHVTTTNQAITALKMLRENKD KFDLVISDVHMPDMDGFKLLELVGLEMDLPVIMLSGNGDPKNVMKGITHGACDYLLKPVR IEELKNIWQHVVRRKRFETKERNNADYQDKTHHGGGEAGGMGNSDQNGKLNKKRKDQNED EDEEHDENEHDNEDLSTQKKPRVVWSVELHRKFVAAVNQLGIDKAVPKKILDLMNVEKLT RENVASHLQKYRLYLKRISCVANQQANMVAALGSTDPAYLRMNSVTSLANFHNLAGGGQL QSKTFRPFVPNGMFGRLNSPAGLGMRGLPSSGMVPLRQAQCLDNAVNDQGKFHPVILSGS RNGNILQGMPPSLELDQLQPDKSLTSINELPSANENVTMFGTSTGFPPLLGAANSPFMLG DPQEAHSNKIFGNQSSVSSIPLDPGPSSHLLDHGRCNDNWSSAVQSSVVHPSSFSFGGGY KQPTLHPGNLRENFSSMASQIGNNTCDVSPPLTNQLQDSKSDLQYHSVSIIKRAEQTISS APQDWENHNQDASYRGNIICSSLNSAVPINGDVEPLVQSSDLNNTYFHRSTEFDSLGQSN YIGTFPMKINEVQRSAMSTSLNLKEEYFMSQLMPQGGYVSNKGDSLEDLVTSVVKQDFND AGTR. >LITCHI016915.m3 MTVERANGGDQFPIGMRVLAVDDDATCLMYLETLLRRCQYHVTTTNQAITALKMLRENKD KFDLVISDVHMPDMDGFKLLELVGLEMDLPVIMLSGNGDPKNVMKGITHGACDYLLKPVR IEELKNIWQHVVRRKRFETKERNNADYQDKTHHGGGEAGGMGNSDQNGKLNKKRKDQNED EDEEHDENEHDNEDLSTQKKPRVVWSVELHRKFVAAVNQLGIDKAVPKKILDLMNVEKLT RENVASHLQKYRLYLKRISCVANQQANMVAALGSTDPAYLRMNSVTSLANFHNLAGGGQL QSKTFRPFVPNGMFGRLNSPAGLGMRGLPSSGMVPLRQAQCLDNAVNDQGKFHPVILSGS RNGNILQGMPPSLELDQLQPDKSLTSINELPSANENVTMFGTSTGFPPLLGAANSPFMLG DPQEAHSNKIFGNQSSVSSIPLDPGPSSHLLDHGRCNDNWSSAVQSSVVHPSSFSFGGGY KQPTLHPGNLRENFSSMASQIGNNTCDVSPPLTNQLQDSKSDLQYHSVSIIKRAEQTISS APQDWENHNQDASYRGNIICSSLNSAVPINGDVEPLVQSSDLNNTYFHRSTEFDSLGQSN YIGTFPMKINEVQRSAMSTSLNLKEEYFMSQLMPQGGYVSNKGDSLEDLVTSVVKQEQDN KAPDGSFGFDGY.
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>LITCHI016915.m1 GAATAAGTCACGTGGCAGAGAGAAACTATCCTAAATTACAGTGAACCAAACCAGAAATGG TAAAAGAAATCTTTATCATTGAAGTCATCAGATATTCACTCCCAATCCAGCTTTTTCACA GTCCACGGATGACCATCATACTTTCATTATAGATTCCATATTCCTTCTACTTTTCAACAC TTATTGCACATTAACACACATAATCTCTCATCAATTACACTAATATACACTGTTTTTTTT TTTTTTTCAACTTCTACTACTGTTAACTTTCTCTCTCTCCTGCAATCTAATACAATTTTT TTTTTCCAAAACTCAGCCATCGCCTTCCATTAATAACCGTCTAATCCTCGTATATTTTCT GGGTTCTCCTCAAAATCCGTTTTTTCATTGTCTATAGTCATCAAGTTTCGATCTTTTTCA ATAAAAAACACCAAAGTCTCTGTTTTTGTTTGTTGGTTTATTTGACGAGAAAAAAGAGAA TGACTGTGGAGCGAGCAAATGGTGGTGATCAGTTCCCGATTGGAATGAGAGTTTTGGCCG TTGACGACGATGCGACTTGTCTCATGTACTTGGAGACTCTGCTTCGTCGATGCCAATACC ATGTTACCACTACAAATCAGGCCATCACAGCTTTGAAGATGTTGAGAGAAAACAAGGACA AGTTTGACTTGGTTATAAGCGATGTGCATATGCCGGACATGGATGGTTTTAAGTTGCTTG AGCTTGTCGGGCTTGAGATGGACCTACCTGTCATAATGTTGTCGGGCAATGGAGATCCTA AGAATGTCATGAAGGGAATCACTCATGGGGCTTGTGATTATTTGCTGAAGCCTGTTCGAA TTGAAGAGCTGAAAAACATATGGCAGCACGTAGTCAGAAGGAAGAGATTTGAGACGAAGG AACGGAATAATGCTGATTATCAGGACAAAACTCATCATGGAGGTGGTGAAGCTGGTGGAA 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