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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016823 | Chr1 | 40524817 | 40529503 | + | Transcription factor TT2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016823.m1 | 14 | 61 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 41.2 | 1.50E-10 |
LITCHI016823.m1 | 17 | 76 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 36.5 | 4.60E-09 |
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>LITCHI016823.m1 ATGGGAAGAAGTCCTCGATGTTCCAAGGATGGTTTGAATAAAGGAGCATGGGCAGCTTCT GAGGACAAAATAGTGAGAGACTATATCAAAATTCATGGTGAAGGCAAATGGAGCAATGTT GCCAAAAAGACAGGTCTAAAGATAAGTGGGAAGAGTTGCAAGCTTCGATGGATTAATTAT CTGAGACCTGATATAAAGAGAGGCAACATTTGTAGCGACGAAGAAGAGCTGATCATCAGG CTCCATAAGCTTCTAGCCAACAGGTGGTCCGGTAGACTTCTCGGAAGAATTGACAACGAG ATCAAGAATTATTGGAATACAAACTTGGCTAAAAGATCACCAGATTTGTCTGCAAGTAAG ACACAGCCTACAACAACAACAACAACAACAACAAGAGTTCAAAACCAATCAGGTCTGGAT CCGGAACCTGGTGTACCCAATTCATTACCAAGCAATAACAACTACAATATGGAGCCAAAG AATATCATTATAAGGGCTTATAATGAGACTCATGACCAAGTAATGGCGCACTCTCATCAT TGTCTGGAGAAAATCACAATTCATCGTCAGACTTGA
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>LITCHI006642.m2 - Up_Stream_Len 2000 ATGAATTTATCTTATAATATCTCTTCAACAAATTATTTGAATGATATAGATTTGTTACAA TTAAATAGACAGAACTCTAAAACTTTGTTTGACACGCATGATTGAAATGGAATGAAATAT ATTGAAATGAAATTAAATTGATTGGATTGGAATGAAAAATCATTATCTCATATTTGATAG AACTTGAGATTGAATTAATATTATACTATATCATGTTTGATGTAGACTAGGATTGGATTG GAATAAAATTAATCTTAAATTTTTATTTATAAATTAATTTTATAAAAAATTTGAAAAAAA AAAAACCACAATTCTTCATCTCATCATCAATCTAATTCATAACATCTCCCACAATTCAAC ATCATCAAACATGGTTTATCAATATCATCAATATAATTCGTTAATATCATTATCTCTTAC ATCAACAACATTATCAACAATATGAAAATATCAAAACGTGAAAAAAAAAGGGGTTATGAT CGAATCCAGAACCAAGAACCAGATGGATTTGGGTTTGATGTCGAACCCAAAGCCACACAA CTTAGAAGGAAAAAAAGAAGAAGAAGAGATGGTAGAGAGGTTATTGCCATTGTTAGTTCG TATGGATAGAAGGGGAGATGAGAGAGACGAAAAATGGTTTATGGTGGTAGTGGGTTTGCG TGATGGAGATGAGAGATAGATTTTGTGACTTTATGGAGAAAGAGAATGAAATAAAAAAAA AAAAAACTCATGAACTTGAGATTTTGGAAAATCATAGTTTAACTTGAGATTCAATTTTTC AAGTTGAATGGAAATAAAGATGGGTTTAGGAATAAAAAATTCATTTTCATCAATATCCCC AAACTTGAGATATGGAAGAATAAAAAAAAAATAAATCCTAATTTCATCTCAAATTTCACG TAACAAATATATCCTAAGGCTTTTATTTAAAAAGCACGCCGAACTAAGCTATAAACGACG AGAATCTAAATTTTCTGTCGTGGGTTGGCCTAATTTAAAGAATTTTAAGGTTTGATTTCT GATTAGTGACAGAAGAAGTTGATGACACGTGTCGACATTTCAAGGAGGTTTGATGGGTTG TGTTATTACTATCAAGAGTTCTTATTGGGGTTCACTTTCGGGTAACAGTACAAAAAGCAA GTTGCTACAGTGGAGCAGGGAGTGAGGGAAGCCAGAGATACTCCAAAGGGACGGTCAAGA TATCGTTTTGCAGTTACCAAGAAGATCACAAGACGATGACGTCATGGAGACGGCGACGTC GATGCGCCGTATAAAGATCGCCGTTTCGAGGCGAAGGGTCCGCGGACGGTGGGCCCCACC ACAGTGTGGAGGTCCCCGAACAGAGCGGGAGGGAAAAAGTTGTACACGTGGACGCTAATT ACCTGATGTTGTCATATCGAGAATTTGGGCCCCAGTCTCTTATAGCTCCACGTCATACGT GCGGCACAACAAGTGTGACCTGAGAGAGAAACATAAAACTTTAAAAAAATGAAAAATAAA ATTTAAAAAGCAGGCACCATAAGAGAGTACTGTGGCCTCTAGACGAGAGTCACCAGTAGA TAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGA TTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGGGACCCACTTTCTCATTT GGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCGTTCTTTAATGCT ATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGAATCCAAATAGCG AACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGTAACTCACTCTCT CTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCGACACGGCTTTCC TGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCGTTGTTTTTCTTG CCGGCGAGATCGGCCGGAGG >LITCHI006642.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATGAATTTATCTTATAATATCTCTTCAACAAATTATTTGAATGATATAGATTTGTTACAA TTAAATAGACAGAACTCTAAAACTTTGTTTGACACGCATGATTGAAATGGAATGAAATAT ATTGAAATGAAATTAAATTGATTGGATTGGAATGAAAAATCATTATCTCATATTTGATAG AACTTGAGATTGAATTAATATTATACTATATCATGTTTGATGTAGACTAGGATTGGATTG GAATAAAATTAATCTTAAATTTTTATTTATAAATTAATTTTATAAAAAATTTGAAAAAAA AAAAACCACAATTCTTCATCTCATCATCAATCTAATTCATAACATCTCCCACAATTCAAC ATCATCAAACATGGTTTATCAATATCATCAATATAATTCGTTAATATCATTATCTCTTAC ATCAACAACATTATCAACAATATGAAAATATCAAAACGTGAAAAAAAAAGGGGTTATGAT CGAATCCAGAACCAAGAACCAGATGGATTTGGGTTTGATGTCGAACCCAAAGCCACACAA CTTAGAAGGAAAAAAAGAAGAAGAAGAGATGGTAGAGAGGTTATTGCCATTGTTAGTTCG TATGGATAGAAGGGGAGATGAGAGAGACGAAAAATGGTTTATGGTGGTAGTGGGTTTGCG TGATGGAGATGAGAGATAGATTTTGTGACTTTATGGAGAAAGAGAATGAAATAAAAAAAA AAAAAACTCATGAACTTGAGATTTTGGAAAATCATAGTTTAACTTGAGATTCAATTTTTC AAGTTGAATGGAAATAAAGATGGGTTTAGGAATAAAAAATTCATTTTCATCAATATCCCC AAACTTGAGATATGGAAGAATAAAAAAAAAATAAATCCTAATTTCATCTCAAATTTCACG TAACAAATATATCCTAAGGCTTTTATTTAAAAAGCACGCCGAACTAAGCTATAAACGACG AGAATCTAAATTTTCTGTCGTGGGTTGGCCTAATTTAAAGAATTTTAAGGTTTGATTTCT GATTAGTGACAGAAGAAGTTGATGACACGTGTCGACATTTCAAGGAGGTTTGATGGGTTG TGTTATTACTATCAAGAGTTCTTATTGGGGTTCACTTTCGGGTAACAGTACAAAAAGCAA GTTGCTACAGTGGAGCAGGGAGTGAGGGAAGCCAGAGATACTCCAAAGGGACGGTCAAGA TATCGTTTTGCAGTTACCAAGAAGATCACAAGACGATGACGTCATGGAGACGGCGACGTC GATGCGCCGTATAAAGATCGCCGTTTCGAGGCGAAGGGTCCGCGGACGGTGGGCCCCACC ACAGTGTGGAGGTCCCCGAACAGAGCGGGAGGGAAAAAGTTGTACACGTGGACGCTAATT ACCTGATGTTGTCATATCGAGAATTTGGGCCCCAGTCTCTTATAGCTCCACGTCATACGT GCGGCACAACAAGTGTGACCTGAGAGAGAAACATAAAACTTTAAAAAAATGAAAAATAAA ATTTAAAAAGCAGGCACCATAAGAGAGTACTGTGGCCTCTAGACGAGAGTCACCAGTAGA TAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGA TTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGGGACCCACTTTCTCATTT GGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCGTTCTTTAATGCT ATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGAATCCAAATAGCG AACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGTAACTCACTCTCT CTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCGACACGGCTTTCC TGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCGTTGTTTTTCTTG CCGGCGAGATCGGCCGGAGG
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>LITCHI006642.m2 GenomeSequence - CGAGAGTCACCAGTAGATAGGGTTAATAAAATAGGGTTGTTTCATCATTTCGCTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTAGATTTCACAAAATTTTAATAAACTTGATCTAAATAGAAACAGGGG GACCCACTTTCTCATTTGGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGC TTTCGTTCTTTAATGCTATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGA AGTGAATCCAAATAGCGAACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTG TATGTAACTCACTCTCTCTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCAC TTTCGACACGGCTTTCCTGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCC GTCCGTTGTTTTTCTTGCCGGCGAGATCGGCCGGAGGATGGCATATATGTGCGCCGACAG CGGCAATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAACAAAAGCAAGAACAAGAACAGCA ACAGCAACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTCTTCTCTCTCAATCCTTTCTCTCT AAACCCTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACCACCCACATGTCTAATAGTCCCAA CTTCGGGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGACCCGTTAGATGCCGGAGAGAACGA GTTCCAGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGGTTTAGGTTCTCAGATTTTGGAGG TGGAGGTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGTTTGATGAACACCGGACACTCAAC GGATAGTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGGCAAAATAATGCTGATTTCGGTCT GTATACTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGACTCAACGTTGGTTGTTGCTCTTC TCCGTCCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCTCCAAAGAGCCCCGTCCAAGCCTG GCCGCCGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAACCGGTTGTGAAGGACACCAAACC AGCCAATGTTTCGCAGCCAAGTGTCCACCAAGCCTCTACTAGCTCCTCCCCGGAAAATGA CCTCTCACCGCCACTTTTAAAAGCTCTACTGGACTGTGCTCGACTCGCCGAGGCAGAACC CAGTCGAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGACTCGGTCTCCGAACACGGAGATCC AATCGAGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTCTACAACAGAGTCTCTCTTCAAGA AGACAAAACACTCTCCGACTTCACTGTAAGTTCTGCTGATTGCATTATCTCGTACAATGC ATTGAACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCACTTAACGGCCAATCAAGCAATATT TGAAGCCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTCGATTTCGGGATTGTTCAAGGAGT CCAATGGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGGTCCGGCGGAAAACCCATCAAAGT TCGGATCTCGGGTGTACCCGCTCCGTCACTAGGTGACTCACCAGCTTCTTCACTTCTCGC TACTGGTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTCAACTTGGACTTCGAGTTCCAGCC GATTCTAACACCCATCAACGAACTCAACGTGTCGAGTTTCAAGGTCGAGTCAGACGAGGT GGTTGCAGTCAACTTCATGCTCCAGCTAAACAATCTACTGGACGACACACCAAACGCTAT AGAGAGCGCTCTCGCAATGACGAAGTCATTGAACCCAGTTATCGTCACGCTTGGTGAGTA CGAATCGAGTTTGAATCGGGTCGGGTTCGTCGCCAGATTCAAGAACGCATTGAAGTACTA CATGGCCGTGTTCGAGTCACTTGAGCCCAACATGAGTCGAGACTCAGTAGAGAGACTCCA AATAGAGAAACTGCTTCTGGGTCGAAGAATCGCTAATGTGATAGGAACCGAATCCACCCA TAGAAGAAGAGAGCGGTTGGAGGATGGAGAGCATTGGAGTTGTTTGATGAAAAATTGCGG GTTCGAACCGGTACCACTCAGTCATTTTGCTATTAGTCAAGCGGAGATACTACTATGGCA CTGTAATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCTGACACTGAACCTGAATACATAAC TCTAGCTTGGAACAAGGTGCCTCTACTTACAGTTTCATGGTGGCGTTAATGGTGGTGTTG GTTTCGTCTGACTAAATTGGGGTCTTTATGGGATGTAGTTACTATTTTTCTTTTTCTTTT TTTGGATTAATTTTTTAGTGATGTTGATGTTGTTATAGTCTAGAAGCTAGAGAGACAACT AAGCATTGAAAACACTGCATTTTGATGGATGCTTTTGGGTTGTTTAATTGTTATTATTAC TGCTCCTGTTAATCAATTAAAAACCAGTTTCTATGAGTTTCTAGCTCCATTTTGTTGGGC TCACAGACTGGGAACTTTTGTATGACAAAATTGTAAGGAAAAAAAAAGTAAAGTAAAAGT TGAATTCAAAGTCGAGGTGGAAAGAAGATTTATGTTCTCAGCCCTTTTAGGTCTCCCAAT CGGATCAGCCTTTGTATATGTGATTTTGAATATTAATGTGAATGTAGTCACTAGTCATCT TTTAGTGGTGTGTAATTTAGAGATAACAACGATTTAAATATTATATTTATATCTATATCG ATTGGTCTCTTTTATTCATCTTAAACTCTCTGTTCTCTTCTGTGATTCTGTCATTTCACT CCTATTATTTTTTC >LITCHI006642.m1 GenomeSequence - ACTTTCTCATTTGGACGCATTTTAAATAAACGTTGTCCTCCTGCTGGGCCAGAGCTTTCG TTCTTTAATGCTATTTCTCTCTCTCTACATGGCTGCACTGTCTCTCTCTAGCTGAAGTGA ATCCAAATAGCGAACTTGCGATCCCGTTGTTTCTGGACCTTTCGTTGTTGTTGTGTATGT AACTCACTCTCTCTGTGGCTCGCTCACTCTACAAAAATCTATTTTCGCTGACCACTTTCG ACACGGCTTTCCTGTCTCGCTAATGTTTTTGTGATAAATGTGAAGTGCAGATTCCGTCCG TTGTTTTTCTTGCCGGCGAGATCGGCCGGAGGATGGCATATATGTGCGCCGACAGCGGCA ATTTGATGGCCGTTGCAGAACAAGTCATTAAACAAAAGCAAGAACAAGAACAGCAACAGC AACAACACCACGTTAATCAACAGCAGCAGCTCTTCTCTCTCAATCCTTTCTCTCTAAACC CTTGTTGGGCCGCGACTTCTACCACTATCACCACCCACATGTCTAATAGTCCCAACTTCG GGTTCGGGCTCACGGGCTCGGGCTTCCCCGACCCGTTAGATGCCGGAGAGAACGAGTTCC AGTTCCCGCAAATTGACCACCATTCGACTGGGTTTAGGTTCTCAGATTTTGGAGGTGGAG GTGAGTTTGACTCGGACGATTGGATGGATAGTTTGATGAACACCGGACACTCAACGGATA GTTCCACTCTGCCTTCTGCTTGTGACGCGTGGCAAAATAATGCTGATTTCGGTCTGTATA CTACCGATCCTTTTGCCACCTGCCCGAGTCGACTCAACGTTGGTTGTTGCTCTTCTCCGT CCGATCTCAACCGTGTTGTCTTCATTGAACCTCCAAAGAGCCCCGTCCAAGCCTGGCCGC CGTCCCCCCCACCTCCGCCGCCGCCTCCACAACCGGTTGTGAAGGACACCAAACCAGCCA ATGTTTCGCAGCCAAGTGTCCACCAAGCCTCTACTAGCTCCTCCCCGGAAAATGACCTCT CACCGCCACTTTTAAAAGCTCTACTGGACTGTGCTCGACTCGCCGAGGCAGAACCCAGTC GAGCTCTCAAATCGCTGATTAAACTCAGAGACTCGGTCTCCGAACACGGAGATCCAATCG AGAGAGTCGCGTTTTACTTCATCGAAGCTCTCTACAACAGAGTCTCTCTTCAAGAAGACA AAACACTCTCCGACTTCACTGTAAGTTCTGCTGATTGCATTATCTCGTACAATGCATTGA ACGACGCCTGCCCATATTCGAAGTTCACTCACTTAACGGCCAATCAAGCAATATTTGAAG CCACCGATAGTGCAACCAAGATTCACATAGTCGATTTCGGGATTGTTCAAGGAGTCCAAT GGGCCGCTTTGTTACAATCTTTCGCGACCAGGTCCGGCGGAAAACCCATCAAAGTTCGGA TCTCGGGTGTACCCGCTCCGTCACTAGGTGACTCACCAGCTTCTTCACTTCTCGCTACTG GTATCCGACTCAGCGAATTCGCTAGACTCTTCAACTTGGACTTCGAGTTCCAGCCGATTC TAACACCCATCAACGAACTCAACGTGTCGAGTTTCAAGGTCGAGTCAGACGAGGTGGTTG CAGTCAACTTCATGCTCCAGCTAAACAATCTACTGGACGACACACCAAACGCTATAGAGA GCGCTCTCGCAATGACGAAGTCATTGAACCCAGTTATCGTCACGCTTGGTGAGTACGAAT CGAGTTTGAATCGGGTCGGGTTCGTCGCCAGATTCAAGAACGCATTGAAGTACTACATGG CCGTGTTCGAGTCACTTGAGCCCAACATGAGTCGAGACTCAGTAGAGAGACTCCAAATAG AGAAACTGCTTCTGGGTCGAAGAATCGCTAATGTGATAGGAACCGAATCCACCCATAGAA GAAGAGAGCGGTTGGAGGATGGAGAGCATTGGAGTTGTTTGATGAAAAATTGCGGGTTCG AACCGGTACCACTCAGTCATTTTGCTATTAGTCAAGCGGAGATACTACTATGGCACTGTA ATTACAGTTCTTCATACTCGTTAATTCATGCTGACACTGAACCTGAATACATAACTCTAG CTTGGAACAAGGTGCCTCTACTTACAGTTTCATGGTGGCGTTAATGGTGGTGTTGGTTTC GTCTGACTAAATTGGGGTCTTTATGGGATGTAGTTACTATTTTTCTTTTTCTTTTTTTGG ATTAATTTTTTAGTGATGTTGATGTTGTTATAGTCTAGAAGCTAGAGAGACAACTAAGCA TTGAAAACACTGCATTTTGATGGATGCTTTTGGGTTGTTTAATTGTTATTATTACTGCTC CTGTTAATCAATTAAAAACCAGTTTCTATGAGTTTCTAGCTCCATTTTGTTGGGCTCACA GACTGGGAACTTTTGTATGACAAAATTGTAAGGAAAAAAAAAGTAAAGTAAAAGTTGAAT TCAAAGTCGAGGTGGAAAGAAGATTTATGTTCTCAGCCCTTTTAGGTCTCCCAATCGGAT CAGCCTTTGTATATGTGATTTTGAATATTAATGTGAATGTAGTCACTAGTCATCTTTTAG TGGTGTGTAATTTAGAGATAACAACGATTTAAATATTATATTTATATCTATATCGATTGG TCTCTTTTATTCATCTTAAACTCTCTGTTCTCTTCTGTGATTCTGTCATTTCACTCCTAT TATTTTTTC