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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016794 | Chr1 | 40267460 | 40271612 | + | Auxin-responsive protein IAA27 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016794.m1 | 29 | 273 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 298.6 | 4.40E-89 |
LITCHI016794.m2 | 29 | 250 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 243.1 | 4.00E-72 |
LITCHI016794.m3 | 29 | 205 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 151.2 | 4.50E-44 |
LITCHI016794.m4 | 29 | 205 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 151.2 | 4.50E-44 |
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>LITCHI016794.m1 ATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCA CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTGATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCCCCATATCTGCGGAAAGTTGATCTC AAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTCAGTGCGGTTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGA TTAATGGATCTTCTTCATGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGACGGGGAC TGGATGCTAGTTGGTGATGTTCCCTGGGACATGTTCACCAACTCCTGTAAGAGGCTAAGG ATCATGAAGAGTTCAGAGGCTATTGGATTAGCTCCAAGGGCAATGGAGAAGTGTAGAAAC CGTAACTAG >LITCHI016794.m2 ATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCA CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTGATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCCCCATATCTGCGGAAAGTTGATCTC AAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTCAGTGCGGTTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGA TTAATGGATCTTCTTCATGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGACGGGGAC TGGATGCTAGTTGGTGATGTTCCCTGGGAGTAA >LITCHI016794.m3 ATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCA CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTGATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCCCCATATCTGCGGAAAGTTGATCTC AAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTAAAATCTCTATGTAG >LITCHI016794.m4 ATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCA CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTGATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCCCCATATCTGCGGAAAGTTGATCTC AAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTAAAATCTCTATGTAG
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>LITCHI016794.m4 AATTATCCACGTACTAATAGAACATTTTAAAAAATTATTCATATTTACGATGAGGGCATT CGAATCCAGCCATTTGTTAGAAAGAAGCAAAATGTGGAGAAAAGAGAAATAAAGAAATGG AGAAGAGAGAGTGAGTAGTGTGATGTGTGCGAGACTCTGAGTGTGAGGTGTGGTGGAGAA TCAGAGACAAAGATTTCTTTTCAGTTAATCCCAACTGCCGTTTTCCCTCGTGTCAGCTTT CCTCACTTTCTAGGGCTTATCACTCATTTTCCTTTTACATATAACTTTTTCCCACAATCC AAACACCAAATCGGCCAAGATATATCTCTCTAGTACACACCCCCAAGTGAACCCATTTCT TCTCTTCAAAATCCGAGCTAATTTGGCCTCTCAAAACAGTCCTTTCGTTTTCAAATCAAA ATCTCCTCTGGTGCATCTTAGCAACACCTGTCCATCTCAACCCCACCGGCCCGCGCATTA TAGCCTTCTTTATTAGAAAAATAAAATAAAACAAAGGGCAGTATCGGAAAGTTTGCCGGG GACTTTTTGTGACTTGTCGGAGTGGTTGCCCACAAAAAGTTGTCCATCATAATAAAATCA TTTTTATTTTTACTAAAAACAGTTGCTACTTGTGTTGTTGTGTTTACAAGCACACTGTGA TTTCAACAATATTCTCAGATACAATTTATTTCGTCTTCTGAGTTACACGTACTAGAGACG GAAACAGAAGAAAGAGAGAAGCTTCTGTGTTTTGCTTCAACCACATACCACATACATATC TCATGCTTTTCTGAGCTATTTTTGATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTG TCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAAAACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGA CTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCACCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCA 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