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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI016794 | Chr1 | 40267460 | 40271612 | + | Auxin-responsive protein IAA27 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI016794.m1 | 29 | 273 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 298.6 | 4.40E-89 |
| LITCHI016794.m2 | 29 | 250 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 243.1 | 4.00E-72 |
| LITCHI016794.m3 | 29 | 205 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 151.2 | 4.50E-44 |
| LITCHI016794.m4 | 29 | 205 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 151.2 | 4.50E-44 |
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>LITCHI016794.m1 ATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCA CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTGATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCCCCATATCTGCGGAAAGTTGATCTC AAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTCAGTGCGGTTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGA TTAATGGATCTTCTTCATGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGACGGGGAC TGGATGCTAGTTGGTGATGTTCCCTGGGACATGTTCACCAACTCCTGTAAGAGGCTAAGG ATCATGAAGAGTTCAGAGGCTATTGGATTAGCTCCAAGGGCAATGGAGAAGTGTAGAAAC CGTAACTAG >LITCHI016794.m2 ATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCA CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTGATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCCCCATATCTGCGGAAAGTTGATCTC AAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTCAGTGCGGTTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGA TTAATGGATCTTCTTCATGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGACGGGGAC TGGATGCTAGTTGGTGATGTTCCCTGGGAGTAA >LITCHI016794.m3 ATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCA CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTGATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCCCCATATCTGCGGAAAGTTGATCTC AAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTAAAATCTCTATGTAG >LITCHI016794.m4 ATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCA CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTGATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCCCCATATCTGCGGAAAGTTGATCTC AAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTAAAATCTCTATGTAG
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>LITCHI016794.m4 AATTATCCACGTACTAATAGAACATTTTAAAAAATTATTCATATTTACGATGAGGGCATT CGAATCCAGCCATTTGTTAGAAAGAAGCAAAATGTGGAGAAAAGAGAAATAAAGAAATGG AGAAGAGAGAGTGAGTAGTGTGATGTGTGCGAGACTCTGAGTGTGAGGTGTGGTGGAGAA TCAGAGACAAAGATTTCTTTTCAGTTAATCCCAACTGCCGTTTTCCCTCGTGTCAGCTTT CCTCACTTTCTAGGGCTTATCACTCATTTTCCTTTTACATATAACTTTTTCCCACAATCC AAACACCAAATCGGCCAAGATATATCTCTCTAGTACACACCCCCAAGTGAACCCATTTCT TCTCTTCAAAATCCGAGCTAATTTGGCCTCTCAAAACAGTCCTTTCGTTTTCAAATCAAA ATCTCCTCTGGTGCATCTTAGCAACACCTGTCCATCTCAACCCCACCGGCCCGCGCATTA TAGCCTTCTTTATTAGAAAAATAAAATAAAACAAAGGGCAGTATCGGAAAGTTTGCCGGG GACTTTTTGTGACTTGTCGGAGTGGTTGCCCACAAAAAGTTGTCCATCATAATAAAATCA TTTTTATTTTTACTAAAAACAGTTGCTACTTGTGTTGTTGTGTTTACAAGCACACTGTGA TTTCAACAATATTCTCAGATACAATTTATTTCGTCTTCTGAGTTACACGTACTAGAGACG GAAACAGAAGAAAGAGAGAAGCTTCTGTGTTTTGCTTCAACCACATACCACATACATATC TCATGCTTTTCTGAGCTATTTTTGATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTG TCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAAAACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGA CTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCACCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCA 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>LITCHI008588.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCCAGTAGAGGCTGGTACGATTCAATTCAACATTTTGTTCGTTCGGGTTTGATTGTGTCA TAGCTCTCTAATTCGGATTAGGTTTATCATTGGATGAACTGCATTGCTGATATTGACCCT AAAAAAAAAACGGTAGGTACAGCTAGTCCGTGAACAGCTAACCATTGCATTGTAAAAATT GGATAGGTTCGATCTATGGTCATTGGGGCCTCCTAAAAAGATCTACTAAATTCATCAAGT TGTTCCAAATAATCAAAACGGCCAGTGATTAATGGAATTCCTTGTCGGCTCTCTGTAAAA TACTCGTTTGGGCGAGGGCTTCCAAACACATCGTAAGCTAAATCTATGTTGACGAATAAC CAACCTGCAATGAATAGGGAAGGTATAGTAATGCTATGAATGACCCAGTATCGAATATTG GTAATAATATCAGCAAAAGAACGTTCTCCTGTACTTCCAGACATGCTGAGCTGCACATAT TCCGGAGAACCAAGTGGGTCTCCATGATCGGAGGCGCCTAAAAGGGTCTCCACCGGTGAA GACCTATCTGGATCTCTATGATCGGAGACCCAAAACCAGGGTCTCCACAATTGGAAGCCC GAACTGGGCCTCCAATCGTGGAGACTCAGAACTAGGCTCCACTAGGTCTTCATGATCGAA AGCCCGAACCAGCCCTCTAATCGTGGAGACCCAGAACCGAGGTCTCCACCATATCGTCAC CGTTGTCAAACCACCGACAAATCCGATCAGAGATGGAGAGAGAAAGAGGAAAAGAGAAGA AAAAGAGTGAGCAGCAAAAGAGAGGAATTAAGAGAAAAAATGAAAACATTCTTATATATA TTTTTTATGTTTTATTTCTAAATAAAAACATCATTTTAAATATTATTTATTTTATTTTTA TATTTTTATAAATATTTTTATTGAATTTTCTTTTTTACCCCTGAAGTCAAATGATCAATT ATAACATATAAAAATAACATTAAAAATAAATCTAATGTTATATATAATTAACGTAAGAAA GGAGATTAAAAAAGTAGGGGAAAAAGTGTCCCGTGTTAGTAGGATAAATTTAACCTATCA AATTGGTAGGTTAAATTTATCCCACCAACATGAGATAAAATGGTTTCATGAGAATGAAGC AATCCAATCCCATACAATCACTAAACAAGGGATTGGATCGAAATTTATTTAATCCCTCGT AATAGACAAGGGTTGAGAGGTGATGCACCTTGGACAGCAAGTGCTATCAGTACTTTGGTT TCTTTCATTAAACATATCGAAAATTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTTTTTTGTGTGATGTGGCAATAAAAATAAGCTATTTATTAATTTGGCCACATATG ATCCAAAGTTGGTCATAGTAACACGTCTTGATATGCTTGTGACATGAATGAACTTTGACT AATTATATGTCAAGTTTTCAAAATATTGAGTTTAATAAAACAATTTGTTGATCATGAGTA TGGAGTGGAATAAATAAGCTAAACTGCAGTAACTACCTTTAATTTGACCATCATAGAGGA TTCATATTTACTCAAACTTTTATTTAAACTATCTAGTTCTGCAATTTGACGGTTTTGCTA TTTAATGATTGGTAATTTTGTCCTCTCCATTTCAATTTTATATGCTTATGCATCGATTTT TAACTTTGATTTTTCAATAACGGACAACAAGTTACAATATCTGTTTAATTTGAAACTTGG TAATGGCTTATAATAGTAAAGAATACTAAAACTTGTAATATTTACGATGTGATTATTGTA AAAATTAATTTTATGTCCCCTAAAACAGTAGATGAATATAATGGTTTTTGCTCTTAGGTT CATCCACATTTTTATACCCAAGAGTTTGAAAAAATTCCAAATGGTTCCATCAAGAAACGA ATAAGGAGCACAAAGCAAGAAATACGCAAGCTTGCGCAGTGTGTAAACACCAAAGAAATA GGTGTACTCCAGGTTGTGAA
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