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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016699 | Chr1 | 39148669 | 39151834 | - | Auxin-responsive protein IAA14 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016699.m1 | 36 | 207 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 187.2 | 4.80E-55 |
LITCHI016699.m2 | 38 | 204 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 183.2 | 7.60E-54 |
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>LITCHI016699.m1 ATGCCAGATGACCCCAACGCCATTACACAGTCACCAGAAAGTGACGTCACCTCCATGAAT CTTGACGACACAGAACTCACCTTGAGACTACCGGGTGAGAGTCGATCACCACAGCTTCTC TCTGGAGGCAACAAGAGCTGCCCCAAGCGCGGATTCATCGAGACCGTTGATCTTAAGCTA GGTAGCTCTCTCAGCGCAACCGGTACTTGCCAAAGTCGGGTCTCAGGAAACGGAAAATGC CCACCTACCAAGGCACAAGTAGTAGGATGGCCGCCGGTTAGATCATCGAGGAAGAAGGCA TTAGAGAAGAGTAATAAGCTTGTGAAGGTGGCTGTAGATGGAGCTCCATATCTACGCAAA GTGGACCTGGATACGTACAGTAGCTATCAAGAACTGTTCAGGGCTTTAGAAGAGATTTTT ACCTGCTTCACTATCCATGGTAATAATGCGAAGGAAAGGAAGATTATGGTTCCGACGAAG GGAATAGAATATGTACCAACGTATGAAGACAAAGAAGATGATTGGATGTTAGTTGGAGAT GTTCCTTGGAAAATGTTCATCGAATCATGCAAACGAATCAGAATAATGAAAAGTTCAGAG GCAGTTGAATTAGCTACAAGAACCGAAACAAATCGCTGA >LITCHI016699.m2 ATGCCAGATGACCCCAACGCCATTACACAGTCACCAGAAAGTGACGTCACCTCCATGAAT CTTGACGACACAGAACTCACCTTGAGACTACCGGGTGAGAGTCGATCACCACAGCTTCTC TCTGGAGGCAACAAGAGCTGCCCCAAGCGCGGATTCATCGAGACCGTTGATCTTAAGCTA GGTAGCTCTCTCAGCGCAACCGGTACTTGCCAAAGTCGGGTCTCAGGAAACGGAAAATGC CCACCTACCAAGGCACAAGTAGTAGGATGGCCGCCGGTTAGATCATCGAGGAAGAAGGCA TTAGAGAAGAGTAATAAGCTTGTGAAGGTGGCTGTAGATGGAGCTCCATATCTACGCAAA GTGGACCTGGATACGTACAGTAGCTATCAAGAACTGTTCAGGGCTTTAGAAGAGATTTTT ACCTGCTTCACTATCCATGGTAATAATGCGAAGGAAAGGAAGATTATGGTTCCGACGAAG GGAATAGAATATGTACCAACGTATGAAGACAAAGAAGATGATTGGATGTTAGTTGGAGAT GTTCCTTGGAAAATGTTCATCGAATCATGCAAACGAATCAGAATAATGAAAAGTTCAGAG GCAGTTGAATTAGTTCATGTTAATGCAGCTACAAGAACCGAAACAAATCGCTGA
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>LITCHI016699.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTTATAACAAATTTTCTCATCATATCTCCGGATCTTTTTGTTTAATAGTTATTTTCATT TTCTCTCTAATAATTGATAAATCAACGTTTCTCCTGGTTGTTTACAGAAATATCAAAAAA CCCTTTACTGTCATATTTTAAAAGATCACTTTTCTAACAAGCAACAGTTTGTGAATGATT TTTCAAACAATAAGGGAAAAAATTGATGATTCATCGGTTTGTTAGGGGGAAAATGAAAAT AACTCTTTTTTCTCATCACAATTTTCATGCCACATTCTTATTGTTGAAGATTCTTTCTTT TTGTTTCATATGTCCTTACAGATCTGTCACCATCCTATATGGCGACCATTTATTGTCGCT ACAATATGTCTTTAAAGTTTAAGGGCATTATTGATATATGGTTACTAAAATAAGAAGTCG AAAAAATTCACTTTAAATGAAAATTCTGATAGACAGTGTTTGCGGTAAGATTATTGATAA GCTAACGTGTCGCAAACCCCATCAGATTAGTTTGTCAGTGGTCAGTTCCCAAACTTGCTT CTCCAAAGCCGCGTGCGGCTGCCGGTTTTCTAGTAAAGAAAGGCATGTTTACTAGCTAGC AATTGACAAATTAGAAAATTAGGCTTGATTCGTTGAACTTTGGAGACAGACACATACTCG ACATTCCAACAGCTTTCACATGCTTGTCGGCCTTCCACCACATTCACTTCTTCAACTTGA CTTTGAACTTCTTGACTTCTTTGGTCCCTCTATTACTTTTACTTTTCTTACATTTTTACC CTTCTTGTTTGAAATTAGCATTCAAGATTTAATGAGGACATGTCACCGTGAGATCGAGGT CTAACTTAAATATTTCAATCAAAATATAATTCTTGATGTAAAATAATAATGCTTGATTAG TTGAATATTTATAGTTGTGTTGGTTGTCATCTTTTCAGTGGAGAGTACATTATAAGACCA TTCCATCTAGTTTTTCTCATTATTGGCGGGGGACAGTGGTGGCTCTTTGGATTGGTTATT GGACTGTTTTTGTTGAAAGTTAGCGAGGACTATGAGGTAATTTTGGCTTTGCTATTTCTA ATGCTGAAATTACAAAAATATGTTGGTTTGTCTAGCTACAAATGTGAACAATTATATCAT TGATTTGATGTGTAGAGGGGTGAAACATATTACCAGGAAATTGTGCAACTTCTATGTGAC TAACTTTTTTTTTTTTTAAATAATTATTTTTTTATTTATATGTAAATGAGGAACAAAAAT CATGTTATTATCACTAAATGTATTTTAAAAAAATGGTTTTAGAATGTTGGGATTCTATAA ATATTTAAGTCCATTAAATTTTTTTAGTAAAGACAACAGATTTTTATTTTTTTTTTTTGG TTTTAATGTAATCAAATTAGTAGTCCCCTCAACTTATCACTTCTCAAAAACCATATATTC CACATCTTTCTCTTTTGTTTTATAAAATAATGATTTTATGAGTATTGACATGTATGTTAA ATCCTTAAAATTATAATAAAAAACTCGTATTTAAAACATTGATGCAGGATTGTTCTCTAT TTTTTTTTAATCATTAATATATGTTCTTTAAAACACCATAACAAAATGAAAATACAAATA CACAGATTCCAAATTTGAAATTTACGTCATAATTTTCACTTTTTTTTTTAAAGAAACAAA TGGCGTGCTCTTTAGTCGTTTGGTGATTAAAATCATAGCAGAATAGTTTGAAAACGTGCT GTCATTTTGACAATTGTAGTGGTATTCTAGGGATCATTCAAAATATCGAAAATGCAAAAT TGGCACTGAATTGATTAAATGAATGGACAAGTGGCACGAACTTGTATGCAAAATGTTGCT ATTTCTTCCTGCTTTTTACATGGACCAATTCCAACCTCCGTATCTTCCCTTACGTGGCTT CTCTTCATTGGACCATCTCTATAATAAAAACCTCATTACATTCACCAACTTAATTATATG CCCTACTTCAACTGGATGCA >LITCHI016699.m2 - Up_Stream_Len 2000 TTTTATAACAAATTTTCTCATCATATCTCCGGATCTTTTTGTTTAATAGTTATTTTCATT TTCTCTCTAATAATTGATAAATCAACGTTTCTCCTGGTTGTTTACAGAAATATCAAAAAA CCCTTTACTGTCATATTTTAAAAGATCACTTTTCTAACAAGCAACAGTTTGTGAATGATT TTTCAAACAATAAGGGAAAAAATTGATGATTCATCGGTTTGTTAGGGGGAAAATGAAAAT AACTCTTTTTTCTCATCACAATTTTCATGCCACATTCTTATTGTTGAAGATTCTTTCTTT TTGTTTCATATGTCCTTACAGATCTGTCACCATCCTATATGGCGACCATTTATTGTCGCT ACAATATGTCTTTAAAGTTTAAGGGCATTATTGATATATGGTTACTAAAATAAGAAGTCG AAAAAATTCACTTTAAATGAAAATTCTGATAGACAGTGTTTGCGGTAAGATTATTGATAA GCTAACGTGTCGCAAACCCCATCAGATTAGTTTGTCAGTGGTCAGTTCCCAAACTTGCTT CTCCAAAGCCGCGTGCGGCTGCCGGTTTTCTAGTAAAGAAAGGCATGTTTACTAGCTAGC AATTGACAAATTAGAAAATTAGGCTTGATTCGTTGAACTTTGGAGACAGACACATACTCG ACATTCCAACAGCTTTCACATGCTTGTCGGCCTTCCACCACATTCACTTCTTCAACTTGA CTTTGAACTTCTTGACTTCTTTGGTCCCTCTATTACTTTTACTTTTCTTACATTTTTACC CTTCTTGTTTGAAATTAGCATTCAAGATTTAATGAGGACATGTCACCGTGAGATCGAGGT CTAACTTAAATATTTCAATCAAAATATAATTCTTGATGTAAAATAATAATGCTTGATTAG TTGAATATTTATAGTTGTGTTGGTTGTCATCTTTTCAGTGGAGAGTACATTATAAGACCA TTCCATCTAGTTTTTCTCATTATTGGCGGGGGACAGTGGTGGCTCTTTGGATTGGTTATT GGACTGTTTTTGTTGAAAGTTAGCGAGGACTATGAGGTAATTTTGGCTTTGCTATTTCTA ATGCTGAAATTACAAAAATATGTTGGTTTGTCTAGCTACAAATGTGAACAATTATATCAT TGATTTGATGTGTAGAGGGGTGAAACATATTACCAGGAAATTGTGCAACTTCTATGTGAC TAACTTTTTTTTTTTTTAAATAATTATTTTTTTATTTATATGTAAATGAGGAACAAAAAT CATGTTATTATCACTAAATGTATTTTAAAAAAATGGTTTTAGAATGTTGGGATTCTATAA ATATTTAAGTCCATTAAATTTTTTTAGTAAAGACAACAGATTTTTATTTTTTTTTTTTGG TTTTAATGTAATCAAATTAGTAGTCCCCTCAACTTATCACTTCTCAAAAACCATATATTC CACATCTTTCTCTTTTGTTTTATAAAATAATGATTTTATGAGTATTGACATGTATGTTAA ATCCTTAAAATTATAATAAAAAACTCGTATTTAAAACATTGATGCAGGATTGTTCTCTAT TTTTTTTTAATCATTAATATATGTTCTTTAAAACACCATAACAAAATGAAAATACAAATA CACAGATTCCAAATTTGAAATTTACGTCATAATTTTCACTTTTTTTTTTAAAGAAACAAA TGGCGTGCTCTTTAGTCGTTTGGTGATTAAAATCATAGCAGAATAGTTTGAAAACGTGCT GTCATTTTGACAATTGTAGTGGTATTCTAGGGATCATTCAAAATATCGAAAATGCAAAAT TGGCACTGAATTGATTAAATGAATGGACAAGTGGCACGAACTTGTATGCAAAATGTTGCT ATTTCTTCCTGCTTTTTACATGGACCAATTCCAACCTCCGTATCTTCCCTTACGTGGCTT CTCTTCATTGGACCATCTCTATAATAAAAACCTCATTACATTCACCAACTTAATTATATG CCCTACTTCAACTGGATGCA
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>LITCHI016699.m1 GenomeSequence - CTTAATTATATGCCCTACTTCAACTGGATGCAATGCCAGATGACCCCAACGCCATTACAC AGTCACCAGAAAGTGACGTCACCTCCATGAATCTTGACGACACAGAACTCACCTTGAGAC TACCGGGTGAGAGTCGATCACCACAGCTTCTCTCTGGAGGCAACAAGAGCTGCCCCAAGC GCGGATTCATCGAGACCGTTGATCTTAAGCTAGGTAGCTCTCTCAGCGCAACCGGTACTT GCCAAAGTCGGGTCTCAGGAAACGGAAAATGCCCACCTACCAAGTAAGACCAAAATCATA TTTTTATGCACTATACGAGTCATTGTCGAGTTGAGCGATAATTTATTTATGCTTTTTAGT TCAGCGTGGACCTAGCTAATTATATTATATGATTTGATAAGTGTAACTTACATCGTGTAA AGAATTTATGGTTCTGGTTTTATAGGGCACAAGTAGTAGGATGGCCGCCGGTTAGATCAT CGAGGAAGAAGGCATTAGAGAAGAGTAATAAGCTTGTGAAGGTGGCTGTAGATGGAGCTC CATATCTACGCAAAGTGGACCTGGATACGTACAGTAGCTATCAAGAACTGTTCAGGGCTT TAGAAGAGATTTTTACCTGCTTCACTATCCATGGTCAGTATTTTTTTTTTTTAATTAACA TATGACATGTATTTGTACTTTGATTAAAGTTATTAAGACCTAAGACTATACAGTCATAGA GATAGTTTTCAGGGGAAATTTAAAATTGAAAAATAATCCATTTATTTTGAAATTTGATGG AAATTTGATGAAAATTCTATGTGTGTGGATTTTTATTGATATAACTACAATAAAATGAGA AATTTATTGATATCAATAATTACAAGTTTGTCGAGATCTTCAAGATTAAACATTATTATA GTCTAAACATCTGTTACTTTAACATGGAGAGGAATCTATTTCCGCAATAAGACGTGGAAA AACTCCTTACAAGTGCTGGAAAATTAAATATATGGTAAGATCTAAATTTTGATCACATAT GTAAAGGGGGACAAACACTAATCACTTATAATTATGAGTAAACATACTGTTACCTGTGTT TCGTTGCACGGCGGTAGTTGTTCATCAAATTTAAAACTGTAAAGGTTAATTTGTTTAGGT TTTTTTGTAAAACCTATGAAATTTGCAGATTCTCCTAATTTGTTATAAGTTAAGAAAACT TTTCTTTAAATTAACTGGCATATAATGCGCTTCTCTATGAGACTGACTTAGATATCCCTT AAAAGAAACTAATTGAATTTATATATATTAAAAAAATATATGCCTAAAATTTATCAAAAA CCTAGCCAAAGGGATATATATGAAGTTAATTAAGTCGATATATTGTATGTGGATCATTAA TTATATATAAGTGACTGTTGATTAAATCAAAGTAAATAAAAATATGTAAATCTAAACGTT GATAACTGAAACACTGAATTATTTTGTGTTCTAAATCAAGCATGTCTGTTTATATTGGTT TGATCATGTTATTTGGTTATTGTAATATTTTAAAACAATTTGGTTATTGTGTTAATTGAA TTAATGAATGTGATTTAGGTAATAATGCGAAGGAAAGGAAGATTATGGTTCCGACGAAGG GAATAGAATATGTACCAACGTATGAAGACAAAGAAGATGATTGGATGTTAGTTGGAGATG TTCCTTGGAAGTAAGTGGATGGGAACTAGCGTTGCTTTATTATTATTATTATTATATTTC CATTATATTCTACTGAATTTTATACTCTTTTTTGGTTTGTTAAGTGTTTAAATCTTTCTT TTGATTTCAAAAGTGTCACAATTTTTGTTCTATTAACTCAAATTAATTCTTGTAATCCGC ATCAAATCTTTAAGATAAAGTTAGTATCTATCTATTAAAAAAAAAAAACTTATCTTTTTC ATCATCTTTAAAGTATAAATATTTATACGAGCCACCTTCTTTTGTTTTATTTTTGTGATC TTTTTAGTATGATTAAAATCTAAGATAATTGATTTAATACCTCATTAACGAAAAATGAGA TTATGAGGTGTTCAAATATTTCAAAACAAAATTTTTAATTACTCTTAGAAATTAGAAGTC TAGTCAAGATGTTTTTTCTTTTTTTTTGCTCTGTGTGTTACAGACTTACACTCGCAGATT TTATTCAGCAATTATATACACTACTAATTGTTGCTTTATTTATTGTCTCTCTAGTTTTAT ATATTAATGTCTTGGTTCTTAGACAATACAATTTATATTTTGATTTTCATGCTAATTTAT GCATATATAATTTTGAATTGTTAGAATGTTCATCGAATCATGCAAACGAATCAGAATAAT GAAAAGTTCAGAGGCAGTTGAATTAGGTAATTCTCCTACTTATATTAAGTCCTTACAGAA AATTTAAATTATGATCATATTTATATATTAAGTGGTGGAAAGTAAATGTGAACATTAGGT TTTGGCAATAAAAAAGAATTTGTTTAGCTCAAAGGTAATTTTAATCTTTTTTTTTTGTTA TCCTTTTAGCTTTTGAAATATTTTATATGCAATATTACATACATTGGTTTCATTCACATG AAAAGAAATATTTTACTCACTTATATGTTTAACCCACAAGAAATAAAATATTTTGTCTAA GTGAAATGTACACTTTTACGGATCAAAAATAAATTTTCAAATTTTTTTTTACCATTTTTA GTAATTCTGACTTAATTAATTGAATTAAAGTTCATGTTAATGCAGCTACAAGAACCGAAA CAAATCGCTGAAGCCCTAGTGGAGAAGTCAGAGAATCCAACAATGAGAGTAGCACGTATG TACAGTAATGGTCCCCATTTTCCTGGTTGGGGATGAATGAACAAGAAAATGTAGATGAAT AAGAAAGAAACACTTGCTTGTAGCTTTTAATTAATTTCTTGTTTCTTTTGCTTTTACAAG GAGAGCATACAGTCCCCAAACCGTATCTTTTGCCATTTCTAATGGTACATCGTGCAATAA AATAAAAATATGAGGACATTTTGATTCGAGTAGGTTATGATTTTGTATATAAATGAAAAC GTTTTCGTGAACTCTCAAGTGGTTTGGCATAGGCCAAACACACCTTGTCACTTCACATAG GCAACACGGGGTTTGAATACCAAATCCGCATGAATGGACAATTGCC >LITCHI016699.m2 GenomeSequence - 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