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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016693 | Chr1 | 39064345 | 39074446 | + | Transcriptional corepressor LEUNIG |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016693.m1 | 10 | 36 | PF08513.14 | LisH | Domain | 30.5 | 2.50E-07 |
LITCHI016693.m1 | 549 | 583 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 19.7 | 0.0012 |
LITCHI016693.m1 | 592 | 626 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 28 | 2.90E-06 |
LITCHI016693.m1 | 634 | 663 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 15.6 | 0.025 |
LITCHI016693.m1 | 718 | 749 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 29.6 | 9.00E-07 |
LITCHI016693.m1 | 801 | 836 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 14.1 | 0.073 |
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>LITCHI016693.m1 ATGTCTCAGACCAGCTGGGAAGCCGGTAAAATGCTGGATGTATACATATATGATTACCTC ATGAAGAGAAAATTACATGCTTCTGCGAAGGCATTTCAAGCTGAAGGGAAAGTATCTACA GATCCTGTAGCTATTGATGCTCCTGGTGGTTTTTTGTTTGAATGGTGGTCTGTCTTCTGG GATATATTTATTTCTAGGACAAACGAGAAGCACTCTGATGTTGCTTCATCCTACATTGAG GCTCAACTTATCAAGGCTCGAGAACTGCAACAGCATCAGAAACCTCAGCAGCATCAGCAG ATGCAGCAGCTGTTAATTCAGAGGCATGCTCAGCAGCAAAAGCAGCAGCAGCAACAGCAG CAGCAGCAGCAGAGAAGAGAAGGTAGCCAGCTTTTTAATGGCGCTGGCAATGAAACGCTC ATGAGGCAGAGCCCTGCAACTGCAAACGCCTTGGCAACAAAAATTTATGAGGACCGGTTA AAGCTCCCACTGCAGAGAGATTCCTTTGATGATTTGGCTATGGCTATGAAGCCGAGATTA GGTGACAATATGGGTCAACTCTTGGATCCCAGTCATGCCTCTCTACTGAAAGCAGCTGCA CTTGGTGGCCAGCCTCCAGGGCAAACACTGCATGGTACACCCGGAGGCAGTCAACAAGTT CAAAGTCAGAATCAGCCACCTCCAGTGTCGTCACAGGACATAAAGAGTGAGATGAATCCT ATGATGACTCCCAGAGCTGCTGGTGCCGATGGATCATTGATTGGGGTTCATGGGCCAAAC CAAGCTGGAGGCAATGTGACTTTGAAAGGATGGCCTTTAACGCTTCGATCTGGGTTTTTT CAGCAGCAAAAGTCTTTGATGCAGTCATCTCAGCCCTTCAATTCTCTTCAGTTACAACAG CAACTTATGCATCAAGCACAGCAGAACTTGGCATCTCCGTCTGCCAATGATTTAGAATGC AGAAAACTGAGAATGCTTCTTAACAATCGCAATATGGGTCTTGGAAAGGACGGTCCACTA AATTCTGTTGGTGATGTAGTTTCTATTGCTGGATCAGCTATGCAAGCTAGTTGTCCTATG TCACCTTGTGGAGATGCTGATATGCTAATTAAGTTACAGCAACGACAACAGTTGCAACAC TACACACTTTCAAGCCACCCGTCTCAGAATTTGAACTACCAACTCGTGCAGCAAGATAAA ATGATTGGGGCTGGCAGCATGACCGTGGATGGTAGCATGACAAACACCTTTCAAGGAAAT GATCTGGCATCAAAAAATCAAATTGGGCGAAAGAGAAAGCAGCCAGTGTCATCTTCTGGT CCTGCCAATAGCTCAGGAACTGCAAACACCACTGGACCATCTCCAAGTTCACCCTCATCA CCTTCTACTCACACACCAGGAGATGTGATCTCTAGGCCTACTTTACCACATAATGGTGGA TCCTCTAAGTCTTTGCTTATGTTTGGTTCTGATGGTTTGGGATCTCTTACATCAGCACCA AATCAGTTGGCTGATGTGGATCGCTTTGTGGATGATGGATCCCTGGATGATAATGTTGAA TCGTATTTGTCGCCTGATGATGCAGATCCGATAGATCGAGCCAGACGGTCTGCAGAAGTC AGCAAAGGCTTCACATTTTCGGAAGTCCGGCATATTCCAGCCAGTACCAGTGAAGTTGAA TGTTGTCACTTCTCATCTGATGGAAAGCTACTTGCCACTGGTGGGCATGATAAAAAGGCT GTATTATGGTGTACAGAGTCCTTTACAGTAAAGTCTACACTTGAAGAACATGGTCAGTGG ATTACTGATGTCCGCTTCAGTCCAAGTGTGTCCCGGCTGGCTACATCTTCGGCTGACAGA ACTGTCAGGGTTTGGGATACTGATAATGGTGGTTTTTCACTATGTACTTTTACGGGTCAT TCTTCAATTGTTATGTCGCTGGACTTCCACCCTAGTAAAGAAGACCTTATCTGTTCTTCT GATGGTAATAGCGAGATACGGTACTGGAGTATCAATAATGGTTGTTGTGCTGGAGTTTTC AAGGGAGGTGCAACACAGATGAGATTTCAACCTCATCTTGGAAGGATTCTTGCAGCTGCT GCAGAAAACTTTGTATCGATACTTGATGTAGAGACTCACGTTGGCAGACTCAAATTACAG GGTCATAAAAGTCAAGTTCATTCTGTATGCTGGGATCCTCATGGTGATTATCTGGCATCA GTGAGTGATGACTCTGTCAGAGTGTGGACTGTTGGTCCTGGCAACAAAGGGGAATGCATT CATAAGCTGAGTAGTACTAGCAACCAATTTCATACTTGTGTTTTCCACCCCTCGTACCCT TCACTGTTGGTCATTGGCTGTTATGAGAAACTGGAGCTTTGGAATATGGCTGAGAACAAG ACATTGACTCTAAATGCACATGAAAAGCTTGTATCCGCGTTGACAGTATCAAATGTCACT GGTTTGTTTGCATCAGCTAGTCACGACAAGTGCGTCAAAATCTGGAAGTGA
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>LITCHI016693.m1 + Up_Stream_Len 2000 TACTAAGGGTGAGCGTTTTCGAGTTCAGGTTGGGTTGAGTTGAAAATCTCCCAACCCAAT TTAATTTTCAACCCAACCCAACCTAACCCATCCAATTTTTTTTTAAGATGTAACCCAACC CAACCCAATAAAAAATGATCGGATTGGGTTGGTTGGGTTGAGTTTGTCGGGTTGGATTTA TAAATCCTCTAGATTTATAAACCATTTAAGGTTTCTGATTTTTTCTCTTGTGTCTTCATT CTTCTACTCTAGATTTGTAAATCTTCTGTGATGGATTTAATGTAATAGCATAAAAGTGTA TGTCTAGGAAAGATTCTAGATAGGAAAGACTTGGACAGGGGTGGGCGTTTTCTGGTTCGG GTTGGGTTGGGTTGGGTTGAAAATTTTTCAACCCAACCCAACCCAACCCATCCAATTTTT TTTTTTTTAAGATGTAACCCAACCCAACCCAATAAAAAATGATCGGGTTGGGTTGGGTTG GGTTTGTCGGGTTGGGTTGAAGATGCCCACCCCTATTTTATACATATGTGATAATAATTA TCATTAATATTAATGGTTCAGTGTAATAATATGGGGTTGATTATTAATAAATTAAAAAAT TAGTTGCGCTTAATTTAGATCATAACTTATGTAATTTGTATGTAAGTGTAAGGTTTCGTT TGATATAATTTATCAAAGTAGATATTTTAGAATTTGATCTTTTATAATTAGAGCTTTTAA AAAAAAATGTTGGTTATTTGATTGTCAAATAAAAAAACTCTTTTATTTTAGACTGATTGA TTGTATTACCTTTTAAAGCTTTTTTACATTATAAATTTATTAAAAATGACATTCAAAAGA AAGTAAAATATTATAGAATGATATTTGAGAAAATAATATATTTATAATTAGTTCACAAAT ACAAATAGCAATTAAAGATTGGTTTGACCTAAATACTACATTCAAAAGCATGCCCAAAGA TATTTTGAAGGTAGAGTTAATGGAGACTCAACATATTTTCATCCAAAAAAAAAAAGAGAT TCAACGTATAAATTAAATAATCTGAGACGTGAGAGTTTATATATTTGATATTTACTTCAT AAAGAAAATGACAAATGAAGTGGAACGTATAAGACACGGGAAAAAAAAAGAAAAAGGGAT GGCCTTGGGTTTGTGAGGAGCCCATTAAAGTAAAGACAAATACAGACATATATAATAGCA GAGGGAGAGGATTGTGGGACAACAGCGAATATAGATACCGTGGAATAGAGAGAGAGTTCA ACGATGACATGCCTAATGTACTGTGTTTGAATCTGTCGGCGGGTGGGTTTGATTTCGTGG TTGCTAGCTTGATGGATCTGAGATTGATGCAAGGATTTTTAAGGGTATATTGATATTAAT AAAATATAAGAGGATTATATTAAATATTTTAATTTTTTTTAAATACTTAAAAAATTTATT TAGAGAAATTTAAATTTAATTTTTTTTAAATAGATATTTTTTAGTTTTTTTTTAATTGTT AAAAATTCTACTTAAATATTAAATAAATTATATAAAAATTTAAGTAAAGTTTTTTATATT AAAAAATATTTTTAATTAGTATATAAGTTATAATAAACGTAAACTTACACTAAAGTTTAA ATAGTTACATGTCACCTACCCTGTAAACATATAAAAGGCTGACACTACCGAACAAACAAA TTTGCAGCACAGGTTGCGTGAAGTTTGGCGCTACATGGTCTCTTGAGAACACAAGAAGAT AAAAATAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGATAGAAGAAACTGGGAGTCCATGTTT TTAAAATAATATTAAACAAAGCTCACGCTCTTCACTCTTCAATTTAAATGCATAAAAAAT GAATAAGGTCTTATTAAAATAATTTGCTCCGACAGCCCAGAGAGTTTGTTCTAAAAAATC TAATCGAAGCACATTCTTTAATATTCTCTGCTTTTAAGGTTTTCTGTTTGTTTCCCTTTC GATTACTTTTAGCTATAATC
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>LITCHI016693.m1 GenomeSequence + ACCGAACAAACAAATTTGCAGCACAGGTTGCGTGAAGTTTGGCGCTACATGGTCTCTTGA GAACACAAGAAGATAAAAATAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGATAGAAGAAACT GGGAGTCCATGTTTTTAAAATAATATTAAACAAAGCTCACGCTCTTCACTCTTCAATTTA AATGCATAAAAAATGAATAAGGTCTTATTAAAATAATTTGCTCCGACAGCCCAGAGAGTT TGTTCTAAAAAATCTAATCGAAGCACATTCTTTAATATTCTCTGCTTTTAAGGTTTTCTG TTTGTTTCCCTTTCGATTACTTTTAGCTATAATCATGTCTCAGACCAGCTGGGAAGCCGG TAAAATGTAAGTGTCTAACTACCAGAGCATTTCATTTTTCTCCTTCATTGTTTTGGGTTC TGGGGTTTTGTTTTAGCGTTGTTGTTTTACTTTTTGTGGGTACTAACTGTTATTCTTCTC AAATGGGTGTGTCTGTTTTTCTGGATTTTGTGTTTTGTCTATGTTTTTCAACATTTGACT GTGTGCTGTTCTTGTTTGTTGTTGATGTAATTTTAATGTTTTGAGTTCTTGCTTCCTCAA CTTAAAAGGGATATTATGTGTTTAATTGGTTTGTCTCTTATGATGATGGAATTGCCAAGT ACTGGTTTTTTGTGCATTTTGTCTGATTTTGGTTTTGAACTCTCTTTTTTGAATTTTGTA CTGGTATGTTTTGCTTATGCTCGAAGAAAGAAGATAACTTCTATTTGTTTTGACCTTCAA CATGGAAAAGGCCTTTTTTTTCCTGTTCTCTTCTACCCAATAGTGCAAACATTAATATTT TAAGCTGGAATTTTTGTTTAAATTGTACTCAATCAAAGCATTTTTATCTTTAATGTGGAG 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