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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI016635 | Chr1 | 38392976 | 38395793 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 39 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI016635.m1 | 89 | 113 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 31.5 | 1.30E-07 |
| LITCHI016635.m1 | 93 | 113 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.4 | 0.023 |
| LITCHI016635.m1 | 160 | 183 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 29.1 | 7.30E-07 |
| LITCHI016635.m1 | 162 | 183 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 29.6 | 4.50E-07 |
| LITCHI016635.m1 | 164 | 183 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.1 | 0.0065 |
| LITCHI016635.m1 | 236 | 261 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.5 | 1.50E-08 |
| LITCHI016635.m1 | 241 | 260 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.2 | 0.0015 |
| LITCHI016635.m2 | 89 | 113 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 31.5 | 1.30E-07 |
| LITCHI016635.m2 | 93 | 113 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.4 | 0.023 |
| LITCHI016635.m2 | 160 | 183 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 29.1 | 7.30E-07 |
| LITCHI016635.m2 | 162 | 183 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 29.6 | 4.50E-07 |
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>LITCHI007178.m1 ATGTCGATTTTTCTTTTCATTCTTTTTCTTCTTCCCTCAGCTGATTCAGTTTCCTTCCAA ATAACTCGCTTTGATCCTGACAGAAATAACTTGATTTACGAGGGAGATGCACAGCCTAGT GTTGGAGCTGTTGAGTTCAATAGTCAGAGTTATCAATATCAGGTTGGTCGAGTAAGGTAT GCTGAGAGAGTGCCCCTTTGGAATCATAAAACTAGAGAGCAGGCTGATTTCACTACACGT TTCTCCTTTGTTATCACCCAAACCGGTTCTCCACATGCAGCAGGGATTGCATTCTTCCTT GCTCCTGTTGGATTCGGGATCCCCCCGAATTCAGGTGGCGGTTTTTTGGGCCTATTTAAC ACAACCACCAGTGACTTTCCTCAAAACCAAATTGTTCTGGTTGAGTTTGACACTTTTCCA AACCCTGAATGGGATCCCAACTTTGAACATGTTGGTTTAAACGTCAACTCGATTTCCTCA GCCAAAAATGCCTTCTGGAATTCCAGTTTGCACAATGGAGATACTGCTGAGGCATTGGTT ACTTATAATGCTACTACCAAGAACTTGAGTGTGTCTTGGACCTACAGTAGCTCCTCTAAT TCTCTAGAGAATTCTAGTCTTTCCCACCAGGTTAATTTGATGGAGATTTTACCTGAGTGG ATCACAATTGGGTTTTCTGCAGCCACCGGCAGTTTTATAGAGCGCCATCAGATTTTGATG TGGGAGTTCAATTCAAGTTTGGTTGTGAAGGAAACAAATGGAAGTGATGAGAAGAGGACT AGAGTAATAGTTCTTATAGTTTCACTTGCGGTTTTGACAGCAGGGGCACTTATAGCATTG GGAATTCTTTGGATGCAGAGGCGAAAACGAAGGAGGAGAAAAGCAACAGCGACACTTGGT GACTTTGGATTAGCTCGGCTGATGGACCACGAATTAGGTCCCCAGACAGCTAGTGGCCTG GCTGGAACTCTAGGCTACATGGCTCCGGAGTATATAAGAACAGGTAGAGCTAGCAAAGAA TCCGACGTCTATAGTTTTGGGATTGTTATCTTGGAAATAGCTACCGGGAGAAAGTCAACT GATCCTGTGGAAGGAAGTTCTCAAATGGGTGTTGTAGAGTGGGTTTGGGATCTCTATGGA AGTGGAGATCTGCTTTCGGCCATTGATGAAAGACTTAATAAGGTGTTTGATGCAGAACAG GTAAAGTGTTTAATGATTGTCGGACTATGGTGTGCTCACCCCGATAGCAATCTCAGGCCT TCAATCAGGCAAGCATTGCAAGTTCTTCACTCTGAGGCAGCAATGCCAACTCTTCCAAGC ACGATGCCTGTTCCTTTTTATTATGTACCTACACCTTCAACCAGTACTGGTGGATCTGCA ATTACTAATTCAAACATTTCAGTGGCTAATTCAATTTCCTTCAAAATAAATCGGTTTGAT CCAGATAACCCTGATATACTGTATGAAGGAGATGCAAGAGTATATGTTGGAGCGGTTGAA TTCAACAGTGTCAGTTATCTTTGTCGTGTTGGATGGGCCACCTATGCAAAGAGGGTGCAC CTCTGGGATTTGGGAACCAACAAAATGTCTGATTTCACCACCCATTTCTCCTTCAGTATC GACACTGGTGGCCGTTCACTTTATGCAGCTGGGCTTGAATTCTACCTTGCTCCTTTTGGA TTTCAAATTCCACCCAATTCAGCTGGTAGTTTTCTAGACCTACTCAACACCACAACCAAT GACTCATCCCAGAACCATATGGTTCTAGTTGAGTTTGATTCTTTTCCAAACCCGGAATGG GATCCTCCTGTTGCCCATGTGGGGATCAACAACAACTCAGTTTCATGTTCAGTTTACACT CCATGGAATGCAAGTTTCCATAGTGGAGATACTGCTGATGTTTCTATTATTTACAATGCT ACTACTAAGAATATGAGCATTCTACCAGAATATATCTCTGTTGGGTTCTCAGCAGCTACA AGTCAACTTACAGAAAGACATCAACTTTTGTCATGGGAGTTCAGTTCAAGTTTTGGTACA GAGGAAACAAAGGAAAAGACAGTAGAGAAGATAAGACAAGAAGTAGGTATAGCTGCTTCA GTGGGTATTGTGGTAGCTGTGGCGGTTATATCGTTTTGCATTTCGTGGAGGAAGAAGTAT AAGAAGAGGGAAGAACTAGAAGAAGCAATCAACTTAGAATCAATCGACGATGACCTTGAT AAAGGATCAGGGCCTAAAAGGTTTTCTTTGAACGATCTCCTTCTAGCCACCAAGAAGTTC TCAAAAGATAGAAAGTTGGGTGAAGGCGGGTTTGGTGCTGTTGGCTATTTGATTGATCTT GACATGGAAATTGCTTTGAAACACCGGAATCTGGGGCAAAATGAGTACATAACTGAGATG AAGATAATTCGCCAGTTGAAACACCGGAATCTGGGGCAAGTCATAGGCTGGTGCCATGAT AGAGAAGAGTTTTTTTTATTGGTCTATGAATTCATGCCAAACGGGAGCCTGGTCTCTCAC CTGTTTGGTAAAAAGAGTAGCCCTCTCACCTGGGATGTTAGGTACAAGATATCTCTTGCA TTGGCCTCTGCATTGCTCTATCTACATGAAGAATGGGAGCATTGTGTTGTTCATAGAGAT ATCAAATCGAGCAATGTGATGCTAGATTCTAGTTTTAATGTCAAGTTTGGTGATTTCGGA CTAGCTCGGCTGATGAACCATGAATTAGTTCCTGAAACTGCTACAGTGTTGGCTGGAACC TTCAGGATACATGGCTCCAGAATATATATAAGCACAGGTAGATCGGATGTATGTAGCTTT GGTGTGGTTGCTTTAGAATTTACAAGGGGCAGGAAGGCTATTGATCCTTTGGAACAGAAG TTTCACACAACATTATTAGAGTGGGTGTGGGAACTTTATGGAGAAGGTGATCTTCTTTCG GCTGTTGATCAGAGACTACACGTTTTTGATGAGAAACAGGCCGAATGTTTGATGACTCAC TTTGAGGCCCTCAATAAGGCAAGCCACATTCGAGTTTTGAATCCCCTATGCCAAATCTTC CAGCCAAGATGCCTATTCCCATGTATCGAGTACCTACACAATCAGTTACTTCTAGTGAGC CATCCCCAACTATTCCAAGCCTTGATGTGGCTCGTTAATGTTATTAACGTTCCTAGTTCG TAA
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>LITCHI007178.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAATTATTTAAGGTTGTTTAATTTTTATTTCAGAGGGTTGATCTGAAAATTAATGGATAT ACAAGGGTTAAAAAATTATGGGATGGACAGACTTTACTATATGGTTATAGCCCATCGGGT TGTTTTTAGCATGATATATTTTCTTATAATTTTTAAGATCCAGAAACTAGAAATTATAGT AACAAAAACCCTAATTTTAATAATATTTGTTTAATGATATGTTAAATTCTACAAGATGCT ACATCATTTATGTTAAATTCTACAAGATGCTACATCATTTGATCAGGGTTAAGAAGATAG CGATTGGTTTTGCATTAAACGTGATCTCAGGCGCCCTTTTGGGATTTACCCTTTTTTTCG GTTTTTTTATGACAGTGGTTGAAATCCTAAATCTAAGCAGACAGAATCACTGTTACAATG AAACATGATATTGATTCATTGTATAACGATTGTGTTAAAAAATTCTGTAAAAAGTTTTCT GTTTTAGCAAATTATATTTACACCTATTAACTCTTTATACATGTACATTGATATATAAAA ATAGAATTTACTAAATCATTTATAAGACTAGTTTAGAGCATCTCCTGCTTTGCGTAATTT TTTCAAATAACAATATTTAATTAAGGTCAACTCTAACAGATGAATACCAAGACAATAGTT TCAATATTTTATTCCTATTGTCTTTCCTTGCATCTTCTCGTTCCAGTCGTGATAAACGCT GGTGGAAAATGATTTTAGAAAGTCAACATAGTTGCGGAACTGCAAGGAAGTTAGTTTGAA TGCACGGACACGTAAGTGTTTTTTAATGTTCAGTGTTAGAACTAGGGGTGGGCAACACCA TGTTCGGATCGCTTCCGACCGGATCCGATCCGAACATGGTAACTTCGCGGATCGTCATTT TTGGATCCGAACATGATCCATCAATGAGAAGGAACCGATCCGATCCGAACACCTAGTTCG CGGATCGGACCGGATCGGACCGGATCAGAACACCTACTTTCAATTTCAACCTATGATAAG AAGATAAATAGAGATATCTTGTTGATGTACCTTCGTGAATTGTAATACATATCTCCCAAA TTTTATAAACATTCATACTAATTACTCAACATCAAACACGTGTAACATCTCCTTTGCTGG CTACCAACATCAAACACCACCGACAACTACCCACCCAGAATAATAATAAAAATAAATAGG AGAATTGGGCACTCAGTTTTCAAGATTATTTTCAACAATAAGTCTTCTGAATTTCAATAC GCCCATCTTTATATTAATGGAAATCATAGTTCAAATCCCACTAGCACCACTCTTTATACT TTTTCCTATCTATTCACAGCAATAATAACATATATATATATATATAAAATCAGCAAATGA AATATGTAACTCAACAACAGAACACAACAAATAAGCATAGAAATCACTAAAACACTAACA CCCAATCATATAAATATCAAGTTAAAGCTGCAAATAGACTCACCAAGTTACTTAGATAAG AGTGAGAGGGAGTGAGAGATGGATGTTAGGGTTAGCTTAAGTGGACTTTATATAGAGACA TATGAAATTACGTATGTATCATTGTTCACGGGTTCACGGATCGGATCGGTTTTGGAAACC CTGATCCGATCCGATCCGTGAAACATGGTGTTTTCACAAGTGAGGATCCGAACACCTTAC TTTTGAACATGTGATCCGATCCGAACACCCACGGATCGGACCGGATCAGGGTGTTCGGAT CGGTTCCACGTTTTTGTGCCCACCCCTAGTTAGAACCACCGTTATTATATATTTAATTTC AACATCATTATCACTGTGTTGCCGGCCATAGTTGATTTAGTATTCTTTGACAGCTATGTG GTTCCTTTTCAGATAATTTCTCTTCTAATAAACTAGATTTAGTAGTTGCAACGTGCGTGC CAAGGTACACACTTATTGGCTTCATTTATGTGTTCTATTAGTGCACCATTTGTGCTACAT GTTTAACTCTCCCTTTCGTC
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>LITCHI026097.m2 GenomeSequence - GTTTTATTCACGTGACCACATGTCAAACGAGACAATTGGTGGGCCAGCAGTTTTACGCAG AGTTAACTCGACGTGGCAGCACTTGAATGCCAAAAACGCGATGGTACCACCAGTTGCTAC AATAATTCACATATTTTAAACCTAAAAATTCAGATCTAATACCGTACACCCAAAAAATCC CATCTTGTGTTTGTTGTTTCTCAGGTGAATTTTGCAGAGTCTTGAAGGCTCAATTTCAGT TGAAGACTTGTGTTGATACAAGGTAAGCTTCTGTTACTGCTCTTAGCTTCAGTCTTTTCA GTGTTCTAGTGACCCTTTTAAGGTGATGATGCCCTCTTAATTTTGTTAGATGGGTTTGAC CTAGACTGTCTTTTCCGCAATTTGCTACATGGTTATGTCTGAAACCCTAAATTGTTATTG AATTCTTGTTGTATGTTTGGTGATTCAGTTGGCAAACTTGTAATACCTGAGCTTTTCAAG GATCTGTGAAAAGGGTAGGTTTCAGTTTCTAGGCTTTTTAAGGCTATGTGTAGTTTAGCT AGTTCTTGAGTAGTTACTATTTGGTTGGAGAATTTGGCGTTTCTGTGTAATAATAGTTAA AAAGGAGAGAGGAAGATGGGTGAGAAATTTTGGGTAAATGAGCAAGACAAGGCTATGGTG GAATCAGTGTTGGGTGTTGAGGCTTGTGAGTTCTTGATCTCGTCGGCTTCTAACAACTTG TTGGCAGATATGGTTTCACCACCGGGGGATTTGGGTGTACAGCAGGCGCTATGTCAGATT GTTGAAGGGTCTAATTGGAACTATGCTATTTACTGGCATGTCTCGAGCTTGAAATCTGGT GGGTCTGTCTTGATTTGGGGAGATGGTAATTGCCGGGACGCAAAGGGTGGTGAGGTTGCT GATGCGAATTCTATTGTGGTAGGCAAATTGGAGGGAGTTGAGAGGAAGGATGAGGTGAAA AAGCAGGTCCTTCAGAAGCTACATGCATGTTTCGGTGGATTGGAGGAGGATAACTATGCA TCAAAGTTGGATGGAGTTTCGGGTGTGGAGATGTTTTATCTTTCCTCAATGTATTTTAAC TTTAGATGTGATTCACCACATGGTCCTGGGCAGGCACATAATTCTGGTAGATCAATTTGG GTTACAGGCATAGGTAGTTGTTTAGATCATTATCAACATAGATCCTTTCTAGCAAAGTCG GCAGGTTTCCAGACAGCAGTGTTTGTTCCTGTGAAGTCTGGAGTTGTGGAACTTGCTTCA GTCAAATTAATTCCTGAGGAAAAGAATGTTGTGAAGATGATCAAAACAGTATTTGGTGGA TCCAGTCCTGTACAGACAAAAGTGTTTCCAAAAATTTTTGGGCGTGAACTAAGTTTGGGT GGCTCAAAATCACAGTCAATCAGTATAAATTTCTCACCCAAGGTAGAAGATGATTTGACA TTCGCTTCTGACTCTTATGATCTACAAGCGATGGGTACCAATCAAATTTATGGAAATTCT TCTAATGGGTGTCCATCTGATGATAATGAAGCAAAACTTTTTCCTCATCTAAACCAAATG ATGGTTGGGGGTTTTGATGCGCAGACAAGGTTATCTGGTTTGGAGCAGAAAGATGACTCT TCACCTCAGGGTGATGAGCGTAGACCAAGGAAAAGAGGAAGAAAACCTGCCAACGGGAGA GAAGAGCCTCTGAATCATGTGGAAGCAGAGAGGCAGCGGCGTGAGAAGCTTAACCAGCGA TTCTATGCTTTAAGGGCTGTTGTGCCAAATATCTCTAAGATGGACAAGGCCTCTCTGCTT GGTGATGCCATTACCTACATTACAGACCTCCAGATGAAAATCAGGGTCTTGGAAACTGAA AAGGAGATGGGGAACAACAAGCAGAAGCAGAAGCCCATTCCAGACATTGATTTCCAGCAA AGACACGATGATGCAGTTGTGAGGGTAAGCTGTCCTTTGGACGCTCACCCAGTCTCTAAC GTCATGAAAACATTCAGTGAACATCAAATTGTAGCTCAAGAGTCTAATGTGTCTACAACA GAGGACAAGGTTATTCATACATTTTCGATTCATACACAAAGTGGTTCAGCTGAGCAGTTG AAGGAGAAACTGGTTTCAGCCTTGTCCAAATGATCTCGTGTTTAATATAAGAAGCAAACT ATGTATCCAATGCATGCCTTGTAGAAAATTGCATGGGATGGCCATATAATCTTGTAGCTG ACTGACTGATGCGTTGTTGTTGTATGCATTAATGATTTGTAATTTGTAATGTAATTTGGA AGGATTGATCGAATTTTACCTTGGTGCCGTTTTGTTGGAGATGTTCAGTTGGGTAATATA TGTGATTAGTATCATTACTTTCTAAACATTTTGTTATCATTATTTTATTAACATTTTATG TTGATATGCGGCAGTGTAGAGTGTTGGATGAGACGCACTTTGTATGATATTTGAATTCTG TACAATGCAGTTACCCTTTGTCCCTTCCACATAAATGATTTTGCCAGCTCGTTAATTTGC TGGCTCTGTACGGAACCATAACATTAGGAATATGCACAGATACGTGAATGTATATATTAC AATAGCAGTATTCTGATTTATGTGTTGTTAACTTCGATCGTCTGAGAAATTATATCACTA TGAAAATTGATCTGGC >LITCHI026097.m1 GenomeSequence - GTTTTATTCACGTGACCACATGTCAAACGAGACAATTGGTGGGCCAGCAGTTTTACGCAG AGTTAACTCGACGTGGCAGCACTTGAATGCCAAAAACGCGATGGTACCACCAGTTGCTAC AATAATTCACATATTTTAAACCTAAAAATTCAGATCTAATACCGTACACCCAAAAAATCC CATCTTGTGTTTGTTGTTTCTCAGGTGAATTTTGCAGAGTCTTGAAGGCTCAATTTCAGT TGAAGACTTGTGTTGATACAAGGTAAGCTTCTGTTACTGCTCTTAGCTTCAGTCTTTTCA GTGTTCTAGTGACCCTTTTAAGGTGATGATGCCCTCTTAATTTTGTTAGATGGGTTTGAC CTAGACTGTCTTTTCCGCAATTTGCTACATGGTTATGTCTGAAACCCTAAATTGTTATTG AATTCTTGTTGTATGTTTGGTGATTCAGTTGGCAAACTTGTAATACCTGAGCTTTTCAAG GATCTGTGAAAAGGGTAGGTTTCAGTTTCTAGGCTTTTTAAGGCTATGTGTAGTTTAGCT AGTTCTTGAGTAGTTACTATTTGGTTGGAGAATTTGGCGTTTCTGTGTAATAATAGTTAA AAAGGAGAGAGGAAGATGGGTGAGAAATTTTGGGTAAATGAGCAAGACAAGGCTATGGTG GAATCAGTGTTGGGTGTTGAGGCTTGTGAGTTCTTGATCTCGTCGGCTTCTAACAACTTG TTGGCAGATATGGTTTCACCACCGGGGGATTTGGGTGTACAGCAGGCGCTATGTCAGATT GTTGAAGGGTCTAATTGGAACTATGCTATTTACTGGCATGTCTCGAGCTTGAAATCTGGT GGGTCTGTCTTGATTTGGGGAGATGGTAATTGCCGGGACGCAAAGGGTGGTGAGGTTGCT GATGCGAATTCTATTGTGGTAGGCAAATTGGAGGGAGTTGAGAGGAAGGATGAGGTGAAA AAGCAGGTCCTTCAGAAGCTACATGCATGTTTCGGTGGATTGGAGGAGGATAACTATGCA TCAAAGTTGGATGGAGTTTCGGGTGTGGAGATGTTTTATCTTTCCTCAATGTATTTTAAC TTTAGATGTGATTCACCACATGGTCCTGGGCAGGCACATAATTCTGGTAGATCAATTTGG GTTACAGGCATAGGTAGTTGTTTAGATCATTATCAACATAGATCCTTTCTAGCAAAGTCG GCAGGTTTCCAGACAGCAGTGTTTGTTCCTGTGAAGTCTGGAGTTGTGGAACTTGCTTCA GTCAAATTAATTCCTGAGGAAAAGAATGTTGTGAAGATGATCAAAACAGTATTTGGTGGA TCCAGTCCTGTACAGACAAAAGTGTTTCCAAAAATTTTTGGGCGTGAACTAAGTTTGGGT GGCTCAAAATCACAGTCAATCAGTATAAATTTCTCACCCAAGGTAGAAGATGATTTGACA TTCGCTTCTGACTCTTATGATCTACAAGCGATGGGTACCAATCAAATTTATGGAAATTCT TCTAATGGGTGTCCATCTGATGATAATGAAGCAAAACTTTTTCCTCATCTAAACCAAATG ATGGTTGGGGGTTTTGATGCGCAGACAAGGTTATCTGGTTTGGAGCAGAAAGATGACTCT TCACCTCAGGGTGATGAGCGTAGACCAAGGAAAAGAGGAAGAAAACCTGCCAACGGGAGA GAAGAGCCTCTGAATCATGTGGAAGCAGAGAGGCAGCGGCGTGAGAAGCTTAACCAGCGA TTCTATGCTTTAAGGGCTGTTGTGCCAAATATCTCTAAGATGGACAAGGCCTCTCTGCTT GGTGATGCCATTACCTACATTACAGACCTCCAGATGAAAATCAGGGTCTTGGAAACTGAA AAGGAGATGGGGAACAACAAGCAGAAGCAGAAGCCCATTCCAGACATTGATTTCCAGCAA AGACACGATGATGCAGTTGTGAGGGTAAGCTGTCCTTTGGACGCTCACCCAGTCTCTAAC GTCATGAAAACATTCAGTGAACATCAAATTGTAGCTCAAGAGTCTAATGTGTCTACAACA GAGGACAAGGTTATTCATACATTTTCGATTCATACACAAAGTGGTTCAGCTGAGCAGTTG AAGGAGAAACTGGTTTCAGCCTTGTCCAAATGATCTCGTGTTTAATATAAGAAGCAAACT ATGTATCCAATGCATGCCTTGTAGAAAATTGCATGGGATGGCCATATAATCTTGTAGCTG ACTGACTGATGCGTTGTTGTTGTATGCATTAATGATTTGTAATTTGTAATGTAATTTGGA AGGATTGATCGAATTTTACCTTGGTGCCGTTTTGTTGGAGATGTTCAGTTGGGTAATATA TGTGATTAGTATCATTACTTTCTAAACATTTTGTTATCATTATTTTATTAACATTTTATG TTGATATGCGGCAGTGTAGAGTGTTGGATGAGACGCACTTTGTATGATATTTGAATTCTG TACAATGCAGTTACCCTTTGTCCCTTCCACATAAATGATTTTGCCAGCTCGTTAATTTGC TGGCTCTGTACGGAACCATAACATTAGGAATATGCACAGATACGTGAATGTATATATTAC AATAGCAGTATTCTGATTTATGTGTTGTTAACTTCGATCGTCTGAGAAATTATATCACTA TGAAAATTGATCTGGC