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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI016635 | Chr1 | 38392976 | 38395793 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 39 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI016635.m1 | 89 | 113 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 31.5 | 1.30E-07 |
| LITCHI016635.m1 | 93 | 113 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.4 | 0.023 |
| LITCHI016635.m1 | 160 | 183 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 29.1 | 7.30E-07 |
| LITCHI016635.m1 | 162 | 183 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 29.6 | 4.50E-07 |
| LITCHI016635.m1 | 164 | 183 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.1 | 0.0065 |
| LITCHI016635.m1 | 236 | 261 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.5 | 1.50E-08 |
| LITCHI016635.m1 | 241 | 260 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.2 | 0.0015 |
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>LITCHI016635.m1 AGAGAACAAAAATATGAGCAACGGCAAGGCGTTGGATCAGTGACCATTGAAAAATGAGCT ACTGTCCCTCAAATAAGGCCAGGCCAGCGGTAATTTAAAAAAATAGTGGAAATAGTAATT AAGAAAAAAAATGTAATTAATGAAAATGAACACGTAATAAAGGGTTTTTGGTATTGGATG CGTGGAGGTTTTAGGCTTTGGCGGTTTAGAGTCCAACTCCAAACTCTTTTTGGTTTCTAC CTCTTTCTCGATTTAGGGTTTGTGGTAGGCGGCTAGGGTTTTTTTAACTCTCGCTCTCTA TATATTTTACTTTATAATGTAGTCTCAAACTTGTTTAGTCTTTCGTTATTCTATAATCAT TCTTGGTCTACCTTTGTTCATTTCAGATTTATTGATTGGTTTTTTTCTTCAAATGATTTA AATTTTGGTAAATAATTCATCTGGGTTCCTTGATATTGCTTTGAAGTACGTGATCATCGT CTGATTTATAGTCAACCAAAAGACTTATCAAACTTTCCGAATATGAGTTTTTCCGATCCA AACCCTTCATTTTTGGCGGCACAATCTCAGCCGTATGCCGTTGGCAGTGATGCCGTTGGT GTCTGGCCTCAGTTCTCTATGAACAATGAACAACAATGTGACACACATTCACAATTTGAT CAACAGCCTCCTTTTAAGAAGCCTAGAAACTATGAAGAGAATCAATCAAACCCTTCTCTG TATCCACCTAGGACCAACAAGCAACCTATGAACCCTCCAATCAATAAAGGGCCAACCAAC ATTTTCTTCAAGACCCGTATATGTGCAAAATTTAAGCAGGGTGCTTGTAGAAACGGCGAA AGTTGTAACTTTGCACATGGTCTGGAGGACCTGAGGCAGCCTCCTCCCAATTGGCAAGAG CTTGTAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCCGGCAGTGGCCGTGTCGAGGAAGATCATCGACCC TCTGGCTCTAATTGGGATGATGATCAGAAGATAATCCATAAGATGAAGCTATGCAAGAAG TTTTATAATGGAGAGGATTGCCCTTATGGTGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCA TCCAAATTTAGGGATGATTTAGGGAGGTACAGGGAGAGCTCAGCTATAAGCATTGGGACT ACAGGACCAACAGTGGTGACTGGAGCAGGTTCTAATCAATCCGAAGTTAATAGGCCTGCA AACAACGCAATTGTAAAACCTGTCTATTGGAAGACAAAGCTGTGTATCAAGTGGACAACT GGCCAATGCCCTTTCGGAGAAAAATGCCACTTTGCTCACGGTGAAGCAGAATTGCAGGTA CTTGCTGGACGCATTGAAGGGGAAGCAGGGAACACAGGTTTTGTTCCGACAAAACCTCAG TTTGTTTCTGCTAATGATGCATCTCCCTGTAAGTCAGTGACTTTGCCTACTTTGAGCAAG GAAGGTCAAGGCAAGAAGTGCTTATTCAAGTTGAAAAGACCCAAGAAAATCAATCGGATT TATGGAGATTGGCTTGATGATATGCCATTAGTGCACAACCTGCCAAGCCAAGTGGAAAGC TGAGTTCGATTGGAGCATGTTATATTGAACTGTTTTTTGTAGTTGAATCAGGAGGGGTAC TTCTGCATTTAATGGTCGAAATTTTGGTTGTCTGTTTGAGCCTCTAGGAGGCATAGAAGA TGGGAGATAGTTTTTGCTTGATGATTTGCACTAGTTGCTCTGATCAATAGCTTTTTGTTT CTTTTTTGATTTTTATTCTTATAGAGTATATGTTTTTGTTTAAGTCAGCAGGCAGTTTGG AACTAACCATTCTTTGTTACTAGAGATCAAATAATAGGGTTTTTGAATGCAAATATAAGT GCGTCCAATTGAATCATACTTGGTTTGCAATTGTCCAAATTCCTATTAATATTCAAGTAA GCTTTGCTGTATCCTTTTGTTAGTACTTAAAGAAAAAGTTCAGTGTTTTTCATTTTATAA TATTCTTATGTTTTTTGTATCTTCCAAAATGGAGAAGAGCTAGAGTAAATTATGATTCAT TGCCTGCAGCATTTCCCATAGAATATTGTTGCTCTGAAAATTAAATGCCCGCAAGACTTA TT >LITCHI016635.m2 AGAGAACAAAAATATGAGCAACGGCAAGGCGTTGGATCAGTGACCATTGAAAAATGAGCT ACTGTCCCTCAAATAAGGCCAGGCCAGCGGTAATTTAAAAAAATAGTGGAAATAGTAATT AAGAAAAAAAATGTAATTAATGAAAATGAACACGTAATAAAGGGTTTTTGGTATTGGATG CGTGGAGGTTTTAGGCTTTGGCGGTTTAGAGTCCAACTCCAAACTCTTTTTGGTTTCTAC CTCTTTCTCGATTTAGGGTTTGTGGTAGGCGGCTAGGGTTTTTTTAACTCTCGCTCTCTA TATATTTTACTTTATAATGTAGTCTCAAACTTGTTTAGTCTTTCGTTATTCTATAATCAT TCTTGGTCTACCTTTGTTCATTTCAGATTTATTGATTGGTTTTTTTCTTCAAATGATTTA AATTTTGGTAAATAATTCATCTGGGTTCCTTGATATTGCTTTGAAGTACGTGATCATCGT CTGATTGTAAGTTTCTTTGTCTTGCAATTTTGGTTTTGCATAGAATCCAATTCAATTTTG AGAAATATTATTGATTGTTGTAGTTTGAATGCTAACGTATACGTTTTGATCGATCGATTG ATTGATTTAGTATAGTCAACCAAAAGACTTATCAAACTTTCCGAATATGAGTTTTTCCGA TCCAAACCCTTCATTTTTGGCGGCACAATCTCAGCCGTATGCCGTTGGCAGTGATGCCGT TGGTGTCTGGCCTCAGTTCTCTATGAACAATGAACAACAATGTGACACACATTCACAATT TGATCAACAGCCTCCTTTTAAGAAGCCTAGAAACTATGAAGAGAATCAATCAAACCCTTC TCTGTATCCACCTAGGACCAACAAGCAACCTATGAACCCTCCAATCAATAAAGGGCCAAC CAACATTTTCTTCAAGACCCGTATATGTGCAAAATTTAAGCAGGGTGCTTGTAGAAACGG CGAAAGTTGTAACTTTGCACATGGTCTGGAGGACCTGAGGCAGCCTCCTCCCAATTGGCA AGAGCTTGTAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCCGGCAGTGGCCGTGTCGAGGAAGATCATCG ACCCTCTGGCTCTAATTGGGATGATGATCAGAAGATAATCCATAAGATGAAGCTATGCAA GAAGTTTTATAATGGAGAGGATTGCCCTTATGGTGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGA TCCATCCAAATTTAGGGATGATTTAGGGAGGTACAGGGAGAGCTCAGCTATAAGCATTGG GACTACAGGACCAACAGTGGTGACTGGAGCAGGTTCTAATCAATCCGAAGTTAATAGGCC TGCAAACAACGCAATTGTAAAACCTGTCTATTGGAAGACAAAGCTGTGTATCAAGTGGAC AACTGGCCAATGCCCTTTCGGAGAAAAATGCCACTTTGCTCACGGTGAAGCAGAATTGCA GGTACTTGCTGGACGCATTGAAGGGGAAGCAGGGAACACAGGTTTTGTTCCGACAAAACC TCAGTTTGTTTCTGCTAATGATGCATCTCCCTGTAAGTCAGTGACTTTGCCTACTTTGAG CAAGGAAGGTCAAGGCAAGAAGTGCTTATTCAAGTTGAAAAGACCCAAGAAAATCAATCG GATTTATGGAGATTGGCTTGATGATATGCCATTAGTGCACAACCTGCCAAGCCAAGTGGA AAGCTGAGTTCGATTGGAGCATGTTATATTGAACTGTTTTTTGTAGTTGAATCAGGAGGG GTACTTCTGCATTTAATGGTCGAAATTTTGGTTGTCTGTTTGAGCCTCTAGGAGGCATAG AAGATGGGAGATAGTTTTTGCTTGATGATTTGCACTAGTTGCTCTGATCAATAGCTTTTT GTTTCTTTTTTGATTTTTATTCTTATAGAGTATATGTTTTTGTTTAAGTCAGCAGGCAGT TTGGAACTAACCATTCTTTGTTACTAGAGATCAAATAATAGGGTTTTTGAATGCAAATAT AAGTGCGTCCAATTGAATCATACTTGGTTTGCAATTGTCCAAATTCCTATTAATATTCAA GTAAGCTTTGCTGTATCCTTTTGTTAGTACTTAAAGAAAAAGTTCAGTGTTTTTCATTTT ATAATATTCTTATGTTTTTTGTATCTTCCAAAATGGAGAAGAGCTAGAGTAAATTATGAT TCATTGCCTGCAGCATTTCCCATAGAATATTGTTGCTCTGAAAATTAAATGCCCGCAAGA CTTATT
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>LITCHI016635.m1 + Up_Stream_Len 2000 CATCCACGGTCACTCTGAAATAATTCTGACAGAGTGATGATACTCTAGTATATTCAACCT GTTTGTACAGTAAAGATCTCTCATATTTATAGAGAGGGGGAGATGACAAAAAGAAAATAC AAAAGAATGTTATACACGCTACATGCAACGGCTATTTACAACTAATCTTGACATAGCCAT GTTGCATTAATTGTCAAGATAATGATTGTTCTCTTCCTGTACACATCTGTATTTAATACA CCAGGAGAGGTATTTCCTTCATTAATTGCATAGCCGCCGCATTGAATGCTTCTGGATAAT TATGAATGGTTTCTTGCGTGGAGTCAGAAGAGTTGGTGATTCTGATGACTTGCTACAAAA GGTTTCTTCTGGAACAGGCTAGGGGTCTGTCAGATCAAGCAAGCTGAGCTCCTATTGACG TGGGCGAAGTAACGATGGGACGATCTAGAAGTAGTGCGAGCTCGCGACCCGGCGACCTCG CGATCTGGACGGGCTTGCGGCAGCGGTTGGGATTATGGGTCTTTTACTTCTGTTCATGTC CCATTGGACTTTTACTGGCCTGCTTGCACAAATCGAGAAAATGGGCGTAACACTTATTCT TTCACAACTAATTTTATATAAAGATTTTATTTCATTCTTCATATTTTGCAATTAAATTGC ATTCTTTAAAAAGTATTTGGTGTTTAAGATTAACATTTAGAATAGAAGTTAGAGTTTGAA AAAAAAAAAAAGAGTTTTATGATATATATGACATTTTAATTAATAATTTGAGGATAGAGT TACCAATAAGCAGCTAATAATTAATGAAATATATATATACATATATACATATATACATAT ATGAATTTTACAGAAGTGAAGGTTGAACCTAAAACCAAGACAGCATACATCCACAGGCAA TGGTTTCTCAATTCACTTGGCTTCGATACATAGGCCAATAGCTTGAATACTCCGTCTCTC TCAACACAAAAGTGCAACTCTTCAAATTCAAAATTAAAATGAAAAAGTGCAACTTTAAAA TGATGATGTGCAACTTTTTGAACTTCAAATTTAGAATCTTATAAGTTTTTCAATTCAAAA CTTCCAACAATCAAGAATTACATTAATTTGATTAGTATATACCAATACATGGTCAAAATA CTATCACTACACAGAACGTTTTGAGCCAATCACTTGAATAAATTTGAATTCTCAATGCTC TGTTTTTTTCTTTCAAATCATATATTCACATATATATTAATTTTCTTATAACTAGCTACA CTGTATGGTACGGATGATGGATCAAATTTATACAAATTATAAGCTTACACATTGACATTA TATAAGTGCTATAATAGTGAATATTGATCAAGTGAGAGAACAAAAATATGAGCAACGGCA AGGCGTTGGATCAGTGACCATTGAAAAATGAGCTACTGTCCCTCAAATAAGGCCAGGCCA GCGGTAATTTAAAAAAATAGTGGAAATAGTAATTAAGAAAAAAAATGTAATTAATGAAAA TGAACACGTAATAAAGGGTTTTTGGTATTGGATGCGTGGAGGTTTTAGGCTTTGGCGGTT TAGAGTCCAACTCCAAACTCTTTTTGGTTTCTACCTCTTTCTCGATTTAGGGTTTGTGGT AGGCGGCTAGGGTTTTTTTAACTCTCGCTCTCTATATATTTTACTTTATAATGTAGTCTC AAACTTGTTTAGTCTTTCGTTATTCTATAATCATTCTTGGTCTACCTTTGTTCATTTCAG ATTTATTGATTGGTTTTTTTCTTCAAATGATTTAAATTTTGGTAAATAATTCATCTGGGT TCCTTGATATTGCTTTGAAGTACGTGATCATCGTCTGATTGTAAGTTTCTTTGTCTTGCA ATTTTGGTTTTGCATAGAATCCAATTCAATTTTGAGAAATATTATTGATTGTTGTAGTTT GAATGCTAACGTATACGTTTTGATCGATCGATTGATTGATTTAGTATAGTCAACCAAAAG ACTTATCAAACTTTCCGAAT >LITCHI016635.m2 + Up_Stream_Len 2000 CATCCACGGTCACTCTGAAATAATTCTGACAGAGTGATGATACTCTAGTATATTCAACCT GTTTGTACAGTAAAGATCTCTCATATTTATAGAGAGGGGGAGATGACAAAAAGAAAATAC AAAAGAATGTTATACACGCTACATGCAACGGCTATTTACAACTAATCTTGACATAGCCAT GTTGCATTAATTGTCAAGATAATGATTGTTCTCTTCCTGTACACATCTGTATTTAATACA CCAGGAGAGGTATTTCCTTCATTAATTGCATAGCCGCCGCATTGAATGCTTCTGGATAAT TATGAATGGTTTCTTGCGTGGAGTCAGAAGAGTTGGTGATTCTGATGACTTGCTACAAAA GGTTTCTTCTGGAACAGGCTAGGGGTCTGTCAGATCAAGCAAGCTGAGCTCCTATTGACG TGGGCGAAGTAACGATGGGACGATCTAGAAGTAGTGCGAGCTCGCGACCCGGCGACCTCG CGATCTGGACGGGCTTGCGGCAGCGGTTGGGATTATGGGTCTTTTACTTCTGTTCATGTC CCATTGGACTTTTACTGGCCTGCTTGCACAAATCGAGAAAATGGGCGTAACACTTATTCT TTCACAACTAATTTTATATAAAGATTTTATTTCATTCTTCATATTTTGCAATTAAATTGC ATTCTTTAAAAAGTATTTGGTGTTTAAGATTAACATTTAGAATAGAAGTTAGAGTTTGAA AAAAAAAAAAAGAGTTTTATGATATATATGACATTTTAATTAATAATTTGAGGATAGAGT TACCAATAAGCAGCTAATAATTAATGAAATATATATATACATATATACATATATACATAT ATGAATTTTACAGAAGTGAAGGTTGAACCTAAAACCAAGACAGCATACATCCACAGGCAA TGGTTTCTCAATTCACTTGGCTTCGATACATAGGCCAATAGCTTGAATACTCCGTCTCTC TCAACACAAAAGTGCAACTCTTCAAATTCAAAATTAAAATGAAAAAGTGCAACTTTAAAA TGATGATGTGCAACTTTTTGAACTTCAAATTTAGAATCTTATAAGTTTTTCAATTCAAAA CTTCCAACAATCAAGAATTACATTAATTTGATTAGTATATACCAATACATGGTCAAAATA CTATCACTACACAGAACGTTTTGAGCCAATCACTTGAATAAATTTGAATTCTCAATGCTC TGTTTTTTTCTTTCAAATCATATATTCACATATATATTAATTTTCTTATAACTAGCTACA CTGTATGGTACGGATGATGGATCAAATTTATACAAATTATAAGCTTACACATTGACATTA TATAAGTGCTATAATAGTGAATATTGATCAAGTGAGAGAACAAAAATATGAGCAACGGCA AGGCGTTGGATCAGTGACCATTGAAAAATGAGCTACTGTCCCTCAAATAAGGCCAGGCCA GCGGTAATTTAAAAAAATAGTGGAAATAGTAATTAAGAAAAAAAATGTAATTAATGAAAA TGAACACGTAATAAAGGGTTTTTGGTATTGGATGCGTGGAGGTTTTAGGCTTTGGCGGTT TAGAGTCCAACTCCAAACTCTTTTTGGTTTCTACCTCTTTCTCGATTTAGGGTTTGTGGT AGGCGGCTAGGGTTTTTTTAACTCTCGCTCTCTATATATTTTACTTTATAATGTAGTCTC AAACTTGTTTAGTCTTTCGTTATTCTATAATCATTCTTGGTCTACCTTTGTTCATTTCAG ATTTATTGATTGGTTTTTTTCTTCAAATGATTTAAATTTTGGTAAATAATTCATCTGGGT TCCTTGATATTGCTTTGAAGTACGTGATCATCGTCTGATTGTAAGTTTCTTTGTCTTGCA ATTTTGGTTTTGCATAGAATCCAATTCAATTTTGAGAAATATTATTGATTGTTGTAGTTT GAATGCTAACGTATACGTTTTGATCGATCGATTGATTGATTTAGTATAGTCAACCAAAAG ACTTATCAAACTTTCCGAAT
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>LITCHI016635.m1 GenomeSequence + AGAGAACAAAAATATGAGCAACGGCAAGGCGTTGGATCAGTGACCATTGAAAAATGAGCT ACTGTCCCTCAAATAAGGCCAGGCCAGCGGTAATTTAAAAAAATAGTGGAAATAGTAATT AAGAAAAAAAATGTAATTAATGAAAATGAACACGTAATAAAGGGTTTTTGGTATTGGATG CGTGGAGGTTTTAGGCTTTGGCGGTTTAGAGTCCAACTCCAAACTCTTTTTGGTTTCTAC CTCTTTCTCGATTTAGGGTTTGTGGTAGGCGGCTAGGGTTTTTTTAACTCTCGCTCTCTA TATATTTTACTTTATAATGTAGTCTCAAACTTGTTTAGTCTTTCGTTATTCTATAATCAT TCTTGGTCTACCTTTGTTCATTTCAGATTTATTGATTGGTTTTTTTCTTCAAATGATTTA AATTTTGGTAAATAATTCATCTGGGTTCCTTGATATTGCTTTGAAGTACGTGATCATCGT CTGATTGTAAGTTTCTTTGTCTTGCAATTTTGGTTTTGCATAGAATCCAATTCAATTTTG AGAAATATTATTGATTGTTGTAGTTTGAATGCTAACGTATACGTTTTGATCGATCGATTG ATTGATTTAGTATAGTCAACCAAAAGACTTATCAAACTTTCCGAATATGAGTTTTTCCGA TCCAAACCCTTCATTTTTGGCGGCACAATCTCAGCCGTATGCCGTTGGCAGTGATGCCGT TGGTGTCTGGCCTCAGTTCTCTATGAACAATGAACAACAATGTGACACACATTCACAATT TGATCAACAGCCTCCTTTTAAGAAGCCTAGAAACTATGAAGAGAATCAATCAAACCCTTC TCTGTATCCACCTAGGACCAACAAGCAACCTATGAACCCTCCAATCAATAAAGGGCCAAC 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GenomeSequence + AGAGAACAAAAATATGAGCAACGGCAAGGCGTTGGATCAGTGACCATTGAAAAATGAGCT ACTGTCCCTCAAATAAGGCCAGGCCAGCGGTAATTTAAAAAAATAGTGGAAATAGTAATT AAGAAAAAAAATGTAATTAATGAAAATGAACACGTAATAAAGGGTTTTTGGTATTGGATG CGTGGAGGTTTTAGGCTTTGGCGGTTTAGAGTCCAACTCCAAACTCTTTTTGGTTTCTAC CTCTTTCTCGATTTAGGGTTTGTGGTAGGCGGCTAGGGTTTTTTTAACTCTCGCTCTCTA TATATTTTACTTTATAATGTAGTCTCAAACTTGTTTAGTCTTTCGTTATTCTATAATCAT TCTTGGTCTACCTTTGTTCATTTCAGATTTATTGATTGGTTTTTTTCTTCAAATGATTTA AATTTTGGTAAATAATTCATCTGGGTTCCTTGATATTGCTTTGAAGTACGTGATCATCGT CTGATTGTAAGTTTCTTTGTCTTGCAATTTTGGTTTTGCATAGAATCCAATTCAATTTTG AGAAATATTATTGATTGTTGTAGTTTGAATGCTAACGTATACGTTTTGATCGATCGATTG ATTGATTTAGTATAGTCAACCAAAAGACTTATCAAACTTTCCGAATATGAGTTTTTCCGA TCCAAACCCTTCATTTTTGGCGGCACAATCTCAGCCGTATGCCGTTGGCAGTGATGCCGT TGGTGTCTGGCCTCAGTTCTCTATGAACAATGAACAACAATGTGACACACATTCACAATT TGATCAACAGCCTCCTTTTAAGAAGCCTAGAAACTATGAAGAGAATCAATCAAACCCTTC TCTGTATCCACCTAGGACCAACAAGCAACCTATGAACCCTCCAATCAATAAAGGGCCAAC CAACATTTTCTTCAAGACCCGTATATGTGCAAAATTTAAGCAGGGTGCTTGTAGAAACGG 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