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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI016635Chr13839297638395793+Zinc finger CCCH domain-containing protein 39

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI016635.m189113PF00642.27zf-CCCHFamily31.51.30E-07
LITCHI016635.m193113PF14608.9zf-CCCH_2Domain15.40.023
LITCHI016635.m1160183PF00642.27zf-CCCHFamily29.17.30E-07
LITCHI016635.m1162183PF18044.4zf-CCCH_4Domain29.64.50E-07
LITCHI016635.m1164183PF14608.9zf-CCCH_2Domain17.10.0065
LITCHI016635.m1236261PF00642.27zf-CCCHFamily34.51.50E-08
LITCHI016635.m1241260PF14608.9zf-CCCH_2Domain19.20.0015
LITCHI016635.m289113PF00642.27zf-CCCHFamily31.51.30E-07
LITCHI016635.m293113PF14608.9zf-CCCH_2Domain15.40.023
LITCHI016635.m2160183PF00642.27zf-CCCHFamily29.17.30E-07
LITCHI016635.m2162183PF18044.4zf-CCCH_4Domain29.64.50E-07
LITCHI016635.m2164183PF14608.9zf-CCCH_2Domain17.10.0065
LITCHI016635.m2236261PF00642.27zf-CCCHFamily34.51.50E-08
LITCHI016635.m2241260PF14608.9zf-CCCH_2Domain19.20.0015
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>LITCHI016635.m1
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GGCAGTGATGCCGTTGGTGTCTGGCCTCAGTTCTCTATGAACAATGAACAACAATGTGAC
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GGCAGTGATGCCGTTGGTGTCTGGCCTCAGTTCTCTATGAACAATGAACAACAATGTGAC
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CCAAGCCAAGTGGAAAGCTGA
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AACCCTTCATTTTTGGCGGCACAATCTCAGCCGTATGCCGTTGGCAGTGATGCCGTTGGT
GTCTGGCCTCAGTTCTCTATGAACAATGAACAACAATGTGACACACATTCACAATTTGAT
CAACAGCCTCCTTTTAAGAAGCCTAGAAACTATGAAGAGAATCAATCAAACCCTTCTCTG
TATCCACCTAGGACCAACAAGCAACCTATGAACCCTCCAATCAATAAAGGGCCAACCAAC
ATTTTCTTCAAGACCCGTATATGTGCAAAATTTAAGCAGGGTGCTTGTAGAAACGGCGAA
AGTTGTAACTTTGCACATGGTCTGGAGGACCTGAGGCAGCCTCCTCCCAATTGGCAAGAG
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ACAGGACCAACAGTGGTGACTGGAGCAGGTTCTAATCAATCCGAAGTTAATAGGCCTGCA
AACAACGCAATTGTAAAACCTGTCTATTGGAAGACAAAGCTGTGTATCAAGTGGACAACT
GGCCAATGCCCTTTCGGAGAAAAATGCCACTTTGCTCACGGTGAAGCAGAATTGCAGGTA
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GAAGGTCAAGGCAAGAAGTGCTTATTCAAGTTGAAAAGACCCAAGAAAATCAATCGGATT
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>LITCHI016635.m2
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AATTTTGGTAAATAATTCATCTGGGTTCCTTGATATTGCTTTGAAGTACGTGATCATCGT
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TGGTGTCTGGCCTCAGTTCTCTATGAACAATGAACAACAATGTGACACACATTCACAATT
TGATCAACAGCCTCCTTTTAAGAAGCCTAGAAACTATGAAGAGAATCAATCAAACCCTTC
TCTGTATCCACCTAGGACCAACAAGCAACCTATGAACCCTCCAATCAATAAAGGGCCAAC
CAACATTTTCTTCAAGACCCGTATATGTGCAAAATTTAAGCAGGGTGCTTGTAGAAACGG
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AGAGCTTGTAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCCGGCAGTGGCCGTGTCGAGGAAGATCATCG
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GATTTATGGAGATTGGCTTGATGATATGCCATTAGTGCACAACCTGCCAAGCCAAGTGGA
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GTTTCTTTTTTGATTTTTATTCTTATAGAGTATATGTTTTTGTTTAAGTCAGCAGGCAGT
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AAGTGCGTCCAATTGAATCATACTTGGTTTGCAATTGTCCAAATTCCTATTAATATTCAA
GTAAGCTTTGCTGTATCCTTTTGTTAGTACTTAAAGAAAAAGTTCAGTGTTTTTCATTTT
ATAATATTCTTATGTTTTTTGTATCTTCCAAAATGGAGAAGAGCTAGAGTAAATTATGAT
TCATTGCCTGCAGCATTTCCCATAGAATATTGTTGCTCTGAAAATTAAATGCCCGCAAGA
CTTATT
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>LITCHI020672.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TTTGAGTATTTGTCTTCACTATTAACACTTATAATTTAAGATTCCTTAGATGTAACTACT
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TTGAGGGTTAAGGCCTTAAGTTTTTCTCACTTTACTGCTGATTGCATGTCTTTTTCCTCA
CTTCACTGCTGACTGCATGTCTTTTTGGTTGTAATCCATGAAAATTTTATGAAGTACTTA
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ACAATAATATTTCACCTGATGAGTCACAAGAAGAACGACATTAATTAACGACACTCGCAA
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GTTGGAATTCGGATTACATTTCATTATTATTTTTCTTAACTCGTGTCTCTCTCTTTCAAA
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TCTCATTCAATCATTTATCTCCCCTCTTAAGCTACATGCTTCTCTTTTTTTAATGTGCTG
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TGCCCTTTTTTATGTAATTGTGGCCTCGCGAAATTGATCGAAACACTGTCCAAAGGATTG
AAAGTTGTGCGAAGATAATA
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>LITCHI020672.m1 GenomeSequence - 
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GAAGATCATAAGCTCATGAACTTCATTCTCAATAATGGCATTCACTGCTGGCGAATGGTT
CCCAAGCTTGCAGGTACGTATATACATATACATATTTCATGCATATTCGTTTGTACCTCT
CTCCTTCTGTCTCATTCTCCCACGCACACACAAATGATCACACACATAAATACGTGCAAA
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CTGTTGAGATGTGGGAAAAGTTGTAGACTAAGATGGATTAATTATCTACGACCAGACCTT
AAGAGAGGTGCCTTTACAGAAACGGAAGAGGACCAAATTATTCAGCTTCATTCCCTACTT
GGTAACAGGTAATGTATTGTTAATATATTATAAATTCAAGTTTTATATATTATAATTGAG
CTTTTTTATATCATAACTTAAATTTTTAGATTTGATGTAACTAACATATTCATTCAATTG
TTTTTTAAATTTTACATATAAATCTTTCACTTTTATATTTTGCTTCCGCGGCTATGACAC
ACAATCATTCATCAAATTCATGAAGTAAAATACGTTGTTAATTAAAAGATGCACTACAAA
AAGGTCATAAATTAATCACCACCGGCCTCTCATCTAATTTGCTAATGATATGAAATGTGG
CGACCAAATAATGCAATAATTAATGCAATATTACTGGCTAGATGCATTATTATTGTTTTT
GTAATATATATATTTTTTGCTAAAATACTTTGAATATTATTATTTATAAAAATTTATATT
TTGAATGTTTTGTAGGTGGTCAAAGATAGCTTCTCATTTTCCTGGTCGGACAGATAACGA
AATCAAGAACCATTGGAATACTCGAATCAAGAAGAGACTGAAGCTGCTGGGTGTGGACCC
CGTGACTCACAAACCCGTTGATAATGACCCAACAGAAAAATCTGATCATGATCAGAAAAT
TAATGAGACAAGTCTAGAGTCAAATTCACCAAAGGAATCCTCACAAGAGAACATTAGCTT
GGTGATAGAGTCTCATGATCATGATGATGACAATAATAATAATAACGATGTCAAGAAGGA
TGTTCCACGAACAGAAAATCAGAAAGTACAAGAAGAAGTGGAGTTGTTAAGCGTGGATGA
CGCAACAGATCTATTAAACAATTACGAGATGATGTGTGGAAATTTGGAGTTTGGATCCTG
GACGTTAAACCAAGAAAGCAACACCTCAACTTCTTGCAGCTCCTCGTTTTCTTGGGAGGA
ATCTAATCATCAAAACCCTACAATGGCTGAATCTCTCTCTCTCCAACAGTGGATTGATAA
TGTCGACTCTTTTCTCTCATGGGACTGCTTCAACCAACCTGAAGAAAATCTTTTCCTTCT
TGGAAAATAAAAAAGTTTTTTATTAGTATACAATATATATCATGATGATCATTGGAGCTT
TAAAAAAATTAGAAAATTTTATCAGATATATGATATATATATACACACACACATCGAGG