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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016630 | Chr1 | 38360160 | 38362182 | + | Protein kinase PINOID 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016630.m1 | 45 | 91 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 51.8 | 7.90E-14 |
LITCHI016630.m1 | 54 | 92 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 24.3 | 1.80E-05 |
LITCHI016630.m1 | 171 | 281 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 77.6 | 1.00E-21 |
LITCHI016630.m1 | 177 | 229 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 25.2 | 9.60E-06 |
LITCHI016630.m2 | 2 | 122 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 90.4 | 1.40E-25 |
LITCHI016630.m2 | 18 | 123 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 52.4 | 4.70E-14 |
LITCHI016630.m2 | 202 | 312 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 77.4 | 1.20E-21 |
LITCHI016630.m2 | 208 | 260 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 24.9 | 1.20E-05 |
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>LITCHI016630.m1 ATGCTGAGTTTGAGGCTTCTCATTACTCGTGTCTGGTTATGGAGTTCTGTCCAGGTGGAG ATTTGTATGCTGCTCGGCAGCGCCAGCCAGGAAAGCGCTTTAGCATCTCCTCTGCTAATT ATATGCATGAACAGGTTCTATGCTGCTGAGTCACTCTTAGCCCTAGAGTATCTCCACATG ATGGGTATAGTTTACAGAGATTTGAAGCCAGAAAATGTTCTAGTTAGAGAAGACGGGCAT ATAATGCTCTCGGATTTCGACCTTTCTCTCAAATGCGACGTTGTTCCAAAGCTTCTGAGG CCTAAAATCAAGTCGGAAGCCATTGAAAAGTATGAAAGATGTTCAATCCCTTCTTGTGCT ACACCCATGCAGCCAGTTCTATCATGTTTCTCATCCTCCATGAGAAAAAAGAAGGGTAAA GATAGGGTCATAACAACAATCACAGAACAAGCTGATGATAGTACTGAACAACTTGACCCC GAAATGGTGGCTGAGCCGATCAACGCTCGGTCCAAGTCCTTCGTGGGTACGCACGAGTAC TTGGCTCCGGAGGTGATATCAGGACAAGGCCATGGCAGCGCAGTGGATTGGTGGACTTTG GGGGTGTTTTTGTACGAAATGATTTATGGAAGAACACCATTCAAAGGCGAAACCAACGAG AAAACGCTCATCAACATCATTAAGCAGCCCTTGAGTTTTCCAAGAGTTGGTTTTAGTAGT AGCAAGGAATTTGAAGAGATGGTCAAAGCACAAGATCTTATAAGCAGGCTTTTGGTGAAG AATCCGAAGAAAAGAATAGGGAGTTTAAAGGGTTCTGTTGAGATCAAGAGGCATGAGTTC TTCAAGGGTGTGAATTGGGCATTGATCAGGTCCATTAAACCACCAGAAGTTCCAAATGAT CATCTGTCCAAGATTAGGAGCAAAGCTTATGTGCCCAAGTTGAGCAAGCAAGAGAGAGAC GCACCGTATCAGATACCTCATCATTTTGACTACTTCTAA >LITCHI016630.m2 ATGAAAGTGGTAGACAGAGAAGCACTCGCTATAAGGAAGAAGCTACATAGAGCTGACATG GAGAAGGAGATTCTAGCTCTGCTTGACCACCCTTTTTTACCAACTCTCTATGCTGAGTTT GAGGCTTCTCATTACTCGTGTCTGGTTATGGAGTTCTGTCCAGGTGGAGATTTGTATGCT GCTCGGCAGCGCCAGCCAGGAAAGCGCTTTAGCATCTCCTCTGCTAAGTTCTATGCTGCT GAGTCACTCTTAGCCCTAGAGTATCTCCACATGATGGGTATAGTTTACAGAGATTTGAAG CCAGAAAATGTTCTAGTTAGAGAAGACGGGCATATAATGCTCTCGGATTTCGACCTTTCT CTCAAATGCGACGTTGTTCCAAAGCTTCTGAGGCCTAAAATCAAGTCGGAAGCCATTGAA AAGTATGAAAGATGTTCAATCCCTTCTTGTGCTACACCCATGCAGCCAGTTCTATCATGT TTCTCATCCTCCATGAGAAAAAAGAAGGGTAAAGATAGGGTCATAACAACAATCACAGAA CAAGCTGATGATAGTACTGAACAACTTGACCCCGAAATGGTGGCTGAGCCGATCAACGCT CGGTCCAAGTCCTTCGTGGGTACGCACGAGTACTTGGCTCCGGAGGTGATATCAGGACAA GGCCATGGCAGCGCAGTGGATTGGTGGACTTTGGGGGTGTTTTTGTACGAAATGATTTAT GGAAGAACACCATTCAAAGGCGAAACCAACGAGAAAACGCTCATCAACATCATTAAGCAG CCCTTGAGTTTTCCAAGAGTTGGTTTTAGTAGTAGCAAGGAATTTGAAGAGATGGTCAAA GCACAAGATCTTATAAGCAGGCTTTTGGTGAAGAATCCGAAGAAAAGAATAGGGAGTTTA AAGGGTTCTGTTGAGATCAAGAGGCATGAGTTCTTCAAGGGTGTGAATTGGGCATTGATC AGGTCCATTAAACCACCAGAAGTTCCAAATGATCATCTGTCCAAGATTAGGAGCAAAGCT TATGTGCCCAAGTTGAGCAAGCAAGAGAGAGACGCACCGTATCAGATACCTCATCATTTT GACTACTTCTAA
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>LITCHI016794.m1 MSMQVEHDYIGLSLEVPCMENSGLNLKATELRLGLPGSESPERGDTTDEGTAVVLSLKTL SASGAKRGYSDAIDRKWVFSADGSDAALFSPADTNAANSDSVVKEASPPQSPKPQEKKPH GSGPSKAQVVGWPPIRSFRKNTMSSHSAKNDDDSEAKLGLGCLYVKVSMDGAPYLRKVDL KTYGSYMELSSALEKMFSCFTIGQCGSHNVPSRDGLSESRLMDLLHGSEYVLTYEDKDGD WMLVGDVPWDMFTNSCKRLRIMKSSEAIGLAPRAMEKCRNRN. >LITCHI016794.m2 MSMQVEHDYIGLSLEVPCMENSGLNLKATELRLGLPGSESPERGDTTDEGTAVVLSLKTL SASGAKRGYSDAIDRKWVFSADGSDAALFSPADTNAANSDSVVKEASPPQSPKPQEKKPH GSGPSKAQVVGWPPIRSFRKNTMSSHSAKNDDDSEAKLGLGCLYVKVSMDGAPYLRKVDL KTYGSYMELSSALEKMFSCFTIGQCGSHNVPSRDGLSESRLMDLLHGSEYVLTYEDKDGD WMLVGDVPWE. >LITCHI016794.m3 MSMQVEHDYIGLSLEVPCMENSGLNLKATELRLGLPGSESPERGDTTDEGTAVVLSLKTL SASGAKRGYSDAIDRKWVFSADGSDAALFSPADTNAANSDSVVKEASPPQSPKPQEKKPH GSGPSKAQVVGWPPIRSFRKNTMSSHSAKNDDDSEAKLGLGCLYVKVSMDGAPYLRKVDL KTYGSYMELSSALEKMFSCFTIGKISM. >LITCHI016794.m4 MSMQVEHDYIGLSLEVPCMENSGLNLKATELRLGLPGSESPERGDTTDEGTAVVLSLKTL SASGAKRGYSDAIDRKWVFSADGSDAALFSPADTNAANSDSVVKEASPPQSPKPQEKKPH GSGPSKAQVVGWPPIRSFRKNTMSSHSAKNDDDSEAKLGLGCLYVKVSMDGAPYLRKVDL KTYGSYMELSSALEKMFSCFTIGKISM.
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>LITCHI016794.m4 AATTATCCACGTACTAATAGAACATTTTAAAAAATTATTCATATTTACGATGAGGGCATT CGAATCCAGCCATTTGTTAGAAAGAAGCAAAATGTGGAGAAAAGAGAAATAAAGAAATGG AGAAGAGAGAGTGAGTAGTGTGATGTGTGCGAGACTCTGAGTGTGAGGTGTGGTGGAGAA TCAGAGACAAAGATTTCTTTTCAGTTAATCCCAACTGCCGTTTTCCCTCGTGTCAGCTTT CCTCACTTTCTAGGGCTTATCACTCATTTTCCTTTTACATATAACTTTTTCCCACAATCC AAACACCAAATCGGCCAAGATATATCTCTCTAGTACACACCCCCAAGTGAACCCATTTCT TCTCTTCAAAATCCGAGCTAATTTGGCCTCTCAAAACAGTCCTTTCGTTTTCAAATCAAA ATCTCCTCTGGTGCATCTTAGCAACACCTGTCCATCTCAACCCCACCGGCCCGCGCATTA TAGCCTTCTTTATTAGAAAAATAAAATAAAACAAAGGGCAGTATCGGAAAGTTTGCCGGG GACTTTTTGTGACTTGTCGGAGTGGTTGCCCACAAAAAGTTGTCCATCATAATAAAATCA TTTTTATTTTTACTAAAAACAGTTGCTACTTGTGTTGTTGTGTTTACAAGCACACTGTGA TTTCAACAATATTCTCAGATACAATTTATTTCGTCTTCTGAGTTACACGTACTAGAGACG GAAACAGAAGAAAGAGAGAAGCTTCTGTGTTTTGCTTCAACCACATACCACATACATATC TCATGCTTTTCTGAGCTATTTTTGATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTG TCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAAAACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGA CTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCACCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCA 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TTTTTATTTTTACTAAAAACAGTTGCTACTTGTGTTGTTGTGTTTACAAGCACACTGTGA TTTCAACAATATTCTCAGATACAATTTATTTCGTCTTCTGAGTTACACGTACTAGAGACG GAAACAGAAGAAAGAGAGAAGCTTCTGTGTTTTGCTTCAACCACATACCACATACATATC TCATGCTTTTCTGAGCTATTTTTGATGTCTATGCAAGTTGAGCATGATTACATAGGCTTG TCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAAAACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGA CTCGGCTTACCCGGCTCCGAGTCACCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCA GTCGTTCTCTCACTCAAGACCCTTTCTGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACTCTGATGCC ATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCTGCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCT GATACCAATGCTGCCAACTCGGATTCCGTTGTCAAAGAGGCTTCTCCTCCTCAGTCACCA AAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCATGGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGG CCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAGAATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGAT GATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTGGGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGACGGTGCC CCATATCTGCGGAAAGTTGATCTCAAAACATATGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCT CTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTTACAATTGGTAAAATCTCTATGTAGTAAACCAACCCA CCAATCGCTACAACTCTTTTTCTGTGTATGCGCACATTTTTCATTCCACTGATTGTGCTA ACAAATTTCTTCATTAATTCTGTTCTAGTGGATTTCATCAAAATCACATTGGCCTGTGCT 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