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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016589 | Chr1 | 37717736 | 37720011 | + | Auxin-responsive protein IAA29 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016589.m1 | 2 | 194 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 78.2 | 9.20E-22 |
LITCHI016589.m1 | 200 | 238 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 47.9 | 1.70E-12 |
LITCHI016589.m2 | 2 | 193 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 79 | 5.20E-22 |
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>LITCHI016589.m1 ATGGAGCTTCAACTGGGTCTTGCTCTTCCAACTCATGCTGCGGTCAATGGCTTCGACCTT AATAGCTATGTTCACGAGCCTAAGGATACTGTGGGTTCACACCCGTCTTGGAACACTCTT GATTTTGCATTTTTGCCTACCAAGTGTCCTACCACTACTACAAATACTGACATTTTCACC GACGCCAAAAAACGTAGCTTTGATGAGGCTTTTGATCAGGTCAGAGTCGTGCCACCAACA CTCCCATTGTTGCACTGGACCAACCAGCCTAATGATGAAGATGACCCCAAAGACCTCGAC AACAACTCTTCTTTTTCCACTAACAAGATCAGTGACGAAGATGATGTAGTGGGGTGGCCA CCAATTAAGAACTTAAGGAAAAAACATAGACAGCAACATCATGGGGATCGAGCTGCCAAG AACAATCAGACATCGGAGAATGGATTTGGTTGTGGCTTTAGGCAATCCAATTCCATGTTC GTTAAGGTGAAGATGGAAGGAGTGGCCATAGCCAGGAAAATTGACCTAAGTCTCCATGAT TCTTTTCAAACGCTCACAACCACTTTGATTTCCATGTTTGGCTTATGGCACGAGGATTCC AATGGTTATGCACTCACTTATCAAGATAAAGAAGGAGATTGGCTAGTTGCACAGGATGTG CCCTGGAGAGCTTTCATTAGCACAGTGCAACGCCTCCAGTTGTTGAAAAGAAGCGGCAGA TTGATTTCAGGATCTTGA >LITCHI016589.m2 ATGGAGCTTCAACTGGGTCTTGCTCTTCCAACTCATGCTGCGGTCAATGGCTTCGACCTT AATAGCTATGTTCACGAGCCTAAGGATACTGTGGGTTCACACCCGTCTTGGAACACTCTT GATTTTGCATTTTTGCCTACCAAGTGTCCTACCACTACTACAAATACTGACATTTTCACC GACGCCAAAAAACGTAGCTTTGATGAGGCTTTTGATCAGGTCAGAGTCGTGCCACCAACA CTCCCATTGTTGCACTGGACCAACCAGCCTAATGATGAAGATGACCCCAAAGACCTCGAC AACAACTCTTCTTTTTCCACTAACAAGATCAGTGACGAAGATGATGTAGTGGGGTGGCCA CCAATTAAGAACTTAAGGAAAAAACATAGACAGCAACATCATGGGGATCGAGCTGCCAAG AACAATCAGACATCGGAGAATGGATTTGGTTGTGGCTTTAGGCAATCCAATTCCATGTTC GTTAAGGTGAAGATGGAAGGAGTGGCCATAGCCAGGAAAATTGACCTAAGTCTCCATGAT TCTTTTCAAACGCTCACAACCACTTTGATTTCCATGTTTGGCTTATGTAAGTAG >LITCHI016589.m3 ATGGAGCTTCAACTGGGTCTTGCTCTTCCAACTCATGCTGCGGTCAATGGCTTCGACCTT AATAGCTATGTTCACGAGCCTAAGGATACTGTGGGTTCACACCCGTCTTGGAACACTCTT GATTTTGCATTTTTGCCTACCAAGTGTCCTACCACTACTACAAATACTGACATTTTCACC GACGCCAAAAAACGTAGCTTTGATGAGGCTTTTGATCAGGTCAGAGTCGTGCCACCAACA CTCCCATTGTTGCACTGGACCAACCAGCCTAATGATGAAGATGACCCCAAAGACCTCGAC AACAACTCTTCTTTTTCCACTAACAAGTACTCTTCTTCTTGTTCCCTTTTTTCACTTTCT CTGTTTTGGCTGCAAATTCGATCATTGTTGGCATTTTCAGGATCAGTGACGAAGATGATG TAG
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>LITCHI016589.m1 GenomeSequence + GGTAAATAACTTAAAAACAAAAAGAGAAAAGACGAGGCAACAGGTGGGTGGGCGAGGTGC GCGTGGAAAGATATGAAAAACACAGGAGAGCAGGGTGTTGGGAACAGAAAACAATGAGCA AGTGAGAAGGAAACAAGGACAGCAACTGGGTCGGCAAAAAGTTAAGCAATGACACGGACG ACCTTTACACTATGTTGCCTGTCCCCTTAGCCCTTGTCTCCTTACCCGCCCACCACGCCT CCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTTTCACTTATATTCTCTTACTC CTACTTATACACTTTGTTACAAGAAACCCAGATCACTTCAACTCCGACTTCTCTCGACCT TGTTTCCTTGGTTTTTGTTTATTCGTTAGGCAATCTTTGTTTTTGTTTGTTGTTGTTGGA TGACATAGATGGAGCTTCAACTGGGTCTTGCTCTTCCAACTCATGCTGCGGTCAATGGCT TCGACCTTAATAGCTATGTTCACGAGCCTAAGGATACTGTGGGTTCACACCCGTCTTGGA ACACTCTTGATTTTGCATTTTTGCCTACCAAGTGTCCTACCACTACTACAAATACTGACA TTTTCACCGACGCCAAAAAACGTAGCTTTGATGAGGCTTTTGATCAGGTCAGAGTCGTGC CACCAACACTCCCATTGTTGCACTGGACCAACCAGCCTAATGATGAAGATGACCCCAAAG ACCTCGACAACAACTCTTCTTTTTCCACTAACAAGTACTCTTCTTCTTGTTCCCTTTTTT CACTTTCTCTGTTTTGGCTGCAAATTCGATCATTGTTGGCATTTTCAGGATCAGTGACGA AGATGATGTAGTGGGGTGGCCACCAATTAAGAACTTAAGGAAAAAACATAGACAGCAACA 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