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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016490 | Chr1 | 36468942 | 36480273 | - | U-box domain-containing protein 52 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016490.m1 | 14 | 154 | PF00582.29 | Usp | Domain | 33.6 | 5.50E-08 |
LITCHI016490.m1 | 466 | 719 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 137.8 | 4.40E-40 |
LITCHI016490.m1 | 468 | 721 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 126 | 1.70E-36 |
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>LITCHI016490.m1 ATGGCTAAAAGAACTAATGGAGAAAATAAGCGTGTTGATATAGCAGTGGCAATAGACAAG GACAAAGGAAGCCAATTTGCTTTGAAATGGACAGTTGATCATCTTCTGTCCAAAGGAAAG CCTCTCACTCTTGTTCATGTCAAACAAAAACTATCTTCTCTTCCCACCCCTTCTGGAAAT GCTGTTGCTATCTCGAATGTTAACGAAAACGTTGCTAGAGCATATAAACAACAACTTGAT AGTCAAATCAGGGAGATGTTCCTTCCATTTCATTGCTTTTGCACCCAGAGAGATATAAAA TGCAATGAAGTGATACTGGAAGACACAAATATAGCCAAAGCTTTAATCGATTATGTTGCA TCGAATGCAATTACAACATTAGTACTGGCAGCAACAAGGACTGGCTTTGTCAGAAGATTC AAAACCACAGACATACCAAGTAGCGTTTCTAAAGGGGCACCAGAATACTGCAATGTTTAT GTCATCGCAAAAGGAAAGATCGCCTCTGTGCGGCCAGCCACTGCTCCAGCACCTGTAAAA GCTTCTGTTTGTAATCAATTGCAAAGCCAACGCAGCCAGAATATTCCACATCTGACTGAA GCTCCTTATATAAATAACCAGAGACTCAGAGCACCTGCGAGGACACCGCCTCCAGTGCAG AACCTGCAAGAAGACATGGAATTCCAATCACCATTCACAAGCGGAAGACCTTCTGTCCCT AAATATGAGCCTTCAAGGCCAGAATCAGACATATCATATGTGAGCAGTGGAAGACCAAGC ATTGATAGCTTGTTTCCTTCTTTCAATAACCATATGGACTATTCTGAATCAAACCCTCAG CTTCCAAACAGTTCAGATTGCAACAACACAAGTTTTCCATCATTGCATTCAGGAACCACC AAGTCAGTAGATTTCACTTCTTCACATTATGAATTGTCATCAAGCTCGCGGGAAAATGGG AACATGCCATCAACATCACCTAGCCAGAACTTGGAAGATGTAGAAGCTGAGATGAGAAGG CTGAGGCTAGAGCTGAAACAAACAATGGACATGTACAGTGCAGCCTGCAAGGAAGCACTC ACAGCAAAACAGAAGGCTAGGGAGCTTCTCCACTGGAGATTAGAAGAAGAACGGAAATTG GAAGAGGCACGACTAGCTGAGGAAGCAGCATTGGCACTTGTAGAAAAGGAGAAAACAAAG TGTAAGGCGGCCATTGAGGCAGCTGAAGCAGCTCAGAGGATTGCTGAACTAGAAGCTCAA AAGAGGAAGAATGCAGAACTGAAAGCCCAGAAAGAAGCTGAAGAGAAGAAGAAGGCACTA AGCGCTTTGAAGCATGGTGACCCCAGGTATAGAAGATATACAATAGAGGAGATTGAAGAA GCAACAGAGTACTTCTCAGACTCTCGCAAGATAGGAGAAGGAGGTTATGGACCAGTTTAC AAGTGTTACCTGGATCATACGCCTGTGGCAATAAAAGTTCTAAGTCCAGATGCAGCTCAA GGACGATCACAATTTCAGCAGGAGGTTGAAGTATTATGCGCCATACGGCATCCAAACATG GTTCTCCTTCTGGGAGCTTGCCCAGAGTATGGTTGTCTAGTCTATGAGTACATGGATAAC GGTAGCTTAGAAGATCGTCTGTTCTGTCGAAATGGCACTCCAGCTCTTCCTTGGCAGTTA AGATTCAGAATTGCTGCAGAAATTGGCACTGGCCTCCTTTTCCTTCACCAAACCAAACCA GAACCACTTGTGCACCGTGACTTAAAACCAGGAAACATCTTGCTTGATCGTAACTATGTC AGCAAGATTAGTGATGTTGGGTTGGCCAGGCTGGTCCCTCCATCAGTAGCCAACTCTGTG ACTCAGTATCGCATGACATCAACAGCTGGAACATTCTGTTACATTGACCCAGAGTATCAG CAAACAGGCATGCTTGGAGTAAAATCTGATATTTACTCACTTGGAATTATGCTTCTCCAA ATAATAACAGCCAAGCCACCAATGGGCTTGACACATCAAGTAGAGCGAGCTATTGAGAAT GGGACTTTTGCTGAAATTCTAGACCCAGATGTTCCTGACTGGCCAGTTGAAGAGGCATTA GGATTTGCCAAGCTAGCTCTTCAGTGCGCTGAACTGAGACGAAAAGACAGACCAGATCTT GGCAGCGTTCTACTACCTGAGCTTAACAGATTAAGAGCACTAGCTGAAGAAACAATGCCC AACATCAATATTCTAGGCGAGGCAGGACCCTATTCAAGTCACAGTCAAGTTTCATCAACT CAAGATTTGATAAGTGATTCCCCATCACTTCAATCAGGGTATGATAGCTCAAGGAGCCGT ACAAGCACACCTTCTGCAGGAAGAAGAAATTGA
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>LITCHI016490.m1 MAKRTNGENKRVDIAVAIDKDKGSQFALKWTVDHLLSKGKPLTLVHVKQKLSSLPTPSGN AVAISNVNENVARAYKQQLDSQIREMFLPFHCFCTQRDIKCNEVILEDTNIAKALIDYVA SNAITTLVLAATRTGFVRRFKTTDIPSSVSKGAPEYCNVYVIAKGKIASVRPATAPAPVK ASVCNQLQSQRSQNIPHLTEAPYINNQRLRAPARTPPPVQNLQEDMEFQSPFTSGRPSVP KYEPSRPESDISYVSSGRPSIDSLFPSFNNHMDYSESNPQLPNSSDCNNTSFPSLHSGTT KSVDFTSSHYELSSSSRENGNMPSTSPSQNLEDVEAEMRRLRLELKQTMDMYSAACKEAL TAKQKARELLHWRLEEERKLEEARLAEEAALALVEKEKTKCKAAIEAAEAAQRIAELEAQ KRKNAELKAQKEAEEKKKALSALKHGDPRYRRYTIEEIEEATEYFSDSRKIGEGGYGPVY KCYLDHTPVAIKVLSPDAAQGRSQFQQEVEVLCAIRHPNMVLLLGACPEYGCLVYEYMDN GSLEDRLFCRNGTPALPWQLRFRIAAEIGTGLLFLHQTKPEPLVHRDLKPGNILLDRNYV SKISDVGLARLVPPSVANSVTQYRMTSTAGTFCYIDPEYQQTGMLGVKSDIYSLGIMLLQ IITAKPPMGLTHQVERAIENGTFAEILDPDVPDWPVEEALGFAKLALQCAELRRKDRPDL GSVLLPELNRLRALAEETMPNINILGEAGPYSSHSQVSSTQDLISDSPSLQSGYDSSRSR TSTPSAGRRN.
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>LITCHI016490.m1 GTCCATGCCTATAAGTAACATATGAAGTGACAAAAGTGCCCCCCTAATAGATTATTGAGA AACAAACAAATGAAACAAAGAGAGGAGGCCAATAAATGTTGTCTTTTAGAATAACCACCT GCCAGTAATGATGGAAACAGCTTCCTTAACAGAAGTTTCAAGAAGTTGGTTTATTATTTT TAGCCACAACGAAGAGAATTGTTTAAAAGGGTCTGCAGAAGCAGTTAAAATGAGAAACCT ATATCCACATTTGAGGTCAGTTTTCAGGAAGAGCAAGTAACAATAGACAGTTGGGTTAGT TTCTGATGTGTTTTAAACGAGACATTGTTACTTTTAGAGTCATGTTAATTTGGAGCTTCA ATTTTTTTGATCTGAGAGATTGAAAGAAAAGAAATGGCTAAAAGAACTAATGGAGAAAAT AAGCGTGTTGATATAGCAGTGGCAATAGACAAGGACAAAGGAAGCCAATTTGCTTTGAAA TGGACAGTTGATCATCTTCTGTCCAAAGGAAAGCCTCTCACTCTTGTTCATGTCAAACAA AAACTATCTTCTCTTCCCACCCCTTCTGGAAATGCTGTTGCTATCTCGAATGTTAACGAA AACGTTGCTAGAGCATATAAACAACAACTTGATAGTCAAATCAGGGAGATGTTCCTTCCA TTTCATTGCTTTTGCACCCAGAGAGATATAAAATGCAATGAAGTGATACTGGAAGACACA AATATAGCCAAAGCTTTAATCGATTATGTTGCATCGAATGCAATTACAACATTAGTACTG GCAGCAACAAGGACTGGCTTTGTCAGAAGATTCAAAACCACAGACATACCAAGTAGCGTT TCTAAAGGGGCACCAGAATACTGCAATGTTTATGTCATCGCAAAAGGAAAGATCGCCTCT GTGCGGCCAGCCACTGCTCCAGCACCTGTAAAAGCTTCTGTTTGTAATCAATTGCAAAGC 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>LITCHI016490.m1 - Up_Stream_Len 2000 AACTTTTATATTTATGTGATTAAATTTATTTGTTTTGTTTTAGATTTATGTTTATTTTCA ACACGATTTTCAATATTTTCTTGAAATATTTATTTTGTTGGACATAGTAAGGACTAAGGA GGTCTTGTGGATACCATTAAGTACCAATGAGCTTCTTCCGCAAAAGCTTGTGAGGAGATG TTTGGGCTGTTGGGTTTCTACGCTATTGCCATTCATATGTCCGCTCTTCTGAGGCTTGAT CTTGTAGAATTTCCCGTGGAGAAGCTAGTTTTCTTGTTGATGATGTTAAGACTCTATGTA AAGAGATTGGTGTTTATGTCAGACTATCTCTAGAAACAAGAATCGTTTGACACATAATTT AGCTTCCTTGATCTTTGTCGGTTCGGAGGTTCTGAGTTGGCATTTTGTCGTTGAGGATTG TATCTTCCGGTTTATAAAATGTTTCTCGAGTTCAAAATAATAATAATAATAATAATAATA ATAGCCACTCAACTTTTATGTTGAACATAAAACTGTTATAACTAGCTGATTAAAGGTGCA ACATTAGGAACAGACTTTCAAATTAAAATTCTTTATAACTGTGATATGTTATATATGTCA CGCCAACTGTCATACAAAATAATTACAAATTATAACCTAATATAATTACCAAATATATGC TAATACCACAAATATAAAATATTGTTAACTAAATAAATTACAAACTAATTACTAATATAT TCTTGACACTAGTTATATATATGATAATTATTTAAAATATAATAACAATATATATATTTT TATTTTATTAATGTGATATTTAAAATAAAAATTACATTCAAATATTGATTGCATAAGAAT ATTATAGTCTAGTACGATTCGATACAATGCATTGTAATCCACAATACAATCCAATGCAAC AAAATACAACGTACAAAAGCAACCTCAATATGAATTTCCAGCCTGCACTATATATATAAT GTTTTTATAATTAGTATCTCTTAACTTTAAAAAATTAGAACAAACTAATTAAATTCATTT ATTGTATTTGAATTAAATCGGAGAGAGAATTTGTTTTAGGAAAGAGAATGCAATGGATGA ATTAAATTGATTCACCCTAACTTTTTAAAGCTTAAAGTATTGATAATAAAAGCACTATAT ATAAATGGACTACCAAAAGAAAGTCTCTTTTGTATATAACTTTTACATTTAATAATTGAA TAATATTACATTTTTCAAATATTTTACTTAAATGATGTGGTATGTGAGTTATAATATTAT ATAATTCATTATGATAATGTATGTAATAATCATATATTAAATTTAGAAGTTACAAAAGTA AAGAAAAAGGGAAAGGTATAACATAAATTCGATCACTTGAAAAATTAAAATTTTATTATG GTCAAATTCGGTTTTAAAATAAAATAAAATTTCTGTTACTAATTTTCTATTTTGCCTTTA CATATATAAATTACAAGTAATGCTATAAATCTCATCTTTTATATCTAACTTATGATAAAG AATACATTTTGTAAGTAAAATAAATAATTATTAATGAATGTTTATTTATCCATTGATAAA TTATAAGTTAAAATATAAAAGATGAAATATGTAATATTACTCATAAAGTCCATGCCTATA AGTAACATATGAAGTGACAAAAGTGCCCCCCTAATAGATTATTGAGAAACAAACAAATGA AACAAAGAGAGGAGGCCAATAAATGTTGTCTTTTAGAATAACCACCTGCCAGTAATGATG GAAACAGCTTCCTTAACAGAAGTTTCAAGAAGTTGGTTTATTATTTTTAGCCACAACGAA GAGAATTGTTTAAAAGGGTCTGCAGAAGCAGTTAAAATGAGAAACCTATATCCACATTTG AGGTCAGTTTTCAGGAAGAGCAAGTAACAATAGACAGTTGGGTTAGTTTCTGATGTGTTT TAAACGAGACATTGTTACTTTTAGAGTCATGTTAATTTGGAGCTTCAATTTTTTTGATCT GAGAGATTGAAAGAAAAGAA
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>LITCHI016490.m1 GenomeSequence - GTCCATGCCTATAAGTAACATATGAAGTGACAAAAGTGCCCCCCTAATAGATTATTGAGA AACAAACAAATGAAACAAAGAGAGGAGGCCAATAAATGTTGTCTTTTAGAATAACCACCT GCCAGTAATGATGGAAACAGCTTCCTTAACAGAAGTTTCAAGAAGTTGGTTTATTATTTT TAGCCACAACGAAGAGAATTGTTTAAAAGGGTCTGCAGAAGCAGTTAAAATGAGAAACCT ATATCCACATTTGAGGTCAGTTTTCAGGAAGAGCAAGTAACAATAGACAGTTGGGTTAGT TTCTGATGTGTTTTAAACGAGACATTGTTACTTTTAGAGTCATGTTAATTTGGAGCTTCA ATTTTTTTGATCTGAGAGATTGAAAGAAAAGAAATGGCTAAAAGAACTAATGGAGAAAAT AAGCGTGTTGATATAGCAGTGGCAATAGACAAGGACAAAGGAAGCCAATTTGCTTTGAAA TGGACAGTTGATCATCTTCTGTCCAAAGGAAAGCCTCTCACTCTTGTTCATGTCAAACAA AAACTATCTTCTCTTCCCACCCCTTGTATGATCTAATACTCATCTGTTTTTCATTTTCTG TATTGATTTCAAGTTTACTGATAGATGTATCATCATACATGTGCAGCTGGAAATGCTGTT GCTATCTCGAATGTTAACGAAAACGTTGCTAGAGCATATAAACAACAACTTGATAGTCAA ATCAGGGAGATGTTCCTTCCATTTCATTGCTTTTGCACCCAGAGAGATGTAAGTTTTGCT TCTATCATTCTTACCCTTTTCTGCTATTCTTCTGGTAAATACTGGTTTTGCCCCTCCGAG CAGTTTTAGAGAAACATAATTTATCCAAACATAAGTGTACTTAATTTCATATCAATACAA 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