Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI016483Chr13638933936392099+Homeobox-leucine zipper protein HAT22

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI016483.m190144PF00046.32HomeodomainDomain58.35.50E-16
LITCHI016483.m1146177PF02183.21HALZCoiled-coil33.73.30E-08
Download   Copy
>LITCHI016483.m1
ATGGAGGATGAACACTGCAACATAGGGCTTGGCCTAGGCCTTGGTTTCGGTGACTACGTG
GCGGCAAGCCGCAGCGAGAGAGCGAAGGCTAATAACAATAACAAGTCTACGGACTGCAAC
TTGGACTTGTCATTTACTCTATTCACTAAAGAAGAAAGCCTGGATCGAGATCATTTTAAG
AAGCATAAGCAGACGTCGATGGTAAAAGATCAAGACCATGTGATTAATAACTGCGATTAT
TCCAATATCAATAAGAATTATACTGGGAGAAAGAAACTCAGGCTCACAAAACAGCAATCA
ACCTTGCTTGAGGACAGCTTTAAATTGCATACCACCCTTAATCAGTCCCAGAAACAGGCT
CTTGCTGAGCGACTGAATCTGAAACCTAGACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGGAGA
GCAAGGACAAAGTTGAAACAAACAGAAGTAGATTGTGAATTCTTGAAGAAATGTTGTGAA
AGTTTAAGCGATGAGAACAAGAGATTGAAGAAAGAAGTGGAAGAATTACAATATCTAAAA
GGAGGAGGAGGATCACCATTATTTATTCAACTTCCTAAGCTAGCAGCTGCAATGTGCCCT
TCCTGCTATGACAAAATTATGAAAACAATGCAAGATAAAGGTTGCGGCCGTTATTGA
Download   Copy
>LITCHI016483.m1
MEDEHCNIGLGLGLGFGDYVAASRSERAKANNNNKSTDCNLDLSFTLFTKEESLDRDHFK
KHKQTSMVKDQDHVINNCDYSNINKNYTGRKKLRLTKQQSTLLEDSFKLHTTLNQSQKQA
LAERLNLKPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCESLSDENKRLKKEVEELQYLK
GGGGSPLFIQLPKLAAAMCPSCYDKIMKTMQDKGCGRY.
Download   Copy
>LITCHI016483.m1
ATGGAGGATGAACACTGCAACATAGGGCTTGGCCTAGGCCTTGGTTTCGGTGACTACGTG
GCGGCAAGCCGCAGCGAGAGAGCGAAGGCTAATAACAATAACAAGTCTACGGACTGCAAC
TTGGACTTGTCATTTACTCTATTCACTAAAGAAGAAAGCCTGGATCGAGATCATTTTAAG
AAGCATAAGCAGACGTCGATGGTAAAAGATCAAGACCATGTGATTAATAACTGCGATTAT
TCCAATATCAATAAGAATTATACTGGGAGAAAGAAACTCAGGCTCACAAAACAGCAATCA
ACCTTGCTTGAGGACAGCTTTAAATTGCATACCACCCTTAATCAGTCCCAGAAACAGGCT
CTTGCTGAGCGACTGAATCTGAAACCTAGACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGGAGA
GCAAGGACAAAGTTGAAACAAACAGAAGTAGATTGTGAATTCTTGAAGAAATGTTGTGAA
AGTTTAAGCGATGAGAACAAGAGATTGAAGAAAGAAGTGGAAGAATTACAATATCTAAAA
GGAGGAGGAGGATCACCATTATTTATTCAACTTCCTAAGCTAGCAGCTGCAATGTGCCCT
TCCTGCTATGACAAAATTATGAAAACAATGCAAGATAAAGGTTGCGGCCGTTATTGATGT
GGTCCTTAACAACAATAAATGGCATAGCGGCTACAACTAAACATAATTTTATTAGGATTA
ATAGCTTTAAGCTAGCTTGGGAACACTTATTATTGTATATCCAGTCTATATCAAATTAAT
TAAGTAGTACTGTTGGTTACTTTCTTACAAGGAACGTTTTCAGTGCCATTTCACTACCCT
AGTATTTTGCAAAAATGGTAAACGTTGGTCTAATTAAATTAAATTCTATTATATAAATAT
TGTCTTCAAAGATACATTGAT
Download   Copy
>LITCHI016483.m1 +  Up_Stream_Len 2000
AAAATTCAATTTCATTAGCATTTATGCGAAAAGGTGCATTTAAAATGTGTTCAAGCCTAA
GGCCTACTGCAAACTTGGGCTTGTCAACCTAAGACAAACTAATAAGAATTTACAATTCCA
AAACATTTCATAAAAGAGAAGGTCAATGGCCCAGTTGATAAGACCATTGACTCTTGTGCC
TTCTACTTTAAAAGCAAGTCTCCCACCATATAAAAATGAATGAGTTGTTCTCTTACTTTA
TATATATCATCCTCTTCATCTATGTGTGAGTTGTTCTCTCTAATATGGGAGTCATTCTCT
TAACCGTATCATAGAATAAAAAACAAACCTTGTTTAGTCTCGACTGATTTCTAGACTTGT
TCCAACTAATAAAAAAAATAATAATAATAATAGAAAGGACGACAGTTGACATATAAAAAC
AAATATCAAGAAAGTTGCAATTCCTTCAAATCCATTAAGGGTGTTAATCTTTCTGTTTGC
CTTACCATAAAAATTGTACCTAAGTAGAGCAGTGCTGCTAAAACCTGCTTAAAGATCGAG
GTGTTGCAAGAAAGCTGTAACTCATTCCATCTTCTTCTCGTCTTTCTGCTCCTCTTCTTC
TTCTTCTCATCTTTACCCTCTTACCTCTTATTCTTTCCAGCATCTCTCACTAGGCAGAGG
CCATAATCAAACTTGGAGGCTATTTTTTAAGCTTTTAATTGTGAAAAGATATTAAAGGTA
TTTGGGTCCCAAAAATGGATTAAGGTTACTTATGAAATTTTTCAAAAATAAGGCTAATTT
TGAATTTTTTTTTCAATCCAAAGTAATTAAACAAAACAATCATCATTTTTTTTTTTCTTT
TTTGATACAACAAGACAATCATCTTTAATATGAAATCAATGAGCATAAGGATTAAACTTT
GAAGAAAATGAATTATTCAAGTAACACTTGCCTTTATTACTTTTCCCAAACCGTTGCATG
ATAAAGGAAATAATAAAGAGCTATTTGTGATCTAGATAGCAGCTTCGATGATTTATATTT
ATATATTTATTTTTTTGTGACTCTTCAGGGGAGAAAGAGAATTCGATTTATACTTGAAGA
AAGAGAAAGTAAGAAGAAAGAGAGAGTTACGATCATTTTTCACTAAGGGTAAAAGTGATA
GTTTACAATTTTAACTTCAATTAAAACTCAAAATATTGATTTAGCTATAGTTAAAGAAGC
TGTCTCACTTATATTATTTCACATGATTTTTAGCATTTTTATTTAGGTTAAAAGGTTAAA
TTAATAATAAATCAGCAATACCCACTACAAAAGCTCAAGTAATAAAAGAAATCACTTTCC
TTGTATAAGAAAAATCGTCAGTTCGATAGAATGCTATACTATAATATTTGATAATAATGC
ATTACATCCATAGTTTATTCACAATCATTTTAATTGTTTCCATTATAACAATTATAATTT
ACAGTTTCTCTAGAATTAGAAATATACATATATGATACATTTTTCATCAAGCAAAACAAA
TTGTCTAAACGTCATGAGAATGTAATCATCAATCAGTCCAAATAAAGCGTTTGCGAAGAT
GTCCCTACACTTCCATTAGTGTTTGGTCCGGTTGATAAAGGACTAAAAACTTTCTACAAA
AATTAATTAGCATCATCCCGTAGAAATATTAGCCAATACAGTAAGAGTCAAACGTGGTGT
AATTGTCATGGTATTAAATACTTTTGGTCTCCGGAAAGAGTCACAATTGTAACGGGTGCC
TTAATTCTCTTTTCATCTACTTGAAAACTTGTAGTTTGAAAATAAAAGCATTATAATAAC
TAAATGTTAATAATCAATTATAATTAATCAAGAGTTTATAATATTGATAACTGATTAAAC
AATGAATCCCTTTATTATTTATTAATTATATACATACATATATCTCTCTCTTTCCTCTAT
AAAACCTTCCCATCACTCCCTACTTTTCAGTTCTCAATTATATTCTCTTCTCGTTTCTTC
TCTTTCTCCTTCTCTTTCTC
Download   Copy
>LITCHI016483.m1 GenomeSequence + 
ATGGAGGATGAACACTGCAACATAGGGCTTGGCCTAGGCCTTGGTTTCGGTGACTACGTG
GCGGCAAGCCGCAGCGAGAGAGCGAAGGCTAATAACAATAACAAGTCTACGGACTGCAAC
TTGGACTTGTCATTTACTCTATTCACTAAAGAAGAAAGCCTGGATCGAGATCATTTTAAG
AAGCATAAGCAGACGTCGATGGTAAAAGATCAAGACCATGTGATTAATAACTGCGATTAT
TCCAATATCAATAAGAATTATACTGGGAGAAAGAAACTCAGGCTCACAAAACAGCAATCA
ACCTTGCTTGAGGACAGCTTTAAATTGCATACCACCCTTAATCAGGTATTTTTCACTATT
TTTATTATTTTTTTTTCCTTCTCTTTTTTGGTAGGCAAATTAATCTCATTTGGTCACTGA
GTATCAGAGTTGAGTGATTAAGTCTTGCTGTTAAGAGTAATCGTCAAAAGTATGTTATTA
ATCAATATGAGGGCTTTTTTCAAATATATATATATATATATATATATATATAAAAAAAAA
AATGAGGTTTTTTTTAAAAAAAAATAAAAATAAAAAAAGAAGAAAACACATGAGTTTTCA
AATGAAAAACAAAGTAAATTATTTTTTCAGTATTATTAATGTTCCCAAACTATAATTCGC
CAACAAAAGACTACAAGAAATCATAATTTGTGTCTTTGATCATCAAATGATTATGTCAGA
AAATTTATTTATTTATTTATTTTTAATGTTAGTTCTAAAAATTACAATTTTTTAACGCTA
CTTTATGAGATTGTTACTGGATAAGATTCTAATTGATTTTGCTTGTGCGATTAAAATTAA
TTTATCATGACACTATAATCTTATATTGTAATAAACGTAGCTTTTTCTTGATACTTGGTT
GCATTCATAGTTTCGGTTACGTGATATATTCAAGCTATTTAAATTTTATGAGAATAATAT
TTAAAGATTTGAATGCAGTCCCAGAAACAGGCTCTTGCTGAGCGACTGAATCTGAAACCT
AGACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGGAGAGCAAGGTAACATTTATTCATAATATCT
AATAATTTACTTTTGTACTCATTTTATTTTAATATAGTTACCAATAATGGGCCCAGAAAA
CTTTGTTAGAGGAGGCATTATTAATGATCATGTTAAAAAAATAATATTATAGTATATATT
ATTTGTTTGTTTCTTTATTTTTTTTCAATGACATGAAGTAATTTAATGAAATTAAAAAAA
AATTAAAAGAGTAGAAATCATAAATCCTATTATTCAAGGTCATAAATAAAAGTATCAGCA
TATAAAAACAATTACTATAAAATAATAATAATAATAATAGCATCAGCCAAGAAATTCTAT
TTCTAAGCTTCGTGTTGTAAGCTAGAAAATTATCTTCACATAACTTTTCTTTTAAGTATT
GAAATTTCTCTTTAAAACCATAAAATCAAGGGTTGTTTATTTATTTATTTTTTTTAAATG
TCTCTCTATAATGCTTCATTTTTTTCATAACCATAATTGCATCCTCAATTTTAAAGCATA
TATGATAAAGTCACAAGATATATATATATATATGTATGTATGTATATATATCTCATTTTG
ACAACTATTACTAATAATGGAATTGTTTTTATAATTTTTTTTAACATGATTTAGAATATA
ACTCTCACTAAAAGGGAGGAATCTCCCCACACTCAAACAATTTTAGTGAGCAAAGGTGGG
ACTCAAATGTGAAATAGAAGTGCTCAACTACTTTGCTAAGAGTCGATATGCTTATAATTT
CATTAAATAGATTTTTGATCATATTAAAAATATAATAATTAACTATTTTATAATTATGAT
AGTTGTTTTTCAATAAGTAATATCTTTATATAATAGATGAAGACAGTTGAAAAATAACAA
ATGAGTCAAATGACAAGTAATGACGATTGTGTAATTCTAATACAACTTAGCAACTTTGTT
TTTGAAGAAGTCAGGGGAGACATGTGCCTCTTCTGGACCAAGCATAAGTACGCCACTGAT
AATTACAATATAGTTAGAAATATAATAACACTGATATTACATGTTCTTGTAATCCGTTGA
AATTAAACATTATGTATAATATGAAAATTTACTCTTAAACATTTGGAGAAATTATTCTCA
TGTAAGCGGAGAAAACTCCTATCACATGGCTGTGCATTGTGTACTCAATTTATGAATTTT
ACTCATAATAATATATATTAAACAAATTCGGTACTTGAGTTGCAGGACAAAGTTGAAACA
AACAGAAGTAGATTGTGAATTCTTGAAGAAATGTTGTGAAAGTTTAAGCGATGAGAACAA
GAGATTGAAGAAAGAAGTGGAAGAATTACAATATCTAAAAGGAGGAGGAGGATCACCATT
ATTTATTCAACTTCCTAAGCTAGCAGCTGCAATGTGCCCTTCCTGCTATGACAAAATTAT
GAAAACAATGCAAGATAAAGGTTGCGGCCGTTATTGATGTGGTCCTTAACAACAATAAAT
GGCATAGCGGCTACAACTAAACATAATTTTATTAGGATTAATAGCTTTAAGCTAGCTTGG
GAACACTTATTATTGTATATCCAGTCTATATCAAATTAATTAAGTAGTACTGTTGGTTAC
TTTCTTACAAGGAACGTTTTCAGTGCCATTTCACTACCCTAGTATTTTGCAAAAATGGTA
AACGTTGGTCTAATTAAATTAAATTCTATTATATAAATATTGTCTTCAAAGATACATTGA
T