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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI016443Chr13575813335770290+PHD and RING finger domain-containing protein 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI016443.m1275321PF00628.32PHDDomain40.61.80E-10
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>LITCHI016443.m1
ATGCAAAGTTCTTTTCTTGATTCAATTGAACCTACTTTAATTCATGAATCTGACAATGGA
AAACCTCCTCTTTTACATAATTGGTTTCCTGCTACTGGAAAAAGGCAGATGTGCCACAAA
TGTGATGAAGATTGTTACAGTTGCCACAGAAAAGCTGTTTTTGTCACAGAGGGAAAAGAG
AATGTGGACTTTTCATGCCCGTTAACTTTTACAAGTTCCCAGCATTCAACTGTCAGCACA
ATGTCTGAAAGAACTGTACCTAACTTTGTATATCGCCGAAGGAAACTACGAGGGAACTCT
GTTTCAATTTTTTCTGTCCATGACCATGTGAACACAAAGAGAAATGATGATTGTCTTTCA
GTTGTCAGCTCAAATGCTCTTTCTGCAACAAAAGAGCAACATGTTTCTCAAGTTGATGAC
GAAAGTGAAGCCATTGCAACTCTTGTCAGGCCTCCTGATACAAGTCATAGTGAGTCCAGT
CATTTAAGGTCAGATTCAGTTCAGGAAGAGCGTGTTTCTGATGCGGCAGCCAAAGGCAGC
AAGCACAAAAACGTAGAGGTAGACAGTGTAAATGACAGTTGCTCATCCTCAAAGTCAAAT
GTTGAACTTGTTTCAGCTTCCAGGAAGACTGAAGTTGATGATGCTGGTGAGTGCTCTTCC
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TTGAGGGATACTGAGCCATATACAACCAATGTTCGAATTGGTAAAGGTTTTCAAGCAAAT
ATACCAGATTGGTTGGGTCCAGTTACCAAGTACATGTTGGATTATCTGTCCCTTGCTCTA
GAAATTCTAGTAGCAGAACCTGTTTGTTCATCACCTTCTAAATTTATCTACTGGTGGTTA
TTCCTGTGCATTCAGTGCATCAAGGAAGTCACAGTCCCAAGCAACTTGAGCTGCGGCATC
TGCTCCTTTTGTTTTAATAGTAAGCCAAGTCATTCTCAGATGGTCACTGTTGTCCAACAT
ATTGCCCTTTCTGAATGTATCCTCACTAGGTTGAATAGTGTTGTTGATATAATGGGTGAA
GCATTAGAACTGGATCCATCAAAGAGTGTAAATTTGCATGAGTTGAAAACCAAAAACCTG
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GAAGGTGTCGATGGAACCATCTGTGGGAAATGGCGAAGAGCTCCACTCTTTGAAGTCCAA
ACTGATGACTGGGAGTGCTTCTGCTCTGTCAATTGGAATCCAGCTCATGCTGATTGCGCT
GCCCCACAGGAGCTAGAAACAGATCAAGTTTTGAAGCAACTAAAGTATATTGAGATGCTG
AGGCCCCGACTTACAGTTAAAAGGAGAAAATTGGATAGTATCTGTAATGGTGGCTCACAA
GACAAGGATGTGACAGACAGAGAGGTCCAAACAGCATAA
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AAACCTCCTCTTTTACATAATTGGTTTCCTGCTACTGGAAAAAGGCAGATGTGCCACAAA
TGTGATGAAGATTGTTACAGTTGCCACAGAAAAGCTGTTTTTGTCACAGAGGGAAAAGAG
AATGTGGACTTTTCATGCCCGTTAACTTTTACAAGTTCCCAGCATTCAACTGTCAGCACA
ATGTCTGAAAGAACTGTACCTAACTTTGTATATCGCCGAAGGAAACTACGAGGGAACTCT
GTTTCAATTTTTTCTGTCCATGACCATGTGAACACAAAGAGAAATGATGATTGTCTTTCA
GTTGTCAGCTCAAATGCTCTTTCTGCAACAAAAGAGCAACATGTTTCTCAAGTTGATGAC
GAAAGTGAAGCCATTGCAACTCTTGTCAGGCCTCCTGATACAAGTCATAGTGAGTCCAGT
CATTTAAGGTCAGATTCAGTTCAGGAAGAGCGTGTTTCTGATGCGGCAGCCAAAGGCAGC
AAGCACAAAAACGTAGAGGTAGACAGTGTAAATGACAGTTGCTCATCCTCAAAGTCAAAT
GTTGAACTTGTTTCAGCTTCCAGGAAGACTGAAGTTGATGATGCTGGTGAGTGCTCTTCC
TCCAGTGTTATAGCTCTAGAGATCATGGGCAAAGAGTTATCAGAAAAGGATCTTTGCATC
TCTATATTGAAATGCGAGGGGCTGCTTGAAAGACTTCGGCCTACTCAGATTTGTGCTTCT
ACAAAAGGCATGGATAGTACTAAGGTTAGATGTTCCAGGTCATGCAAAATTTGCAGTCGT
TCAGAAACTACTCTACAAATGCTAATATGTGATAATTGTGAAGAGGCATTTCATTTATCT
TGCTGTAATCCTCGTGTGAAGGAAATTCCAACCGATGAATGGTTTTGTCATTCATGTTCA
GTAAAGAAGTGTAAAGTTCTGAAGGCGTCTGTTCTCAGAAAATCATCAAATATTATTAGT
GAAGTTGGAAAATATAGAAATGCATCATCTAAAGGCGATTCCAGTCCTGTAGAATTGATG
TTGAGGGATACTGAGCCATATACAACCAATGTTCGAATTGGTAAAGGTTTTCAAGCAAAT
ATACCAGATTGGTTGGGTCCAGTTACCAAGTACATGTTGGATTATCTGTCCCTTGCTCTA
GAAATTCTAGTAGCAGAACCTGTTTGTTCATCACCTTCTAAATTTATCTACTGGTGGTTA
TTCCTGTGCATTCAGTGCATCAAGGAAGTCACAGTCCCAAGCAACTTGAGCTGCGGCATC
TGCTCCTTTTGTTTTAATAGTAAGCCAAGTCATTCTCAGATGGTCACTGTTGTCCAACAT
ATTGCCCTTTCTGAATGTATCCTCACTAGGTTGAATAGTGTTGTTGATATAATGGGTGAA
GCATTAGAACTGGATCCATCAAAGAGTGTAAATTTGCATGAGTTGAAAACCAAAAACCTG
CCTAAACTCTGCTCCATAGGTAATTGGCTTCAATGTAGGCAGGTTATAAAGGGTCTAGGT
GAAGGTGTCGATGGAACCATCTGTGGGAAATGGCGAAGAGCTCCACTCTTTGAAGTCCAA
ACTGATGACTGGGAGTGCTTCTGCTCTGTCAATTGGAATCCAGCTCATGCTGATTGCGCT
GCCCCACAGGAGCTAGAAACAGATCAAGTTTTGAAGCAACTAAAGTATATTGAGATGCTG
AGGCCCCGACTTACAGTTAAAAGGAGAAAATTGGATAGTATCTGTAATGGTGGCTCACAA
GACAAGGATGTGACAGACAGAGAGGTCCAAACAGCATAACAATTTTGTTTCAGAATCCAT
ACAGCCTGCATTGACGTGTACTGTGTACACTCAAAGTCACAAATCCAAGTCCGAATTTTC
GGAGTATTGTAATTTTTGTAGATTGGATAAATTTCAAGTATGAGATGCATATCTTTCTGG
TGGCTTCATCCCAATCTGCTTCATCCTGCAATTACTTATAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
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>LITCHI016443.m1 +  Up_Stream_Len 2000
CCAAAGCGGACAATGTTTTCACTATGCTGGGGGTGTTGTTACAATTGATATCAGAGCTTG
GTTTGTGACACAATGATGGGTCAGTGTTCCATCCCTAGGTTCTCAATCCCCGGGAGGATA
TGAGGTTTAAAAAGGGGAAGATTGTGGGAATATTGTCGATTGTTGTACTAACAAGAGCTG
CTAAATTCAGATCCCTAACAAGAGGGTCCTGACTAGTTCATATCCAATATGAGCTTCTTG
AAATTATGGAGCTGTTATATCACGAAATTATAACTACCAAGATTGTCAGCTCAAACAATA
GTGTCAATTTAGAACATAGCGAACAAAGAAAGAACAGGAAATCTGTTTATGTAAAATAAT
TGTATCAGTTGCAATGTATAAGAAACTAATGGCTATTACATATAGATGTACTTATTAAAA
TCAACATTCCAATTAGAGGAATATGTTATGTCTTTGTGGTTTCGTCTTGTTAGCTCAAGG
CCCATGTTTACATTTATTCTAGGTGATCTTCAATGATGTAATAAACCCTAGACTTATGTA
GTGTTGGTTGCTTGGTAAAGAAAACAAGGTGTGGAGATGAGCATATGCAAATTAGCAAAT
ATTGGAATTTCTAGCTTTTGGGCTTCTTCAATTGGTGTGATGGCTAGGGGTGGGCCAATG
TCTTAGGTGTATATGGTGGATGCACAGAAAGTATAGCCATTGATGTTTTGAATGACACAA
GGTTTGACAACAATGAAGTATGGTTGTGAGTGGTGTTTTGTGACTCAATTTCAAGTTTCC
AACCAATCAGGTAATTTGATCATTCTAAAAGGCAAGCATACTAAGGTCAATGACAATCAT
AGCTGAACATATTCTATGAACCGACCAACTCAAGGAGGAATTCATGCATTTGTTAATCCT
TTTTGTAGTAGGAAGTTGGCATAAGACTATTTTTTCTCATGTGCAACTACATCTTCTTTG
ATATTTGAAGAAAAAGATAAAATAAAAAGGGAGAGGCTAGGATATTAGTTTAGCTATTTT
AGAATATGACAAAACTCAAAATGGTGGGTTGAACTATTGGCATTATAAAATGATTATCTT
AAAATTTGTCTGGGTGGTGAATGGATAAATTATATAAGTTTGATGTCCATGAGGAAGACG
GCAGAGACTTTGGAGTTTCAATTCAATTTAGTCTATCTTTTAGTTATTTGAAAAAAGAAA
TACAATATTAGAACCTAAGAATTAAATTTTCACCAATTAACAGCAAATAATGAAAAAAAA
ACGAAAACAAAAATGTAATTCGTGGAGGAGAGAGGGCTTTTGGTTCTGTGATTTATTTCT
TTTAGCTGGGGGATGATTGGGTATTTACCTTGTGATTTTTTGCCCCTTTTATTTTCTTTA
GTTATCTACTGTTAGTATATTCTTTTGCTGCATCAGTGTAATTGTAATTCATAATGTTAT
GCTAGGTGTATAGGTTTTACAGTTGGTGATCAATTTGGAATTTGTGATAAGGTGTCAGGA
CCATTATAAAATGTCATTCTTATAATTGGGGAAAGATAAATTAGAACGTTGTGTTGACAA
GTGTTCTTGAAAAAGTAACAGGATCAGTTTGGTTTTATTATTTACATGGTGGAAAATTTT
CTGGTAAGATGATACAGCAGCTGCTTGGAGTACCTAAAAGATAGCTATTTATATTTCTGG
GAAGCATGTCCGGATTTGTTGTGAGAATGATGAGTTTAAATTCCATATATTTTGAAATTC
ATTAGCTGATATAGAGAAATCAAGATTTTATTCAAGGAAGAGAAATATCTAATCTCCACT
TTTGTCCTACCATCCTGACCTCTTTGCTTCTATTGTTTTGTTTGACAGTGATCAGGATTG
AAGGTGATATATTCACGGGAAAGTTTTTATGTGGGGTTTGAATTCTATATTTGAAACAGA
AACAGAGTATTATTGACTTCATTTGGGAGTTTAAAGCTTTCATTCTGGAGGATATAGTAC
TTGTTTCAGGTGAAGTGCTG
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>LITCHI030097.m1 GenomeSequence - 
ATGGATGATCTTGACATAAACAATTACAAGATCTCTGAAATTGAAATCATTGGAGATTTT
ACAACCGTTGGGGCTAGTAGTGGTAAAAGTGTCGATGGAGATGAAATTGGTAGAGATCAA
GTCAATCATTCTCCAGCACAGGTCACAATCCCAGAGCAAGAGGGAGTTGCAACTATGCCA
TTGGATCCAGTAGATGAACCTTATGAGTGCCAACAATTTGATTCTGAAGAAGCAGCATAT
GCATTCTATAATGGATGTGCATCTCGTGTATGATTTGTCATCCGAATAACCAACAATTCT
CATATTGGTCAATCAATGTAACAGAGGGGGTTTTGAATCAAATAACAAGCGTAGAAAGAC
TATCAAACAAACAGAGGAGACAAAAGTTTGCTGTAAAGCCAAGATTAAGCTTAAGAAAAA
TGTTAACTCCAACAAGTGGGATCTCATAAAGTTTATGAAGGACCATAATTGTCCCCTAAC
ACCAAGAAAGGGGAGAAAAGATGGCCTTTATGATAAATTTCAGGTCACTTCTTAGTACTC
CTCATTTTATTAGGATTGTTGTTTCTTTTTCATGGCTTGAAGTTAATTAATATATAATCT
TTTATCTCATAGAGACCATGCATGATTATTATAGTTTGAAAATCTATTATATTATTGGAT
TTTCAAACATGTATAAATATTTATCAGTAACTGCTAAACTTAAAATTTAAGTTGACAGGT
AAATATAAAACTATAATATTTAGAAAATAGGCTGATAAGATTTATGATGCAATGATGATA
TCAAAGATCATTAAGTTAGATTTGAACTCCTTTTTAATCCCTATGCAACAAGCTCTATAA
TAAAATGTGCTAAGCACATTTTATTGCACTTTTGATTCAATTTCTGTCCGTATCACATAT
GGTGTGACTGATCTAATGAATCTTGGAATAATTAGGTTCTAAATATTATGTGAATAATTA
GTTATGAATCCTCTATGTTTTTAGTCATAAGGGGTGGATTGGATGAGAAAATAGAAATTA
TTATACTTCTATCAAAAATTTATGAGTTCTAATCTTGCTTGGTTCACTTGTCTAGAATAT
ATAGTACTTCTCGAATTTCTTGACTATGAATTTCGTAGGGCCCAATAGAAATCCTAATTT
GATGAATAAATAGGTTTGAGATTTTGAAATTAATGGCGCACTGAAATGGTCTTATTTTTA
TTGATGAAGTCTCCTTGAGGCGGCATATGTGAATCCCCATATTTTGAAATATTCTTACCC
ATATTCATGATGTTTAGATTGAAGTGATATGAATGGTTAAGATCAATGGTTTCAGGAACA
TTATAACTACTCTAATACCTACACCTTTCTGTTCTATATATATTTATATATATGTCCACT
CTCACTTCTTCAATATTTTCTCCTCTCTTTAAATGAGTTCTTATAACTTCATAGTTTTTC
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TAGTCCATATTTTTCAGAACTGAAGCCAAATTATATTAATTCATTGATAATCTCCTTAAA
TCTTTTGAAGGAGGACTATCTTTAACCAACATGTACGGTGTTCAAATTAAGCATGTGTAC
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ATTAGAGCCAAATAAAAGTTGGTTGGACTCTAGAGACATAAAAATTACATCTTTGATACA
AAACTAGATATATAATAGAATCAAAAACAATTTTGGACTTGTTTATAAACCATTTTTATC
TGTTTGAAAAAGTTATTGTGACCACCATCTTGATGTTATGAAGATTATCATTATAGCCTA
ATTATGTATTGCAACTGACTGTTTTGTTGTGTTACTGTTCTAGGGTCAACATGACAAATC
TCAGGAATCATCAGAACAGCTGGTAGAAGAGAAAAAGAAAAGTGAAAAACAAAAAAGGAA
TTATCAGAGTAAGCGGGTTACCACAAAGTTTGTGAAGGACCACAATCATCCCCTAACACC
TGGAAAGGGGAGAAGAGATGGACTTTCTGATGACTTCCCGGTCAGCTCTTAGCACTCATT
ATTATTAGCGATTGTTATTATTTGCATGTCTTGGAAGCTTGTTAATATAATCTTTCATCT
AAGATTTGCCAGAGACATTGCATGATTAGTATAGTTGGAAAATTTATTATATTAACGGAT
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TTCAACTGTAATATTGAAGGAATGGGTTGACGGAATTTATCATACATCAACAGGAAAGAA
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GGATACAACTTGTGTTGCTGAAACCAATTATTAAAACAATTTTGTCTTGGCCTTTCATTT
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GTTTGGAATATTGATGGATATGCTAAGCATCTAAATATGGCACTGTCTTTGATGCCTTTT
TTATTGTCCACTTCTTGTTTAAATCACAGTTATTGCACTTTTGATTGAACTTTGATCCGT
GTCACATAGAGTGTGATCAAGTATCTCATGAATCTTGGAGTGATTAGGTTCTAAATATTA
CATGACTTAATAGATCACAATCCATTATGTTTAGAGGATATATATATATATATATATATC
CCACAAATTTCTTGACTATGAATTTTGTAGGGCGCCACAATAATCCTCAATTGAGATCTG
ATGAATTAGGTTTGAGGGTTTGAAATGGCACCTTGAAATCGTGTGATTGTTACTGAATGT
GAATTATCTCATTGAGTTAGTATACATGAATCCCCAAATCTGGAAACATTGTTACCCACA
TTCATGACCTTTAGATTGAAGTGATATGAAGGGTTAAGATCAATGGTTACAGAACTTTAA
TAAATGCACTTCTCTCTTCTACTTGATATGTACCCTAGCTACGTAAAATCTTTCAGTCAC
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TCAATCTTTTGGAGGACTATCTTTAACCAATACATACAGTGTTCAAACTAAGCATGTGTA
CATAATCCTTACCATACTGTTTGTGGTCCTTTTTGTGTATCAATGTACTATGTTTAATTG
TACTTGTTTGACAAAGATTTCAATTTTTTTACCTCTTTCCTAGAGCTTGATTGTTAGAGC
CAAAAGAAAGTTTGTTGGACTGGAGAGACATCAAAATGACATCTTTGAGTGCAAAACTAG
ATATATAATAGTGTCAAAATCATTCATGACCTGTATATAAACCATTTTATCTGGTTGACA
TGGTTATATATTTTGTGACCACCATCTTGATGTTATTGTTATGGCCTAACTACATATTAC
AATTGACTGTTTGTTGTTTTACTGTTTTAGAGTCAACATGACAAATCTAGGGAATCATTA
AAGCAGTTGGAAGAGAAGAAGAAGAAAACTACAATCCACAAAAGTAAAGTGGAATTGCTT
ATTGAAGCATAA