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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016443 | Chr1 | 35758133 | 35770290 | + | PHD and RING finger domain-containing protein 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016443.m1 | 275 | 321 | PF00628.32 | PHD | Domain | 40.6 | 1.80E-10 |
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>LITCHI016443.m1 ATGCAAAGTTCTTTTCTTGATTCAATTGAACCTACTTTAATTCATGAATCTGACAATGGA AAACCTCCTCTTTTACATAATTGGTTTCCTGCTACTGGAAAAAGGCAGATGTGCCACAAA TGTGATGAAGATTGTTACAGTTGCCACAGAAAAGCTGTTTTTGTCACAGAGGGAAAAGAG AATGTGGACTTTTCATGCCCGTTAACTTTTACAAGTTCCCAGCATTCAACTGTCAGCACA ATGTCTGAAAGAACTGTACCTAACTTTGTATATCGCCGAAGGAAACTACGAGGGAACTCT GTTTCAATTTTTTCTGTCCATGACCATGTGAACACAAAGAGAAATGATGATTGTCTTTCA GTTGTCAGCTCAAATGCTCTTTCTGCAACAAAAGAGCAACATGTTTCTCAAGTTGATGAC GAAAGTGAAGCCATTGCAACTCTTGTCAGGCCTCCTGATACAAGTCATAGTGAGTCCAGT CATTTAAGGTCAGATTCAGTTCAGGAAGAGCGTGTTTCTGATGCGGCAGCCAAAGGCAGC AAGCACAAAAACGTAGAGGTAGACAGTGTAAATGACAGTTGCTCATCCTCAAAGTCAAAT GTTGAACTTGTTTCAGCTTCCAGGAAGACTGAAGTTGATGATGCTGGTGAGTGCTCTTCC TCCAGTGTTATAGCTCTAGAGATCATGGGCAAAGAGTTATCAGAAAAGGATCTTTGCATC TCTATATTGAAATGCGAGGGGCTGCTTGAAAGACTTCGGCCTACTCAGATTTGTGCTTCT ACAAAAGGCATGGATAGTACTAAGGTTAGATGTTCCAGGTCATGCAAAATTTGCAGTCGT TCAGAAACTACTCTACAAATGCTAATATGTGATAATTGTGAAGAGGCATTTCATTTATCT TGCTGTAATCCTCGTGTGAAGGAAATTCCAACCGATGAATGGTTTTGTCATTCATGTTCA GTAAAGAAGTGTAAAGTTCTGAAGGCGTCTGTTCTCAGAAAATCATCAAATATTATTAGT GAAGTTGGAAAATATAGAAATGCATCATCTAAAGGCGATTCCAGTCCTGTAGAATTGATG TTGAGGGATACTGAGCCATATACAACCAATGTTCGAATTGGTAAAGGTTTTCAAGCAAAT ATACCAGATTGGTTGGGTCCAGTTACCAAGTACATGTTGGATTATCTGTCCCTTGCTCTA GAAATTCTAGTAGCAGAACCTGTTTGTTCATCACCTTCTAAATTTATCTACTGGTGGTTA TTCCTGTGCATTCAGTGCATCAAGGAAGTCACAGTCCCAAGCAACTTGAGCTGCGGCATC TGCTCCTTTTGTTTTAATAGTAAGCCAAGTCATTCTCAGATGGTCACTGTTGTCCAACAT ATTGCCCTTTCTGAATGTATCCTCACTAGGTTGAATAGTGTTGTTGATATAATGGGTGAA GCATTAGAACTGGATCCATCAAAGAGTGTAAATTTGCATGAGTTGAAAACCAAAAACCTG CCTAAACTCTGCTCCATAGGTAATTGGCTTCAATGTAGGCAGGTTATAAAGGGTCTAGGT GAAGGTGTCGATGGAACCATCTGTGGGAAATGGCGAAGAGCTCCACTCTTTGAAGTCCAA ACTGATGACTGGGAGTGCTTCTGCTCTGTCAATTGGAATCCAGCTCATGCTGATTGCGCT GCCCCACAGGAGCTAGAAACAGATCAAGTTTTGAAGCAACTAAAGTATATTGAGATGCTG AGGCCCCGACTTACAGTTAAAAGGAGAAAATTGGATAGTATCTGTAATGGTGGCTCACAA GACAAGGATGTGACAGACAGAGAGGTCCAAACAGCATAA
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>LITCHI016443.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCAAAGCGGACAATGTTTTCACTATGCTGGGGGTGTTGTTACAATTGATATCAGAGCTTG GTTTGTGACACAATGATGGGTCAGTGTTCCATCCCTAGGTTCTCAATCCCCGGGAGGATA TGAGGTTTAAAAAGGGGAAGATTGTGGGAATATTGTCGATTGTTGTACTAACAAGAGCTG CTAAATTCAGATCCCTAACAAGAGGGTCCTGACTAGTTCATATCCAATATGAGCTTCTTG AAATTATGGAGCTGTTATATCACGAAATTATAACTACCAAGATTGTCAGCTCAAACAATA GTGTCAATTTAGAACATAGCGAACAAAGAAAGAACAGGAAATCTGTTTATGTAAAATAAT TGTATCAGTTGCAATGTATAAGAAACTAATGGCTATTACATATAGATGTACTTATTAAAA TCAACATTCCAATTAGAGGAATATGTTATGTCTTTGTGGTTTCGTCTTGTTAGCTCAAGG CCCATGTTTACATTTATTCTAGGTGATCTTCAATGATGTAATAAACCCTAGACTTATGTA GTGTTGGTTGCTTGGTAAAGAAAACAAGGTGTGGAGATGAGCATATGCAAATTAGCAAAT ATTGGAATTTCTAGCTTTTGGGCTTCTTCAATTGGTGTGATGGCTAGGGGTGGGCCAATG TCTTAGGTGTATATGGTGGATGCACAGAAAGTATAGCCATTGATGTTTTGAATGACACAA GGTTTGACAACAATGAAGTATGGTTGTGAGTGGTGTTTTGTGACTCAATTTCAAGTTTCC AACCAATCAGGTAATTTGATCATTCTAAAAGGCAAGCATACTAAGGTCAATGACAATCAT AGCTGAACATATTCTATGAACCGACCAACTCAAGGAGGAATTCATGCATTTGTTAATCCT TTTTGTAGTAGGAAGTTGGCATAAGACTATTTTTTCTCATGTGCAACTACATCTTCTTTG ATATTTGAAGAAAAAGATAAAATAAAAAGGGAGAGGCTAGGATATTAGTTTAGCTATTTT AGAATATGACAAAACTCAAAATGGTGGGTTGAACTATTGGCATTATAAAATGATTATCTT AAAATTTGTCTGGGTGGTGAATGGATAAATTATATAAGTTTGATGTCCATGAGGAAGACG GCAGAGACTTTGGAGTTTCAATTCAATTTAGTCTATCTTTTAGTTATTTGAAAAAAGAAA TACAATATTAGAACCTAAGAATTAAATTTTCACCAATTAACAGCAAATAATGAAAAAAAA ACGAAAACAAAAATGTAATTCGTGGAGGAGAGAGGGCTTTTGGTTCTGTGATTTATTTCT TTTAGCTGGGGGATGATTGGGTATTTACCTTGTGATTTTTTGCCCCTTTTATTTTCTTTA GTTATCTACTGTTAGTATATTCTTTTGCTGCATCAGTGTAATTGTAATTCATAATGTTAT GCTAGGTGTATAGGTTTTACAGTTGGTGATCAATTTGGAATTTGTGATAAGGTGTCAGGA CCATTATAAAATGTCATTCTTATAATTGGGGAAAGATAAATTAGAACGTTGTGTTGACAA GTGTTCTTGAAAAAGTAACAGGATCAGTTTGGTTTTATTATTTACATGGTGGAAAATTTT CTGGTAAGATGATACAGCAGCTGCTTGGAGTACCTAAAAGATAGCTATTTATATTTCTGG GAAGCATGTCCGGATTTGTTGTGAGAATGATGAGTTTAAATTCCATATATTTTGAAATTC ATTAGCTGATATAGAGAAATCAAGATTTTATTCAAGGAAGAGAAATATCTAATCTCCACT TTTGTCCTACCATCCTGACCTCTTTGCTTCTATTGTTTTGTTTGACAGTGATCAGGATTG AAGGTGATATATTCACGGGAAAGTTTTTATGTGGGGTTTGAATTCTATATTTGAAACAGA AACAGAGTATTATTGACTTCATTTGGGAGTTTAAAGCTTTCATTCTGGAGGATATAGTAC TTGTTTCAGGTGAAGTGCTG
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>LITCHI016443.m1 GenomeSequence + ATGCAAAGTTCTTTTCTTGATTCAATTGAACCTACTTTAATTCATGAATCTGACAATGGA AAACCTCCTCTTTTACATAATTGGTTTCCTGCTACTGGAAAAAGGCAGATGTGCCACAAA TGTGATGAAGATTGTTACAGTTGCCACAGAAAAGCTGTTTTTGTCACAGAGGGAAAAGAG AATGTGGACTTTTCATGCCCGTTAACTTTTACAAGTTCCCAGCATTCAACTGTCAGCACA ATGTCTGAAAGAACTGTACCTAACTTTGTATATCGCCGAAGGAAACTACGAGGGAACTCT GTTTCAATTTTTTCTGTCCATGACCATGTGAACACAAAGAGAAATGATGATTGTCTTTCA GTTGTCAGCTCAAATGCTCTTTCTGCAACAAAAGAGCAACATGTTTCTCAAGTTGATGAC GAAAGTGAAGCCATTGCAACTCTTGTCAGGCCTCCTGATACAAGTCATAGTGAGTCCAGT CATTTAAGGTCAGATTCAGTTCAGGAAGAGCGTGTTTCTGATGCGGCAGCCAAAGGCAGC AAGCACAAAAACGTAGAGGTAGACAGTGTAAATGACAGTTGCTCATCCTCAAAGTCAAAT GTTGAACTTGTTTCAGCTTCCAGGAAGACTGAAGTTGATGATGCTGGTGAGTGCTCTTCC TCCAGTGTTATAGCTCTAGAGATCATGGGCAAAGAGTTATCAGAAAAGGATCTTTGCATC TCTATATTGAAATGCGAGGGGCTGCTTGAAAGACTTCGGCCTACTCAGATTTGTGCTTCT ACAAAAGGCATGGATAGTACTAAGGTTAGATGTTCCAGGTCATGCAAAATTTGCAGTCGT TCAGAAACTACTCTACAAATGCTAATATGTGATAATTGTGAAGAGGCATTTCATTTATCT 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