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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016388 | Chr1 | 34770225 | 34774430 | + | AP2-like ethylene-responsive transcription factor AIL5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016388.m1 | 174 | 232 | PF00847.23 | AP2 | Domain | 46.7 | 3.10E-12 |
LITCHI016388.m1 | 276 | 326 | PF00847.23 | AP2 | Domain | 34.9 | 1.50E-08 |
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>LITCHI016388.m1 ATGAATATGAACATGAACAACAACATGGATTCTTCTTGGCTCGGTTTCTCTCTTTCCAAT ACTCCTATCAGCTTGCCATCCTCATCTTCTGACTCTTCTCACCTCAGCCTTTTTGAAGCT TTCACTAACACCACCACCACCACCACCACCGCCACTTCAGGTAATGTTGTTGATCATGCA CCAAGAGATCAAGAAGGTGCACCAACCACTATAAATGGTGCAACAAACCTCTCTATATTC ACCGGAAGTCCAAAACTGGAGGACTTCCTAGGCGGTTCTTGCACCAGTACTGGACCACAT CAGCCCCAACTGGGTCAGTTCTCTAGCGGGACACCCGTGACTGTCTCTACAGGCACTGAG CTTTACGATTCCGAACTCAAGACCATAGCCGCCAGCTTCCTTCGCGGTTTTGCCACCGAA CCAACAGACAGCCAAAAGCAACCGCCGCCTCAAACTCAGCTGATTCCAACCGACTCTGCG CCCAAGAAAGCCATCGATACCTTTGGCCAACGCACCTCCATCTACCGCGGTGTTACTCGA CATAGATGGACGGGTAGATATGAAGCTCATTTGTGGGATAATAGCTGCAGAAGAGAAGGT CAAAGCAGAAAAGGAAGACAAGTTTATTTGGGTGGTTATGATAAAGAAGAGAAAGCAGCT AGAGCTTACGATCTTGCAGCTCTCAAATACTGGGGTCCGACCACTACTACAAACTTTCCG GTTTCTAACTATGAAAAGGAACTGGAAGATATGAAAAGCATGACTAGGCAAGAGTTTGTT GCTTCTCTTAGGAGGAAAAGTAGTGGTTTCTCTCGAGGAGCTTCAATTTACAGAGGAGTG ACCAGGCACCATCAACATGGACGGTGGCAAGCAAGAATAGGAAGAGTTGCAGGCAACAAG GATCTTTACCTTGGCACTTTCAGCACCCAAGAGGAAGCAGCTGAGGCCTATGACATTGCT GCAATCAAATTCAGGGGCCTGAATGCAGTGACCAATTTCGATATGAGTCGCTATGATGTT AAAAGCATTGCCAACAGTAATCTTCCCATAGGAGGAGTAACCGGCAAGTCCAAGAACTCC TCGGAATCAGCTTCCGATAGCAAAAGCATAGACGGAAGCCGGTCAGATGACCGGGATATT TCCTCAGCGCCTTCTGTCCCCGTGCCCTTTGTGTCGCATCCCACGTCCTCTACCCTAAGC TTTGCGTTGCCCATCAAACAAGACCCATCAGATTACTGGTCCAGTATTCTTGGATACCAA AACAACACTACTACTGCTGTCCCCACTATAAGCAATGGCAAGAGCAACTTTGGTGTGGCA CCAACTTTATTTCAATCATGCACAAATGTGTCTACTTTTCAAAGTCCTACAACTTTCAAT ATGGACTTCTCTGCAAATTCCTCAATCAATGAGAGCAGCAGCAATGGGCTATGCAATGGT GGATATACTCAGCAACAGGCTAGTGTTAGTAGTAGTACAAGTTCAATCCCATTTGCTACA CCCATTGCCTTGAATAGTAATGGTAACAATTACGAGAGTTCAGCTGGTTACAATGGTAGC TGGATTTCACCGTCTTTGCATGGTTTCCAGTCTGCAAAGTCCAATCTCTCAGTGTTTCAG ACACCGATTTTTGGCATGGAATGA
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>LITCHI016388.m1 MNMNMNNNMDSSWLGFSLSNTPISLPSSSSDSSHLSLFEAFTNTTTTTTTATSGNVVDHA PRDQEGAPTTINGATNLSIFTGSPKLEDFLGGSCTSTGPHQPQLGQFSSGTPVTVSTGTE LYDSELKTIAASFLRGFATEPTDSQKQPPPQTQLIPTDSAPKKAIDTFGQRTSIYRGVTR HRWTGRYEAHLWDNSCRREGQSRKGRQVYLGGYDKEEKAARAYDLAALKYWGPTTTTNFP VSNYEKELEDMKSMTRQEFVASLRRKSSGFSRGASIYRGVTRHHQHGRWQARIGRVAGNK DLYLGTFSTQEEAAEAYDIAAIKFRGLNAVTNFDMSRYDVKSIANSNLPIGGVTGKSKNS SESASDSKSIDGSRSDDRDISSAPSVPVPFVSHPTSSTLSFALPIKQDPSDYWSSILGYQ NNTTTAVPTISNGKSNFGVAPTLFQSCTNVSTFQSPTTFNMDFSANSSINESSSNGLCNG GYTQQQASVSSSTSSIPFATPIALNSNGNNYESSAGYNGSWISPSLHGFQSAKSNLSVFQ TPIFGME.
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>LITCHI016388.m1 AAGCTTCAGTGTCTAGTTATTGAATCTTGACCAAACCACCCTCAAGAGGGAAATGGAAAC AAGCAAGTGGGAGCATTTTAGAGGCAGACCGGGCGGTGCTTTTCACATCCCCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTGTATATCTCTATGTATACTAATATTTGATTTAACAATATAATAATAT AGGAGAGAACCCATTATTTAATTTACTGAGAAGAGAAGAGAGAAAGAACCTCGATGCTCG TGTGTGTGTGACCCTAAACACTTCTCTTTCTCTCTCCAGTGTCTTCACATTCATTCATCT ACCTCTATATCTGTGCTTCATTTTCATCTTTACTTGGAACGAAAACCACCCACTTCTCTC TCTCTTTCTTGTTTCCTTTCGCCACTATTTCCAAAGACACAACAAACAATGAATATGAAC ATGAACAACAACATGGATTCTTCTTGGCTCGGTTTCTCTCTTTCCAATACTCCTATCAGC TTGCCATCCTCATCTTCTGACTCTTCTCACCTCAGCCTTTTTGAAGCTTTCACTAACACC ACCACCACCACCACCACCGCCACTTCAGGTAATGTTGTTGATCATGCACCAAGAGATCAA GAAGGTGCACCAACCACTATAAATGGTGCAACAAACCTCTCTATATTCACCGGAAGTCCA AAACTGGAGGACTTCCTAGGCGGTTCTTGCACCAGTACTGGACCACATCAGCCCCAACTG GGTCAGTTCTCTAGCGGGACACCCGTGACTGTCTCTACAGGCACTGAGCTTTACGATTCC GAACTCAAGACCATAGCCGCCAGCTTCCTTCGCGGTTTTGCCACCGAACCAACAGACAGC CAAAAGCAACCGCCGCCTCAAACTCAGCTGATTCCAACCGACTCTGCGCCCAAGAAAGCC ATCGATACCTTTGGCCAACGCACCTCCATCTACCGCGGTGTTACTCGACATAGATGGACG GGTAGATATGAAGCTCATTTGTGGGATAATAGCTGCAGAAGAGAAGGTCAAAGCAGAAAA GGAAGACAAGTTTATTTGGGTGGTTATGATAAAGAAGAGAAAGCAGCTAGAGCTTACGAT CTTGCAGCTCTCAAATACTGGGGTCCGACCACTACTACAAACTTTCCGGTTTCTAACTAT GAAAAGGAACTGGAAGATATGAAAAGCATGACTAGGCAAGAGTTTGTTGCTTCTCTTAGG AGGAAAAGTAGTGGTTTCTCTCGAGGAGCTTCAATTTACAGAGGAGTGACCAGGCACCAT CAACATGGACGGTGGCAAGCAAGAATAGGAAGAGTTGCAGGCAACAAGGATCTTTACCTT GGCACTTTCAGCACCCAAGAGGAAGCAGCTGAGGCCTATGACATTGCTGCAATCAAATTC AGGGGCCTGAATGCAGTGACCAATTTCGATATGAGTCGCTATGATGTTAAAAGCATTGCC AACAGTAATCTTCCCATAGGAGGAGTAACCGGCAAGTCCAAGAACTCCTCGGAATCAGCT TCCGATAGCAAAAGCATAGACGGAAGCCGGTCAGATGACCGGGATATTTCCTCAGCGCCT TCTGTCCCCGTGCCCTTTGTGTCGCATCCCACGTCCTCTACCCTAAGCTTTGCGTTGCCC ATCAAACAAGACCCATCAGATTACTGGTCCAGTATTCTTGGATACCAAAACAACACTACT ACTGCTGTCCCCACTATAAGCAATGGCAAGAGCAACTTTGGTGTGGCACCAACTTTATTT CAATCATGCACAAATGTGTCTACTTTTCAAAGTCCTACAACTTTCAATATGGACTTCTCT GCAAATTCCTCAATCAATGAGAGCAGCAGCAATGGGCTATGCAATGGTGGATATACTCAG CAACAGGCTAGTGTTAGTAGTAGTACAAGTTCAATCCCATTTGCTACACCCATTGCCTTG AATAGTAATGGTAACAATTACGAGAGTTCAGCTGGTTACAATGGTAGCTGGATTTCACCG TCTTTGCATGGTTTCCAGTCTGCAAAGTCCAATCTCTCAGTGTTTCAGACACCGATTTTT GGCATGGAATGAGCTCACAACAGTAGTGGGGGAGTGGTGGTGATCAGGACTCCAAAGATG ATGAGAATCTGTGCAATGTTGCAAAGGGTTTTGGGTCAACTTTTTTACTTAAAATAGATT AAAGAAGTGGTCTGACTGACAAGAATTTGACAGGAGCTGACTGTACTAACTCAAGTTCTT TGTTATGGATCTTTAGTTCTTTTTCTTTTGCTTTTTCCCTGTTTTAACTGACAATCATCA TTTCACATATGGATATAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACGAAAGTTATCCT TCTGTAATATTTACTTCTATCTCTGTGGCATCAAATTATCCGTTTTATATATCATTTGCT AATTTTCTATTTTTCCCTTTCACATACTATTAGCTATGTTAGTGGAGAAGTGTTTATAGC CAGCACATAAGCCACCGATGATCAAGAAATGAGACACGTCAACTTTGACCTAAATGTTTG ATTAATTAACCATCCCAGCTTTGTTACAGCTGTAACCTGTAATACAAGAACAATAAGTTG AAAACTACTCCCGTGGACATGGTTGACGAAGAAACATATTTGGGGCGTTTTACATGGGTT ACACAAATGACAAATCTTTTGTGGTATAAATTATAATCGTCTCAAACGGATTTGCCATTG TGAACGGTGCATTCTTTGACTTACTTAGCTTCTAAAAGTTGGTTTAAGATTTGACTACTT AAGCCAATTTTATGACTATTATGTTATTTTTTTCAATCTTATATCACAT
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>LITCHI016388.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTAATGAAATCAATTCAAATATGGATTGAATACATTCAAACATTTAAAATATTTTAAATT CCAATGAATTATTGACCAAATACATTTCCTAGATTTAAATAGTTTAACCAAAAATGGCAT TTAAAAAATATATAAAAACTTAAATCAATCACAATACTTCATAATGATCACTTTAAAATT CATTTAAATCCACCATTCACATAAAATTTATAAAGTCAATGACATATTGAATACATCTAA ATCTTATTAGATTTATTGCACATCAAAATTGAATACAAATAGATTTTATATAAAAATTTA AATCAATCACAATGCTTCATAAAAATCACTTAAAAATTCATCTAAATCCATCATTCACAT AAAATTTGTGAATTTAATGACATACTTAATACACCTAGATTTTCTTAGATTTCATACATA TCCAAATTAAATACACTTAGATTTTATTAGATTTCATACATATATCTAAATTGAATATAT TCATATTTTAATGGATTCTATATAAATATTGATTGAATATACTTAAATTTTAATAAAATT AATTCAAATATAGATTGAATACATTCAATATTTAAAATATTTTAAATTCGAATAAATTTT TGACTGAACATATCTCCTAGATTTAATCGTTCCACCATAAATGATATTTAAAAAAATATA TAAAAATTTAAATCAATCACAAATCTTTTAGATTTAACAATTCTGTGTGACCTTAAATGA AAATAGGGAAAATATATAACAATAATATAGTATTACTGTCTTAAGAAACCAGCTAAATCG GCAATTTTTTTTTTATTAGAAGAATATTTATATTTAAAGTCTCATTAACTTAAAAGTAAA AATGAATTTGTTTTATATTTACTATATTAATATAATCTAAAAAAAAAAAAGTTATTGCAC AATTATAAGATTTGAATATCATTTATTAGTCATAAGTCAGCGGTTCAGTGATGGAGCCTT TAAACTGCACGCTCGCATATTTCTTAAGAGGTGGGTTCGACACCCAATAATATCAATCTC TTTCTCTTGTTGTTTTCTCCCTACTATATAAAGGTTGTCCCCTAACTCATATGTGGATCG CTCACTCCTTATGAGAGTCGCTCTCCAAGTCGTACCATTAGTATTTGATACCGTTTGATC TCCATTATTCTTTAAATTAGTCTCGGTATTGTAATGTAATGTAGTAAAAAAAATACCATT TATTTCGAACTTAATGAAGTACTTGTAACAATTTTCTTGAAAGTTATAAAGCTCAATAAA TTTAAAAATTCTTTAGTCAGCACCGCCTCATGGAAGATCAATACGTTTTTTTACAACTTT GCACCCGATCTAAACTAAAACAAACTACATGCACCACCTAATTGAATATATAATTAAATT AAAATGAAATAAAAAATAAAGAAATCTCAACAGGGAAAAAGCAAAGTAATTTTAATAGAA ATATATTTCAACGAAAAGGAGAAAATTGCATGATACACCCATATTATTTAGTATTTACAA TTATAAACAGAAAATGACTCATGAGATATCGATGTCTCGATTACTAACATATTACATATA CATTATAAATATCTCTGTCAGTCTCAGGCTCAAAGCTTCAGTGTCTAGTTATTGAATCTT GACCAAACCACCCTCAAGAGGGAAATGGAAACAAGCAAGTGGGAGCATTTTAGAGGCAGA CCGGGCGGTGCTTTTCACATCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATATCTCTATGTA TACTAATATTTGATTTAACAATATAATAATATAGGAGAGAACCCATTATTTAATTTACTG AGAAGAGAAGAGAGAAAGAACCTCGATGCTCGTGTGTGTGTGACCCTAAACACTTCTCTT TCTCTCTCCAGTGTCTTCACATTCATTCATCTACCTCTATATCTGTGCTTCATTTTCATC TTTACTTGGAACGAAAACCACCCACTTCTCTCTCTCTTTCTTGTTTCCTTTCGCCACTAT TTCCAAAGACACAACAAACA
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>LITCHI019960.m2 GenomeSequence + AAACAACACCTTATAGCTTTCACAATATTAAGTACACAAATCCAAGTTAATTTATAACAC AAAATAGAATGTTGTAATTTGTCAATCAAATTGACGAATTCAACAAGTAAACACTAGCAC CAACAACTGTGGCCACCCCACCACCACCACCACCACCCACTACTACAAATACTCTCCTCC AACCATCAACCAGAAGATGGCCACCTCCACCAGCCACCTCCACCATCCAGCTACCAGATC ACCACCTCAGCTGTCACACCACACACCCATCTGACCACCACTAACACTACCAGTCAGCCA TGTTAGGCTTCCACAACATCCTCTTCATTTCTCAACCATCTTCTTCCCACCCACCACCCT CCATTACTTCCTCTGACCACCCCTACCCCCACAATGACAACAGAAATGTTCCTCAAAACT ACAACACCAACAATGATCACTTGAGTGAGTCAAGCTTTTGGAGCCTGCAGAAGAAGAGCA AAGATGGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGATGATGATGACAATGACAATAATGATGGTGATG GTTCCCTGAGAGCGTGTAGGGACTGCGGTAACAGAGCCAAGAAAGAGTGCAGTTTCAGGA GGTGCAGGACTTGTTGCAAGACTCGTGGCTTCGACTGTGCCTCCCACGTGAGAAGCACCT GGGTCCCTGCTTCTAAGCGCCGGGAGAAGAAGCTTGCCACCCCTGGAGCTGCTTCTGCTT CTGCTTCTTGTTCCTCTTATGGTGTCAAGAGGCCTAGGCCTTTTGTAGTACCATCGCCAT CTTCACACAATGTCACTACTCCTGCCACCTCCTCTTCCTCTGCTAATGATTTGAGTCTTG GTATCTCCTCTCATCCTCAGGGTATATACGCTTAACCATCGTGTCTCTCTCTGTCACTCT 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