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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI016372Chr134441627;34441859;3444188834447534+"Ribulose-1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit N-methyltransferase, chloroplastic "

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI016372.m1123330PF00856.31SETFamily36.56.50E-09
LITCHI016372.m224112PF09273.14Rubis-subs-bindDomain23.29.40E-05
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LITCHI016372.m3123330PF00856.31SETFamily36.94.90E-09
LITCHI016372.m4123330PF00856.31SETFamily36.56.50E-09
LITCHI016372.m524231PF00856.31SETFamily37.33.70E-09
LITCHI016372.m7123330PF00856.31SETFamily36.56.50E-09
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>LITCHI016372.m1
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TTGGGGAAGATGAATGGTATGTCCTCTGAGACTATGTTGTTACTGTGGAGTATGAAGGAG
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AGCCAAGTTGATTGTATTGAGGATTGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTGCGG
GGTACTTGGCTCTCAAACAATCACAATATTTTCCACTATGGCTTGCCATCTCCATTATTA
GACTATTTAAGGAGAGCTCGGAACCCTACACAGCAGGAAAAGACAATTTTACCAGCTAAC
TTGGAAACCGAAATAGAGGTTCTTGAAGACCTCCAATTGACCTTTAGTGACATGCTGAAA
AATCTTGGTGATGCAGATTTTGTTGACAGGGAAAACACAAGCTGGGACGTAAAGTTGGCT
GTGGAATTCAAAGATCTCCAGAGGAGGATCGTATCATCAATTATAGCATCATGTTCTGCT
GGACGCAAGTTGGTTGAAACTGAACTGTCCAGATTTATGTCTGAAGAGTGA
>LITCHI016372.m2
ATGGAGACACCTGAGCTGTGTTCGTCTGATAAGAGTGGTGATCAATATTATGTTGTTCTT
GAACTTGCTGAGACTGATCCTTTTTTTGATAAAAAGAAGAAATTACTGCATGAGAAGGGC
TTTGGTGTCAAGGAACGAATATCCCTCAAGAATTCTTCTTCGTCTGATTCGATGAGTGAA
ACTTTGGAAACAATGCTTCAGATAGGAAGAATTATCTGCTTAGATGAGGTGGAACTTTAC
TTTGGTGAATTTGGAACACAATCTGGATCGTACAGCAGCAGGAATGAGGTGGAAGCCCTG
AATTTGGTCCTTTTGCTTGTTAAGTCCTTGCTCACTAGTCAAATGCACAAGCAACTTGAT
GTCTGGGAAGATTTACAAAAGGCAATCATCAAGAAGATCCATGAATTCTCTAACCAGAAC
AAAATGGATGCTAAAATTGATAGAAACTACATTTGCGAAAAGGAAAAGTGTTTAGTACAA
TGGGGTGAGAGGAATGGTGTAAGAACAAAACTGGAGATTGCTTATGTAGAAGGAGCTGGA
AGAGGAGCCATTGCAATGAAAGATCTATGTATCGGAGATGTAGTGTTGGAGATCCCTGTG
TCTATAATCATTTCTGAGGAGCTTGTGTACAAATCTGACATGTATAACAAATTGGGGAAG
ATGAATGGTATGTCCTCTGAGACTATGTTGTTACTGTGGAGTATGAAGGAGAAGCACAAT
TGTGAGTCAAAATTCAAGAATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTTAATACAGGATTG
AGCTTTGGAGTTCAGGCAATCATGGCGTTGGAAGGGACCTTGTTGTTAGAAGAGATAATG
CAAGCAAAAGAGCACTTGCGAATGCAATATGATGAGCTGTTTCCTGCACTATGCAATGAT
TATCCTGAAATATTTCCTCCAGAGTTCTACGCATGGGAGCAGTTCTTATGGGCCTGTGAG
CTTTGGTACTCCAATAGCATGAAAGTCATGTTTGCTGATGGAAAGCTGAGGACTTGTTTG
ATTCCCATTGCTGGCTTTCTTAACCACTCGCTATACCCACACATAATGCACTATGGCAAA
GTAGATTCTGCAACAAATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGCAGCGCTGGCGAA
CAATGTTATCTTAGTTATGGCAATTTTTCTACTTCACATCTTATTACATTCTATGGTTTC
TCACCCCAAGGCGACAACCCATATGATGTTATTCCTATCGATATTGATGTTAGCCAAGTT
GATTGTATTGAGGATTGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTGCGGGGTACTTGG
CTCTCAAACAATCACAATATTTTCCACTATGGCTTGCCATCTCCATTATTAGACTATTTA
AGGAGAGCTCGGAACCCTACACAGCAGGAAAAGACAATTTTACCAGCTAACTTGGAAACC
GAAATAGAGGTTCTTGAAGACCTCCAATTGACCTTTAGTGACATGCTGAAAAATCTTGGT
GATGCAGATTTTGTTGACAGGGAAAACACAAGCTGGGACGTAAAGTTGGCTGTGGAATTC
AAAGATCTCCAGAGGAGGATCGTATCATCAATTATAGCATCATGTTCTGCTGGACGCAAG
TTGGTTGAAACTGAACTGTCCAGATTTATGTCTGAAGAGTGA
>LITCHI016372.m3
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AACCAGAACAAAATGGATGCTAAAATTGATAGAAACTACATTTGCGAAAAGGAAAAGTGT
TTAGTACAATGGGGTGAGAGGAATGGTGTAAGAACAAAACTGGAGATTGCTTATGTAGAA
GGAGCTGGAAGAGGAGCCATTGCAATGAAAGATCTATGTATCGGAGATGTAGTGTTGGAG
ATCCCTGTGTCTATAATCATTTCTGAGGAGCTTGTGTACAAATCTGACATGTATAACAAA
TTGGGGAAGATGAATGGTATGTCCTCTGAGACTATGTTGTTACTGTGGAGTATGAAGGAG
AAGCACAATTGTGAGTCAAAATTCAAGAATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTTAAT
ACAGGATTGAGCTTTGGAGTTCAGGCAATCATGGCGTTGGAAGGGACCTTGTTGTTAGAA
GAGATAATGCAAGCAAAAGAGCACTTGCGAATGCAATATGATGAGCTGTTTCCTGCACTA
TGCAATGATTATCCTGAAATATTTCCTCCAGAGTTCTACGCATGGGAGCAGTTCTTATGG
GCCTGTGAGCTTTGGTACTCCAATAGCATGAAAGTCATGTTTGCTGATGGAAAGCTGAGG
ACTTGTTTGATTCCCATTGCTGGCTTTCTTAACCACTCGCTATACCCACACATAATGCAC
TATGGCAAAGTAGATTCTGCAACAAATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGCAGC
GCTGGCGAACAATGTTATCTTAGTTATGGCAATTTTTCTACTTCACATCTTATTACATTC
TATGGTTTCTCACCCCAAGGCGACAACCCATATGATGTTATTCCTATCGATATTGATGTT
AGCCAAGTTGATTGTATTGAGGATTGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTGCGG
GGTACTTGGCTCTCAAACAATCACAATATTTTCCACTATGGCTTGCCATCTCCATTATTA
GACTATTTAAGGAGAGCTCGGAACCCTACACAGCAGGAAAAGACAATTGTAATTTTTCTC
CCTATAAATCATCATGTTTTATGCATTCCTGTTGCCCATTTTCTGTTCTTAAAATCTTCT
ACCTAA
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CAACTTGATGTCTGGGAAGATTTACAAAAGGCAATCATCAAGAAGATCCATGAATTCTCT
AACCAGAACAAAATGGATGCTAAAATTGATAGAAACTACATTTGCGAAAAGGAAAAGTGT
TTAGTACAATGGGGTGAGAGGAATGGTGTAAGAACAAAACTGGAGATTGCTTATGTAGAA
GGAGCTGGAAGAGGAGCCATTGCAATGAAAGATCTATGTATCGGAGATGTAGTGTTGGAG
ATCCCTGTGTCTATAATCATTTCTGAGGAGCTTGTGTACAAATCTGACATGTATAACAAA
TTGGGGAAGATGAATGGTATGTCCTCTGAGACTATGTTGTTACTGTGGAGTATGAAGGAG
AAGCACAATTGTGAGTCAAAATTCAAGAATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTTAAT
ACAGGATTGAGCTTTGGAGTTCAGGCAATCATGGCGTTGGAAGGGACCTTGTTGTTAGAA
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TGCAATGATTATCCTGAAATATTTCCTCCAGAGTTCTACGCATGGGAGCAGTTCTTATGG
GCCTGTGAGCTTTGGTACTCCAATAGCATGAAAGTCATGTTTGCTGATGGAAAGCTGAGG
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TATGGCAAAGTAGATTCTGCAACAAATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGCAGC
GCTGGCGAACAATGTTATCTTAGTTATGGCAATTTTTCTACTTCACATCTTATTACATTC
TATGGTTTCTCACCCCAAGGCGACAACCCATATGATGTTATTCCTATCGATATTGATGTT
AGCCAAGTTGATTGTATTGAGGATTGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTGCGG
GGTACTTGGCTCTCAAACAATCACAATATTTTCCACTATGGCTTGCCATCTCCATTATTA
GACTATTTAAGGAGAGCTCGGAACCCTACACAGCAGGAAAAGACAATTTTACCAGCTAAC
TTGGAAACCGAAATAGAGGTTCTTGAAGACCTCCAATTGACCTTTAGTGACATGCTGAAA
AATCTTGGTGATGCAGATTTTGTTGACAGGGAAAACACAAGCTGGGACGTAAAGTTGGCT
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GGACGCAAGTTGGTTGAAACTGAACTGTCCAGATTTATGTCTGAAGAGTGA
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GAAGGAGCTGGAAGAGGAGCCATTGCAATGAAAGATCTATGTATCGGAGATGTAGTGTTG
GAGATCCCTGTGTCTATAATCATTTCTGAGGAGCTTGTGTACAAATCTGACATGTATAAC
AAATTGGGGAAGATGAATGGTATGTCCTCTGAGACTATGTTGTTACTGTGGAGTATGAAG
GAGAAGCACAATTGTGAGTCAAAATTCAAGAATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTT
AATACAGGATTGAGCTTTGGAGTTCAGGCAATCATGGCGTTGGAAGGGACCTTGTTGTTA
GAAGAGATAATGCAAGCAAAAGAGCACTTGCGAATGCAATATGATGAGCTGTTTCCTGCA
CTATGCAATGATTATCCTGAAATATTTCCTCCAGAGTTCTACGCATGGGAGCAGTTCTTA
TGGGCCTGTGAGCTTTGGTACTCCAATAGCATGAAAGTCATGTTTGCTGATGGAAAGCTG
AGGACTTGTTTGATTCCCATTGCTGGCTTTCTTAACCACTCGCTATACCCACACATAATG
CACTATGGCAAAGTAGATTCTGCAACAAATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGC
AGCGCTGGCGAACAATGTTATCTTAGTTATGGCAATTTTTCTACTTCACATCTTATTACA
TTCTATGGTTTCTCACCCCAAGGCGACAACCCATATGATGTTATTCCTATCGATATTGAT
GTTAGCCAAGTTGATTGTATTGAGGATTGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTG
CGGGGTACTTGGCTCTCAAACAATCACAATATTTTCCACTATGGCTTGCCATCTCCATTA
TTAGACTATTTAAGGAGAGCTCGGAACCCTACACAGCAGGAAAAGACAATTTTACCAGCT
AACTTGGAAACCGAAATAGAGGTTCTTGAAGACCTCCAATTGACCTTTAGTGACATGCTG
AAAAATCTTGGTGATGCAGATTTTGTTGACAGGGAAAACACAAGCTGGGACGTAAAGTTG
GCTGTGGAATTCAAAGATCTCCAGAGGAGGATCGTATCATCAATTATAGCATCATGTTCT
GCTGGACGCAAGTTGGTTGAAACTGAACTGTCCAGATTTATGTCTGAAGAGTGA
>LITCHI016372.m6
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TGTGAGTCAAAATTCAAGAATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTTAATACAGGATTG
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TATCCTGAAATATTTCCTCCAGAGTTCTACGCATGGGAGCAGTTCTTATGGGCCTGTGAG
CTTTGGTACTCCAATAGCATGAAAGTCATGTTTGCTGATGGAAAGCTGAGGACTTGTTTG
ATTCCCATTGCTGGCTTTCTTAACCACTCGCTATACCCACACATAATGCACTATGGCAAA
GTAGATTCTGCAACAAATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGCAGCGCTGGCGAA
CAATGTTATCTTAGTTATGGCAATTTTTCTACTTCACATCTTATTACATTCTATGGTTTC
TCACCCCAAGGCGACAACCCATATGATGTTATTCCTATCGATATTGATGTTAGCCAAGTT
GATTGTATTGAGGATTGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTGCGGGGTACTTGG
CTCTCAAACAATCACAATATTTTCCACTATGGCTTGCCATCTCCATTATTAGACTATTTA
AGGAGAGCTCGGAACCCTACACAGCAGGAAAAGACAATTTTACCAGCTAACTTGGAAACC
GAAATAGAGGTTCTTGAAGACCTCCAATTGACCTTTAGTGACATGCTGAAAAATCTTGGT
GATGCAGATTTTGTTGACAGGGAAAACACAAGCTGGGACGTAAAGTTGGCTGTGGAATTC
AAAGATCTCCAGAGGAGGATCGTATCATCAATTATAGCATCATGTTCTGCTGGACGCAAG
TTGGTTGAAACTGAACTGTCCAGATTTATGTCTGAAGAGTGA
>LITCHI016372.m7
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GAAGCCCTGAATTTGGTCCTTTTGCTTGTTAAGTCCTTGCTCACTAGTCAAATGCACAAG
CAACTTGATGTCTGGGAAGATTTACAAAAGGCAATCATCAAGAAGATCCATGAATTCTCT
AACCAGAACAAAATGGATGCTAAAATTGATAGAAACTACATTTGCGAAAAGGAAAAGTGT
TTAGTACAATGGGGTGAGAGGAATGGTGTAAGAACAAAACTGGAGATTGCTTATGTAGAA
GGAGCTGGAAGAGGAGCCATTGCAATGAAAGATCTATGTATCGGAGATGTAGTGTTGGAG
ATCCCTGTGTCTATAATCATTTCTGAGGAGCTTGTGTACAAATCTGACATGTATAACAAA
TTGGGGAAGATGAATGGTATGTCCTCTGAGACTATGTTGTTACTGTGGAGTATGAAGGAG
AAGCACAATTGTGAGTCAAAATTCAAGAATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTTAAT
ACAGGATTGAGCTTTGGAGTTCAGGCAATCATGGCGTTGGAAGGGACCTTGTTGTTAGAA
GAGATAATGCAAGCAAAAGAGCACTTGCGAATGCAATATGATGAGCTGTTTCCTGCACTA
TGCAATGATTATCCTGAAATATTTCCTCCAGAGTTCTACGCATGGGAGCAGTTCTTATGG
GCCTGTGAGCTTTGGTACTCCAATAGCATGAAAGTCATGTTTGCTGATGGAAAGCTGAGG
ACTTGTTTGATTCCCATTGCTGGCTTTCTTAACCACTCGCTATACCCACACATAATGCAC
TATGGCAAAGTAGATTCTGCAACAAATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGCAGC
GCTGGCGAACAATGTTATCTTAGTTATGGCAATTTTTCTACTTCACATCTTATTACATTC
TATGGTTTCTCACCCCAAGGCGACAACCCATATGATGTTATTCCTATCGATATTGATGTT
AGCCAAGTTGATTGTATTGAGGATTGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTGCGG
GGTACTTGGCTCTCAAACAATCACAATATTTTCCACTATGGCTTGCCATCTCCATTATTA
GACTATTTAAGGAGAGCTCGGAACCCTACACAGCAGGAAAAGACAATTTTACCAGCTAAC
TTGGAAACCGAAATAGAGGTTCTTGAAGACCTCCAATTGACCTTTAGTGACATGCTGAAA
AATCTTGGTGATGCAGATTTTGTTGACAGGGAAAACACAAGCTGGGACGTAAAGTTGGCT
GTGGAATTCAAAGATCTCCAGAGGAGGATCGTATCATCAATTATAGCATCATGTTCTGCT
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>LITCHI016372.m3
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ATAAAAAGAAGGTGAAATTTTGGGAAATTACTGCATGAGAAGGGCTTTGGTGTCAAGGAA
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GGTGTAAGAACAAAACTGGAGATTGCTTATGTAGAAGGAGCTGGAAGAGGAGCCATTGCA
ATGAAAGATCTATGTATCGGAGATGTAGTGTTGGAGATCCCTGTGTCTATAATCATTTCT
GAGGAGCTTGTGTACAAATCTGACATGTATAACAAATTGGGGAAGATGAATGGTATGTCC
TCTGAGACTATGTTGTTACTGTGGAGTATGAAGGAGAAGCACAATTGTGAGTCAAAATTC
AAGAATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTTAATACAGGATTGAGCTTTGGAGTTCAG
GCAATCATGGCGTTGGAAGGGACCTTGTTGTTAGAAGAGATAATGCAAGCAAAAGAGCAC
TTGCGAATGCAATATGATGAGCTGTTTCCTGCACTATGCAATGATTATCCTGAAATATTT
CCTCCAGAGTTCTACGCATGGGAGCAGTTCTTATGGGCCTGTGAGCTTTGGTACTCCAAT
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AATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGCAGCGCTGGCGAACAATGTTATCTTAGT
TATGGCAATTTTTCTACTTCACATCTTATTACATTCTATGGTTTCTCACCCCAAGGCGAC
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TGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTGCGGGGTACTTGGCTCTCAAACAATCAC
AATATTTTCCACTATGGCTTGCCATCTCCATTATTAGACTATTTAAGGAGAGCTCGGAAC
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ATTCCTGTTGCCCATTTTCTGTTCTTAAAATCTTCTACCTAACTACGTTTTTCTATAATG
TTTTTGAGTTTTTCATCTGGCATTTTCGAAAAATTTTCTTGAAGTAGATTATATGTCATT
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TTTTTGTTTTACATTGTCAATGTTTCCAGTTACCAGCTAACTTGGAAACCGAAATAGAGG
TTCTTGAAGACCTCCAATTGACCTTTAGTGACATGCTGAAAAATCTTGGTGATGCAGATT
TTGTTGACAGGGAAAACACAAGCTGGGACGTAAAGTTGGCTGTGGAATTCAAAGATCTCC
AGAGGAGGATCGTATCATCAATTATAGCATCATGTTCTGCTGGACGCAAGTTGGTTGAAA
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>LITCHI016372.m4
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ATGTAGTTATTGTTGGGTTTTTTTGTTTGTTCTCTGCAGCTGTGTTCGTCTGATAAGAGT
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>LITCHI016372.m1
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>LITCHI016372.m2
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CTACTTCACATCTTATTACATTCTATGGTTTCTCACCCCAAGGCGACAACCCATATGATG
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>LITCHI016372.m7
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GGTCCTTTTGCTTGTTAAGTCCTTGCTCACTAGTCAAATGCACAAGCAACTTGATGTCTG
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AGAGGTTCTTGAAGACCTCCAATTGACCTTTAGTGACATGCTGAAAAATCTTGGTGATGC
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>LITCHI016372.m5
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AATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTTAATACAGGATTGAGCTTTGGAGTTCAGGCA
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ATGAAAGTCATGTTTGCTGATGGAAAGCTGAGGACTTGTTTGATTCCCATTGCTGGCTTT
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GTCATGTTTTTAGATGTTATAGAA
>LITCHI016372.m6
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ATGTAGTTATTGTTGGGTTTTTTTGTTTGTTCTCTGCAGCTGTGTTCGTCTGATAAGAGT
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CCTCAAGAATTCTTCTTCGTCTGATTCGATGAGTGAAACTTTGGAAACAATGCTTCAGAT
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TGGATCGTACAGCAGCAGGAATGAGGTGGAAGCCCTGAATTTGGTCCTTTTGCTTGTTAA
GTCCTTGCTCACTAGTCAAATGCACAAGCAACTTGATGTCTGGGAAGATTTACAAAAGGC
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TTGCTGGCTTTCTTAACCACTCGCTATACCCACACATAATGCACTATGGCAAAGTAGATT
CTGCAACAAATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGCAGCGCTGGCGAACAATGTT
ATCTTAGTTATGGCAATTTTTCTACTTCACATCTTATTACATTCTATGGTTTCTCACCCC
AAGGCGACAACCCATATGATGTTATTCCTATCGATATTGATGTTAGCCAAGTTGATTGTA
TTGAGGATTGCCCCATGTCTAACTGGACCACCCACATGGTGCGGGGTACTTGGCTCTCAA
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TCCAGAGGAGGATCGTATCATCAATTATAGCATCATGTTCTGCTGGACGCAAGTTGGTTG
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ACAATGGGGTGAGAGGAATGGTGTAAGAACAAAACTGGAGATTGCTTGTGAGTTTCTGAG
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CTAAAGTGGGGATGGGAAGAATCTACCCTGTTATCGTTCCTGACAATTCAACTCTTTATG
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CTCATTTGGAAAATATATAGGGTTACGTCCAACATTTTATGAATTTCATCTACGTAAGCT
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TTTTCTTCTTTTATGATACCTGTATAGCTACAGCTGAAAATTCATGGCGCAGAAAATTCC
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AAATATAATTTTGCAGAGAGATTTACCTTCTGATGAAGAGAAGGGGATAGGCTTCTTGCA
TTATGTGTGGAGGACATGCTTTAGCTGCTGAGCAATTGACCTCTGAAATGTTATATGTAT
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>LITCHI016372.m7 +  Up_Stream_Len 2000
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TTTTAAATCCCAAAATACAAAAATCAATTTCTTATTTTTATTTAATAACCAAAAAAAAAC
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ATAATTATTTTATTTTAATTTTTGAGATAATCCTATTTTTTATTGTAGTTTGATATAATA
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>LITCHI007166.m2 GenomeSequence - 
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>LITCHI007166.m3 GenomeSequence - 
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