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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016372 | Chr1 | 34441627;34441859;34441888 | 34447534 | + | "Ribulose-1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit N-methyltransferase, chloroplastic " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016372.m1 | 123 | 330 | PF00856.31 | SET | Family | 36.5 | 6.50E-09 |
LITCHI016372.m2 | 24 | 112 | PF09273.14 | Rubis-subs-bind | Domain | 23.2 | 9.40E-05 |
LITCHI016372.m2 | 180 | 387 | PF00856.31 | SET | Family | 36.2 | 8.20E-09 |
LITCHI016372.m3 | 123 | 330 | PF00856.31 | SET | Family | 36.9 | 4.90E-09 |
LITCHI016372.m4 | 123 | 330 | PF00856.31 | SET | Family | 36.5 | 6.50E-09 |
LITCHI016372.m5 | 24 | 231 | PF00856.31 | SET | Family | 37.3 | 3.70E-09 |
LITCHI016372.m7 | 123 | 330 | PF00856.31 | SET | Family | 36.5 | 6.50E-09 |
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>LITCHI016372.m1 ATGAGTGAAACTTTGGAAACAATGCTTCAGATAGGAAGAATTATCTGCTTAGATGAGGTG GAACTTTACTTTGGTGAATTTGGAACACAATCTGGATCGTACAGCAGCAGGAATGAGGTG GAAGCCCTGAATTTGGTCCTTTTGCTTGTTAAGTCCTTGCTCACTAGTCAAATGCACAAG CAACTTGATGTCTGGGAAGATTTACAAAAGGCAATCATCAAGAAGATCCATGAATTCTCT AACCAGAACAAAATGGATGCTAAAATTGATAGAAACTACATTTGCGAAAAGGAAAAGTGT TTAGTACAATGGGGTGAGAGGAATGGTGTAAGAACAAAACTGGAGATTGCTTATGTAGAA GGAGCTGGAAGAGGAGCCATTGCAATGAAAGATCTATGTATCGGAGATGTAGTGTTGGAG ATCCCTGTGTCTATAATCATTTCTGAGGAGCTTGTGTACAAATCTGACATGTATAACAAA TTGGGGAAGATGAATGGTATGTCCTCTGAGACTATGTTGTTACTGTGGAGTATGAAGGAG AAGCACAATTGTGAGTCAAAATTCAAGAATTATTTCGACACTCTACCACAAAAGTTTAAT ACAGGATTGAGCTTTGGAGTTCAGGCAATCATGGCGTTGGAAGGGACCTTGTTGTTAGAA GAGATAATGCAAGCAAAAGAGCACTTGCGAATGCAATATGATGAGCTGTTTCCTGCACTA TGCAATGATTATCCTGAAATATTTCCTCCAGAGTTCTACGCATGGGAGCAGTTCTTATGG GCCTGTGAGCTTTGGTACTCCAATAGCATGAAAGTCATGTTTGCTGATGGAAAGCTGAGG ACTTGTTTGATTCCCATTGCTGGCTTTCTTAACCACTCGCTATACCCACACATAATGCAC TATGGCAAAGTAGATTCTGCAACAAATACCTTGAAGTTCCCTCTATCAAGGCCTTGCAGC 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