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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI016333 | Chr1 | 33614143 | 33616290 | - | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 5 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI016333.m1 | 62 | 107 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 27.7 | 2.50E-06 |
| LITCHI016333.m1 | 299 | 341 | PF06203.17 | CCT | Motif | 63.9 | 1.20E-17 |
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>LITCHI016333.m1 ATGGGAATCGACTTGGAAACCGTGAGGGGGATTTCCGGAGGCTGGGGCGTGGCCGCCAAG CCCTGCGACTCCTGCAAAGCGGCCGCAGCGGCCATCTTCTGCAGACCCGACTCTGCTTTC CTCTGTCTCAACTGCGACTCCAGGATCCACGGCGTCAACAAGCTTGCCTCCCGCCATGAG CGGGTCTGGATGTGCGAGGTCTGTGAGCAGGCACCGGCCGCCGTCACCTGCAAGGCCGAT GCAGCCGCCCTCTGCGTCACCTGCGATAACGACATCCACTCCGCCAACCCTCTGGCGCGG CGCCACGAGCGGACCCCTGTTGAGCCCTTCTACGACTCAGCCGACTCGATTGTCAAGTCT TCGGCTTTCAATTTCCTGGTGCCGGCCGAAAACGGCGGCTCAGAGTTCGCAGGCGCGTGT CAGGACGGCGTGGAAGCGGGGTCCTGGATGTTGCAGAATTCGAAACTAGGCTTGGAAAAC GCTACGGACGTGAAATCCGGGGACATGTTTTTCTCGGAGATGGATCCGTTTATCGAATTT GAGTATCAGAATTCGTTTCAAAACCATCACAGTGCGGCTATGGATAGTGTAGTACCCGTT CAGACAACTAAACCCGCCCCGATTCCGATGATCAACAATGAAAATTGCTTCGATATCGAT TTCTGCCGATCCAAGCTCTCTTCTTTGAGTTACCCAACTCAGTCCATCAGCCAAAGTGTT TCATCGTCATCGCTTGATGTTGGGGTTGTTCCAGATGGAAACTCCATGTCTGATATATCG TACCCTTTTGGCCGAAACATGACCAACGGGACCGATCCTACCGTACCGGTCTCTGCGTCT GCAGCAGCAGCTGCGGCTACTGCAAACCAAGCGACCCAGCTTTGCGGTGTGGATCGCGAA GCTAGAGTTTTGCGTTACAGAGAGAAGAGAAAGAACCGCAAATTCGAGAAGACCATCCGC TACCACTCACGTAAAGCCTACGCCGAAACCAGACCCAGAATCAAAGGCCGGTTTGCCAAA CGGACCGACGCGGACTCTGATGTTGACCGCCTCTACAGTACCCATGCGGCCGTTGCAGCC GCCTTCATGGCCGATTCTCAATACGGGGTCGTTCCATCCTTTTAG
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>LITCHI016333.m1 MGIDLETVRGISGGWGVAAKPCDSCKAAAAAIFCRPDSAFLCLNCDSRIHGVNKLASRHE RVWMCEVCEQAPAAVTCKADAAALCVTCDNDIHSANPLARRHERTPVEPFYDSADSIVKS SAFNFLVPAENGGSEFAGACQDGVEAGSWMLQNSKLGLENATDVKSGDMFFSEMDPFIEF EYQNSFQNHHSAAMDSVVPVQTTKPAPIPMINNENCFDIDFCRSKLSSLSYPTQSISQSV SSSSLDVGVVPDGNSMSDISYPFGRNMTNGTDPTVPVSASAAAAAATANQATQLCGVDRE ARVLRYREKRKNRKFEKTIRYHSRKAYAETRPRIKGRFAKRTDADSDVDRLYSTHAAVAA AFMADSQYGVVPSF.
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>LITCHI016333.m1 GTATCACGAAAATCTTAATCAAACCCACTGTCATTTCATCTTTTCTCTCACAAAGGCCTG GTCCCACGTCGGCACAGACACATTGACAACTACTTCTCCCAAATGAAATTATTTTATTAA AAATACAAAGTAATAACATTATTAAATAATAAATTTTTACGTGGCCTAGGCTACTCCACG TGTCCCTCTACCACTCGTTATCACCTAGATTTCCAAAAACAAAAAATCCAGAAAACTGAA CATATCAAAAACCAGTTCAAGCTCCTCTCCACGTTTACTTCAAAATCACATATCCCGTAG AAACAGAGAAATAAAGACGAAAAAAAGAAAAATAAAAAACCAAATCTACAGGGTTTGATT GTTTGGTGATGGGAATCGACTTGGAAACCGTGAGGGGGATTTCCGGAGGCTGGGGCGTGG CCGCCAAGCCCTGCGACTCCTGCAAAGCGGCCGCAGCGGCCATCTTCTGCAGACCCGACT CTGCTTTCCTCTGTCTCAACTGCGACTCCAGGATCCACGGCGTCAACAAGCTTGCCTCCC GCCATGAGCGGGTCTGGATGTGCGAGGTCTGTGAGCAGGCACCGGCCGCCGTCACCTGCA AGGCCGATGCAGCCGCCCTCTGCGTCACCTGCGATAACGACATCCACTCCGCCAACCCTC TGGCGCGGCGCCACGAGCGGACCCCTGTTGAGCCCTTCTACGACTCAGCCGACTCGATTG TCAAGTCTTCGGCTTTCAATTTCCTGGTGCCGGCCGAAAACGGCGGCTCAGAGTTCGCAG GCGCGTGTCAGGACGGCGTGGAAGCGGGGTCCTGGATGTTGCAGAATTCGAAACTAGGCT TGGAAAACGCTACGGACGTGAAATCCGGGGACATGTTTTTCTCGGAGATGGATCCGTTTA TCGAATTTGAGTATCAGAATTCGTTTCAAAACCATCACAGTGCGGCTATGGATAGTGTAG TACCCGTTCAGACAACTAAACCCGCCCCGATTCCGATGATCAACAATGAAAATTGCTTCG ATATCGATTTCTGCCGATCCAAGCTCTCTTCTTTGAGTTACCCAACTCAGTCCATCAGCC AAAGTGTTTCATCGTCATCGCTTGATGTTGGGGTTGTTCCAGATGGAAACTCCATGTCTG ATATATCGTACCCTTTTGGCCGAAACATGACCAACGGGACCGATCCTACCGTACCGGTCT CTGCGTCTGCAGCAGCAGCTGCGGCTACTGCAAACCAAGCGACCCAGCTTTGCGGTGTGG ATCGCGAAGCTAGAGTTTTGCGTTACAGAGAGAAGAGAAAGAACCGCAAATTCGAGAAGA CCATCCGCTACCACTCACGTAAAGCCTACGCCGAAACCAGACCCAGAATCAAAGGCCGGT TTGCCAAACGGACCGACGCGGACTCTGATGTTGACCGCCTCTACAGTACCCATGCGGCCG TTGCAGCCGCCTTCATGGCCGATTCTCAATACGGGGTCGTTCCATCCTTTTAGAAAACCT CATTCGAGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACTATCATGATCCTGTAATTCTTGCTTAGAA GTTTTAATTGTGGGACTAAAATAATCGTACGGTTGGTGTTAGTTGTTGAACATGTTTTTG ATGTAAAATAGGGTATCTGGTGGCGTTTTAGCCGACAGACTTCGCAGGAGTATGATGATA TGATGAAGCCGTTGTATGATATCCTCTCCCTGCTCAAAATCAAAAAGCCCGTTTACTTTT TCTATGGGGGCTTACTGTAACTTCATTTCCAGTTAAAGTAAAGTTTTCATTCTCTCTTCA TTATCTATTTCTCCATTCCTATTGGTCCTATAATTATTTAGATTTTCTTATATATTCTTG GAATATAACGTCATGATTGGATTCCATTGTTGTAATGGTACAGTAAGGCTACACTTAACG AGTTTCAATCATTTAAGTAGGGCTTCGTAAGTTATATATAGTATAATTTTTTTTTTTTGA GGCAGTATAGTTTTGAAGTTAAATATATTATATTCATGTTTCTTAGGGTCGTGGAGTTCA ATGTCTT
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>LITCHI029714.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGAATTGTGCACTAACAAAGAATAATTAAAAAACAAAAACTAACCAATGGATTTAGTTCG ATTTGGTTCCGTATCATATAATGAAACCGAACTGGTTTTTCTCCAATTCTACATCACCCC TTTATAAAATTAGTTTAGGAATTGCAAAGCAACTCTTAATTAATTTGGTTATGCATTACC TACCATCACCTCCATCTTTTTAAGGGCTACTTACTTGTAAATATATACAAGTGTGGAGAG ACTTGCCCTGTTCTAGTAAACTAGTTATTCAAACATGCCTGCAGTGTTTGGTTTAGATAG ATATCAAGTTATCAACGGACATGAATTAACTTTTGTTTTTCAGTTTTCCATCATGTTATT ATCACTAATTAAATCATAACTTGCTTTAATCTGTTCATTTGAGCATTGGGCCACCAACGG ACCTAACTATTTGAAGTGGTAGGGCCTACGTGAGCAAATCCAACTCAAAAACGAACTCAA ACTAGAAGTGGGCCACTAAGTGATAGATAGCGTAAAAATGGGCCGGCCTTGTTGGCCCAG TTCTGATGATAAAATGAATCTCAGCCGTCGGATGAAGGGCCCCACATGTGTCAGTCCCAC CAGCAACATGAGACGGTTGTTGACCCACCGCACTGGACCTTATCCAACGGTTCAAAGTCA AAAACAAGTAACCATCTTTTGGTGACCATTATACCCCGTAACATCCACTCTAATCTAACC CAACCTAGTGTAGAAAGTGAGATCCATTGATAGGCAATATAGTCATTTCAATAATCACTT TTCGCTCTGCTGCTAAAGACAAGACAGTTTCTCCTTTCAGTTCGCATCTCTTTTTATCAT TATCCTTCCCCATCCCTATCTCTTCAACCTTTTCAATTTACAAATTTACCCCCACTCACC 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