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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI016323Chr13351843633523386+Zinc finger CCCH domain-containing protein 16

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI016323.m1326PF00642.27zf-CCCHFamily395.80E-10
LITCHI016323.m1726PF18044.4zf-CCCH_4Domain31.89.50E-08
LITCHI016323.m1826PF18345.4zf_CCCH_4Domain30.62.60E-07
LITCHI016323.m2326PF00642.27zf-CCCHFamily38.95.90E-10
LITCHI016323.m2726PF18044.4zf-CCCH_4Domain31.79.80E-08
LITCHI016323.m2826PF18345.4zf_CCCH_4Domain30.62.60E-07
LITCHI016323.m3326PF00642.27zf-CCCHFamily39.34.60E-10
LITCHI016323.m3726PF18044.4zf-CCCH_4Domain32.17.60E-08
LITCHI016323.m3826PF18345.4zf_CCCH_4Domain30.92.10E-07
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>LITCHI016323.m1
ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC
CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT
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TCCTGCAGACGCCTAATTGTTGAAGATTTTGAGCATGAGAGACCGCTTTGGAAGCTTACT
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TTGCGGGCAGCAGCATATGATGATGCTAAGCGTGGGTTGAGCTTGCAGTCTATAGTTGAA
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AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT
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>LITCHI016323.m2
ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC
CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT
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AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT
CAAAATAGTGCCCCTCCTACAGTCTCCAGTTTTAGTCATTTAGGATCATCAATCAATAAT
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AATTCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGC
TCATTTGGCAACCAATTTCCAGCCCAGGCAACCAGAAGTTCCTTTACCTCCAACACAACA
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AATCAGTTTTCTGTGCTCCCCAGCAAGCCTGTAACATCTACGAATGCAGCTGAGCAAGGA
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ATTTGGTTAAAAGAAAAATGGATTCCTGGAGAGGTAAAGGACTTTATTTGTGCAATTATT
GTTGTTATTTGTTTAGTAGGACTTTCGAATAGATTCTGA
>LITCHI016323.m3
ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC
CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT
CAACCCCAGAGGCCCAATCCTTTTGGCTTTGGTGTTCCCACCAATTCTCAACCAAAGCAG
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TTGCGGGCAGCAGCATATGATGATGCTAAGCGTGGGTTGAGCTTGCAGTCTATAGTTGAA
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TATACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTC
AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT
CAAAATAGTGCCCCTCCTACAGTCTCCAGTTTTAGTCATTTAGGATCATCAATCAATAAT
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AATTCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGT
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>LITCHI026110.m1
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SVKCGSSSRCHCSKKRKHRVKRSIKVPAISNKLADIPPDDYSWRKYGQKPIKGSPHPRGY
YKCSSMRGCPARKHVERCLEDPSMLIVTYEGEHNHQRLPSQSANA.
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>LITCHI026110.m1
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GTTTATAGTATATAAACAGAATGAAATCCAAACCAGGTCAGTCAGTTGTAAAACAGCAAA
CCCAAGTTTAGTAGTTGAAGTGAAACTAGACACAGAGATACAAATATGCATATCTGGAGT
CTGGACTGGAAACAGTAAGACTGAAGCCGAATACCAAAAAAGAATAATAAATAAATAATA
TAATAGCCTTTATTAAAACAATAGAGTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAATAACC
AAGGTCTTTGGTGTGGTCCCAGTCTCAAATCTGTGACAGAGACGGCAGTTTCATTTCTCT
CTCTCTCCTCTTCTCTGCTACATATACCCTTTATTTAAACACATTTCTCTCTTGTCTCTC
TCTATTTCTAGTTTTTCTTTGTGGAGTTATGTTTTTATTTTTCTGCTTATAATAATAATT
ATTGTAGAAACAGAAGAAATAAAGAAATGGGAGTTTTGTAGTCTTATGGAGGTGTGAATT
CTCAAGCGAAGCAAAAGTCTTCTCTTCACACCTCTCTCAATCTCTATTGCAGGTGAAGAA
TCTAGGGTTTGACAGCAACAACTCCTACAAAGAGACTACCCAGTTGAATCTGATCTTCTC
AGCCTTATTTCATTTCGACAATTTTGGCTTTTGACAACTGCTGTTTCTTTAAATTCTGTT
TGGGCGTTGGAGTTTTGCTTTGTTTAAAACTTGAAATTTGAGTTTGTGGCCTTTTCATGA
AGATCTGTTCTGCTGTTAAATTTAAGATCGTTTAGAGTTATTTTATGGCTTGTGTCTGAT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTAGGTTTTTTTTTTTTAATTATTATTATTATTATTTT
GTGGGTGGGTGTTGTGGTTAAGAAAGATGGAGGCGGTCGAAGAAGCTAACAAGGTAGCTG
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GGAATTTGATGGTGGAAACTGGAGAAGCTGTCTTTAGGTTCAAAAGAGTTGTGTCTCTTC
TCAATACTGGTTTGGGTCATGCAAGAGTGAGAAAGCTCAAGCAGTTACCAACTCCTTGTA
ACCAATCCATCCTCTTAGATAAGGCTGACATTCCATCCAAGAATCTGCAGTTTCTCCACC
CTGGTTACCATGAAACCCACCCAATTCAAGGAATGGGGTCTCTTGCTAAAAGTTCGTTAT
CTCTAGGGAACCCATCATTGGAGTTGCTCTCTAATGGTAAAAACCATCTCCAACTCAACC
AGCAAACACCTTCGTCGCACTATAATTTCCTTCAGCATCAGCAGCAGCAGCAGCTACAAC
AGAGGTTTCAACTCCAGCAACAGCAAATGAAACTTCAAGCTGAAATGATGCTTAGGAAGA
GCAACAGTGGCGTCAACCTGAATTTCGATAGCTCTAGCTGTACGCCGACTATGTCGTCCA
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CCTTCCATTTGATTGGGGCGCCTCGCTCTTCGGATCAGAGCTCGCAGCAACACAAGAGGA
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GCTCGAAGAAGAGGAAACATAGGGTGAAGAGGTCAATCAAGGTGCCTGCTATCAGCAACA
AGCTTGCGGACATCCCTCCTGATGATTATTCATGGAGGAAGTATGGGCAGAAGCCAATCA
AGGGTTCTCCGCACCCTAGGGGATATTACAAATGTAGCAGCATGAGAGGTTGTCCTGCAA
GGAAGCATGTCGAGAGGTGCTTGGAAGACCCATCGATGCTTATTGTTACGTATGAAGGCG
AGCATAACCACCAAAGGTTACCATCACAATCTGCAAATGCATAA
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>LITCHI026110.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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CTCAATTTTACACGTGGAGAATATCTGTTGGGAGGAGTCGTCGTCCGGTCTCGCAACGGC
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AGCGAAGATTGATTGAGTTGAGAGATAAAAAAATTAAAAATAAAAACAAAATTGAAAATA
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CTGGCCCTTTTCTTTTTAGACTTTGCCAATCAAGTTGAGAGTTCCCTGTTTTCTTTGTTT
TCTAAAGGGTTTGTTTTTTTATTGGTCTTGCCCTTTGGTCAATTCATGTTGCAACTAAAT
TTCCTAATGTTTTATCTATAATCAGTCAGTCACTCTTTTGTATTCTTCTTCAAAATCAAC
TAAAATTAGTTAGAAGTTTCATCACATTAGGCACATTTTTAACGAAGCCTATGTTGACTT
CAAAATCAACTTGAATTCATGCTCTCAAAAAAGCTTGTGGCCAACTACAGTTGCCAATTT
TGCATAATCAATTTTGGGATAAAATGCAATTGTGAAATTATCTACCATATTTTCAGATGG
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TAAAAGATACGTTACAAACACCAAACCCACTCCACTTTGAGAAATTGGAAAGTACCAAAC
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CAGTTGAGCTGGTGTAATTATGCTTAGTGACAGTTTATAGTATATAAACAGAATGAAATC
CAAACCAGGTCAGTCAGTTGTAAAACAGCAAACCCAAGTTTAGTAGTTGAAGTGAAACTA
GACACAGAGATACAAATATGCATATCTGGAGTCTGGACTGGAAACAGTAAGACTGAAGCC
GAATACCAAAAAAGAATAATAAATAAATAATATAATAGCCTTTATTAAAACAATAGAGTT
GAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAATAACCAAGGTCTTTGGTGTGGTCCCAGTCTCAA
ATCTGTGACAGAGACGGCAGTTTCATTTCTCTCTCTCTCCTCTTCTCTGCTACATATACC
CTTTATTTAAACACATTTCTCTCTTGTCTCTCTCTATTTCTAGTTTTTCTTTGTGGAGTT
ATGTTTTTATTTTTCTGCTTATAATAATAATTATTGTAGAAACAGAAGAAATAAAGAAAT
GGGAGTTTTGTAGTCTTATGGAGGTGTGAATTCTCAAGCGAAGCAAAAGTCTTCTCTTCA
CACCTCTCTCAATCTCTATTGCAGGTGAAGAATCTAGGGTTTGACAGCAACAACTCCTAC
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CTCAAATATCATTTTATTTCCTTTGTTTCATTTACCTGTACCTGTTATCTGCTTGTGTTC
ATATCTCCTTTTTTTGTCATTTTCACAGACTACCCAGTTGAATCTGATCTTCTCAGCCTT
ATTTCATTTCGACAATTTTGGCTTTTGACAACTGCTGTTTCTTTAAATTCTGTTTGGGCG
TTGGAGTTTTGCTTTGTTTAAAACTTGAAATTTGAGTTTGTGGCCTTTTCATGAAGATCT
GTTCTGCTGTTAAATTTAAGATCGTTTAGAGTTATTTTATGGCTTGTGTCTGATTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTGGGTTAGGTTTTTTTTTTTTAATTATTATTATTATTATTTTGTGGGT
GGGTGTTGTGGTTAAGAAAG
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>LITCHI021505.m1 GenomeSequence - 
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TGGGGTTGTGACGTAGATTCACTGGATAACGCTTCTGCCCTCCAGAAATGGCTGTCTGAG
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GTTGCTTTGAAGAACATCAGGAAGGGTGAGAAGTTGCTCTTTGTTCCACCCTCTCTTGTC
ATCACTGCTGACTCGGTAAAATTTCTCTTTCTTTTCATCTATCAATCAAAAAAGTTGTTC
GCTTGTTACTAGTTTTTGTTTTTTGGTAGTTCTCTTCAATCAATGCAAGCTGTTATCTTT
TTGTTTGTGTTTCAATGAGGGCTTTTGTTGTGTTGTTTGTTTGATTTCACAGGGTTGATA
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CAGTACATGTAATGCTGTTGATTTGTTGTAGTAGTCCTCTAGTTTTCTTCAATGGAAATT
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TTTGTATGTGGATGTTGGTTGTAAATTGTGGATGATAGCAATGGGGCTGTCCAGAGGCTG
GTGAAGTGTTGAAGCAGTATTCAGTTCCGGATTGGCCATTGCTTGCAATCTATTTGATTA
GTGAAGCAAGTCTTGAGAAATCTTCAAGATGGAGCAATTACATCTCTGCGTTACCCCGCC
AGCCTTATTCGCTTCTTTATTGGTGAGTTTCTGTGCTTCACTGCTTGTTTTGTGGTGGGG
TTCTTTGAGAGTTTAATTCTTTGCTACGGAAAGGGTCTACTCTCAGTGTTTCTCCCTACA
GACTCTCTATGTCATTTCAGGACAAGTGCTGAACTAGATAGGTATTTGGAAGCTTCGCAG
ATTAGAGAGCGGGCGATTGAAAGGATTACCAACGTCATTGGAACGTAGGAATTTGTTATT
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TATCGTTAGACAGTAAAAACAATGATCAATCAATATAATACTAGTCTATATCTCCAGGCT
ATTTTACTAGTCTGTATCTCTAGAAGACAGTAAAAACGATGATCAATCCATATAATACTT
CAGTACATTCTATACTGGAACCTTGTCAGGTGTTCTATAGACACTTATATATACTGCCAT
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AATTTGGAAACATTCAAATGGTCATTTGGTATTCTTTTCTCACGATTGGTAAGCAAATGT
TCAAACTCATTTGGCACACTCAAATTTTACAGCATTGGGAAATGATGCTCATTGCAAGTC
TAGACATCCTCTAATTATAATGCTTGTATCCTTTTCTTTTCGACCTATGGCTCACATCCT
TATTTTGTATCTATTTTTGTTTAATTTGAGTAACAAGCCATTTGTAAGAATTGAAGTTCA
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GTCATTATGTCGTTTAAAATATTCGCTGACAAATTCTGATTATGTTACGTTTGTATTTGA
CTGGTCTAGGTGGAGACGTTTTTGGATTATGATAAATCCTCAGAGGGAATTGTCTTCACT
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CGATTCTATATACAGATCTCTAGTAGGAATTCCTGATGTAGAAGGAGAAACAACATGAAC
CTGGTTATTAATACTATATCTTAAATTGCTCGAAAAGCTTGAAATTTTTTTATAAAAGAA
AATGTTCCGCCTCTAACAATAATCATTCAAGTTCAATAAGCTTTACCTTGGTCACTAGCT
TCAGCTTTAGTTTGTGTAAAAATATTTAACCTCACTGCTTGACCAGTCTCTTATTTCACT
GCATGCAGGTTTTTATATCTTATGGAAGGAAATCAAATGGAGAGCTATTGCTTTCATATG
GATTTGTTCCAAGGGAGGGCACCAACCCAAGCGATTCAGTAGAGTTGTTGTTATCTCTTA
AGAAATCTGACAAATGTTATAAGGAGAAGTTAGAAGCCCTGAGGAAGCACGGGTTGTCAG
CGTGAGTATCTGATCATCTATGTGTTTAATTTACCTTTCTTAAGTTTTTCCAAAAGTTTT
CTTACGTCTCATAATATAATAAATGATCAAGTGTTTGAATTTTAAGTTAATTTGTTAGAG
ACGTAAACATATTCGGTTTCTGTCTTCGTATGTTACTCCAATTGATAAACTTCAATTGAT
GCATGGAACTACATGAAATCTTTTGGCAGATCTCAGTGTTTTCCGATGCAAATCACTGGT
TGGCCATTAGAGTTAATGGCATATGCTTATTTAACAGTCAGCCCTCCAAGTATGAGGGGA
AAGTTTGAAGAGGTATGTTAATTTCATCTACAAATCAAAAGCAAACATGTTTTAGTATTG
CATAAGATAGCTCAAACATCTTTTGACCAGATAGCTGCTGCTGCCTCAAATAAAACAACC
GTCAAGAAGGACATGAAATACCCCGAAATTGAGGAAGAAGCTTTACAATTTATATTGGAC
AGCTGTGAATCAAGCATATCCAAGTACTCCAAATTCTTGCAGGTTTCACAGCTTCTTTGT
TAGAGACTTATATACAAGTCAATGATTTTATTTCCAAAAAACTGTTGTCAACATACTATA
ACATGTTATATTGGGGGACTTGTAGGCAAGTGGATCGATGGATTTGGACATAACATCACC
AAAGCAACTGAACCGGAGAGTGTTCCTGAAACAACTAGCTGTCGACTTGTGCACTAGTGA
ACGAAGAATACTGTTTCGTGCACAATACGTAAGGAATAATCACCCCTCTTGCTCGTGTAA
ATCAATCAGTATTCATCTCATAATACCACGACATGCTGTTTATTGCACAATAATGCATCA
TCATGAATGATTCAATTGGATTTTAACGATATCATATTATTCTTTGATGTACATTTGTGT
TTGTATATTCGAATACAATGCTTGATGTTCAATGCCTTATTATGTGTTGTAGATACTGAG
GAGGAGATTGAGGGACATGAGGAGTGGTGAACTGAGAGCTCTTAAAATATTTGACAGCTT
CAGGAATCTCTTCAAATGA