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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016323 | Chr1 | 33518436 | 33523386 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 16 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016323.m1 | 3 | 26 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39 | 5.80E-10 |
LITCHI016323.m1 | 7 | 26 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 31.8 | 9.50E-08 |
LITCHI016323.m1 | 8 | 26 | PF18345.4 | zf_CCCH_4 | Domain | 30.6 | 2.60E-07 |
LITCHI016323.m2 | 3 | 26 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.9 | 5.90E-10 |
LITCHI016323.m2 | 7 | 26 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 31.7 | 9.80E-08 |
LITCHI016323.m2 | 8 | 26 | PF18345.4 | zf_CCCH_4 | Domain | 30.6 | 2.60E-07 |
LITCHI016323.m3 | 3 | 26 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.60E-10 |
LITCHI016323.m3 | 7 | 26 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 32.1 | 7.60E-08 |
LITCHI016323.m3 | 8 | 26 | PF18345.4 | zf_CCCH_4 | Domain | 30.9 | 2.10E-07 |
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>LITCHI016323.m1 ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT CAACCCCAGAGGCCCAATCCTTTTGGCTTTGGTGTTCCCACCAATTCTCAACCAAAGCAG CAGAACCAATTCAAGCCTTTTGAAAACAAATGGACTCGGTTCTCCCCCATACCTACAGCT GATGCTCGAAAACCTGAGAATCAGCCCCAACCAACAAATCATAAGTGCACTGATCCTGAC TCCTGCAGACGCCTAATTGTTGAAGATTTTGAGCATGAGAGACCGCTTTGGAAGCTTACT TGTTATGCTCACTGGCGAAATGCTCAATGTGACATTGTTGGTGATGTTAGCTATGAAGAA TTGCGGGCAGCAGCATATGATGATGCTAAGCGTGGGTTGAGCTTGCAGTCTATAGTTGAA AGAGAGAGGAATTTACTCAATTCCAAGTTAGTTGAGTTTGACAACCTTCTTCGCAATCCC TATACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTC AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT CAAAATAGTGCCCCTCCTACAGTCTCCAGTTTTAGTCATTTAGGATCATCAATCAATAAT GGGTTTGGAACAAGGCCCTCTGCACCATCAAATAATGCCTTTCGGCAACCAATCTTCCCA AATTCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGC TCATTTGGCAACCAATTTCCAGCCCAGGCAACCAGAAGTTCCTTTACCTCCAACACAACA AGTAACCAGTTCTCTACTCCAGCAATGACAACACCTAATGCTAGCCCATTTTCATTCGGT AATCAGTTTTCTGTGCTCCCCAGCAAGCCTGTAACATCTACGAATGCAGCTGAGCAAGGA CCTATAAACATTCAGTTGGCGAAGAACTTGGAAAGTGGAACTGTTACGGGGGATGCCAGT ATTTGGTTAAAAGAAAAATGGATTCCTGGAGAGATTCCAGAAGAAGCACCTCCAGAGGCG TTTGTTATGTGA >LITCHI016323.m2 ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT CAACCCCAGAGGCCCAATCCTTTTGGCTTTGGTGTTCCCACCAATTCTCAACCAAAGCAG CAGAACCAATTCAAGCCTTTTGAAAACAAATGGACTCGGTTCTCCCCCATACCTACAGCT GATGCTCGAAAACCTGAGAATCAGCCCCAACCAACAAATCATAAGTGCACTGATCCTGAC TCCTGCAGACGCCTAATTGTTGAAGATTTTGAGCATGAGAGACCGCTTTGGAAGCTTACT TGTTATGCTCACTGGCGAAATGCTCAATGTGACATTGTTGGTGATGTTAGCTATGAAGAA TTGCGGGCAGCAGCATATGATGATGCTAAGCGTGGGTTGAGCTTGCAGTCTATAGTTGAA AGAGAGAGGAATTTACTCAATTCCAAGTTAGTTGAGTTTGACAACCTTCTTCGCAATCCC TATACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTC AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT CAAAATAGTGCCCCTCCTACAGTCTCCAGTTTTAGTCATTTAGGATCATCAATCAATAAT GGGTTTGGAACAAGGCCCTCTGCACCATCAAATAATGCCTTTCGGCAACCAATCTTCCCA AATTCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGC TCATTTGGCAACCAATTTCCAGCCCAGGCAACCAGAAGTTCCTTTACCTCCAACACAACA AGTAACCAGTTCTCTACTCCAGCAATGACAACACCTAATGCTAGCCCATTTTCATTCGGT AATCAGTTTTCTGTGCTCCCCAGCAAGCCTGTAACATCTACGAATGCAGCTGAGCAAGGA CCTATAAACATTCAGTTGGCGAAGAACTTGGAAAGTGGAACTGTTACGGGGGATGCCAGT ATTTGGTTAAAAGAAAAATGGATTCCTGGAGAGGTAAAGGACTTTATTTGTGCAATTATT GTTGTTATTTGTTTAGTAGGACTTTCGAATAGATTCTGA >LITCHI016323.m3 ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT CAACCCCAGAGGCCCAATCCTTTTGGCTTTGGTGTTCCCACCAATTCTCAACCAAAGCAG CAGAACCAATTCAAGCCTTTTGAAAACAAATGGACTCGGTTCTCCCCCATACCTACAGCT GATGCTCGAAAACCTGAGAATCAGCCCCAACCAACAAATCATAAGTGCACTGATCCTGAC TCCTGCAGACGCCTAATTGTTGAAGATTTTGAGCATGAGAGACCGCTTTGGAAGCTTACT TGTTATGCTCACTGGCGAAATGCTCAATGTGACATTGTTGGTGATGTTAGCTATGAAGAA TTGCGGGCAGCAGCATATGATGATGCTAAGCGTGGGTTGAGCTTGCAGTCTATAGTTGAA AGAGAGAGGAATTTACTCAATTCCAAGTTAGTTGAGTTTGACAACCTTCTTCGCAATCCC TATACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTC AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT CAAAATAGTGCCCCTCCTACAGTCTCCAGTTTTAGTCATTTAGGATCATCAATCAATAAT GGGTTTGGAACAAGGCCCTCTGCACCATCAAATAATGCCTTTCGGCAACCAATCTTCCCA AATTCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGT ACAGTGTCGAAGGTTTTATTTGAATATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATA TATCATGTGCGAGATTTCTCATGTTTTTTGTGTGGGATGTCTAATATCACCCATAATAAT TGA
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AACCAGTTCTCTACTCCAGCAATGACAACACCTAATGCTAGCCCATTTTCATTCGGTAAT CAGTTTTCTGTGCTCCCCAGCAAGCCTGTAACATCTACGAATGCAGCTGAGCAAGGACCT ATAAACATTCAGTTGGCGAAGAACTTGGAAAGTGGAACTGTTACGGGGGATGCCAGTATT TGGTTAAAAGAAAAATGGATTCCTGGAGAGATTCCAGAAGAAGCACCTCCAGAGGCGTTT GTTATGTGAACTGCCAGCATACAAACCACACAAACTATTGATGTTGCATTCAAGATGGGC GATGAGATTTTACATAACGTCTTCATGCGTAGAAGTAGAATAACTGATATCATACAGAAG AGGCAATTTATTTTTTTTATTAGCGTTGATGAAATTGTTTGGTGGCATCCGGCAGAACGA CTCCAGTATGAAGTTAGCTGCAGGACTGATGTATCGTTGATGTGAGTAATCGTGGATGAT AGGAAACTGAGGAAGAATGATATTAATGGTGTGAATGAAGAATTAATTTAGTAGTTGCTA GTGAGTCAAAGTTTGCTGATTGTATAGCCTAGTAATGTGTCCCCAATGCTTAGATTTTGG CTCTACCATAGAATGGTGAATAGAACTCATCCACTTTCATCCAAGAAAGCGATTTGAAAT CTAAAAGTGGTTGAAGGTACTGCAACAGTTGTATGAGTTGTGCCTTTTGAGTTGGAGAAC GATTGGTTGTGTTCATAATGTATGATGCATCATGTGCATCACTTTAATTTTGGAATTCTT TTTGGTAGACATGGACAATGAAGGTTCAATGGATCCACGTTGTGTTAACCACTGTTTAAG GGAAAGCGTTTGTTATACGGCGTCGGTCCATATTTATCTGATCTTATATTGTATATCAAC AACGCGGTTTCATTTTGAAATCGATTCGAATTGAAATGGTCTTTGAAGATCGTGCAAACA 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TCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGCTCA TTTGGCAACCAATTTCCAGCCCAGGCAACCAGAAGTTCCTTTACCTCCAACACAACAAGT AACCAGTTCTCTACTCCAGCAATGACAACACCTAATGCTAGCCCATTTTCATTCGGTAAT CAGTTTTCTGTGCTCCCCAGCAAGCCTGTAACATCTACGAATGCAGCTGAGCAAGGACCT ATAAACATTCAGTTGGCGAAGAACTTGGAAAGTGGAACTGTTACGGGGGATGCCAGTATT TGGTTAAAAGAAAAATGGATTCCTGGAGAGGTAAAGGACTTTATTTGTGCAATTATTGTT GTTATTTGTTTAGTAGGACTTTCGAATAGATTCTGAATTCGAAATATTTAAATACATTTT ATTTTATGGCAATTTGTGTGTAATTTTGGTTTCGATCACAGTCCAATTCCCTTTCCTCCA CCATGTTTAAAAGAAATGGTAAATTCTGTTTCACTATCTATCTCTGGAAAGCCCTGGAAT TTGAGAAAGTGAATTATACAGTAGCTGTTGCAACCACTTATGAATAGTATTTGCTTTCTA CACTATTTTAATTTATTTTAGCCATTTTGACCTATGTTTTTTAAGATTCCTAGTTTCACA AGCCCTCTGATATGTATTTCTGTTCTAATTAATTAGATTCCAGAAGAAGCACCTCCAGAG GCGTTTGTTATGTGAACTGCCAGCATACAAACCACACAAACTATTGATGTTGCATTCAAG ATGGGCGATGAGATTTTACATAACGTCTTCATGCGTAGAAGTAGAATAACTGATATCATA CAGAAGAGGCAATTTATTTTTTTTATTAGCGTTGATGAAATTGTTTGGTGGCATCCGGCA GAACGACTCCAGTATGAAGTTAGCTGCAGGACTGATGTATCGTTGATGTGAGTAATCGTG 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