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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI016323 | Chr1 | 33518436 | 33523386 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 16 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI016323.m1 | 3 | 26 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39 | 5.80E-10 |
| LITCHI016323.m1 | 7 | 26 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 31.8 | 9.50E-08 |
| LITCHI016323.m1 | 8 | 26 | PF18345.4 | zf_CCCH_4 | Domain | 30.6 | 2.60E-07 |
| LITCHI016323.m2 | 3 | 26 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.9 | 5.90E-10 |
| LITCHI016323.m2 | 7 | 26 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 31.7 | 9.80E-08 |
| LITCHI016323.m2 | 8 | 26 | PF18345.4 | zf_CCCH_4 | Domain | 30.6 | 2.60E-07 |
| LITCHI016323.m3 | 3 | 26 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.60E-10 |
| LITCHI016323.m3 | 7 | 26 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 32.1 | 7.60E-08 |
| LITCHI016323.m3 | 8 | 26 | PF18345.4 | zf_CCCH_4 | Domain | 30.9 | 2.10E-07 |
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>LITCHI016323.m1 ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT CAACCCCAGAGGCCCAATCCTTTTGGCTTTGGTGTTCCCACCAATTCTCAACCAAAGCAG CAGAACCAATTCAAGCCTTTTGAAAACAAATGGACTCGGTTCTCCCCCATACCTACAGCT GATGCTCGAAAACCTGAGAATCAGCCCCAACCAACAAATCATAAGTGCACTGATCCTGAC TCCTGCAGACGCCTAATTGTTGAAGATTTTGAGCATGAGAGACCGCTTTGGAAGCTTACT TGTTATGCTCACTGGCGAAATGCTCAATGTGACATTGTTGGTGATGTTAGCTATGAAGAA TTGCGGGCAGCAGCATATGATGATGCTAAGCGTGGGTTGAGCTTGCAGTCTATAGTTGAA AGAGAGAGGAATTTACTCAATTCCAAGTTAGTTGAGTTTGACAACCTTCTTCGCAATCCC TATACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTC AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT CAAAATAGTGCCCCTCCTACAGTCTCCAGTTTTAGTCATTTAGGATCATCAATCAATAAT GGGTTTGGAACAAGGCCCTCTGCACCATCAAATAATGCCTTTCGGCAACCAATCTTCCCA AATTCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGC TCATTTGGCAACCAATTTCCAGCCCAGGCAACCAGAAGTTCCTTTACCTCCAACACAACA AGTAACCAGTTCTCTACTCCAGCAATGACAACACCTAATGCTAGCCCATTTTCATTCGGT AATCAGTTTTCTGTGCTCCCCAGCAAGCCTGTAACATCTACGAATGCAGCTGAGCAAGGA CCTATAAACATTCAGTTGGCGAAGAACTTGGAAAGTGGAACTGTTACGGGGGATGCCAGT ATTTGGTTAAAAGAAAAATGGATTCCTGGAGAGATTCCAGAAGAAGCACCTCCAGAGGCG TTTGTTATGTGA >LITCHI016323.m2 ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT CAACCCCAGAGGCCCAATCCTTTTGGCTTTGGTGTTCCCACCAATTCTCAACCAAAGCAG CAGAACCAATTCAAGCCTTTTGAAAACAAATGGACTCGGTTCTCCCCCATACCTACAGCT GATGCTCGAAAACCTGAGAATCAGCCCCAACCAACAAATCATAAGTGCACTGATCCTGAC TCCTGCAGACGCCTAATTGTTGAAGATTTTGAGCATGAGAGACCGCTTTGGAAGCTTACT TGTTATGCTCACTGGCGAAATGCTCAATGTGACATTGTTGGTGATGTTAGCTATGAAGAA TTGCGGGCAGCAGCATATGATGATGCTAAGCGTGGGTTGAGCTTGCAGTCTATAGTTGAA AGAGAGAGGAATTTACTCAATTCCAAGTTAGTTGAGTTTGACAACCTTCTTCGCAATCCC TATACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTC AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT CAAAATAGTGCCCCTCCTACAGTCTCCAGTTTTAGTCATTTAGGATCATCAATCAATAAT GGGTTTGGAACAAGGCCCTCTGCACCATCAAATAATGCCTTTCGGCAACCAATCTTCCCA AATTCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGC TCATTTGGCAACCAATTTCCAGCCCAGGCAACCAGAAGTTCCTTTACCTCCAACACAACA AGTAACCAGTTCTCTACTCCAGCAATGACAACACCTAATGCTAGCCCATTTTCATTCGGT AATCAGTTTTCTGTGCTCCCCAGCAAGCCTGTAACATCTACGAATGCAGCTGAGCAAGGA CCTATAAACATTCAGTTGGCGAAGAACTTGGAAAGTGGAACTGTTACGGGGGATGCCAGT ATTTGGTTAAAAGAAAAATGGATTCCTGGAGAGGTAAAGGACTTTATTTGTGCAATTATT GTTGTTATTTGTTTAGTAGGACTTTCGAATAGATTCTGA >LITCHI016323.m3 ATGCAGTACAAGAAAGAGGTGTGCAGAAATTATCAGCGTGGCAGCTGTCAGTACGGTGAC CGCTGTAAATTTATTCATGCGACTCCTAAATCTAATGCCTTTGGTTCCACATCCACTAAT CAACCCCAGAGGCCCAATCCTTTTGGCTTTGGTGTTCCCACCAATTCTCAACCAAAGCAG CAGAACCAATTCAAGCCTTTTGAAAACAAATGGACTCGGTTCTCCCCCATACCTACAGCT GATGCTCGAAAACCTGAGAATCAGCCCCAACCAACAAATCATAAGTGCACTGATCCTGAC TCCTGCAGACGCCTAATTGTTGAAGATTTTGAGCATGAGAGACCGCTTTGGAAGCTTACT TGTTATGCTCACTGGCGAAATGCTCAATGTGACATTGTTGGTGATGTTAGCTATGAAGAA TTGCGGGCAGCAGCATATGATGATGCTAAGCGTGGGTTGAGCTTGCAGTCTATAGTTGAA AGAGAGAGGAATTTACTCAATTCCAAGTTAGTTGAGTTTGACAACCTTCTTCGCAATCCC TATACAGGGCCACATAAGTCTGGTGTTGCTAGCCAAAGTCCATTTCCTGCTGCCACACTC AATGCTTTCCCTCCAACTCCTCAAAACAGCGCCACTCCAAATGCATTCTCTGCAACTCCT CAAAATAGTGCCCCTCCTACAGTCTCCAGTTTTAGTCATTTAGGATCATCAATCAATAAT GGGTTTGGAACAAGGCCCTCTGCACCATCAAATAATGCCTTTCGGCAACCAATCTTCCCA AATTCTAGTCAGACTCCAAGTGCATTTGCCACAAACAATATGCCATCTGCAAATTTTGGT ACAGTGTCGAAGGTTTTATTTGAATATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATA TATCATGTGCGAGATTTCTCATGTTTTTTGTGTGGGATGTCTAATATCACCCATAATAAT TGA
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>LITCHI016323.m1 MQYKKEVCRNYQRGSCQYGDRCKFIHATPKSNAFGSTSTNQPQRPNPFGFGVPTNSQPKQ QNQFKPFENKWTRFSPIPTADARKPENQPQPTNHKCTDPDSCRRLIVEDFEHERPLWKLT CYAHWRNAQCDIVGDVSYEELRAAAYDDAKRGLSLQSIVERERNLLNSKLVEFDNLLRNP YTGPHKSGVASQSPFPAATLNAFPPTPQNSATPNAFSATPQNSAPPTVSSFSHLGSSINN GFGTRPSAPSNNAFRQPIFPNSSQTPSAFATNNMPSANFGSFGNQFPAQATRSSFTSNTT SNQFSTPAMTTPNASPFSFGNQFSVLPSKPVTSTNAAEQGPINIQLAKNLESGTVTGDAS IWLKEKWIPGEIPEEAPPEAFVM. >LITCHI016323.m2 MQYKKEVCRNYQRGSCQYGDRCKFIHATPKSNAFGSTSTNQPQRPNPFGFGVPTNSQPKQ QNQFKPFENKWTRFSPIPTADARKPENQPQPTNHKCTDPDSCRRLIVEDFEHERPLWKLT CYAHWRNAQCDIVGDVSYEELRAAAYDDAKRGLSLQSIVERERNLLNSKLVEFDNLLRNP YTGPHKSGVASQSPFPAATLNAFPPTPQNSATPNAFSATPQNSAPPTVSSFSHLGSSINN GFGTRPSAPSNNAFRQPIFPNSSQTPSAFATNNMPSANFGSFGNQFPAQATRSSFTSNTT SNQFSTPAMTTPNASPFSFGNQFSVLPSKPVTSTNAAEQGPINIQLAKNLESGTVTGDAS IWLKEKWIPGEVKDFICAIIVVICLVGLSNRF. >LITCHI016323.m3 MQYKKEVCRNYQRGSCQYGDRCKFIHATPKSNAFGSTSTNQPQRPNPFGFGVPTNSQPKQ QNQFKPFENKWTRFSPIPTADARKPENQPQPTNHKCTDPDSCRRLIVEDFEHERPLWKLT CYAHWRNAQCDIVGDVSYEELRAAAYDDAKRGLSLQSIVERERNLLNSKLVEFDNLLRNP YTGPHKSGVASQSPFPAATLNAFPPTPQNSATPNAFSATPQNSAPPTVSSFSHLGSSINN GFGTRPSAPSNNAFRQPIFPNSSQTPSAFATNNMPSANFGTVSKVLFEYLSLSLSLYIYI YHVRDFSCFLCGMSNITHNN.
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>LITCHI028951.m1 ATGTCAGAACCAAGAGTGGAAAAGAAACAGGGTCTGCTAAGCGATGGTACCATAATTGCT GTGAAGCAGCTTTCTTCAAAATCAAAGCAGGGAAATCGTGAATTCTTAAATGAGATAGGA ATGATTTCATGTTTGCAACATCCAAATCTCGTGAAACTATATGGCTTTTGTATTGAAGGG GATCAACTATTGCTGGCCTATCATGTACAACAAAATGGGAAATTGAAGGAACTAGTGGAT CCAATGTTGGGATCAGAATACAAGGAGGAGGAAGCAGAAAGGATGATTAAGGTATCTCTC CTATGCACCAATGCTTCACCGTCACTAAGGCCAACCATGTCTGAAGTGGTTGCCATGCTA GAAGGAGCAACTAAAATACCAGATGCCATGCCTAAAGCAGGTAGTTATAGTCAAGTCTTG AGGTTCAAAGCTATAAGAGACCAACGTCATTTGATGCACAATCAGAGCTTGTTAGGAAGT CAGGCTAGTCAATCAACATTAGTCGATGCCTCTACTTCTGATCAAGACCTCTATGAAGTT AATGAAGAGTCATATTTGAGGTATAAAGCCATGAGAGACGGTTATGGACAGATCGACAAG GAGAGTTTAATATCAGTGCTCCAACTTTCGACCTCAATCCCCTCTTGGACCGGCTCGTCA ACATCTGCTCGTGATCTTTATAGCAACAATTTGAGTTCCAAAAAATTGATTGATTATAAT TCTTTTAAATCAAAAGGAGTGAGTCCTTATGCTTCCCATGCCATAATTCTTCTTTGTATT GGCATGAGGATCTTGAAGCAAGAATGA
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>LITCHI028951.m1 - Up_Stream_Len 2000 TACTTATTTTGGATATTGTTTAGCAAATGCGAATTATACTGTAACTCTACACTTTACGGA GATCTTTTTCACGGATGACAGTACATATAATAGTCTCGGAAAGCGCATATTTGATATTTA TATTCAGGTAAATTAATCACAATCAAGACATATCTTTTGGTTGGGAGTGTGTGAGTAAAC ATTGGTGGCAAATGCTGTTTATAATGGATTGTTGTTCAAATTTAATATACCATCTTTTCC TGCATGTGTTCCGAAACCTGTGCCATGTTTCAAGCTATGCCCTTAACAGGGTATTCTTTG ATTCACAATTTTAGAGGTTTTGCTTCTTTTAGAAAATAACATACTGAGAAGGTGTTATTG AATTATGGCATGTGGCAGGACACATTAGTTGAGAAGGATTTCAATATAGAAGCTGAAGCT TTTGGGGTTCTTAAACCTATTTCAAAACCATATAATGTCACTGTTGCAAATAACATCTTG GAAATACGTTTCAACTGGGCTGGTAAAGGAACTACAGCAATTCCTAGAAATGGAGTGTAT GGCCCACTTGTATCAGCTATATCTGTGGTGGATCCTAGTGAGTGATATCTCCTCATATTC TTCTACTTCTGTTTTTGACTAATATTATACTATATATCACAATCTTGTTTAAGATGAGTA GAATTGCTGTGGTAGCATGAAGATTGAAGTGTAAAAGATAATGAAATATTAAGATACCCT AGTAGATGGATTAGGTTACAGTTGAACTTGCATTGTTAAATAATGAGATGTATATCACAT GTTGAGGTGATATAGTAAAGTAAATTAAGGGAGTAATGAAATTAAAAGAAATTTGAAGTA ATTGTGCAACACTCCACTAAGGTTTGCCAAAAAGACAAGCGGAAACACATTTATTGTTTC CTTACACATTATCCCCATTTTGTTAGTCAAATTTATTAAGGTTAGTCAAATTAAGTTGAT TCAAGGGTAATTTTATCATTTAATATTTTTTTTTTTAAATTTAAGGAAAAATAATTAAAA ATTAATGAAAATTTAAAAAAAAAATGTCCACAGGCCATTATGCGAGGGATGATGGGAATT AATTTAAAAATAAAATAAATGTTGCAAAAATTAATCAAAATCAACAAATAAAAATCAATC AAAAATAGGATCTTTTCTACATTTAACAAATAAAAATTGAAACTGTACAACATTGAACTC AACAAACTTGACAGTGAAGTCATGTATAGACTTCTCTCAGTGGCAGCTCTTGCATACACA CCATAAAGGAGTGAGTTTTGGAGAAAACTTCAGGAAGAGTAGCTGATTGCAAGACGAACC CATCTCGCAAAAAGGATGATTTAGAGGACCCAAGTGAGGATTTCATTGAACAAGCCGCTG AAGAAGCCATTGAAAAAAACTGGGATCTTTTTGGTCTGCGTGAAGGCAGAGTAAGGCACG GAAGAAGAAGCCATCGTGAGGCACATGGTGGAGATCCAATATTCCACCACTTTTTTTTTT AAAAAAATTTTTTTATCTTACTCATTGATAAAAAAGTCATTTGACCAACACCCTTGATCA ACTGTTAAAATTAATAGAATTAGACTAACAGAATAAGAATATTGTATAAAAAAAAGGGTA AATGTGTTTTTACTTGTTTTTTAACAAATCTCTGGAGTATTATGCAATTACTTCATATAT AAATATGTCAAAATAGAAGAACATGTTTATTATTTGAATAAAAAAATAATATATTTATGA AGAATGTGTGAGTAGGCTTGAGAGTCAGGTTCCTGTCTTAGTAATAGTACTTTGATTTTC CCTTTAATGAGCGTGTGAGGGAACTTATATTTTAAGACCATTAGTTAATTTTCTGAGTGA CAAATTGTAATAATTTCTTGATGGGTTCTTTTGTGCAGACTTCAAACCGGGAAAGAAAAG TATTGCATCTATTGTTGGCGGAGTTGTCGCAGGAATATGCATTATAGTCTTGGTTTTGGG CTTCCTCTACCGCAAATACT
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>LITCHI025642.m5 GenomeSequence + GTTGGTTGTTAATGGAGTTTATTGGTGGGCTCTGTGTCTGCCTAAAAGAAGCCCAACTTT AACTTAACCGCCAAAAGGAGCGTCAATGACTGGTCAAGAGCTCCAGAATATTCGGTTCGC ATAAATCTCTGTCTGAAATCCCTTTCTCGTAGATACTCCAAAAAACCCAAGGCTATTATT GTAAACTCAGTAACCGAACTCTCCTCACTACTCAAAAGAAACACCTAGCAACCACCGTCC GATCAAATATAATTACCAATTGACGGTCGAGAATCCACGTTTGACTGAAGTACAAAAAAT GAGGCTGGAATGATTGGCTTTGATCGAGCTTTGACCACGAAAAATCAAAACAAAAAGACA CCTGGAGCCTTTGTAGAGCGAAATTCTAGAGAGAGAAAAAAATTAATTAGCGAAAATTAA GAGAGAGGAAGAGGAGGTGGTGAGAGATTTTTCAGTTTTGATTGTGTAGCTAGCTCTGTC ATTTATTTTCTTGTTTCAGTGTTTCAATTTTTTTGAACGGAGAGGAGGAGAGAGAAAAAA TATCTCTCTCTCTCTTCTTGTGAAGCGATTTTTTTTTTTTGATAAATTGAAAAGGAAGGA AAGTGTTCCAGTTGAAGAAATTAGGGTTCTTTGGAAGAAACCATGAATGTGATGCGTCGA CTTAAAAGCATTGCTTCTGGTCGCACTTCTATTTCCTCGGATCCTGTAAGTTTATTTTAT TTTATTTTTTGATTTCTTAGCTTACCTTTTTTTATGTGTTTGTTTATATATGTATGCAGA TTTTAATTAAAAAAATATTTATTTGGAGATCATCATTGGCCTGGATACAAGTAGTGTATT TTTGTTATTTTGCTTGTGTTTTGGCGTCAATTTTTGGCTTTTGCATTGTGTGTTTGTTTC GACTTTGTATAGATTTGTTGGTAATCGTTTTGTTTTGAGTTTGTGAATCATGTTGTTATC TTAATTTGGGCTGCGATTTTGATGATGATTTAGCTGGGATTTTCATGAAATATTAAGATT TTGCGTTCTTGTTTTGGCACAAAATCTTTGTTATTTTATGATGCAATATATATAATTTAA TAGAAGCATGTGTTTTTTGGGTAGATTATTTGTGTATGAGTGTTGTTGATGGTAAGCTGT AGTCTAGTGGTTGGATTTTATGAAGAGCATTGTTGTTGGGGTTGGTATCGGGTCAAAATC AACATTATTGGTTCTTTTTCTAAGAATGGGTGGATACTATGCAATTACTTATTTTACCTT ATTAAACAAGCATGAAGGTATGTAAAGGTTTTGGTATCTATAAGACAGAGAATTAAAAAA AAAAAAGACAGGAGTAAGTTATTTGCGTAAGTTGCTTTGTCTTTATGTGATGTTGGTTGC TGTATTGTATTATTGATTTGATTGGAGAAAGAGACTTCTTAGTAAGGTTGTCTGTAAGAT GGAGGAAGAAAAAAAGCGGGAATAGGTTACTTTTGCGTAAGTTGCTATGTTGTTTTGTGA TGTTGGCGTCTGTATCCTATTATGAACTGCATTCGAGAAAGAGATTATTAAACAAGGTTT TGTATCTTTAAGCTGGAGAATGAAAAGAAGTGGAAATAAATTATTCGTTATAGTTGCTGC TTGTTTTACCAATGTTTGGCTAAATTATTTTATTATTGATTTACATTCGAGAAAGCGAAT ACCAAACAAGGTTCTAGCATCTCAAAGATGGAGAAAGAAAAAAAGGTGGAAATAAGTTAT TCACGTTAATTGCTATGTCTTTATGTGATGTTGGCTCAGACAATCCTATTATTGATTTGC ATTTGAGATAGAGATTACTAAACTAGGTTTTAGTATCTCTAAGGTGGAGAAAGAAAAAAA GCAGAAATAAGTTATCAGCATAAGTTGCTACTTCTTATGCGACATTGGCTTAAGTATCCT ATTACTTGTTTGCTCATCAGGCAATTACGTTTGTTGAATGCTGGATTTATTTATTTTTCC TTTATGGTTAAATTTTAATGAAACATCAATAAAGCTGCAACCTCAAAACTACAGACTTTG TGTTTGAGTTTTGAGATGCAACAATTTTAGCTTGTTTTAACATTGATTTTCTGTTTTAAT GCTTCCTGGATGCCAGTTTACAGGCATCAACTTCGGTTTTCTTTCTAAATTAATAGAAAT TTATATTCTCTAAAAGCTTTGGTCGTGTTAGTTGAGAGCTACATATTTTTTGGAGACTAA AGTAGCTTAAATAGGAAGGTTTTAATTGTGTATAGCCTCCCAGCTGACAAATTGCGGAAT GGGCCTGGTATCATTGTCTGAACATGCATTATTGATGCTTTTATTACTAGTGTTCGGATT TAAACTAGTAAAGACTTTCCATATAGAAGAAGATAGATATGGTGATGTGGAAATAAGGTT GGTTAACTGTTCATGTGTTAGTTTCTTCTCAAAAAATTGAAATTTTCTCATACAGGGTTG CGATTTAGGCATAAAGAGGGCGAAAGTTGACAAAGAAACAGAGGTAAATGAAGGAGTGGG TTCAGTTGGGAGAACTGCTACCAGTTTAGAGCAGCATATGGCTTCCACTTCGCTAGAGCC TGTTGCAAGCACATCTGATGTATCTGCAAATGCTAGAACGGAAAGTTCTGGTTATGATCA GCTGCCTAAAGAAATGAATGAGATGAGAATTAGAGATGATAAAACTGTGAACACTGATGA TAAGGTAGTGGGACAAATGTAATATGAGGGTTCCTCATGAGAGCTTTTTGTCAAGTCTTT TTATGAATTTAGGATTGGTGGAATGGATGCACTTTGGTGTACATTCTCATTTTGAACTTG 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