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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016285 | Chr1 | 32979978 | 32983565 | - | Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016285.m1 | 26 | 72 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 29 | 1.10E-06 |
LITCHI016285.m1 | 270 | 328 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 37 | 2.30E-09 |
LITCHI016285.m1 | 294 | 352 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.6 | 1.10E-07 |
LITCHI016285.m1 | 295 | 316 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.8 | 0.32 |
LITCHI016285.m1 | 535 | 593 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.3 | 1.30E-07 |
LITCHI016285.m1 | 705 | 944 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 59.1 | 4.60E-16 |
LITCHI016285.m1 | 714 | 944 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 56.9 | 2.00E-15 |
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>LITCHI016285.m1 ATGGAGTACATCACTCTCCTTCTCATGTCCTCCTTGTTTGTTGTTGCATTGGTTTTGGCT AGTGATCCTTACTCAGAAGCACTTCTCAGCTTAAAATCTGAGCTCATAGATGGTTCCAAC ACTTTGGATGACTGGTTTCTGCCTCCTCCTGGGAGCAGCAGCAACCCATCTGGGGATTAT GTCCATTCATGTTCTTGGACTGGTGTTACTTGCAACAAGAACAATACTGCTGTTGTTGGA CTAAACCTGTCCATGAAAGATCTTGCTGGGGTGTTGTCTGGCAAGCAGTTGATGGTTTTC AATGAGCTGGTTGACCTCAATCTTAGTCACAACTCTTTCTCTGGACACCTTCCTGTTCAA CTCTTCAATCTCACCAGTTTGAGGAGCTTGGATATAAGTAGAAACAACTTCTCTGGTCAC TTCCCCGGTGGACTTTCAGGACTTGGGAATCTTGTTGTTCTTGATGCTTTTAGCAACAGC TTTTCAGGTCCATTGCCTGTTGAAGCTTCCCAGCTTGAGTATCTCAAGGTTTTCAATCTT GCAGGGAGTTACTTCAGTGGACCGATCCCATCAGAGTATGGTTCTTTTCAGGCCCTGGAG TTCATTCACTTGGCAGGAAATTTCCTCAATGGTGAGATACCACCAGAGCTTGGTAACCTC AAGACTGTGACTCACATGGAGATTGGTTACAATTCATACCAAGGAAGCATTCCTTGGCAG CTTGGTAACATGAGTGAGCTAAAGTACCTTGACATAGCTGGTGCAAACCTCTCAGGTTCA ATACCAAAGCAACTCTCCAATCTCACCAAGCTTGAGTCACTTTTCCTGTTCAGGAACCAG CTCACTGGAATGATTCCAGGGGAGTTTAGCAGAATCAGTGGCCTTAAAAGCTTGGATCTC TCTGACAACCAACTTTCAGGGCCTATTCCAGAGAGTCTTTCGGAGTTGAAGAGTCTTAGA CTGCTAAGTCTTATGTACAATGAAATGAGTGGCACTGTGCCTGAAAGCCTAGCACAACTT CCCTCCCTTGAAATTCTATTCATATGGAACAACTACTTTAATGGTTCACTTCCACAGGAC TTGGGCAGGAATTCAAAGCTTAGATGGGTTGATGTTTCCACAAACAACTTCATTGGCAGA ATCCCTCCTGGTATTTGCTCACGTGGTGTGTTGTTCAAACTAATCCTGTTTTCAAACAGT TTTACGGGCAGTCTTGCACCATCACTCTCCAATTGTCCCTCCCTTGTCCGGCTCCGGCTT GAAGACAATTCATTCTCAGGTGACATCCCTTTGAAGTTTAAACAGCTTCCTGAGATCACA TACATAGACCTGTCAAGCAACAAGTTCGCAGGAGGGATCCCCACAGACATGTCACAAGCT CCAAAGCTGGAGTACTTCAATGTCTCTAACAATCCAGAGCTTGGAGGCACCATTCCACCA CAAACTTGGTCTTTGCCACTTCTTCAAAACTTTTCAGCTTCAGCTTCCAACATCACAGGC AATCTCCCTGCATTCAAATCCTGTAAATCCATTTCTGTCATTGAATTGCATAATAACGAT TTGTCAGGATCTGTCCCAGAAAGTATTTCCAATTGCCAGGCACTTGGGAGGGTTGATTTA GGTAGCAATAAGTTAGTTGGTTCTATACCTGAAAAGCTTGCAGGTCTTCCTGTTTTAAGT GTCCTAGACTTGTCACATAACAATCTAAGTGGTCCTATACCAGCAAAGTTTGGCGATGTG TCTAGCTTGGTACTCCTGAATGTATCTTTCAATGACATATGCGGTTCCATACCCTCAGGA AAGGCATTGAAATTGATGGGCCCAAGTGCTTATGTTGGAAATCCAAGGCTTTGTGGAGCT CCTCTTAGACCATGTCCTTCTTCTGTGTCTATATTTGGAAGCAAAGGCACCAGGAGGCTT GTACTGGTTTTGATATTGTGTGTAGGGGTGGTTGTATTCATTGCAGCATCACTTCTGGGG ATATTTTTCTTCAGGAGAGCAAGTAAAGGCCAGTGGAAGATGTTATCCTTTCCTGGTCTG CCTCGATTCACAGCAAACGATATCATGAAAAGTTTCGACTCCACAGATTCAATGGAGGCA GTGCCATCACAATCAGCTTCAGTTTGCAAAGCAGTTCTGCCCACAGGAATAACAGTTTCG GTGAAGAAGATCGAATGGGGAGCTAAGAGAATGAGTACAATGTCTGAATTCGTAATGCAA ATGGGCAATGCAAGGCACAAGAACTTGGTCAGATTGCTTGGTTTTTGCTACAACAAGCAT CTAGCTTGTCTGCTATATGATTACTTGCCTAATGGAAATTTGGCTGAGAAGATTAGAATG AAGAGGGATTGGACAGCCAAGTACAAAACTGTGATTGGCATTGCAAGAGGACTATGTTTC CTTCACCATGACTGCTATCCTGCTATTCCTCATGGAGATTTGAAGTCAAGTAACATAGTT TTCGATGAAAATATGGAACCCCATTTGGCTGAATTTGGCTACAAATATCTTACACACTTG GCTAATGGTTCAATTTCCAGCAGGAAATCGGGTGAGTTCCACAACGCCATAAGAGAGGAG CTATGCATGGACATCTATGGCTTTGGAGAGATCATTATCGAACTCTTGACAAATGGTAGG CTGACAAATGCTGCAAATAGCATACAGAATAAACCAAGAGATGTTGTCTTGAGAGAAATA TACATGGACAATGAAGTTGGTGGTGATGCTACCAATTCATTGCAAGAGGAGATCAATTTA GTCCTTGATGTTGCTCTCCTCTGCACGAAAACTACCCCATCCGATCGACCCTCCATGGAA GATGCACTGAAGCTTTTATCAGGATTGAAGCCACTTAGAAAATAG
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>LITCHI016285.m1 TACTTTCACTAGTTCCCATGCACCACTTGGCCCCAACAATGCAACATCAATTCATATCAC ACACCATATTTACATTTTGTTACAATCTGATCAACCCAAATTAATATTGTTTACCTGCTC CTGCTGCAATTTCCAATGGAGTACATCACTCTCCTTCTCATGTCCTCCTTGTTTGTTGTT GCATTGGTTTTGGCTAGTGATCCTTACTCAGAAGCACTTCTCAGCTTAAAATCTGAGCTC ATAGATGGTTCCAACACTTTGGATGACTGGTTTCTGCCTCCTCCTGGGAGCAGCAGCAAC CCATCTGGGGATTATGTCCATTCATGTTCTTGGACTGGTGTTACTTGCAACAAGAACAAT ACTGCTGTTGTTGGACTAAACCTGTCCATGAAAGATCTTGCTGGGGTGTTGTCTGGCAAG CAGTTGATGGTTTTCAATGAGCTGGTTGACCTCAATCTTAGTCACAACTCTTTCTCTGGA CACCTTCCTGTTCAACTCTTCAATCTCACCAGTTTGAGGAGCTTGGATATAAGTAGAAAC AACTTCTCTGGTCACTTCCCCGGTGGACTTTCAGGACTTGGGAATCTTGTTGTTCTTGAT GCTTTTAGCAACAGCTTTTCAGGTCCATTGCCTGTTGAAGCTTCCCAGCTTGAGTATCTC AAGGTTTTCAATCTTGCAGGGAGTTACTTCAGTGGACCGATCCCATCAGAGTATGGTTCT TTTCAGGCCCTGGAGTTCATTCACTTGGCAGGAAATTTCCTCAATGGTGAGATACCACCA GAGCTTGGTAACCTCAAGACTGTGACTCACATGGAGATTGGTTACAATTCATACCAAGGA AGCATTCCTTGGCAGCTTGGTAACATGAGTGAGCTAAAGTACCTTGACATAGCTGGTGCA AACCTCTCAGGTTCAATACCAAAGCAACTCTCCAATCTCACCAAGCTTGAGTCACTTTTC CTGTTCAGGAACCAGCTCACTGGAATGATTCCAGGGGAGTTTAGCAGAATCAGTGGCCTT AAAAGCTTGGATCTCTCTGACAACCAACTTTCAGGGCCTATTCCAGAGAGTCTTTCGGAG TTGAAGAGTCTTAGACTGCTAAGTCTTATGTACAATGAAATGAGTGGCACTGTGCCTGAA AGCCTAGCACAACTTCCCTCCCTTGAAATTCTATTCATATGGAACAACTACTTTAATGGT TCACTTCCACAGGACTTGGGCAGGAATTCAAAGCTTAGATGGGTTGATGTTTCCACAAAC AACTTCATTGGCAGAATCCCTCCTGGTATTTGCTCACGTGGTGTGTTGTTCAAACTAATC CTGTTTTCAAACAGTTTTACGGGCAGTCTTGCACCATCACTCTCCAATTGTCCCTCCCTT GTCCGGCTCCGGCTTGAAGACAATTCATTCTCAGGTGACATCCCTTTGAAGTTTAAACAG CTTCCTGAGATCACATACATAGACCTGTCAAGCAACAAGTTCGCAGGAGGGATCCCCACA GACATGTCACAAGCTCCAAAGCTGGAGTACTTCAATGTCTCTAACAATCCAGAGCTTGGA GGCACCATTCCACCACAAACTTGGTCTTTGCCACTTCTTCAAAACTTTTCAGCTTCAGCT TCCAACATCACAGGCAATCTCCCTGCATTCAAATCCTGTAAATCCATTTCTGTCATTGAA TTGCATAATAACGATTTGTCAGGATCTGTCCCAGAAAGTATTTCCAATTGCCAGGCACTT GGGAGGGTTGATTTAGGTAGCAATAAGTTAGTTGGTTCTATACCTGAAAAGCTTGCAGGT CTTCCTGTTTTAAGTGTCCTAGACTTGTCACATAACAATCTAAGTGGTCCTATACCAGCA AAGTTTGGCGATGTGTCTAGCTTGGTACTCCTGAATGTATCTTTCAATGACATATGCGGT TCCATACCCTCAGGAAAGGCATTGAAATTGATGGGCCCAAGTGCTTATGTTGGAAATCCA AGGCTTTGTGGAGCTCCTCTTAGACCATGTCCTTCTTCTGTGTCTATATTTGGAAGCAAA GGCACCAGGAGGCTTGTACTGGTTTTGATATTGTGTGTAGGGGTGGTTGTATTCATTGCA GCATCACTTCTGGGGATATTTTTCTTCAGGAGAGCAAGTAAAGGCCAGTGGAAGATGTTA TCCTTTCCTGGTCTGCCTCGATTCACAGCAAACGATATCATGAAAAGTTTCGACTCCACA GATTCAATGGAGGCAGTGCCATCACAATCAGCTTCAGTTTGCAAAGCAGTTCTGCCCACA GGAATAACAGTTTCGGTGAAGAAGATCGAATGGGGAGCTAAGAGAATGAGTACAATGTCT GAATTCGTAATGCAAATGGGCAATGCAAGGCACAAGAACTTGGTCAGATTGCTTGGTTTT TGCTACAACAAGCATCTAGCTTGTCTGCTATATGATTACTTGCCTAATGGAAATTTGGCT GAGAAGATTAGAATGAAGAGGGATTGGACAGCCAAGTACAAAACTGTGATTGGCATTGCA AGAGGACTATGTTTCCTTCACCATGACTGCTATCCTGCTATTCCTCATGGAGATTTGAAG TCAAGTAACATAGTTTTCGATGAAAATATGGAACCCCATTTGGCTGAATTTGGCTACAAA TATCTTACACACTTGGCTAATGGTTCAATTTCCAGCAGGAAATCGGGTGAGTTCCACAAC GCCATAAGAGAGGAGCTATGCATGGACATCTATGGCTTTGGAGAGATCATTATCGAACTC TTGACAAATGGTAGGCTGACAAATGCTGCAAATAGCATACAGAATAAACCAAGAGATGTT GTCTTGAGAGAAATATACATGGACAATGAAGTTGGTGGTGATGCTACCAATTCATTGCAA GAGGAGATCAATTTAGTCCTTGATGTTGCTCTCCTCTGCACGAAAACTACCCCATCCGAT CGACCCTCCATGGAAGATGCACTGAAGCTTTTATCAGGATTGAAGCCACTTAGAAAATAG CAAAACATATGCAGATATAGTATGAACTGAGGAGGCCTAATTTCAGTTTTCTCATTATTA CATTACATATATAGTACATGAACATATATATAATTATATGTAAGAAGTTGTTAACATATA AGAGTGGCCATTTGTATTTAATATTGGTTGATATATGTTTATATATAGTTTGTTTTGTCA CAATTATTATTACAACTGTTTTAGTGTAATATATCAAGATATATAAGTTTGTGTATTGAT TTTATTTATCAAACAGAAAAT
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>LITCHI006500.m1 - Up_Stream_Len 2000 AATTCTTATCACATATGTAGAAGATAAATGCAATAATTATTCAAGTTATAAGTGTTTATG TTATTCAAATTCCTCGTTCATTAGTTCAACATGAATATTCTTGTATGATCACATGTTTTA GATATAGTGTTATGATCCAGAGAATGTATAGATGAAATTATTTTGCTTTAGTAGGAAATT CATATATATATATATATATATATATATACATATACATTCGAAGTGTTTATGTTATTCGAA TTCCTCATTCATTAGTTCAACATGAATGATATTGTATAATCACATATTTAGTTTTATGAT CTAGAGAATATATAGATGAAATCACTTTTGCTCTAGTAGGGAATTCATATATATATATAT ATATTAGAAGTGCTTATGTTATTCAAATTCCTTGTTCATTAGTTGAACATGAATATTCTT GTATAATCACATATTTTAGATATAGTGCTGTGATCTAAAGAATATATAGATAAAATCACT TTTGCTCAAGTAGGAAATTAATATCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATAT ATATATATAAATAAAAGGAACACGCTCATACATATTAGAAAATCTTTTATAAGATGTTGA GTTAGCGTGATGTGTTCATGTTAATGTGATGCTCTAACAATAGTACGACACGGGGCATAA ATATAAAAACCACAAAACAACTACTCAAATTTCACTATATAAAAACCACAAAACAACTAC TCAAATTTCACTATAGATTAAGTTATTGTATGGGAACTTTTAGGATACCATGCGCTTATA AAGAGCCCGCTATTACTTCCATCTCATCCTTTTGATTTTATTATTAAAATTATTCCATTT CTTTTATATAATTGCTAGAGAATCTTACACTAATAATTTAAAATTTGTTGAATCATATCA AAATTAAACAATATATATATATATATATATATAGAGTAATGCTAAGTTTCTCAAATATTT TACTTAAATTCATACACAAATGATATGATATATGAGTTACCAATATTTTATAAATCATGA AATGATTGAATAAGTAATAGAATATTTACAACTCATATACTATATCATTTAGATATGATT TTAGATAAAATATTTGAAAAATCTAGTATTAATGTTATATTTATAATTTAAAAATCCAGA AAAATATCTTTTGTCATAATAACAAATGATTACTCTCCATAAATGTTATCACATCTGCAT AATAGAAATCAGAACTTCTATTATATATGACTCAAAAAATCTAGAAAGATACCTTCTCTC GTAATAACAAATGACTACTCTCCATAAATCATATCACATATGCATGACAGGAACCAGAAC TTCTATCACACATATTAAGAAGAAATACAATAATTTGTAAGTGCATGTACTATTAAAATT ACTCATTTATTAGCTGAATATTTTTGTATAATCTCATATTTTGAGTAGTATAATGACCCC CTAAATACATAAATTAAATAATTTTTCTCGAACAAAAAATTGATTCGTTTGTACAAGTAA CTTTTATCGTCTAGCAAGTTTTTAGCATTAGAAAATCAGAATCCCGCACAAACCTAGAAG TGACGTAAATGAATAAACGTGGATGAAGGAAAAATGAAATAAAAACAAACAACATGTCAA AGCAAAGATAAGACCATACAACACACGCACAGTCACGCACAAAGACGCAACCCTCAATGA TTAAACCCATATCACGGCATAAGAGGCTAAAAAGTAACAACATCAACCCCCACCACCATG CCGTTTTGAAAAAGCGCTTCTCCAAAGCGCTTCTGGAGAACAAGCTCACCAACTAAAAAC AACACACACAATCTCTGTTTCGCCATCGCTTTCTCACTTCCTCGCTCACTCTCTGCTGCA GCTTATGGCAGCAGCAGCAGCAGCACCTCCTCTGCTCTCTCTTATCCTCACACCACCACT CTCTTCTCACTCTCCAAAACTATAACAAACAAACAAACAAACACAAGTTTTCTTTTTGCT CAAACGAACAGGCACATACA
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>LITCHI009641.m1 GenomeSequence - ATGATGCATGAGTTTCGCCTTCCAAGCTCCAGCAATAATAGCAGTAAGAGTGATGGTAAA ATCAATCTCCAAGAAGCGGTAAGCAAGCAGAAATTATTAGTACATATATAGGCTACTAAA TGTTCCTAGTGTGAACGTTTACATCTTTTTCTCTATCAATAAGTGGTTGTGAATTATCAT GATCACGATATAATTGCAAGCATGAAGAATTCTTATAAATAGATATTATCAAAATACCCC TAAAAATGAAACTAATATAAAATCACGTTTTTTTTTATATTCAAAAATAGGGTTCAATGA TATTATTTTTTATTTTAGGGGATTGTTTATGTTTTTTCCTTATTATAAATAGTTGCTCAA TGTATCATTCACAATTGAGAAATAGTCTATTTGATTTTATTAAATTATAATAGAGTTTGA TAGGTGATTGCAAGTAAGAACAATAAGCTTAATGTTAATGCTAAGATTTCAACATGCTTT TAAATGTATTTGAACAAAATTTTGACTCTCTGCACAAGAATTAATAATGAAACATGCATT TCAAGTTTGATATCCCAAAAAAAAAAAGAAGATAGTTTTAATTTGTAAGGAAACAAGAAC TTTAATAACAAATAGTAGTTGTAGGGCAGTCATCATATGTTTTTGAGTAATCATCATGTA TGATTACAAATCTCGTATAGTGATAAGACCTTCAATCAATACATCTGTTACGTGATGTGT ATGTTTAATTACTTTTTTTATCCATTATTACATGTTTTTTTTTTTGGCTTATTTCATAGG AAGTATGGACAATATGTAGAATTTTCAAGCGAAATGTATCACAGAGAAAGTTGTACACCC CAGATTTGAGATCATCAGATCAATCAAAACGTGATTCAACAGTACCACAACAAGGTTCTA 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