Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI016148Chr12960379529606499+Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24230

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI016148.m1106151PF13855.9LRR_8Repeat37.22.00E-09
LITCHI016148.m1115129PF13516.9LRR_6Repeat110.4
LITCHI016148.m1116152PF12799.10LRR_4Repeat282.30E-06
LITCHI016148.m1140153PF13516.9LRR_6Repeat10.10.78
LITCHI016148.m1140162PF00560.36LRR_1Repeat10.70.75
LITCHI016148.m1212270PF13855.9LRR_8Repeat32.18.00E-08
LITCHI016148.m1236249PF13516.9LRR_6Repeat9.80.98
LITCHI016148.m1309324PF13516.9LRR_6Repeat8.72.2
LITCHI016148.m1381396PF13516.9LRR_6Repeat8.72.2
LITCHI016148.m1577659PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain45.56.00E-12
LITCHI016148.m1577658PF00069.28PkinaseDomain34.41.50E-08
LITCHI016148.m1671761PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain28.31.10E-06
Download   Copy
>LITCHI016148.m1
GAATCACCACTTCTCCTTGGTGTTGGCTGTTTACTTGTGATTGATAGTGATGGTGGTTTG
GCTTCTTCACAAATGGGGTTTTGTTTCTTTGGTTCAATATTCGTTCTTGCACTCTTCTTC
AAGCCTCTAGCTTGTCAACAACCAAACACAGATAGCTACTATGTTTCTGATTTCTTCAAG
AAGATGAGCTTAGCTTCTTCTTCTTCTCAAGCTGCCAACTTTTCTAGTTCTGTTTGTTCA
TGGCAAGGTGTCTTCTGTGATACTAAAAAAGAACATGTAATTGGTTTATCAGCTTCTGGT
TTAGGTCTCTCAGGTTCTGTTCCTGACACCACCATTGGCAAACTCACCAAGCTTCAATCT
TTAGATCTTAGCAACAACAAAATCACTGCTATGCCTTCTGATTTGTGGAGTTTGGGGTCA
CTCAAGTCTCTCAATCTCTCCTCCAACCAGATTTCTGGTTCCCTCCCTAACAATATTGGC
AATTTTGGTATGCTTGAAGCCTTTGATCTCTCCAACAACAATTTCTCTGGGGAGATTCCT
GCAGCTATCAGCTCCCTTGTCAGTTTAAGAGTCCTTAAACTTGATAGAAACATGTTTCAA
TGGAGCATTCCGCCAGGGATAGTCAATTGCCAGTCTTTGGTTTCACTTGATCTCTCAATG
AACAACCTAAATGGCTCTCTACCTGATCGTTTTAGTGCTGCATTTCCAAAGCTTAAAACT
TTGAACCTCGCAGGAAATGACATTCATGGAAGGGAAACTGATTTTGCAGAGATGAAATCC
CTCACAAGCCTCAACATTTCAGGAAACCTGTTTCAGGGGTCAGTGATGGCTGTGTTTCAG
GAGCAACTTGAGGTGATTGACCTGAGCAGCAACCAGTTTCAAGGTCACATTTCTCAGGTA
CAATTCAACTCTAGTTATAACTGGTCTCATTTAGTTTATCTAGACTTGTCTGAGAATCAG
TTAAGTGGAGAGATTTTCAACAACTTAAACCAAGCTCAGAATCTTAAACACCTTAATTTA
GCTTGTAATAGATTTAACAGACAGGAGTTCCCAAGAATTGCAACACTTTTGGGTTTAGAG
TATCTGAATTTGTCTAGGACTAGTCTCACTGGTCATATTTCCAGTGATATCACACAACTG
AGTAATTTGCATACACTTGATCTTTCCATGAACCATCTCAGTGGCGAAATTCCGGTACTG
AGCATCAAAAGGCTTCAAGTTGTTGATGTTTCACAAAACAATTTAAGTGGGGAGATTCCT
GTAACTGTATTGGATAAGCTTCCTTGGATGGAAAGTTTTAACTTCTCTTACAACAACTTC
ACTCTTTGTGCTTCTGAGTTGTCCCCCAAAATCATACAAACAGCCTTCTTTGGTTCAACA
AACAACTGTCCAATAGCTGCAAATCCTGCACTCTTCAAAAGGAGAGCAGCCAAACAGAAG
GGACTAAAGCTTGCTCTAGCTTTAACTCTCTCAATGATCTGCTTGCTTGTTGGGTTGCTG
TTTTTGGCCTTTGGTTGTCGGAGGAAGCCCAAAATGTGGGCTGTAAAGCAAACATCATAC
AAAGAAGAGCAAAACATTTCAGGTCCCTTTTCGTTCCAGACAGATTCGACCACATGGGTT
GCTGATGTTAAGCATGCAAATTCAGTTCCGGTAGTGATTTTCGAGAAGCCATTGTTGAAT
ATCACATTCGCAGACCTCTTGTCTGCAACTTCAAATTTTGATCGAGGCACCCTTTTGGCT
GAAGGGAAATTCGGGCCCGTCTATAGAGGGTTTCTACCTGGTGGAATTCATGTAGCTGTA
AAAGTTTTGGTGCACGGATCAACATTGACTGACCAAGAAGCTGCAAGAGAGCTTGAGTAT
CTTGGTCGGATCAAACACCCGAATCTTGTTCCACTAACCGGTTATTGCTTAGCTGGTGAT
CAAAGGATTGCTATTTATGATTACATGGAGAACGGGAACTTGCAGAATTTGCTTTATGAC
TTGCCGCTTGGGCCAGAATGCGATTCTCCAACGCCAAAATCTGATGTATATTGCTTCGGT
GTGGTTCTATTTGAGCTCATTACTGGGAAAAAACCTATCGACGATGACTATCCTGAGGAG
AAAGAAGCAAACTTGGTCAGTTGGGTTAGAGGCTTGGTGAGGAAGAACCAAGGATCAAGA
GCTATTGATCCAAAAATTCGTGAAACAGGACCCGAAAACCAAATGGAGGAGGCCCTGAAG
ATTGGATATCTTTGCACGGCTGACCTTCCTTCCAAGCGACCAAGCATGCAGCAGATAGTT
GGCCTCCTTAAAGATATTGAACCAATTACGCATCAATGA
Download   Copy
>LITCHI016148.m1
ESPLLLGVGCLLVIDSDGGLASSQMGFCFFGSIFVLALFFKPLACQQPNTDSYYVSDFFK
KMSLASSSSQAANFSSSVCSWQGVFCDTKKEHVIGLSASGLGLSGSVPDTTIGKLTKLQS
LDLSNNKITAMPSDLWSLGSLKSLNLSSNQISGSLPNNIGNFGMLEAFDLSNNNFSGEIP
AAISSLVSLRVLKLDRNMFQWSIPPGIVNCQSLVSLDLSMNNLNGSLPDRFSAAFPKLKT
LNLAGNDIHGRETDFAEMKSLTSLNISGNLFQGSVMAVFQEQLEVIDLSSNQFQGHISQV
QFNSSYNWSHLVYLDLSENQLSGEIFNNLNQAQNLKHLNLACNRFNRQEFPRIATLLGLE
YLNLSRTSLTGHISSDITQLSNLHTLDLSMNHLSGEIPVLSIKRLQVVDVSQNNLSGEIP
VTVLDKLPWMESFNFSYNNFTLCASELSPKIIQTAFFGSTNNCPIAANPALFKRRAAKQK
GLKLALALTLSMICLLVGLLFLAFGCRRKPKMWAVKQTSYKEEQNISGPFSFQTDSTTWV
ADVKHANSVPVVIFEKPLLNITFADLLSATSNFDRGTLLAEGKFGPVYRGFLPGGIHVAV
KVLVHGSTLTDQEAARELEYLGRIKHPNLVPLTGYCLAGDQRIAIYDYMENGNLQNLLYD
LPLGPECDSPTPKSDVYCFGVVLFELITGKKPIDDDYPEEKEANLVSWVRGLVRKNQGSR
AIDPKIRETGPENQMEEALKIGYLCTADLPSKRPSMQQIVGLLKDIEPITHQ.
Download   Copy
>LITCHI016148.m1
GAATCACCACTTCTCCTTGGTGTTGGCTGTTTACTTGTGATTGATAGTGATGGTGGTTTG
GCTTCTTCACAAATGGGGTTTTGTTTCTTTGGTTCAATATTCGTTCTTGCACTCTTCTTC
AAGCCTCTAGCTTGTCAACAACCAAACACAGATAGCTACTATGTTTCTGATTTCTTCAAG
AAGATGAGCTTAGCTTCTTCTTCTTCTCAAGCTGCCAACTTTTCTAGTTCTGTTTGTTCA
TGGCAAGGTGTCTTCTGTGATACTAAAAAAGAACATGTAATTGGTTTATCAGCTTCTGGT
TTAGGTCTCTCAGGTTCTGTTCCTGACACCACCATTGGCAAACTCACCAAGCTTCAATCT
TTAGATCTTAGCAACAACAAAATCACTGCTATGCCTTCTGATTTGTGGAGTTTGGGGTCA
CTCAAGTCTCTCAATCTCTCCTCCAACCAGATTTCTGGTTCCCTCCCTAACAATATTGGC
AATTTTGGTATGCTTGAAGCCTTTGATCTCTCCAACAACAATTTCTCTGGGGAGATTCCT
GCAGCTATCAGCTCCCTTGTCAGTTTAAGAGTCCTTAAACTTGATAGAAACATGTTTCAA
TGGAGCATTCCGCCAGGGATAGTCAATTGCCAGTCTTTGGTTTCACTTGATCTCTCAATG
AACAACCTAAATGGCTCTCTACCTGATCGTTTTAGTGCTGCATTTCCAAAGCTTAAAACT
TTGAACCTCGCAGGAAATGACATTCATGGAAGGGAAACTGATTTTGCAGAGATGAAATCC
CTCACAAGCCTCAACATTTCAGGAAACCTGTTTCAGGGGTCAGTGATGGCTGTGTTTCAG
GAGCAACTTGAGGTGATTGACCTGAGCAGCAACCAGTTTCAAGGTCACATTTCTCAGGTA
CAATTCAACTCTAGTTATAACTGGTCTCATTTAGTTTATCTAGACTTGTCTGAGAATCAG
TTAAGTGGAGAGATTTTCAACAACTTAAACCAAGCTCAGAATCTTAAACACCTTAATTTA
GCTTGTAATAGATTTAACAGACAGGAGTTCCCAAGAATTGCAACACTTTTGGGTTTAGAG
TATCTGAATTTGTCTAGGACTAGTCTCACTGGTCATATTTCCAGTGATATCACACAACTG
AGTAATTTGCATACACTTGATCTTTCCATGAACCATCTCAGTGGCGAAATTCCGGTACTG
AGCATCAAAAGGCTTCAAGTTGTTGATGTTTCACAAAACAATTTAAGTGGGGAGATTCCT
GTAACTGTATTGGATAAGCTTCCTTGGATGGAAAGTTTTAACTTCTCTTACAACAACTTC
ACTCTTTGTGCTTCTGAGTTGTCCCCCAAAATCATACAAACAGCCTTCTTTGGTTCAACA
AACAACTGTCCAATAGCTGCAAATCCTGCACTCTTCAAAAGGAGAGCAGCCAAACAGAAG
GGACTAAAGCTTGCTCTAGCTTTAACTCTCTCAATGATCTGCTTGCTTGTTGGGTTGCTG
TTTTTGGCCTTTGGTTGTCGGAGGAAGCCCAAAATGTGGGCTGTAAAGCAAACATCATAC
AAAGAAGAGCAAAACATTTCAGGTCCCTTTTCGTTCCAGACAGATTCGACCACATGGGTT
GCTGATGTTAAGCATGCAAATTCAGTTCCGGTAGTGATTTTCGAGAAGCCATTGTTGAAT
ATCACATTCGCAGACCTCTTGTCTGCAACTTCAAATTTTGATCGAGGCACCCTTTTGGCT
GAAGGGAAATTCGGGCCCGTCTATAGAGGGTTTCTACCTGGTGGAATTCATGTAGCTGTA
AAAGTTTTGGTGCACGGATCAACATTGACTGACCAAGAAGCTGCAAGAGAGCTTGAGTAT
CTTGGTCGGATCAAACACCCGAATCTTGTTCCACTAACCGGTTATTGCTTAGCTGGTGAT
CAAAGGATTGCTATTTATGATTACATGGAGAACGGGAACTTGCAGAATTTGCTTTATGAC
TTGCCGCTTGGGCCAGAATGCGATTCTCCAACGCCAAAATCTGATGTATATTGCTTCGGT
GTGGTTCTATTTGAGCTCATTACTGGGAAAAAACCTATCGACGATGACTATCCTGAGGAG
AAAGAAGCAAACTTGGTCAGTTGGGTTAGAGGCTTGGTGAGGAAGAACCAAGGATCAAGA
GCTATTGATCCAAAAATTCGTGAAACAGGACCCGAAAACCAAATGGAGGAGGCCCTGAAG
ATTGGATATCTTTGCACGGCTGACCTTCCTTCCAAGCGACCAAGCATGCAGCAGATAGTT
GGCCTCCTTAAAGATATTGAACCAATTACGCATCAATGA
Download   Copy
>LITCHI016148.m1 +  Up_Stream_Len 2000
ACGACATAGATAGTGATTCATTTCAATTTGTCCCAATAGTTTTTTAATTTCTTGTACTTA
TATCCAAAAATAAAGTATAAAGATTACCATACATGGTTGTTTGGTTGTTGGCGCCGTTGG
TAAGCGCCAGCAACCCCCATGCCTCCCTTTGTAAGAGGCATGGGTTCGACACCTAATCCC
GCAAGATCCAAATGATATATATTTATATATATAATACTAAATATAATATAATATAATATT
CATATAATAATAATCATACTAATAGTAGTCTCTTAGCATTTGTGTGGGTTGACCCCCACC
TCCGTGTGGGTCTTCTCTCGTACCTCCGTGTAGATGAATTCCTCCCAATTAGGAGTTGTT
CCTCGGACCGTGCCACCAGCGTCCTATCTCGGTTGGTCCTAGTAGTCCTCTGGGTCCATC
CCAGATACAATTCTTATACTAAAAAAAAAAAAAAAAATGATTACCATACATATACACCAA
GCTACCCTAAACTAGACTCAAACAAACTTGTTTTAATATGTAATTAAATATTAAAATTTA
AAATTATTTTTTTTTCTAACTTTTCTCTCTTAAGAATTGTTAATATGAAAAAGATTCTAC
AAAAGAAAGATGAGATATGTGTAGTACTGATTATAAAAGTTAATGTCTTTTAATTTTAAA
AGGTTATGACGAATTAATCAAATTCATTTATTGTATTCTTCCTCCTAAAATAAATTATCT
CTCCTATTTAATTCAAATACAATGATGAATTTAATTGATTTGTTCTAACTTTTTAAAATT
ATAAAGTACTGATGATAAAATTATTTTATATATATAGTGTTTTTATTATAAAAAAGTTTT
AATTTTAAAAAATTTAGGACAAACCAATCAAATTCATCTATTGTATTCTCTCTCCCAAAA
CAAATTTTTTCTTCTATTTCATTCAAATAGAATAAATAAATTTAATTGATTCATTTTAAT
TTTTTAAATTTAAGACATCTTAATTATAAAAGTACTATATATATATATATATATATATTT
AGTTCAGCAAATAACTACAAAAAGTTGTCAATGAATGTGGAGATGGGGATTAATGAAGAA
AAAATTTTAAGATTGAATTTTTGGGTAAAGTAACAGAAATAAAAAGAAAGAAGACTTTTC
TCTTGCTACACAAAAACAGAGCACAAAAACAGCACTCAAAGGTAAAACCATCAACATGGA
TATTGACTTTTGAAAGAGACATCAACATGTGTACACACTCTCCTTTTTTTCCAAAAAAAA
GCCTAATTTTTGCATTGTGTTTGAAAAAGAAACCAGCACTTTTTCTCTACTAGCGGGGAA
AAAGAAAACATTTTGAAAACAATTTTTAAAAAAATAAAAATAAAAACGAAAGTGATCAAC
ACTCAATGAAGAAGAATCATTGAATACCAACCAACAAGTACTGATAAATTCAACGACCCC
AATTTGATACTCTGTATTCTATATTTATTCACTCACCTCTTCATTTATGAAGCTCAACCT
CACCTTACCTTCCCAATATTACCCTTCTCACTGTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTCT
CAAACTCTGTGTCTCGCATTCCAAAACCCCTTCTTAAATTTTAGCTTATATTATAATATT
AAATTATAATATATATATTTTTCATGTTCTGTTGAAAAACACAAAGTAGTTTGCTTCTTT
CTTCACTGTTTGTGTCGTGTTGGGTTGTTTGGTTTTTTGTTTCGTTGGATTTTTGTTTGG
CTTTAATACAACTGCAAAGCCAGACAGGTGCTGCTCACATTTTTCTCCTTTGATACACCA
AAAAGTTCGTTGCTTGTTGGTTTCTAGGCCTTCAAAAAAGAACCCCATTTGTTTATCTCA
ACCGTGCTCCTCAACTTTCTTGTCTTTTTCTTTACTGTAACATCTTATGTTTTCTAGTAT
CACAGTAACTAGCTTCTCCTCCTCATCCCCCAGAAATTGCAGTAAAATGGTTGTTCTCAT
TTGTTTTTAACTCCAAACAG
Download   Copy
>LITCHI016148.m1 GenomeSequence + 
GAATCACCACTTCTCCTTGGTGTTGGCTGTTTACTTGTGATTGATAGTGATGGTGGTTTG
GTTGTTTTGAGAGGGTTCTTGAGTTCAACTCTCCATTTTTCAATCATTGTTACTTAGTTT
AGGCTTCTTCACAAATGGGGTTTTGTTTCTTTGGTTCAATATTCGTTCTTGCACTCTTCT
TCAAGCCTCTAGCTTGTCAACAACCAAACACAGATAGCTACTATGTTTCTGATTTCTTCA
AGAAGATGAGCTTAGCTTCTTCTTCTTCTCAAGCTGCCAACTTTTCTAGTTCTGTTTGTT
CATGGCAAGGTGTCTTCTGTGATACTAAAAAAGAACATGTAATTGGTTTATCAGCTTCTG
GTTTAGGTCTCTCAGGTTCTGTTCCTGACACCACCATTGGCAAACTCACCAAGCTTCAAT
CTTTAGATCTTAGCAACAACAAAATCACTGCTATGCCTTCTGATTTGTGGAGTTTGGGGT
CACTCAAGTCTCTCAATCTCTCCTCCAACCAGATTTCTGGTTCCCTCCCTAACAATATTG
GCAATTTTGGTATGCTTGAAGCCTTTGATCTCTCCAACAACAATTTCTCTGGGGAGATTC
CTGCAGCTATCAGCTCCCTTGTCAGTTTAAGAGTCCTTAAACTTGATAGAAACATGTTTC
AATGGAGCATTCCGCCAGGGATAGTCAATTGCCAGTCTTTGGTTTCACTTGATCTCTCAA
TGAACAACCTAAATGGCTCTCTACCTGATCGTTTTAGTGCTGCATTTCCAAAGCTTAAAA
CTTTGAACCTCGCAGGAAATGACATTCATGGAAGGGAAACTGATTTTGCAGAGATGAAAT
CCCTCACAAGCCTCAACATTTCAGGAAACCTGTTTCAGGGGTCAGTGATGGCTGTGTTTC
AGGAGCAACTTGAGGTGATTGACCTGAGCAGCAACCAGTTTCAAGGTCACATTTCTCAGG
TACAATTCAACTCTAGTTATAACTGGTCTCATTTAGTTTATCTAGACTTGTCTGAGAATC
AGTTAAGTGGAGAGATTTTCAACAACTTAAACCAAGCTCAGAATCTTAAACACCTTAATT
TAGCTTGTAATAGATTTAACAGACAGGAGTTCCCAAGAATTGCAACACTTTTGGGTTTAG
AGTATCTGAATTTGTCTAGGACTAGTCTCACTGGTCATATTTCCAGTGATATCACACAAC
TGAGTAATTTGCATACACTTGATCTTTCCATGAACCATCTCAGTGGCGAAATTCCGGTAC
TGAGCATCAAAAGGCTTCAAGTTGTTGATGTTTCACAAAACAATTTAAGTGGGGAGATTC
CTGTAACTGTATTGGATAAGCTTCCTTGGATGGAAAGTTTTAACTTCTCTTACAACAACT
TCACTCTTTGTGCTTCTGAGTTGTCCCCCAAAATCATACAAACAGCCTTCTTTGGTTCAA
CAAACAACTGTCCAATAGCTGCAAATCCTGCACTCTTCAAAAGGAGAGCAGCCAAACAGA
AGGGACTAAAGCTTGCTCTAGCTTTAACTCTCTCAATGATCTGCTTGCTTGTTGGGTTGC
TGTTTTTGGCCTTTGGTTGTCGGAGGAAGCCCAAAATGTGGGCTGTAAAGCAAACATCAT
ACAAAGAAGAGCAAAACATTTCAGGTCCCTTTTCGTTCCAGACAGATTCGACCACATGGG
TTGCTGATGTTAAGCATGCAAATTCAGTTCCGGTAGTGATTTTCGAGAAGCCATTGTTGA
ATATCACATTCGCAGACCTCTTGTCTGCAACTTCAAATTTTGATCGAGGCACCCTTTTGG
CTGAAGGGAAATTCGGGCCCGTCTATAGAGGGTTTCTACCTGGTGGAATTCATGTAGCTG
TAAAAGTTTTGGTGCACGGATCAACATTGACTGACCAAGAAGCTGCAAGAGAGCTTGAGT
ATCTTGGTCGGATCAAACACCCGAATCTTGTTCCACTAACCGGTTATTGCTTAGCTGGTG
ATCAAAGGATTGCTATTTATGATTACATGGAGAACGGGAACTTGCAGAATTTGCTTTATG
ACTTGCCGCTTGGGGTTCAAACCACAGAAGATTGGAGCACGGATACATGGGAAGAAGACG
ACAATAATGGGATCCAAAATGTAGGTTCTGAGGGGTTATTGACAACTTGGAGGTTTCGAC
ATAAGATAGCACTTGGCACTGCACGAGCATTGGCGTTTCTTCACCATGGATGCTCACCTC
CAATCATTCACAGGGATATTAAAGCTAGCAGTGTTTATCTGGACTACAATTTGGAGCCAA
GAGTATCTGATTTTGGATTGGCCAAGGTCTTTGGAAGTGGCTTAGATGATGAAATTGCAC
GTGGATCACCTGGTTACGTCCCACCAGAATTTTCTCAGCCAGAATGCGATTCTCCAACGC
CAAAATCTGATGTATATTGCTTCGGTGTGGTTCTATTTGAGCTCATTACTGGGAAAAAAC
CTATCGACGATGACTATCCTGAGGAGAAAGAAGCAAACTTGGTCAGTTGGGTTAGAGGCT
TGGTGAGGAAGAACCAAGGATCAAGAGCTATTGATCCAAAAATTCGTGAAACAGGACCCG
AAAACCAAATGGAGGAGGCCCTGAAGATTGGATATCTTTGCACGGCTGACCTTCCTTCCA
AGCGACCAAGCATGCAGCAGATAGTTGGCCTCCTTAAAGATATTGAACCAATTACGCATC
AATGA