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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016148 | Chr1 | 29603795 | 29606499 | + | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24230 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016148.m1 | 106 | 151 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 37.2 | 2.00E-09 |
LITCHI016148.m1 | 115 | 129 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 11 | 0.4 |
LITCHI016148.m1 | 116 | 152 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 28 | 2.30E-06 |
LITCHI016148.m1 | 140 | 153 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 10.1 | 0.78 |
LITCHI016148.m1 | 140 | 162 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.7 | 0.75 |
LITCHI016148.m1 | 212 | 270 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32.1 | 8.00E-08 |
LITCHI016148.m1 | 236 | 249 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.8 | 0.98 |
LITCHI016148.m1 | 309 | 324 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 8.7 | 2.2 |
LITCHI016148.m1 | 381 | 396 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 8.7 | 2.2 |
LITCHI016148.m1 | 577 | 659 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 45.5 | 6.00E-12 |
LITCHI016148.m1 | 577 | 658 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 34.4 | 1.50E-08 |
LITCHI016148.m1 | 671 | 761 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 28.3 | 1.10E-06 |
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>LITCHI016148.m1 GAATCACCACTTCTCCTTGGTGTTGGCTGTTTACTTGTGATTGATAGTGATGGTGGTTTG GCTTCTTCACAAATGGGGTTTTGTTTCTTTGGTTCAATATTCGTTCTTGCACTCTTCTTC AAGCCTCTAGCTTGTCAACAACCAAACACAGATAGCTACTATGTTTCTGATTTCTTCAAG AAGATGAGCTTAGCTTCTTCTTCTTCTCAAGCTGCCAACTTTTCTAGTTCTGTTTGTTCA TGGCAAGGTGTCTTCTGTGATACTAAAAAAGAACATGTAATTGGTTTATCAGCTTCTGGT TTAGGTCTCTCAGGTTCTGTTCCTGACACCACCATTGGCAAACTCACCAAGCTTCAATCT TTAGATCTTAGCAACAACAAAATCACTGCTATGCCTTCTGATTTGTGGAGTTTGGGGTCA CTCAAGTCTCTCAATCTCTCCTCCAACCAGATTTCTGGTTCCCTCCCTAACAATATTGGC AATTTTGGTATGCTTGAAGCCTTTGATCTCTCCAACAACAATTTCTCTGGGGAGATTCCT GCAGCTATCAGCTCCCTTGTCAGTTTAAGAGTCCTTAAACTTGATAGAAACATGTTTCAA TGGAGCATTCCGCCAGGGATAGTCAATTGCCAGTCTTTGGTTTCACTTGATCTCTCAATG AACAACCTAAATGGCTCTCTACCTGATCGTTTTAGTGCTGCATTTCCAAAGCTTAAAACT TTGAACCTCGCAGGAAATGACATTCATGGAAGGGAAACTGATTTTGCAGAGATGAAATCC CTCACAAGCCTCAACATTTCAGGAAACCTGTTTCAGGGGTCAGTGATGGCTGTGTTTCAG GAGCAACTTGAGGTGATTGACCTGAGCAGCAACCAGTTTCAAGGTCACATTTCTCAGGTA CAATTCAACTCTAGTTATAACTGGTCTCATTTAGTTTATCTAGACTTGTCTGAGAATCAG TTAAGTGGAGAGATTTTCAACAACTTAAACCAAGCTCAGAATCTTAAACACCTTAATTTA GCTTGTAATAGATTTAACAGACAGGAGTTCCCAAGAATTGCAACACTTTTGGGTTTAGAG TATCTGAATTTGTCTAGGACTAGTCTCACTGGTCATATTTCCAGTGATATCACACAACTG AGTAATTTGCATACACTTGATCTTTCCATGAACCATCTCAGTGGCGAAATTCCGGTACTG AGCATCAAAAGGCTTCAAGTTGTTGATGTTTCACAAAACAATTTAAGTGGGGAGATTCCT GTAACTGTATTGGATAAGCTTCCTTGGATGGAAAGTTTTAACTTCTCTTACAACAACTTC ACTCTTTGTGCTTCTGAGTTGTCCCCCAAAATCATACAAACAGCCTTCTTTGGTTCAACA AACAACTGTCCAATAGCTGCAAATCCTGCACTCTTCAAAAGGAGAGCAGCCAAACAGAAG GGACTAAAGCTTGCTCTAGCTTTAACTCTCTCAATGATCTGCTTGCTTGTTGGGTTGCTG TTTTTGGCCTTTGGTTGTCGGAGGAAGCCCAAAATGTGGGCTGTAAAGCAAACATCATAC AAAGAAGAGCAAAACATTTCAGGTCCCTTTTCGTTCCAGACAGATTCGACCACATGGGTT GCTGATGTTAAGCATGCAAATTCAGTTCCGGTAGTGATTTTCGAGAAGCCATTGTTGAAT ATCACATTCGCAGACCTCTTGTCTGCAACTTCAAATTTTGATCGAGGCACCCTTTTGGCT GAAGGGAAATTCGGGCCCGTCTATAGAGGGTTTCTACCTGGTGGAATTCATGTAGCTGTA AAAGTTTTGGTGCACGGATCAACATTGACTGACCAAGAAGCTGCAAGAGAGCTTGAGTAT CTTGGTCGGATCAAACACCCGAATCTTGTTCCACTAACCGGTTATTGCTTAGCTGGTGAT CAAAGGATTGCTATTTATGATTACATGGAGAACGGGAACTTGCAGAATTTGCTTTATGAC TTGCCGCTTGGGCCAGAATGCGATTCTCCAACGCCAAAATCTGATGTATATTGCTTCGGT GTGGTTCTATTTGAGCTCATTACTGGGAAAAAACCTATCGACGATGACTATCCTGAGGAG AAAGAAGCAAACTTGGTCAGTTGGGTTAGAGGCTTGGTGAGGAAGAACCAAGGATCAAGA GCTATTGATCCAAAAATTCGTGAAACAGGACCCGAAAACCAAATGGAGGAGGCCCTGAAG ATTGGATATCTTTGCACGGCTGACCTTCCTTCCAAGCGACCAAGCATGCAGCAGATAGTT GGCCTCCTTAAAGATATTGAACCAATTACGCATCAATGA
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>LITCHI016148.m1 GAATCACCACTTCTCCTTGGTGTTGGCTGTTTACTTGTGATTGATAGTGATGGTGGTTTG GCTTCTTCACAAATGGGGTTTTGTTTCTTTGGTTCAATATTCGTTCTTGCACTCTTCTTC AAGCCTCTAGCTTGTCAACAACCAAACACAGATAGCTACTATGTTTCTGATTTCTTCAAG AAGATGAGCTTAGCTTCTTCTTCTTCTCAAGCTGCCAACTTTTCTAGTTCTGTTTGTTCA TGGCAAGGTGTCTTCTGTGATACTAAAAAAGAACATGTAATTGGTTTATCAGCTTCTGGT TTAGGTCTCTCAGGTTCTGTTCCTGACACCACCATTGGCAAACTCACCAAGCTTCAATCT TTAGATCTTAGCAACAACAAAATCACTGCTATGCCTTCTGATTTGTGGAGTTTGGGGTCA CTCAAGTCTCTCAATCTCTCCTCCAACCAGATTTCTGGTTCCCTCCCTAACAATATTGGC AATTTTGGTATGCTTGAAGCCTTTGATCTCTCCAACAACAATTTCTCTGGGGAGATTCCT GCAGCTATCAGCTCCCTTGTCAGTTTAAGAGTCCTTAAACTTGATAGAAACATGTTTCAA TGGAGCATTCCGCCAGGGATAGTCAATTGCCAGTCTTTGGTTTCACTTGATCTCTCAATG AACAACCTAAATGGCTCTCTACCTGATCGTTTTAGTGCTGCATTTCCAAAGCTTAAAACT TTGAACCTCGCAGGAAATGACATTCATGGAAGGGAAACTGATTTTGCAGAGATGAAATCC CTCACAAGCCTCAACATTTCAGGAAACCTGTTTCAGGGGTCAGTGATGGCTGTGTTTCAG GAGCAACTTGAGGTGATTGACCTGAGCAGCAACCAGTTTCAAGGTCACATTTCTCAGGTA CAATTCAACTCTAGTTATAACTGGTCTCATTTAGTTTATCTAGACTTGTCTGAGAATCAG TTAAGTGGAGAGATTTTCAACAACTTAAACCAAGCTCAGAATCTTAAACACCTTAATTTA GCTTGTAATAGATTTAACAGACAGGAGTTCCCAAGAATTGCAACACTTTTGGGTTTAGAG TATCTGAATTTGTCTAGGACTAGTCTCACTGGTCATATTTCCAGTGATATCACACAACTG AGTAATTTGCATACACTTGATCTTTCCATGAACCATCTCAGTGGCGAAATTCCGGTACTG AGCATCAAAAGGCTTCAAGTTGTTGATGTTTCACAAAACAATTTAAGTGGGGAGATTCCT GTAACTGTATTGGATAAGCTTCCTTGGATGGAAAGTTTTAACTTCTCTTACAACAACTTC ACTCTTTGTGCTTCTGAGTTGTCCCCCAAAATCATACAAACAGCCTTCTTTGGTTCAACA AACAACTGTCCAATAGCTGCAAATCCTGCACTCTTCAAAAGGAGAGCAGCCAAACAGAAG GGACTAAAGCTTGCTCTAGCTTTAACTCTCTCAATGATCTGCTTGCTTGTTGGGTTGCTG TTTTTGGCCTTTGGTTGTCGGAGGAAGCCCAAAATGTGGGCTGTAAAGCAAACATCATAC AAAGAAGAGCAAAACATTTCAGGTCCCTTTTCGTTCCAGACAGATTCGACCACATGGGTT GCTGATGTTAAGCATGCAAATTCAGTTCCGGTAGTGATTTTCGAGAAGCCATTGTTGAAT ATCACATTCGCAGACCTCTTGTCTGCAACTTCAAATTTTGATCGAGGCACCCTTTTGGCT GAAGGGAAATTCGGGCCCGTCTATAGAGGGTTTCTACCTGGTGGAATTCATGTAGCTGTA AAAGTTTTGGTGCACGGATCAACATTGACTGACCAAGAAGCTGCAAGAGAGCTTGAGTAT CTTGGTCGGATCAAACACCCGAATCTTGTTCCACTAACCGGTTATTGCTTAGCTGGTGAT CAAAGGATTGCTATTTATGATTACATGGAGAACGGGAACTTGCAGAATTTGCTTTATGAC TTGCCGCTTGGGCCAGAATGCGATTCTCCAACGCCAAAATCTGATGTATATTGCTTCGGT GTGGTTCTATTTGAGCTCATTACTGGGAAAAAACCTATCGACGATGACTATCCTGAGGAG AAAGAAGCAAACTTGGTCAGTTGGGTTAGAGGCTTGGTGAGGAAGAACCAAGGATCAAGA GCTATTGATCCAAAAATTCGTGAAACAGGACCCGAAAACCAAATGGAGGAGGCCCTGAAG ATTGGATATCTTTGCACGGCTGACCTTCCTTCCAAGCGACCAAGCATGCAGCAGATAGTT GGCCTCCTTAAAGATATTGAACCAATTACGCATCAATGA
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>LITCHI016148.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACGACATAGATAGTGATTCATTTCAATTTGTCCCAATAGTTTTTTAATTTCTTGTACTTA TATCCAAAAATAAAGTATAAAGATTACCATACATGGTTGTTTGGTTGTTGGCGCCGTTGG TAAGCGCCAGCAACCCCCATGCCTCCCTTTGTAAGAGGCATGGGTTCGACACCTAATCCC GCAAGATCCAAATGATATATATTTATATATATAATACTAAATATAATATAATATAATATT CATATAATAATAATCATACTAATAGTAGTCTCTTAGCATTTGTGTGGGTTGACCCCCACC TCCGTGTGGGTCTTCTCTCGTACCTCCGTGTAGATGAATTCCTCCCAATTAGGAGTTGTT CCTCGGACCGTGCCACCAGCGTCCTATCTCGGTTGGTCCTAGTAGTCCTCTGGGTCCATC CCAGATACAATTCTTATACTAAAAAAAAAAAAAAAAATGATTACCATACATATACACCAA GCTACCCTAAACTAGACTCAAACAAACTTGTTTTAATATGTAATTAAATATTAAAATTTA AAATTATTTTTTTTTCTAACTTTTCTCTCTTAAGAATTGTTAATATGAAAAAGATTCTAC AAAAGAAAGATGAGATATGTGTAGTACTGATTATAAAAGTTAATGTCTTTTAATTTTAAA AGGTTATGACGAATTAATCAAATTCATTTATTGTATTCTTCCTCCTAAAATAAATTATCT CTCCTATTTAATTCAAATACAATGATGAATTTAATTGATTTGTTCTAACTTTTTAAAATT ATAAAGTACTGATGATAAAATTATTTTATATATATAGTGTTTTTATTATAAAAAAGTTTT AATTTTAAAAAATTTAGGACAAACCAATCAAATTCATCTATTGTATTCTCTCTCCCAAAA CAAATTTTTTCTTCTATTTCATTCAAATAGAATAAATAAATTTAATTGATTCATTTTAAT TTTTTAAATTTAAGACATCTTAATTATAAAAGTACTATATATATATATATATATATATTT AGTTCAGCAAATAACTACAAAAAGTTGTCAATGAATGTGGAGATGGGGATTAATGAAGAA AAAATTTTAAGATTGAATTTTTGGGTAAAGTAACAGAAATAAAAAGAAAGAAGACTTTTC TCTTGCTACACAAAAACAGAGCACAAAAACAGCACTCAAAGGTAAAACCATCAACATGGA TATTGACTTTTGAAAGAGACATCAACATGTGTACACACTCTCCTTTTTTTCCAAAAAAAA GCCTAATTTTTGCATTGTGTTTGAAAAAGAAACCAGCACTTTTTCTCTACTAGCGGGGAA AAAGAAAACATTTTGAAAACAATTTTTAAAAAAATAAAAATAAAAACGAAAGTGATCAAC ACTCAATGAAGAAGAATCATTGAATACCAACCAACAAGTACTGATAAATTCAACGACCCC AATTTGATACTCTGTATTCTATATTTATTCACTCACCTCTTCATTTATGAAGCTCAACCT CACCTTACCTTCCCAATATTACCCTTCTCACTGTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTCT CAAACTCTGTGTCTCGCATTCCAAAACCCCTTCTTAAATTTTAGCTTATATTATAATATT AAATTATAATATATATATTTTTCATGTTCTGTTGAAAAACACAAAGTAGTTTGCTTCTTT CTTCACTGTTTGTGTCGTGTTGGGTTGTTTGGTTTTTTGTTTCGTTGGATTTTTGTTTGG CTTTAATACAACTGCAAAGCCAGACAGGTGCTGCTCACATTTTTCTCCTTTGATACACCA AAAAGTTCGTTGCTTGTTGGTTTCTAGGCCTTCAAAAAAGAACCCCATTTGTTTATCTCA ACCGTGCTCCTCAACTTTCTTGTCTTTTTCTTTACTGTAACATCTTATGTTTTCTAGTAT CACAGTAACTAGCTTCTCCTCCTCATCCCCCAGAAATTGCAGTAAAATGGTTGTTCTCAT TTGTTTTTAACTCCAAACAG
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>LITCHI016148.m1 GenomeSequence + GAATCACCACTTCTCCTTGGTGTTGGCTGTTTACTTGTGATTGATAGTGATGGTGGTTTG GTTGTTTTGAGAGGGTTCTTGAGTTCAACTCTCCATTTTTCAATCATTGTTACTTAGTTT AGGCTTCTTCACAAATGGGGTTTTGTTTCTTTGGTTCAATATTCGTTCTTGCACTCTTCT TCAAGCCTCTAGCTTGTCAACAACCAAACACAGATAGCTACTATGTTTCTGATTTCTTCA AGAAGATGAGCTTAGCTTCTTCTTCTTCTCAAGCTGCCAACTTTTCTAGTTCTGTTTGTT CATGGCAAGGTGTCTTCTGTGATACTAAAAAAGAACATGTAATTGGTTTATCAGCTTCTG GTTTAGGTCTCTCAGGTTCTGTTCCTGACACCACCATTGGCAAACTCACCAAGCTTCAAT CTTTAGATCTTAGCAACAACAAAATCACTGCTATGCCTTCTGATTTGTGGAGTTTGGGGT CACTCAAGTCTCTCAATCTCTCCTCCAACCAGATTTCTGGTTCCCTCCCTAACAATATTG GCAATTTTGGTATGCTTGAAGCCTTTGATCTCTCCAACAACAATTTCTCTGGGGAGATTC CTGCAGCTATCAGCTCCCTTGTCAGTTTAAGAGTCCTTAAACTTGATAGAAACATGTTTC AATGGAGCATTCCGCCAGGGATAGTCAATTGCCAGTCTTTGGTTTCACTTGATCTCTCAA TGAACAACCTAAATGGCTCTCTACCTGATCGTTTTAGTGCTGCATTTCCAAAGCTTAAAA CTTTGAACCTCGCAGGAAATGACATTCATGGAAGGGAAACTGATTTTGCAGAGATGAAAT CCCTCACAAGCCTCAACATTTCAGGAAACCTGTTTCAGGGGTCAGTGATGGCTGTGTTTC AGGAGCAACTTGAGGTGATTGACCTGAGCAGCAACCAGTTTCAAGGTCACATTTCTCAGG TACAATTCAACTCTAGTTATAACTGGTCTCATTTAGTTTATCTAGACTTGTCTGAGAATC AGTTAAGTGGAGAGATTTTCAACAACTTAAACCAAGCTCAGAATCTTAAACACCTTAATT TAGCTTGTAATAGATTTAACAGACAGGAGTTCCCAAGAATTGCAACACTTTTGGGTTTAG AGTATCTGAATTTGTCTAGGACTAGTCTCACTGGTCATATTTCCAGTGATATCACACAAC TGAGTAATTTGCATACACTTGATCTTTCCATGAACCATCTCAGTGGCGAAATTCCGGTAC TGAGCATCAAAAGGCTTCAAGTTGTTGATGTTTCACAAAACAATTTAAGTGGGGAGATTC CTGTAACTGTATTGGATAAGCTTCCTTGGATGGAAAGTTTTAACTTCTCTTACAACAACT TCACTCTTTGTGCTTCTGAGTTGTCCCCCAAAATCATACAAACAGCCTTCTTTGGTTCAA CAAACAACTGTCCAATAGCTGCAAATCCTGCACTCTTCAAAAGGAGAGCAGCCAAACAGA AGGGACTAAAGCTTGCTCTAGCTTTAACTCTCTCAATGATCTGCTTGCTTGTTGGGTTGC TGTTTTTGGCCTTTGGTTGTCGGAGGAAGCCCAAAATGTGGGCTGTAAAGCAAACATCAT ACAAAGAAGAGCAAAACATTTCAGGTCCCTTTTCGTTCCAGACAGATTCGACCACATGGG TTGCTGATGTTAAGCATGCAAATTCAGTTCCGGTAGTGATTTTCGAGAAGCCATTGTTGA ATATCACATTCGCAGACCTCTTGTCTGCAACTTCAAATTTTGATCGAGGCACCCTTTTGG CTGAAGGGAAATTCGGGCCCGTCTATAGAGGGTTTCTACCTGGTGGAATTCATGTAGCTG TAAAAGTTTTGGTGCACGGATCAACATTGACTGACCAAGAAGCTGCAAGAGAGCTTGAGT ATCTTGGTCGGATCAAACACCCGAATCTTGTTCCACTAACCGGTTATTGCTTAGCTGGTG ATCAAAGGATTGCTATTTATGATTACATGGAGAACGGGAACTTGCAGAATTTGCTTTATG ACTTGCCGCTTGGGGTTCAAACCACAGAAGATTGGAGCACGGATACATGGGAAGAAGACG ACAATAATGGGATCCAAAATGTAGGTTCTGAGGGGTTATTGACAACTTGGAGGTTTCGAC ATAAGATAGCACTTGGCACTGCACGAGCATTGGCGTTTCTTCACCATGGATGCTCACCTC CAATCATTCACAGGGATATTAAAGCTAGCAGTGTTTATCTGGACTACAATTTGGAGCCAA GAGTATCTGATTTTGGATTGGCCAAGGTCTTTGGAAGTGGCTTAGATGATGAAATTGCAC GTGGATCACCTGGTTACGTCCCACCAGAATTTTCTCAGCCAGAATGCGATTCTCCAACGC CAAAATCTGATGTATATTGCTTCGGTGTGGTTCTATTTGAGCTCATTACTGGGAAAAAAC CTATCGACGATGACTATCCTGAGGAGAAAGAAGCAAACTTGGTCAGTTGGGTTAGAGGCT TGGTGAGGAAGAACCAAGGATCAAGAGCTATTGATCCAAAAATTCGTGAAACAGGACCCG AAAACCAAATGGAGGAGGCCCTGAAGATTGGATATCTTTGCACGGCTGACCTTCCTTCCA AGCGACCAAGCATGCAGCAGATAGTTGGCCTCCTTAAAGATATTGAACCAATTACGCATC AATGA