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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016140 | Chr1 | 29424495 | 29432294 | + | AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor At1g51120 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016140.m1 | 106 | 154 | PF00847.23 | AP2 | Domain | 26.1 | 8.60E-06 |
LITCHI016140.m1 | 229 | 331 | PF02362.24 | B3 | Family | 86.3 | 1.10E-24 |
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>LITCHI016140.m1 ATGTTGGGACCAGAAACTAATGTAAGATCTGTTTATCATTTGCGCGTCACCATTTCAAAT ACTAGTTTCAGCCCTTGCTTATACTACTCCTATGCAACCAGTGACAATGCTCCAGAAATT GCAAGCTCTCTTGGTGCACGAGCTGTTAGATTTCACATTGATAATGCTGAAAGTACTTCA AAAAGAGTCAGTATGGAAGAAAGCCTGATTTCGAGTGGAGAAACAAATGTAATTACAGAA TTGTCAGATTCAACTAGCAGCTCTCGCGCACTTCCTGCAAGCAAACGTGCAAGGCATGCG AATATCATCTCCTCCACAAAATTCAAAGGTGTTGTACCACAGCAAAATGGGCATTGGGGT GCTCAAATTTATGCTCACCACCAACGGATATGGCTTGGGACCTTCAAATCTGAAAAGGAA GCAGCTATGGCTTATGATAGTGCTGCAATCAGGCTTCGGAGTGCTGACTCTCACAGAAAT CTTCCATGGACAAGCATCACTGCTCAAGAGCCTCACTTCCAAAGTAGTCACACAACTGAA GCAGTGCTCAACATGATTAGGGATGGATCGTACGAATCCAGGTTTGCAGAATTCTTGAGG AATCATTCTGGGGGTAGAGAAAACGATGGAAGTCTCACCCATATGAGGTCACAAGCGAAT GGATGGCTGATGTGTAGGCAACTATTCCAAAAGGAGTTAACACCAAGCGATGTGGGTAAG CTAAATAGACTTGTCATCCCGAAAAAGTACGCTATTAAGTACTTCCCAACTACTTCTGAA GGTGGAGAAGAGCGTGAAAAGAGGGAGGATGCTGATGATGTGCAGCTAGTTTTCTATGAC AGGTCGATGAAGTTGTGGAAATTTCGCTATTGCTATTGGAGGAGCAGTCAGAGTTTCGTC TTCACAAGGGGCTGGAACCGGTTTGTGAAGGAACACCAATTGAAGGCTAACGATACTATT TCTTTCTACATGTGCGAGAGCAAAGACAAGGCTAAAATTACTAAATCATTCTGCATGATC GATGCAAACAAGGATGAAAACAACGGTTCCTTCCTTGGCATGTCCAATAATATTCGGTAT GCTGAAATGCAAATGGATTTTAAACTTCAACTAGGCCAAAATGTTATCAATATCGATGGA GACGAAGACAAGGCTGAAGAAAACGGGGAATCATCAGAACAATCTCCGAAGCATGAGGGC AAATTGAAACCTTTCAAGCTCTTTGGGGGACTCATTTCAAAAGAACAAGTTCAAACATCT AAAGCCAACTTGAATATTAACAAAATGGTAACCTGGTCAAGGAGAGCATTTAAAGCCAAC TTGAATCCCATCAAAACAGCCATTGCCTTAGCTAATTCAATAGAAACTGAACCTGAACAA TGCTAG
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>LITCHI016140.m1 MLGPETNVRSVYHLRVTISNTSFSPCLYYSYATSDNAPEIASSLGARAVRFHIDNAESTS KRVSMEESLISSGETNVITELSDSTSSSRALPASKRARHANIISSTKFKGVVPQQNGHWG AQIYAHHQRIWLGTFKSEKEAAMAYDSAAIRLRSADSHRNLPWTSITAQEPHFQSSHTTE AVLNMIRDGSYESRFAEFLRNHSGGRENDGSLTHMRSQANGWLMCRQLFQKELTPSDVGK LNRLVIPKKYAIKYFPTTSEGGEEREKREDADDVQLVFYDRSMKLWKFRYCYWRSSQSFV FTRGWNRFVKEHQLKANDTISFYMCESKDKAKITKSFCMIDANKDENNGSFLGMSNNIRY AEMQMDFKLQLGQNVINIDGDEDKAEENGESSEQSPKHEGKLKPFKLFGGLISKEQVQTS KANLNINKMVTWSRRAFKANLNPIKTAIALANSIETEPEQC.
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>LITCHI016140.m1 ATGTTGGGACCAGAAACTAATGTAAGATCTGTTTATCATTTGCGCGTCACCATTTCAAAT ACTAGTTTCAGCCCTTGCTTATACTACTCCTATGCAACCAGTGACAATGCTCCAGAAATT GCAAGCTCTCTTGGTGCACGAGCTGTTAGATTTCACATTGATAATGCTGAAAGTACTTCA AAAAGAGTCAGTATGGAAGAAAGCCTGATTTCGAGTGGAGAAACAAATGTAATTACAGAA TTGTCAGATTCAACTAGCAGCTCTCGCGCACTTCCTGCAAGCAAACGTGCAAGGCATGCG AATATCATCTCCTCCACAAAATTCAAAGGTGTTGTACCACAGCAAAATGGGCATTGGGGT GCTCAAATTTATGCTCACCACCAACGGATATGGCTTGGGACCTTCAAATCTGAAAAGGAA GCAGCTATGGCTTATGATAGTGCTGCAATCAGGCTTCGGAGTGCTGACTCTCACAGAAAT CTTCCATGGACAAGCATCACTGCTCAAGAGCCTCACTTCCAAAGTAGTCACACAACTGAA GCAGTGCTCAACATGATTAGGGATGGATCGTACGAATCCAGGTTTGCAGAATTCTTGAGG AATCATTCTGGGGGTAGAGAAAACGATGGAAGTCTCACCCATATGAGGTCACAAGCGAAT GGATGGCTGATGTGTAGGCAACTATTCCAAAAGGAGTTAACACCAAGCGATGTGGGTAAG CTAAATAGACTTGTCATCCCGAAAAAGTACGCTATTAAGTACTTCCCAACTACTTCTGAA GGTGGAGAAGAGCGTGAAAAGAGGGAGGATGCTGATGATGTGCAGCTAGTTTTCTATGAC AGGTCGATGAAGTTGTGGAAATTTCGCTATTGCTATTGGAGGAGCAGTCAGAGTTTCGTC TTCACAAGGGGCTGGAACCGGTTTGTGAAGGAACACCAATTGAAGGCTAACGATACTATT TCTTTCTACATGTGCGAGAGCAAAGACAAGGCTAAAATTACTAAATCATTCTGCATGATC GATGCAAACAAGGATGAAAACAACGGTTCCTTCCTTGGCATGTCCAATAATATTCGGTAT GCTGAAATGCAAATGGATTTTAAACTTCAACTAGGCCAAAATGTTATCAATATCGATGGA GACGAAGACAAGGCTGAAGAAAACGGGGAATCATCAGAACAATCTCCGAAGCATGAGGGC AAATTGAAACCTTTCAAGCTCTTTGGGGGACTCATTTCAAAAGAACAAGTTCAAACATCT AAAGCCAACTTGAATATTAACAAAATGGTAACCTGGTCAAGGAGAGCATTTAAAGCCAAC TTGAATCCCATCAAAACAGCCATTGCCTTAGCTAATTCAATAGAAACTGAACCTGAACAA TGCTAG
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>LITCHI016140.m1 + Up_Stream_Len 2000 CGACTTTAATTAATCAAGTGTTTTGCATTCATGTTCCTGAGAAACTCATCCTTCATGTGC CGTTTAGAGATGCGAAGTAACTATCAATACAAAGTTTATAATAGTCAATGGAATAGATCA CATCGAAAAATAATTTTCAGACTAATGGTGTGGTTTTCAGTTATCAGTAATTGGTGAAGG GACATAGGTCTTGCCCTTGTCTCATGTTTTGACTACATGGTGATTGGCTTGTATTAGGGA TGGCTTTAATTGTATTCAAATTTAGGTGACATGTCACGGTTTTTTTTTTTAATTTTGTTT GATTGAAGTTAATGTTATTGAGTTATATGCCTGGTTTATGTGATTCTCTTTCATGTTCAA CTGCCACATGAGTGGTTGTATGTTTATCTTATAAAGTCTTAAAGCATTGATAAATTGTTG ATGTGATCTGTCGATTGTCCATTATCTAACAAAAGATTCTTCATATTGATCTATGGTCTT CCTATCTTTATTTCTTAATTTTCTTAACGGAATATTTTTATTTTTATGTAAAATTCAACA TTTAATTTAGTTCGGTTCAAGAATGCATCCTGTACTCTTATTTGCTCTAAATTTGATGTG GTGTAGAGAATCATTAGAATTCCCATTGTGTTTTTTTTTTTTCCTCGGTTGATATATAAG GCCAAATCAACCGATGACATAAATAAGTAGATGCCAACTAGATTCATGTTTGGTACTCAT ATATTCTGATGTTGGAAAACATTATAAGTATTTGGAGAAATATTTAATCATAAGGGTTTA ACCATGATACTTTTGTAATTAATATATTTCATGTGTTCAAAGACTGATAGTTTATTTTTC CACTCAGCTCAAATTGTTTTACAATTATTGCTTGCACAAAGAGCAGTTCGTAAGCTAATT TGTATGCATGTGATCATCAGAATTAATGTAAATATCCCATCTTGTAAGAGTGAATTAAAC ATAAAAAAGATCATAAAATATTCAATTAATTGTTCATTTTGTCATACCAGCATGTAAAAT TTGTAGGAAGAATATTTTGTCTTCAACCCATGAAATCAGGATATTTTGAATACATAGCCC TAGAACGCCTTTATTTCTGCTTTTATTTGGAAGCTTAGGAATTTGTAATACCTAGTATAG CAAAGTTGTGGTAGACAATATTCATTCAGGAGGTTATGACAACTGTAGCGGTAGAATTTG TGGCACTGACACGATTAGTTACCCATAAATGGAACTGATCGCTTTGACATTGCCTAATTA AGAAGCTACACTAATGACAGAGCTGTTGATAATTAATTTCTTACAATACACTTCTACTAA TGTAACACTTTAAAAAATGAATATGAATCTGTTGAAATTGTGACTCTGAAATTCTTACAG TCGTTGAAATATTTCATTCATAACCTGAATGACAAATTCCTCCTTGAAGTGAAATGTTTC TCAATTTAATGTTTTTCTCTAATTATGAAATATCAGGTTCGTATAATTCAATATCATTTG CCCTTGAATCTATTGCATGTATAATTTTTGGTTCTTTGCCGTCTTGAGTAAATGATAAGC TTTAAAATTTTCTCATTAATGTTCATGTATTATAGTTATTACATCATAATTCAGTAGTAA AAGAACTATATAAAAAAAAAAATAAAAAAATTAATGGTCTACGAGGGTATAGCCTAATAG GGTGGATCTTGTGTGAGCAAGAGATCTAGTGATGAAATTACTGCTCAAACCAGCCTTGGA GGATGATTCAACTTAATTTCGGTTGTGTATGGGATGAGGCTAGGCTAGGCTGCATGGCAT GCTAAAAGTAGAAAAGTAAGAAAAGATTTAATTGCCGCATTAGAGATATTGTAGTAGATG TTGAGTGAACAGAAGCTTATGTACTTGGTATATATATTCGTAGAAGATTTATGATTTCAA GAGCTAAATATTTAAGTTTCATTGTGAACTATTTTTTACTTGTCTACAAATGTTGGGACC AAGTTATGTTAAAAAAAAAA
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>LITCHI016140.m1 GenomeSequence + ATGTTGGGACCAGGTACATGCCTTACTAGGATTTCACAGGATAATATTTGTGATTATTTG TTGAGTTGTACTAGTTTGTCTTGTTTTCTAAATACATAAATGATTACCATTAATTAAACC AATTTCAATATTATGAAAAGAATAGGTCTTGAGTAAGACTGTATTTATGTAGCAAAGCAC AAACAGTAATTGACAACACAAACAACCACAGGATTATGCAGTGATTTTCTGTAATTATCA TAAATTTAAATGGCCTTGTCATATGGCCGTTGGAATGGCTCCAAGACAATGAAGGCATTA TCTATATATTAGAGAAGTTTCCTAGTTTCATCAAATATACTAAAAATTAAAATGCCTTAT CAAGTGTCCCTTAGGTTGTGTTTCCATTACAAAATAGGCTGCTACTTTGATGAAATGAGA GGAAATCCACACTACTTCATTTTGTAATGATTCAGCAACTTCAAGGTTGAGTTACATTTA AAATGCGGTTTTTGTTCAATGTAGTTCTCTCTTGGTAGGAATAGAATTGTTGGTCCCTTT TGATAGAAACTAATGTAAGATCTGTTTATCATTTGCGCGTCACCATTTCAAATACTAGTT TCAGCCCTTGCTTATACTACTCCTATGCAACCAGTGACAATGCTCCAGAAATTGCAAGCT CTCTTGGTGCACGTTCATTCAACGAATATATTCAGTTAAAGCCATAACGTTGGTGCTAAT CATCTTCAGGCCTGTGAGGTGATAAAACTGCTGTTGATTTACTCTAGAATATTGTTGGTA GATCGTCTAGTTCATCCTCAGTTAAATATGTTAATAAATCATACGTAATGTGGCTTATCT ATATTTTCTATAAGTCCAATTTTGATGTTTTATTTTATTAATCTTTTTGGAAATTTGACT 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