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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI016136Chr12939437829399620+Transcription factor bHLH66

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI016136.m1248293PF00010.29HLHDomain37.61.80E-09
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LITCHI016136.m8246291PF00010.29HLHDomain37.61.80E-09
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GGAGGTGGTGTCAATGGTGGTGATTGTATTCAGGCCACCGCCAATGGTGGACGGAACACT
AACGGGGCACAAACGACATCCACCAACGATAGCATGACAGTGACGGAGCACCAGGTAGCG
AAGTTGATGGAGGAGGACATGGGCTCCGCCATGCAATACTTGCAAGGCAAGGGTCTGTGT
CTAATGCCCATCTCCCTGGCCACGGCGATATCCACTGCCACGTGTCACTCCAGGAACCCT
CTGATCAACAGCAATCAAAATAACAACAGCGGCAACCCGTTGATGCAATCCAACGGTGAC
GGTCCATCCTCTCCCAGCATGTCGGTGTTGACTGTCCAATCAGCCACCATGGGTAACGGC
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GTAACAAATAAGAAATTTCACTTTGTCAATAAAAGATTGTGTTTAATCGATTTCATGGTC
GCATTACGTTTGATTCAGATGTGGTCGATCGAATTTAACTCGAACTGGCTATTGTATTAC
AACATATATGAATGCATTTGA
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GAGAGAATGAAAGCTCTACAAGAACTGGTGCCTAATGCCAACAAGACAGACAAGGCTTCA
ATGCTAGATGAGATCATTGACTATGTGAAATTCCTCCAGCTGCAAGTGAAGGTTCTCTTC
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GTCGGTAACGGCCCCGAAAACGACGTCGTCGATGGGTCGTCCTTCAAGTCTCCGTCAAAT
CTTCAGGGGGGAGATAATAATTCGGTTCAAGCTATATACAACGGGTTTGCTGGATCTTTA
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AGCTTCGCTGCCCAGCCAGCTACGGCTGCAGCAGCGGTGAACCAGCAGGCACAGCCGCAG
GCATGTGGGTCGAACGGCGGAGCACCGGCGGGTCAGCCCAGACAACGGGTCCGGGCTAGA
AGAGGTCAAGCAACCGATCCGCATAGTATCGCCGAAAGATTGAGAAGGGAGAGAATTGCA
GAGAGAATGAAAGCTCTACAAGAACTGGTGCCTAATGCCAACAAGACAGACAAGGCTTCA
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AGAGGTCAAGCAACCGATCCGCATAGTATCGCCGAAAGAGTATGCATATATTTTTGTTCA
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CTTCAGGGGGGAGATAATAATTCGGTTCAAGCTATATACAACGGGTTTGCTGGATCTTTA
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CTTCAGGGGGGAGATAATAATTCGGTTCAAGCTATATACAACGGGTTTGCTGGATCTTTA
AACGGGTCCGGATCGAACCAGCTTCAACAATTCCACCACGGCTCGATGCAGCAACCGCAA
AGCTTCGCTGCCCAGCCAGCTACGGCTGCAGCAGCGGTGAACCAGCAGGCACAGCCGCAG
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AGAGGTCAAGCAACCGATCCGCATAGTATCGCCGAAAGATTGAGAAGGGAGAGAATTGCA
GAGAGAATGAAAGCTCTACAAGAACTGGTGCCTAATGCCAACAAGACAGACAAGGCTTCA
ATGCTAGATGAGATCATTGACTATGTGAAATTCCTCCAGCTGCAAGTGAAGGTTCTGAGT
ATGAGTAGATTAGGCGGTGCTGCTGCTGTTGCTCCACTTGTTGCTGATATGTCTTCTGAG
GGAGGTGGTGTCAATGGTGGTGATTGTATTCAGGCCACCGCCAATGGTGGACGGAACACT
AACGGGGCACAAACGACATCCACCAACGATAGCATGACAGTGACGGAGCACCAGGTAGCG
AAGTTGATGGAGGAGGACATGGGCTCCGCCATGCAATACTTGCAAGGCAAGGGTCTGTGT
CTAATGCCCATCTCCCTGGCCACGGCGATATCCACTGCCACGTGTCACTCCAGGAACCCT
CTGATCAACAGCAATCAAAATAACAACAGCGGCAACCCGTTGATGCAATCCAACGGTGAC
GGTCCATCCTCTCCCAGCATGTCGGTGTTGACTGTCCAATCAGCCACCATGGGTAACGGC
GTGACTGACGGGTCCGTTAAAGACGCTGCCTCCGTTTCCAAACCGTGA
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CAGATCCACCACAACGCGTCGGCTGCGGCGGGGTTTGATCCCTCCGCAGCCTCCGCCGCC
CAGGACGACTTCCTCGAGCAAATGCTCTCCTCTATCCCTTCATGCTCCTGGACCGACCTC
AAGTCTCCCTGGGTCGACCTCAACGGCCGCGACCTCTCCGACGAGACGCCGCCGCCCACC
TCCCACCACTTCGACGACTCCATGATTCTAGCTTCCAAGTTGAGACAGCACCAGATCAGC
GGCGGCGCCACTGGAGGATCCGCCGCCGCCGCCGCGGCTGCGAAGATGATGCTGCAGCAG
CAGCAGCAGCAAATCCTGTTGGCCGCCAGAGGAGCCATGGGCCTGCCGTTAAGTGTCGGT
AACGGCCCCGAAAACGACGTCGTCGATGGGTCGTCCTTCAAGTCTCCGTCAAATCTTCAG
GGGGGAGATAATAATTCGGTTCAAGCTATATACAACGGGTTTGCTGGATCTTTAAACGGG
TCCGGATCGAACCAGCTTCAACAATTCCACCACGGCTCGATGCAGCAACCGCAAAGCTTC
GCTGCCCAGCCAGCTACGGCTGCAGCAGCGGTGAACCAGCAGGCACAGCCGCAGGCATGT
GGGTCGAACGGCGGAGCACCGGCGGGTCAGCCCAGACAACGGGTCCGGGCTAGAAGAGGT
CAAGCAACCGATCCGCATAGTATCGCCGAAAGATTGAGAAGGGAGAGAATTGCAGAGAGA
ATGAAAGCTCTACAAGAACTGGTGCCTAATGCCAACAAGACAGACAAGGCTTCAATGCTA
GATGAGATCATTGACTATGTGAAATTCCTCCAGCTGCAAGTGAAGGTTCTGAGTATGAGT
AGATTAGGCGGTGCTGCTGCTGTTGCTCCACTTGTTGCTGATATGTCTTCTGAGGGAGGT
GGTGTCAATGGTGGTGATTGTATTCAGGCCACCGCCAATGGTGGACGGAACACTAACGGG
GCACAAACGACATCCACCAACGATAGCATGACAGTGACGGAGCACCAGGTAGCGAAGTTG
ATGGAGGAGGACATGGGCTCCGCCATGCAATACTTGCAAGGCAAGGGTCTGTGTCTAATG
CCCATCTCCCTGGCCACGGCGATATCCACTGCCACGTGTCACTCCAGGAACCCTCTGATC
AACAGCAATCAAAATAACAACAGCGGCAACCCGTTGATGCAATCCAACGGTGACGGTCCA
TCCTCTCCCAGCATGTCGGTGTTGACTGTCCAATCAGCCACCATGGGTAACGGCGTGACT
GACGGGTCCGTTAAAGACGCTGCCTCCGTTTCCAAACCGTGA
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NIYECI.
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TATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTTTGCATTTGAATTGATTAGGAA
AGAAAATTTTTTTGGAGAGAATATGCTATTATAAAATTAAAGATAGCACAAATTAGATTA
AGATAATTGTTGCATATTCACTCTTACTTTAGCTCTAGAAGTTCCAAAGTGTTCAGGGCA
ATGCTTCCCCTCGGTAGGATTTGTATTAAAAGTCGATTTTGTTAGATGATACTATACCAT
AATTGATTGGCATCATAATAAAATAAATAAATAAATAAAGATTTTTTTTTTTTTTGACAT
ATTACACACATAAATAACATAGTTGAGCTCTCTAGATAAGGTTTATTAGGTGTGACTTAA
CATAAAGGCTTCCAAAAGCAGGAGGATGACTCTTGAAGAGGGAGGAGAAGCCCATGCAGA
TAAGGGAAAAACTGTCATTTTGCTTGATGCCACAAGGGTTCGAACCCTGCACTTAACTCT
TTTACTATAATGCAAAGGTAATGTTCTGAGACAGCACATTAAGTGCATTACGAAAGCTAA
TTTATGCTTACCCATTGGAATAAGTTTTGTGGGTTTGTAGCAGTAAATTTCTCACAATGT
CAAAACAAAATTAGTGGCGTTTAATCAAAATTCGGATCTTTTCTTGTTATCAATTGATAT
CAATATCAGCATTTAAATTTTGAAGATTCGAATTTTAACAAAATCCAGATGCACATTACA
GATAAAAATTACAACCTAAAAAGTAAATAAACATGTCGATCTTAGAATATGATCACAAAA
GACCCCACAAAATATATACCTGAAGAAAACAAACAAACAAACACACCACACCAAATCCAA
CCCATAACGAAACAAAACAAAACAAAACAAGCACCCCCACAAGGCCCCATCCCCCCGTCT
CTCGCTCTCTCTCTCTCTATTTAAGACCCAGTGCCATTAATGTGTAAAGAGAACTCCCAA
CAATCTCTCTCAAAAACCCCCCACAAAACATTCACTTGAAAATGCTCTCTCTTGCTTCTT
TTTGAATACCCATCTCTGTTTTCGTGTTTTGAAGAAGAGAAGACAAGTAATATGCAACCT
TGTAGTGGAGAAATGCAGGGATACCCATCTCAGATGACTAACGGCCATGATCAGTCGCAG
ATCCACCACAACGCGTCGGCTGCGGCGGGGTTTGATCCCTCCGCAGCCTCCGCCGCCCAG
GACGACTTCCTCGAGCAAATGCTCTCCTCTATCCCTTCATGCTCCTGGACCGACCTCAAG
TCTCCCTGGGTCGACCTCAACGGCCGCGACCTCTCCGACGAGACGCCGCCGCCCACCTCC
CACCACTTCGACGACTCCATGATTCTAGCTTCCAAGTTGAGACAGCACCAGATCAGCGGC
GGCGCCACTGGAGGATCCGCCGCCGCCGCCGCGGCTGCGAAGATGATGCTGCAGCAGCAG
CAGCAGCAAATCCTGTTGGCCGCCAGAGGAGCCATGGGCCTGCCGTTAAGTGTCGGTAAC
GGCCCCGAAAACGACGTCGTCGATGGGTCGTCCTTCAAGTCTCCGTCAAATCTTCAGGGG
GGAGATAATAATTCGGTTCAAGCTATATACAACGGGTTTGCTGGATCTTTAAACGGGTCC
GGATCGAACCAGCTTCAACAATTCCACCACGGCTCGATGCAGCAACCGCAAAGCTTCGCT
GCCCAGCCAGCTACGGCTGCAGCAGCGGTGAACCAGCAGGCACAGCCGCAGGCATGTGGG
TCGAACGGCGGAGCACCGGCGGGTCAGCCCAGACAACGGGTCCGGGCTAGAAGAGGTCAA
GCAACCGATCCGCATAGTATCGCCGAAAGATTGAGAAGGGAGAGAATTGCAGAGAGAATG
AAAGCTCTACAAGAACTGGTGCCTAATGCCAACAAGACAGACAAGGCTTCAATGCTAGAT
GAGATCATTGACTATGTGAAATTCCTCCAGCTGCAAGTGAAGGTTCTGAGTATGAGTAGA
TTAGGCGGTGCTGCTGCTGTTGCTCCACTTGTTGCTGATATGTCTTCTGAGGGAGGTGGT
GTCAATGGTGGTGATTGTATTCAGGCCACCGCCAATGGTGGACGGAACACTAACGGGGCA
CAAACGACATCCACCAACGATAGCATGACAGTGACGGAGCACCAGGTAGCGAAGTTGATG
GAGGAGGACATGGGCTCCGCCATGCAATACTTGCAAGGCAAGGGTCTGTGTCTAATGCCC
ATCTCCCTGGCCACGGCGATATCCACTGCCACGTGTCACTCCAGGAACCCTCTGATCAAC
AGCAATCAAAATAACAACAGCGGCAACCCGTTGATGCAATCCAACGGTGACGGTCCATCC
TCTCCCAGCATGTCGGTGTTGACTGTCCAATCAGCCACCATGGGTAACGGCGTGACTGAC
GGGTCCGTTAAAGACGCTGCCTCCGTTTCCAAACCGTGATGATGGCGTTGACTGACTGTT
CTTTTAGTCTATTTAGGGAGGACATTAAAAAGTGGGACCCCGTTCAAAGTCTACTAAAAT
AAGACGTCAACACGACGTCGTATTTTGGTAGACTTTGTGGCTATAAGCCTATAAAGCTGA
CTACAAAAATCCAAGTTGGACCAAATCCCATCTTCCTTTATGTTATTATTATTACGTTTT
TTTTTAATTAATTTTTAATTTCCATTATGAGTTCTGTCTTTTTTTTTTTTAAATTAAATA
CTTTCTTGTCATATTATTATAATTAGTGTTAATTAAATAAATCCTTTTATAATAATTACA
ATTCAATATATCTATTTGCAGTTTAAGTGATAAACATCTTCTTTTTTCGATATTTGTAAT
AGGATTTGAACTATCATCTAGCTTATATATTAACAATCATAAGAAGTTTTCTTTTGGAAT
ATATTTTCAAGTTGTGTATAGTGACTATTGGTGTTAGTGAATTTTTAAGCACTTAGCAAG
TATATATCATGATTTAGTTTGAGTCATTTTCATTATAAGTGGTATCAAGAAAGAAAAGAT
AATAACATTTCAGGTGGGATCCAAAGATGATAACAATATAATTAAGGACCAAGATGGGTG
TTTCTTTCCATGGAAAAAGGATGTGGCATGGCAGCTTTGATTGTTACTTTGAGGGCGGTT
TTTGTTGGTT
>LITCHI016136.m2
TATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTTTGCATTTGAATTGATTAGGAA
AGAAAATTTTTTTGGAGAGAATATGCTATTATAAAATTAAAGATAGCACAAATTAGATTA
AGATAATTGTTGCATATTCACTCTTACTTTAGCTCTAGAAGTTCCAAAGTGTTCAGGGCA
ATGCTTCCCCTCGGTAGGATTTGTATTAAAAGTCGATTTTGTTAGATGATACTATACCAT
AATTGATTGGCATCATAATAAAATAAATAAATAAATAAAGATTTTTTTTTTTTTTGACAT
ATTACACACATAAATAACATAGTTGAGCTCTCTAGATAAGGTTTATTAGGTGTGACTTAA
CATAAAGGCTTCCAAAAGCAGGAGGATGACTCTTGAAGAGGGAGGAGAAGCCCATGCAGA
TAAGGGAAAAACTGTCATTTTGCTTGATGCCACAAGGGTTCGAACCCTGCACTTAACTCT
TTTACTATAATGCAAAGGTAATGTTCTGAGACAGCACATTAAGTGCATTACGAAAGCTAA
TTTATGCTTACCCATTGGAATAAGTTTTGTGGGTTTGTAGCAGTAAATTTCTCACAATGT
CAAAACAAAATTAGTGGCGTTTAATCAAAATTCGGATCTTTTCTTGTTATCAATTGATAT
CAATATCAGCATTTAAATTTTGAAGATTCGAATTTTAACAAAATCCAGATGCACATTACA
GATAAAAATTACAACCTAAAAAGTAAATAAACATGTCGATCTTAGAATATGATCACAAAA
GACCCCACAAAATATATACCTGAAGAAAACAAACAAACAAACACACCACACCAAATCCAA
CCCATAACGAAACAAAACAAAACAAAACAAGCACCCCCACAAGGCCCCATCCCCCCGTCT
CTCGCTCTCTCTCTCTCTATTTAAGACCCAGTGCCATTAATGTGTAAAGAGAACTCCCAA
CAATCTCTCTCAAAAACCCCCCACAAAACATTCACTTGAAAATGCTCTCTCTTGCTTCTT
TTTGAATACCCATCTCTGTTTTCGTGTTTTGAAGAAGAGAAGACAAGTAATATGCAACCT
TGTAGTGGAGAAATGCAGGGATACCCATCTCAGATGACTAACGGCCATGATCAGTCGCAG
ATCCACCACAACGCGTCGGCTGCGGCGGGGTTTGATCCCTCCGCAGCCTCCGCCGCCCAG
GACGACTTCCTCGAGCAAATGCTCTCCTCTATCCCTTCATGCTCCTGGACCGACCTCAAG
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>LITCHI016136.m7
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>LITCHI016136.m8
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>LITCHI016136.m5
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GGATCGAACCAGCTTCAACAATTCCACCACGGCTCGATGCAGCAACCGCAAAGCTTCGCT
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>LITCHI016136.m6
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CTCTCTTTTTCTTTTTCATTTTTTATTTTGTGAGAGTGTTTGATTTTTTTAATTTAATTT
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GCTGCTGCTGTTGCTCCACTTGTTGCTGATATGTCTTCTGAGGTAACAAATAAGAAATTT
CACTTTGTCAATAAAAGATTGTGTTTAATCGATTTCATGGTCGCATTACGTTTGATTCAG
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CTTATCCGCATATATTACCTATATAATGTTAGTATTTCATTTTCTAATCTATTTAGATGT
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TTTTGATAATGTGAACTGTCCTATGACCTATGTGATGTGCTAGGCATGTAGCAAAACTGG
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ATTTGTTTAATTTAATTAATAGGGAGGTGGTGTCAATGGTGGTGATTGTATTCAGGCCAC
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GGCAGCTTTGATTGTTACTTTGAGGGCGGTTTTTGTTGGTT
>LITCHI016136.m3
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>LITCHI016136.m4
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ATATAATTAAGGACCAAGATGGGTGTTTCTTTCCATGGAAAAAGGATGTGGCATGGCAGC
TTTGATTGTTACTTTGAGGGCGGTTTTTGTTGGTT
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>LITCHI016136.m8 +  Up_Stream_Len 2000
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GCCCATGCAGATAAGGGAAAAACTGTCATTTTGCTTGATGCCACAAGGGTTCGAACCCTG
CACTTAACTCTTTTACTATA
>LITCHI016136.m5 +  Up_Stream_Len 2000
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AAGAAGAGAAGACAAGTAAT
>LITCHI016136.m4 +  Up_Stream_Len 2000
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AAGAAGAGAAGACAAGTAAT
>LITCHI016136.m7 +  Up_Stream_Len 2000
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TCACTTGAAAATGCTCTCTCTTGCTTCTTTTTGAATACCCATCTCTGTTTTCGTGTTTTG
AAGAAGAGAAGACAAGTAAT
>LITCHI016136.m6 +  Up_Stream_Len 2000
AATTATTGCGACAATTTAAATTTACAATCCCAAATTTAATTCTACTATAGTGAAAAGAAT
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AAGAAGAGAAGACAAGTAAT
>LITCHI016136.m1 +  Up_Stream_Len 2000
AATTATTGCGACAATTTAAATTTACAATCCCAAATTTAATTCTACTATAGTGAAAAGAAT
TACATTTGGTGAAATTTATTACATATAATATTATTTTTATTTAAATTTATTAAATCAATT
GTAGTATGAATAGTCAACAAGTAAAATGCTGAGGTTGCAATAACTTCAAAAAAAAAAAAG
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TATGCTTTATAATTACTATATAAGGTACAATAATAATAAATATGACTTAAATGTTATATC
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>LITCHI016136.m6 GenomeSequence + 
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>LITCHI016136.m2 GenomeSequence + 
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CCCTCTGATCAACAGCAATCAAAATAACAACAGCGGCAACCCGTTGATGCAATCCAACGG
TGACGGTCCATCCTCTCCCAGCATGTCGGTGTTGACTGTCCAATCAGCCACCATGGGTAA
CGGCGTGACTGACGGGTCCGTTAAAGACGCTGCCTCCGTTTCCAAACCGTGATGATGGCG
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