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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016085 | Chr1 | 28606436 | 28609865 | - | MDIS1-interacting receptor like kinase 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016085.m1 | 40 | 89 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 32.5 | 8.50E-08 |
LITCHI016085.m1 | 117 | 177 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.6 | 9.40E-07 |
LITCHI016085.m1 | 213 | 273 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.7 | 9.10E-07 |
LITCHI016085.m1 | 214 | 236 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11 | 0.57 |
LITCHI016085.m1 | 453 | 513 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30.2 | 3.00E-07 |
LITCHI016085.m1 | 597 | 656 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 44.2 | 1.30E-11 |
LITCHI016085.m1 | 598 | 618 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.6 | 0.81 |
LITCHI016085.m1 | 621 | 642 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 14.1 | 0.056 |
LITCHI016085.m1 | 775 | 1033 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 167.7 | 3.40E-49 |
LITCHI016085.m1 | 776 | 1035 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 157.9 | 3.00E-46 |
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>LITCHI016085.m1 ATGTACAAACCACAAACCATGGCAACAACATTAAACTTGCAAAACGTACTCTCCCCTGTT TTTCTTGTCCTGTTTCTTAACATAGTTGCCTCGCTACCAAGTGTTGCTTTTGCTTCTGCT GAAGAGGCAAACGCTCTTCTCAAATGGAAAGCTAGCTTAGCAAACCAAACACAGTCTCAG CTATTTTCTTGGACTCTGCTTTCTCACAATGCCTCCACCTCCAAACCAAGCACAAGTCCA TGCACTTGGTATGGAATCTCATGCAACTCTGCTGGAAGCGTTAGCAAAATAAACATTACC AGTTTCGGTTTGAATGGTACCCTCTATGAGTTTCCATTTTCGTCATTTCCTAATCTTGTG TATCTTGATCTTGCTATGAATTCACTCTATGGTATCATTCCATCGCAAATTGCAAACCTT TCTAAACTTATTTATCTTGATTTGTCCATTAATAAGTTCTCCGGACAAATCCCATTAGAA ATTTGTCTCCTTACAAATCTTCAGGCCCTGCACCTTGTTGAAAATCAATTAAATGGCTCA ATTCCTTATGACATAGGTCGTTTAAGATCTTTAGAAGACCTTGCGTTGTATAGTAACTAT CTTAATGGTCCAATTCCTTCTTCTCTTGGTAATATTAGGAACCTAACTTATTTGTATCTC TATAACAATTCCCTTTCAAGTTTTATTCCTCCTGAATTAGGAAATTTACAAAATTTGAAT GCACTTTACATAGATACCAACAATCTCACTGGCATAATTCCTTCCACTTTTGGAAAGTTG AAAAATCTAAAGGTCTTAAATGCATTCCAAAATAATATTTTTGGTCCAATTCCTCATGAA ATAGGAAATTTGAAATCTCTTATTGGACTAAATCTTTATTCAAACAATCTTTCTGGTTCA ATTCCAATATCATTAGGTCATCTGAGAAGCCTCACTACTCTTCTACTATATAAAAATCAA CTTTCAGGTCCCATTCCTAAAGAGTTAGGAAATTTGTTATCTCTAACCGATCTAGAGTTG AGTCAAAATCAATTGAATGGCTCAATCCCTACTTCCCTTGGTAATTTAGTTGATTTAGAA TTTCTTTATCTCCGTCACAACAAATTTTCTGGTCCCATTCCTTCAGCATTAGGAAATCTT GTGAACTTGACTAAATTGGTACTAGACGAGAACCAATTTACTGGTTTTCTACCCCAAAAC ATTTGCCAAGGTGGATCACTCCAAAGGTTTACTGTCAATAGAAACCATCTCACAGGTCCA ATACCAAAGAGCTTGAAAAACTGCACAAGCTTGACTAGAGTTCGTTTGGATGAAAACCAA TTCATAGGGAATATAGCTGAAGACTTTGGTGTTTATCCGAACTTGACAGTGATATATTTA AGCCACAACAAGTTTCATGGTGAAATTTCATCTAATTGGTTCAGATGTCCAAAATTAGTT GATTTAGACATTGCAGGGAACAATATTACTGGAGGCATACCACCCGAAATTGGGAAGGCA GCTCAGCTACAAGCACTGGATCTTTCTGCAAATCATTTAATTGGGGAGATTCCAAAGGAG TTGGGAAAGTTGACTTTGATGTCTAAGCTCAACTTGAGTAACAATCAACTTTCAGGTGGA ATACCTCCAGAATTTGGGTCATTGATCAATCTCGAGCGTTTGGACCTATCAAAAAACAAT ATGGGCCAATCAATTCAATATTTGGGAAAGTGCACCAAGCTGAACTACTTGGATTTGAGC AACAACAAATTCTATGAAGAAATTCCAAATCAGTTGGAGAAGTTAGATCATTTGTCCCAG CTAGATTTGAGTCATAACTTTCTCGAAGGAAAAATACCATCAACACTTAGCCATATGGAG AGCCTGGAAATGCTAAATCTGTCACACAATCGTCTTTCTGGTTTAATTCCTAAGAGTTTT GAAGGTATGTACAGCTTGAAATTTGTTGACATATCTTACAATGATTTGCAGGGTCCCCTT CCTAACAACAAAGCATTTCAAAATGCTTCAGTGGAAGCCTTAAAGGGGAACCAGGGTTTG TGTGGCAACGTTACAGGACTACCACCATGTCCATCTGCTCCTTTTGTCAGATATGAACAT AACTCGCGGAAGAGTCAGAGATTGGTGTTTTCAATTACTTTCCCTCTTTTGGGTACTCTT CTGCTTTTCTTTGTGCTCTTTGGAATCTACTTCATTTTACATAAAAGGAAGAAAGATCCC TCAACGGAACACAGTGAAAAGTTGCTCTTCATTTCGGATTTTGATGGAAGAATTTTGTAT ACGGACATCATAAAAGCAACAAACGATTTCGACGCAGCTTATTGCATTGGAGAGGGAGGA TATGGAACTGTCTACAAGACTAACCTGCCATCAGGTAAAATAGTAGCTGTGAAGAAACTT CATGCTCGTCCTCATGGTGAAAAGACTTTTCAAAAAGAGTTTCTGAATGAGATAAACACA TTAACAAAAATCCGACATCGAAATATTGTGAAGCTTTATGGTTTTTGTTCAAATGCACAA CATTCATTTTTGATTTATGAGTATCTTGAAAAGGGTAGCTTGGCCACAATTTTGATGGAA GAAGAGAAAACTAAAGAATTGGATTGGTCTAAGCGGTTGAATATAGTTAGAAGTGTGGCT CATGCCTTGTCTTACATGCATCATAATTGCTCACCCCCAATCATTCATCGAGATATATCA AGTAAAAATATTTTGCTGGATCAAGATTATCACGCTCATGTATCAGACTTCGGCACTGCC AAAATTCTAAAGCTAGACTCCTCCAATTTGACTGAGCTTGCTGGGACTTATGGATATGTT GCACCAGAGCTTGCGTACACGAGGAAAGTAACAGAAAAATGTGATGTCTATAGTTTTGGA GTATTGACATTGGAAGTGATAAGAGGAAAGCATCCAGGTGATCTTATCACCTCTTTGTTA TCTCCACCAACTACGGAGAACATGTTGCTGAAAGACGTTTTGGACCAACGCCTTCCAATT CCTGCGCCTGAAGTAGAGGACGAAGTAATTAAAATGCTAAACATTGCGGTTGCTTGCTTG CATGCCAGTCCACAATCTAGGCCAAGCATGGACATGATTGCTCCGTTGTTATCAGCCTAA
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>LITCHI016085.m1 GenomeSequence - TTTGTAAATTATCATTACAATGTACAAACCACAAACCATGGCAACAACATTAAACTTGCA AAACGTACTCTCCCCTGTTTTTCTTGTCCTGTTTCTTAACATAGTTGCCTCGCTACCAAG TGTTGCTTTTGCTTCTGCTGAAGAGGCAAACGCTCTTCTCAAATGGAAAGCTAGCTTAGC AAACCAAACACAGTCTCAGCTATTTTCTTGGACTCTGCTTTCTCACAATGCCTCCACCTC CAAACCAAGCACAAGTCCATGCACTTGGTATGGAATCTCATGCAACTCTGCTGGAAGCGT TAGCAAAATAAACATTACCAGTTTCGGTTTGAATGGTACCCTCTATGAGTTTCCATTTTC GTCATTTCCTAATCTTGTGTATCTTGATCTTGCTATGAATTCACTCTATGGTATCATTCC ATCGCAAATTGCAAACCTTTCTAAACTTATTTATCTTGATTTGTCCATTAATAAGTTCTC CGGACAAATCCCATTAGAAATTTGTCTCCTTACAAATCTTCAGGCCCTGCACCTTGTTGA AAATCAATTAAATGGCTCAATTCCTTATGACATAGGTCGTTTAAGATCTTTAGAAGACCT TGCGTTGTATAGTAACTATCTTAATGGTCCAATTCCTTCTTCTCTTGGTAATATTAGGAA CCTAACTTATTTGTATCTCTATAACAATTCCCTTTCAAGTTTTATTCCTCCTGAATTAGG AAATTTACAAAATTTGAATGCACTTTACATAGATACCAACAATCTCACTGGCATAATTCC TTCCACTTTTGGAAAGTTGAAAAATCTAAAGGTCTTAAATGCATTCCAAAATAATATTTT TGGTCCAATTCCTCATGAAATAGGAAATTTGAAATCTCTTATTGGACTAAATCTTTATTC AAACAATCTTTCTGGTTCAATTCCAATATCATTAGGTCATCTGAGAAGCCTCACTACTCT TCTACTATATAAAAATCAACTTTCAGGTCCCATTCCTAAAGAGTTAGGAAATTTGTTATC TCTAACCGATCTAGAGTTGAGTCAAAATCAATTGAATGGCTCAATCCCTACTTCCCTTGG TAATTTAGTTGATTTAGAATTTCTTTATCTCCGTCACAACAAATTTTCTGGTCCCATTCC TTCAGCATTAGGAAATCTTGTGAACTTGACTAAATTGGTACTAGACGAGAACCAATTTAC TGGTTTTCTACCCCAAAACATTTGCCAAGGTGGATCACTCCAAAGGTTTACTGTCAATAG AAACCATCTCACAGGTCCAATACCAAAGAGCTTGAAAAACTGCACAAGCTTGACTAGAGT TCGTTTGGATGAAAACCAATTCATAGGGAATATAGCTGAAGACTTTGGTGTTTATCCGAA CTTGACAGTGATATATTTAAGCCACAACAAGTTTCATGGTGAAATTTCATCTAATTGGTT CAGATGTCCAAAATTAGTTGATTTAGACATTGCAGGGAACAATATTACTGGAGGCATACC ACCCGAAATTGGGAAGGCAGCTCAGCTACAAGCACTGGATCTTTCTGCAAATCATTTAAT TGGGGAGATTCCAAAGGAGTTGGGAAAGTTGACTTTGATGTCTAAGCTCAACTTGAGTAA CAATCAACTTTCAGGTGGAATACCTCCAGAATTTGGGTCATTGATCAATCTCGAGCGTTT GGACCTATCAAAAAACAATATGGGCCAATCAATTCAATATTTGGGAAAGTGCACCAAGCT GAACTACTTGGATTTGAGCAACAACAAATTCTATGAAGAAATTCCAAATCAGTTGGAGAA GTTAGATCATTTGTCCCAGCTAGATTTGAGTCATAACTTTCTCGAAGGAAAAATACCATC AACACTTAGCCATATGGAGAGCCTGGAAATGCTAAATCTGTCACACAATCGTCTTTCTGG TTTAATTCCTAAGAGTTTTGAAGGTATGTACAGCTTGAAATTTGTTGACATATCTTACAA TGATTTGCAGGGTCCCCTTCCTAACAACAAAGCATTTCAAAATGCTTCAGTGGAAGCCTT AAAGGGGAACCAGGGTTTGTGTGGCAACGTTACAGGACTACCACCATGTCCATCTGCTCC TTTTGTCAGATATGAACATAACTCGCGGAAGAGTCAGAGATTGGTGTTTTCAATTACTTT CCCTCTTTTGGGTACTCTTCTGCTTTTCTTTGTGCTCTTTGGAATCTACTTCATTTTACA TAAAAGGAAGAAAGATCCCTCAACGGAACACAGTGAAAAGTTGCTCTTCATTTCGGATTT TGATGGAAGAATTTTGTATACGGACATCATAAAAGCAACAAACGATTTCGACGCAGCTTA TTGCATTGGAGAGGGAGGATATGGAACTGTCTACAAGACTAACCTGCCATCAGGTAAAAT AGTAGCTGTGAAGAAACTTCATGCTCGTCCTCATGGTGAAAAGACTTTTCAAAAAGAGTT TCTGAATGAGATAAACACATTAACAAAAATCCGACATCGAAATATTGTGAAGCTTTATGG TTTTTGTTCAAATGCACAACATTCATTTTTGATTTATGAGTATCTTGAAAAGGGTAGCTT GGCCACAATTTTGATGGAAGAAGAGAAAACTAAAGAATTGGATTGGTCTAAGCGGTTGAA TATAGTTAGAAGTGTGGCTCATGCCTTGTCTTACATGCATCATAATTGCTCACCCCCAAT CATTCATCGAGATATATCAAGTAAAAATATTTTGCTGGATCAAGATTATCACGCTCATGT ATCAGACTTCGGCACTGCCAAAATTCTAAAGCTAGACTCCTCCAATTTGACTGAGCTTGC TGGGACTTATGGATATGTTGCACCAGGTGATATGACATTATTATTCTTTTAATTTGAGAA TATTTTTTTAATTATAGCATAAATTTTAGGCTAAATATTACATTATACTTAGATGATTAC TAATTTTTCATTGTTTTTAGAGCTTGCGTACACGAGGAAAGTAACAGAAAAATGTGATGT CTATAGTTTTGGAGTATTGACATTGGAAGTGATAAGAGGAAAGCATCCAGGTGATCTTAT CACCTCTTTGTTATCTCCACCAACTACGGAGAACATGTTGCTGAAAGACGTTTTGGACCA ACGCCTTCCAATTCCTGCGCCTGAAGTAGAGGACGAAGTAATTAAAATGCTAAACATTGC GGTTGCTTGCTTGCATGCCAGTCCACAATCTAGGCCAAGCATGGACATGATTGCTCCGTT GTTATCAGCCTAATCAACAACAAATTCACAAGATGAGATAATTGTGCAGAAGGCTATCAT GCAAGTCTTGTAGGAAAGTTATCTGAAAGCTATTGTGTAGTTGTGTACTATATTGCAGTG GCTGAAGTATTAATATTTCTTACTCTTTTTTAAGTATCTACATGTGTGTAGTTAGTTTTC AAGTGCCCAT