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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI016031 | Chr1 | 27726520 | 27730881 | - | "Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g30825, chloroplastic " |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI016031.m1 | 23 | 279 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 154.3 | 4.20E-45 |
| LITCHI016031.m1 | 24 | 278 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 94.7 | 5.90E-27 |
| LITCHI016031.m1 | 448 | 496 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 18.3 | 0.002 |
| LITCHI016031.m1 | 453 | 481 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 16.4 | 0.0087 |
| LITCHI016031.m1 | 522 | 549 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 20.8 | 0.00034 |
| LITCHI016031.m1 | 550 | 598 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 26.1 | 7.20E-06 |
| LITCHI016031.m1 | 558 | 586 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 18.1 | 0.0024 |
| LITCHI016031.m1 | 588 | 634 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 42.2 | 7.50E-11 |
| LITCHI016031.m1 | 591 | 621 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 16.1 | 0.01 |
| LITCHI016031.m1 | 627 | 655 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 23.6 | 4.20E-05 |
| LITCHI016031.m1 | 665 | 691 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 14 | 0.049 |
| LITCHI016031.m1 | 731 | 754 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 14.1 | 0.047 |
| LITCHI016031.m1 | 767 | 792 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 11.3 | 0.37 |
| LITCHI016031.m1 | 803 | 830 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 15.1 | 0.022 |
| LITCHI016031.m1 | 824 | 864 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 18.8 | 0.0014 |
| LITCHI016031.m1 | 836 | 864 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 14.5 | 0.036 |
| LITCHI016031.m1 | 898 | 952 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 23.6 | 4.50E-05 |
| LITCHI016031.m1 | 907 | 950 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 36.7 | 3.80E-09 |
| LITCHI016031.m1 | 908 | 936 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 19.1 | 0.0011 |
| LITCHI016031.m1 | 941 | 971 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 19.3 | 0.001 |
| LITCHI016031.m1 | 969 | 1022 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 23.1 | 6.50E-05 |
| LITCHI016031.m1 | 975 | 1005 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 19.1 | 0.0012 |
| LITCHI016031.m1 | 997 | 1056 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 23.3 | 5.40E-05 |
| LITCHI016031.m1 | 1011 | 1040 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 20.1 | 0.00056 |
| LITCHI016031.m1 | 1030 | 1090 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 23.5 | 4.80E-05 |
| LITCHI016031.m1 | 1066 | 1124 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 33.6 | 3.20E-08 |
| LITCHI016031.m1 | 1074 | 1106 | PF12854.10 | PPR_1 | Repeat | 30.4 | 2.60E-07 |
| LITCHI016031.m1 | 1077 | 1125 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 49.5 | 3.90E-13 |
| LITCHI016031.m1 | 1081 | 1110 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 31.6 | 1.20E-07 |
| LITCHI016031.m1 | 1101 | 1133 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 15.8 | 0.012 |
| LITCHI016031.m1 | 1115 | 1136 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 10.2 | 0.84 |
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>LITCHI016031.m1 ATGACGGTGAAGATGAAGAGAAACAGGTACATGAAACTTTGGAAGGAAGAGGCTCTTACT TCTGAAACTAAGACATTCCTCGGTAAAGGGAGCTTTGGCTCCGTTTACTTGATTAAAAGA AAAGCCTCCAAAACGGATACTTTTCCGGCGGAGATGGCTGTGAAAACAGCAAAAGTGGCT GACTCCGTGTCTCTCAAGTTCGAGAAACAGGTTCTTTCGAAGCTGACAGCGAGTACCTAC GTGATAAGATGTTATGGAGACGAAGAGACTGAAGAAGTCGTCAATGAAAACTCCTCTGGT CATGTTGAGAGGGTTTATAATTTGTTTCTTGAATTCTGTAGCGGTGGAAGCTTGTTTAAT CACATCAGGAATTCGGTGCATGGGTTGCTTCCATGCCAGGTTAGGTCGTACACTAGAGAT ATCGTTCGAGGGCTTGTGTACATTCACAGCCAGGGCATTGTTCACTGTGATATCAAGCCT GATAACATCCTGCTTGTTCCAAGAAACGACGATCATGATGGGTTTATTGCTAAGCTTGCG GATTTCGGGTTGGCCAAGAATCTGTTTCTTGAGGATGAAGAGAGCCCCTACATGAGAGGG ACTTGGCGGTACATGTCGCCGGAGCTGGTAAGGGAAAAGCTGTTGACGTTCACAGCTGAT ATCTGGGCACTCGGGTGCGTGGTGGTGGAGATGATGAGCGGACAGCCCGCATGGGGTTGT GATTTGGGTAAGGATGAGCTTCTGAATCGCATTGGCTATACTTCTGAAGTGCCTGAAATT CCATATAATGCTTCTGAGAATGCGAGATCTTTCGTGAAGGAATGTTTCAATAGGGTCCGA CACGTTAATGGCTCTTCTTCAGAGACTGAATCGTATAGTATTAATGAACCAACCCAATTG GATGATGACAACAATTTGGCTAAAAGAAATCGGGGTAATGAGGCTTTTCATGAACAAAAG TCGAATTTTTCGAGGAAAGTTAGGAAGAGAAGTTATGGTGAAAGAAAGGGGACTAAAAGA GAATTGGGTTTGAATTTTAGTTTTGGAAGGAATTATAGTGAAGAAGAAAGGGAGTATTTT TCGGTGAGTGATGGTGAGTTGGATGTGGATTATTCTGTTGTTGGGGCTCACTTGAGCTTG GAGCAATGTAATGCCATCTTGAAACGGCTTGAGAGGTGCAGTGATAGCAAAACCTTGAGG TTTTTCGAGTGGATGAGGAGCAACGGGAAGTTGGAGAAGAATTTGAGTGCTTACAATTTG GTTCTTAGAGTGTTTGGTAGGAGAGAAGATTGGGATGCAGCTGAGAAAATAATCAGGGAA GCGAGTTGTAACGCAGATGGTGAGCTGAGTTTTCAGGTTTTCAATACTCTTATTTATGCG TGTAGTAAGCGTGGGCATGCGAAGATGGGTGCAAAGTGGTTCCATATGATGCTCGAATGT TCAATTCAGCCAAATGTTGCCACCTTTGGGATGCTCATGGGGCTTTACCAGAAGGGTTGG CATGTTGAGGAGGCAGAATTTGCGTTTGCTCGAATGAGAAGCTTTGGAATTGTGTGTCAA TCTGCCTACTCATCAATGATCACGATTTATACCCGTTTGAATAAATATGAAAAGGCGGAA GAGGTTATTGGTTTGATGAGAGAAGATGAACTGGATCTGAATTTAGAGAACTGGTTGGTT ATGCTTAACACTTATAGTCAGCAAGGCAAGTTAGAAGAGGCTGAACTGGTATTGGGCTCA ATGAGAGAAGCGGGTTTTCCTCCAAACATTGTTGCTTACAATACCTTGATTACGGGGTCT GGGAAGGCATCTAATATGGATGCTGCTCAACGCCTATTCATGAGCATTCGAAGTCTTGGG TTAGAGCCAGATGAAACTACTTATCGCTCCATGATTGAAGGTTGGGGTAGAGCTGGCAAT TATAGGGAGGCAGAATGGTATTATAAAGAACTCAAGCGGATGGGTTACAAGCCCAACTCA TCCAACTTGTACACGCTTATAAATTTGCAAGCCAAACATGGGGATGAGGAGGGTGCTGTT AGAATTCTTAATGATATGCTGAAGATGGGATGCCAATATGCCTCTGTCCTTGGTACCCTT TTGCAAGCGCATGAGAGGGCTGGAAGAATTGACAAAGTGCCGGTAATATTAAAAGGGTCT TTTTATAAACATGTTTTAGTTAACCCAACTTCTTGCTCCATTCTGGTTATGGCCTATGTG AAACATGGGTTGGTGGATGACGCTATAAAAATCTTGGCGGAAAAGGAGTGGAAAGATCCT GTTTTTGAGGATAACCTGTATCATTTGTTGATTTGCTCATGCAAAGAATCAGGTGATGTT GAGAATGCTGTTAAGATATACTCTCAAATGCCTGATTCTGATGACAAGCCAAACTTGCAT ATCATGTGCACAATGATTGATACTTACAGTGCTATGGGCCTATTTGTTGAAGCAGAGAAA CTTTATCTGAAGTTAAAATCTTCAGGAATTGGCTTGGACATGATTGCCTTTACTGTTGTT GTAAGAATGTATGTCAAAGCTGGATCACTGAAAGATGCTTCCTCTGTTCTAGAAACGATG GAGAAACAGGGAGAAATTGTTCCAGACAAATATCTATACCGTGATATGCTCCGCATTTAT CAACAATGCGGCATGCCAAAAAATTTACAAAATCTGTACTACAAGATCTTGAAGAGTGGT ATCACTTGGGATCAAGACCTGTACAACTGTGTCATAAAAAGCTGTGCTCGTGCCCTGCCG ATTGATGAGATTTCTAGGATTTTTGATGAGATGATTCAGCGTGGATTTTCTCCTGATAAC GTCACCTTCAATATCATGCTTGATGTTTATGGAAAAGCCAGGCTTTTTGGGAAGGTTAGG AAGTTGTTCCAGATGGCTAAAAAACTAGGTTTAGTGGATGTAATTTCTTACAATACGATC ATTTCTGCCTATGGTCAAAATAAAGACATAAACAATATGGTGTCAACTGTTAGGGAAATG CAATTTGACGGTTTTTCGGTTTCCCTTGAAGCTTACAATTGTATGTTGGATGCCTATGGG AAAGAGGGTCAAATGGATAATTTTAGAAGCATCTTGCAGAGAATGAATGAATCGAGTTGT GTTTCTGATCACTATACTTACAACATTAAGATCAATATCTATGGAGAGCAAGGATGGATC AATGAAGTTGCTGGTGTGCTGACAGAACTGAAACAATGTGGGCTTGGTCCTGATTTGTGC AGCTATAATACGTTGATAAAGGCATATGGAATTGCTGGCATGGTCGAAGATGCTGTTGGT TTGGTCAAACAAATGAGAGAGAATGGTATCGAACCTGATAAGATTACATACACCAATTTG ATCACTGCACTGAAAAAGAATGATAAGTTTTTAGAGGCTATTAAGTGGTCCTTGTGGATG AAACAGATGGGTGTCTAA
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>LITCHI012069.m2 TTTGGCGATATAAAACCGGGTCTCGCATGAAAAAAACAATAATTTTCTTCTCTGTATGCA AGAAAGCTTCGATTTTTTTTTATTAATTTATCGAAACAAAAGCCAGGGACTGTGTCTTCT TGTTTGTTGAATCTGTGTTGAGGATCTTTTCAGGTTTTTTTGAGCTTGAAAAGTGGTGCA GAGATGGCAGTGATGTCAATGAATACTCTGCCACTTGGGTTCCGATTCAGACCCACCGAT GAGGAACTGGTTGATTTCTACTTGAGATTGAAGATCAATGGCAAAAACAACGAGGTTTGG GTCATTGGAGAAATCGACGTCTGCAAATGGGAGCCCTGGGACCTACCCGATAAGTCAGTT ATTCAGACAAAGGATCCAGAGTGGTTCTTCTTCTGTCCCCAGGACAGGAAGTACCCGAAT GGGCTGCGGTTGAATAGAGCTACTGAAGCTGGTTATTGGAAAGCTACTGGTAAGGATAGG AAGATCAAGTCTGGTAGGAACTTGATTGGCATGAAGAAGACGCTTGTTTTTCACACTGGT AGAGCTCCAAAAGGCAAGAGAACCAACTGGGTCATGCACGAGTACCGCGCCACCACTCAT GATCTTGATGGCTCCCACCCTGGCCAGAATGTTTATGTTCTTTGTCGTTTATTCAAGAAG AATGATGAGACTGTTGAGATTTCTCATGGTGATGAGGTTGAACCTGCTGAGTCATCTCCT GTCTCGGCTAATACTCCTCCAGATGATAATGTATCTGAGTTGGCATTGCCTGAAGCACCT CCGATAATTGAAATTGTAGAGGAGAAGCATCCCATTAGTATCAAAGGCTCTCCTTTGCCT GAATTAAAGACTGATCATATGGAAGGCCTTGTTGAGCATCAGAGCAACAGCTCTAATGCT TATGACGCAAATAGCCAAATGGTTCAAGATTTAATACTTGATAATGAAATTGATTCGTTC 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TGGTATTGGACAGGGTACTGCACAGAGAAGAATTCGTCTGCAGTGTAAACTTCAAGTCCA GGCAGGTAGTACGATGTCAAGAGCTTTAAGCTGTACTCCTCAGGAGCAAGAATCAAAACC TAATGCTATAGAGGAGTCAAAAGCTGAGGTAGAGGCATCTGCTGCCAGTGTATGTGCAGA TATTAGTGCTAGTGATGAACCACAGGAAAAATCCCATTTTGAGGTGACTGAAAACAGAAA TATATCTGAAGAACTTACCACCAATGATGGGCTAAAGGAGACGTCAAACGGTATCATTTT GATGGACAAAGTGGTTTCAAAGTCTTCACGACGCCCAATTTTGCCATTTGCTGTGATGTT TAGGGTAGCTGCAGTTGTAGTCATGTTGGCAGTCTTGGTTAGTTTTATGTGTCGAGTCGC TTAGGACATAAATTTTGAAGCTGCTTAGAGTTGTTAGCTCATTAGTCAAATAATGTATAG TCTGGCCAATTTCTTTTAGGCTTTTTGGGTTAATAATACTGACTAGAACTTATTATAAGG ATAGATTCTTTACTTACTATCTGTTACCATGTACATCTATCTTCAGCTGCCGTTGCAGTA TATGCTCGGACTTAGTCTTGTATTTTTGTTGGTATATATTTCTATAAAAGCAGCTTCATT TATTTGAACTTTTGCATATCCATTTATTAGAGCTTAAATATTCTCTCTATTACATCTTTT ACTTGCCCGCTTTTACGAAACAACATATAACTCGTAGGTAGAGAATCCATCAAGAAAGAC TGCGGACTTTGTTGATCACGCTTGAATCTTTGCCATTGGACACTAACCGAGCAGCTTTTA TTGCGTGCTCATCTAAGATGTTATCAACCTTATAAGCTAGCTGCATATTTGAGCTTCCGC AACCAATTCTGAAGTGCCCTGTCTCTTGGTTGTTTCTTCTTTACATCTTCAAGCACAGCT 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