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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI016029 | Chr1 | 27687895 | 27697499 | - | Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24130 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI016029.m1 | 30 | 70 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 31.8 | 1.40E-07 |
LITCHI016029.m1 | 199 | 259 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.8 | 1.10E-08 |
LITCHI016029.m1 | 352 | 412 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34 | 2.00E-08 |
LITCHI016029.m1 | 412 | 461 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.2 | 2.60E-06 |
LITCHI016029.m1 | 425 | 444 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.1 | 0.57 |
LITCHI016029.m1 | 499 | 519 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.1 | 0.55 |
LITCHI016029.m1 | 666 | 954 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 149.8 | 1.00E-43 |
LITCHI016029.m1 | 668 | 954 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 133.6 | 7.90E-39 |
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>LITCHI017391.m1 ATGCCAATGGCTTCAATGAGCAGTAATTGCACCAGGAAAGAAGCTAACAGAGGAGCATGG ACACCTGAAGAAGACCGAAAACTGGCTCAAGTCATTGAAGTCCATGGTCCAAAGAAGTGG AAATCTGTTGCAGCCAAAGCAGGTTTGGATAGATGTGGGAAGAGTTGCCGGTTAAGATGG ATGAATTATCTTAGACCAAATATCAAGAGAGGAAATATATCAGACCAAGAAGAGGACTTG ATTCTCAGGCTCCATAAACTCCTTGGAAACAGGTGGTCTTTGATTGCTGGAAGATTACCA GGTCGGACCGATAATGAAATCAAGAACTACTGGAATTCTCATTTGAGCAAGAAAATAAAG CACAATGAAAAACGAAGGAAAGGTTCAACGGCAAAGGAGTTGAAGCTTGAGATGTCTAAC GTAGTGGAGATGCGCACCACAGAAAACCAAAACAAAGAGGGCACCTCCAATGCAGATGAT CAGGACTCGTCAAAATCTACACTTGTAGGAAATCATGAGTTATTTAATAGCTATAATGAG GACCCTCTAGATTTGGAGTGGATGGGTAGATTTTTTGAAATGGATGAAAGTTGGTTTGAT TTTGCATGA
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>LITCHI017391.m1 - Up_Stream_Len 2000 GATGTAACAATTTGCTGTCTTATCTAATGGTGGTGGCTGATTGCACAGAAGGATATGGTC TTGAAGTTTTCATTGTTTCTTATTCGTGTCACGTGTTTTGCCTCCAAAAAATCCATGGGT ATTAATGTCAGTTCATTTAGCATAGAACTCATTTAACAATTGTGATTTGTGAAATTCTTA TGATGATATCATGATATGATATTTATTATTGTAGTTATATTTTTGTAAGAAAAAAAAAGA AGAAAACGTTTTCATCCAATTATTCATGACTAGAATATTTGGGAGGAAAATCTTTGAAAA TTAAACATAAATACGGTGAGATTTTCTTTTTTTACCAATAAATATGGTGAGATTTTAATA GATGGATATCAGTAATGCTAAGATGGCAACATCAAATTCATTTCACGTGGACCACTTCAA ATCTGGGTACAAAGGTACAGTGATGAACGGTGAAATTATTGAACCAATTGATAAATTTGG GGATTATCACTTTAAGAAGGACACAATTTGATAAATTTATTAGGATCTGCTGATTGTCAT CTACTCCATATTAATGACGATGGATCAAACCATACCCTTCCAAAACATATGCATCCACAA AGATGCGTTTTAGAATCACTACCTAATACTGTAATACACATAAATTAATTAATTAAACAA ATGTGCTTCACATTCTCACCTAGGCTAAGTCCTTAAAAAAATATTTAACCAGAAAATACT CAACTATGCCAAACACTGAATATGTACAATTCTCCCTGGTTGGAATCAAACCTACACTGG TTTTGTAGTTCTACTTTATCAAAAAACCACCTCAATTAATCAAGGAAAAAAAAAAGGGCT CTAGAAAAGAACATACACAGCCTGCAAATTAATGCCTTTGAAAATTTATTGGTTTTGTTA CATTTTCTTTTTACCAAAATTTAACTAAAATAAGGGATGATTTTAACTGAAAATGTAGTC CGACAATTCATGTAATGTTAAATAACTTGACTCAGTAGGACCCCAAACTTTAAAAACCAT TACAGGTAAATTGGTGGAGAGTGATCTATATACTGTACTCTGCTTCCTGACACAAGCAAA GGAACGGAAGGGGCTCTAGGCAAAACAATACAGACTAAAAAACTATAATTACGCACAGAA TTTTGTGATAGTCATCAAAGATGGGCATGAGGCATGTGATTATAAGACCATGTATGTAGC AAGTAATCATGCATTTTATTTTCTCTCTCAAGAAGAATCTCATCTTTTTTTTAATTTGGT TTTAAGTACTGTACTTTATTATTCCCTGCATGATATACAGTTCTCGTTATAAAATAACGA AACTGACTTGTTTTTTTTTCATCTGTAATTTGACCCTCTTCTCATCCTCAAATTGTTTAT CTCTTGTTTCTCTTCATGTACCTAATGCCTCCACAACAATCTGTCCCACTTGAAACTTCC AATACGTTTTCATGTAAACTGTATACTTATCATATATATGATGCAATATGAGCATGTATT TGTTGATTCACTTTTTGTTTTCCAATTTGATGTATATAGATATATGTCATGATTGAATAA CGACAGCCATTGGATACGTGGATGTCTTCTCTCTGTTTGTATGCTCCCCTTTTGATCAAA AGTTGATGTGTGCACAAGGTTTAAGTTGTATACATATAATATAATTATCACATGTTAGAT TCTCTCATTCTCCAATCATCAACCAAATTAATAGAAATTAAAAAAATAATAATAATAAAA ATAGAAAAATTTAAATCTGGGAACACATCAGTGATCTCATTTATAAATGGTTAATTGGAG GGTTGGAGTTTCAAAGTTAGTCCCAGGGAAAGGTAGCTAGCTAGACATAGAATCTCTCAT CACCCAATAAAGCATAAATATCCCTTATTATAAGATTAACTTACTGGCCAGAGTGCCTGC TCTTTTCCTACCTCAGTCCACTAGCTTTGTGTTTAGATAACTCTTTTGCTTGTTCACACA AGGAATTGTAAGGAAGAAAG
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>LITCHI013807.m1 GenomeSequence - ATGGTTCACAGAGTATTGCCAACTCATGTAAACCAAATGAATGAAAGTGCATTGAAAAGC GACGGAGTCTCAAGACTTGCATACCTAAAAAATGGTAACTTGCGTAGCCGATTGACAAGA GGGCACCACTCTCTCTCCCACCTACTCAAGATATGGTGAGATATTTTTGTATAAAAAGTA AAACAAAGTACTTCAAAAGAGAAAAAGCAGGTTATGTTTTTTTTTTCTTTTCTGGGAAAA ATATTAATTTTCAGTCAAGTTCAATTAATAGTATATGACTTTAACTTTGAAGTGTGGTTT TGAATTTTACTAATTTGTATCTAAATCTTTACATATTAGGCACACATTCAAGAACTCGAG GAAGAAGTGAAACTATTCAAGAATCTTACACATCCAAACATTGTTGTGAGTAATGGTATA TTCAGTTTTGTTGTGGATTTGATTGTATTTGGATGATGTCTCATTGTTTTTGTCAAATTT TTTTATTTAGAGATATTTGGGAATTGCAAGAGAGGATGAATCATTGAATATATTGTTAGA ATTTGTTCCGGTGGATCTATATCATTGCTATTAGCGAAATTTGGATCCTTCCCTAAGTCT ATAAGTGATAATTGATTGTTGGTTTTTCAATTTTAGATTGTGGGTGCTCTGGAATGCTAA AATGGGTTGTGTTTGATTAACAGGTTATTAGAATATACAACAAAACAGTTGTTATTGAGA CTAGAATATCTTCACATGAATGGAATTATGCATGGGGACATTAAGGTAATTTTATTTAGT TCTTCTAAAGAGAAACTTTTATACATCTATCTCAAGCTTGATTTAATAAGGGGCATGGTT TCACTCAGGGAGCAAACATTATTGTTGATAATAAAGGCTGCACTAAACTTGCAGACTTCA GTGCATCCAAGAAAGTTGTAGAGCCAGTATGATTTTTATTTTTATTTTTTGTTTTTTAAG TAACAAAAGAAAATTTTGTTTGCCCTTATGGATTTTGCATGAATTTCAGGTTTTAACGTT GCCACAGACTGTAATAAATAGTGTCAAGTCAATGAAGGGTACACCATGTTGGATAGCTCT AAAGGTTCTTCTCTAGACTGAGATATATTGGCATAGCTTGTAAGGAAGACTTCCACATTC ATGCTTGCAGATATTAACATTTATTTGATTGTCTATGCATTGCCATATATGACTATGCCT TTTCTACAAGTTATCTTTTTTGTTTGTCTATATTTGTTGAAAATTTTACTCTTAGTGAGA CCCAATTACGAGGCATGCTAATTACTATATCAATATGATATAATATTTTTGATAAAAATG AGAGCAAGAAAGAGATAAAACAAAGAGCTTGATTTATTATGTGTTTTTTTTTTTTTAATT ATTAACGTTTCATTTTATATGTTGTAAAATATGATGTTAAGGTCATGTAATGAGAGTTTG AACATTTAATAATATGATGCCCTGTTTGTTTGTTTTGGTTCTTCATTTAAAAAAAAAAAA AAAAGTTTAGTTTTAAGGTTTTGATGTCATTTTATTAAAAGTTTTAAGTTTTTTTTTTTG TCAAATGTTTTGATGTCGTTGTATAGTTTTTTAGGGTTTTAATTTTTTGATGAGAATAAT TAATGATGGTACTTTGTTGATTCTCCATTCACTTTCTTGGTGATGGTTCTGTTTTTTTAA TGAAAAAGTAATGAGTAAGGATTTGTTGTTATTTTGATTTGGGTTTGCATTTGGTGTTTT ATATGAGTTTATGGGTGTTGAGTTAACAGTGTTGGAAGTCTTTTAGGTGAAAGTGGTGGT ATTGATGGCTTTTTTTTCCCCTTATTTCTTGGGAGGCTGTTTCTTGGTTGTTGAGGTAAT TGTGATGTTTAAGGTCATGCATAACATTTATGGTGAAGGTAGCAAGGTCGTAAGGTTGGT TTGGAACTTATCTATTGGGTGTAGATAATGTTGAGGACTGTTTTGTGTTGAAATTTTGTT GTTTCTCTTGTTTATGTTTATTTATGGCTTTAATGTCTGTTTGGAGTCTCTATATTCAAA ATGAAAATGATGATTATTGATGTGTTTCAAATGTTGATTTTGTGTGTTTCTTTGTTCTAC ATTTGGATCTTTTATGTGTTTTAGGATTTTGAAGACTCTCTGCATTTGTATTTTTCAAAC GTTTCTTTGTTCTGCATTTGGATTCATAATTACATATTTGTAGATTGTTAAGAGATTGAA TTCAACACCTCACGCAAAAGAGATCAAGCTTCAGTTATTGCAAGATGTAGCTCGAGAATT CTCCATAGAATGGGATTCCAAGGCCTTGCAACAGAAATTGTATACACCACCACCACCTAC CCAGGTGAGCCTTCTTTCCCGTGACTTACCAAGTTATTAA