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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI015945Chr12277098922772885-Protein SHORT-ROOT

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI015945.m165438PF03514.17GRASFamily324.21.10E-96
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>LITCHI015945.m1
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CAGCAAAGCAATGGTCAGATATCAATAGATATGCAGCATCAAAGCAATCACCAGCCACAA
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CAACAGCATCACTAAACGACTCAGAGAAAACAACCCCACCTCTCCTACTACTCTAACCTT
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GAGCTCTCAAGCTGTATTCAGGTGCGTACGAGTGAGCAGCGTTGATGACGATGAGGACCA
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TGCAGGGTAGCGTTGGCACTTTTCTTGGTGACTTATCTTGGTTCTTTGCGTCTTAAGCCT
GCTTTTATGCAGAATTTATGGCTTTCATGTTGGCAATATATAGAGAATGCCTTTGCTCGT
GGCTAGCATCGATTATGGATTAAAACAATAAATTCTCCATCTTTGGTTATTTATTTCAAT
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>LITCHI006535.m2
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CAACACCAATATTTTGAAGAGAGGATTCATCAGGAAAAGAATTGAAGAGTGCCCTCCAAA
AGCATTCGACGTGTGTACCTATTTCAGCTTTTGAAATTTTCCTTTCTTCAATTTCTTCTC
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CTAGGCGCCGGGAGAGGCAACAGCAGCTCGCTGCTTTGCAACAACAACAACAACAACTCC
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CCGCAGGTAGTGGTGTTGGTGGTGCTGCCTCTACCGCATTTTTAGATCCTTCTTGTTTGT
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TCTTATAATTCCACTTTGAAATCTCAATCGAAGTTGTTTGTTTGTTGATATATTGTATGA
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>LITCHI006535.m3
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TTATTTTTAATTTTCGGCTTTTGGAGAGGAGGAAGAGGGACAAGTACATACGAAAAACAA
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CTGTTGGTGGTGCTGTTCAACAACAACATAACCAACCACTGAATCTCATAACTGCTTCTC
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AAATATATATTATGGTTTCGTCTCTGCTTGTACAAAGTACACCAGCTATATATC
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TTGCGGCACTTGTGCTTTATGCTAGTTAAAGGTGAACTGGATCGTTACTCTCTTAGTGTC
ATACAAATTTGCAGGTTGAC
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TGCAGTGATTATTGTTGAGAGCTACAAGGTTGTATCTTTTGATGATAATGTATAATTATG
ATACTATTAGACATGTATTAGCTTTAGCTGTTGTGTCTGTAATATATGCTATGCTGCAGT
GTTATTGATGTATGATTGGTGGCTCAAAAATTTATTTTTTCTTCTTTTTCTAGGTATAGA
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ATACAAATTTGCAGGTTGAC
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GTTTATCGGCAGAGAACAGGCGTGTTTAGATTGCATTAGGAGGTACTTTCATGTTGTGTT
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GTAGAAGAAAGTTTACATGTGGGTTGTGGATGGTATTGGGTTTAGTTTGTGAGTTGTCTG
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GTTATTGATGTATGATTGGTGGCTCAAAAATTTATTTTTTCTTCTTTTTCTAGGTATAGA
TTGCGGCACTTGTGCTTTATGCTAGTTAAAGGTGAACTGGATCGTTACTCTCTTAGTGTC
ATACAAATTTGCAGGTTGAC
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GTTGGCATCACAGGGAGAACAAACACACCAACCACATAAAATCAAGACCCAAACACAGAT
ACTCGAGTGTACCTTCTCACACCCAATCAGCTCTCCCCTCCGCTCCTCTTCTCTTCTTCT
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AGGAGGAGCATGTGGTAGAAGAAAGTTTACATGTGGGTTGTGGATGGTATTGGGTTTAGT
TTGTGAGTTGTCTGTTGAATTTTATGAAAGTGTGCATCTAAAGGAATTTCAATTGAGTTA
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TGCTATGCTGCAGTGTTATTGATGTATGATTGGTGGCTCAAAAATTTATTTTTTCTTCTT
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AGTTTTACTGAGCAAGAACAACCCCCAAATCCTGAACCTGTCCGAAGCTGAACTCAAGCT
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TGATGCACATAGTCGCAATATTGAAGCATATAATCATGATTTGTCACTTTTATGGTTCTT
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AGATTCCTGCTCAACAAGGGTCACTACCTTGGGAGACAGTCTCTTGACCAGCATCAGCAT
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GAGCTTTCTTCCGACTATATTCAGCCCACCTCCACGGGCATAAGCTGAGGTGGAATCGTC
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AGTGATCCACTGACTCCCCTGTGCGATTTGGAAGTCAATGATGTGAACTCTGTCTTCGTC
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CAAAGCTTTGTAAATTGAACTCCCTGAGGAGGCCAGTCGGGCAACAAGCCCTTCCAACAT
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GACTTGTTTCACATCCTTCCTTGAGCTTGCCCCCATTATTTGTCTCCAAATGTTCATCTC
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GCAGTATTGTTCATAAGTATTTGGAACCAAAAAGTCGGTAACTACACTGCTGTCAGTGTA
GCTGTTGTCATTGTAGCGGAGGTGGTGGTCTATATTTTGGAACTGAGACAAGTAGTATGC
CTCAACTTCTTGCATTGGTTGATAGAACGATCCACTGGACATGCTTGAATTTTTGTATAG
ATGTGATGCTTGCATTTACTTTGTCAGTCTTCCTGGCCCCTTCGTTTACAGTGACATCAA
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GAAACCAAAATAAAACCCTCTCACAGCCTTTTGAAAACGGAAATATCGATGAAAGCACAA
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TACAAAGTACCTGCTCATAAGATTTCTTGGTTTTGGCTTCTTTTTCTATCTCCTCAACTT
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AAGACGTAAACTAACAAAAGGGCTGTCTAAGCGAATCACTAATAATTTTTCAGTATATAT
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AAGCTTACAGATAATCTTTCTAAACAAATTCGCAACTTTAACACAAAGCAAATTATACAT
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GAAACCAGCTACCAGAACCGTAAACGAGCACGAATCTAGTCAAAATGAAAGAGATGGTTG
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CATCAAAGAAAACAACCTTAACAGACCACATTCAAGCCAACAAAATAATCAACACAGTGT
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CCACAAAATTGGACTTGATATTTTAGCTCAAAAGGAAATTCAAGGTATTTCAAAAGTATG
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>LITCHI021444.m2 GenomeSequence + 
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ACTCGAGTGTACCTTCTCACACCCAATCAGCTCTCCCCTCCGCTCCTCTTCTCTTCTTCT
TCTTCGAGTCCGTATTTTCGGATTAGACTCTCTCTAACACTATCACCACCAACCTCTCCT
TCTCTCTCTCTCGCTCCCCCTCACCACCAACTCAGTGTTGACTCGCCAATCGAGTCTCGA
TCCGCGGCGGCCGTGATCGAGTCAAAAAGTCAACGGTTGCAACCCTGGCTTCGAACCACC
TGATCACTACCTCCTCCCCTCGCTAGGGCGCGCCTCTTCTGCTTTTCGACTCCAAAACAC
TGAAGCCGGTACTGCTATAGATTGATTCATTGATTGATTTTTGGTGAATTTTGTCGCTGT
TGTTAATTTTTATAAAATTGAATTGTGTTTGTTACACGTGTCGATTGACGTCGAGAATTT
CACTGTTTAGTGTTTAGTGATGATGTTTGTCGAAAAATTGAAAGCTTGTGTTTCGCGTAG
AGTCTGTTGCTTGCTGAGAAAATGTGAGAAAATCGTAAATTTTGCAACTTTCCCGGTTTT
GATTGGTTAATTGTTAGTATCTGATAACTGTATTTAATATATATATATATATATATATAT
TGTTAATTATTAGTTTGATGCAATTTTGAACTGATTTATGTGTCTATGATTGACGAGATA
ACATTGTTTTAATGGTTTATCGGCAGAGAACAGGCGTGTTTAGATTGCATTAGGAGGTAC
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AGGAGGAGCATGTGGTAGAAGAAAGTTTACATGTGGGTTGTGGATGGTATTGGGTTTAGT
TTGTGAGTTGTCTGTTGAATTTTATGAAAGTGTGCATCTAAAGGAATTTCAATTGAGTTA
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AATGTATAATTATGATACTATTAGACATGTATTAGCTTTAGCTGTTGTGTCTGTAATATA
TGCTATGCTGCAGTGTTATTGATGTATGATTGGTGGCTCAAAAATTTATTTTTTCTTCTT
TTTCTAGGTATAGATTGCGGCACTTGTGCTTTATGCTAGTTAAAGGTGAACTGGATCGTT
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GGATGAAGTTGCTCCTGATAAATCGCCACATGGACAAAGCCCTGACCATGGGAGTCATGG
ATCAGAGCCAAACAATTTTAGTGAAATTCGTGCACCACAATCTGATCAAGATGATAGCAC
TCCCTTGAATGTGCGAAAGAAAGATTCAGTGGAATCAAATACCAGTCAGTCACTGAGATC
TGATCAACAAGGAAGTGTTTCTTCCATAAAATCTGAGAAAGCATCGGAGACGACTACTGA
CATCGTTCTGGCATCACCATCTGGTCCTGAAGGGAGTACTCCTACTATAATGCGGGAGAA
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ATTTATAAGAAGCTACTACAAATGTACATATCCAAACTGCCGAGTTAAAAAGCAACTGGA
TTGTACTCATAGTGGGCATATTACAGATACTATTTATTTTGGTCAACATGATCATCCAAA
GGCTCCAAACCTCCCTCTAGCTGTTGGATTTGTTGTGTCTATTGTTGAAGAGAGACCAGA
TGACTCTTCTTCAAGTGTTGCCAAAGGTAAGAAAGACACTTGAATCATTAATATCTGGTT
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TGCCAGCCGATCCTTAAGTATACTTATGATTAATGGTAAAAAAAAAAATTGTAAACAGGA
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ATGGGCAGAAGTTAGTGAAAGGCAATCCAAATCCAAGGTATGCTTTAAGTGTACAGTTTG
TGCATAACTAGTCCATGATTTTATATGGTCTTTCTGCTCATTGGTTATGGAGATCTGTAT
GCTTTTAAAGGTGATATAATGAGATCTCTCATATTGATTATTATAGACAAAAGGACTGAA
TGCTTTTAGCTCGCCTGCATGTCAGGTTACTCTAGCTAACATCATTTTCTGGTTGAGTTT
GTGCTAACTCTGTGTGCTGTCATGTTATGCAGGAATTACTACAGGTGCTCAAGTTCTGGA
TGCCCAGTCAAAAAACATGTAGAGAGGGCATCTCATGATCCAAAATTGGTTATTACAACA
TATGAAGGACAGCATGACCATGACATGCCTCCATCAAGGACTGTTACTCATAACACAGCT
GGCCAAAACAATACCACAACAGGTCAAAATGATGAATCAGGCGCAAAACAAGAAGAAACT
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GAGCAATTGAACGGGGAGTCAAAAACAAAATCAGTAGTAACAGGTGATGTTGGTGGCTCA
GATATAGCTGACAAGTCTATCTCGGGTCCTGAAAGCTACTCAGCTGAGCAGCAGAATGGC
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AGTTCATGCCTTGAAAACCGATCAGATGACCAACTGAATGGTAAGTCTGGAACTGAAACA
GAACAAAATGGTACTGCCCACCATGATAAGGTTGCCCATGTTACTCCATGCCCTGAGACT
AGTTTTACTGAGCAAGAACAACCCCCAAATCCTGAACCTGTCCGAAGCTGAACTCAAGCT
GCTGGTTTAACTGCACAGAGACGGCTAATCGCTCGAATGATGATTCTGATTAAGATCAAT
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GTTATCAGATTCGATACAAAATTAAAGATGTAGATTTTTAATTATCTTAGAAGTATTTAA
TGTAGGAAAGTTGTTAATGCTAGTCCCTTGCCAGTAGCATTTTTTTATCTAGTTTGAAAT
TGATGCACATAGTCGCAATATTGAAGCATATAATCATGATTTGTCACTTTTATGGTTCTT
GATAATTAAAGATGATGGACTAATTTCAAAACTTGCTAAAGCATTTCTTCACTGAAATTA
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CATTGCGGAATATTACTTAACACTAAATACCCATTGTTGAAACATCTGCAACTTTCAATG
GGAATCAGATGCTCGATTTCCTCTCTCAACAGGAAATCGATGATGATTCGAAAGCCATTG
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TTCAGCTTCTGCCCTGGTAACTAAGTAGGAAGAAATTTTAAGAACCTAACAGTTTCTGTC
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TTCAACATTGATCCGCTCCTTATGATCCCTTGGGAGGGTCACATCGATTGATTCGAACAT
AGCTGTGTAATAGTTCAATGCCTCCAGGAACCGCGGGTAGAATGCGGCGGTATTTGTGTT
AGATTCCTGCTCAACAAGGGTCACTACCTTGGGAGACAGTCTCTTGACCAGCATCAGCAT
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GAAATTCACAGCCAGCCCCTCCCCAGGTTGAACTCCAAGATTATCCAGCCTAACATCATA
GCCAGACATGCCTGCAGCATGGAACTCAAACGGCACCTTAAATTGTTTGGCAAGCTGAGA
GAGCTTTCTTCCGACTATATTCAGCCCACCTCCACGGGCATAAGCTGAGGTGGAATCGTC
AATGCCTGTTATGCGAATGTGGGGTGGCCCACCAGGCCTAGCTGCAAATGCCTGGATAAG
AGTGATCCACTGACTCCCCTGTGCGATTTGGAAGTCAATGATGTGAACTCTGTCTTCGTC
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CAAAGCTTTGTAAATTGAACTCCCTGAGGAGGCCAGTCGGGCAACAAGCCCTTCCAACAT
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GACTTGTTTCACATCCTTCCTTGAGCTTGCCCCCATTATTTGTCTCCAAATGTTCATCTC
TGATGAGCATGTTTCAGTTCCATTTTGGAAGGTACTGTCGATGCTGTCAATAATGTCAGA
ATCCGGTCCCAACATTACCGTTTCTAGTTCTCTCAGTTTATGCCTCAAATCACTCACATC
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ATCAGGAGGATATGACTGAGACTCCTGCTGCGACATTGGGCTTCCATTGGGTGAGAAATT
GACAGTCGATGGGGATTTGTATGTGTTGTAACTACGATTCACTGAAGATGACTCCAGGGT
GCAGTATTGTTCATAAGTATTTGGAACCAAAAAGTCGGTAACTACACTGCTGTCAGTGTA
GCTGTTGTCATTGTAGCGGAGGTGGTGGTCTATATTTTGGAACTGAGACAAGTAGTATGC
CTCAACTTCTTGCATTGGTTGATAGAACGATCCACTGGACATGCTTGAATTTTTGTATAG
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GAAACCAAAATAAAACCCTCTCACAGCCTTTTGAAAACGGAAATATCGATGAAAGCACAA
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AAGCTTACAGATAATCTTTCTAAACAAATTCGCAACTTTAACACAAAGCAAATTATACAT
CGTCTTGTCTTCTCTGTCACAACCAAAACAAATATGTTTTATTTTAGCTCCTAACAGTCA
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GAAACCAGCTACCAGAACCGTAAACGAGCACGAATCTAGTCAAAATGAAAGAGATGGTTG
GGAGATGGAGGAATTGAAGAAAGGTGACATCATGACATCCCAATTAATATGCACATCAAT
CATCAAAGAAAACAACCTTAACAGACCACATTCAAGCCAACAAAATAATCAACACAGTGT
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CCACAAAATTGGACTTGATATTTTAGCTCAAAAGGAAATTCAAGGTATTTCAAAAGTATG
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GTTAAAAGAATAAGTTGTCTTTCAGACATCAAAATCGTTTTTAAGATACAAAGCCACCAA
CCTAGTTAAGGAATCTCAACTTGTAACTTCACTAACAGAAGCAGAACCTGTGTTCTGTTC
AGCGTTTGAGAGGTTCTCTGTTCCTAACAGAGAGAGAAAGTAAGACTTTCTGTTGGAG
>LITCHI021444.m1 GenomeSequence + 
GTTGGCATCACAGGGAGAACAAACACACCAACCACATAAAATCAAGACCCAAACACAGAT
ACTCGAGTGTACCTTCTCACACCCAATCAGCTCTCCCCTCCGCTCCTCTTCTCTTCTTCT
TCTTCGAGTCCGTATTTTCGGATTAGACTCTCTCTAACACTATCACCACCAACCTCTCCT
TCTCTCTCTCTCGCTCCCCCTCACCACCAACTCAGTGTTGACTCGCCAATCGAGTCTCGA
TCCGCGGCGGCCGTGATCGAGTCAAAAAGTCAACGGTTGCAACCCTGGCTTCGAACCACC
TGATCACTACCTCCTCCCCTCGCTAGGGCGCGCCTCTTCTGCTTTTCGACTCCAAAACAC
TGAAGCCGGTACTGCTATAGATTGATTCATTGATTGATTTTTGGTGAATTTTGTCGCTGT
TGTTAATTTTTATAAAATTGAATTGTGTTTGTTACACGTGTCGATTGACGTCGAGAATTT
CACTGTTTAGTGTTTAGTGATGATGTTTGTCGAAAAATTGAAAGCTTGTGTTTCGCGTAG
AGTCTGTTGCTTGCTGAGAAAATGTGAGAAAATCGTAAATTTTGCAACTTTCCCGGTTTT
GATTGGTTAATTGTTAGTATCTGATAACTGTATTTAATATATATATATATATATATATAT
TGTTAATTATTAGTTTGATGCAATTTTGAACTGATTTATGTGTCTATGATTGACGAGATA
ACATTGTTTTAATGGTTTATCGGCAGAGAACAGGCGTGTTTAGATTGCATTAGGAGGTAC
TTTCATGTTGTGTTTTAGGTTTAGAGTTGAAATTTGGAGGAGTTGGATAGTGGAGTTGAT
AGGAGGAGCATGTGGTAGAAGAAAGTTTACATGTGGGTTGTGGATGGTATTGGGTTTAGT
TTGTGAGTTGTCTGTTGAATTTTATGAAAGTGTGCATCTAAAGGAATTTCAATTGAGTTA
ATTTGATGCGAAAGTGCAGTGATTATTGTTGAGAGCTACAAGGTTGTATCTTTTGATGAT
AATGTATAATTATGATACTATTAGACATGTATTAGCTTTAGCTGTTGTGTCTGTAATATA
TGCTATGCTGCAGTGTTATTGATGTATGATTGGTGGCTCAAAAATTTATTTTTTCTTCTT
TTTCTAGGTATAGATTGCGGCACTTGTGCTTTATGCTAGTTAAAGGTGAACTGGATCGTT
ACTCTCTTAGTGTCATACAAATTTGCAGGTTGACATGGTTTCTCCGAGGAAGGATGCGGT
GGATGAAGTTGCTCCTGATAAATCGCCACATGGACAAAGCCCTGACCATGGGAGTCATGG
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TCCCTTGAATGTGCGAAAGAAAGATTCAGTGGAATCAAATACCAGTCAGTCACTGAGATC
TGATCAACAAGGAAGTGTTTCTTCCATAAAATCTGAGAAAGCATCGGAGACGACTACTGA
CATCGTTCTGGCATCACCATCTGGTCCTGAAGGGAGTACTCCTACTATAATGCGGGAGAA
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TTGTACTCATAGTGGGCATATTACAGATACTATTTATTTTGGTCAACATGATCATCCAAA
GGCTCCAAACCTCCCTCTAGCTGTTGGATTTGTTGTGTCTATTGTTGAAGAGAGACCAGA
TGACTCTTCTTCAAGTGTTGCCAAAGGTAAGAAAGACACTTGAATCATTAATATCTGGTT
TAGTCCTTAGTTAATTGCTTGTTTTAATTTGTGACCTCATGTTTGTAGACAAATCATCTG
ATACTCATGAGCAGACACCTCATAAGACTGAGCCAATGACCGATTCGCAGCTGTCAATTA
CAGCAAGTGATGATGTGAAACCGCTACCTCAATCAAATAAGATAAGGGATGAGATTAATG
ATGATTCATCGGGATCAAAACGACGGTATGTTAGTCCTCTGGCTATATGAATTTCTTGTG
TGCCAGCCGATCCTTAAGTATACTTATGATTAATGGTAAAAAAAAAAATTGTAAACAGGA
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TCGTTGTCCAGTCTTATAGCGAGGTTGATATTGTCAATGATGGTTACCGCTGGCGTAAAT
ATGGGCAGAAGTTAGTGAAAGGCAATCCAAATCCAAGGTATGCTTTAAGTGTACAGTTTG
TGCATAACTAGTCCATGATTTTATATGGTCTTTCTGCTCATTGGTTATGGAGATCTGTAT
GCTTTTAAAGGTGATATAATGAGATCTCTCATATTGATTATTATAGACAAAAGGACTGAA
TGCTTTTAGCTCGCCTGCATGTCAGGTTACTCTAGCTAACATCATTTTCTGGTTGAGTTT
GTGCTAACTCTGTGTGCTGTCATGTTATGCAGGAATTACTACAGGTGCTCAAGTTCTGGA
TGCCCAGTCAAAAAACATGTAGAGAGGGCATCTCATGATCCAAAATTGGTTATTACAACA
TATGAAGGACAGCATGACCATGACATGCCTCCATCAAGGACTGTTACTCATAACACAGCT
GGCCAAAACAATACCACAACAGGTCAAAATGATGAATCAGGCGCAAAACAAGAAGAAACT
AATGTTGTCTGCCCCGATGTGGCTGTCAATTCTAGTTCAGGGCCTCAGAGCAAGTCAAGT
GAGCAATTGAACGGGGAGTCAAAAACAAAATCAGTAGTAACAGGTGATGTTGGTGGCTCA
GATATAGCTGACAAGTCTATCTCGGGTCCTGAAAGCTACTCAGCTGAGCAGCAGAATGGC
AGGTCGAATACCGCTACTGTCAAAGAAAATGATGTCACCCGTGGCACAAACAACCATGAT
AGTTCATGCCTTGAAAACCGATCAGATGACCAACTGAATGGTAAGTCTGGAACTGAAACA
GAACAAAATGGTACTGCCCACCATGATAAGGTTGCCCATGTTACTCCATGCCCTGAGACT
AGTTTTACTGAGCAAGAACAACCCCCAAATCCTGAACCTGTCCGAAGCTGAACTCAAGCT
GCTGGTTTAACTGCACAGAGACGGCTAATCGCTCGAATGATGATTCTGATTAAGATCAAT
CAAGACGATGCACTGGATACTGAAGATTGGGTAATTTATTCTATGTGAAACTATTCTAAT
GTTATCAGATTCGATACAAAATTAAAGATGTAGATTTTTAATTATCTTAGAAGTATTTAA
TGTAGGAAAGTTGTTAATGCTAGTCCCTTGCCAGTAGCATTTTTTTATCTAGTTTGAAAT
TGATGCACATAGTCGCAATATTGAAGCATATAATCATGATTTGTCACTTTTATGGTTCTT
GATAATTAAAGATGATGGACTAATTTCAAAACTTGCTAAAGCATTTCTTCACTGAAATTA
GATTAATGGGAGGATTATACTTAAACAACTTGAGATTAACTTAACTTCCTGATAAAGTGA
CATTGCGGAATATTACTTAACACTAAATACCCATTGTTGAAACATCTGCAACTTTCAATG
GGAATCAGATGCTCGATTTCCTCTCTCAACAGGAAATCGATGATGATTCGAAAGCCATTG
AAATGTGGTATCAGAGGAAGTTGGTCCCTTGACATTACAAATAAAGTAAACAGGGAAGGG
CACCTTCAATATAAACCCAGAGGAAAAAAAAAAACAAAAACAGAGAAACCTGAGCTGTAC
TTCAGCTTCTGCCCTGGTAACTAAGTAGGAAGAAATTTTAAGAACCTAACAGTTTCTGTC
CAGGTTACCACCAGAAGATCAAAGGAGTTTCAGTTTTCACTTCCAAGCGCATGAAGCGAC
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