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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI015945 | Chr1 | 22770989 | 22772885 | - | Protein SHORT-ROOT |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI015945.m1 | 65 | 438 | PF03514.17 | GRAS | Family | 324.2 | 1.10E-96 |
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>LITCHI015945.m1 ATGGACATAACTCTTTTTTCTCCAAAAGGAAATCTCCCAACTCACTTCTTTCCTTCCAAC CAGCAAAGCAATGGTCAGATATCAATAGATATGCAGCATCAAAGCAATCACCAGCCACAA AACAGCCACACATCGACGAGCCGGTCATCGGATTCCGGCGAGCCATGTGCCACAGCCAAC AAATGGGCATCAAAACTTCTCAAGGAATGTGCTAGAGCCATCTCCGACAAGGACTCTAGC AAAATCCATCACCTTCTTTGGATGCTAAACGAGCTCGCTTCACCTTATGGAGATTGTGAT CAGAAACTGGCCTCTTACTTCTTGCAAGCTCTCTTTTGCAAGGCCACAGAATCAGGGCAC AGATGCTACAAAACCCTAACTTCGGTTGCTGAGAAGAGCCACTCCTTTGATTCAGCCAGG AAGTTGATCCTAAAGTTCCAAGAGGTGAGTCCATGGACTACTTTTGGTCATGTAGCTTCC AACGGTGCAATCTTGGAGGCCTTAGACGGAGAAACCAAACTTCATATAATTGATGTAAGC AACACCCTTTGCACTCAATGGCCTACTTTGTTGGAAGCTTTGGCTACAAGAAGTGATGAG ACTCCACACTTGAAGCTGACTGTTGTTGTGACTGCCAACATAGTCAGATCGGTCATGAAG GAAATAGGTCAAAGAATGGAGAAGTTCGCTAGGTTGATGGGTGTTCCCTTTGAGTTCAAT GTGATAAGTGGGCTAAATCGATTAGGAGAGCTCACCAAGGAAGGACTAGGTGTTCAAGAA GATGAAGCAATTGCTGTGAATTGTATTGGAGCCTTGAGAAGAGTTTCAGAAGAGGAAAGA AGGACTGTGATTCAGATGTTTCAATCACTCGGGCCAAAAGTTGTGACGGTTGTCGAGGAA GAAGCTGATCTTACAAGCTCTAGTTATGACTTTGTCAAGTGCTTTGAAGAGTGCCTTAGA TTCTACACATTGTACTTTGAGATGCTAGAGGAGAGCTTTGTCCCAACAAGCAATGAAAGG TTGATGTTGGAAAGGGAGTGCTCCAGGAGCATAGTTAGGGTTTTGGCTTGCGGTGATGAA GATGGTAGTGGAGAAGAGTGTGATAGAAGGGAAAGAGGAAGCCAATGGTCAGAGAGGCTC AGGGAGGCATTTTCACCAGTTGGGTTCAGTGATGATGTTGTTGATGATGTCAAAGCATTG CTAAGGAGGTATAGAGGTGGGTGGGGACTTGTACTCCCACAAGCAGATCACGACTCCTCA GGAATTTACTTAACATGGAAAGAGGAACCAGTGGTGTGGGCTTCAGCTTGGAAACCCTAA
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>LITCHI015945.m1 MDITLFSPKGNLPTHFFPSNQQSNGQISIDMQHQSNHQPQNSHTSTSRSSDSGEPCATAN KWASKLLKECARAISDKDSSKIHHLLWMLNELASPYGDCDQKLASYFLQALFCKATESGH RCYKTLTSVAEKSHSFDSARKLILKFQEVSPWTTFGHVASNGAILEALDGETKLHIIDVS NTLCTQWPTLLEALATRSDETPHLKLTVVVTANIVRSVMKEIGQRMEKFARLMGVPFEFN VISGLNRLGELTKEGLGVQEDEAIAVNCIGALRRVSEEERRTVIQMFQSLGPKVVTVVEE EADLTSSSYDFVKCFEECLRFYTLYFEMLEESFVPTSNERLMLERECSRSIVRVLACGDE DGSGEECDRRERGSQWSERLREAFSPVGFSDDVVDDVKALLRRYRGGWGLVLPQADHDSS GIYLTWKEEPVVWASAWKP.
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>LITCHI016976.m1 TATCATTAATTCTCTCGCTCTCTCTTCTCTGAAAAATAAAAATAAAAAATAACCCTCCAT AAAATGGTCTCTCGCTCATTTTTGTGAATTCTAATTGCTTGTTCAGCTGCTACTGTCTCT GGTATCATTAATGAGCTTCAAGTTGATTGATTTTGGCTCTTTGTTTGTCTATTGATTCTC TCTCTGCGTTTCCAGTAAGTACTTGTTCTAATATCAAAAGGGTCTGTTTGGTCTACTTAA TATTCAGATTTTATATTTATTTGTTATGTGTTTTTGGTTGTCATGAGTTGATGATGTTTT GATTTGTTTAATATAGGATGGATAGAGGTTTGTTCATGCATGTTTATTGTATATATGGTG ATTGTTTTAGTAGAGTTAAGCAACTTGCGCTCGTACCTTTTTTTTTTTAATATGTGGAAG TTTTTGACAATTGCTTTTGGTTACTGTTAAGATTACTATTATAGTTTTCCAATGAAGATG ATGATTTATAGTGTTTTTTTTATAACTTATTTTGACAATGATTGATGATGTTGGTTTGTT CGAAGTCACCTCATGATATTCATGTGTGCTTGTTTTAAGTGGAGTTAAAGCAACTATGCA AGGAATCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTAATATATATATTATTATGTTTGTGAGACCCTGAA AATTATAGTACTTTTGAGATTACTATTATAATTTTCTGATGAAGATGATGATCTAGAGTG TTTCGTGCTTATATAACTTGTGCAAACAGTGATTTATGATGTTGGTTTGTTTGAAATGAC CTAATGACATTGATATTTTTATTTTTTTGATTTGGTATACGGAATGGCTGGAAAGTTTGC TGTTCAACCTGACCCTTTCGAGTATGAGCTTTATGTTGGTGATCCTGATCACCTGGTAAC TGTGGTCGCAACATCAAATCAGAAGACTCCGTGGATTGACCCCGGAATGGTGAAACTTAG ACACAGAATAGGGAGGGGAGCATTTGGTGAAACATGGTTGGCTACCTATCATCGATCAAC TGAAGCTTATGAGGAGTATTACGAGGTGGCTGTCAAGATGTTGCATCCCGTTAAAGAGGA TTGCATGAAGGTTTTGTTGGATAAGTTGGATGATTTGTTTACCAAGTGTGAAGGGATTGA AGGTGTGTGTTTGCTGCAGGGAATTTCAGTTATCAGTGGAAAAATTTGCATCATTATGAA ATTCTATGAAGGATCGATTGGCGATAAAATGGCCCACCTCAAAGGAGGGAAGCTAACACT TTTTAATGTTTTCAGGTATGTCGTCGATTTGGCTCAGGGAATTTCAGAACTTCACGCAAA AGGGAACCTGGTCCTTAACCTTAAACCGTTCAACTTCCTTCTCAATGAAAATGACCAAGC AGTTCTGGGAGATGTTGGTATTCCTTATCTATTGCTTGGAATTCCTCTACCGAGCCCGAA TTTAATTCGCAGGCTTGGAGCACCAAATTACATGGCTCCAGAACAGTGGCAACCGGAAGT CAGAGGTCCAATATCATTTGAGACTGATTCATGGGGATTTGCATGCAGCATTCTAGAGAT GTTGACTGGTGTTCAGCCTTGGTGTGGGAGGTCAGTTGAGCAAATTTATGATGCAGTTGT CAAAAAGCAAGAGAAACCGCAAATTCCCAGTGGCCTTCCTCCTCCAGTTGAGAGTGTTCT ATGTGGTTGCTTCGAGTATGACTTCAGGAGTCGCCCTTTAATGACAGACATATTGCGTGT GTTTAAGAGCTGGCAGAATGCAATTAATATTGATGGAGGCTGGACAGATCCTGGGAGCAG ATTACTAGTAGAGAGATCTAGTGGTGGTTATACTGGGAGGTTTCTATCAAAAGATGATTT GCAAGTTGGTGACATGGTGCGTTCTAGAAAGCTGCCTAACTCTCACAAACCTGAAATCAT GGATATTCCGGAAGGAACAGTGGTTGGTTTAGAACGTAACACGAACACAGAAAGGGATGG TTTTGTTATGGTGAGGTTACATGGTATCCATGACCCCTTGAGAGTTCATGTTTCTTCACT GGAACGAGTTGCCTTTGGCTTGGCAGCTGGGGATTGGGTACGCTTGAAGGCGGAAGATAA GAGGCACTCTCCAGTTGGTGTTCTTCATTCCATTCATCGCAATGGAAGCGTGGCCGTTGG GTTTATAGGGTTGGAGACCCTATGGAAGGGAAAAACTTCAGAACTGCAGATGGCGGAATC TTACCATGTTGGTCAGTTTGTAAGGTTGAAAGGTAACGTTCTTAGTCCTCGATTTGAATG GCCTCGTAAAAGGGGAGGGGCTTGGGCTACTGGGAGAATTTGCTGGGTCCTACCAAATGG GTGCCTCATTGTCAAGTTTCCTGGGAGGTTGTCTTTTGGAGAGCAAAGCGTTTTTTTGGC AGACCCAGCTGAAGTAGAAGTGGTTAGTTTCAGGACTTGTCCAGATATGGTAAAAAAATA TGAGCATCTTGAGGATTTCCACTGGGCTGTGAGACCACTTCTTATTGCATTAGGTATCTT TACAGCCATGAAGGTGGGATTTTCTGTTGGAAGAAATATTAGGGTTTCGGATGTGAAGGA GGAAAAGAGAAAGAGTGGTCAACATGTGGATAGCCAACGTATCGATAACCATAATGCCGC CAGCAATTCTGCATCTGGCAAACGTTCTTTTTGGTGAAAGCGTTAGTACCAGTGCTGCAC AATTGATATTAGGACATGTTTGTCTGCCGAAAGCTAGTCAAATTTGCTGAATTATGTACA TATTGACTTTGCTAATTTATGCTGCACAATTGATATTAGGACATGTTTGTCTGCCGAAAG CTAGTCAAATTTGCTGAATTATGTACATATTGACTCTGCTAATTTATGCTGCGTATAGGA CATGCGACTAATTATTTCTACGAAAACATGCAACAGCAACTAATACTGCTACTGGGAAAT TGTCGTTTCATTTCGG
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>LITCHI016976.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGTAGAATTCTGTACATATCCCAACTTATAAAATATTTGAAAAGAAATTCCTTTTTTTG GCAATTATAACGTCAATTTGTTTTTACACGAAATTTCTCTCACTTCAAAAATTTCTCAAA ATCTGCCCTAGGAGCAAGGATTCACGACATATTTCTAACAAAATAATTAGAAATTTTTCA ATAAACTTGGAAATTATTTAAATTCACTTCTTTGTTTTTGACATCATAAACGCTCGAGAG AAGTCCTCTCCAATCCAATAACATTCAAGATTTGTGATCAAAATTATTAAAAAAAAAAAG GATTTATGACTAAGGATGACAAAAATACTCGATCCGATCCAAACCTAAAAAAATCCGATC TATTTGGGATAGATTTGGAGCTAAAAAAATTGACTTTGGGGCGGGTTTGAAGCCAAAAGA CTGACCCAATCAGGTTACCGGGTCAGTAACGGGGCAAACTTTTTTGTCCCGACCCGCCCC ATTAACCCGATATATATTACATTTTGGTATTTATGATAATTATATATTACATTTTTAATA TTATTTTTACGTAACATTAAAACTTATTAACTTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTAT AGGTTCATGTTTAAAAGCATTGGGATGAATTTTTAGTATGAATTTTTATAATATTTTCGG TTATTTATTTATTTAGTGTTTTAAATGAAACTTGATTATGTTGTTGCTATTATTTTGGTA TTCATGACTATGTAGTATTAATATTTTGGATTGTGTAATAACATTTCAATATAAATGTAG TTAATCTTTTGATATTTGTTGTGTTTTTTTTTTATATATTTGTTTTAGTTAAAAATTAAA TCAGGTCAACGAGTCGGATTCGGGGCAAGTCCCTCCAATTGGGTTTGGGTTTGGGGTAGA AAGTAATGATTCGTTTGAGGCAAGGGTTGGGTTTGGAGCATCCCTCAAAAATTTCGGATT GGGTTCGGAAAGGACAAAACCCAATCCGATCCGATCCAATCCATTGTCATCTCTATTTAT AACAAATATATGTGGACCCCACATCCGTATATACCGGCCAAAACAGTGTCGTATCATTAA TTCTCTCGCTCTCTCTTCTCTGAAAAATAAAAATAAAAAATAACCCTCCATAAAATGGTC TCTCGCTCATTTTTGTGAATTCTAATTGCTTGTTCAGCTGCTACTGTCTCTGTAACTTCT ACAACTCTCTCTTGTGTTTCTTCTTCGTTTAAATTCTCTCAATCAACTAACACTCTCTGA TCATCAAGTTTTGTTTTTTTGTTGGTGGGTTTTTCAGGGTATCATTAATGAGCTTCAAGT TGATTGATTTTGGCTCTTTGTTTGTCTATTGATTCTCTCTCTGCGTTTCCAGTAAGTACT TGTTCTAATATCAAAAGGGTCTGTTTGGTCTACTTAATATTCAGATTTTATATTTATTTG TTATGTGTTTTTGGTTGTCATGAGTTGATGATGTTTTGATTTGTTTAATATAGGATGGAT AGAGGTTTGTTCATGCATGTTTATTGTATATATGGTGATTGTTTTAGTAGAGTTAAGCAA CTTGCGCTCGTACCTTTTTTTTTTTAATATGTGGAAGTTTTTGACAATTGCTTTTGGTTA CTGTTAAGATTACTATTATAGTTTTCCAATGAAGATGATGATTTATAGTGTTTTTTTTAT AACTTATTTTGACAATGATTGATGATGTTGGTTTGTTCGAAGTCACCTCATGATATTCAT GTGTGCTTGTTTTAAGTGGAGTTAAAGCAACTATGCAAGGAATCTGTCTTTTTTTTTTTT TTTAATATATATATTATTATGTTTGTGAGACCCTGAAAATTATAGTACTTTTGAGATTAC TATTATAATTTTCTGATGAAGATGATGATCTAGAGTGTTTCGTGCTTATATAACTTGTGC AAACAGTGATTTATGATGTTGGTTTGTTTGAAATGACCTAATGACATTGATATTTTTATT TTTTTGATTTGGTATACGGA
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>LITCHI026295.m1 GenomeSequence - TTGAAGCAAATATTGATGTTCAACGCCTATCATTTCCTTGTCCACGTATTTCACTTATCA AACATTTTTGCGACTCTTTTATTGCCCTCTCACCTTGCTCACTCTCCGCAATTGCTCACC AGGTAAATCGTCACCCTGACGCGCGGTTCCTGCTCTCCCTAAGCGCGTTACCACAAACCA CCATGTCACCACAATCTCTAAACGCTTGGTGGGCTCCCACAACAACAACGATTATTATTC CGGCCAATGAAATTCTACTTTCGTCTCATCTTTCTCTCTTTAACGGTGGAATTCACAGAC AAGATTCTGACTCCAAGACACAAATGAATTGGTGATCGCAATACATGACACGTGTCTTAA TATCAAACCGAGTGGGTTAAACTCGCGTACGTGAGCAAGTACGCTTCAGTGTAGTTTCTC ACACCAATAATTTCCGTGTCTGGAAAATAAAAAATAATAATTTTTTTGTTATTTATTTTT ATATATTTAATAAATTATAATTCCCAATAAATATTACGTACTCCTAAAGTCATCATCATC ATCTTCGCTAGTTCTTCTTCGCTTTTCATTTTTTCATTTGTTTTTCTCTCGAGAAAATAC TTTCTTTAACGGAACCCTAGATTTTCTCACCAACCAAACACCTACTTTACCGATTATTTC TCAAACCCAAACCCTAATTCACACCCAATCCCCACTTCTGACCTTCTTGAATTCCCTCCC CAGCTCTCAAAATCGGCAATTTTGAATCTTTCTTATTTTCTTCTCCGAAAATTCCCGGCC ATGGGAAGGATTTTCCGGGAATACACGAAGGGCGATGCGGCGTCGTCATCTTCCTCGTCC TCGTCGCAGACGACGACAACATCGACGTCGATCACGGAGACTGTGAACGGATCTCACCAG TTCAAAATCACGGGCTATGCTCTGTCGAAGGGGCTGGGAATCGGCAAGTACATAGCGTCG GACACGTTCATGGTGGGTGGATACGCGTGGGCGATTTACTTCTACCCTGATGGGAAGAGC GTGGAGGACAATGCTGGGTACGTCTCGCTTTTCATTGCTTTGGCCAGCGAAGGCACCGAC GTCAGGGCTCTCTTTGAGCTCACGCTGTTGGATCAGAGCGGCAAGGAGCGCCACAAGGTC CATAGCCATTTCGGTCGGACGCTTGAGAGTGGGCCCTATACCCTCAAGTACCGCGGTAGC ATGTGGTGAGATATATTCCTCTTTTCTTGTTTGATTCTGCAATTTTATGTTTTGATGTGA AGTGGGCTTTTAGGAAATCCAATCCTCACATTTGCACTTGACAGGTTAAGATTTCTATAG ATTACCCATGTTGCTTGATGTGTTTTTTTCTTTATGATTTTGGGTTAGTTATTGACCATC ACTTTTTTTATCTGTAGCAATTGGCTTATGGTTGTTATCAAGAAAAGTTCATGTAGTAAT TTGGAGGTCTATGTTGCTGTTTATATGCATGTAAGCTTGTCTATACGTGTGATTCTCTTT GAATTCTATTGAATCATGAAATGATTTTTGAATTTGCTTTAAAAGATTTTTTGGTTCATT TTTTTTTATTTAAAGAATTAGTTTAGAAAGTATTGATGTCATATACTGTCTTTGGATATA GTTAGTAAATCTTCCTTTGGGATGCATAATGATGATTGTCTGTACATAATTTATTTTTAT GATGTATGTTATTCTGTATCTCAAGAAGCATTTTTGGGCATAGTGTTTTTTTTTTTTTTC TTCCTTCCAAAGTTGATCCTTATTCTATCATTCTTAGCTTAGTATCCATTTAGATTATGG TAATTAGTTTTGAGCACAATGTAGTGGGTCCTGATCATTGAATGCTGCAGGGGGTACAAG CGGTTTTTCAAGAGAACTCTTTTGGAGCAATCAGACTACCTCAAAGATGATTGTCTCTCA GTTCACTGTAGTGTAGGTGTTGTGAAGTCACATACTGAAGGACCGAAGATTATCTCTATA GCAGTACCACCTTCTAACATTGGTCAGCAATTTGGCCAACTATTAGAAAGTGGCAAGGGA ACTGATGTAAATTTTGAAGTTGAGGGTGAAGTATTTGCTGCTCACAAATTGGTACTGGCT GCTCGTTCACCTGTATTTAGGGCCCAACTTTTTGGTCCTATGAAGGATCAGAACACAGAG TGTATAAAAGTGGAGGACATGAAGGCCCAAGTTTTTAAGGTTGAGTACCCCCTTCTCATT TCTCTTGGCCGTGTACTATTTTGTGTCAACCCATTTTTATGTGTAGTTATTGTTGTGTTT GATTGCTTAGAGTGGTTGGAAACTTGTTTCATGCTTGTCTACGATATGGTTTCCTTAAAT TTTTTTCTACAGTAAAATATCTGTGTTTGTATCCTGCAAACCTCAATTCTTTTGGGTTGT TCCATTTGAAAAGTTAAATAGAAAGCTTTTAACAAGACAAGCCATGACTGATAGGTCAGT GTATGAGAGACAGCGTCTAGCAAATTTTTTATTTGGGTTATTATTGTGATTTGTGTTTTT TCCACAGATCTAAATTTGGTGTTGGTTAGCATTATGATTAATCTGTAACATCTCATTGGT CATGTAGTAATACTGCCATGTCCATTGCAAGAGAGGTTTTAATTGATTTCTGTATAGATT TAATCGTTAATTAGAGGATATTACCCAAATAAGTCCTAGTAATTTGTGCCGATAAATGAT GATGTCTATGAAATTCCTACACAGTCTATGTTGAAAGTCCTTTCCGATTTCTTAGGTGTA CTATTGTTTAATGATGAAAACTCCTATTAGTGATATGATAAGATCACTGAACTTTATGTT ATATTTTTGAAGTCAAAATGCTTTATATGATTTGTGCAAGGTCTTTGATTGCATCGTAAT ATTGTAATAAAATGGTATCTTATGCTTTTCTTTTTGCTATTTTGTTTTTATCCTACTTCA CTTTTCTTGAAAAATATATCAGTTAGACTCTTTCAGATTTAGCAAGTTAATATTTCTAAG ACTGTGAAATGATTTGATTTATTGCTTTTCTGCCCTGGTCTGCACCTTCAGGCTTTACTG CATTTCATTTACTGGGACACCCTACCTGATATGGAAGAACTAACTGGTGTGAACTCAAAG TGGGCTTCTACCTTGATGTCTCAGCATCTGCTTGCAGCGGCAGATAGGTATGGTCTAGAA AGGCTCAGGATGCTATGCAAGGCCGGTCTGTGCGAGGATGTTGCCATTAACACTATGGCA ACCACTTTAGCTTTGGCAGAGCAGCACCATTGTTTCCAGCTGAAGGCTGTTTGTCTTAAA TTCGTTGCTATGCCTGAAAATCTGAGAGGTGATTGTGCTGTAATAATTGTTTTTTATTCA GTTAATCAATGTTGCATCAGATAGTTCTTTTATGAAGAAGACATTTCATGTGAAAAGGAA AAGTTTTGTTCTTTTTGACTCAAGAATACTAATTGTATTTTACATAATATAGTTAGATAT CTTCAATTTTTGGTTTTCATTTCATATACACGCATGGGGAATGAACCTGGCTATCAACTT TTATTTGTATTGAGCTGATTTAATTAAACATTCAATCTCAATCTTAGCATTTTGTGTTGT AAGTTATGGCAACTCGGACATAGGAACTTGTTTAAATAATCAACTAGTAACGATTTTTGT TTTTGTGTCCTGATGATTAATTAGCTGAAGCTTGTTCTCTTTCCTTTTTGCTTTGCAGCT GTGATGCAAACTGATGGCTTTGAGTACTTGGAAGAAAGTTGTCCCTCTCTTTTGACAGAA CTTTTGGAGTATGTAGCTAAGGAAAGCGAGCACTCAATAGTAGTATGCAGGCATGGGAAT GAAGGAATCCTTGATGGCAGTGATGTCAATGGTAGGCGGGGGAAGCAAAGGCTATAGCCA TAACAGCTTTGAAGCAGTTTCTTTTGGTAGCCAAAGAATTAAGAAACAAAAGGAAAAAAA AAAAAGATGATTCTGATGATAGGATTAGAAACAATTTTTCCAATGTTAAGCTTTTCTTAT TTGCAAGTGTTGTAAATGTAGTTGTTCATCTGCTGTCAATTGTTGGGTTGTTATTTGAAG ATTTCGTTTTGTAGTTGGTGTTTACTGATCTGGCTTTATAAGTAAGGTTTCGTGAATCAC TGATTTGTGTGCCTGTTTCGTTGCATTTCAGTATTATTGGTGTTGGATAGCATAAATATT GTCAAACACAGCGTCTATGCTACTGGACTGTCCACATGTTGGCTAATTTTGATTCATTTT TCAATCTAATATCTTATAATCTTCTTGTAATTCCTTGTGATCTACTGTTCTGTAGAACGC AAATTTTTATGGATGTTTGTTTGGTCATTTTTGGTCACCATTGATAATTTGATATTTATT ATTATTAAATGTCTTAAATAGGCTGTATCCGACAAGGGTCTTGATTTTTGGAACATGTCT TTTCCATGATAAAC >LITCHI026295.m2 GenomeSequence - 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