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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI015945Chr12277098922772885-Protein SHORT-ROOT

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI015945.m165438PF03514.17GRASFamily324.21.10E-96
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>LITCHI015945.m1
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CAGCAAAGCAATGGTCAGATATCAATAGATATGCAGCATCAAAGCAATCACCAGCCACAA
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>LITCHI015945.m1
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>LITCHI015945.m1
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TTATGTGCCACTCTTTATTGTTATTATTATTAGTTCCAATATTTTAGCTAACTATCCCAT
TTCCTACTTGGATTGTTTTCTCGGTTTCTTTCCTCCC
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GCAGGCCGGCTGGGGTCGCGTTAACTGCATTGATCATCACAATTCTAGTATTGGATTATA
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TCTGGTGGTGGTGATCAGGATTTTATTATGGATTTTATCTCACAATTGGGGTCTGAGTCA
GGTTTAGAGGCGGAGAAAAC
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ATAATCAATCAACGTAGTTGAAACATAAGACCCAAAATACTGTCTAGGATTCAGCCACAT
CAGCATGTATTCAGTCCAGAAAAATGTATGACCCATAATGAAGTGGAGAGATTTCAAAGC
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GCAGGCCGGCTGGGGTCGCGTTAACTGCATTGATCATCACAATTCTAGTATTGGATTATA
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CGAAACAAATGGTCCCCCCAAAGTCACTGATAATAAATTAATAATTAAATAGTTTATATA
TAATATTTATTGTTTCGAATAATTTTTTATTTAATTTTTTAATAAGTTAATACGGGACAA
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AAAGAGAACTGCACGGTGAAGAGTGAATTGACCAAAGTGCCCTCGGGAAGACAGATGTCC
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GATTTTATTTAACTTGAGTTTTTTTTTTCTGTGATGAGTAAACAAAATCAGTGGATAATT
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AATGGTTGGGAGTGACACGTGGAGACATATAGACTGTTGGATGATAATTCCATTTGAAGG
AGAGGTGATGACAAAATCCATAGCCAACGAAGAGAGACAGTTAACTAGTTCAGTGTGCTT
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CCCAGAGACAGAGAGAGAGAGAATACATGACGATTGACGGCTGTTGCAGAAGAGAGAGTC
TGCTAGCTGCTGGTTGGTGCTTGCTTGCTTGTATGTGTATATGTGTATGTTGAGTATTTA
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CGTGTGTACCTATTTCAGCTTTTGAAATTTTCCTTTCTTCAATTTCTTCTCTCAACAACA
GCAAGCAAGCACTAATCGACAACTGTTAAGTGCTTTTACTGTTTTTAAGTGCTTTCTTTA
TTTTATTGTATTTTATTTTTAATTTTCGGCTTTTGGAGAGGAGGAAGAGGGACAAGTACA
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CAGTACTATATTTTCTCTAAAAGAGAGAAATTATTTATAATAATGATTTCCACATGATGT
TCTGGTGGTGGTGATCAGGATTTTATTATGGATTTTATCTCACAATTGGGGTCTGAGTCA
GGTTTAGAGGCGGAGAAAAC
>LITCHI006535.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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ATAATCAATCAACGTAGTTGAAACATAAGACCCAAAATACTGTCTAGGATTCAGCCACAT
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AATGATTGCTAGTGACCATCACGATTTCAAGTCTTCCCAAAAATTCCACTACATTTTATA
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CCGATGGTTGGTCAAAATAAAGAATAGTACGGACTTACTATCTCCGTCAATAGGCCTCTT
GCAGGCCGGCTGGGGTCGCGTTAACTGCATTGATCATCACAATTCTAGTATTGGATTATA
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CGAAACAAATGGTCCCCCCAAAGTCACTGATAATAAATTAATAATTAAATAGTTTATATA
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CAGTACTATATTTTCTCTAAAAGAGAGAAATTATTTATAATAATGATTTCCACATGATGT
TCTGGTGGTGGTGATCAGGATTTTATTATGGATTTTATCTCACAATTGGGGTCTGAGTCA
GGTTTAGAGGCGGAGAAAAC
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>LITCHI006535.m3 GenomeSequence - 
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GTGGGGGGTGTGGGGCAATAGAGAGATTAAATTGGGATAGCTGCTGCACCCAGAGACAGA
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CCAGTAGGAGTTCAATCAACGTCCCGGATGTGTCCACGTCGTCGAGATCGGCGTTCATGA
TGATGGGAAGCGGAGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGTGTTAGTTGTCAAGATTGTGGAA
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TCGAGTGCGCAACACATGTTAAAAGCACTTGGGTTCCTGCCTCTAGGCGCCGGGAGAGGC
AACAGCAGCTCGCTGCTTTGCAACAACAACAACAACAACTCCAACTTCAACTTCGTGGAG
GTGGAGACACCAACAACAACAGCATCACTAAACGACTCAGAGAAAACAACCCCACCTCTC
CTACTACTCTAACCTTCACTCGTATACAGACCGACGCCTCAGGTACACACACACACATAT
ATATATACACTGTTTTGTTTCTGTGTGTTGGGTTGTGTTGTCTCACGCTTGCCTTCAAAG
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CCTCCTACATTACCAGCAGTTTTTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTCTCTCTTTTTTCTTTA
CAATCCTGTTGGTAATCCTGACGAGTACTGGATTGACAAGGAAGAGAATTGTGTGAGTGT
GTGCGTATCTCTGTCTTCGTGTAGTTATCTATGTAACAAAAGTGTGTGTGCTTGCATTTG
TGTGCCATTCTTTTTATTGTAACATGGGGAAAAAAAAAGAAGAAACTGAAATATATATAT
GTATATATATTTGTTTACCTTATAATATGAAATATGTATGTATACATATAATTCTAATGT
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AAGCTGTATTCAGGTGCGTACGAGTGAGCAGCGTTGATGACGATGAGGACCAGTATGCAT
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CTGAAAACAGCTACATGTCTGGTGGTGAGAGCTCTTCTGTTGGTGGTGCTGTTCAACAAC
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CCGCCGTCACCGCCACAACCGCAGGTAGTGGTGTTGGTGGTGCTGCCTCTACCGCATTTT
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CTCACTATAAATGCTCTTCTTTTTCCTCTCTCGTCCACTTCTCTTCTTATAATCTAGATC
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TATATATAATTTCTTTGTTCTTATAATTCCACTTTGAAATCTCAATCGAAGTTGTTTGTT
TGTTGATATATTGTATGAGATGGGCAGGCATCAGCATATGTTGCGTAGAGTGTTGTTCTT
TGGCAGTCGTTTGTCTGATTTATTTTTAAAAGAAAATCATCACGTTGAATTGTCTTCAGG
GTCGAAATTTCCGTTATAGTTTCTAGTTAGATTTGAATTCTCTCTTTCACAGCTTAGCTT
TTTTCCTCTTTACCCGTATATTTGCCGGTTTCAAATAAATATATATTATGGTTTCGTCTC
TGCTTGTACAAAGTACACCAGCTATATATC
>LITCHI006535.m1 GenomeSequence - 
GCCAAAGCTCTTCACACACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGGGTGGGGGGTGTGGGGC
AATAGAGAGATTAAATTGGGATAGCTGCTGCACCCAGAGACAGAGAGAGAGAGAATACAT
GACGATTGACGGCTGTTGCAGAAGAGAGAGTCTGCTAGCTGCTGGTTGGTGCTTGCTTGC
TTGTATGTGTATATGTGTATGTTGAGTATTTATATGTGTGTGTATTTAATTGAAAAAGGA
AAATTAAATGCCAACACAAACACCAACACCAATATTTTGAAGAGAGGATTCATCAGGAAA
AGAATTGAAGAGTGCCCTCCAAAAGCATTCGACGTGTGTACCTATTTCAGCTTTTGAAAT
TTTCCTTTCTTCAATTTCTTCTCTCAACAACAGCAAGCAAGCACTAATCGACAACTGTTA
AGTGCTTTTACTGTTTTTAAGTGCTTTCTTTATTTTATTGTATTTTATTTTTAATTTTCG
GCTTTTGGAGAGGAGGAAGAGGGACAAGTACATACGAAAAACAAAGAAGAAGGAACAATT
TTCCAATAATAGAAAACAAAGCTCGAGCTGGTCAGTACTATATTTTCTCTAAAAGAGAGA
AATTATTTATAATAATGATTTCCACATGATGTTCTGGTGGTGGTGATCAGGATTTTATTA
TGGATTTTATCTCACAATTGGGGTCTGAGTCAGGTTTAGAGGCGGAGAAAACATGGCTGG
GTTGTTCTCACTAGGTGGTGGTGCTGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGAGGTAGAGGATCAAT
CAACCGCCACAGCAACGAAGACGACGACGACCAAAGAAACCACAACAGTGAAATTCCAAC
GGAGGCGTGGTTTTGGTGTAGAAATGAAGACTATAATGTCAAGGGTTTCGAGCTATGGCA
ACAACAAGAGCTTCTTCATCAGAGAATACTACATCAACAGCAACAACAACAGCAGCAGCA
GCAGCAAGATCTTTACTCTACAGCGGCTATGTTAGAGATGGGACCCAGTAGGAGTTCAAT
CAACGTCCCGGATGTGTCCACGTCGTCGAGATCGGCGTTCATGATGATGGGAAGCGGAGG
TGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGTGTTAGTTGTCAAGATTGTGGAAACCAAGCCAAGAAAGA
TTGTTCTCACATGCGGTGCAGGACTTGTTGTAAAAGCCGAGGGTTCGAGTGCGCAACACA
TGTTAAAAGCACTTGGGTTCCTGCCTCTAGGCGCCGGGAGAGGCAACAGCAGCTCGCTGC
TTTGCAACAACAACAACAACAACTCCAACTTCAACTTCGTGGAGGTGGAGACACCAACAA
CAACAGCATCACTAAACGACTCAGAGAAAACAACCCCACCTCTCCTACTACTCTAACCTT
CACTCGTATACAGACCGACGCCTCAGGTACACACACACACATATATATATACACTGTTTT
GTTTCTGTGTGTTGGGTTGTGTTGTCTCACGCTTGCCTTCAAAGATATATACATACATGT
CACTACTCTTTTCAAGAATTTGGGGCCATATTGAAATGGACCTCCCTCCTACATTACCAG
CAGTTTTTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTCTCTCTTTTTTCTTTACAATCCTGTTGGTAAT
CCTGACGAGTACTGGATTGACAAGGAAGAGAATTGTGTGAGTGTGTGCGTATCTCTGTCT
TCGTGTAGTTATCTATGTAACAAAAGTGTGTGTGCTTGCATTTGTGTGCCATTCTTTTTA
TTGTAACATGGGGAAAAAAAAAGAAGAAACTGAAATATATATATGTATATATATTTGTTT
ACCTTATAATATGAAATATGTATGTATACATATAATTCTAATGTTTTTCGGGGTGTTTTT
AGGGTTAGAATTAGGAGGGAAGTATCCGGCAGAAGCGAGCTCTCAAGCTGTATTCAGGTG
CGTACGAGTGAGCAGCGTTGATGACGATGAGGACCAGTATGCATATCAGACGGCTGTGAG
CATAGGAGGGCATGTATTCAAGGGAATTCTCTATGATCAAGGCCCTGAAAACAGCTACAT
GTCTGGTGGTGAGAGCTCTTCTGTTGGTGGTGCTGTTCAACAACAACATAACCAACCACT
GAATCTCATAACTGCTTCTCCCGCCAATGTGACCACCACCGCCGCCGCCGTCACCGCCAC
AACCGCAGGTAGTGGTGTTGGTGGTGCTGCCTCTACCGCATTTTTAGATCCTTCTTGTTT
GTACCCAGCTCCACTCAACACTTTCTTCGCTGGTACGCAGTTCTTCCCAAGCCCAAGGTC
TTGATGATCACCATCATCACTACTACTCTACACTTCACAAAGCTCTCACTATAAATGCTC
TTCTTTTTCCTCTCTCGTCCACTTCTCTTCTTATAATCTAGATCAAATATTTGATAATGT
TATTGAACTTGAACTACTTGGTGATCATACCACCACCCCATTTAAGTAGGAGTAAGTTAA
AAAAAAAAATGAAAAAGTAGATTATGTTTGTCATCTTCAATTTAGTCCAAAATTTAAAGC
TCAATTTAGATTACACTTTATATATATATAAATATATATATATATATATATAATTTCTTT
GTTCTTATAATTCCACTTTGAAATCTCAATCGAAGTTGTTTGTTTGTTGATATATTGTAT
GAGATGGGCAGGCATCAGCATATGTTGCGTAGAGTGTTGTTCTTTGGCAGTCGTTTGTCT
GATTTATTTTTAAAAGAAAATCATCACGTTGAATTGTCTTCAGGGTCGAAATTTCCGTTA
TAGTTTCTAGTTAGATTTGAATTCTCTCTTTCACAGCTTAGCTTTTTTCCTCTTTACCCG
TATATTTGCCGGTTTCAAATAAATATATATTATGGTTTCGTCTCTGCTTGTACAAAGTAC
ACCAGCTATATATCACTCACCATGCAAGAGCTATCTAGCTCTTGAACTTCAATAAATAAA
TATTATAATAATAATAATAATAATAATAATACTCTCACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTAGATACTCGTGTGATGATGAACGTTATTTTTCAAAAAACTTAAT
TAGAATTGAGATGCATAGATGTGACCTTGATGATAAAATGGGAAACATTGCATATCACTG
CTCTCATTGATTAATGCACACACAGCCTGTAAGAAAAGTAGAGTACGTATATATATGTAT
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GTATTTTGTATCATTACATGACTTTTTTTTGCTGCTTGTGTGATAACTTAGAATTTGTAT
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CAATTAACCCCACAAATCAAAAAAGTAAAAGGGTTTTTCTTTTAAAAGAAAAATATGAAC
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AATGCTAGCTAGTTGCTGATAAATGAATGCTGTGTGACCATCTCTTCTTCTGATTTTCTT
GTTTGCTATTGCTAATTAATAGGTTTGATGGAGTGTGGTATTAGGGAATAAGATCTTGTG
TGGTATTAGAGAATAAGGTCTTTTGCTTTGAGAATGAATATCACTCGCGTCAGAGTTTAG
AGAGAGGTTTGATTTATATATTTTTTTAATTATTATAACATAGCATATTATTATGTTTTA
AGGGTAGTTAAATTATTGCATGTAAATTTGATCTAAGAAATCTTTCAAAAACTAATTTTT
AGACTTGGCTTAGATTGTTTTCTACATCTACCTATATATGTATTATGAAATTATATTCAA
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