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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI015894 | Chr1 | 20928990 | 20932245 | + | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI015894.m1 | 86 | 176 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 96.8 | 9.90E-28 |
LITCHI015894.m2 | 86 | 176 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 97.6 | 5.80E-28 |
LITCHI015894.m3 | 86 | 176 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 96.8 | 9.90E-28 |
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>LITCHI015894.m1 ATGGCAGGCTCTGCTGGACACAGTTTTGTAGATTGTGATGGTGGTGGTTCGGATAATGAA ACGTTGGAGAGCTTTGATGAACATGAAGTTTCAGAAGATGGGTTGTTGCTGCATTATGAT GATTCACACCATGTTGTGAGTAATGACTTAAATTTGATGATACCATCAGTGGAAGGTTTC GTTGTTGAGGAAAGCAGTTCTGAAAGTCTAGAACCGTATACTGGAATGACGTTTCCGTCT TTAGATGACGCGAGGGATTTCTATTATGAGTATGCCAAGCGTACAGGTTTTACCATACGA ACGAATCGAATCAGACATTCGCTGAAGAACATGGCTATAATTGGCCGGGATTTTGTTTGT TCTCGGGAAGGCTTCCGTGCTGCTAAGCATACGCTTAGGAAAGATAGGGTTCTTCCCCCG CGGCCGATTACAAGAGAAGGGTGCAAAGCGATGATAAGACTGGCAGCAAGGGATGAGAGT AAATGGGTTGTTACCAAATTCGTTCAGGATCACAACCACAAACTAATGACTCATTGCAAA TCTCCAGGGGAACTGCCGATTGTAAATATTCTAAGTGAGGAAGAGAAGGATAAGAAAATC CAGGATTTGTATGACGAACTTCAGCGTGAAAGGGAACGATCTGCAGCATTACAACGACAG CTACACATGCTATTGAAAGATCTTGAAGAACATGCGGAGTTCATGTCTATAAGAATTGAA GACATTGTCAACGGGTTGAAGGAAATTGAACTTGATGATCTGTAA >LITCHI015894.m2 ATGGCAGGCTCTGCTGGACACAGTTTTGTAGATTGTGATGGTGGTGGTTCGGATAATGAA ACGTTGGAGAGCTTTGATGAACATGAAGTTTCAGAAGATGGGTTGTTGCTGCATTATGAT GATTCACACCATGTTGTGAGTAATGACTTAAATTTGATGATACCATCAGTGGAAGGTTTC GTTGTTGAGGAAAGCAGTTCTGAAAGTCTAGAACCGTATACTGGAATGACGTTTCCGTCT TTAGATGACGCGAGGGATTTCTATTATGAGTATGCCAAGCGTACAGGTTTTACCATACGA ACGAATCGAATCAGACATTCGCTGAAGAACATGGCTATAATTGGCCGGGATTTTGTTTGT TCTCGGGAAGGCTTCCGTGCTGCTAAGCATACGCTTAGGAAAGATAGGGTTCTTCCCCCG CGGCCGATTACAAGAGAAGGGTGCAAAGCGATGATAAGACTGGCAGCAAGGGATGAGAGT AAATGGGTTGTTACCAAATTCGTTCAGGATCACAACCACAAACTAATGACTCATTGCAAA TCTCCAGGGGAACTGCCGATTGTAAATATTCTAAGTGAGGTATGTCTCTTGCAATTTTTG TAA >LITCHI015894.m3 ATGGCAGGCTCTGCTGGACACAGTTTTGTAGATTGTGATGGTGGTGGTTCGGATAATGAA ACGTTGGAGAGCTTTGATGAACATGAAGTTTCAGAAGATGGGTTGTTGCTGCATTATGAT GATTCACACCATGTTGTGAGTAATGACTTAAATTTGATGATACCATCAGTGGAAGGTTTC GTTGTTGAGGAAAGCAGTTCTGAAAGTCTAGAACCGTATACTGGAATGACGTTTCCGTCT TTAGATGACGCGAGGGATTTCTATTATGAGTATGCCAAGCGTACAGGTTTTACCATACGA ACGAATCGAATCAGACATTCGCTGAAGAACATGGCTATAATTGGCCGGGATTTTGTTTGT TCTCGGGAAGGCTTCCGTGCTGCTAAGCATACGCTTAGGAAAGATAGGGTTCTTCCCCCG CGGCCGATTACAAGAGAAGGGTGCAAAGCGATGATAAGACTGGCAGCAAGGGATGAGAGT AAATGGGTTGTTACCAAATTCGTTCAGGATCACAACCACAAACTAATGACTCATTGCAAA TCTCCAGGGGAACTGCCGATTGTAAATATTCTAAGTGAGGAAGAGAAGGATAAGAAAATC CAGGATTTGTATGACGAACTTCAGCGTGAAAGGGAACGATCTGCAGCATTACAACGACAG CTACACATGCTATTGAAAGATCTTGAAGAACATGCGGAGTTCATGTCTATAAGAATTGAA GACATTGTCAACGGGTTGAAGGAAATTGAACTTGATGATCTGTAA
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>LITCHI015894.m2 CTTTTAGCGTGCACTTATCCCTTGTTTCGAGAGTAGAGTGTATGCTGAATAGAGATACTT GTAGGTTCTGATCGAACATATGTTTGATATGGTGTTAAAAAAATATAAAAAAATTGTCAA TAGGGAAATGGGGATCCCGGTGAGAAGTGAAGGCGCAGATCCCCATACAACAGTGTTGTT GGTTTGTGCCAACACACCGACCGTTAGATCTGGGCCTTCACCATCTTCTTCACATCTATG ATCTGATTCTCTCTTACCACCGTCAGACTCTTCAACGCTCGAATCCTCCTTCGTAACGCC GAACAAAAATGGCAGGCTCTGCTGGACACAGTTTTGTAGATTGTGATGGTGGTGGTTCGG ATAATGAAACGTTGGAGAGCTTTGATGAACATGAAGTTTCAGAAGATGGGTTGTTGCTGC ATTATGATGATTCACACCATGTTGTGAGTAATGACTTAAATTTGATGATACCATCAGTGG AAGGTTTCGTTGTTGAGGAAAGCAGTTCTGAAAGTCTAGAACCGTATACTGGAATGACGT TTCCGTCTTTAGATGACGCGAGGGATTTCTATTATGAGTATGCCAAGCGTACAGGTTTTA CCATACGAACGAATCGAATCAGACATTCGCTGAAGAACATGGCTATAATTGGCCGGGATT TTGTTTGTTCTCGGGAAGGCTTCCGTGCTGCTAAGCATACGCTTAGGAAAGATAGGGTTC TTCCCCCGCGGCCGATTACAAGAGAAGGGTGCAAAGCGATGATAAGACTGGCAGCAAGGG ATGAGAGTAAATGGGTTGTTACCAAATTCGTTCAGGATCACAACCACAAACTAATGACTC ATTGCAAATCTCCAGGGGAACTGCCGATTGTAAATATTCTAAGTGAGGTATGTCTCTTGC AATTTTTGTAAAAATGGTGAATTGATCGGCTTTGCCACAGTAAATTTTTTGATACATATG 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CTTTTAGCGTGCACTTATCCCTTGTTTCGAGAGTAGAGTGTATGCTGAATAGAGATACTT GTAGGTTCTGATCGAACATATGTTTGATATGGTGTTAAAAAAATATAAAAAAATTGTCAA TAGGGAAATGGGGATCCCGGTGAGAAGTGAAGGCGCAGATCCCCATACAACAGTGTTGTT GGTTTGTGCCAACACACCGACCGTTAGATCTGGGCCTTCACCATCTTCTTCACATCTATG ATCTGATTCTCTCTTACCACCGTCAGACTCTTCAACGCTCGAATCCTCCTTCGTAACGCC GAACAAAAATGGCAGGCTCTGCTGGACACAGTTTTGTAGATTGTGATGGTGGTGGTTCGG ATAATGAAACGTTGGAGAGCTTTGATGAACATGAAGTTTCAGAAGATGGGTTGTTGCTGC ATTATGATGATTCACACCATGTTGTGAGTAATGACTTAAATTTGATGATACCATCAGTGG AAGGTTTCGTTGTTGAGGAAAGCAGTTCTGAAAGTCTAGAACCGTATACTGGAATGACGT TTCCGTCTTTAGATGACGCGAGGGATTTCTATTATGAGTATGCCAAGCGTACAGGTTTTA CCATACGAACGAATCGAATCAGACATTCGCTGAAGAACATGGCTATAATTGGCCGGGATT TTGTTTGTTCTCGGGAAGGCTTCCGTGCTGCTAAGCATACGCTTAGGAAAGATAGGGTTC TTCCCCCGCGGCCGATTACAAGAGAAGGGTGCAAAGCGATGATAAGACTGGCAGCAAGGG ATGAGAGTAAATGGGTTGTTACCAAATTCGTTCAGGATCACAACCACAAACTAATGACTC ATTGCAAATCTCCAGGGGAACTGCCGATTGTAAATATTCTAAGTGAGGAAGAGAAGGATA AGAAAATCCAGGATTTGTATGACGAACTTCAGCGTGAAAGGGAACGATCTGCAGCATTAC 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GGTAGAGAATCCTTGCTCTATTTGGTG
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>LITCHI015894.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAGTGAAGTTTACAGTTTTACTAAGATATCATATTGAAATTTAGTTTTATTATTTCAGAT ATGAAATTATATGAATCATTGAAAAATATTTATAATTAATAAAAATATGATATGTTTTAT TTAGAAATATTTTTGAAAATATATATTCATTCGCTGGGTGTTAGCGTTCACTTTTTTATA AATTCATTTTTCTAGGTATCCACTGCAGGTTCGTACAGATTATTACATATCGTGAGAAGA GCCACATGATGATAAACAGTTGAATTTGTGTATATTATTTCTTTATTTACCAGATTTTGT AAATGTATTTCCAAAATAATTTTACAGATTAATAATTATTTTATAGATATTTTAAAAATA TTATATATATTCAGTTTATGGGTCCAGCATGAGAAATTTAAAGATTTTAGATTTGTTCAA TTTACATTTCAATCAAGATGATTATCAAAATTACGATAATTATTTTAAATGATTTTCAGT AAATCCAGATTTTATCAAGAAGGCCATAGTTTTCACGGAATCCTCCCATATTCGAGAGAG AGGTCGGGATGGGTTCTATCAAAGAAGTGTTGTTGAAGACTGAAGACTGAATAGTGACTG AAACCTAAAATCTGAACAACATGTTTTTTTTTTACTTCGAATATATTATAAATTTGTTTA TTTTTTAAAGTTAAAATTATCTAAAAATTAGTAATTTGACATTTATATCATTTTAACTAT TTGTTGTTATGTAATTTTAATTAATTTAATAGAAACATTTAAAAATAAATAATTTAATAA ATTCTAAAACATTTTTATGTACATATTAATAATATTTTATTCATAATTAAAATATGAATA AAAAATATAGTAATATTAACTATATTTATATATTTAAATATATTAATATATTTAATAAAA 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>LITCHI015894.m1 GenomeSequence + CTTTTAGCGTGCACTTATCCCTTGTTTCGAGAGTAGAGTGTATGCTGAATAGAGATACTT GTAGGTTCTGATCGAACATATGTTTGATATGGTGTTAAAAAAATATAAAAAAATTGTCAA TAGGGAAATGGGGATCCCGGTGAGAAGTGAAGGCGCAGATCCCCATACAACAGTGTTGTT GGTTTGTGCCAACACACCGACCGTTAGATCTGGGCCTTCACCATCTTCTTCACATCTATG ATCTGATTCTCTCTTACCACCGTCAGACTCTTCAACGCTCGAATCCTCCTTCGTAACGCC GTAAGCTCCAACTTTTTTTCGTTTGTTTATTGAATTTCTGACTTCAATTGTTGTTTTTCA AGTTATTTTTCAAGCAAATGAAAAAATGGTAGAAAAATAAAATTATGTGAAATTAATCCA ATAATTAGTATACATTTTATTAATTAAGCTTTGAAAATAGTTTCTTTTAGAAGTGCATTT GGGTTCTTGTGGATAGTATGATGGATTGTTTCTTTTTGAATGAACAAAAAATTACACCAA CCCAGTTTGGAGAATTGTTTGAACTATCATGTTGTAAGTAGCTGATTGTTGAGGGTCATT TTTTCTATGGTGATCGTTTGAATTATTTGGCGTCTGTGACTGTAATTTTTTGTGTACTTG TTGTGGGAACTGAAAGTTTTGTTCATTGGATAAATAACCTTGTCTATTTAGGAACAAAAA TGGCAGGCTCTGCTGGACACAGTTTTGTAGATTGTGATGGTGGTGGTTCGGATAATGAAA CGTTGGAGAGCTTTGATGAACATGAAGTTTCAGAAGATGGGTTGTTGCTGCATTATGATG ATTCACACCATGTTGTGAGTAATGACTTAAATTTGATGATACCATCAGTGGAAGGTTTCG 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