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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI015886 | Chr1 | 20761521 | 20778076 | + | eIF-2-alpha kinase GCN2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI015886.m1 | 44 | 154 | PF05773.25 | RWD | Domain | 61.5 | 9.10E-17 |
LITCHI015886.m1 | 440 | 559 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 52.7 | 4.20E-14 |
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>LITCHI015886.m1 ATGGGTCACTCTTCAAAGAAGAAAAAGAAAGGAGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGA GGGAGTGGAAGGAGAAGTAAAGGAAGAGCTCAACTCAAAGACCACGCTTCTCATAGTGCT GCCGATAATGAGCTTCTCGCTGACGAGATCACTGCCTTGTGTTCAATTTTTCAAGAAGAC TGCAAAGTTGACTCAGGATCAACGCCACAAATTATAATTAAGCTCAGGCCTTACTCAAAG GATATGGGTTATGAAGATCTAGATGTTTCTGCTCATCTTGTAGTTAGATGCTTACCAGGA TATCCTTACAAGTGTCCAAAGTTGCAGATTACACCTGAGAAAGGTTTGACAAAAAGTGAT GCTGATAATCTTTTGAGTCTTCTTCAAGATCAGGCAAACTCTAATGCTCGAGAAGGGCGG GTAATGATTTTCAATCTGGTGGAGGCTGCTCAGGAGTTCCTGTCTGAAATCATTCCAGTT AGTCAGTCTACTGAATCTGGTTTAAGCTCAAATAATGGTAGCAGCAGCCGGATGTTTAAG GACATTGCCGTCTCAACTAACAAGAGTAGCTCTTCTAAGGGACCTTTTGTTTATGGCTTT GTAGACCTGTTCAGTGGCTCAGGAGAGTCATGGCACTGGGGTCTTGGAATGGATGAAAAC ATGGGAATAGTTTCTTCTGTGCATTCTCATACATCAGATGGTTCAAAACTCGGGCATGAG GTTTTGGCAAAACAGATTGATAAGAATGTAAAGCCAATGACAGTGCAAGACACAAAGCAA GGTCCATTACTTTACCCTAGTGCCAAATTGGATGCTGTCAAAGAAGAGACTGAAGATGAC AATAAGAGCATATCTAGTACTGACTCAAGCCGGTCTGATAAGGAGGAATTGGTAGGAAAT GCTATGGAAGGTAAGAATGAGGATATTTTTCTTTGGGAGCATGGGGCAGATGATGATGAT AGTGATCTGGAAAGTGAGCCTTTTGATTTATTGTCTTCTGCATCCTTTGGTCAAGATCAG GTGTCTCAAAATGTTGAAAAAGATCTGATAATGGCTCATCTTCTTCGCCTTGCTTGTGCT TCTAAAGGACCATTGGCTGATGCGTTGCCACAGATATCCACTGAGCTTTACAATTTAGGT ATCTTTTCAGAATCGGTGCGGGATTTGGCTTCTAAACCATCTTCACTCTTTAACAAAACC TTTAACAGTGTTTTCCATCAACATATGAGTTCATCAAGAGTTTCTCAATTTTGGAAACCC ACTTCAGATTTGGGAGGCATGTCTACATCTCTCCCAAGCTCACGATATCTTAATGACTTT GAGGAGCTACAGCCTCTTGGCCATGGCGGTTTTGGCCATGTAGTATTATGCAAAAATAAA TTAGATGGAAGGCAGTATGCAGTGAAAAAAATTCGTCTCAGGGACAAAAGCTTGCCAGTT AACGACAGAATATTGAGGGAAGTAGCCACACTTTCCCGTTTGCAGCATCAGCATGTTGTC CGCTACTATCAGGCATGGTATGAGACGGGAGTTACTGGTTCTGATGGTGACAGTGCCTGG GGTTCGGAGACTGCAGCAAGTTCCACGTTCGGCCATATAGCTGCAAGCTCAGTTGATGTC CCTGGGCAGGATATTAAGTTTGAATCAACATATCTGTACATTCAAATGGAATATTGCCCT CGGTAA
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>LITCHI015886.m1 MGHSSKKKKKGGGGGGGGGGGSGRRSKGRAQLKDHASHSAADNELLADEITALCSIFQED CKVDSGSTPQIIIKLRPYSKDMGYEDLDVSAHLVVRCLPGYPYKCPKLQITPEKGLTKSD ADNLLSLLQDQANSNAREGRVMIFNLVEAAQEFLSEIIPVSQSTESGLSSNNGSSSRMFK DIAVSTNKSSSSKGPFVYGFVDLFSGSGESWHWGLGMDENMGIVSSVHSHTSDGSKLGHE VLAKQIDKNVKPMTVQDTKQGPLLYPSAKLDAVKEETEDDNKSISSTDSSRSDKEELVGN AMEGKNEDIFLWEHGADDDDSDLESEPFDLLSSASFGQDQVSQNVEKDLIMAHLLRLACA SKGPLADALPQISTELYNLGIFSESVRDLASKPSSLFNKTFNSVFHQHMSSSRVSQFWKP TSDLGGMSTSLPSSRYLNDFEELQPLGHGGFGHVVLCKNKLDGRQYAVKKIRLRDKSLPV NDRILREVATLSRLQHQHVVRYYQAWYETGVTGSDGDSAWGSETAASSTFGHIAASSVDV PGQDIKFESTYLYIQMEYCPR.
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>LITCHI015886.m1 ACCTGAAGCCGTTGGTTAGTGCATCAATTGTCTCCATGCTCCTAAATGCATAGGTTGACA CTCCCATCTCTTATGTGGGTTGTCCCTCAACCCTCCTGTGGGTCTCTCACTCGCCTCTTT GTAGGTGGATCCATTCCATTTAAGAGCAATTTCCTGGGTCGCTCACACAAATATTTCTAT CTTGGTAGGTTTTAGTTTTCCTTGGACTCGTCCAGTCACTAAAGAAAAAAGAAACTTCTA TTAATTTTAACGAAAGAATTCAGCCATTGGATATATTTCAATTCAGCGCCGCCGGTGATT CTCGTGTCAAACATTTTCCATTCTCATTGTTTTATTAATCGTATAATTCTAGCATTTCAA GTCTCCTGTTCCACGATTTTTCTCTTAATTATCATCAAAGCATCAAGAAACAGTGACATA CAGCTGGGATTTCTGGGGTTTTATGTTTGGTCGAAAGGATAAGTGGGCTTGTGTTGATTG ATTATGGTAAAAAAATGGGTCACTCTTCAAAGAAGAAAAAGAAAGGAGGCGGAGGAGGAG GAGGAGGAGGAGGAGGGAGTGGAAGGAGAAGTAAAGGAAGAGCTCAACTCAAAGACCACG CTTCTCATAGTGCTGCCGATAATGAGCTTCTCGCTGACGAGATCACTGCCTTGTGTTCAA TTTTTCAAGAAGACTGCAAAGTTGACTCAGGATCAACGCCACAAATTATAATTAAGCTCA GGCCTTACTCAAAGGATATGGGTTATGAAGATCTAGATGTTTCTGCTCATCTTGTAGTTA GATGCTTACCAGGATATCCTTACAAGTGTCCAAAGTTGCAGATTACACCTGAGAAAGGTT TGACAAAAAGTGATGCTGATAATCTTTTGAGTCTTCTTCAAGATCAGGCAAACTCTAATG CTCGAGAAGGGCGGGTAATGATTTTCAATCTGGTGGAGGCTGCTCAGGAGTTCCTGTCTG AAATCATTCCAGTTAGTCAGTCTACTGAATCTGGTTTAAGCTCAAATAATGGTAGCAGCA GCCGGATGTTTAAGGACATTGCCGTCTCAACTAACAAGAGTAGCTCTTCTAAGGGACCTT TTGTTTATGGCTTTGTAGACCTGTTCAGTGGCTCAGGAGAGTCATGGCACTGGGGTCTTG GAATGGATGAAAACATGGGAATAGTTTCTTCTGTGCATTCTCATACATCAGATGGTTCAA AACTCGGGCATGAGGTTTTGGCAAAACAGATTGATAAGAATGTAAAGCCAATGACAGTGC AAGACACAAAGCAAGGTCCATTACTTTACCCTAGTGCCAAATTGGATGCTGTCAAAGAAG AGACTGAAGATGACAATAAGAGCATATCTAGTACTGACTCAAGCCGGTCTGATAAGGAGG AATTGGTAGGAAATGCTATGGAAGGTAAGAATGAGGATATTTTTCTTTGGGAGCATGGGG CAGATGATGATGATAGTGATCTGGAAAGTGAGCCTTTTGATTTATTGTCTTCTGCATCCT TTGGTCAAGATCAGGTGTCTCAAAATGTTGAAAAAGATCTGATAATGGCTCATCTTCTTC GCCTTGCTTGTGCTTCTAAAGGACCATTGGCTGATGCGTTGCCACAGATATCCACTGAGC TTTACAATTTAGGTATCTTTTCAGAATCGGTGCGGGATTTGGCTTCTAAACCATCTTCAC TCTTTAACAAAACCTTTAACAGTGTTTTCCATCAACATATGAGTTCATCAAGAGTTTCTC AATTTTGGAAACCCACTTCAGATTTGGGAGGCATGTCTACATCTCTCCCAAGCTCACGAT ATCTTAATGACTTTGAGGAGCTACAGCCTCTTGGCCATGGCGGTTTTGGCCATGTAGTAT TATGCAAAAATAAATTAGATGGAAGGCAGTATGCAGTGAAAAAAATTCGTCTCAGGGACA AAAGCTTGCCAGTTAACGACAGAATATTGAGGGAAGTAGCCACACTTTCCCGTTTGCAGC ATCAGCATGTTGTCCGCTACTATCAGGCATGGTATGAGACGGGAGTTACTGGTTCTGATG GTGACAGTGCCTGGGGTTCGGAGACTGCAGCAAGTTCCACGTTCGGCCATATAGCTGCAA GCTCAGTTGATGTCCCTGGGCAGGATATTAAGTTTGAATCAACATATCTGTACATTCAAA TGGAATATTGCCCTCGGTAAAACATATAATTCACTTCTATTTTTCTTCTCTATGTTCGTG TCCTTAATCTTTTTCTCTCACTAATTTTTCATTAGCTTATCTCCCTTGTCTAAACTAAAC TCAATTTGAGCAAATTTGTGTAAATTCATTGTAGAAATGGGTGAAATTAAAGATTCTTGT CTCTGTACATGTGTCTTTGGTGTCTACCTTTTCTATATAATGATTATCGTTACTGAATAG TTAGCCATGATAATTTAAGATTGGTGTTCATTGCAATCCTATGTCTTTCTCGAGTAATTC TTGGTTCTGGAAAATCGTCTTTGTCTATAAGATGAAGTTTAAGTAGAATTGTCTTATATA AATCATTATGGTGAAGCACATATTTCATGCAAGATGATTATTTTTTAACTTTTTTTTTTT TTAAAATACTTTCCATTAATGATTATTTTGCTTCATTTTACGTTGTGCAGTGCTGTTTGA GATCTTGAATACACAGACCATGAAACATATGCTCC
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>LITCHI015886.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCAACAATCAAAATGAACTCCGTCGAACGTGCAAGTGGGCTGAAGACGTAACACTATTGG ACTGGTTCATTTTGAAATATCATGTACATGCATAACTATTTAAGACTTTATGCATGTTTT GTAAATATTATTTTGGGAAATACACACACTTGTGCTTTTGTATTATGTTTTAAAACCACG TGTACATAATGTTTTTATATAAGTTCAATGATTTTCGAATTGTTTTTTAAATTAAAATCA TGTTGTGGTTGATTGTGAAAAGGAAATGAGGGCTTGAGGCCTAGAAATTGAGATTGTGTG GTTTTTGAAGTGCATAGGTTTTATATCATGTTTTTACAAGGTGGAATTTTTAGAACACTA GTTGTGAAATTTTTATAAACCTATTTTGTAAATGCTCTTTTAAAAAGATTAAAAAAAAAG TTTTTACCCTCTTTCATTTGAAAAAAAAATCTAAGAGTTTTGAAAAAGTTTTCAATAGTA AGAAAAAAGTTTAGATTCACAGGAATCTTTCAGCCGGAGCGGATTTCGATTGGAAGACCA TCGTGGGGTTGTCGGGCGGGCTGTCTAGCTATCTAAGGAAGAAGGGCCCGTAAAAAACCC ATTCATCTTCATCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAGAATTCACTTCCATTAATCAT CCACATCAACAGGAAACAACCCATTCATCAACCGAAAACAACCCATTTCCATCAATTATC TCATCTTTTCTCATATATTTCCTCCTTTTCCTTTCCTTTTTTAGTTTTATAGTTTTTTTG TTTTATGGGTTTTCAACATTCTGGAATTCTACGTTTCTCACCAAAACGGGTTTCTAGCAT ACTGGAAACCTAGAAATTTTGATTGAAAACTAGTTTTTGAGTTTCCAACACCAATATACA TAATCTCTTAAACCTAAAATTATCATCCATTGATCCAAACCATCAGTCTTAAAACACAAA ACACATAAATCCCAAATCAAACCAACATCACCCAAAAAAGGATAAGAGGAGAGCAAAAGG GGAGAAAGAGAGAGTAAAAGAGAGAGGTCTTTCGTCACCATCTATCAACACTACCGTCGT AGAGATTTTTCGGTACCTTCATCATCGACCAACGACAGAGAAAGGAGAGGAAAAAAAAAA GGGAGATAGCAAGAGTTTACATTTGATTTTAAGTTTGTTTTAGTTTAATTAATAGTATTT TATTTTATTTTTTATATTTTTATATTTTGTGTTATTATTAATTAATTAATAGTTTTTATT TTTTAAATATTATTATTAATTAATAATCTAAATGACATTTTGATAATTTCACTATTTTGA ATGAAAAATATTAACATTTTAAATGAAAACTTACCAGCAATAGGAGATGATTCACCTAAT AAAAAAAATTGGAAGCTAATCTTGAATAGTTTAGTTTTTAGAGATTTTTCATAATATTCT TAATATTTTCTCTGTTATAAACTAATTTTAATAGATTTAAAAGCTTCTAGTAATTTTGTC AATGACACCTGAAGCCGTTGGTTAGTGCATCAATTGTCTCCATGCTCCTAAATGCATAGG TTGACACTCCCATCTCTTATGTGGGTTGTCCCTCAACCCTCCTGTGGGTCTCTCACTCGC CTCTTTGTAGGTGGATCCATTCCATTTAAGAGCAATTTCCTGGGTCGCTCACACAAATAT TTCTATCTTGGTAGGTTTTAGTTTTCCTTGGACTCGTCCAGTCACTAAAGAAAAAAGAAA CTTCTATTAATTTTAACGAAAGAATTCAGCCATTGGATATATTTCAATTCAGCGCCGCCG GTGATTCTCGTGTCAAACATTTTCCATTCTCATTGTTTTATTAATCGTATAATTCTAGCA TTTCAAGTCTCCTGTTCCACGATTTTTCTCTTAATTATCATCAAAGCATCAAGAAACAGT GACATACAGCTGGGATTTCTGGGGTTTTATGTTTGGTCGAAAGGATAAGTGGGCTTGTGT TGATTGATTATGGTAAAAAA
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>LITCHI015886.m1 GenomeSequence + ACCTGAAGCCGTTGGTTAGTGCATCAATTGTCTCCATGCTCCTAAATGCATAGGTTGACA CTCCCATCTCTTATGTGGGTTGTCCCTCAACCCTCCTGTGGGTCTCTCACTCGCCTCTTT GTAGGTGGATCCATTCCATTTAAGAGCAATTTCCTGGGTCGCTCACACAAATATTTCTAT CTTGGTAGGTTTTAGTTTTCCTTGGACTCGTCCAGTCACTAAAGAAAAAAGAAACTTCTA TTAATTTTAACGAAAGAATTCAGCCATTGGATATATTTCAATTCAGCGCCGCCGGTGATT CTCGTGTCAAACATTTTCCATTCTCATTGTTTTATTAATCGTATAATTCTAGCATTTCAA GTCTCCTGTTCCACGATTTTTCTCTTAATTATCATCAAAGCATCAAGAAACAGTGACATA CAGCTGGGATTTCTGGGGTTTTATGTTTGGTCGAAAGGATAAGTGGGCTTGTGTTGATTG ATTATGGTAAAAAAATGGGTCACTCTTCAAAGAAGAAAAAGAAAGGAGGCGGAGGAGGAG GAGGAGGAGGAGGAGGGAGTGGAAGGAGAAGTAAAGGAAGAGCTCAACTCAAAGACCACG CTTCTCATAGTGCTGCCGATAATGAGCTTCTCGCTGACGAGATCACTGCCTTGTATGTCA TTCTCTTCTTCCTTTGAAATGGGTATAGAATATAGTGTCTACGCTTTTTTGGCTTTGTAT TGGAATTGATTTAATGTTCATTTATTTATTTATTTGATTATTGGATGAATTATTTAGCGT GATTGGATAGCTAGTGGTGGCTAGCTTGGTTGAAATTGGGTTAGAATATGAGCTGAAAGT TTTAACAGGATATATGTGTTTTGCTTCTTTTCATTTTGATTTATATGTATGTATATGTAC 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