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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI015662 | Chr1 | 16461634 | 16480199 | + | Integrin-linked protein kinase 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI015662.m1 | 73 | 125 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 32.8 | 8.20E-08 |
LITCHI015662.m1 | 78 | 164 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 38.9 | 1.10E-09 |
LITCHI015662.m1 | 91 | 141 | PF13857.9 | Ank_5 | Repeat | 36.1 | 6.10E-09 |
LITCHI015662.m1 | 104 | 135 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 35 | 1.30E-08 |
LITCHI015662.m1 | 104 | 133 | PF13606.9 | Ank_3 | Repeat | 22.1 | 0.00015 |
LITCHI015662.m1 | 197 | 453 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 153.9 | 5.10E-45 |
LITCHI015662.m1 | 197 | 451 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 128.5 | 3.20E-37 |
LITCHI015662.m1 | 726 | 993 | PF07766.16 | LETM1_RBD | Domain | 272.2 | 3.50E-81 |
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>LITCHI015662.m1 ATGGTGAACCTAGCGGCGCAACTGAAGCGGGGGATATCGCGGCAGTTCTCGACAGGGTCG CTGCGGCGGAGCCTGACGCGCCAGCTGTCGAGGCAAACGTCGTTCGATCCACGGCGGAAC AATATGCGGTTCAGCTTCGGGCGACAGTCGTCGCTCGATCCGATCCGGAGGAGTCCGACG CAGGACGAGCTGACGGTGCCGGAGAACCTCGACTGCACGATGCAGCTACTGTTCATGGCT TGCAGAGGAGACGTCAAGGGAGTGGAGGACCTGCTCGACGAAGGCATTGATGTCAACAGT ATTGATCTCGATGGACGCACTGCTTTGCATATCGCCGCCTGTGAGGGACACGTAGAGGTC GTTAAGTTGTTGCTGAGGAGAAAAGCCAATATCGATGCTCGTGATCGATGGGGCAGTACG GCAGCAGCTGATGCAAAATACTATGGAAATGTGGAAGCTTATAATGTTTTGAAGGCACGT GGAGCCAAAATTCCGAAAACCAGAAAGACACCGATGGCTGTGGCAAATCCTCGAGAAGTG CCTGAGTATGAACTTAATCCGCTAGAGCTTCAAGGATCATATCAAGTAGCTAAATGGAAT GGTACGAAGGTTTCTGTAAAGATATTAGATAAGGACAGTTGCTCTGATCCTGAAAGCATA AATGCCTTTAAACATGAGTTAACTTTACTGGAAAAAGTCAGGCATCCTAATGTGGTTCAA TTTGTTGGAGCTGTCACCCAAAATATACCTATGATGATTGTTGCAGAGTATCACTCAAAA GGTGACTTAGGAGGCTATCTTCAAAAGAAAGGGCGTCTATCTCCATCCAAAGCCCTCAGA TTTGCTCTTGATATTGCTAGGCATGTGCAATTTTTGGAAGTTATCTCTAAAATTTTTGTG GGAATGAATTATCTTCATGAATGTAAACCAGAACCAATCATCCACGGTGATTTAAGGCCA AAAAATATTTTGCTGGATAATGGAGGTCAATTGAAGGTAGCTGGATTTGGTTTGTTAAGA TTGTCAAAGATTACACCTGACAAAGTAAAATTAGAACAACCAACTGCTCAGATGGATGCA AATCTATACATGGCACCTGAGGTATATAATGATGAAGTGTTTGATAGAAGTGTTGATTCC TACTGTTTTGGTATCATTTTATATGAGATGATCGAGGGATTGCAGCCTTTTCATCCCAGG AGTCCTGAAGAGACTCTGAAATTAATGTGTTTGGAAGGAAAGAGACCAGCATTTAAAATA AAGGCACGAAGTTATCCTCCAGATCTAAAAGAGTTGATTGAGGAATGTTGGGACCCAGAA CCTGTAGTTAGACCAACTTTTTCTGAGATCATAGTACGGTTGGATAAAATAGTTGCTAAC TGCTCAAAACAAGGATGGTGGAAAGACACTTTCAAGCTTCCATGGGAGGACATAATGGCT TCTAGTGCTGTTTTGAGAAGGAAGAGATTGATTTCTGATTGGTTGAGTGTGTTCGGTCGT ACGGTTAAGAGCTTGCAGTGTCATGCATATGGCGTTGGATGTTGTGATGCACGTAATTAC AGTGTATTAGGGAATGGGAATCATGAGTTGCTGGACTTGAATTGTGGAAAGGGAATAAAT GGTAGTTGGTTAGCAAAAGCAGGATTTTTGGGGTTGTTCCAGTTTGGACGGTTTGAGCGT AGATATTATGGGATCAGGGGTTTTGGCGTTGGTGATGGACAGTCTGAACATGTCTCTCCG ATGGGGTTTAGGTTGATGTCACATTCAGTTCGGAATGCTTCCACAGCTACAGCTAAACAA CCAGAAATGGGCAGTGATGATGAGGGAATGGAAGATCTGGTTAGTAAGAAGAGGAAGGAA GCATCTGCTGAAGAATGTGATCAAGCTGTTGAAGGTTTGAGTAGTGCAAAGGCGAAAGCA AAGGCCATGAAGTTGCAAGAATCTCAGAAGGTTGCTAAGACCGTTTTAAGAAAAACATGG GCCACTCTTGTAGGGATTGGCCCTGCTTTGAGAGCTGTTGCTTCTATGAGCAGGGAGGAT TGGGCCAAAAAACTTGTTCACTGGAAGCATGAATTTGTATCAACATTGCAACATTATTGG TTGGGTTTGAAGTTACTATTGGTTGATGTAAGGATCAGTTCAAGATTGCTCTTAAAACTT GCTGGTGGGAAGAGTCTTTCTAGAAGGGAGAGGCAACAGCTAACTCGAACCACAGCGGAT ATATTCAGGCTGGTTCCTTTTGCTGTGTTTATCATAGTTCCCTTTATGGAATTTCTGTTG CCAGTATTTCTCAAATTGTTTCCCAACATGTTGCCATCAACCTTCCAAGACAAGATGAAA GAGCAGATCAATCATTTATCCAAAGAGGCTAACAAAGTGGCAGATGTTCCTGCTTTAATG TCGATGCCTGTGACAAGGTTTACTCCTGTGAATTTCTTGTTCATAATGGAAGCACTAAAA AGGAGGCTGAATGCTAGGATAGAATATGCCAAGTTTCTACAGGATACTGTCAAAGAAATG GCAAAGGAAGTTCAAAACTCTCGGAGTGGGGAACTTAAGAAAACTGCTAAAGATCTTGAT GAATTTTTGAACAAAGTTAGAAGGGGTGCTGGTGTCTCTAATGAGGAAATTTTGGGTTTT GCTAAGTTGTTTAATGATGAACTTACCCTGGACAATATCAGCAGGCCTCGTCTAGTAAAT ATGTGCAAATATATGGGAATCAGCCCTTTTGGAACAGATGCATATTTGCGATTCATGCTT CGGAAAAGACTCCAATGGATTAAGAATGATGATATGTTGATTCAAGCCGAGGGTGTTGAG ACTCTTTCAGAAGCTGAACTCCGTGAAGATTGTAGAGAGAGGGGCATGCTTGGATTGCTC TCTGTGGAAGAAATGCGGCAACAGCTCCGTGATTGGTTGGATTTGTCTCTTAACCACTCC GTGCCATCTTCCCTTCTTATTCTTTCAAGAGCCTTCACTGTATCTGGAAAATTGAGACCA GAGGAAGCTGTTCAAGCTACACTGTCTTCTCTGCCTGATGAGGTTGTGGATACTGTTGGT GTTACATCTTTGCCATCAGAAGATTCTGTTTCAGAAAGAAGAAGGAAACTGGAATACCTT GAGATGCAGGAAGAATTGATTAAGGAGGAGGAACAAAAAGAGGAAAAAGAGTTAGCTAAG ATACATGAATTGAAAGGTAGTGATGAGGATGTTGCATTAAAAGAGATGACTGTACCAACA GCAAGAGAAGCACAAGAACAAGCTAGAGAAAGAACACTGGAAATGCAGGAGCAGCTGTGT AAACTCAGTCAAGCATTGGCTGTTTTAGCTTCAGCTTCTTCAGTTCGTAATGAGCGTGAA GAATTGCTGAGGCTTGTCAATAAGGAGATAGAACTTTACAATAGCATGGTAGAGGGTACT GATGGTGAGAAAGATGCCATGAAGGCATACAGAGCTGCTCGAGACGAAAGTGACCATCAT GCTGAAGTGGCTGAAGGGGAGGAGGTTTCTTCAGCACTCATAGATAGGGTTGATGCTATG CTTCACAATCTTGAGAAAGAAATTGATGACGTGGATGCTATAATTGGTGATCGTTGGCGG CTACTTGACAGGGATCATGATGGGAAAGTTACTTCAGAAGAGGTGGCAAGTGCTGCTTTG TACTTGAAAGATACCTTGGGGAAGCAGGGCGTCCAAGAACTCATCAGCAATCTTTCCAAA GATAAAGATGGGAAGATTCTTGTTGAAGACATTGTCAGATTGGGTAGCCGGACAGAAAAT ACCAACTCAGCTGAAGAAAGGAGAATGTAA
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>LITCHI015662.m1 MVNLAAQLKRGISRQFSTGSLRRSLTRQLSRQTSFDPRRNNMRFSFGRQSSLDPIRRSPT QDELTVPENLDCTMQLLFMACRGDVKGVEDLLDEGIDVNSIDLDGRTALHIAACEGHVEV VKLLLRRKANIDARDRWGSTAAADAKYYGNVEAYNVLKARGAKIPKTRKTPMAVANPREV PEYELNPLELQGSYQVAKWNGTKVSVKILDKDSCSDPESINAFKHELTLLEKVRHPNVVQ FVGAVTQNIPMMIVAEYHSKGDLGGYLQKKGRLSPSKALRFALDIARHVQFLEVISKIFV GMNYLHECKPEPIIHGDLRPKNILLDNGGQLKVAGFGLLRLSKITPDKVKLEQPTAQMDA NLYMAPEVYNDEVFDRSVDSYCFGIILYEMIEGLQPFHPRSPEETLKLMCLEGKRPAFKI KARSYPPDLKELIEECWDPEPVVRPTFSEIIVRLDKIVANCSKQGWWKDTFKLPWEDIMA SSAVLRRKRLISDWLSVFGRTVKSLQCHAYGVGCCDARNYSVLGNGNHELLDLNCGKGIN GSWLAKAGFLGLFQFGRFERRYYGIRGFGVGDGQSEHVSPMGFRLMSHSVRNASTATAKQ PEMGSDDEGMEDLVSKKRKEASAEECDQAVEGLSSAKAKAKAMKLQESQKVAKTVLRKTW ATLVGIGPALRAVASMSREDWAKKLVHWKHEFVSTLQHYWLGLKLLLVDVRISSRLLLKL AGGKSLSRRERQQLTRTTADIFRLVPFAVFIIVPFMEFLLPVFLKLFPNMLPSTFQDKMK EQINHLSKEANKVADVPALMSMPVTRFTPVNFLFIMEALKRRLNARIEYAKFLQDTVKEM AKEVQNSRSGELKKTAKDLDEFLNKVRRGAGVSNEEILGFAKLFNDELTLDNISRPRLVN MCKYMGISPFGTDAYLRFMLRKRLQWIKNDDMLIQAEGVETLSEAELREDCRERGMLGLL SVEEMRQQLRDWLDLSLNHSVPSSLLILSRAFTVSGKLRPEEAVQATLSSLPDEVVDTVG VTSLPSEDSVSERRRKLEYLEMQEELIKEEEQKEEKELAKIHELKGSDEDVALKEMTVPT AREAQEQARERTLEMQEQLCKLSQALAVLASASSVRNEREELLRLVNKEIELYNSMVEGT DGEKDAMKAYRAARDESDHHAEVAEGEEVSSALIDRVDAMLHNLEKEIDDVDAIIGDRWR LLDRDHDGKVTSEEVASAALYLKDTLGKQGVQELISNLSKDKDGKILVEDIVRLGSRTEN TNSAEERRM.
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>LITCHI015662.m1 TGCCAATCAAATCAAAACGAAAACCAAACAAAAAAACGCGAGTACTTACCGCGTTTCAAC CTCCTGGAAGCAACTAACAAACGAAAAAAAATAACTGTTATATACGTAATACTAGTGCGC TTAAAAACCAACAAACAATCGTCCTCCCACATCCTTCGGTTCTCAAAACTCTCCACAATA ATTTGAACTCCGTCCATTCACTCCAAACCGACCTCTCCTCTCTCTCTCTGTGGTCTCTTT GCATGCTCTCCATTTCCAAAACAACGACACTTTGTTTTTTATTTATTTATTTTATTTTTT CGGTTTGATAAAAACAAAACACTCTTGAAAAAAAAAAAGTTGAAAAAAAATGGTGAACCT AGCGGCGCAACTGAAGCGGGGGATATCGCGGCAGTTCTCGACAGGGTCGCTGCGGCGGAG CCTGACGCGCCAGCTGTCGAGGCAAACGTCGTTCGATCCACGGCGGAACAATATGCGGTT CAGCTTCGGGCGACAGTCGTCGCTCGATCCGATCCGGAGGAGTCCGACGCAGGACGAGCT GACGGTGCCGGAGAACCTCGACTGCACGATGCAGCTACTGTTCATGGCTTGCAGAGGAGA CGTCAAGGGAGTGGAGGACCTGCTCGACGAAGGCATTGATGTCAACAGTATTGATCTCGA TGGACGCACTGCTTTGCATATCGCCGCCTGTGAGGGACACGTAGAGGTCGTTAAGTTGTT GCTGAGGAGAAAAGCCAATATCGATGCTCGTGATCGATGGGGCAGTACGGCAGCAGCTGA TGCAAAATACTATGGAAATGTGGAAGCTTATAATGTTTTGAAGGCACGTGGAGCCAAAAT TCCGAAAACCAGAAAGACACCGATGGCTGTGGCAAATCCTCGAGAAGTGCCTGAGTATGA ACTTAATCCGCTAGAGCTTCAAGGATCATATCAAGTAGCTAAATGGAATGGTACGAAGGT 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