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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI015402 | Chr1 | 12600421 | 12610091 | + | Zinc-finger homeodomain protein 11 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI015402.m1 | 8 | 30 | PF04770.15 | ZF-HD_dimer | Family | 29.8 | 6.30E-07 |
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>LITCHI015402.m1 ATGTCATATCCTACCGCCACCTCTGCAAACCCCATATCCTTAAAATGCGTAACCTGTGGC TGCCATTATAACTTCCACCAACGAGACCGGGAAGACAACAACATCGGCACCATCATAACC CAGAAAGATTTCTCAGCTTTAGCTCGGAGTGCGTATGCTAATGATGGCTTTGAAGAAGGA GAGCTTGTTTTGAAGGACACTATTGTTGTTGGCATGCAACATTCTTCTAATAAGACCAAG AGAAAGAGAGATAACAACATGAAGAAAGAGACTGAAACCATCACAACAGAGACAAAGTGA
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>LITCHI015402.m1 ATGTCATATCCTACCGCCACCTCTGCAAACCCCATATCCTTAAAATGCGTAACCTGTGGC TGCCATTATAACTTCCACCAACGAGACCGGGAAGACAACAACATCGGCACCATCATAACC CAGAAAGATTTCTCAGCTTTAGCTCGGAGTGCGTATGCTAATGATGGCTTTGAAGAAGGA GAGCTTGTTTTGAAGGACACTATTGTTGTTGGCATGCAACATTCTTCTAATAAGACCAAG AGAAAGAGAGATAACAACATGAAGAAAGAGACTGAAACCATCACAACAGAGACAAAGTGA
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>LITCHI016922.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTTGGGTTCTGAAGTGTGTGAACTTAAATGAATGCAATGTCAAAAAGTGTTCTAAGTTAT CCGAGTTGCCAGAAGCGTAACTGACAATTATGTGGCAGGTGAGAGTGGCCAATTGTTCAA TGGATTCATCAAATAAATGTTGTTTTTGGGTGTCAGAAATATGGAAAAATGATAAAGTAG TAAATTGATGCACAAAATGTTTGTAATCAACATAATTTTCAATCGCCACCCCCATGTGGA TGGTTATAAAGCAAATTTATCAGTCAAAAATAGCAGCTGATAAGGGCAGAGGACCGTATA GGGATCGTTAACCTCTTAAATTAAATTGACAATATTGTAAATATCTACACAATTGTACAA AGTTATATCTTGCATTGAAAACTTGTTTGATGTTCAAAACGGCGGCTATTTGGAGTGCAA AATTTACAGAGCACACAACTTTTTTATTTGCGTTTTGAAATTATATATTAAAAATGTTTG CATTCATTTACAAATTAACAAACAAATAAAATTTATGTAGCTTTAACTTTAACGTGGACT GAGTTAAATTTTATATTAAAAGACAATTTCAGTAAATTGTTTATAGTTTAATTAATTGTG TAAAATCATGATGTTTACTTCAAAACTAGTTTAAAGAACAAGAAAGTGAAATGTCTTATT AATAATTTCATCTGGTCATGAGTTTCAAAAAAATATATATCATCAAGTCATGAGTTAAAA TGGTCCAAGTACGTGCCACATATTTATGAATCAACATGCATGAAATAGACATAATAAAAA ACTTTAAAGATATGAATCCAGAACATGGAAGGTGCAATGTTGGCACGTGGGTGAACAATG AACATGAGAGGAGGCATTGATCAGAACTTGGAAGACCATACAAAACCCTAAAACACACAC TTTGAACATATCTCCCCATGCCACCCACCATGTGCTTCTTGCTTTTCCAATCTTCAACAA AAACTCACTACAATCCATGCATTTGAATTTTCTATTTCCCTATAACCCATTTGCATGAAA ATGACAAGCAGCCCACATTGTATTTTGTATAGAAAGATCTAGCTAAGCCAGTCTCCCACT GTTATGTTGTCACAACTTCCCTTTTCTAAAACCTATTAATTAATTCTAGTCACCCTCACT TTCTGATTCAAGAGAGTTTAGCTCTGGGTGCAACTTTGATCCCACAACAGTAGATGAGAT TTGATCAAATGATTTTAATTGTTTGGGTAATTATTATGGTCTAAGATTCTTCAATCTTTG TGTCCAAAAAAGGATTGACCCAATCATTTTTGCACCATTTCAGGACCATATTGAATATAT AGATAGCATAATATATATAATCATATATACACACTGTTAATCAAACTTCAAAGATTCTCT TAAAAAAATAAGTTAGTAACTTGTATTTTGTATAATATATATGATAATTGATCAAGTTTT TTATTCTGCTATTTTATAAAGAAACGGGTAACAGTTTTGATCAAGTCATTATCCGAACAA AAATCAAGCTCACATGAAGAATCCACGCGATCATGACCCTTAGATTTTCTTGAAGAAAGA AAGAGTGATAAAGCAACAGTTGGGTTTTCTTATGTTACTATCTTTATTTTTAAGACAGAA GTTATTATTGTTGCCATGTGAATTGAATTGGGTCAGTTTGAAATTTCACTTAGATCACAT ATTTATTCAACAATCATAACTTCCAAATAAGCCAACTGTAAACTAATATCAGAAAATAAT TTTTTTTTATCAGGACCCAGAAACCTTATATGGGACCCATTTTTTGCTCTTCGTTGGGAT CCAGAGAAGGCCATTGAAAAAGAGACCTCCAGTTCCCCATCCAGCTATCAACAAACTCAA CTACAAAAGCCCATCTCTCCCTTTCTTCACTAGCACCACCATCCACCACAAACAACTCTC TCATTTTTTTTTCCCTCAGGCAGTTCCACAAACACTTTTCCAAGAAACGTTTCGGTGTTT TTTTTTTGTTTTTGTTAACA
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>LITCHI016495.m1 GenomeSequence - GAAAAATATACTGAGTGAAATTTGATCCTTCATACTCAGACGAGTAGGCAACCATCTATT TTTTGTTAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATGAAAAAGAGAAAGAATAAGAATTTT TAGGAAAGGATTAATACAGTGGACGTGATATGAAAGCGAGAAGAATATAATAAGAAAAGT GTTGAGAAGACAAAAGGAAAAAGAGAGAGAAAATGAGGGCATTTATTGGGAAAGAGGGAA AGCAGATGTCTGGTTAATGTAGGGGAAGATAGGGGCAAAGCTTCAACCTTGAGCATTTGG TCTCTGTCAAACTCTACAAACTCATCCTCCTTTAACTTCTCCATCCATCTATCCACTAAC TGATCCCACCTTATTAGGTTTTGGATCCTTGATTTAATGATTTTCCCGCTGTAAATGACT CTCCGCCATTAACTGGCTGTCCCAGTTTATATTTTATAGACAGAGAGCAATGAAGACACC GGCAAACGGTGCTGCCGGAGCTTCCTCTGTGGCAGCTCCGACAACCACCAGTAGTATCGC CGAAGGTAACCCCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGAAAAGAAAACAAAAAAGGAGCA TAGACAGAACCGATCAGGTTTTGTCTTTTGTCTAATTTGAAACTTTTCTCCTCCTTCTCA TGGTTGCATACATAATAAAAAAGAGAATAAATTTTGGTTAGAAGAAGAATGAATCAATGG ATGACACGTGTTGCAGGAGACAAGAAGATGATAAACTCGGAGCTATGGCACTCCTGCGCT GGTCCTCTGGTCAATCTGCCTGCTGCTGGCACCCACGTCGTCTACTTCCCTCAAGGCCAC AGCGAACAGGTCTTTCTTTACTTGATTTTCCTTTTTTGGATTTTTGTTTAATTCTCTTGA 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