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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI015372 | Chr1 | 12148988 | 12149614 | - | Transcriptional regulator TAC1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI015372.m1 | 36 | 60 | PF13912.9 | zf-C2H2_6 | Domain | 25.1 | 1.40E-05 |
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>LITCHI015372.m1 ATGGAATCTGGAGGGAAACAAGGAAGCTCGGAGATCACTTCAAGCGATGAAAATGATCGC CTTGAACAAGTCAAGGAAGACACAGCTGCTACTATCAAACGATCATATGAATGCACATTT TGCAAGCGAGGCTTCACCAACGCGCAGGCCTTGGGAGGGCACATGAATATACATCGCAAA GATCGAGCCAAGAACAAGCAAATTACTGGTTCTTCCTTTGCAAGCAAACCCATGACGGTG AGCGAAGACTACATGAACCCTAGATACATCTCGGCAATTTCGACTGAACAGGTGAAGTAC TATTCTGTTCTAGAGGCTCAAAGGAATTATTTAATGTATTACCAACCATCCGTTTCAAGC CCTATAAATCCTCATGTTTATCATGCTAGCGAATTTCTTATCCCAAGGTCACAATATTCT TTGAGCACAAATGAAGAGCCCCTTTTGGGTGAAAATTTGAGCTTGGGGATCAGCCGTAAT TGTGTAGAAGACAAAGAAGATGAACTGGATTTGGAGCTTCGACTTGGTCATAATCCCTAA
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>LITCHI015372.m1 GATAGGGTAGTTTTGGGCATGGAATCTGGAGGGAAACAAGGAAGCTCGGAGATCACTTCA AGCGATGAAAATGATCGCCTTGAACAAGTCAAGGAAGACACAGCTGCTACTATCAAACGA TCATATGAATGCACATTTTGCAAGCGAGGCTTCACCAACGCGCAGGCCTTGGGAGGGCAC ATGAATATACATCGCAAAGATCGAGCCAAGAACAAGCAAATTACTGGTTCTTCCTTTGCA AGCAAACCCATGACGGTGAGCGAAGACTACATGAACCCTAGATACATCTCGGCAATTTCG ACTGAACAGGTGAAGTACTATTCTGTTCTAGAGGCTCAAAGGAATTATTTAATGTATTAC CAACCATCCGTTTCAAGCCCTATAAATCCTCATGTTTATCATGCTAGCGAATTTCTTATC CCAAGGTCACAATATTCTTTGAGCACAAATGAAGAGCCCCTTTTGGGTGAAAATTTGAGC TTGGGGATCAGCCGTAATTGTGTAGAAGACAAAGAAGATGAACTGGATTTGGAGCTTCGA CTTGGTCATAATCCCTAATAGTACGTGTTGTTGTGTTCATTAACCTAAATACTTGCCATG AGAAAATATATAGTGTACAGAGATGGG
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>LITCHI015372.m1 - Up_Stream_Len 2000 AACTACAATATCAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATATATATATATATATAT ATAACTTGAAAATAGTAGCCGCTTCAAGAAATGTTCAATATTGAGTGTTCTTTGGCCGTC TTTATTACAGAGGAATCATCTATTCATGTACCACACTACAAGACATGTACTTCATGGATA TTGCATTAAAGCCAACAGGTGCATTACATCAATTCATTCTTTTTGAACTGTTCCCATCTC ATCTCCGTTAAACCTTCGAACTAGCCTTTTGGATCCTATGACCATTCAATAAACATGCAG TCTCAAAATATAAATCCCAACAAAAATAAATATTCTAATACCAGCATATCTGTCTTGTTT TGCCCCTAAAATCCCCCATTAATTATAAAAGTATAATAGTCTCAACATATATATAATTAT GAACAATTTATTTTTCACCCGGTTATATGCAGATTATTTTTACATGCCTAGGTAACTTTA AAACTAGCATCACCATCCAATTAATTGAATTGAGGTTGCACTCACATGTACAAGATAGAG ACATGATGCATTCGGGGATAGAACTATAGGAATATTTGATCATACGGAACTATGATGTCA TCTTGTAAGAGTACTTAAAACTCCTTTCAAACATAGTGATTAAATAACAATTTTCTTGAT CGGTATTTTTGCATTTACAACATACAAAAGCCATGAACAATTAATTACTTTTCACCCGGT TATTTGCAGATTATTTTTTCATGCCTAGGTTACTTTAAAACTACCATCACCATCCTCTTA ATTGTATTGAGATTGCAATCACATGTACAAGATTGATATATGATGCATTTATGGATAGAA CTAGAAATGTTTGATCATACAGATCTATGACATGATGTCATCTTGTAAGACTACTTAAAA CTCCTTTCAAGCATAGTAATCAAATAACAATTTTCCTGGTTGATACTTTTGCATTTACAC CATCCTTATAAAATTATATTCGAATTGCACTTTGTTTTCAGTAGCAAAATTGTAAAAATT ACGATGTCAAAAAATAAAATAAAATAAAGAAGTACCACAGCGAGCTAGCCAAGAAAACAA CTAGCTGTTGAAAGCTACATCAGCACAACTAGTAACCAAACAGGCAAATATTAAAAGTTA TTGCGAGAGACCAAAGAGAGAGACAGGGGAAAAAAAATGTAAAACTAGTAATGAAAGATG GGTCCATCAACCGGCCGACTAGGAGGAAAACGCCTAGAGCAAAAGACAAAATAGCGTTTC TTCTAATACAAATTCACATACACAATGGTACAGCCAACGTCATCCATCTATTGTCTTTCG ATCAAATTGTAAAGCCTTATTTGATATGTATGATTGAATTGAATTATTTTGATGAGAAAT AAATTAAATTAATTAATGTTATGATATATTTAATGATGTATGAGATTAGATTAAAAATAA TATTGTTCATTGTTTGATCTTTTATGAAATTGGACAAAAAATAATTATGTTATTTTTATT AAATAAAACTAAAAATGTTTTTATATTATTTTAAAAAGTAAAATATAATTCTTTAATATA AATTTTGAAATAATTTTAATTTATTATTATTGAAATATATTATTTTGTAATATTTTAATA AAATTATAAAATAATGTTAATAAATTTAATGATTTATATAATTATTGTAAGAAAGGGAAT AAAAAAAGTAGAGAAAAAAAAAAAGTGTCTCATGTTGATGGTGGATTAAATTTATCCCAA CAACATAGAACAAAATGGTTGTATGGGATTGGAAAATCCAATTACATGCAACCACCAAAC AATGGATTGGATTGGAATTTATCCAATCTCAATCCAAGCCCTTCTAACACACAAGGCCTA AAAGGTTTGTTCTCTCTCTTTCTTTGTTTCTCTACATCATCATATCTCGTGACACCGAGA AACTTTGTGTCAGAATGTTATTGACTCAAAGTTAGAAAGTTTTTGACAATTTTGTGCACA TTGATAGGGTAGTTTTGGGC
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>LITCHI022966.m4 GenomeSequence + CCAATGGCGTCAAGTGAAAGATCATGGATCATGATCACGCAATTGTTTGATTCCACCCAA TAGAAAACTCTCATTCTCAAAGCAAAAACAAAACGATCACTTCACATTTCCCGATGTTAC CTCTGTACACACCTGATAGCTTCCTCAAGCCGGCCAACGACACGTGGCGACCAATCTCAT GCTGACGATTAATACAGACAAATTCGATGTAAGAAAGCTAATATTTTATTATGATAATTA TTATAGTAGTGGGAGGCTGGAACAGACCAACACCTTTGCTTTGATACAAATATTTCATAT ATTAAACTATGCACTAAAGGACTGTTAATGCTCATTGACTATCTCCGGCGAATATATCGC TAGCTAACTCTGATGGGCGGAGACGACGACCCTTCTGCTGCTGGTTCGAGTCTGTATAGA GTGTTGTTGGATCGGTTCCAGAGTCTGGAAGCGAATCATGCAAAGCTAGGACGAGAGTTG GAGGAGTTGTTATTGCAGGTGAAGAGTAAAAACGAGGTGGTGATGTCAGATTGGGAGTTG GGATGCTTGCCTGGGTATTACTATGAAGGGAGTCCGTACAGGAAAGTTTTGGAGTCAATG GGACATCCAGTTTATGTGTGCAGTGCTTCCTCTGGGGAGATCATGTACTGGTACGTGTAT ATCTGTGTATGTTGATTGACTTTTGTTTTGTTCTTCGAGTTAGACAAAGGTTGGGGGGTC GGGGGGTGGTGGCGCGCTTTGTTTTTGTTGTTGAGTAAGTTAGAATATGCTTCTTCATGT AAATATATATATATATATATGACACTTGCTTTGATGCGATGATGTCGGAATAACAGAGTT TTAACAGGAATTGTTTAAGTTTATGAGAGTTGATAAATGGAAATTGTATTACTTTGAGTA 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