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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI015203Chr199251849928115;9928305-Auxin-responsive protein IAA12

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI015203.m188209PF02309.19AUX_IAAFamily86.82.30E-24
LITCHI015203.m289281PF02309.19AUX_IAAFamily199.39.80E-59
LITCHI015203.m389281PF02309.19AUX_IAAFamily199.39.80E-59
LITCHI015203.m488209PF02309.19AUX_IAAFamily86.82.30E-24
LITCHI015203.m588209PF02309.19AUX_IAAFamily86.82.30E-24
LITCHI015203.m688209PF02309.19AUX_IAAFamily86.82.30E-24
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>LITCHI015203.m1
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CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT
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ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGTACCTTTTCG
TCCTCCTTTGTTGTTTGA
>LITCHI015203.m2
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CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT
GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA
GCCAAGGACTTCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAAT
GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT
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>LITCHI015203.m3
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CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT
GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA
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ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGCTCAGGGGGA
GAGAAGGATCTGGCAACAAATTCATCCAAGCTTTTGGATGGATCGTCTGAATTTGTCCTC
ACCTATGAGGATAAAGAAGGAGATTGGATGCTTGTGGGAGATGTCCCGTGGAGGATGTTT
CTCAACTCGGTAAAAAGGCTTCGAATCATGAGGACTTCTGAGGCTAATGGACTCGCTCCA
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>LITCHI015203.m4
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CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT
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TCCTCCTTTGTTGTTTGA
>LITCHI015203.m5
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CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT
GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA
GCCAAGGACTTCCCTTGTGTTGTCAAGGTCTCTCAACTGAACCACAACAGATCACCAAAT
GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT
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GGCAGTGAAAAGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAA
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ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGTACCTTTTCG
TCCTCCTTTGTTGTTTGA
>LITCHI015203.m6
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CCAGCTGAGAGTGAGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTGAGTCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGT
GGAGGAGGTGGATGGAAGAGCAAAGCAATTGCATGGGGTGAGTGTGGTAGAATCTTGACA
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GCTACTGCTCCTTCTATTTCTGTTTCTGGCACCAAGAGAGCTGCTGACTCCGTTCCTCAT
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GGCAGTGAAAAGGATAAATTGAAGGATGCTTCCAAGAAGAAAATTTGCAACGGCAACAAA
TCTAGTAATGTTTTCAATGAAAAAGGACATCTTGGGTTTGTCAAGGTGAATATGGATGGA
CTTCCCATTGGAAGGAAGGTGGATTTGAATGCTCATGCTTGCTATGAGACTTTAGCTCAA
ACATTGGAAGACATGTTTTTTAAGCCCCCCAAGACAATCAATTCGATTGGTACCTTTTCG
TCCTCCTTTGTTGTTTGA
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>LITCHI020927.m1
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RGGVKATIRNE.
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>LITCHI020927.m1
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TTTGTATCCCTTACTTATTGTCAACAGCAATGGCAAACGAAGGTCTTGGACTTGAAATCA
CAGAGCTGAGATTGGGTCTTCCAGGTGGTGGACGTCCTAGTTCAACGGAAAAAAAAGAGA
AGAAAAGGGTTTTCTCGAATATTTCCGATCACGAAGACGTCGATGGCACCAACGGTGACC
ACGAAATCCAAACAAAAACACAAGTTGAGGGGTGGCCGCCAGTGTGCTTATATCGAAGAA
AGAATAGTTTTAACGAGAACAATCACCTTGAAACATCGAATATGTACGTGAAAGTTAGCA
TGGATGGGGCACCATTTCTTCGCAAAATTGATTTGGGCACGCACAAAGGGTACTCAAATC
TTGCCACGGCATTGGAGAAGCTGTTTGGTTGTTTTGGCATAAGTGATGCATTGAAGGATG
CAAACAACTCTGAATATGTTGCCATCTACGAAGACAAAGACGGAAACTGGCTGTTAGCAG
CAGACGTTCCCTGGGAGATGTTCATTGAATCATGCAAGAGGCTGAGGGTCATGAAGAGAT
CAGATGCCAAGGGTTTTGGACTGCAACCGAGGGGTGGTGTCAAGGCAACTATTAGAAACG
AGTGAATTGAAAATTCACCCTTTGCTCAGATCAGATGGAGAATTTGACACCCGAATCGAT
TGGTTTTCGTACTCACCTTCTATTTGATGTTGTACTGCATGCGTTTATCTAATTAAGCAG
GAAATTGAATTCCTGATCAAACTATGAGTGTACTCTAGCTTATAATTAAACAGGGAAACA
ACCCTTCATATATAGGGAAGAAAATTAATTTGCCTCTCTATCACGAAATTATTGCTATAA
TTTTTGTTAAAGATAGTGCTATATTTGTTGTTCAGAGGTAATTAAGTGCAAATTAAAAAT
GAAATAAGTTTTTTGCATAACAGAAATGCACCGACTGGTTTCAGCAACATCTCTCAACTT
CTTCACAAATTGATGAACACATGATTAAATGTACAATTTTCTGACTTATCCCTGCAGAAG
AAAGTTTGATTTTAACGTTAAATTAACAGATAATCATGGAGTGTGTGAAAGTTGGATTTA
GAGTACTTTAAATCATACGTATCAATCAAAGTGTTTGAAATAAGAAGTGAGCAATCTTTC
ACGGCTAACATAATTGAATCCTTTTGCTTTTTCAACTTGATTAATGTTCAGGTGAGTATC
AGATCACTTTATTTGTATTTTATAT
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>LITCHI020927.m1 +  Up_Stream_Len 2000
TCATATAAGAACATGCGTCATGTGCGTGTGTCCTAAGACTGCTTCCCTGCTTAATTAAAT
TTATATGCATATGCCCCGACATCAATCAGAAGCTCCATATATAATTAATAGTTACTATAG
TACTCTCGAACAGAAACATATATAAGAGGAATAATGTAGATCTTCCATGATTATATTTGT
GAATAAATTAGGTTCGCAAGTTTTGTGTTAATAATAGAGAGCCGTTAGATGGGATATAAA
TATATAACTAAACCATAATTAATTTTAGGGATCACTTGGGATCTATGCATATCCATTATT
TTTATGACTTGTTTTTAATCCATCTCAGTAGAGATTTCTTGACATACTCGTCTCAGGTCA
GTACAAGATTTTTTAGTGGTTTGCTTAGAGTTTAATTTATGGATATGAGAATCATCAATA
ATTCGGTATATATGTATATATATATATCTACACACGCTACGCTTCTCCCATGGATCTTAT
AATATGTAGATGTGTATTACACCGTTTCCATCTCAAGTACTAAAATAGAAACTTATATTG
TTTTCGTTTAATATGAGTTAAAATAGAAGAAGATAGGACAAGTGGATGTATCGAGAATTT
ATGCATGGCAAATTAACTATATAATCTTTCTTGTTACGCGCAACTGCTTTTCATCATTGG
AAAAATCACTGCATTCTTTTCCTTTGTCTTGCTAATTATCTAGCTAGGCAAAAATTTGAA
AAACTGCTGAAGGGAATATGCTCCTTCCAGCTAGCTACTTAGACTAGCCATGCTGGTCTA
TAATAGGTAATTTTGACAGCAACACTTGACGCGGTAGTGAAGTCACAGGGTCCCGGAAAT
CCTAGAGTTGACTTGGCTATGGACTGTATGGAAGACCATTTCTTCGATTCTTGTTTGCTA
TTTGTGTTGCATGCCAATGCATGCATGTGTTGAATCTTATCTTATATATACGTACATGAT
CGATTGAACATGCATGAACAGAAATTATGATCACTAAATATTTTTGAATTGAAATTAACT
CCCTAATCTAGAACCCTGTATACGATCACAAATTAAATTAAATCTCATTTTAAAAAATCA
TCTAATGGTCCATATATAAAGGTTGTAGAAACCACGAATAGCTTCATTATTTGATTTAAT
TCCAATCTATTTGGTTGTATATATATGTTTAATGTAAATGTATATTTTTGACTTAATTAA
AATTGAATGTAGCCTAATAGTACTACTAGAGATATATCAAAGTATATACGCTTTTTTTTT
TTTTTTTGGGTACAATTTAACAATGAAATTTTAAAATTAAATCCCAATGAAAGTACTGAT
GATGATCTAATTAATCTATAATTAATGCTTGTGAAGTTGGATATTAGTTAGAAATATGAG
ATAAGAAAGAAGGGTACATAAATTCATGTTTGAACTCAGGACGATGAACGAAGCTGACCA
TCATGCAAGCACCTCAATATTGATGAAGTATGGATGATCAGCCACAAAATCATATTACAT
GATGCATATATATAAATATATGTATGTATGTAGATGTGTGTGTATATATATGTGCGTGTA
TATAATCTGGTGCTACTGCTGATGATACTTTTTCCATAATTCAATGCAAATACCCCTTCA
ATGAGGCAGATCACATGGCCTGTTCCCGTCACCGGATCAAACGGCCAGGATCAAATCCCC
CGAAATCAACAAATGACCAACAGCCCTGCGATATGTCCCATTTCCAACTTATTGTGCCGG
TCATTTATCGGTTTTGAGGGAGCACATAGTCCCCACATCTGCTTCTCATGTGACCGACCA
ATAACCCTTAGTTGACCTGTCACAGCTCCCACTCTGGCTCTCTTCTCTTCTTGTATAAAA
CCTCGCTATATCATCACTACTTTTGTCAAAACTGGTAATACCAATCTCTACCAAGTCATA
AAGCAAAGAGAAAGAGAAGTAAAAAAACACCAACCAAACTTTCTTGAAAATTTTGTATCC
CTTACTTATTGTCAACAGCA
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>LITCHI020927.m1 GenomeSequence + 
GACCGACCAATAACCCTTAGTTGACCTGTCACAGCTCCCACTCTGGCTCTCTTCTCTTCT
TGTATAAAACCTCGCTATATCATCACTACTTTTGTCAAAACTGGTAATACCAATCTCTAC
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AGAAAAGGGTTTTCTCGAATATTTCCGATCACGAAGACGTCGATGGCACCAACGGTGACC
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TGGATGGGGCACCATTTCTTCGCAAAATTGATTTGGGCACGCACAAAGGGTACTCAAATC
TTGCCACGGCATTGGAGAAGCTGTTTGGTTGTTTTGGCATAAGTAAGTTGGGTTTCGTTT
CTTCTCCTTAGTTTTGTACCGTTCTAGGGCTATACTATATAGCAAAAATATGCATAATTT
TGTATAAATTGGAAGGCTACGGTGACTTATATTGAACTACGTTCTAGTACTCGTTTAACA
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TTTATGCGCTTTATTCAAAATTTTATACGGATCGTTTGTTATGGAAACATTTGGCAGGTG
ATGCATTGAAGGATGCAAACAACTCTGAATATGTTGCCATCTACGAAGACAAAGACGGAA
ACTGGCTGTTAGCAGCAGACGTTCCCTGGGAGTAAGTGTCTCAAACCAAACTTCTCATGT
ACAATTTAGAAAAGATTGTGATATGTGCGTGGTTGTTATTTATTTTTTCTTGACAATTAA
ACAAGCTCTTAGCTCAGATGAATGTCAAGACGAAGAATAAACTAAATTTTCCTTGATATA
TGATACTGGATAGTTGAGATCATCAAGCATTTATGGCTGATCTGGGGCTTCTAATGATGT
ATTAGTGACAGATCCCATTTAAGGAAAAAAAAAACAGTGGCAAAATTATCATTATGGGAT
TTGCACATATGGTGTTGTTCTGTCTTAAATGGATCTCACACTACCATATAAACAAATTTC
ATTCACTATATATGTAGTGTCGGTTTAGATGGCAGTTTTGCTCTCAAAACCATGCCTGAT
CAAGGCAAAAGACATTTTTACTGTCAATTGTGTTAAAAGATTCTAGTGAACAATTGCCAC
CATTATGGAATTTACACACATGAAACTTTCAAAGAGGAAGTGTCAAAGACAATTGGACCC
TCTCCCGATTCGAATGTCATAATTAAGCTAGAATCAGAATTGTGGTCTGATTTTCATTTA
TAGTCTCATTATTTTTTTCTCAATTTATTAGTAGTCTCGTTATTTTTTACTCAATTTATT
AGTAGTCTCGTTATTTTTTTCTCAATTTATTAGAAGTACAAATTAAGCTAATAAACAGCC
GGTTTATTGTGTTTACAGGATGTTCATTGAATCATGCAAGAGGCTGAGGGTCATGAAGAG
ATCAGATGCCAAGGGTTTTGGACTGCAACCGAGGGGTGGTGTCAAGGCAACTATTAGAAA
CGAGTGAATTGAAAATTCACCCTTTGCTCAGATCAGATGGAGAATTTGACACCCGAATCG
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AGGAAATTGAATTCCTGATCAAACTATGAGTGTACTCTAGCTTATAATTAAACAGGGAAA
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AATTTTTGTTAAAGATAGTGCTATATTTGTTGTTCAGAGGTAATTAAGTGCAAATTAAAA
ATGAAATAAGTTTTTTGCATAACAGAAATGCACCGACTGGTTTCAGCAACATCTCTCAAC
TTCTTCACAAATTGATGAACACATGATTAAATGTACAATTTTCTGACTTATCCCTGCAGA
AGAAAGTTTGATTTTAACGTTAAATTAACAGATAATCATGGAGTGTGTGAAAGTTGGATT
TAGAGTACTTTAAATCATACGTATCAATCAAAGTGTTTGAAATAAGAAGTGAGCAATCTT
TCACGGCTAACATAATTGAATCCTTTTGCTTTTTCAACTTGATTAATGTTCAGGTGAGTA
TCAGATCACTTTATTTGTATTTTATAT