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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI015071Chr182847848287537-Transcription factor FAMA

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI015071.m1228279PF00010.29HLHDomain37.61.70E-09
LITCHI015071.m2214265PF00010.29HLHDomain37.71.60E-09
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>LITCHI015071.m1
ATGTTTTTGTTGATAGATCTTTTCATCACCATGTTGTTTTGCTCTCAACTGATCCACCTC
TTGCAGCCAAGTTTTGCAGCCCTAGATTACTCTCTTGATCATCACCACCATCAACAACAA
CAACATCAACATCAAGACCACATCTTGATGAAGTCATCACGAGCCGGCGAGACATCTGCT
GATAGTAACATTAACAACCCAGCTGGAATGGTTGATTATATGCTCAATAATCCTCAATCA
CAACAACAACAACACATACCATCATCAGGGTTTTGTACTTCTTCTTCCAACTCTTTTGAC
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AAGGTGTTAGGGTTCGATGCCATTATCAAGATCCTCTCAAGAAGAAGGCCAGGCCAGCTC
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ACAGCCGAAGACATAGCCAGCTCAGTGCAACAGATATTTAGTTTCATTCATGCAAACAGC
GGCATATGA
>LITCHI015071.m2
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CTCAATAATCCTCAATCACAACAACAACAACACATACCATCATCAGGGTTTTGTACTTCT
TCTTCCAACTCTTTTGACAAGTTGAGCTTCGCTGATGTGATGCAATTTGCTGACTTCGGA
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GTCGAGAGAAATCGAAGGAAACAAATGAATGAACATCTTCGGGTTTTGAGGGCTCTCATG
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GTGAGGGAGTTGGAACAGCTTCTTCAATGCTTGGAGTCACAGAAAAGGAGAAGACTTCTA
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TTGGCGGATGTTGAAGTGAAGGTGTTAGGGTTCGATGCCATTATCAAGATCCTCTCAAGA
AGAAGGCCAGGCCAGCTCATTAAGACCATTGCTGCTCTTGAAGATTTGCAGCTCAACATT
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GCAAGCGAATCGACGTTTACAGCCGAAGACATAGCCAGCTCAGTGCAACAGATATTTAGT
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>LITCHI015071.m1
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>LITCHI015071.m2
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>LITCHI016835.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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CAGCTGCTTAATTAAGCTAGTTCTAGAAGATTTTTTATTCCTTAATTTCCCACTGATCGA
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TTAGTATTTAACGTATTTTATTTATATATATTCGGACTTAGGTCATATAATCAATTATCT
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TGCTTTCTCCAAGTGAATTAGATAGAAGTAGTTAGTTTTAGTTACTGTTTTTGTCTACGT
AAAATTTTTTGCCATATTTAAACTCTGCAAGCTAGAGCGTCAGACACACGCGCCGTCCCA
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TGTGTGGAAAATTGGATTTTGATTGAATGCTTGTTGTGATTTGAGAGATGTGTGAGATGG
GTTTGTTTTTGTTTTTGATTTGAAGAAGAAATGAAGAAGAAACCATGAATGTAACCCCTT
AAAAGAACAAGACATAGAGACAGATAAAAATATAAAACAAAAGGCCAAAGAATTCTCTAA
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TTGCATTGGTTGGTTAATTCTTCTTCAATGCTGCCTCATTGAAGCCTATTGAGTATTGAC
GCTAGTGTGTTGAAGATTCCTCAGATCTACAGTGAAAGGCTCTTTTGTCAACTCTGTTTC
CTCTTCTTTACTGGGTTGGTCTTGGTTCAATCGCAAAAGGTTAGCAAAAACTTTATGAAA
TTTGAAAAAAGTTTTCATTTTTACTGTCAAGAAGAAGAGAAGAGTTGGTTTTTTAGCCAA
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GTCTTGGCTTGGATAAGATCTCAGCTTCATTGGGTTGAATTCTGATTCCAATTTGGATTC
AAATTCACTTCCTTTTCTCCAAAATGTGATTGAATTCAATGTTCTTTGATTGTTTTAATG
TTCTTGTACTAGTTTCAAGTTGAGAGATTGAATTCTCACTCTCTTCTGATCATATAATTT
ATTTACTTTAATGTTTTTGTTCTTATAAGGTCCTGCTTTGATCTTTTTGGCTTCAATAAG
ATGTTGAGAGAGTCTAGTTGAGACTACCATTGATGCATACACTTGAAGATTATCGAAGAA
TGGTTTAAGTAGTGTTGTTTTTTTTTATGTTCATCAGCATCTTGGGACACATAGAAGTTG
GATGAAACTGAATTTTCTGA
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CAGCTGCTTAATTAAGCTAGTTCTAGAAGATTTTTTATTCCTTAATTTCCCACTGATCGA
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AAAAGAACAAGACATAGAGACAGATAAAAATATAAAACAAAAGGCCAAAGAATTCTCTAA
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TATTTTATTTTTTTGTTTTTCTTCTTTACAATCACATGCTATCCTCTCTCTCTCTCTCTC
TTGCATTGGTTGGTTAATTCTTCTTCAATGCTGCCTCATTGAAGCCTATTGAGTATTGAC
GCTAGTGTGTTGAAGATTCCTCAGATCTACAGTGAAAGGCTCTTTTGTCAACTCTGTTTC
CTCTTCTTTACTGGGTTGGTCTTGGTTCAATCGCAAAAGGTTAGCAAAAACTTTATGAAA
TTTGAAAAAAGTTTTCATTTTTACTGTCAAGAAGAAGAGAAGAGTTGGTTTTTTAGCCAA
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GTCTTGGCTTGGATAAGATCTCAGCTTCATTGGGTTGAATTCTGATTCCAATTTGGATTC
AAATTCACTTCCTTTTCTCCAAAATGTGATTGAATTCAATGTTCTTTGATTGTTTTAATG
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ATTTACTTTAATGTTTTTGTTCTTATAAGGTCCTGCTTTGATCTTTTTGGCTTCAATAAG
ATGTTGAGAGAGTCTAGTTGAGACTACCATTGATGCATACACTTGAAGATTATCGAAGAA
TGGTTTAAGTAGTGTTGTTTTTTTTTATGTTCATCAGCATCTTGGGACACATAGAAGTTG
GATGAAACTGAATTTTCTGA
>LITCHI016835.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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GTTTGTTTTTGTTTTTGATTTGAAGAAGAAATGAAGAAGAAACCATGAATGTAACCCCTT
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TGGTTTAAGTAGTGTTGTTTTTTTTTATGTTCATCAGCATCTTGGGACACATAGAAGTTG
GATGAAACTGAATTTTCTGA
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>LITCHI021886.m1 GenomeSequence - 
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AAAACCTAATTCAGTTCCTGATTACTCTTTTTAGCGTAGAACCACTTAAATTAATTTGAG
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TTGATGTTAACAGTTGAATAATTGAATAAACTATTTGTAGTTATAATCAGATTCACACGA
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GTGAATCTTACTTTGCTGGTCGAGATGTGAAGATCTAAGAAGCCTTCCTGGTAGACTTTC
CGCTTCTGCTTGATGTGCTTCGTGTAGGTCACGCGCCACCGCCTCTTCGCATCCTCCTCC
ATGTCGCTGCGATTTCAAAATTTTTTCGTAGCTTCGAAATATGTACGAACAATTTCCACG
GGCGGGAAACCAGATAAAAGTTTCTACGACGTCGTTTCGTCAATTTGGGGGGAGGGGGGT
GTGTGGGTTGTGGCCGCGCTGGTTGGGTGTGGGGGACAGAGGAGGGACATTTTTGTAATT
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TGTCCACAGAAAAAAAGGAGAGATGCAAAACCCAAACCCAGCTTTGCGGTCACCATTAAT
TGTTTGTTTATTTATTTGTTTCTGTATTTGGGTTTCGCTGTAAACATCCTCTAGCTTGAA
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GTTCGTCTGGTTGTGGGTGTCGAATCCTTTGATTTTGTCATTTTTAGATATAAATTAGTT
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TGTTGTGATTCTGTGGTTTAAGTAGAGACGCGAAGGAAACTGTGATTGAGAAGATTGAAG
CGGATAGTTAGTTTTAAGCTGATGACTGATCTCTCTGACGCTTAGTTTTCACTTTAGATA
TGTTACATATTTCTTGTCATTTCTGAGATCGGGATGTTGTTGATATGGATACATATTTGT
TTTGTAGTTGATAAGCGAACATAATTTTTATGCCAGCAGTTTGGTAGGGGTATTTCTGGC
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TTGGATTTGAGCTCAAGGAAGTTTTAGTAGAATGTGCCATACTGGCATTTAGCTCTATAG
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TAGATGTCTTCATTAATGTATTGTAGATGTCTTCATAAATGTATATTATATCTTGACTTG
TTTGAATTGAGGGCGCAACAACTTGTTACATTGGTTGAACAGGTGATCATTTTTCTTTTC
AACCCCCGGTAACTACGTTATTGACCACGGACAGTCTATGGTGTAAAGAAAATATGGGAG
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GTCTTGTTTTTCTGGCTAGAATGAGGTCTCCTGCAAACCGCGGAAAACCAATTGCTATTA
AGAAATTTAAACAATCCAAAGATGGTGATGGTGTCTCCCCAACTGCCATTCGTGAAATTA
TGTTGCTTAGAGAGATTACACATGAGAATGTTGTAAAGCTTGTCAATGTGCACATTAATC
ATGCAGACATGTCACTTTATCTGGCCTTTGATTATGCTGAATATGACCTTTATGAAATCA
TCAGATATCACAGGGACAAGGGTAACCAAATTATCAACCCTTACACCGTGAAATCATTAC
TATGGCAACTGCTAAATGGCCTGAACTATCTCCACAGTAATTGGATAATACATCGAGATC
TCAAGCCTTCAAATATCTTGGTTATGGGCGATGGAGAAGAACAAGGAGTTGTCAAAATTG
CAGATTTTGGACTTGCAAGGATTTATCAAGCCCCCTTGAAGTTCTTATCTGAAAATGGGG
TTGTTGTTACCATTTGGTATCGTGCACCTGAGTTGCTTCTTGGAGCAAAGCACTATACAA
GTGCTGTTGATATGTGGGCTGTTGGATGCATCTTTGCTGAACTTTTGACTTTGAAGCCAC
TATTTCAAGGGGCAGAAGCCAAATCCACACAGAACCCATTTCAGTTTGATCAGCTTGACA
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CGCATTGGAACTCAGATTCACAGCACATTCAAGGGCGCAAGTACGAAACTAATGGACTTC
CCAGTGTTGTTCATCTCAACCCAAAATGTCCTGCATATGACCTTCTTTCAAAGATGCTTG
AATATGATCCTCGGAAGCGTATAACAGCTGCACAGGCTCTGGAGCATGAATATTTTCGGA
TTGAACCTCTACCAGGACGCAATGCCCTGGTTCCCTCTCAAACTGGACCTGGGGAGAAAG
TCGTGAGCTATCCTGCCCGTCCAGTAGATTCAAGTACAGATTTTGAAGGCACAACTACAC
TTCAACCTCCACAACCAGCAGCATCTGGCAATCCTGTTGCTGGGAATATGGCAGGGGCTC
ATGCAATGTCAAATAGAAATGTCCCTCGGCCAATGCCTGCTGCAGTGGGCATGCAAAGGA
TGCAACCTCAGGGCATGATGGCATATAACTTTCAATCTCAGCCAGGAGCAGCAGGTGGAA
TGAATCCTGGGGGCATGCCAATGCAGCGGGGTATGGCTGCCCAGGCTCATCAACAGCAAC
AGTTGAGAAGGAAAGATCCAGGAATGATGCCCGGATACCCTCCCCAACAGAAATCAAGAC
GATTATGAGCAGATGCATCGATTCAATTAACCTAGTTAGATAACTTTGACAGACCCCTTA
TAAAAAACAAAACAAAAAATTGAGATGTGCCCAGTATAGGACCAAGCTACAGGTGGATAT
CTTTGACTTCAGTGATCTCATATGTGCTTGAAACGGAGCTAATTCGCATGCTCACAGGAA
GTTATTAATAGCCAAGCAATCATTTGGGTTAAGTGCCCCAGAATACAGAGAGCAAATGAA
GCTTCTTATTAACCTAGTCTCTCTATCTATGAGATATTTGGTGTGGGGAGAATGAATTGT
ATCTTTTGGGGGATTGTCTGTGTTTGGAACTGTGATTCCATATGAGCTCACGTATCATCA
TTTATCAAATGATGGAACTTATTTGAACTATGAAAAAAAAAAAAAAAAAACACCAAGAAG
AAAAGTTTTGTTGATGTTTCATTGCATATATGCCCTAATTTTAACCCTGATGTTATGTTA
TAATGGTTCTGGTTTCTTGTATGCCTCTATTCACTTGAATCTGAGTTCTTTTCTTCTTTA
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GCATGTCCTTTTCCATTTGAGTAAAAGACTAACTCCTATTACCTTGTAAAAAAGCAACAG
TCGGGAGACTCTATTTGTTAAGAGTGACTTTTTTCTCTATTATGGAGTCGGAATGAGAAT